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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s319 | supercontig | LSalAtl2s319:3561..22769 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000005900 >EMLSAP00000005900 ID=EMLSAP00000005900|Name=EMLSAP00000005900|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=484bp
ATITYSSKRLSDDETSLKYKLYTSKSVLKFSPTLQNHNQSYRCEAWNEAG KAREPTYVTLDVKFSPNVVVMPIXAGVIREGDKVGFRCTVSANPPPHEKS YRWYIENEPIRSHFGFYYEIYNVSRHFNDKQIKCTVENDLGKAMGVRTME VEYGPNIIQNPKTVAGDREEVVTLHCIVDSNPPSQYHWTKDDSREIISKS QNLTLRLSDATAGEYLCHAITPGYTSVTTSPARVLLKGKPVLRSKTLQTG SIGQDAHINCEAHSVPEPNVVVWRYHGKILNEENPHYRIVNSPMQRGVRS TLIVRGTVDSDYGPYKCQVQNSYGRAELLIELEREQPFPLLVMVITIFAG VILVLTVVIVVILCRKRLFCCCNLPHTKSSPEKYFNNHMGTNNAEALEYN PCNTNILIRDKKSCEDVISTGYIRYGNYVRDFEPPQLRRDSLYSSGTSQS VLNISDPRFPATYSNTFHRQIPSGIKGPSQYXSV back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s319:3561..22769+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000005900-701747 ID=EMLSAT00000005900-701747|Name=EMLSAT00000005900|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=19209bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s319:3561..22769+ (Lepeophtheirus salmonis) GCCACAATTACCTACTCCTCAAAAAGACTCTCAGATGATGAGACCTCTCT
CAAATACAAACTCTACACCTCAAAGTCAGTCCTTAAATTCAGTCCCACTC
TTCAAAATCACAATCAAAGTTATCGTTGTGAGGCTTGGAATGAGGCAGGG
AAAGCGAGGGAGCCAACCTATGTTACACTTGATGTCAAATTCTCTCCTAA
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CACATATCGTTAGTATAAATGCCTCATGCTTGTGATAATTAAAGCTTAGT
GAGACGACTTATCAAGTTGACAGAGATCTCTACATATAATCTAGGGTTAT
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GGCCCTAAGGACGGTTGCTCTTTGGGATCTGTGCGTTCAATTCCCGGTCC
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TCAGTAATATGTTAAAAGCATTCTGCCTATTTGGTGCGTCAACATAAAAA
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TTTAAATTCAAAATGGAGTATTTTCAATAGATCCACTAATGCTTAAACCA
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AATAATATTTTTCTTACGCTGACGAACAGATTGGTAGCTCTTGACAATGA
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GGCTATTAGGGGATGTAATATACTTATTGATGTTGAAGGTAGTCTGGATG
GAGATGCCAATGGCCTTTGCAGCCTTCTCCACACTGACACTGGCGTTGCC
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AATATACTTATTGATGTTGAAGGTAGTCTGGATGGAGATGCCAATGGCCT
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AACTCAACTTTAACTATCGATTGATTCAAGAACGCTAAAATGTCGTCTTT
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TTTTTATATTGCATTTCATTATTTCTTAATGTATTTTATACATGGTTGTA
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GTACGGCGTCATAAGAAATCGTAAATCTAAAAACCCACAGGTTATCGTCT
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ATAGAACGAACTTCCCTTTCAGGAACCTGGTCCTCCAACTAAAGATAGAA
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AAATATTCGAGTAAATTGCMGGTKCCGGAACTAATMTATCCACATCCAAA
AAAATGGTCTCGGATATGGCATCTCTTCGAATAATACAAGTTCACTTATA
CCATATCCAGGTATTTCGTATCCGGGTCTTAGTCCCCCTGCCCTATCTCT
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TAAATTCTAATTGTAAAAAAGTATGAAAAATGCCCCTCATATTTATCGTT
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GATGCATCTAGCTCAAGCCTTCCTCACGGTTGACTTGAAGGAGAAAMTCC
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ATTATAAAAAACAAAATCGTGTCGTGTACGATACACTTAATATTTATGAT
CTCAAAAACTCTGTCAACAAGTGCTGGGATCAGATGTTTTCTGACTAAAT
ATTAAGACGTGTTCCGTTTTCAGGTAGTGTCCGTTGGAAGAGCCGAGGGC
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AGTCATTTAACTCAATATTTCCCAGTCTGGGAAAAGGTACTCAAAAAGAG
AAGTATAATTTATAAAAAAAAACGTCATTCTGTTAAAAATGAAGGAAATT
ATTCATTAAGAAAGGCCTTTTATTTGTCATTTATATGTAAAATGAGAAGG
CTCATAGTGTGTGTTTTTTAAAGTCACTTGATATGAGAAATAAATGCAAT
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GTTGGATTCCGATGCACAGTCTCAGCCAATCCTCCTCCACATGAGAAAAG
CTATCGATGGTACATTGAGAATGAACCTATTCGAAGTCATTTCGGATTCT
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GGTTGAATGTGAGTAGTTGTGACAGTAGTCATACTATTAATTGGTGATGG
ATTTGAGTAAGACTCGAACTCGGGGGGGGGGGGGGAAACTTGKCRCWTTT
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TAGGAAGTTTATTTTACCAGTAAGAAGTCATTCAATTTTGAGAGGTCAAG
GTGACAAAAGATGTTTCAAATGAAAAACTAACCTTATATCTTTAACAAAT
TAAAATACATAACTCATTTTCATTTTCATGTGGTCAACGATAAAAAAACA
TGATCCCCCATAATTTTTGAAAAAGTTAAGGTCACACTTTTATTGGGAGA
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GYGATAACTGACTTAATTMTTMTACTTAAATTTCATCAATTCAAAAACAA
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GATGACTCAAGAGAAGTATGTTTTTTGATAACCATTCATATTATTTATAT
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TAAAATATATTTTCTTGTGTATAGGAGAGAACATGCATTGAAAAGATACA
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TGTGAAACTTATTAAAATGTGTTATAGAAATAAAATGAAAATATTAAGCA
TAATTAAAGGTCACAAAGTGAAATTTATTTTTTGATAATAAAGAATATAA
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TTATACATTTTGTCTAAAAGGTGATATTTGATACATTTTATTAAAAACAT
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AAAATTTTTCCTTAAAAAATACAAATAAACATGTCACATCAACAAATAAA
AAAAAATTATGAAAAAGGAAAGGAAAAATAGAAAAGTGCCATGGTCCTGA
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GTCAGTTTTGTTTCCAAAATTGTATTTATTTTGGTATTTTTTTCTTTGGG
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TGTTGAGTTTTGTAAGATTAGAATATCCATAAATAAACTCACTTTAAATT
AACCTCCATTAATATTTGTCACTTTTCTATGTATATAGATCATCAGTAAA
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ATGCCACGCAATAACCCCTGGCTACACATCCGTCACCACATCTCCAGCTC
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GGCTCTATTGGTCAAGATGCTCACATCAACTGTGAGGCGCACTCTGTTCC
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GTAAATATATTTATGGAAAATGTTGAAACCCATCTAAGGTGAAGAATGGG
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ACGAGATTTGGTAGAACAAAAAATGATTTTGCTTTCCAAAAAATCTTAAG
CAGAAGCTCGATATTGATTTCAAATTTGCATAAATTTGTAGTTGAAGTTG
CGTGATTATGATCTTATAATACTTAATTCAGACTATATTGGCAGTCAAGA
ATCTACGAGGTTTTATAGGTATAACTGATTGTTTGGCGCTTGAAGTGATT
ATTTAATTAGTTGCGTTTGATAAATTCACATGAAAAGCTCTTTCTTGATT
AAAATTTCTTTCTGTCTATGATATATTGGCACTTGACAATGCACAAAAAA
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TGCTCCATGAGAAAGATGGCTCTCGAGAAATCATGCGTAGGGTGGTCAGG
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ATACAGTCATATATATGTCGTGTACTAGAAGAAACGCTAAAATGAGATGA
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GTAGTGAGGTAAACCACTGAGAGGATTCTGCGAGGGATTCAAAGGTGTGG
TGATAATTAACAGCCAGCTACCCTTCTTTTCTTATGGCACATCCTTGGAT
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GGACTTTTTCTCTTCGAATGACTGTCATGTTTCTTTATTTTTCTTATTGT
CTATTTTGTCTCTGATTCAAAATCATTACATAGAGAGATTTTGAGAGATT
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CTGTTTGTTGTTTAAGTAATAAACATTACATATTTTGGTTTTGAAAGTCA
AACACGCCAGTATCTTTATTGTATCACGCAACCTTTCCTTCAGAAAGAAA
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CAATAATGCATAGTATTGTTTAATTAAAAGAGTAGTTATGATTAGTTATT
TTACTATTTCTATGAAGAAATAGCCCCCAAAAAAAAAATTATAGAAATTG
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TTGTATTCTGTTCTTTTCGGAAACGGAGCATAACTATAGAATAACTCATC
ACGTTGTGTATTTATGAAAAAGAATAAATTATGGAATCGTATGCCGTATC
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AAGGTGAAATGTCCTGAGGGAAAATTGTTAAAGGTGAAAGTACCGGATAC
TAGAAAATTCAATGATTGTATTATAATCATCAAAAGTACTACTTTTAACT
CTTTACTTAAAAGTATTCGGTTGTTTTTTATTTGTTTTGCTTTTAGTTGC
AAATTGTACAATCTACTTATACAAAATCCTAACTCGTATGGTACAGTCAA
ACCTGGTCTAACAACGACCTGTTTTAAGCGTATCACTTCACTAAGCACCC
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GCTTTTTCAGTTTCTTTTATCAGACGTCTTGGTTTAGGTTTGACTGTATA
TATAAATATACTTTTTACTGTATTTATCTATTTTCATTTTTATAGAGAAT
CCTCATTATCGTATTGTCAACTCTCCTATGCAAAGAGGGGTACGAAGCAC
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AAGTTCAAAACTCGTATGGTCGCGCCGAGCTTCTCATTGAATTGGAAAGA
GAGCGTAAGAAAATATAGTTTAATTAATCATTTGAGTATTTTGTTGTCTT
ATACTATGTAAATTATGGATAAATAAGCAAACATGCTGACCCATGTTTTC
GGGGTAATATTATTTTTCCCTGTACAAATACTGTTGATGCCCCTCAATGG
TTGTACATGCCATTTTAATTAGGGTTTATTTTTATTTTTGGATAATAAAG
AAGTAATATGGTAAAATTGAACGAGACTAGCTTAAGGGATAGAACACAAA
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TTCGCTTTATGTTCCAAATATTTGTACTTTTCAAAATATAGAATGCCCGA
AGTATACGTGATGTTTTGATGTAATAAGACTTCTACTAGCATAATCATCT
ATTATTTTCTCATGCAAGTTCCACGCAAGTTAATTTTTTTTGAAAAAAAT
TTCAAAAATCCCTAGCTGTTCTCAAAAAAATTAAAAAAATGTAATTAATT
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TTTGCCAAAAAATTTCTAAAATTAAATTTAAATTTCACAAAAGATGTCCT
CCGGAGCKCCTCCAGCGGATGCCCCTGATGGCTGAGGAATCCGAGCCATT
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GTGTCGGTCCTTATTTAGCGCCAAGGGCCGCGGTCCAGTCATGCCCCACT
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TCCATTTGTTTAAATTATTCCGTCATATAATACCAGGGGTGTCCGCAAAA
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AGTTTTTTCTGAATAGCTATGTATTCTTAATTATAAGTCCATATACATAA
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ATTGGAGGTTCAGGGTTTATTGCGTGAGCCCACCACATATTCAGTCTAGG
TTAAGATTCGGATACCCGGGCCTATTTTATTACCAAAGCACTATAGTAAT
TGACATTCCAACGGAAGTTAAAGGCTTTAGGCAATTAGGAACTTTGTATG
GTAAAAAAATTGTCTATATCCCCTCGATATAATGAGTTATGAGCTATTTA
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TTTAAATTATTAAAAGCAAGATGTGTAATATTTTTACTGAGCAAAAAAAT
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AAAAAAAAATTATAAAAATCCAATTTCAATACCAAAAAAAACAATTTCTT
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TAATTGTCCTTAGCAGTAGAAATAAGTAACCCAAAAACGGGACATTCATT
TATCCTTTTATGTCCAATTATAATGTATAATTAGCCAATAATTCATTTTG
GGGTATTTCTTTTATTAATCATGCGCTAAATCAATGTTATTTCTCATCAA
TTAAGTAGATTTTGTTATTTCTCATTTAATTTGTATTTGATTATTTAGAA
TCTTTTTATATACATAAATATATTTGTTAACAATATGAGAGATTATTGGT
GTTTTTGTTGTTTTTTTGTGAACGCAAAACTATTGAGACACACACAAAAC
TTATTTTAGGGAAGCAAATTAATTTATAAATAAATAAAAAACTTTTTTGT
AAAATAATTCCCTTCATTTCAGAGCCCTTTCCTTTACTCGTCATGGTCAT
AACTATATTTGCTGGAGTAATACTCGTTCTTACTGTTGTCATCGTAGTCA
TTCTATGTCGAAAGCGACTCTTCTGCTGCTGTAATCTCCCTCACACTAAA
TCCTCTCCAGAAAAGTATTTTAATAATCACATGGGAACAAACAATGCAGA
AGCCTTGGAGTATAATCCTTGTAATACCAATATTCTCATACGGGACAAAA
AGTCTTGTGAAGTAAGTTTTGATTGACCAAATTCTGGCAAATTTTAATGT
ATGTATTTATAAAGAACTTAGACTCGCCTGAGGCGGATAGTGCTTGTTGG
GATGCATCTGACTCTCAAGATGGACTTTATCGAATAAGATCCGAAAACGG
GGAATCTTTGACCACTCAAATGTATCGGGATGGGACTGAATTAGAACCTG
AATTTCCTCCTAAACCTGTAGGTATTCAACATGGGGGGCAGGGTTAGTGG
GCCCTGGGGGAAAGATAAATAAGTGGGTCATTTCCCTTCGTTTTTATTTT
AAATTTGATTTAGAAAATAAAATGCGGTTTTTTAAATGACCTTTTTTTTA
AGAAAAAGAAATATTTCGAGTGGCCTTTTGTAATAAACTTTTTATTTTAT
AATGACCTTATATTTTATTTTTAAACTTATAGGATGTTATCAGCACTGGG
TATATTCGCTATGGTAATTATGTTAGAGATTTTGAGCCTCCACAGTTAAG
AAGAGATTCTTTGTACTCAAGTGGAACTAGTCAATCTGTTCTCAATATCT
CAGATCCACGGTTTCCTGCAACCTATTCTAATACATTTCATCGACAGGTT
AGTGTCCATTAGATTCTTTAGGAATTCAGTGTTAGCATGAGAATACCAAC
TTTGGTAGAAAGTATAAAATAATCATACAAACCGTCATAACTTGATATAA
TAAAAAATATGCTCAGAAGTCAACGTTCTATTAGATACCAATTTTTTACT
CCGTAAATGAGATGAGAGTAAAGAATTCCACTAAGGATTTTTCCTTTTTA
TAAGTACAAAATGTAAGCTGGCGCCAAAAAAAATTTAGAATATGTTTCTT
TTTAAATTAATTTCATATTTATTTTCAATCAATACCTTTCATATCATAAG
TAAAAAACAGGATCAAATATCCACTAATTGCCTCGAAATGGGGAGTGTCA
AAATTATCTAAAAATTCAGTTTTTTTATCTAAATACTTCGTATTTAAGAA
AATCCAAACATAGTCAACAATTCATCTGTAAAATATCCGGATTTGATTAT
ATTTTTCATAATCATCAAAGGTTTTTTCCTTTCTATTACCAGATTATTTG
CAGAGATATCAAAATGGTTCTAAATGCTATAATTTTAAGGACATTGCACA
TAACTTTTTTCATCTAAAAATATTTTTATATTTATTTTTTGACTTCGATA
TGCTGATATTACGTCAAAAATTAATAAAGTCTTGCAAAAAAAATTCAAAT
ATCATTGGTAATAAAAATAGGTTAATTTTGTCTTCCAAATTTTGCTAAAT
TTATATTTCTTACGTGTATTTTAAACGAAACATAGTCAATCATATCACTA
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TCATATCATGACAAATTTTAAGTCATTAAAAAAAAGTAGGTAGTTTCTGG
CTTTAACTGTTTAAGCATATTAAGAAAAAAAAAATGTAATTACAATTAAA
AATGAAAAAAAAAATGGAAAGCAGTTATATATAAATTTGTCGTTCAGAAG
ATGATAAAAATATCCAGTATACTCAAAATAGCTCTACAGGCCCAGATTAT
AGCTAATAATTTCAGTAACACAAAAAACTTAGCTAGAAAAAAATGTATTT
TTAATGAAAAAATTATAATGTCTACCCGAATTTATTGATTGTTTAAAAAG
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