EMLSAT00000006007, EMLSAT00000006007-701854 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000006007
Unique NameEMLSAT00000006007-701854
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s326supercontigLSalAtl2s326:163162..177003 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000006007 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000006007EMLSAG00000006007-688773Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000026199EMLSAE00000026199-735127Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000026200EMLSAE00000026200-735128Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000026201EMLSAE00000026201-735129Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000026202EMLSAE00000026202-735130Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto773610auto773610Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000006007EMLSAP00000006007Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000006007

>EMLSAP00000006007 ID=EMLSAP00000006007|Name=EMLSAP00000006007|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=374bp
MNEGTIMELNSSNVSYNTSLNTTIPSSSPNSLLHTKLWVLGIIIVLTILG
NSIVILAIATRFIKMTRMYFFILHLSIADVLTAFLTLLPELIWTYTSPNF
YGGAFLCKAVKFGQMIGPYLSSYVLIMTAIDRYHAICFPFSKCTWTPKRS
NIMIGLAWLVSLALCVPQIIIFGSGEKSHSCSATFAQDWGQKAYVTWFAV
SNFFLPLIILIYCYGCICKCIWDNFNSKIPLNPGVEVRSITCCKNKGRAE
EGISRAKIKTIKLTVVVIAGYIACSAPFICVQLWVTFGTVTESIRKFLNL
LSKYIHYSNIVLDGSITWLFWLXTLNSVVNPWXYMFFNGNLIEIFCCNSW
DCRRRNSSFPTNKFNYHPSQNSST
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mRNA from alignment at LSalAtl2s326:163162..177003+

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000006007-701854 ID=EMLSAT00000006007-701854|Name=EMLSAT00000006007|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=13842bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s326:163162..177003+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGAATGAAGGTAAATTATTTTTACAGCATAATATATGTATACTATAGTA TATTCAACGGAAATTGCAGAAAAATTTAGTAATAGTTGGACCATTTATGA TTACATAAATGAAAATTTTGAAGTTAGTACACTGAGAAAAATATTAAAGT CTGAATTGAATGTCATTTTTGTCTGTTCATAACCAATTTTAGGCGAAAGC TTTTATAAAGTTATCATGGTGATGATTTCTCATTTAAAAACACGTGATCT AGTAAGAAACTATAAATGAGACCAACTGTGATTAATTTATTCTATTCATC CGATCAAGACCAAACTTCTTCACAGGATAGGTCCAAAAACTAATATGGTT TTTTTTGTATGAAAAAAGTATGGTAGCATTTGGTTCTGTTTATAATTTCA AACAGAATTACAATACTGGTATTCAGAAATTAATACTTTATCTGTAATAA ATAGCTTTTACCTTATATTACTTTCTTTGGGTGTTTATCTAACCCATTCA CTCAAAATAATATTTTATTATCTTTTGTGTATAATATTTTTGAACAGCCC TCGGTAAAAACTCAAAATTTATACTTGAGTTACGGTATCCAATTTTGAGA ATTAATTTCTGAGTTATGGAAATTATGGATTTAATTAATTATATAGGTTT CAAATAATACACTAAAGTGTTCTCTTATATATCTACCTCATGGACAAAAA TGAGTTAAAGGACGCTAAATCAGTGTATAACAAATTATATTCCTTGAGTT GTAAATTTTAAGCATTTATCTTATGTATCTATATAAATTAACATAGTAGC CCTTAAAATTTGATAACGTTTAATTAAATTCAGGACAAACACCTATAGCC TAGCGAAGAAGGAAATAGAAACAAGTACTACTCCTTTTCTGATAAAGATA TAGACATGAATTMCTCCGAGCCCCAAAACGATTTATACATCGGAAATAAG CAATGTGAGGTTCCTTTAAAATATTCCAAAATTAAATATAAATAAGTCGA TAAGACGACAAAATTTGAAATAAATAATTAAATTGAAGAAATCCCTACAA AATTTTTTACTTGTCTTTTTTAGTATTAATATATGCCCATCAATCTAAAA TACAAAATGTTTTTAAATGGCGCACCTTTGTCTTATTTGTTATGTTTTGA TGTTTAATACAAATATCTTATCGTAAACAATTGTCTAAAGAAACTGTAAG CAAAAAATCAGCAAAGTCAACTGAGAAATAAAAGGGGCATAACCAAAAAC ATGGAGTAACGCAGAGCTGAAATTCTTGAGTTATCTATTTATGGAAAATC ACTATCAAAAATCTCTAGAGTAATTGGCTAAAACCGCTCAACTAKGCACC AGGTAATAGCAAATGGCACACCAAAACCTTCCACAAGGTCCAGATCAACA ACAAAATAATTGGTTGAGGGAGTTAAAGGCAATATTGAAAGCAGAAGAGG CAATGTGACAGTCAATAATCTAACTCGTAAGTTTTGACAACACCCATAAC ACCATGCACCGCAGAGTTAAGGAAAATTTAAACCTTAATTGGTTACAAGA GAACTCCCCATCGGGGCTTGAAACCTTTGGATCGAGTAAAGTGATTGACC CATTGCAAAATCCTTCACAACAAATTTGAAAAGCAAGACTCTTACCTTCC TATTGCTTGACTGTTCCCCCCTATTCTTTACGTTTTTGAGCACCTCAAGG GGAAGCTTTTGGGAAACTAATACACATAATGTTCAACTGAAGGTTGCCAT CATCACTGCTTGCACAACCTACAGCCGAACTTTCTAAAGAACTGTTGTGC AAAGTTCTGCACGGGGTTGGAACTAATAATTAAAGCGAAAGTCTGCTATA TTGATTGACAATGTAAATAAAATGTCCCTTAATTGTATTTTTAATATAAA TTTTTCTAATTTGATTATGTTTTTGAATAATAACAATTTTTGAAAAGTGT TACATTTTTGACAAAGGAGCTTGTATAAAGTGTATACTCTAGCTTAAGCT ACAATATAAATCAATTGAAAAACTTATTAGATTCCAAACAAAATTCTTCA TTTATCGTATGGTTTTTTTTTTTTTGATTAAACCCATTTTTCATGAAGTT CTTTCATTAATCCCATGTTATTATAAATTGATTTGAACTTATATTTATCA TGTATTGATTTTTTCCCCGTTGAAATATGTGTCTGAATCGAAAAATATTA TCTAGAAACGGGATATATATATATAAAAAAGGCTCAAATAGCCAAACCTT TGTCAGTTTAAGCATTTTAATAATCATTTTGGTATTGTACAGCTTAAATA ACAGTAAATGTAGGTTTTAGATGCCAGGGAAAAGTACCATTACGTTATGA TATTGATAATTTTTTTCTTTCTACTTCCTAATAATGTATACCAAGTGCTA TGTTGAAATCTGAACAATTAATACTTTTAACTTTAATTAGATGTATCGAC GTAGTCATTAGACATCCACAAAAAATATTTGGAGACTAGATGTAACGAAA TATTGCATCCTTTAATTGTCAATGAAGCTCTTTCTTGCGTCCACAATACC CTCAAGATGCCTCCTGAAGGATTGGCACGTCTTTCGAATGTATTTCTTGA ACAAATTGGTCTAGGGTTCGTTTTCAGTGGCCTCCAGAGTCATGATATTT TCCTTCCCAATGGTACAGGTTCTACATGCTGTACATGCGACCAGAAGGCG TAGTCGAAAGGGTTTGGGTCGGGTGAATACTGGGGCATATTTCAAATTGA TGTTAGTGCTCAACCAGTTTTGAGCAGCTTTAGCTGTGGGCAAGTACGCC GTGTTGTTGTAGGACCATATTATAATCTCGGAAGTAAGCCAAACCACAGG AGGAAGTAAATTTCCACATTTGATTGCCTGCATCAAGAAGGGCGGAGATC TTTCCAAAAGTGTCACGTTCAGAATTTTCTTGATGATTTAAGAAAGAAAT AAATAAATGTTATTTCTATACAATGTTATGAATGTTCAACGTGCCAAACT TTATTCATGTTCCTTTATGAAAAACTCTTTAGAATCTCTCAACTTTCTAA TAACTTTGTTTTTAGAGTACATTTCGTGCTCAGTATGATAATTTAATATT ACTTTACCTTATTCAAGAGTAGCATTAAATTATCGTATGTTTCCAACATA TAAAATGTTAAATTTACTAAATTTGTACAATATTTTACCAGCACTAAAGC AATGGTGGTATAGTATCTCCCACACGGATAGCTACTTTTATAGATCCCAG TGAAAATGATCCACAAAAGTTTCAAAACTAAGCCGACCAACAAAGAAGGA TATTTGAGGCACTTTTGATTTATACAGATATAATACAAGTATCAATATAA AACGAATGAATTTCGATAGTCAGGGTACATGTTTCAACAAGTGAAAAATA ATGGGCACAAAAATTCTTTGACTGTATGTAGAGTAAGTATACACTCTTAC GAGGTTTATGGCGCCAAAACATTATTAATAAAGTAGTTTTAAAAACTTTT TTTGAAAGACGTATTTCAATAGGGAAATTAATTATTATGCATAAAAAGGA TAAGGATCCAAGATTTATAGAGAACCTTATGCCATTAACTATGCTCAATG TGTCGTATAAAATCTATAATGGAATCTTAGCAATGAGATTAAATCATATT TTAAATTTGTTACAAAAAGGGGTTGGTGCAGTTAGAGTCATTGAGGATGT GGTCAGGGGAATGAAGGATTCTATTGCACAGGCAACGATACAAAATTCCA AATTAGTAGTGTTGGCGATTGTTTTTATGAACTCATTCGACCGTATATCA 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ATTACTCCCAGACCAATAAGAACTTAGATTTATAACTCACGAGGAAACCT CATTCCTATCCTCCGTCTTTCATTAGCACATGCACTACTTATTACTTAAA AAATAAATAAAAAATAGAAATAGAAAATAAAAAAGACAGTCAAATTCCCC CATAGAAAAAAAAACTTTCCCCAATTTAATACATAAATTATACAACTCTG ATCATTCAATAATTTGGGATGTTGAAATTTTCAAATCCTCGTGAGAATAA ATTTAAAAAGAAAGTATAGTCTGGTAAACTGCAAGAAATTAGTGGTCGTA TTAAGTATTTCGCTTTATTACTAAATTCAGACATATTASAAAGCAAGTAA CATTATTTTTTATAGTAGTCTGTGCCAGTAGATATGTTTTTTTATTTAAT GTTGGTAACATACATTTTTTTAACTACACTCAGGAGGATTTATACCATTT TTACATCCCTTCTAATAATACTCGTTCAATTTTAGGAGGAACTCTTAGGC TTTATAAATCCTAAAAAGGGTATAGCGATGCCATTATCATAACAGCAGCA ACAAGAGCGGAAAACGCCATTTCCAAGTCTAAAAAAAAGGAACAAACTAT TTTAGCATTATGGCCAACTTTATAAACAAGTGATATACTCTAAACTACTC CCATATTTTTTTTAAATTTTCAACTTCTAAGAAATATTGTTTATTAATTT AGTTAAATTTATTTCGTAGGTCTAGTTAAATAATAAAATAATTTYAAGAT ATATTCGTAAGTAAAATTGACCAAATTTTCAGGGAAAAGTAATCTAACTT TGAGATATCCCCCCTGAGAGCTTTGATAAAAGGTAACACAATTTTTGCCA TAGTGATACCCCTACCTATGTTGAACATGTTGCCAAAGTTTCATTGTCAT AAGATTGGCAATTATTTGTTTCTTAGTCAAGTACTTACTTGTGTATTTCA GTTTTATATTGAATCAAAATTGAGGTCATAAAAAAAGGAAATAATCTACT TTGACTTCATTTTTTGAATCCTCATACTTCAAATATAACAAAAAAAAGAA GAAGGAATTTGTAATATGTTGAATAAACAGTGTGCGGCAACGAATAATGC AGTAGGATTTAAACTGGTTAAGAACTCGTATCCCTTATTTTAAACTATTT TAAGTTAGATGAGCTAATTACATAATACAATTAAAACATATTTTTTAAAA CAAAATTCGAATTACGATCGAAAGCGACGATGTAGGTTCAAATACAAAGG ATATCCGACTTSCCAGCCACATATGTCAAGGTGGCAGAAATTGTCAGGAT TGGCAACTGCTTGGATAGGCTCSTCTTCAAGGTGAAAAGCTAAAAAATGA TGGCTTGGCCTTGTACAGCATCTTGGCAGTGGTAGTCTAAAAAAAATTCG GTCACCGGCCTTTTTGGACTCGGTGAAAGGGATGATAAACAGGAGCCTGA TGAAGTGCATGAGAAAGATGGCAAATTTTTTAAATTAAAAAAAGAAATTT AATATTTGAAATTTCATTTAAGAAAATAAATAAAATACTATTGGTAAATG GTGTTTTTGCTACTTTGTTGGAGCGCAAGATTATTGGGTACTCTCAAGTT CGAAAACCCCCTAATAAAGTATCCAATCTGGGAGTATTACAGCCTTTTCA GCCGCAAGTAAACTCTTTACAAAAGAAGTAGGAAGATTTAGATTTATGTT GTTTATTAAATTTCACCGGTAATTGGGTTAAGAGTCGCTTTATTAATTTG AAATATACATCCATTATAAATAAGGTTTAGTACTTGAGGAATTTCATGAA TTGGTTTATKAAYAGGTGTAAGTGTTAGAGTGTACCCATTATTCCTAATA GGGTGAAAATCTMATTATTTTTACTCTCACATTGGAGGTTTGCGACGCTT TTTTTTTAAAGTCTTAAAACCAAGCCCTTCACAAATTGTCGWCCTTGCGG ACACCCCTGAAGGGATTATGGTCAAAGTACTTTTGACACCCGTCAGCCCA GACCTAAGCCCCCTGGACTTTGGGGTGGGTGATGCCATTACGAGGAAGTC TTGTACGACTTCTCAACCCAATGGGGAGTCGCTGAATGCTGCAGTGGACA AGGAGTGGGAGGACATGAGCGAGGACTTTGTTAGGAAGACGTGCCTGGTC TTCTGCGCCAGGATCGGAGTCATACTGGTGGCCAAAGGAGGCCATTTTGG GAAATGATATAAATAATGACATCCCAATAAACGAGTACAAATTTCAATTC TCTGCCTCTTTTATTTTCGAAAATCTGCGCAGAATTGTACAAGGGAATCA ATTACTGCACCATTCGCTGCCGCACACTGTAGTACCTATTATCATGGTTG TAAACTGTAAGCATTTGTTGTATATAAAACAAAAACCGAAAATTAATATG GGGACCCTGGCAATGATGTTTCTGTAAAATGAAGGAAATAAACGTATGTT CTACTCCATATCAAATAAGGACATCTACAGGAATTACTCCGTTTTCAATC TTCAATTTTTTACCCTTAATGTGACAAGAACTTACATTCATAACTTCTCG GCGTTGGTCTTTGTAACACTTTAAATTTAGATGTTCTCTCCTGGAGAATA GAATGATAACCCTAACTATAACCACATATTTTTTCCCTTATAATGTACAT TATGAAGCTATTTACAAAGAAACTGAAAACCCGGCAAAATGCCTAATATT TTAGAAAAAAGGAATTAATTTTTAATAGTTTAAGGGGGGTTTTCAGTGCT TTAGCAGTTTAGGTGTTGTTGTCCAGGGAGTACTATTAGAAAAAATTCTT AGGCTAATATAAAATATCATCTCTAATATTGCTACGTGGCTAAAAAAACT CTTTGATTTCATCAGATTATAGGAAATAGTTTAACTAAATATTCTACCAA ACATCATTTTATTTGATAATTTATCTTTATTATTTATGAGAAACGTTTTT GGACAGAGGAATTCCCCGACTCCTTTGTACAGATCAATTTTCATGTTTCT TCGAAAATAATTCTTAAATGAGTTTCAAATGGCTCTTACTTTAATTTAAA TGAGGGTCAAAGAATTTAAAGACTCTGAATTTCACTTTTTAATGATCAAT GACTGACTCATTCGAATAAGGATAAGTTTACAAATTTTTTGATCATTATT TTTTTTTCWAAAAAGAATGTACTCCATTCATAAATTAGTTTTTACCACAT GGTGACATATAAGTGATAGACAAMTAAAAGATATTCTTTTACTTTAAAGC TGTTTAGAGAAGCTTTGAGGAAAGTTACCCAGATTTTCTTCTATTGAAAG TAAAGATTTTTTATGTGAAGTACTTACTTTTTATCTCATAATTAATGGCA TTGACATCAAAAACATCAATGAGTAAAAAGATAATAATAGGGTGGAAATT ATAATAGATTACATATCACTAGAAAAAAGCTTTTTGCTCGCTAATACTTT TAAATTTTCAAAATAGGGATAAATAATTGATATTTTCTAAATGTATCCTT TCAGATTTTGACAATTTCCACACCCCTAGTTATATCAGATATATCTCACT ACCACCGTAATGTTTAAAAAAAAATTATATAGACAAAGGGTGCATATAAT GCTGAAGAACAACTTTGATAAATTTATGATTGGTTATTCTTTTTCATTGT TATCTGCGACGTAGAAGTTGCAATCTTTACGCAATGCAGAAGAAAATGTC ATTGGTTCGAATGTGAATGATGATCTGTACTCATTATAGTGAGACAAGAG TTTACAGTATTTGAAAACAAATGTCTTACTCGAGGATATCAATAATATAT TTCTAAGTTTTCCTCTACTACAAATGCTATTGGAGAGCCCTAAAGTGTTT TAAGATTTTTTCTTAACACGAATTGGGGAATCTTTTGGAATCACGTCAAA TGATTCCAAGAATGTAATAATTTTTCGTGTTTTCAAAGTAAGTAAATTAC ATTATTTTTCCTTCCCATCAACAAGTGAGACTTCAGATCTGTAGAACTTG CGAAAGCCAGTTCTGTTTAATTAACAGCTTGGATATTTACTGGATTCGAG TTTTCGATTTTAGACCGTAGTTGTGAACAAAATCTTTTGAAAGGCATCTT TACCTTCAAGTGACTTTATGTAGAGAGCGTGATTCATTTTGGGTGGAACT TGAATTGAAAGACAGCAATGGTGTGATCAATTGATAATGCATTGTCGATG ATAATGGACATTGGACAAAGTTCTCATATCTTTGGAATTTGTTGTTTTTA TTGAAATTATAGATCCACATGTTATAATACTCATTGATTACCTTGAAAAG CTCGACCATCAACAGCGATCATAATATAGGGTTTGGGACCATGAAGTTAA TATTTGTAATAGTCTAGAAATAACTGTATTTTTAAGTACAACTTTTTACC CTTCTTGAAAGTTGACATAGCATTAATTGAAGCCATCTTGTCGAATTCAA ATCTTGTTCAAATTGCCAGGGGTTACCACATTACTTTTTGATTTCCTTTA TTTGTACACACCGAGAGGTAAATTCTTTATACAACTCTACACATTTTATT CTAGATCTTTCTAATTCACCTAAGTAACACTGTACAACTGGAAAAGATAT CCTTAAAAAAGTTTTCATCCTTGTAAATTTGAGATAAGACTATCGAGGTA TTATTTTTTTTATTTTTACCTTCAAAAAATAACCTTAAATATTTTTATGA CGTTATCTTTAATTAACAATGATGAAGATATCTTTTTGAAAAATGGGTTC 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AAGATGAAAAGCAATTTACTACTTAATTTCAAATACTTTCTGGATGTATA TACTTCAATGCTCCTTGCAAACACTGTAGAAAATTGTTTTACACAGTTAT TAATGCATGCTCTTGTACACTGGCCTTCACTACATATACTGAAAAAAATT ATATTGCTTAACATAGCATGAATAAGTGATATATTGCTAATTACTATTCT TTTATTAGGGCTCACTTCAATATTTCGAGTGTTCCTACAAAAAATCTCGC CATAGAATAAGCTCTCACGAGGTGTAAAAATAGGATATCAGAGAATCTGA CAGAAGGTGGCCCTATCCGAAATGAAGAATTTAGAGTGATTCTTATTTGA CAGCTGAGATATACTCTGTTTTGCCATAAAAATTCCGGATTATTTTAATG TAACGTAGAAGTACTCGTTGGATTTCATTCGCTACTTCCCATATACTTCG AAAGATATATGAYGCTTCTTCGCCGTCTTATACGCATCCACAGACAGTTT AAAAACTTTTGTTTATTCAATGCTTAAATGTTGTGAATTTTTGTCTCCAT CCAACTTTTTTTATTCGTATAATTTTGATAATCTTTATTTATTTGTTTTC TACCAGTTCACTACACCAATTTTATCGAAGATTTTTATTAAATGTGATAA ATTACTACTGATTATTTTTATTATCTTTTACTTCACTGTGAAAATTAATT GTTGTATTGCCTTATCCTTAGGGATTTCATTATAACTAAGATGTGTTTTT ATATATGTAACTTCTCCAAACGAATAAAGACTGCATGTGAGAAAAAAAAT AGAGGGTTCTAGGAAAAGAGACCACTACCTCATCCTAAAAAATAAATTGG CTACAAAAAGGAATTTATTCAAAGAGTTATTATTCGGGAAAAACTTATTT AATACCTAGTATTATTATTTTAAAAAGTTTTTCTTCTAAAAAGAATGTAG 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