EMLSAT00000005467, EMLSAT00000005467-701314 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000005467
Unique NameEMLSAT00000005467-701314
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s294supercontigLSalAtl2s294:184919..205719 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000005467 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000005467EMLSAG00000005467-688233Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000023916EMLSAE00000023916-732844Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000023917EMLSAE00000023917-732845Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000023918EMLSAE00000023918-732846Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto774106auto774106Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000005467EMLSAP00000005467Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000005467

>EMLSAP00000005467 ID=EMLSAP00000005467|Name=EMLSAP00000005467|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=377bp
MAAAXXXAKXATEIFLGVGEVSIDNFTFKLYYKWTVTMFIVSSVLVSTSQ
FFGEPIQCETAEDSIDDDVLNAFCWMYSSFDMPSSYTGSCARKRVDSTHL
YNTYYQWVSIFLVAQAIYFSLPPEERIRQETVNPMCEVFPKIAACDFHRY
GMGGGMDNRFGICVLGLNMINDKVFVFIWYWYCLLIILGVIRIISRTSQI
ASSKVRYFLMKIKMNAYFGKHNHHMRHIQHYVLNCSIGDWFVLYQMSKNL
NKRFFAEFIALTAMIVNPDPNIAPEEPEIFFSDEEIFRIKNFSSTEVSKD
SDTKNGDEEEEGAEEEEEESSKPSNPFAKVEGDIEEASGASCLTGKQRML
IKNGKGAISAKHKAMVANAQVRRLKRR
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mRNA from alignment at LSalAtl2s294:184919..205719-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000005467-701314 ID=EMLSAT00000005467-701314|Name=EMLSAT00000005467|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=20801bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s294:184919..205719- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGCAGCTGCKATNGMMARCGCCAAAKCAGCCACAGAGATTTTCCTCGG AGTTGGAGAGGTCTCCATTGATAATTTCACATTTAAGCTCTATTACAAAT GGACTGTGACCATGTTCATCGTTTCCTCTGTTCTTGTCTCCACCTCCCAG TTCTTCGGAGAGCCTATTCAATGCGAAACGGTACTATGCTTTTGAATTAT ATGTATGTATTAGATGCTTACTATAGGTGAAGTCATTCCAAATATCTTTT TTCTGTTCACAAGTTTCATATTATCACTTATACAACATAGACGCACATAG AGAGAAATATGTATAATTGACATTTGTATGTGAATAATATGTATGTTTGT AGGAAAAGTGTCAATGAAGGTCTCACAGGCCAATTTGGATGTCTCTATAA TTATTAACATTTGCCTTGCCTTTGCTCATTTATCAATCGAACAAATGACT TTCTGGATTAGATAAATAGCAAAAGATTAAAGTCAGAATTAATGATAGCA ATTTGATAAAATATTAACTATGATTACGTTTTAGATATCTATAACTCACA TGAATCCATCCTCGTTCTCACTTCTCTTTATCAAAGACCTTGGACATGCC CTCAAATACACTAATAAATTACAAATATGTGCATCTTATTTTGAAGCATA TAATTAAGTCTATTAACATTCTTCGTAGAAATTAATGTGAGTGAAACAGT TGACGTATAATTTAAATAGAAATATTAATACTACATATTTGAATACTCCA TAGGTTGCTTAATACCGTTATGCAATAAAGGATTGTATAATCTCAAAAAA AATTCCAATTACATCTAGTGTTTATAAGGTTAACTCTCTAATTTCACTGG ACAGCAATTTATTGTTGAATCATTATCGTTAAATGATACTCAAGATTTCT TCATAGAAATAATAAAATGTTCAATATATATATAGATATATTTATCAGCT GTAGAAAAAGTACTGAGKCCTGCCTCTTAGTAGTCATTAAAATACTCATA ATTGATCAGGATGTTGTTGTAAATAAGAAAAATAATTTTATAATATTTTC TACTCTATATCAATGCACATTGATTATGAATCTAGTCKCCCTCAGTATCG ATGACKCCCTCCACTACCTCCAGAACCCCTTTTCATAATCCTCCACTGCT GGTTAACGAAGGTCTTCAGGTCATCAATATTTGGGTGGTGGACATTGCAG GTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCCTTAACCAGGAGGAAAC TAATTGGAGGCATTTTTTCTACAGTTGATGTAACAGCCCCTAACATCATC CGATGACTGTCCAGATGCTGTTGTCAGCTTTGTCAAAGCGTAACAACCAA TCATTTGACGGAGTCAACAACAAGCAAAATGATTGGTTGGTATACTTTGC TTGTTGTAGACGGAGTCAACAGTAATGTCATTTCATCAGAGAAAAAAATT ACCCAGTTGCTGTTGTACTTCAGATTACTCAAGAGTTGGAGACATCGCTG AAGACGCGGCTCCTTTTGACGTTGGGYCAGGAGTTGCGTCTCAGTTCTTC TAACCGACATTCATATAGCCCTTCGGATGGCCTTGCCCACAGTAGACCGA TTCTTCTTCTTGGCGTACTTTGACATTTCCATTGTTGAGTTGAACTTAAA GGTGTCCATGATGCCTTCAGGATTCACTTTAGTGGGTCTTCGACTCTTAG ATTTGTCCTTAAGGTTGTTTTTATCGAGCGTATGTACAGGATGTACTGTG TATAGTGCTCCCTGATGTATATAACATACATATTTTTGATATAAGAAATA GTAATGTCAATTAAATCTGATCGGTGTGTATGCAACATCCAGCGTTTGTA GCTAAAGCTAATCTAGGCATCCTGCTAGTGACTGAAGTACTCCTTAGCTT ATCAGGCATAATTTCATATTGTTATTTTTTGTTCATTCTGGAGGAGAGAG TATCTATGATCTACATATGTATTGAATAAATTCATGTGAGTACGCTCATG AATACCTGTGAGTAAGACTAAAAATTTATTGGGGAGTTATTTTTTAGGGA AAGTTTGTCTATACGACGATGCTTTAATAGCTCCGAGCAATAACGGGTTC TACCGTTAGTATATTATAAAAATAAATTATACCTACATTTTAGGGCTTAA TTTGAACATGCGGCCATTTTCCTTAAACTTTCATGTACTAGTATTTATTC ATAATTATTCCTTTTTATCACATGAAGTTGGGAATATATCAATCTTTTAT ATGTTTTGTTTGATATATTGACACAATCTTTGATGTCCACTGTTTTTCAC ATGTCAAGTTTACTACATTTTAGGGTAAATTGCTTTTAAATATTTACATT CTACCTTTATCATGTTAAACTATTTATTTTTGGATGGATGACCATTTGCG TATTAAGGATTGCATCAGAGTTTGAGCTAAAAAAAAAAGAAAAAAAATAT CCGATTTTTCTTTAAAAATCTACTTTTGTATCTCCATTTTATAAAGTATG ATTTTAACTTCTTTTGTTAAAATTATCTCTCTCTTAAATATGATGTTCGA CTTCATTAATATTTTGCAAAGTACATCAAAAATAGGGTACTTATATGTCA AGGAAAATTGATTATAATTTCATGGGATATAAGTTATCTGATTGATGAGA 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AACCATTTATGGATAATACAATGTTCTTAAAAATCCTAACCATTCTTCAA AAATAAAAAAGAATAGCATAAATTTACTCTGAAAAATAATTCCTCCCATT CTACGAGTTTTAGTACTCAAAAAGTCCCTGTACAACGAAAATTTCATAGA ACGCGGATTTTCCATCTAAAAAAAACTGAGAGTACTTTTATACTGGTGTA GAAAAAATAATGAAACCTTCTAAAAATACAGTTCTAAATAGGTGTTGTTG ATAAAATATTAAAGTTCCGATAATTTTTTAATAGCCTAGATTCTAAGCCT TTGATTGATGTACATGTTTGAACTATGGATGTACTATTTCTTATATAAAA AATATGAATATTTTATACTTCAGGGAGAACTATATACAGTACATACGCTC GATGCTACATCCCAAAATCCTGCTAAATTTTATCAATATATCTGAATTGT TAATTCTTAGATAAAAAATATGTACATGGATGTTTTTAATCATCCCAAGA TTCATAAGTTATTTTTTTATTCACTAATTGGCTCTTAAGTTGAATTAGTG TAACTTTTAGAGATATTTTACGATAATTAGCAAGATTTATTGAAAAATTA CAGATATTTTACTCCCTTCAGTCATATTGTGTCAACTAACTGAAAGCTTT AATTATATCTCATAATCATAAAAGTAAATTCCCTAATTCCCATGATTACA ACAATTTTTTTACAAACATTGATCACGTCGAATTCGTTACGCAACTTTGC TTTAAAGCTTTAAGTAAAACAACAAATAGAGAGATATTTGTATTTAAAAA AAATTCATGAAAAATGTGTTAAAATATTTTTAGGGTGATAAATACCTAAA TATGAAGAGAGGTCCAATTTATTACAATATAGTCAACTAATGTCAAATTG ACTACAATTTGATATAATAGACAATTTTTCATGGTGTGCATAATATGTAA 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