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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s2 | supercontig | LSalAtl2s2:843530..868630 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000005602 >EMLSAP00000005602 ID=EMLSAP00000005602|Name=EMLSAP00000005602|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=363bp
MIGNFDSLKNLLKRREKPTLERWVNKLHYRATTSLLLGSCILVTTIEWVG NDSRISCIXEGPDDSWTXPANVINTYCYIMTTFTLPKHYNSRVGHDSLAP GVGSYNWDTGDETYRAYYQWVPFVLFFQAILFYIPHSLFKIWEGGKVTSI MIGLNNLVLDKDDRETRQKLLANYLVESVNTHNLWAWKMLLVDFLNVVNL IFNIYFVDVFLGGEFSAYGTRKRIDPMSVVFPRVTKCTFFKYGPSGSMQR HDSLCVLPINIVNEKIYVFLWFWFLALSIVTILGMFYHLVVTRSSGITKA LILYRSMNKESNKLDSIGENYQIGDWKLLFIISQNMEPIVFCELIKNLHM AFLLKKRENILEK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s2:843530..868630+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000005602-701449 ID=EMLSAT00000005602-701449|Name=EMLSAT00000005602|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=25101bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s2:843530..868630+ (Lepeophtheirus salmonis) TTTTAAACTGTGAATTAAATTATTTTAAACAAACAAATCCAAGTAAAAGT
CTTGATGTGAATATGTAGCAAAGTTTTACAAAGGATTACACAAAAAGTAA
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TATATACTCGTACTATCGTATACTATATTTAATTATGTTTTTTTTTTGTG
CGTAATTTCATTTTATACTTTAATTATCAATCACAGTAAATACTAAAAAT
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CCCTGTTGCCCGAATGTAGAATTATCTTTTAAATTGTGGAACTTATGACA
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TTCCGATTTTAGCCTAGTATAGCTTGTTCTGTTCGATAACTTGTTGCTAA
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TGGGAGGGTTGGCATCCCTACTATTAAGAAAAAAACTCAGATAACCAACT
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GAGGCATCTAATTTTTGCTTTAAACTAAACTAACTAATTTATACAAGAAT
ATCGTCAAATTCTTATCATATTTTTTATAGTAGAATAATTTTTTACGACT
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TTAATTTTATAGTTATGAATGGTTCGCAGCTAATGTGTTCATTGTAGTTA
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TTCATGCTAATGTAATAATCCTATCTACTATATCAATGCGTCAGTGAATA
AATATTTATAAAACAAATTTCTAGAACTAATATAAAATATTGACAATGAA
TAAAAAGGAAAATAAATTAAAAGGATTTAATATCTAATGATTGAGTGTAA
TTATTTTTGTTGCGAGGTATCTTCTTTTTCTTTAGGCGTCGTTTAATCTT
CCGAACTTTTCGTATCTTTTTATGATGAGGAAGGGAGTTTTGGAGGTGTT
TTGTTGTGGTGTTAAACGGAGCTGTGACGCGGGTAGGCAACATAGTCGGA
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GATACGTTTCTTCTTCAGGGACTTTTTTTCCCTTTTCCTATCATGAGGCT
TTTCTTTATTTCGAGAATAGAGACTCTCAGCCAAAGAGCAATCCACGTTG
AACCACCAATCACAAATTAAATGATCCTGATTGAAAATAGTTCCACTCGG
ACAAAAGAAGGAGAACTTATCAACGTTGTTAATAGTACTGACTCCACAGA
TGTGAAAAATTTGACACTCAGTCTCGGGGTCAGCATATAAACCTTTAAAA
ACGAAAATGTTAGAAGTTTCATACAAAATGAATATTTTATTAGGATCCTT
CAAAATTACCTCCATTTATTTTACCCTTGCAGCTAAAAGAAGTCCTTGGA
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AACTAAATTTCCATGAGAATTTGATTCAAATATTAAATTTCCTTCTTGTT
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GTCCTCCATTTCCAACTTATAGACATTTCACCTATCCTTTCCGATCTACC
AATTAAACTGTGACTCTAAAATACTTGTTCATCATTTTATATGCACGTTT
TATTACATTTCTGTCTTCCTAATTGCAAAATAATAATAATAATGTGTGTT
TTTTTTTTGTTAATATTTGGAATTTACTTTTCAAAATAATAATAATAATT
ATAATAAATTGATTTAATTTGAGGTAAATACGTAAATAGATGTGACAATT
ATATTAATGAAATGATATTACATAGATATACATTTATGTATAAATTTGAT
TTGTGATAACTATACATACATATATACAATGTATATATCAGTTTAGTCTT
ACTGATAGTGCATAACTACTAAAGGACACAAGGGGAATAATACCCCTTCC
CTATTGAAGTATACAGTGAAGGAAATAAGTGCTTTACCCCTTGCCGATTT
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GGTTGGAGGGAATATAGGATTTTTAGTCTAGGCCAAGAAAAAAATTGTAA
CGAAAAGAAAGGAAATTTTTTTAAAGGATTTATTTTCTAAAAGAAGGGTT
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TAAATAATCAAGGCTCAGCCCCCTCAAAAAAAAAAGAATACATATCTAAT
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TATGCTTAGGGTCATTATAGTGCTGGAAGACACATAATACGATCCTTGAG
AAAAGTAAAGTGTCGCCCAAGATTTTCCGGAGAGTAGAACCCCGTCTATA
CTCCCTGGGATGCAGTCAAGTCTTTCTTTCCCCTTAGCAGAGAAACACCC
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TTGGGGTTATACTCATATTTTTTTTTTTAATATGTAAACATTCTATTGTT
ATAATTACTCTATCTGTCCATATACATTAAGTTAATGTAGGTATGTTAAA
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GAAGTCTCGAAGTGTTTTGGGGATTCCCATAAAAGTGATGGGTTTTCATT
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GTTTTTAATCTTTTAACCACTTTAATTTTTTTTTTAATCCGTTGTTTCGT
TTAATCGTACCGTTTCTCTGGAAATAAGTTATATCTGATAATAACCACTG
ATAAAGTAATCGGAATAAATATTAGGTATGATGGACGTCAAATCATTGTC
TTATCTAGTACCATGTAAAGTTTCCAATTTATCAGTCTATGCAAAATACA
TAAATTTTAATCCGTTATTAGCACCTACAATCTTTATTACTGCCTAATAT
GAAAGTCTTAATTTTTAACCTTTCTCTCTTTTTTTTAATAATTATTATTA
ATTGTCTGGAGAGCGTGGGAAGATATTCATATACTCGAATTTCAAATTAT
ACAGTTCAATTTCAGGTATTTAAAAGTATCATCTTTTGCACAATACTTTA
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GAAACTTAGGTATAGGTAGGTAAATTTTTTAGAAATGTACTTACATTTTA
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GTTACAAAACAAAGGTTTATATTCCATTTTCATGATTTGCTGAACTATTA
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TGTGTTATGAATCCAATCTTCTTCTTTTTTTTGGGGGGGGGGATTGTTGA
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TGATGTATTTTTTTTAACGTTAATTAAAAAAAAATTACGTAGATAATATC
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GGATTTCTTGGTAATATTAGGCGTCGTTGAATAGACAAACTCTGTTTTAT
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AAAAATGAAAAAACAATGATAATAACTTGAGAAAATGAAAAAATATTGTT
CAGGTCAAGGTTAATAGAAAAACAAGCTTAGACCATCATGTAGTCGGGCT
TGCTAGAATTTTCAATCTCATGTATTGTACCGACTGCTGGGCAAGACAGG
CAGATTTTGGCAAAACACACAACCACTCATAGTCTATGACGTTACTATTG
CTAGAATTTTCAATTTAATGAATCGTACCGCCTGCCGGCCAAGAAAAACA
GATTTTGAGAAAACACACAACCACTCATACACTATAACGTCTATTTAAAA
AAGCGTGGTGGAAGTCAATTATCAGTCGTAAACGCGTTATGGTATAACTT
TGTAATTCTATTAACCTTGGATCAGGTTACCAACAATCCCAAATATATGT
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AAGCGCTCTTTGTTAAAAATGAATCACTCCAAGCTAACAGATAGAAACAC
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TTTCTCTTTCTATCTCATTCCTCTTATAAGTTTCACCGTAGGATTAGACA
ATCATTGCAGTTTTTACTTTATATTTATGTATTTTTATAGAAATTTTCTG
TTCAGGATTTAATGTAGATAGAAGTTCTTCTCCATGATACTTATTACGTC
CATTCTGTAATTATTCTGTAATATTTCATGGTAGATACACGAGCTTTACT
TAATGAAATGGATCTCCTCCACCCTCAGTTCATGGATCGACTACCAGACC
TACCCCCCTAGAATACTTAGTAAGAGACAAACTCTCAACCTCTTCCACAT
AATGAGACCTTCCATTTACTTTAATGATCATCCAAATTCCTAATTTTCCG
AATATCTCGAAAAGGATTATCTTCAATGATTTCATTTCAAAAAGTAATTT
CTTTATTACTAAAAGGCTCGGATAATTGAATTTCTACTAATCGCTGTCAC
TGTCTCCAATTTCCAGTTAGAATGAGAAAATATGACGTTCAGAAAAAATT
ACACCATGTACCGTTATTGTTTGATTATATTTAGAGATCATACCAGTCAA
ATTGTATTTTAATATGAACCATCAAATATTTCAATTGTCTCCGTAGCCAG
GGACGACTATTACAGTTAAAAAAACTAGTTTGAGTTAGAAATTACAAAAA
TATGAGTACACATTGGTTTTTTGAGAAATGGACAAAAATACCTTTTAAGA
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TTTTCGCTTGACATTTACTCGGAATTCATATATTTTTAGACTTTAAACAA
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ACAAATCATTATCAAATATTTAGTAATGACAACCAAATGAAAAAATACTA
GTTATTATAAATATTTTAAGACACTCCTGTATAGCTTTACAATGTTAAAA
ACCCCTGCAGTGTTCACCCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACAAAATAT
GATGCGCTTTTGTAAGGACAGCATTAGCTTTTTAATTTTCTGTACCGCTA
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ACAAGAAATGATTAAGAGTCTCCATTAAATAGCGAATGTCATAATTGGTC
TTTGGACTTCAATTTTATCGGGAAATATAGAGTGTATAGTGTAATAAAGC
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TCCCATTCCAAAGATAGTTCAAAACATTTTATGATTACTTTTGAGCCTTT
GCAGAATCCTTCTAGTCTTGAAGAGTAAGTTGAGAGTGTCTTTAAAATTT
TGGACACTCCATTGCAGGGATTGCTTTTACAATTTGGCTATTGTTTNCTT
ACTTCTATTTGATATAAACATTCCTTCACCAGCATCTCCCATTCCAAAGA
TAGTTCAAAACATTTTATGATTACTTTTGAGCCTTTGCAGAATCCTTCTA
GTCTTGAAGAGTAAGTTGAGAGTGTCTTTAAAATTTTGGTACACTCCATT
GCAGGGATTGCTTTTACAATTTGGCATTGTTTCATAAGAAACTTCTTGAG
ATGAATGCTCCATAAATGATAATTATTCCAAAGGTGGCAAATCCAATGGA
GATTCAATGACTTTCATGGAGCTCAAAAATCTATAACCAAATTTCTTGGA
GTTGTTTAGTCTTTTTTCAAATATTTTTTTTATTTTTACTAAAGTGAAAA
AAATTACTTTCAATGTCACAAATTGTCGTTAAAATATCAGCTTGAAAAGG
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TATTGCCTTATCCTATATATTTAAAGTGAATGAAAAAAACTTTAAGGCAA
TCCTCAGTTTAGAAATGATGTCATCCTGATTCATTTCAACGTTTTTTTCA
CCTATCCATGACCCTAGAAGTTTTATTTTACCAGTGTTCTTACAAAGGGT
CATTTTTTTTTTTAAAGTTCTTTTTATGGACTTAAAACTTCTGTATTTTC
TGCATTAATTTCATAGACAATTACGTTTTCAAGATTTTTCATATTTTGAA
TAGATTTGAAAGTTTGAAGTGGAGTAATAGTAAAAATTAAAGACAAGTCA
TATGGATAACAGAAGCATTTTAAAATAGAAGTCCAAGAATTAAAACTAAT
GATTTTTTCAAATTGATGGATATTTTGTATAAAATAAAAAGTATTGCAGA
AGAAGGGTACCCTTGGCAAACGACTCTTCCATATATTCTTATAATGTCAT
TTGAGGGTCTAAAATTTGCATGTTACCTTTATAAGGTTTCCGTCTTTGTA
CCAAAATTCTACATTTCGCACATTATATTTTTGATCAAGATACTGACTAC
TCTTTTTGGATTCACTAAATCATTATTAAAAGATGAAAAAGATGCATAAC
AATCCGGTAAAACAAAATTATTTCATAATTTCCACCGAGTATCACACAAT
AAAATTATGTCACGGATATCTAGGAACTTTAATACTCTTGATTTTTTAAA
TAATTTTTGAGGTTACTCATTACCTTCTATCGCCATTAGAGATTCTGAAG
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CTGCAGAAATATCGCAGTAGGTTTTCTTGATTTTCTTAATATAATATGAC
ATTTGATTTGGTCTTTTGGTTGGTTTTTCAATATTACAACTTTTATTTCT
TTCTTATCTTCTAATTCCTCAAGTAAATTCATACTGAATTTCTCTACACG
TGTAGAAAACAAATTCTTATTTTAGGACTTACTTCCTGTTTTAATTGGAA
TAGGTTGTTCCTTCTCCTAGGAACAACCTTGAGATAAAAATTCCCCTCCA
TGCTCTTGTGTCATACCTATTTTCGTGAMCATTAATCCGAACTGCTTTAT
CAGGTGATTCAGTGAGAACAGATCTTTATTTAAAAATCTGAAGCCTTTTG
CCGGAGCAGTAAATCCTGTAATAACCAAAATGGAAGCATTTTTGACACTG
CTGGCGGACTCCACTAAACCTTAAGTTAACCTAGCAGATTAATATATAAT
AATAATATTAATATATTAAGTCAACTAAGAAAAGAGGACTGCATTATTAA
AAAACCAATGATCCTCCAAAAATTACTTTTACCCCTCAAAATCAGCTTTT
GTCCAATATATCCAAGAAAAGTTGACAATTTTGTAAATATAAATTTTGTG
GCTTTGCTTTTTTTATGTTCCAGAAAAAAAGACTTGCAACTGTTCGTACC
ATGTTGTTTGTTTTATATTTTATATGGTAAATTGTCTACATATACGCGAT
TTTTTTATGAATAGATTTTCTACTAAACTAATCATTTAAAAACCAAAGCC
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GTTGTCAATAAAGCCCTCGACTTGATCTCATAAACGGGAGCAGGTATTGA
TAACAGTCTCCTTTGGTAGATTCCAGAATTCCTCCTGGACCCTGGACGTC
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GTCGATTTTAGGGGCCTAAATAACCAATTTTTATAGCAATGAAAACCTTT
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CTTTTCTCGTCCCTAATTTTTAACTTACATTTTGGGGGCCTAAACAACCA
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GACTCTATTGGAGAAAACTATCAAATAGGAGATTGGAAGCTATTATTCAT
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