EMLSAT00000005786, EMLSAT00000005786-701633 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000005786
Unique NameEMLSAT00000005786-701633
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s310supercontigLSalAtl2s310:69123..92810 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000005786 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000005786EMLSAG00000005786-688552Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000025254EMLSAE00000025254-734182Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000025255EMLSAE00000025255-734183Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000025256EMLSAE00000025256-734184Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000025257EMLSAE00000025257-734185Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000025258EMLSAE00000025258-734186Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000025259EMLSAE00000025259-734187Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto771281auto771281Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000005786EMLSAP00000005786Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000005786

>EMLSAP00000005786 ID=EMLSAP00000005786|Name=EMLSAP00000005786|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=534bp
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LPRNSPSGKIEALSRNIFVDENKLPGVINKDGKRCVPKLIQVEEIVYEQG
MECQHTFKKKCHSTYITDYSSSSNKRCYNSFKKSCHITFKSVPHVEKVNK
CHTPYVKECGDGIDGPEVCSTQYENHCETKYKTYELEQDEPDCKMVEELR
CQNVTVELLHIDLEDSSQPYAVKEKCEKWPVQKCNLIKKIVKKVHPESKC
LKVPREICAPSNCKSKPGKEICHEESRTIIQRIPEEDCDLQPEENCLMES
VLVPRKSFENIEVEQYDLWVPSKKPHTEKVKKCHTPFVKECGEGIDGPEV
CSTQYENHCETKYKTYELEQDEPDCKMVEELRCQNVTVELFHIDQADDAQ
PFAVKEKCEKWPVQKCDLVKKNVKKVHPESECKKVPRQVCAPSNCKTKPG
EEICNEESITQIQNVPEEDCDLEPEENCRMESSLVPRLVPKQNCVKVPKE
VCVNTKKNPKKVTKPIVKQWCYDPNDLTKKVEDL
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mRNA from alignment at LSalAtl2s310:69123..92810+

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000005786-701633 ID=EMLSAT00000005786-701633|Name=EMLSAT00000005786|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=23688bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s310:69123..92810+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGAATGTTAGACTAGTCATACTATTGGTGAGTATCCATTCCTAACGATG CTACTTAGATAACTTTTAAGTTCTATTATCCCAATAGGTTTGTACTCAAG TCTTTGCACATGTTTGCGCTCAGAAACAATTCAGCAAGGATCAATTACTA AATATTCTACGATCAGCACAATTCAATGACTTATCAAATGTGGCAAATTT TGTTAAGATACTTCCTCGAAACAGTCCCTCCGGAAAAATTGAAGCCTTGT CCAGGAATATATTTGTTGATGAGAATAAACTTCCTGGAGTAATTAACAAA GATGGAAAGAGGTGTGTTCCAAAATTGATTCAAGTTGAGGAGATCGTCTA TGAGCAAGGAATGGAATGCCAGCATACCTTCAAGAAAAAGTGTCATTCGA CTTATATCACGGACTACTCCTCTTCATCTAATAAGAGGTGTTACAACTCC TTCAAGAAGAGTTGCCATATCACCTTTAAGTCTGTTGTAAGTATTACATA TTGTAGACCAAAAAAAAAATTAGGATCAAATTTTGAATTTTTTTTCAATA GCCCCATGTTGAGAAAGTAAATAAATGTCACACTCCATACGTCAAAGAAT GTGGAGATGGAATTGATGGGCCCGAAGTATGTTCAACTCAATACGAAAAC CACTGTGAAACCAAGTACAAGACCTATGAGCTCGAACAAGACGAACCTGA TTGTAAAATGGTGGAGGAACTCAGATGCCAAAACGTGACTGTAGAACTTT TGCACATTGATCTAGAAGATAGTTCTCAACCCTACGCTGTCAAAGAAAAA TGCGAAAAGTGGCCAGTTCAGAAGTGTAACTTGATAAAAAAAATTGTCAA AAAAGTTCACCCAGAGAGTAAATGTTTAAAAGTACCTAGAGAAATCTGTG CTCCAAGCAACTGTAAGTCTAAGCCAGGGAAGGAAATTTGCCACGAAGAA 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