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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s33 | supercontig | LSalAtl2s33:1105410..1115436 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000006208 >EMLSAP00000006208 ID=EMLSAP00000006208|Name=EMLSAP00000006208|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=318bp
MTSFKNSANISSKFILRILLLASISRAQNYNGLSRPNSIPVGSSSSSSTK
SNLWQSQRPPDMAKITDLEVMCGNSHMEVMINFDRPFYGIVFSKGAVDIY
NCIYVQPQSGQAAYKFKIMYDSCGSKPDLNGKFYENNIVIQYDKDLIEVW
DEAKRLRCEWYNDYEKGVTKAPIQVSDLDVIELNFRGDNVDCWMEIQQGK
GPWASPVAGIVPLGTTLTMVVGIDDKQGEFDMRLKSCEASDSKSRPILLS
DENGXVLRPKMISKFMKMKSSDSRATVVTYAFFHAFKFPDSMAXNIXCKX
XESLSLFXHIHLCTLCLF back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s33:1105410..1115436+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000006208-702055 ID=EMLSAT00000006208-702055|Name=EMLSAT00000006208|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=10027bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s33:1105410..1115436+ (Lepeophtheirus salmonis)
AACTCGTTCGTGTCGTGTACTCTGATAGAAAAATTAATATATATATATAT
ATATTATTTACATATCCTTATAGATATTATTGGACATCAAAAATTTCATG
TTCCTTGTCGAGAGAAGCACCATTATGAATAAACCTTTTTCCTTTTGGTA
ATAAAACGCATTACAAAAGGAATCAGTGATCTCCCTAATTTGCTAGTGTG
GCTTTAAGCATAGTCCAAGTGCCGTTCTTTGATACAACATATAGATACAA
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TTTTTATATCCAGCTATATGTTATTTATAATAAATATGATATTAAGAGAA
TGGCTATACATATATACCTACCCTCTGTCTCAAAAAGATGACATTGCGGC
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TTTTGTTTTTGCAATATAATAGAGGCACCTATAAACATACGTGATTGAGG
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AGCTTCAATGTTTCTTTAGAGTAAAAGATATTATATTTCCGCTAAGTTTT
GCTACGTCATTATTAAACATTGGTTTAGCGGTTTTTTTATAGTACACAAA
AGTGAAATAGTGGTTTTATTATACATAGGTAATCAATGTTATGTACAAAG
TACATACTTCCATTTAATGACCATTTGTTGTTGTTTTGGAAAAACAAACA
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ATTGTTTTCTCTAAAGTAAGATCCTCTCTTCATTCGAAGAGATAGTGCCC
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GAAGTTTTACGAGAACAACATTGTCATTCAGTATGATAAGGATCTCATTG
AAGTTTGGGATGAGGCCAAAAGACTTCGTTGTGAATGGTATAATGACTAT
GAAAAGGGCGTGACAAAGGCCCCCATTCAAGTCTCGGATCTAGATGTAAT
TGAGTTGAATTTTAGAGGTGGGTTCCCATATTGATTAATTAATTAATTAT
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GGGGACAATGTGGATTGTTGGATGGAGATTCAGCAAGGGAAGGGTCCATG
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AAAAGACATTACGAAGATAGATCCATACATATGCAAGGGGCTCTCATATA
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TTCGACGCTCTGTTAAAAGAACCAACAAGATTTTTATAGTATTTCATATA
TATATACAACTATATTAAAAAAACCACAGTTGCAAAGTCCTTTTTCACTT
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AATATCAGTATTTGTATATTTTATATAGTATACTATCAACATGCCCAGGA
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GTTATAGCCCCTCAAAATATTCATGCCCATTTGATAAAGAATAAATATAT
GTAATTGTCTTTCTCTGTCCTGGCCAAACTTTCTTGTAGTTGGGCAAGGA
ATGTACAATATTTTACACTCTCAGTAACTGCCTATTTTTTTTTAAACAAG
TCCCGTTTCTAGTCGATTTTGTTTTTTTTTTTTGTCTTTTTTTTTTACCT
GGGAAAAAAATATTTTTTTTTTGTGTGTATATAAATATATATATTACTAC
TATAAGAATATTTCAAGTACCTTAATTTCCTTGTATTAATAATATTGATG
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AACTATTATACCCAAAACATGTAGGTATATTCTCCCCCCTTCCCCCCTCA
TTTAGTCTCATTCCCCAAAAACACGTAGATTAGAGCTGTTAGTTCCTCAA
TTTTTTGATCACAGCTGTTTGGAAAAATTGATATTTGATAAGGAAATAAC
TTATGCGAAATTTTATTTCCTACGATGTCATCTTTAGGTCAATATTTGAA
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GTCATTACTTTGCATTTATGAATTATGATAGACATTATTCTAACCTATAA
AAAAATCTTAAAAGGTTTTTTTCTAAGGGTACCCCATGAAGCACAAAGAG
AGAATAACATAAGAAAATTTTGATCTTTCCTTACTAGGATGAGCACTAGT
TGCTGATCAACAAATTTTTCACACTTTTTTCCATAGAACAATTTTAGAAA
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AAAAATAGTATTTTTACTATATAAATTTACGAAACAAAGTGTTACTATTC
TTATTTAATAATTTGATTGAGATATGGGACCCAAAGATGACCTCGTAGAA
CAATGCAAATTTCCATAGGTAATTTTCATACCATATGAAACTTTTTTGCA
CTAACCGTAAGCGAAATTTAAAAAAAGTAGGAAATCAAATTGTTCTTACG
TACAGATAGCTGATATCTAAAGCACCTTGAGGTTTTATTAAATATTTAAT
TGATAGAAATGCGAAAATTTTTGAAATCTTCAGAAGCTTATATTTAAAAA
AAAGTATATTGTGATGTAATCTTCAAGTTGTTAGTGATTCAATTACTTAT
TCTTCCCTATTTTTATAATTCAAATCTATTAGCAAGTAAGGATCATTATA
GTTTATATAGTGATCTTTGTCAGCAGATATACCGTCTCTCAATTTTAAGA
ACATATACTTTACACACCGCAGTAAGTGCACCGTGCCAAAATGCCAGCTG
ATAACTGACATTGTGCGTCTCTCTTCTTGCATATATTATTCTCTACATAC
CAACTAAATGCTTGCTAATTATAAGTCAAAAGTATGTTGATTTAGGTGTT
AATTAATGTAAAAGTCCTTAAATTCCTTTAAATCGTCACGGAGTGTATCC
TGTAAAAAAAAACCATATCTAATATATATTTGCTAGGATGGGCATTTGAT
GTAATATTTGACTTTTAATTAATACATTATAAATATTGGCTCAACATAAA
ATTAATCTTGTACAAAAAAAAGTATAGGAGACAATCCCAATTAATTTTTT
TAAATTTCACATTGGTATATTATACAGATACATTTGAGTCAATTATAGGG
TTTTTATTTATATTTATGAGATGAGTTAAGATACTCAAGGATATTATCTA
TAGCATACAGCCTATGCTTGAGTTATAAGACCTATATATATATATATCCC
GATATGGCCGTTCAAATAAAATCTATAAATTTATTATTCTTTTATTATGA
CGATCGTCAATTAAAGGTAAATTAAACTAATTTCTTTATTGGAAATTAAC
GATCATTTGTCAAAAAATACAATTTTTCTAAAATATCATTCTAGTTTAAT
TTTGTGTTGACGGGCCATATATTATGTTTAGTAATTTTTGGACAAAACCA
CTATCTATTATATTTTGTATTGTTGTACATATCCTATACTTATTCAAACA
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TCAAGTGTGTTGTTTATCGTTTAAATATACATATATGTACACAAGTATTG
ATTTCAGCTGTATATTGTATAGGTATATAATATGCAGATGAAGCAAAGAG
TCATGCTTGATTTAGCCTTGTCATTCATTGATAATATTTTTTTATTCCTT
ATTTTTCCTTAAACATAATTTCAATTCAATTCTACTTTCTTTTGAGTAAT
TTATCACATAGCTTCAGGGGAAGTCAATTTCGTTTATAGCCATACGTATT
CTATTCTTGAAATAAAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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NNNNNNNNNNNNNNNATAAATAAATGAATACACATTCCTCACTGCAAGTT
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CGCCCACGTAGTAATAGAACTTTTATCATATCCTTTTATACTTTCTTCGA
CAATATTATAATNNNNNNNTCCATGATGATTAAATACTTGACTGCATGGA
ATTTATTTGTTCATACATTTTTCCTTATGATTTCATGTTTTATTTTGGTA
GTGAATATAATTATTGATGGAGACTCTTTATTTCAATAGAAAGTACCTGT
GAATAAGTTGAAATGGTTGACATTANNATACTTGGCGTTCACTATTTCTC
CAAGCCATATTTCTCTTTAAAGAGTTAAGTAATAGGTGAATTAAAACGAT
TTGAGCGACTTTTTTATTTATTTTGACAATAAAGTTAACATAGTTGGGAT
TATTTAGTTTTCTGACTAATTTTCAGTTCCTGGGCAATGTAATAAGTCCA
ACCTGTCCAACCAAACGATCTCTATTATTGTATTGACATTTTCGACGTCC
ATATTACCAAAACAGAATCTTTGGAATCATTCCGTTGCTGTTGCATTCGA
TACTGTATTGGGTTCATAAAGACCACAATTTTTTGACTMCCTGCTCCGCC
ATTTCATCTTTTGGTCCTAGTGAAAAATGTATCGACTTTCCTCTTTTTTM
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TTTTTTTATGTAATTTATTAATTGTGAGATATGGCTGRCTTAATACATCT
GTCAAAAAAAGCTCAGAACTTTTTCGTTGACCTAATACATTTTTTAAAGA
AGTACTTATTTAATCTCTGGGACTCTTTCTTTTGAGAAACTGTTTCAAAA
TAGGTAGAACAACATTTTAACTCAAAGTTATAATGGTGTATTAAGTGAAC
ATTTTATTGATTTTTGATACCCCTTCTAGGAAGAATTTCGCAAATATTTA
ATAGCTAATACACTTAAGGTACGGGTCAGTTCTTATTAAAGTTGGTTGGA
AAATTAAATGAGGAGAATAACTGATTTGTAAATAAGATCTTCCTACTATG
TAAGTCTATTTTGAAATAAGTTGCAATTCCTCCTGTCTAAAAACCATAAT
TGTTTTTTTGTTTTTGCAAAAAATATGCAAATATCTACAGGGTGTGTAGA
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AGTACTGTTTTTAAAATTGAAATACCTTTTTAGATATGAAATTCAATTTT
TACGATTTAGTTCACGTTACAAAAGACAAAAACCTTGTATTTCGAGGTTC
TAGGTCAATTTGTGGAAAACATTTTTGGCGAAGAATAATTTGCTGAATTT
TCATTGGACAAAAAATGGTATTTAATATACATATGATTGTATATTTTAAT
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TCATATTAGGTAAATTAATGAGTAGGATCTTTTACCGAAAAATATTTATT
TTATTAATTATATTAATTAATGGTCATTACATAAACACAACATTGCGACA
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ATCACAGCCAACCCAAAAGATGGATTTCCCTAAATTTTTTCACGTAGGTT
CTTAAGGCTCCAGAAACGGTTCTATAGCAATTTTTGGGCCTTCAAGGCAA
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TTTGAATAATGAACGAKTTCTTTGATGCTCAGGGAAGCRGCGGTGGAAGA
ATTTAACCTGCCTCTGATACCAGCAACCCACACCCCGTGGCTGGGGGTGT
ATTCTAGCTTAATAGAAGGGGTTCTTGGTGCTTAGAAATACTGCGACAGC
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GTATTTTGGGATATTAGAAGGGTTCCTTGATGCTCAAGAAAGTGTCGGAT
CCCAAATAAAGCAACTAATTCCGCATCAGGAGAAAGAAGAGTGCCTAAAT
ATTAGTAAACTCATACTCAAAAAACCAACATGAGTATAATTCTTAAAATT
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TAAAATATCTAGCACAATTATTGCAATTTATTATATATTTCTACAATGAG
GGAAATCTGGAAAAGCTCTTGCCCGTAGAATCACGCTTATATTTCTGTAT
TGTTATGTCTCTAGTCATAGAAAATGTGTTTTTTAATAATAAAAAATAAC
TTTTTGATATTTGCACCTGGCAAGAAAACTATAAACATCGAAACGAGAGA
TTTGTAACCTATGCCTTCAAAATAGGCACTCTGCGATTGTATTAAACTTG
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ATCTTACATGAAAGATCTCAGCTGGAACAACTTGCATGATAAATATATAA
TTATATATTAAATGATTGTACCTTATACTTCAATTGAAGAAAATATCTAC
GTATTAACAATAATACTTGAAGGGGGAAAAAAATACATGTAGCAAAATAT
TTATACGTAAAAATGTAAAATTTCACTTATTAGATGATTGTTTATTTCCA
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AGTCATGTTTTTAACGGGAGAATACGCACTCATGCTTTTTCTACTTATTT
TTGACCAACTTAGGGCTATTGTTCAAAGTATGATAATTATTAAATGAAAG
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ATATGTACGTATACGTATATAAAAAAAAGTAATTTCTATTTTCCAAAGGA
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AAAATGATTTCTAAGTTCATGAAAATGAAGAGCTCTGACTCACGAGCTAC
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ATTCACCTATGTACTTTGTGTTTGTTTTGATTTTTTAAATATATAAATAT
GAAGTTTTTTGTGCCATGATTGCATGTTAGGAAAAAGTAAATTAAACAAA
AATTAACTTTCAAAACTCATGATCAATCAGGAATCCAGAATTAGATTGGG
GAAAAAGTAATTTTAAAGTTACAGCCTCTTTTTAAACTAAGTATGTCTTG
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