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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s294 | supercontig | LSalAtl2s294:184919..205719 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000005467 >EMLSAP00000005467 ID=EMLSAP00000005467|Name=EMLSAP00000005467|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=377bp
MAAAXXXAKXATEIFLGVGEVSIDNFTFKLYYKWTVTMFIVSSVLVSTSQ FFGEPIQCETAEDSIDDDVLNAFCWMYSSFDMPSSYTGSCARKRVDSTHL YNTYYQWVSIFLVAQAIYFSLPPEERIRQETVNPMCEVFPKIAACDFHRY GMGGGMDNRFGICVLGLNMINDKVFVFIWYWYCLLIILGVIRIISRTSQI ASSKVRYFLMKIKMNAYFGKHNHHMRHIQHYVLNCSIGDWFVLYQMSKNL NKRFFAEFIALTAMIVNPDPNIAPEEPEIFFSDEEIFRIKNFSSTEVSKD SDTKNGDEEEEGAEEEEEESSKPSNPFAKVEGDIEEASGASCLTGKQRML IKNGKGAISAKHKAMVANAQVRRLKRR back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s294:184919..205719- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000005467-701314 ID=EMLSAT00000005467-701314|Name=EMLSAT00000005467|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=20801bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s294:184919..205719- (Lepeophtheirus salmonis) ATGGCAGCTGCKATNGMMARCGCCAAAKCAGCCACAGAGATTTTCCTCGG
AGTTGGAGAGGTCTCCATTGATAATTTCACATTTAAGCTCTATTACAAAT
GGACTGTGACCATGTTCATCGTTTCCTCTGTTCTTGTCTCCACCTCCCAG
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ATGTATGTATTAGATGCTTACTATAGGTGAAGTCATTCCAAATATCTTTT
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CTCAAATACACTAATAAATTACAAATATGTGCATCTTATTTTGAAGCATA
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TGCCCGTATTTGCCCTTGACAATTGTGCATCGACTGTATGTAAATGTTTG
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ATGTATTAAATAAATTATATAAGATCGCGGGCTGGTCCGACATATTGGTC
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AGTCTTAACACTAGTAAATATATAAAGGTAATGTAGCTGTAAATATTTAT
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AATATTTATGATGATTCATTCCGTAGTACACTATATATTTTGTTAATAAC
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CGCCAAAATGTTCTAACACAATTTGTAACCTATTTTCAATAGGCCAATAT
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ATCCATTCTAACTACTCAACCCCAAATATTGACCGCTGAAATGCATGTAA
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ATGTTTATTGTTCATTGATCAGGGGAAAAAAATGAATAAATAGTCAAAGA
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TGTTCTTGAATGTCTTATAATACAGTTGTAGTAAAAACACATTAATTTTT
TTTTTCAAATAGATGGGATTTCAGTGATGTGTATCTCGCGTTTTATAAGT
GAGTTACGAGTCCATAAATTATTTTCAGAAACTTAAATCTCCAATAATTT
CTTTATACCTGACACAAATATTTACTAATTATAACCAATTAATCCGTAAA
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ATATAGTATACAAAATATATTTTTAAAAACTATGTGTTGGAGTGGGTCGT
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TGCTTCTGTTTTATGTTAGTCGCGCACCTGCTCTTATTAGGACCTCAAGC
ATCATGGTGGGCATATGATTTTCTTCTTTGATAAAGAATTAACGAAAATT
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GTGTGGTTTTCTCATTATTTATTCTCAAATGAGTTGTTGAATCTGAAAGG
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ATAGCGAAAAAAAACATAAGTGGACTCTATTTTAAAAGCACAATAAGGGT
TTAAATTTGACATATACGTATTACTTTACAAGCGTTTGTAGAGTCAGTAA
CTTAAACATACGAAATTTGACATGATATATACATTTGTATTCAATTTCCC
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TTCATGGACATAGATAGTGGTGTGTGAGTCCATATTTAACTGGTCCTGTC
AAGTCTTAAAATGGGTCCTATCAGTCATTGGGAGCAGTTCTTTGGGCTGT
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ATTTTTAATTTTACAGTATTGAAGCAACCGATTTAAAATCAAGTAAACAC
ACGATCCAGATTAAATTTTACAATGATCATGTCTGGCATACATTATTTTA
AACCATTTATGGATAATACAATGTTCTTAAAAATCCTAACCATTCTTCAA
AAATAAAAAAGAATAGCATAAATTTACTCTGAAAAATAATTCCTCCCATT
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ACGCGGATTTTCCATCTAAAAAAAACTGAGAGTACTTTTATACTGGTGTA
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TTGATTGATGTACATGTTTGAACTATGGATGTACTATTTCTTATATAAAA
AATATGAATATTTTATACTTCAGGGAGAACTATATACAGTACATACGCTC
GATGCTACATCCCAAAATCCTGCTAAATTTTATCAATATATCTGAATTGT
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AATTATATCTCATAATCATAAAAGTAAATTCCCTAATTCCCATGATTACA
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CAAATTAAGTTTAGTTTAACCTCATAATTCTGCAGTTTATATTACCATAA
TCAGGGATCCGAATTGGGAGCTCTTTGGGAATGTTAAAGTAAAACACCGA
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ATGTATTTGTAACTTTGAAAGACTACATATCTGCTGAGAGGGGTCACTTT
AAAAAACTATTGTGATCCTTGCTTGTTTATACGATTGAACTTTCAAAATA
GGAAAAAATAATTATAAGAGCATTAATACCTTGGATATTACAGTTAATAC
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TAGCTTTCATGCAATTTCATTAGATCAGCAACAATCAGCTGTGACGAGGG
GATGGGGAGAAGGAAATAAGTAAGGTCATAGCAAAAATTATTCTGATCTC
GATTCTCAATTCCACTTTGTGTCCAACTAAGACTTATAATGATCACTCCG
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AATTAAATGTTCTAGAAAAGGAAGTTAACTTTTAAGGAATAAAATAATTA
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ATAGTTTCTATGTCTCCTTGGGACATGGTCTTAGGAGTGTCAGTTTTTTT
TTAAACATATATATTTCATTCCAATGTAACCAAGAAAATAAACAAAAATA
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GTGTCCATTAAAAGAAAGAATTATTCATTAAAATAGTTTATTGACAATAG
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AAGTTTAACTCTCATAATATGAAAAACAAAATAGGTATGAAAGTTTTTCT
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GGTTCAAAATAAATTTATCCTTCCTTTTCCCAAAATTTAGTGATGGGACG
CCAAAAAAAAAAAATCTTCCGATTCTAGTAAAAATTTCTAAATTTCTGAT
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GAAAAAAATCTAATAGTTGAGACTTCAAATATAAAGTTTTTTGTAAAAAA
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TTTTTTTTCATATTRTGGAAAAGTAATAAATAGTTAAATACTGGTTATAA
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GATAGAGAGAGAAAGAGACAAGGTAGAAAAAATGTTTTACCTACCTTGAG
TCGTATTTATTAATATACGTTACGTAATTCAAACTTCCTGTTACCATCTT
CTATTTGCATTTTACTGTATGGAATATCAACAAGTCATGCCTCTTTATGA
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GTAATTGATGGTTTATACACATAAATATGTGTAGGTATACTTTCCACAAC
AATGCGTGGGAATCCATTTGAAAGGCAAAATCCAAATTCTCTTTTTTTTA
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AGGACAACATTCATTATCCGTTAATTTGGGTCAATTTAAGTGCTAATATT
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AAAAAGAGAGAGAAAATCCCAATTGATTTATTTACTTCATATATACCGGG
ACGTCAGAAAGTATTGGAGAATAAATTTAATTGCGTTTGGAGATGTTTTG
GTTAATTTTATGCCAAAGCTGCATTAACAAAAAACAACCGCTGACTGTTT
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ATGGAGCAAAAAAGGTAAGAAGTAAATCTTTTAGTCTGGGCAAGATTTAG
CAATTCTGATATTGTAAAGACCCTTAAAGAATAGAGACTCACTCACTAGA
GGAACAAAGTTAATGTCAACAATGTTTAGAACATCAATGATAGTTATAGA
CGTGGAAGGCCGATAAAATTAAAGTCTGAAACGGCAAACAAAAAAAGCTT
TTTTGAAAAATCCTAAGATGACTATGACGGACTTGGAGAAGAAGTGGTCT
GTGACCCGTTTAACGGTGTCCCATGCGGTAAAAGAAAGCTGGTGGAAAGT
TTTTCAGTCATATTAAACGACCTTTGCCCAATCAACAACATCAGCAATTA
CGATTGGATCAGTGCAAAAAGCTTTACAATTATCTGACGTGTCACAGAAA
ACGAATTTTGTTCTCCTCGCAAGAGAAGACWTTTACAATTGATKCCGTGT
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GACAAGCAAGAATTACTTGATGATTTTGGAAAGAAAAGTTCTTCCCTAGG
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GTATTGAGTCCCAATAGTAATTGGTTGAGAAAGAGTGGCTATCAGTCTCG
AATCACTTAGTTATGAACGTGCGCAAAGCGTTCTTGGGGCGTGTGGAATG
GGTGATTGAGGCTGAAAGTGCACAAATTCATAAATAATGTCATTTCATTT
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TAAATTGGTACCGATATTCAACTATTCTTGAGAATCAGTTCCGCACTAAA
TTATCTTTTTTCATTCAAGCTTACCTGATTTTTTTTAGAGTGATAACTCT
GTCCAGACCTCAGCCTCCCACGTTGGAACAATATTTTTCGATTTTTTTTT
TTGCGGCTTCATATATATATTCATATACTAAATTTCTTTTCTTTTCTATA
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TTATTATAAATATCTGGAAAACCATGACAATTTAATTAAGTGAACTTCTG
TGTTAGAACTATAGAAAGATAATGAGAATCAAAGGATTTTACTATTAACT
TGACTATCCATCTCAGAGGATGCTTGAACTTGGAGTTCCATATTCCAGGA
GGGATGACAAATACTCTAACATATGTCTGATTAAAAATTGTAAGCCTTTA
TTGAATCGTGTTCACAATTTGAAAACGTATATGACGTCATAAACAATTTA
TATGTAAAATTGGTCCGTACCAAATTTTAAATATGAGCAATCTCTTTGGG
ACTAGACCAAATTGTTCTTTTTGACCAATCCAGTCCGATGCTTTCCTTTG
GACCTGTCTGAGCAAAAAAATTTCTTCAGACTGATCTAAAACGAATTTTA
CCTTCAGAACAAGCTTTAAACTTTTTGAAAGGACCTAACTAGTTTGGCAC
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CCATTCACGACTTTCAAATATAAATTATATCAATTTCTAAAGTGCAAATA
AAAAAAAATTAAATGTTTAATAATTATACTGATAGAAATTGACAATAATT
TGTCCAAAAACACAAATCCAAGTCACCCTCAATTTTGAGGGAAAAAAATT
TGAAGCCTCCTTTTGTAACGACGTACCAATTATCTTTAACTGCATTTGAA
TTGCCTTAACCAGCTTTTTGTTGGATACTTTTACTAAAAAAACTATTATA
TTGTCATAAATCGAATCCGACTTGACCCAAGCTGTAAAACTTTTTACTTA
GTTTTCAGATCCACAACACATATATTCCCGATCAAACACAAATTTATGTC
AATTTATATCATAAAATTATACTTATTTAATCATTGGATACGTCGCAAAT
TAGACTTAAATTAACCGAAATTGATCGTGACAGTAAAATGATGAGAAATT
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GTCAAATGAAGGTTTTAACCGTAGGTTAAATTTGGTGGCACAAGAATCAT
GATGGTTTCAGATTGGCCTAGGATTTATAGATCGAGCCCGTTGACGTCTT
TCAAGGGGGCTCTACCCCCCCCCCCCCTATATCAACTTTCCAAAAAAAAT
TTTTTTTTATAAAGAATTTTATTTGTCTGAAAACCTAGAACTTTAACACT
ACTTTCAATCACAAAACTTTGGCTAGTTTGTGAGCAACTAGCGACACACC
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GAAGAACACACTCATTTATTTTATAAAGTAACACTAACTTGTTTTTGTGT
TGATATACCATTTATATTATTAATTTCTTGCCCAATTATTAAAATTTAAA
TTCAAGTCTATGGGATAAATGTTATTTCGTAAATAAAAAAAACATAATAA
GGCAAACAATTCTGCACAAAATATGTCTAAAATCTCTCAACCCAATAAAT
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ACAAATAATAAGATAAATTATTTGAAATTCCATTCTGACTCCATTTTTAA
AACAGTATGTTATTTACGTATCGTAGTAGATATAATCGTGTAAATCTTTA
CATGAGCCATTATATGGGGATTATAAATATTTATAGTAAACATTTGAATT
TTTTTTTTCTCTTATATTGCATTCTATGAAATATTGTTATTGCAATTTGC
TTTTAAGTATGTTACGTATACCCAATATATAATTATATATGAATATTATA
GGGTGCATACATTAATTCATTTATGTACTCACAAACACAATTTCTTCTGT
TTGAACAACAATACAATCTTCGTTTTGCACTTTAAAGATATATAATATGT
GTATATCAGGGGCATCCGCTGGATTATATATATATTTTTTGCAAGGGGGG
GGGGGGGGCTTACTTTTTGGWTTAAGRTTTTTGGAAAAAAATWTCTAGCC
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AGACAAAAGAAATACCAGTTTATTTTTTTTATATATATTAACATTATAAA
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TTGTGGGATAAGTTAAGAAAGTCACAAATTTTAGCTATAATTTAATACCT
TTATTAGACCATAGAAACTTATATTGACCCCGATTTGGTCTTTTCAACTA
GTGATGAGACTCGGTGAAGCACCTAATTTTTTTCATTGTGATCCTATGTG
ATTTTTTCTTGACCGATAATTTGGTTAGGACCACGGTCTCAGACCGTGGA
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