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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s322 | supercontig | LSalAtl2s322:930431..963136 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000005984 >EMLSAP00000005984 ID=EMLSAP00000005984|Name=EMLSAP00000005984|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=617bp
MSESSTLFNTASKTASVNKLARVRSALKKQFYDGSSNQIANKQSVSTSSS AFRRPKLGDISRLKAIDNEDLPSSLLFSDDNNLIMSSSTTGDSNASSXSS SPKASFTSNFVSVIEGTKNLGLNSGEKQRTDSLTSSSNDSQDQEQQLQDI ESSDEDKLVKMNPGSVPLPSKCSTQLKKLIRDYSFKSASSGRGSIDSAMS SNNPSNECELPIFPNLPFSPYGSPNASPRIRRKPLRETKRVNSISEDNGE YVQLNQYKLEQNLGQGSYGIVKLVHNKEDDNHYALKIVSKKKLRRKAGLF VYREIATMKKLDHPNVTKLVEVLDDPEDENMYMVFELLERGEILEVPTDS PLTEEQAWLAFRDITLGLEYLHYQKIIHRDIKPSNLLRADNGSIKIADLG VCNEFDGHDAFLTNTAGTPAFTPPESLSHKPGDEPFSGKAADIWSMGVTL YSIVYGKVPFHDENILALYNKIRTQPLVFDEDSDISISEELKDIIKRMLV KDPNERITLQELKQHDWVTGYGIYPLLTEEENCVLVEVTDSEVKNSIHTV PKLDTLILVKSMLKNHSFSNPFNSLRARFQSEGRSNSAPGAYDIYLNSTG TTDPSLPKLEEKDKEED back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s322:930431..963136+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000005984-701831 ID=EMLSAT00000005984-701831|Name=EMLSAT00000005984|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=32706bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s322:930431..963136+ (Lepeophtheirus salmonis) TTTGGAGACTCAGTTATATATGGTGAAGCATTGTGATATTGTGTACGTAG
GGTCTCTCTAGATCTGACATAATTTGGCCATTTCTTACACTTCTTGTAAT
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TTTATAGCATTGATCAATTCAATTGTTGAGAGTATCAAATTATTTAATTT
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TATGCATTTATTTAAATGAATTTGAATATTTATACAACAATCGGAACAAT
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AATACATACGATAAAGTGGAAACGTCCTCTCACCTCTCCATGTGTTATCA
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ATGGAGTAACATTGAGGCAGAAGGATCTTGATGTCTGCAAGAGATGACGA
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ATGAGTCGTGTTGTGTTGGTCCTTATATAGGTCGAAAGACTGAAGTCTTG
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TGTCCRCAYGGGYAYYYATACCCCCCCCCCCCCCCCACCAAATTAAAGAA
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTTTGAAATTCTTT
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TACTTACAAAATTAATGAGGACCGGACTGAAAGGACTTAAGTCTTTTTAG
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AAAAAAACTAAAAAGAATGCACTCCTATCTGAACATTCTTAATAAATTTG
TCAGTCTTGTGACTTTTTTGGTTATTACAACAGCTACAAATGACATTGTT
ACAAACTACGTTATTTCAGCCGTTGAATTTACTCTTAACTAGGGATGAAA
CAATTCCAAAATTTCAGCTGATTCCGATACCATCTTTATGAACGATTCTA
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GAAAAAAATGAGTTTTTTCCTTGAAATATTGTCGGGCCCTTATCTAAATT
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TCATACTTTCAGCTATTCAATGCAATACTTTTAAACTTTTCAAATTTATT
CGTTTTGAAGCTATGAACCTCTGAATAAAAAGCACCTATTTCCCATTTTA
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CTATCTTCAACAACGACGGCTTAACCCAGCTTTGAACCTTAAAAGAGCGA
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CCTATACTGCTTTTGTACCATTTTTGCTGTTGGACAGTGTTATTAGACTT
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TTAGATTACACAACAGGTTTTAAAGACTCTTCCATAATATTTTTGGAGAG
AAAATTCACTTAACCCTGAAGATATGGGCAACTTCAATTMGCTCCAACTA
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GTTTCAATAAAATATGTTAAATATAAAATAACCCTAAGGACTCTCAATTA
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TTTTGGTTGCCATTTTTAAAAATTTTACCGTTCTGTTTTAGCTCATTTTG
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TGAATAGACTTTCATTTTCAATGGAAGGACCTCTGTATTTTGTTATGTTA
GTCTAATATTATATGTTAATATTAAAGAAAAAATAATTTTATCTGGCACC
CCCTCAAGTAGAAGTTCCTAGTCTTCAACCTACGTATTATATTTCTTTGA
TCCTCATATCTTTTTATTGGTTGACGTTTTGAAATAATAAAATTTTCCTT
TTTTTTTTTTGCTTAATAATGTATATAATTAAATGCGTACAGGTATTGGT
GAAATTGGCATTATTAATGCAATTCTGAACCTTAAAAAAGACCGATTCTG
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TTTCTATCTAGAAAATATCAGTTTCTTTCATCCGGATTTAACTTTATCGA
TGCCTTAAAGTATAAGTTACAAGTATATTATTGATCAAGGACAACAACAC
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CATACATACATTAATTTATATTACGTAGAGTTTATGAAACAAATGATAAT
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AGCAGCATATATACGGGTAGAGAATGTTAGTATCCAGAGTGGGTCCTTGG
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ACATTTAACCTGCCTTAAATATAAATCGAGTTAGTGCAGTCGGTTATAAA
AGAAGCTTAACTTTAGACTCTAAGTATATATCTGTAATGATAAGTTTTTA
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GTATCTTTTTGTCAACTGTCGTTTTATCTGCTCCCCTTCCCTTTGATCAG
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GTATATGGTCTACACTTCTTAATACTGTCTTTAAAAAGAAGGAAAATTTG
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CAATAATTCTTAGACACTTTTCTCAGTTTAAAAGGAACAAGTTATAATTC
AACCTATCAAGGTTCAGAACACTGATTAGGCGAAAAAGAAGCAAAAATAT
CGACGGCTGACAAAGAAAAACATTTTATATTTTGCAAAGTAACGCCCTAC
CACCCCTCTCAATATCTTGTTATCTATACTTTGCAACCTTCTCACTAAAA
AGAAAGTGAAAAAAGGTTCATACTCAGTCCCCATTTGCCTAAATATTCCG
AAATATGACATTACTATTTAATAATTGTTGGGAACAAAAGTGATTTGAAT
AACAAATGCCTACATCCTTACTCAATAAAGTAGTCATCAGTTGAAAATAA
ACAATGCACCTACTGTGGGGAAGTGATTGTAAGTTCAGAGCACCTCTTCT
TCCTCTGCCCGTATGTACTACAATTACTTTACAGATTAGGGGAGATTGTA
CAACAATAATAGGCTAATGAAAACCACGAAGAGACATTGCCATTCACCCA
GAGAAGTTCAAAATGGAAGCCTTGATAGCAAAAATAGGCAAAATCTTGTA
CGCGGCAAAAACGCGAATAAAAAGACAATAAATCATGGATGGAGGTAATA
GTTAAGAGAGTAAATTAATCTTCTGTGAATAACTATGGATTTTTTTTTGT
ATCCATAACCTAAGCCCTCCTTGACCCTTGAATTGAAACTTCAAAAACTC
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TTTTTAATCACTTAAATTTGATAGGGAGAGTTTTTGAGGTTCCAAGATTA
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TTTATGCGAGAACACTATTTTTTTATTAACAGTGTAATAAGCTGTCTTAG
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TCTATTAATACTTCTAAAAGAAAAAAACTGTTCTAGAATATTTGTATTGA
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TCTGTGTTCACTGGACAACTTTTAAAATGCAATTGTCGAACAAAAACAGT
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TTCAAACTTTTGTTGATGAAATATTTAATAATTAAAGATGAAAATAATAT
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AAGATAACTATAAAGTGATTACTTGTTCGTGAAGGACGAAAAATTACATT
GGGTATTTACTATGGAGTCATAAATTTGTTTCCAGGCTTGTCGGTCGGAG
TTTTTTCTGATCAATGATCAATTTCGATTAAATCGCTGATCGTAGTATCA
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AAAAAATGCGATCCAATCAATTAGTACAAAATTACATATCATGTAAAAGT
GCTGTGGTTTTCGAGACCAGTCTTTGTCTTGAGACGGGACTCGAGACTAT
TTTTTTGAAGTTTTGGTCTCGTCTGGGTCTTGAATATCAAAGTCTTGGTC
TTGGATCTAATCCACTTGGTCTTGGTCTTGCACTAAAGATACTGGTATTG
ATCTTGGTCTTGATTTTCGTCTCGAACTTTATTACCTCAGTCTTGACTTG
GTCTCGATCCTTATATATGTCTTGGGAACTGATTTTTGCCGATATTTATA
AATAGGAATTTTTGACACTTCAAATACAAAAGAGTAATTTAATTACCAAA
CGTCCCAAATAGATGAATACGACCAAGCAGGAAGTGGAAAGATGCCTGGC
TGATGACTCTGGAGGTAGAAAAATCATCTTGGCCTACCGGAGGGCCAAAA
AAGGTATTTCAAAGATAGAATGTTGTGCTTTTGAGTTGTGCCCAGAGCGA
GAGTTTGTTCTCAAATGCATAACTGATTCTGAGATGGACTAGAGAGAGTC
TTAGAGACGAAAAAATTTGTGAAGCAGCTCCTGTTAATGTAAAATAAAGA
GTTAGAAGAGAAATAATTTATATATATAGATATTTTATTATTCGCTGGCA
GACTATATTTTAGTTTTTTCTACATATATTTTATTTTTTTGTTATCGTTA
AATGTGGTAAATAAATAAATTTGAGAAAGGTGTATATATCGAATATTTAG
ATTAAAAAGGTATATTTATATAGGTTTAAATAAATTATATAATTGAATCG
CGGATTACAAATGTCCCAGATCGTTATATCACTATATGGCAGTGAATTTC
TGATCGGATAGCAATTTTTTTCCTTATCGCTCACATGCCTGCTTGTTGTA
CTTGGAGTAGAATTGTGATTTGACATGGAAGTAATTCTAGCCTACTGAGT
GGGACCCCAAAACTTTCAGGAGCATGACTAAACCACAAAAACGTGATTTT
TATGGAATCAAGAAAAAAACTACTCAAAACTAAATTCTGATATGTTGAAA
TACTATATTTAGCTATATTGTTTATTCTATATGTCCTCCTTCACAAACAA
TAACACTCTCGGCACGCCGGCGAACAAAGTGACAGCTCTTGAGGATGAAG
GTCATGTCCATAACGTATCACGCTGCCATGACGGCATCTCGGAACGAATT
CTAACTTGGGTGAGAGTTATGACTGACATTTTTCTCAAAGACAACCTAAA
CTGCAAAGTCTAGGGGATATAAATCAATATTGAGTGAGGGGCACAAAGAG
GCAGGTTATAAGTCGGCCATAATGTTGTTGCCAAAGTTTTGCTACTTTTT
CTTGGCTTTATGGGAGCTTACAACACTATTCCCATTGTTAGTGGACTTTT
TTATATTGTAGGTAGTCCAGATGGAGATAACAACGGTCTCTGATKCCTTG
TCTGCACTGACAATGGCCTGGAGGAGATTGTCCATTCGTTTCCTTTTTTA
GTTGTTGCTCTCATATTTTTAAATTAAGAGACATAGAATTAAAAAAAAAT
TGTTTTTTTTTGTTTAATTTGTCGTTAAGTTGCATAATGATCCTTGCTAA
TAAAAATAACAATGATCAAATTGTAGTTCAATCCTACTGCAAGTTTTGAG
TCCCCACTCTGTGTTTGTCCTCACGATATAAGGAGTGGGATTTGTTATTA
TTTCCTTCATCACATAGCTACTCAGAGCTAATTTATCGAAACGTCATAAC
AGCTAAACGGTTCTCCTTCAAAACATTCTTCAAATTGTCAGTGTGATCAC
GTTCATTTTCTGGGTTTTTTTTAATTTAGCATACTGGCATATCATATTAT
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TTTAATCTACTTTAACATAACTTGACCACTTTTATTGTATGCATTGACCA
GTATTTCCTTTCCCAAAAGGTAAACACTCTATTTTTTAACTTTTTTACTT
TCATTATGAATTAGTAATGAGATGTTTTATTTATGCAGCAGTGTAAATAC
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ATAACAAAATAATGTAGCTAGCGCATGAATAATTAAAATGATGTAATAAA
CGGGTATAATTTCAGTGTTGCATATATACAATATTCACTAGTAACGCAGG
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CCGGTTTTCAAAAAAAACTGAGATATGGAGGTGAACGCAAATTGCAACTA
CACTCTTAAGTACTTTTGCATAGAGTGGGGTTGTTATCATTTTTAATACT
CTACTTCAAATGGGTAGTCTTAAAAAAATCAAATATGATAAAAAAAATAC
ACATGGACACATTTTACAAAATTAAAGTAGGTGTCAGAAAATCATACTGC
ACCAATTAGAGCTCCATAAAGCCATTATTACTTTAATTGGTGTTGGGTTA
TTAAAATAAATTTATTCCGGAGTTAATCATCTTTCATATCATTGATTGCA
GTATATTAACAAAAATGACAATTTAGAAAAAGGCAACGGWTTGCAGCTAT
CATCCGTACCCATCACTCTGTAAAGTGGCGAAAGCCTGTCCATAAGGGGG
ACAAAAAGTGGATTGCATAATAACATTTTCACTAAAGTCTTCTTGACCGA
TGTTGCCTTTGAAATTGAAGCCAATGAGTAGCTAGAAGTGATAAAAAAGG
TTGTGAAGGCCGGGTTGGAAGCCAACTGCCCAAAACTGTTGACAGTAACA
CTCATCATCTGGCCATAAGGGCATAAGAACTAAACCCCGATTCCTGACGT
TCAAATTTGTGGCCCCTACACTATGGAATATGGGCCTATGCGGAGAGCAA
GAACTGCAATGTTGATTCTCTGAAGGCCTCTGTTGAGAAGGGTGGGTTGA
AATGACCAATGACTACGTCATTAAAGTTTACAAGGCCTTCCAGGCTAGAT
TGCTGGTTAAGGATGTTCACAAAGGAGGACATTTTGAAAAGGGGATCATT
TATAACAAATATGTTCTATTTGTTATAATAAATCACTTATTAGTACTAGA
TTGTTCAGTTCAATAAATATTTTCCATTATATTCTCTACTGAGCACAATT
GTTTATTTTGTAGGCCTGAACTACAAATGAATAATACACTTTGTACGCTA
CTGTAATTCATTGCTGTATGGTGATGATGTACATGGCTTGCTTCAGCTCT
GTGAGAGAGGATTTTTCATGAAAATTCTCATGAGAGCAGAAAGGATGTAC
AACTCGTACTTAGAATATAGTCATACTTTTTCCTTATTATCAAAGTAATC
TTTTACTTAGGGGTGCCTCAAAAACTACGTTTTATTTGTAATCGAGTGTT
TATGAAGAGGGAGAGAGCAAATTTAAAGTGTTACTTCTTCAATCAACGAT
GATGCATTATTTCTCTCTCTCTCTTTTTTATTTCTTGCCTTCATTTTCCC
TTTCTCTTTCCTTGTCTCTACATACATACTTGTGTTATTTTCTCCTTTCT
AGAATCGTCAACGCTCTTTAACACAGCCTCAAAAACAGCCTCTGTGAATA
AATTGGCCAGAGTAAGAAGTGCCTTGAAAAAACAATTCTACGACGGTAGT
AGTAATCAAATCGCAAACAAACAGTCAGTATCCACATCCTCCTCGGCATT
TAGAAGACCAAAACTGGGTGACATTTCCAGGTGAGAAGATCATGAGCATT
AATACCTTGAGAGGGAACATAATTTAACCAATATATATTTTATTTATTTT
GTAGATTAAAGGCAATTGATAATGAAGATTTACCCTCATCCCTTTTATTC
TCTGATGATAACAATTTAATAATGTCATCCTCCACTACAGGCGACAGCAA
TGCCTCCTCCAKCTCTTCTTCTCCCAAAGCATCCTTTACATCTAACTTTG
TATCCGTTATTGAGGGTACAAAGAATCTTGGACTCAATTCCGGAGAAAAA
CAAAGGACAGATTCCCTCACGAGCTCTTCCAATGACTCCCAGGATCAAGA
GCAGCAACTACAAGATATTGAAAGCTCTGATGAGGATAAACTCGTGAAAA
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AAACTCATTCGAGACTATTCTTTTAAATCTGCTTCCTCTGGAAGAGGCTC
CATTGATTCTGCTATGAGTTCAAATAATCCCTCAAATGAGTGTGAACTCC
CAATCTTCCCTAATCTTCCTTTCTCTCCTTATGGATCTCCCAATGCCTCA
CCAAGGATTCGTCGAAAACCTTTGAGGGAAACAAAGCGGGTAAACTCCAT
TTCTGAGGATAATGGAGAGTACGTTCAACTTAATCAGTACAAACTCGAAC
AAAATCTTGGACAGGTAAAATGAACATTTGTACTTGTGGGGTTTTTTAAA
TGTATACATATTTCAGTCAGGAGGAAAAATGCCTCGTTTTTTGTTTCTTC
TTAAGTTATTTATGTTTCCAATGTTTTGAACTTTGAATCTACATACTAAT
GTACAAATATATAATTTAAGTATAATGATGTCATACTATATTTTGACAAA
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TTTTTCCAATGATTATGTAACTTGAATTAAACATCTGTGATATAAAGAAA
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