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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s326 | supercontig | LSalAtl2s326:244578..255604 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000006009 >EMLSAP00000006009 ID=EMLSAP00000006009|Name=EMLSAP00000006009|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=132bp
MMKRNYIPLVQFLVLSTYMNFIFGMNFEFRSFESPITSQAQIACQANNIK
ANGNYICTKFGEIVCLFGWKNESSLCSEPICSQKCDLVHGKCTAPNTCTC
EVGWESSNCNECVRLPGCLHGNCSKPYELYCF back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s326:244578..255604- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000006009-701856 ID=EMLSAT00000006009-701856|Name=EMLSAT00000006009|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=11027bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s326:244578..255604- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGATGAAGAGAAACTATATACCACTTGTTCAGTTCTTAGTTCTTAGCAC
TTATATGAACTTTATATTTGGAATGAACTTTGAATTCAGATCTTTTGAGT
CCCCTATAACAAGTCAAGCTCAAATTGCGTGCCAAGCGAATAATATTAAG
GTAATTAATTGAAATATTTGTAAGTTTATGATAATATATTTATTTTGAAA
TGTCTTTGAATATCAGAATTATCGCTTATATTACGTTAATCAAAAGCGTA
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AAGATATTTGTTAAAAACAGATTTTTAAGTGCTCAAATTAGTTTATTTGA
GGAGCATTATTCAAGTAATCGTGCAGACATTTTTTTATTGTTCTCCTTGT
ATTTGATTTCATTTAAATGATTGATTTTTTTTATCAGTTCAGATGATTAC
ATCAAAATTTAAAATTAACTCAGTGAGAATAAATTCGAGATTTTATAACC
CAATGGGTACTGTAGAGACAAGGTTAAAGTTTTCCTCACAATATTTATTC
TTCTTTAATATTTATACAATTGAACATAATAACACATGTTTTTTGGCCAG
AACAGGCCCTGAAGAGTTTTTTGAGATTGAACTACAAAACATCTGTAATA
CTTGACATGTTACATCCAAATTTAATTTTTTGAAAACCTTGTCTATAATT
AAAATAGATTCAAACTATAAACCGTACATGTGCATTTCATGTTAAAAATT
GGATAGTCTGAAGTTTAAACGATTTTACTTAAATTGAACGAAACACAAAA
AGTGTTGTTGAAACTGCCGCTGCACCCCTTATTAATAAGGAATTATGTAG
ATATATTTATAAGTAAGTACAAGAGTTTAATACTGCTTAATATATCTCAA
ATTTTTATTTTGGTTTCCTAAAAATAGTATTTTGTAAAGAAATTACAATT
TTTATTTATTTAACAAATAGTAATCAAATTTTTAACATAGAAATATTTGA
ACCAAATACAATTAAATTATTTAAATATTGAAAAATTACATAATGTTAGC
AATTGAATAACCCAAGCTAATATTAAAAAGTTATTTAAACTTTATGACAA
AAACATATTTAAGATTGGTTTTATTTCAAACTTAATATAAATTATAAGTC
ATTAACATATATTAAAAAATTAAATATTCAATCAATAACAACATAATGAC
CTATTAAGGATTAAGTATTTAATATTTACTTTTAATCTACATCAGTACAA
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AAAAATAGGACCTTCACAAGTACGAGATTTTTTTATTTGACAATCTGAAG
AATGTTTCTTATTTTCAAAACTTTTATTTTTAATTAATAGAGAGCAATCC
TTCGTTTTCTTAGCACTTAAGAAATTTTTCAAACTCCGAAAAATATCGTT
TTATTCAAAAAGTATCCTTCCATTAATTGTATAAATATTGTATTTTCTTT
AACATATAGGAACTTATCTCTTTAAGGGAAAAATTCTGCATATTTTAATT
AATAAATCGTAGCCAAAAGTAAATTAAATGAATAATGATATCGAATAGTA
AAAATGAGTTTTTAACTGTTTATATTGTTGATATATGTACATTAGACTTG
TTCCTATTTTCTTCTCAAAAGGTAAGGAAGACATAACCCAAAAATATTTT
TATTGATAAAACATGAAGATATATAAAATTTGAGTTTTATAAATTAAAGT
TTCAAGATAACGCAGAACGTTTCAAGTAGTAAATTTAATAATTATATAAA
AAAAAAGAAATTTATCATTATAAAAAACAATTTTCATTTAAATAAACAAT
GTTTAAAAAGTTTATATTTATATTTTATCTGAAAGGATTGTGTCTTCTAA
AAATATTGTTGTATCAGGTATAACGCGCACTTTTTGAAATTAAAGTATTT
AATCTGTATAACAAATAGAATTATCAAAATAAAATACTCATATTTTTTGT
AAAGATTAAAAAATTAAATTAAAAATCCCAATACGTATGATAAAAAAGAA
AAAAAAAAGAATATATTATTTATGAACCTATATATAGATACAATGTTGCT
TTTTAGTTAAAAAACTTGTGAAAAGCGATAATAATATAATAAGTTTCAGA
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CTATTCATATAAATGTTATGTTTTGGATATTTTACGTATTTAGCTTTTAA
TTCGTATAACTTTATAAAAAGTGTGTTTCTACATGCGTCCCTTGTAAGAT
TACAATTTATTTGAAAGTATAATAAGCTTTTTTTTGTTAAATAAAAATGT
TAAAATCTATAATTTTTCGTTAGGCCAAAAAGTGAACTACAAAAAAATCT
TAGAAATATATATATAAAAAAATTTATTTAAGATTTGTTACTTGAAAAAA
TATAAATTCAGCCATCAAATTTTATTGATAAGATACAAAATGTTGGTATC
TGTAGAACATAAAATTGGAAATTGTAGGCTATAAAAGTTATTTAATGTTT
CTTTAGATAACATCAATCAAGATCTCAATCCTCGGGCAATTTTTTTTAAT
AGTTTAATCAGTATATAGTTACGAAACTCTGTATGTATTCAATTGTTTGA
GCAAAATCGCATTGAAAAAAATTGTATATACATATTAGTGTAGTGGAAGA
TAATTATTAGGTTGAAAACAAATTTAAGATCAATTTTTTTTCATTATCTT
TTTTTTTTGTTCTGAAGGAGAAGCTACTAGAAGCTACACATATTGGTGAG
GGAACAATTTATTAACTTTATTTTTCTTTATTACTAATTTGGGTAATTTG
GCAGAATATGCACAAAGGGGGATGGAGGAACATCCTTGCCCGCGTAGGCC
AAACACTAGCGGACATTTAAAAAAGATGTCATATGCTAGTATTACCGCAA
GAAGAGAGAAAATGATAAAATCTGCATCCGATTCTACTAATTTAAATGTT
GATTTATTGTGGATACATTCATTGTTATACGCATAGACGAGTCAGGCCGT
CCTTTTAGGCAAGATAACCTCAATGTATTTGACGTAGCCATTTTTCTTTT
TCTTTTTTTGGTTTTTCTGAGAAAGAGCTTTATAGAGCAAATCCTAATCA
TTCATTCGGTCGTGCTAGCTTCTCCACAAACAAGCGTATTGATGGAAAAG
ATGGATCAGCTTCTCTTAAAAAAGAGTTGAAGGTACAAGTTATCCATATG
TTACATTCAAATAAAACAAGTTGATGCTTCCGTCCACATTGTCGGGATTT
ATGGACCAAATGAGGATAACCCTGAATTTTATTCTAATGAACTGTATTCA
TTAATTTTTAATTGTTGTACTATAGTACACCTACATCTATGACTGAAAAA
ACAAGATTCTACTGCAATAGGAAAGGGTAATTATAAAGCTTCTAGGAGTC
TGCAGAGAATTATGGAGAAAAAAAATGTTGACTGATGCGAACTGTTAAGA
ATGGGCTCACACACCTTCTCTACACTAAAACACGGAACAATAAGGCTGTA
TCTTCACATCTCGACATTTGCTTCTGTAGAACAGGGAATGCATTTAGGCC
TATTGAATTTACAGTTATTCCAAATATTATTTATAACCATCAGTCTATTC
TACCTAAGTTCGAACCAATACATAACGTAAAACAGAAAGGGAGATGGATA
TTCAATTCATCTGTCCTATACGATGAGGAATGCCGTGAGGGAATGAGAGC
AATGATCTCCCATGCCAGATTTCGTATAGATATGGGGGGAAAAGTGTGAA
TTTGAATTATGCCAGCTTTGCCGATAATATTCGTGTGAACCTCCAGAATA
AATAACATTGTCTGTTCAGGAAACTGAGAAACACTTCTCAGAGCAAGAAA
TTGTAGAAACTATAAGAAGATGTGGCAAAAAAGATACATCTCCTAGCTTA
TGAGACTTTGGTTTTTAAATTTATCAACTTTATGCTGATGAACTTGCACC
GATTCGTAAGGAAATATTTGAGTGGATAKTGATGTTGGGGMCCTTTCCAT
CAAATATAAATGAAAGTCTACTTAGTACAATACCCAACAAAGGAAAAGAT
ATACGATTCTTTAAGAATTGGAGGCCAATCACACTTCAAAACACTTTGTA
TGTACAATGTATTTTCACATATAATTGTGGAAAGACTGAAGAAGACAAAG
CAAGATACAGTACATAATTCCCAGAAAGGATTTATAGATAGTCAGAGAAT
GGAAGACATTGTTGCAAACTTACAGACTGCTTTCGATAGTTTTGCTAATT
ATACTATATAAAACATTGACTATGAAAAGGCTTTTGACTGTGTCTCACAT
ACTCAGATTATAAGAACACTGATGTGCAAAGGATTTGGAAAATTCATAAT
AAGAGCTGTTGCTACAGTGCTTGTAAACTCCAATACAAGTTATGGGTCAG
GACACATATTAAGACCTTTTCAGATATAACGTGGATGCAAGCAAGGAGAT
CCCATAGCAGCAACTCTTTTTGTAGTTGCTGTGGATCTCTTATTGTTACA
AATGAGGGATACCGAAGTATTAAAAAAAAATAAAAAAAAACAATTGGATA
TTGTGAATCCATTTAAATATATGTACATGATACATCAGAAATCATAGCAC
CAGGAAGAGTTTTAACGATAGCATCCATCATTGAAATATAAAGACTTCTG
TCATGGTTTGAGATTTTGTCAGGCCTAAAAATTAATTTTGAAAAATCCTA
GCTAATAACAAATAATAGTGACATAAACTCACTATATTCCCCGCATGTGA
AATCAAGCATCAAGTTGCTTAAAGCTATTATTTGAAAGGATTCAAAGGAC
TACAATAAGCAGGAAATTATTTCCCGAATAAAGAAAAATACAAATCTAAT
TAAATCTCTTAACTTTCATAGATGGGAGCAAGTTCAAATTTGGAACTCCC
ATATAGTTCTAATGGTAACTCATCTTCTACGTATATGTATGTATGACATC
GAAATCTGCTCAGACATAGATGATAAATTGATGAATTTCGTAGATCTTCC
ATGGAAAAGGATATTCTTCATAAAAAGAACCACAACTCCCAAAAGGCTAG
GCGGATTTGGAGCAATAGATTTCAAAAGCTTTTGGAAGTTTTTTTTAGCT
GAATGGATTCTGTAATGTTTAAGAAGAGAGGACTTTCGGAATTCAACAGT
ATCTCCTGATTTTTTTTATCTCCAATATTCCAAGTGTGTGGTACGTTCAA
TAATAAGTAATTTATTTAGACTCAAATATTGGTGCTCGCACCTTGACACA
GTAAGGGATACTTTTTATACTCTTGAACTAGTCATGGGTGGGTACAGTTC
ATTAAAAGGTGACTTGATAGAAATTCCCGCTTATCTCCAGAAAATCCCAC
TTTATCTCTCGGTTGATCTTTTTAACTACAGGGATATTCTTTTAGTTATG
ATGACACATAAAAAAATTTATATAATCCAGAATATACGACTTGGGCATAC
TTATGATTTTACTAAAGAGCTTTGTGTAAGACAGGAGCTCACTAAGATAA
AAGTTGCATAAATAAGAAAAATGTGGTGTGAATCATCACTATCAATGATT
AAAAATGTTTTAAAGAGGAAAAACATACAGTTAACAGAAAGACAAGCCTG
TAATAGTTTGTCAGAACCAATTGCTGACTCCTTCTGAAAAATGGTTTTTT
ATTACCGTATGATTACTGGAACCCTGGAAGGTATTGTTATTAATTAAGAA
CTATAATCAATTGATACTGGTTAAAAAAAAAATATATATTTCATTTAATT
TACGATGATTTTGGGCATACTTAATGTATGTCTGTTTATTTATATATATA
AAATAGGTCAAAATGACGGGAGCAAACAAAAAAATTCTAGCAGATGCATA
TTCTTTAAATAGATTTTTTTTAAATTATACATTGAATATTTGTCTATAAT
ATTTCTATGATATTTTTCATCATTATATCTTATAAATAAATTATAAGGGT
CTAAAAAAGAGTGCCGTGTTTTATCATTGTCAGCCTAAAAATTGGAAACA
TATCGAGTTTAAAACAAGATACAAAATCAATAAAAACACTTTATAATCAT
AATAAATACTTTTTCATAAGTTTAATTTATCCTAGTTTTAGTTTCAGTAT
TGATTTAAGTGTAAAAACTGACTTTGAGCGATAATAGTTCTGAATTACTA
TAATACTAGATATGTCAGAATTCAGATGACTGAGATATAAACTGAGATCA
CTTTTGGATTCTATGTTCATAGATAAATTTGATTATTTTTTTAACTCATT
TGTTCAAAATTCTCCACCATTAATTATTTCTCCGTGTTATGAGCTAGAAA
TATATCAAAAGACCCATTCCAGAGCTATTAAATGTTTTTAATGGCATACA
CTTCACTAAAACTATTTAATAATAGACCGAGACTCGACTCGACAGCAAAT
ATTTTTTCTAACGATATAGGAGTAATTAATTCATGAGGGATTTATTATTC
AATTTTTTATTTTGCATATTTTCAANGGGTGTTTAATTGTTAGTGTGACA
TTTTAATTCGATCTTCTTCTGTATTTTAATGAAAAATTCATGTTTTTATA
GTTTCAGTCTTCAAAGGGCGTTTTTGACCTCTAAAGACATTAAAAAAATA
ATTTTAAATGACTTTGTAAATTTGTAAAAGTAGTCAGAAGTTTCAATTTT
AAAGTTATGTTCCTAAATTTCAAAATTTTCATTGAAGTTATTTTTCTCGT
GTGATACATAACAATATAATGCTTATTTTTCATTTTGAGGAAAAACAAAT
TGTAATCTAATCATATAAGTATCAGCAGTCACTCCATAATTTTATTGTAA
GTATCCAAAGTGATAAAAATTGCCGTTAAATTGAGTGACAAAAACACACA
GTTGGACAATGGATAATAAAGGAAAATGTTTATGAAGTAAAATCAAAAAT
CAAAATATTGTTATTGGAAAATAATTTAATATTACTTAAGGGTATCAAAC
TTCCATACAAATACAGTAACGAGTAATTTTAATATTCGTGAAATATATAT
TTTTGAATTGAAGTAGCCATATTTAAATTCATTTTCCAAATTGCTTCCAG
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CCTATTCTACAGTAAAATTCAATGAATTCTCACTTATTTATGCTATTCTT
TTTTTTAAAGAAGCCATATTTACCATTTGAAATAAATCACTCAATATTAA
CAAATTCATCCAATATAACACTTCAGGCATGATTCAAAATGATTGATTAG
TTCCAGTTGATTTTTATTCATCTTTCAATGTCCAAATAAAAAAAATGATA
ACAAACGAAAGTTGCCATATCATTTCGACTTTGTATGGCAATTACCATTA
TCGGCCTTTGAAATAGTATTTGCTGATGCTCTCATTACATTGTCTACAAA
AACATTTATTACATTTTGGAACTTTTATTGATTACATATGATCAATTTTT
TAATCATATCAAAATATTCAAATTCAAAGGCATATGTTCTCTGTCGATGG
CATAATTCGGTTAGTTTGAAAAGAGCAAATACTTATAAACCTTATGTGAA
TTATTTCATGGACTGACTGGCTGGGAAATATTTAGGGKATCTAAAAGATT
TATCGTCTTCAAATTAAGATAAAGTTCCTTCATTTTAAGTACTATTTTTT
TTTTGGTATTAAACATTTGTGGATGCTGGAAGTTGAATATGGACGTTTAT
GTTTCAAAAATAGTTTTGTATGTTACTTTAAATAAAATTATTTTTGTATA
ATATAATGGTATTTATAGATTCTAATTTTATCACTAACTTCTATAAAAGT
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ATCAATGTAAATTTATCCAAAAATACAAACATATTTTTTTAAGTTAATGA
AGTAGTATGTCCTCTATACTATTTTTAAAATTTGGAAAATTTGTACTAAA
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AGGACGTGGAGAGAAATTTGGGGGTTTCGCTAATAAATAGATTTTTTTCC
ACAGTTCCCCGTGTCTTAAAAAATATATTATATATCGATTCAAAAATTCG
TCAAAAAATAAAAATTCTACAACAACTACTTATTTTTCTAACAAAAAAAG
GGAAGCACGTATATTAAATACACATAAAAAAAGGAAATTGACCAATGACT
ACGACAACATCAAAAAAAGAACTTGATGTAGATATAGAAATATAAAGGAA
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AAAATTTGTTTTCATATAACTCCTCAGGGCCTTGTTCTTGATAAATTCAT
GCTTGATGTGAATTGTATTCATATAAATTAAAAAGAATGCCGAAACAATA
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TACACTGAGTGTTTTAGTACCTTAAACTTTTCGTAATAGTGTTACTTTTA
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TTAAATAATATCAAATACATAATTTGTATTGAGAAATGACTGAATTATTA
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TGCATTTTCTAAAAACCAAAAACAAGTTTCCATTTCTTTGCCCAAAATTT
TACTTATTTTGAAATGATGTTTAAGACTAATCAATGTAAACGTGTTTGTC
TTATTTGGTTTAAAATACCTTTGTATGACCTACATGTAAATAAATATAGT
GTTTTAGATATCTTTGTAGTTGGAAATTTACTGTTGCTACAATTAAAGTT
CTCTGATTCAGATCTATGTCTACATACAATGGTTATATTTAGTCTACCTG
AGAGTAAATATTAATATTTCCATTAGGTTAATATGTGTTAATTGAATTTA
TTATTACATAAAATATTATTTATAATAACCGGTCAAAATGGCCCGTTAAC
AATCTTTATACAAAGTCATTTTTATGGAAAGTAAAATGAAATAAAAAGTT
AATTGAGGAAAAGTAAAAAACTTCCAGTCTCAAAAATATCAACAACAGAT
ATTTTTCTTTGTTTAAAGTTGAAAAGGGGTCAATTTGACGCGTATGGTGG
CACATAGGTGTTTCAAATTTTAAATCAATTTACATTTTTTGATCCTTTGG
TTATCAGATTGAAGCTGGATTTACTTTAATTAAGCCTTCATTTAACAATT
TTATGAAACAAAAAAGTTGTCTTTGCATAATCTTTTCATAAATAAATGCA
ACTATTAATTAATAAAGCCTATTAATGGTAGGGATTAATTTGTATATGCA
TATTTTATTTTATATGATAAAAAATATTTTTCTCTCAATTTTCAATTTTA
GCTATATGTAAGGCCTGGTTGCTTAAATGGATTTTGCTCATCTCCTGAGG
AATGTCTGTAAGTACATTTTGACCTTCAACCATTGGAAAAAACTATTTGA
TTTTCTTTTTTAGTATATTGTTTCTAA back to top
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