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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s340 | supercontig | LSalAtl2s340:327554..342492 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000006244 >EMLSAP00000006244 ID=EMLSAP00000006244|Name=EMLSAP00000006244|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=160bp
MENMACNRTYYGEVGRSYRLSIPXPRANKLPFICDLHFVAKHDDFGDLIQ ITLEEFKLGRFRDSHTAGCPDGYLKLLDGMTPRDLHRLSGGKGDNSGQFC GIVSKSIRPVYISEKNEVTAALRFFKFYGGETPERNFAFRIKYKFLRLSR AHSRERDGKK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s340:327554..342492+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000006244-702091 ID=EMLSAT00000006244-702091|Name=EMLSAT00000006244|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=14939bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s340:327554..342492+ (Lepeophtheirus salmonis) ATGGAAAATATGGGTAATTTGGGGGATCATCCTTGAAGAAAGGGATATAT
TACACAATGTGATGTGAGTTATAACATGTATTTTTTTTCCATTGCTTTTT
CATGTTTTTTAATAAAATAATACAATATAAGAATGCTTTTTCATATTTAT
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TGCCTCAAAAAATGCCTTCCTTTGATGTTGTTTTATACGAAGTCCTTCCT
CCATAGTCATTAATAAATGCCATCGGTGATTATAAGTTAGATCTAAAAGT
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ATTCATTGTATTTGGAGCACTCTTTCAAGTTTCACCTCCGAAAAACAAAA
ATTTCTAACAAATTCGTMAAACAGACGATCCACATTTTCTTGAATGACTA
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GTTTGTATTACATAGTTAGTGGTTGTGAACAATAATTCTTTGAGGAGAAC
CTTGTTTTGTGTAAGTTAGTAGCTAATCTCGGTTTTAAAGTACAATTTAC
CACGTCCTTTAATATAAATTATTAAACATGAAGCGACATTTGATTTTTTT
TCAATTTCCAATTTTAAATAAATAATAATAATATATAAGTGCATTCCATC
ACAAGGAAATAGCCTCAAAAGATTCAATTGCATATGATAATATGAAATAT
ATAAATAATCTTCATTATTTGATAAATTGCACCACAAAATAGTTTTTCTG
AGGAAGAAAGGAAAAATGCCTTAACATATTTTTCACTTGTAATGGTTTAT
GCTGTATACTCCATTCTTTAGCCCAACATTTAGGGAACAAAAATTTGCAA
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AATAAGGAAGTTTTTATTTTTTCATCCCATGTCTGTAAGTTTCAAAATGT
CTGGGCAACATAAAAAAATACCACTGGTGTACAGCCTTCTCCGCGTCAGT
AACAGTGCAAATGAATGCTTCAAATACCATTGGCATCTCAATCCGAACGA
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TCCTCCTCCATCTCGGTCCTCAGTCCCTTGGCTTAAAGCGGTTTGAAGAA
GAATGTATTCCGTACCTCTCATATAAATTTGGATTCCACCTGAGCTCCCA
TCATAGTGGCGTAGTACGCTATGGACACATCGTCTTCGTCAGAGATGTAA
TGTAATCGCTGGCGTGTCGAGGCTAATAATTTTTACGAAGGAGGACATAT
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ATTTTTTCTTGATTCTATTAAAAATTAATTAAGTTATTGCAAGTTTTGAG
TTCCCATTATGTACATTCCATATACAGGGTCCACAGAAAGTCCTATTAAA
TTAACTTTATATAATATAATTATATGTAAGGTTGTCATATATTATGTTGA
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AAGGGCAAAGATCCACCACCCTCTTGAAGAACCTGAAACCCCTAGAAGTC
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CAAAGCAAGGATTGCATGAACTACCATGAGGAACCTCACTTAGATGGCCA
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TCCCTAGAAATTGAAGAGACAACCTTACCTGGCAAGCAAGGTCAAAGCTA
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TGAGAAGGGTAACCATGGAGTCAACAAAGTGGAGAAGCCATAGTCTATGA
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TGCTGGACAGGGTGAAAATCAACACCAAGGAGTAAATCAGCACTATTTTG
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CTCCTTCCAATCGGATAGTGCTCCCTCCCACACATCCAGAGAGATGCAAC
GGTGGTGTGAGGGAAATTTGAGTGGCTTYAATGACAATACAGTCTGCCCC
ACCTCCAGCCCCCACCTAAACGTTTTGGATTACTCCATGCGATCTATTAT
TGAAAGCAGAGCCTGTGTGACCCTCAGCACGAATTTGGACAACCTGAAGG
CCAAACTGTTGGCTGCCTGGGGATCCATCCCCATGGACATGGTGCGTGCA
GCATGCAAGTCCTTTCCAGAGAGACTTCGACTGCGTAACATACTTTCTGC
GGATCCTATATATTGGCTTAAAAAATAAGAATCCTCAAAATGCACACATA
TTTATATCTTTAATACTAATAATAATATGTAATGACAGACATTGAGCTCC
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TTTAGAAAGGTATAATATGACATATAATTTTATGAGCAAATAAATCAAAT
GGTAAATAAGGGAAATGAGGGGGTCCCTTTTAGTTAGTTGGATATTTGTT
TGGCAGATTAACCTTGGAGGAAATAAAAAAAGGTATGGGAGTGAGAAAAT
TTATTTTTTCAGAATCAATGCAATAAAAAAACCCAAAATGGTTACCTTAT
TATGTGCGTGGTCTTTTTACAGTATATATTTTTTACTCATTACACTTAAA
AGCAATGTGCAATAAATTACTAATAAAACAATTAATTTTATTGAGGCAAT
TTTGTCTAACATTGCACAAACCTTACACACCATTAACCAATCACAAGTTC
ATTAAATGTATATAAAAAATGAGAGAAATGTGATTATTTATTTAAATCTT
TTTAATGGAAGGTTAAAGAAAATGAATGTCATTGTATGTATGAAAAAAAG
CCAGCTAAATCATGCTTTGAACTGTCATATTTAAAAAAAACACAATTATT
TATATTACATAATTTCTAAAATTTGTGAGCTTAAATGCTCACAAAATTAA
TCATATAAGTTAACGTTTTTCTATGTAAAGAGAATAAAGTACTTTTATAA
ATGAAAGTACTCTCTAGATGAATGACTTTAAAAAAATTATTTCTCAAAAT
AAATATGTGTATTTTATATTTGTTTAAGATGAGTAAAATGTAATCAAATA
TATGTTGACAAAAAAATGGATTTCCTTCTATGATAAATTGATGAGGAATT
AGAAAAATCATTGAACAGTAAGCTATTAATGGAAATTGAAAAATGAAATA
AATTAAAGATCAAAATGACTTTAAAATTTTCATATTTTATTAAGTGTAGC
TGTTGTTTGTAGTCTTAAAATGTACAATATAAGAAAAATAGCAAAATTTC
ATTTTATATTTAGTTTATATGATGTTCAAAAGCTCTTAAATATAGGGATA
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TTCAATGAACAACACATATGTGCCGTTTTGATAATCAGGAATGACAAATT
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TAAGTATCCAAACACATTAGGGGAAAGGAGATATGTGCACCTAGTAGTTT
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TGGATAGATCACTTAGTCCTCTCTCTCTGATAAACTTTATAAACGAGGAG
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TTCAAAAAAAGTTTTTACTCAAATACAAAACTTATTTATGTAGTTTGGAA
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GTATTATGATCAAATAAAACTGTACAGAATAAATAGATTAAAAAGACAAT
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GCAGAATAGGAAATACATTGATATAAAAAAATTATTTATATACAATTGTA
TTCCCATCCTTCTTTGTATCAAAAACATTTTAACTTAAAACTGATTGATC
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ATATATAAATATTTATATTATATGATAATTTATGCTGCACAAGTATGTTC
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TAATACTTCGTCGCTGGGTTTTAGTTGTGAACTGACCACAAAAGTAACAT
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CATTTGGATAATATCTTATTATATTCTTCTTTAGATATAAAGTATTTTCA
GAATAAATATTGGTAGCAATNAGGAAGAGGTTCAGAAATGGTGCGCCTGA
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CATTATATTTTAGAAAAATAACTGGGGGATTTGTATAATTTTGTATTTAT
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TTACCAAAAATATATAAGCAAACTTATAAAAAACAAAATTAGTTTCATCT
GAAAAACTGTACTTCCAAGAAGATAAATTTGGAATTAACATCAAAAATAC
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TACCAAACGCCTATGTGATTGAAATTAATTCAAGTTAATATAAGTACACT
CTTAAATTCATCTATTTATCTTCATTGGATTTATGTAAGAACTGCTTTCT
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GTAGTTAGATGTATACTTTTAAAGTGTATATATTTGCATGACTATACATC
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TAAATTCTATGGAGGAGAAACCCCGGAGAGAAACTTTGCTTTTCGTATCA
AGTACAAGTTCCTTCGACTATCGAGGGCACATTCACGGTAAGGGATAATA
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CATAAGTGACACCATACAACATAAGCTCTGGGTAGTGTATTTGTAAAATA
GAAGTCTTTCGACAAATGAAAGAAAATGAATGTAATGATTTATCATTACA
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AAATGACTGAGTCATTATTGAAAAATTAATTGCAATAAAATAATATTTCT
ATGAAAAATATTTAGTGTGTTAAATGAAATGCTTTTTCATATTTTAGATC
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TTCCATATGCTTGTTCTTTTTTGTAATACCAAGTATATCGTAGATTAATT
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AATATTATCTCATTGTGATTTCCACATAAAGTTATATGAGATCCTCATCT
GTTTTATTAATTTTTTTTTATATTGTGATCATATTATTAGTGTGTCAGGG
GACCATTACTATTATATGTTGATTATTTCAAGATCTGCTTCAAAGCAGAT
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AGTAAAAAAGTTACACCAAACAATAAATCGTTTATAATTACATGATAAAC
AGTTGAACAATTATGATAATTACATTGTTGAAACTTTGTATTGTTTTTTA
AATATTCCATCCATTTTGAATTCTTAATTATAAATTAAAATGCTAAAAAT
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ACAAGAACTTAAAGTTTCTACCAGACATTTGTCATTTGTTATTCTTAAAT
TAAAATAATTGGACTTTTATCATGGATGAAAATTTATATGAATTATTAAT
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CATGTATCGTATAAATATAATACTATAATTTTTTTTAACTACCTATGTAC
GTCTCCGTCCTCTCACTTAAAAAAAAAAGAATCCAAGAAATTGGAAAAAA
AAAATGGAACAAATTTTAAGTAAATCAGTTAATAAAATTAAATAAACCTC
TTTTAAAAATGTCTGTAATTAAAAATAAATAGTAAAAAATGCATTATGAA
GATAAATAAAGAATTGTTTGATTAAATATTTCAGGAAATAATGAAAAGAA
TTCATAATAAAATGTAGTCCACTAACAGAGAACTACATATAAAAAAAGTT
GGTTGAATTTAGAGCAAAATTTACTTGTTTTGTTTCTTATTCTAAAATTT
TTTAATTGTCGTTAGACAAAACTTAAACATTTACGATATTCAATTTAAAA
ATTTTTTTTCGCATAGTTTAACATCTCTAATTCTAATCATAAAATTATGT
AAGTTAATAGACAAAATATAATTTTTATTATTATCAAATATAATGTAAAA
ATATTCTTAAGCGATAAATGAAGATTTAATTAATCTAATTATCACATTCT
TGTTCTATTTTTTTTAGAGAGAGAGATGGAAAAAAGTGA back to top
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