EMLSAT00000005984, EMLSAT00000005984-701831 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000005984
Unique NameEMLSAT00000005984-701831
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s322supercontigLSalAtl2s322:930431..963136 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000005984 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000005984EMLSAG00000005984-688750Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000026105EMLSAE00000026105-735033Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000026106EMLSAE00000026106-735034Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000026107EMLSAE00000026107-735035Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000026108EMLSAE00000026108-735036Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000026109EMLSAE00000026109-735037Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000026110EMLSAE00000026110-735038Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000026111EMLSAE00000026111-735039Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000026112EMLSAE00000026112-735040Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000026113EMLSAE00000026113-735041Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000026114EMLSAE00000026114-735042Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000026115EMLSAE00000026115-735043Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto780094auto780094Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000005984EMLSAP00000005984Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000005984

>EMLSAP00000005984 ID=EMLSAP00000005984|Name=EMLSAP00000005984|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=617bp
MSESSTLFNTASKTASVNKLARVRSALKKQFYDGSSNQIANKQSVSTSSS
AFRRPKLGDISRLKAIDNEDLPSSLLFSDDNNLIMSSSTTGDSNASSXSS
SPKASFTSNFVSVIEGTKNLGLNSGEKQRTDSLTSSSNDSQDQEQQLQDI
ESSDEDKLVKMNPGSVPLPSKCSTQLKKLIRDYSFKSASSGRGSIDSAMS
SNNPSNECELPIFPNLPFSPYGSPNASPRIRRKPLRETKRVNSISEDNGE
YVQLNQYKLEQNLGQGSYGIVKLVHNKEDDNHYALKIVSKKKLRRKAGLF
VYREIATMKKLDHPNVTKLVEVLDDPEDENMYMVFELLERGEILEVPTDS
PLTEEQAWLAFRDITLGLEYLHYQKIIHRDIKPSNLLRADNGSIKIADLG
VCNEFDGHDAFLTNTAGTPAFTPPESLSHKPGDEPFSGKAADIWSMGVTL
YSIVYGKVPFHDENILALYNKIRTQPLVFDEDSDISISEELKDIIKRMLV
KDPNERITLQELKQHDWVTGYGIYPLLTEEENCVLVEVTDSEVKNSIHTV
PKLDTLILVKSMLKNHSFSNPFNSLRARFQSEGRSNSAPGAYDIYLNSTG
TTDPSLPKLEEKDKEED
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mRNA from alignment at LSalAtl2s322:930431..963136+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000005984-701831 ID=EMLSAT00000005984-701831|Name=EMLSAT00000005984|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=32706bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s322:930431..963136+ (Lepeophtheirus salmonis)
TTTGGAGACTCAGTTATATATGGTGAAGCATTGTGATATTGTGTACGTAG GGTCTCTCTAGATCTGACATAATTTGGCCATTTCTTACACTTCTTGTAAT AATTAAGAAATTACCTCCAAAAAGGAAGGTTCGTGTAGTATACCATTCAA ATGTGATCACCTTGTCTCCTGCAAATATCTATATTTTGGTCAATATTATC TGTTCAGTCGTGAAATAATCCTTCAAGTACTAATCCTTCAACATGAGCGG TAAGTCAATTATATCAGCCCTGCTTAACTAGCTTCACTGAACATATCAAG CTGCTATTCACAAGGAACAAAAAGATTTCATAGCAGACTGATTTAAATAT TAGTTTCAAAATTTTGTGTTTTTTTTTTTTTGTAATCTTTCTATACTTTM CCCGGGCATGAAGGATCCATATTTACAATACAAACACAGACACTCTTCAA ATTAAAGATAAATTTGAAACCTACGTTGTATTATAACATATGTACAACAT GAATACTTCTTTTTATCTTCAAGCTGAGTTAATAACGAAGAAAAATAGTA CCGTTAGTCCATCTCTTCTTTAAGAAAAGAATACTTTATATAACACGTTC ATATAAGTTATAACTTATAATAACTAAGTAACTAGTGATAGAACAAAGTT TAGGAATTATATAATTATTTAGAAAAAATAAATCTATTATTCATAATAGA TTTGCTTATCCTATAAATGTTTATCGTATTGACAATCAAAAAATGACAAT CGAAATCGACGATTTCTATTATTTTATCCACATTTTTTAAAAATTAGTCT TGCCTATTATAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATTTTCTCTTTATTGCTATCCA TCTTTAAACGCGCGCTCTAAAAATAAAAAGTTAAACACGAACAAACTGTC 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TTATCTTCACCATCATCAATCCTACAACCAAAAACCCCGAATTTATTTAT CATTGTGTTGTATTTCAAAAAAGCAAATAAATGAAACTAACTATTTAAAT TATGTCCAAAGATGTAAGAACGAACAGCAGATTGTTTTAAAGTATCATGT TCTCTTCTTATCAAGACCCTGTATGAATATATTCAACATTACATTTCAAT TATGCATTTATTTAAATGAATTTGAATATTTATACAACAATCGGAACAAT TTATTTGCGCTAATCACATAACCTATTTTTATCTTGCATATTGTGTTACA TAAAATTGATTAGTTAAAAAAAGAAATCTAAAAACCAGTAGTTAGACAAG AATACATACGATAAAGTGGAAACGTCCTCTCACCTCTCCATGTGTTATCA AAAGTTATGGGAGATACGGAGCATGTTCGAGGAAAGGGTTGAGGAAGGCT ATGGAGTAACATTGAGGCAGAAGGATCTTGATGTCTGCAAGAGATGACGA AGACATGAAGATAGATACACTTATTACGGGGCTCTTTTTTATTGTTTACA AAAATAAATGCCAGTTAAACAGTTCAATGGTACTGCTACGTTAATCCTGT CACAAATTGGAATATGGAGAATGTAATGAACTTGATATTTACAATTGACA TATATAGCAGTATCTTTTTATCTTTCTGAAAAATAAATAGATGTTATTGG CACTCAAAAATAGAAAGAATACATACGATGCCAGTCATTTATCAAGTATA TATTTCGTTATTAGAAAAATTATAGAATATTTTATTCAAAATGTTGTTTC ACATATGACAAGTGTAAGAACTTCTACAAACAAAGGACATTTATCCTATA TATGAATTTAGTTTTCTTGATCTGACTTCAGCTTATTTTATAAACGTACA GTTCCATTTCTTTTTAACAGCAAGGATTTTTTGAGAAAAATTCAAAATAT 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CTCTTATATCAGAGCTGTTTTATCTTATTACACAATTATTTAAGGAATAC TTTGGCTCTTATTTTTTACATGTATTGACCTATAGTAAATTTGGGGGACT TCTGTGTTCACTGGACAACTTTTAAAATGCAATTGTCGAACAAAAACAGT CACTAAGTGTATGAAAAATGTGTGATGTAATCATATCTAATAAGAAAGTT ATGAGTTTCTTTTGATTTGAGAAGTATTATAATTAATTTTGTATATAAAT TAAACGAAAAAACTTTAAAAAAGTATTATTTGTGAGGAGGTACAACTGTT AGATATCGTAATAAACAAATAAGTAAACAAGAAACTACACAAAATCAACT CATTCCAAGGGGCACAAGATGGAACTACCATTCGTGGCCATGTATAGCAT ATACGTTTAAGTAAACAACAAAAATCATGCATTGTTTTCTACCTAATAAA TTCAAACTTTTGTTGATGAAATATTTAATAATTAAAGATGAAAATAATAT GACAATGGAAGAGGGAGTGTCTTTCTGTAGTTGCTACCTGAATAGATATT TTTCCATTTTCTAAAGCTGTTATCCTTATTATTTTATTCTTGAAAAGAAA AAGATAACTATAAAGTGATTACTTGTTCGTGAAGGACGAAAAATTACATT GGGTATTTACTATGGAGTCATAAATTTGTTTCCAGGCTTGTCGGTCGGAG TTTTTTCTGATCAATGATCAATTTCGATTAAATCGCTGATCGTAGTATCA CAATCGGTCTTGATCTTTATATGGATATATCGTAACAGAAATTATTAAAA AAAAAATGCGATCCAATCAATTAGTACAAAATTACATATCATGTAAAAGT GCTGTGGTTTTCGAGACCAGTCTTTGTCTTGAGACGGGACTCGAGACTAT TTTTTTGAAGTTTTGGTCTCGTCTGGGTCTTGAATATCAAAGTCTTGGTC 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