EMLSAT00000005602, EMLSAT00000005602-701449 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000005602
Unique NameEMLSAT00000005602-701449
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s2supercontigLSalAtl2s2:843530..868630 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000005602 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000005602EMLSAG00000005602-688368Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000024538EMLSAE00000024538-733466Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000024539EMLSAE00000024539-733467Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000024540EMLSAE00000024540-733468Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000024541EMLSAE00000024541-733469Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto779894auto779894Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000005602EMLSAP00000005602Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000005602

>EMLSAP00000005602 ID=EMLSAP00000005602|Name=EMLSAP00000005602|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=363bp
MIGNFDSLKNLLKRREKPTLERWVNKLHYRATTSLLLGSCILVTTIEWVG
NDSRISCIXEGPDDSWTXPANVINTYCYIMTTFTLPKHYNSRVGHDSLAP
GVGSYNWDTGDETYRAYYQWVPFVLFFQAILFYIPHSLFKIWEGGKVTSI
MIGLNNLVLDKDDRETRQKLLANYLVESVNTHNLWAWKMLLVDFLNVVNL
IFNIYFVDVFLGGEFSAYGTRKRIDPMSVVFPRVTKCTFFKYGPSGSMQR
HDSLCVLPINIVNEKIYVFLWFWFLALSIVTILGMFYHLVVTRSSGITKA
LILYRSMNKESNKLDSIGENYQIGDWKLLFIISQNMEPIVFCELIKNLHM
AFLLKKRENILEK
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mRNA from alignment at LSalAtl2s2:843530..868630+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000005602-701449 ID=EMLSAT00000005602-701449|Name=EMLSAT00000005602|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=25101bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s2:843530..868630+ (Lepeophtheirus salmonis)
TTTTAAACTGTGAATTAAATTATTTTAAACAAACAAATCCAAGTAAAAGT CTTGATGTGAATATGTAGCAAAGTTTTACAAAGGATTACACAAAAAGTAA AGCCATGATAGGAAACTTTGATTCACTTAAAAATCTTCTAAAACGAAGAG AAAAGCCGACTCTTGAACGATGGGTAAATAAGCTTCATTATCGTGCCACA ACTTCCCTTCTCCTGGGATCCTGCATTCTCGTTACTACAATAGAATGGGT TGGAAATGACTCACGCATATCATGCATCAMGGAAGGACCTGATGATTCAT GGACAATRCCAGCCAATGTCATAAATACCTATTGCTACATCATGACAACC TTTACTCTTCCCAAACATTATAATTCCCGAGTTGGGCATGACTCTCTGGC TCCAGGTGTTGGGAGCTACAATTGGGATACGGGAGATGAGACATATAGAG CATACTACCAATGGGTTCCCTTTGTACTATTTTTTCAAGCCATTCTATTC TACATCCCTCATAGGTAAGTGAGGCTCATGACGCCATAAAAAGTGTAAAC TAATATCTTTATTTTCTTTTAAATGTAAAACTTAACAATTGGTTATGTAT AACAAGGCAAACAAATAATAAGTACCCATTAAGTAACAAATAATTTAGGA AAATTCCTCGCTATTAGAGTCTTTTTCCATTTTGAGGTTTATAAGTAGCT GGACTCAGAGGAGGGAAATCGGTAATTGTAGTAGTAGTTGTGGCAGYTTG TGTTGCAATTGAAGGMGTGGMACTTCGAAGCTCATCCTCATCACCTTTAG TTTGTTTTTCTTTACTTTTGGGACACTTCTCTGGGATACATCGAAGGGAG TAGTAGTGATAGGAGTAGTGATCTTGTAGTTGACAGGAGGAAGATGATTA ATCGATGAGTTAAAGGAGTTGACAGGAGAATTTATTGAGTTGAAGAATTT ATTTCGAGAAGTGGCATTTGAAAGAACAGGAAAACTGATGCGAGAGGAAG CGGCCCTCACAATATCTTCAAGTAAGGAAGGGCTTTCATCAACGTGTCTT TCTCTGGACTCAAAAATCTTATCATTGATGGAATAAAGATTTTCGGCTTG ATCACAGTCAAAGTTAAACCACCAGTCGCAGATGAGATATTCTTGATTGA AAATGGTTCCATTGGGACAAAGAAATGAATATTTTGTGAGTCCATTGCGA GAGCCTTGACCACAAATGTGAAAAACTTGACATTGAGCCTCAGGATCAGA ATAGAGGCCTATAAAAAAAGATAAGGAAAAGATGTGTATAATGGAAATTG CCAAATAAAGAGTTAATTGGACCTCCAATAAGTCGATCATCACAAGAGAA TTTTGTTATTGGGACAGAAGAGAAAATAGGATAATCCTCTACTGGGATTC CAGGGAGAGACAGATTTAGTGCCTCAAATGGGTCAAGGAGACGAAGAGGG GTTTGAAGTGTTGTTGTTTCCTCTCCATGAAAGGAGGATATGAATAGGCT AGAGCATAAAAGATAAACATGCACTTGATTCGGAATATGATTCATATTGT GTTTATTTAGTGTAGTTGGATTACTGATCCTCCATGAACTATTCCTATTT CTCGTTAAACAATACTTTTTATATGAAAAGAACTATAGTTGGGATTCTTC GATAGAGCAGAGTAGTGGATGAGTGGGAGTTAAAGGCACTCTGTAGAAAA TATTTGAAATAATTTAGTTCGCATCATGGTACTCGGAAAAACGGTCAATT GACATAATTGCAAGTATTGTTGAGTTCTAAGTGAGGAAGAGAAATAGAGT CACAATAAATATGTATCCACATATTTTAATACGTACATATCTTTGGATTT GTCCTATTTACAAGTATATAATTTGTTAGATATATGTACATGACCATCCG CCATGTACTTACATAGTAATCGTAATTATACTATTAAAATAACCTATACT AATTAACATCTTTGCTCCTCTTTACTTTTTTTCCTTCTTTTACACAAAAT AATAATTAATTTTTAATTAATCTATATCAAATCTTACTTTTCTTCCTGAA TTTTACATTTCTAAGTGAAACGTAACATACAAGTTTAAAAAAAGATGTTA TTTGTATACATTAGTAGGTGTTCATTATACTAAAGCATTCGTAGTAGGAA AAACATCTGGATTTGATATTATTATACGGATATAAAGTTTTGGCTTATAT AGCTACAAGTCAGCATCAGCTGTTGAAATTTTATCAACCGAGCAAGGGTT TAGTAAGATATATCTATTGTGTGGAGTAAAGATACTCTCAGGAAAGAGAT GGCAAGACAGTTGAAGTAATAATGCTGATAAAAAATCCTGTATTTAAACT TTATTGACCCATTCACGCAACCTCAACAGTAAAATAAGAATAACTAGGAA TGGGACTTTATTAGAAAACAAGGAGTATAAAACTTTGATCTTTCATAACT AAAATCCCATACCTAACAATGAGATAGAGACAATAGATGAACTTTTTTTT TTCATTTTTATGTTTGTGGCATCTTTCCTCATAGTCCAATTAGTGGAAAC CTCTGTCTATCTCTCGAGACAATCAAATAGCATGTGACCACTTACTATAT GATTAAAACCAGATTACAATTGTACAAATATACAACCACCTATGTTTTAA TTTCTGCAATACTACCGGTCACGATACAACAAGATTTACTTCGGTATCAT TTCTTCGTATATTTATGAGAAAGTGAGGTACTTGTTGCGGAGGAGACATG TTACNCTGCCAATAACTTTAAAATGTAAAGTTATCTAACCACCCTGTTCT TATACAATTGATTGTATCCCTTTGTTTATCAAATAAACATAAAACCTGGG TTGTCTAATGCTTACATTTATAGGAAATTTCTACATTGACATTTTTGACC CAAAAAGTAAACATTTTAGCTATGTGTTTGTTGAGATATATTTCTATTAT AAAACATGAAATTTAAATTTTCATATTAAATGTCATATTGTTCAATTAAT ATACATGCTTACAATATATTATTAGTTCTAATATTCAGTTCACATCATTT ATTCTGATTCAAGCACTATGGAGGAGACTTGTTACACCCCATTTTTATTA TATATACTCGTACTATCGTATACTATATTTAATTATGTTTTTTTTTTGTG CGTAATTTCATTTTATACTTTAATTATCAATCACAGTAAATACTAAAAAT AATATTTTGTAAATTTTATTACTAACTATTTTATTTATTTATCTAATATA TGTAATTGATAAGTATTTACTTTATACTGACAAACTATGTATAATAAAAA GTAAAATAAATGTTTGAATATAACAAATGGAAGTTTTTACATGTTTCCTC CTGTTGTAACATGTCTAATCCTACCTTGTATCATGTCTCCTCTTGGTGTA TCAACTTTTGGTTAGTTTTTAAAACACCAATAAATGGCTATTAATTATTG CACTACATCAAAAATACTTTGGAATTATTTGTCCGAGGCAACTACCTATG CCCTGTTGCCCGAATGTAGAATTATCTTTTAAATTGTGGAACTTATGACA GTTTAAAAAAATAGATTTTTTGTAATATGAATCCTTAGTCTCCCCAATAG TTAATATTTTGAATTCAAATTTTAATTATTTAAATTGTACCTTATATGAG TATAATTATTTTGATACTGGCATTTCATTTTGACCAATTATTTGTAATCT TTTAACTCAGATATTTTTAACTAGGAAATTGTCAATTCTTGTCATAATTG ATGAAGGTTGATTTGTTCAGGAAAATAAAAGTTTTTAGTGACCAGGTTTA 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AACTTGATGAAAATATAGTTAGTTTTATAATATATTAACGATATTACAAG GGATTTCTTGGTAATATTAGGCGTCGTTGAATAGACAAACTCTGTTTTAT TAATATAGTATATAACTCCCCAACAAATCAAAATATTTACTTTCCGTTTT TCATAAGCACACCTACATGAATTTAACGTATATTTAAATATTCTCTCCTA AAAAATGAAAAAACAATGATAATAACTTGAGAAAATGAAAAAATATTGTT CAGGTCAAGGTTAATAGAAAAACAAGCTTAGACCATCATGTAGTCGGGCT TGCTAGAATTTTCAATCTCATGTATTGTACCGACTGCTGGGCAAGACAGG CAGATTTTGGCAAAACACACAACCACTCATAGTCTATGACGTTACTATTG CTAGAATTTTCAATTTAATGAATCGTACCGCCTGCCGGCCAAGAAAAACA GATTTTGAGAAAACACACAACCACTCATACACTATAACGTCTATTTAAAA AAGCGTGGTGGAAGTCAATTATCAGTCGTAAACGCGTTATGGTATAACTT TGTAATTCTATTAACCTTGGATCAGGTTACCAACAATCCCAAATATATGT ACTTCACTTTTTTCTCTCTTTTTTGAAATGACGCGCTGAGCTTAAGCTAC AAGCGCTCTTTGTTAAAAATGAATCACTCCAAGCTAACAGATAGAAACAC TTTGCTTCATTGATATAGATATGTATGCTACTTATTTTCTCGAAAATTAA GAATGAATATATATAAATAGTTTATTAAGGCATACCTTGGTATTATTAGA AATTCGTATACAAATACACATTATTGGAAACCAGGTACTGTTACTATGTT TTTTATTTTGGTCTTAATTAGCCGGACTACAACCTTTCAAAATTTCACAC ATCATACATACATTTGGGATATATTGTATAAGTTTATCCGCACGTCAAAT 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