EMLSAT00000006244, EMLSAT00000006244-702091 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000006244
Unique NameEMLSAT00000006244-702091
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s340supercontigLSalAtl2s340:327554..342492 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000006244 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000006244EMLSAG00000006244-689010Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000027243EMLSAE00000027243-736171Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000027244EMLSAE00000027244-736172Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000027245EMLSAE00000027245-736173Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000027246EMLSAE00000027246-736174Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto776424auto776424Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000006244EMLSAP00000006244Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000006244

>EMLSAP00000006244 ID=EMLSAP00000006244|Name=EMLSAP00000006244|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=160bp
MENMACNRTYYGEVGRSYRLSIPXPRANKLPFICDLHFVAKHDDFGDLIQ
ITLEEFKLGRFRDSHTAGCPDGYLKLLDGMTPRDLHRLSGGKGDNSGQFC
GIVSKSIRPVYISEKNEVTAALRFFKFYGGETPERNFAFRIKYKFLRLSR
AHSRERDGKK
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mRNA from alignment at LSalAtl2s340:327554..342492+

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000006244-702091 ID=EMLSAT00000006244-702091|Name=EMLSAT00000006244|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=14939bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s340:327554..342492+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGAAAATATGGGTAATTTGGGGGATCATCCTTGAAGAAAGGGATATAT TACACAATGTGATGTGAGTTATAACATGTATTTTTTTTCCATTGCTTTTT CATGTTTTTTAATAAAATAATACAATATAAGAATGCTTTTTCATATTTAT ACTACTTAATTTTTTTCATTTTTTCTATTTAATTCTCCGTCTTTTGATAT TGAAGAAAATGTTTGATCTTGCTATGTTTGTATATGTATGAGTGAAAATG CTTAAGTAACTCAGTGAGAAGACATTAATTTACTTCACTTGAAACTACAA CATGAAATCAACAAATTTATAAATATGACTTATCTTTTGTATTAATTTGT TCCGAAATGTTTGAGTCTACCCCAGTAAGACAAGAAATCATGTCACATAG TCTCCTCCGGCTCSGACGCTTGATAGCGTCATAGCAATGGTTATTGAACT CCAACATCCCTTCTTGGCTCACTAACTTCATCATCCGCTGAACACGGCGT GTGAGGTCTTCATGGCTATCAAAACGTAATCCCGGAGCAGGTTATTCAGC TTACGGAAGATAAATGGGTCTCAGAGAATCGTGCTGTAAAGACTCTGTTT GATCATTTCCACCTTTATCCACGTTAAGTACTGCCGAGTGTCATTGACTA AGTGGGGATGTGCGTTCTCCAACATGAGCAAAATTNNNNTTGAGGGAGTT TTGTTCCTTTTTATGTTGGAAAACCGCTGTCCTGTTGCACGCATTCTCGA GCTTAAAAGAGCCTTAACGGATCTCACTAGCCCACGGAAGGATGTTGCAT GACTAGGAAAGGCATCAGGGTAAAAGATAATGAGGTCGGCTTGGATCTCA GTGACTATTTTGCCCAGTTTGTAGCGTATCAAAAGCACGAGCAAAAATTG TGAGTCTCCATATTCAGTGACGAATGGAAAAACATGTGGTATGTAAGCAT TTGTTATTTAGTCTTTGAATAACTATGGACTGTTTTGCCACCATAAAATT TATAAGAAAATCGATCTTGGTGGAATTTTGCAGCTAAATTTTTTGATTTT TTTCTCACCATTTCGTAACAGAATAATACGTAGGTCATTCATAAACAGAA TGAAAGAATCTCATTCTAAAGTTTGGATGTGTTGTTGACACACAAATCAT CACAACCCAAAGAAGTAAAAAAGTACAAGTTCTGTTATATAAATTTAGAT GCACAAGAACACAATTGCCTAAGGATTTTAAAATTTTTCTAAGAATATTG TATTTAATATGTTAAAAAATTAAAAATAAGGTTTTTATAAAATAATAAGT GAAAGTATTGTTATATCAAGGTACAAAAAAATAAGATTCCGTTGACAGAA GAAATAAGCAATATTTTCATAATATTATTTTTTGAGTGAAAATATACTTT GAAAGTTTCAGTTAGTAGCTAAAGCACAGTCGAAGAGTCAACAGCAGAAT TTTTTAACCATATTACACTTTCACATGTAGAACACAGGTGCGCTGTTATG ACGATATTGGTGAACAGCAATCTGGAAATTAGCAATGCTGAGGTATAAAA ATATAGCAATCGATAAAAAATGCCTTGGTTGAGACCAAAAACTCCTGGGG AGTGATCCAAAGGACTACTAAAATTAGGTGTCTAAGGATATTTGTCTTCC TAGCTCCCCGTCCTTAATCCAATGAATTATTTGTTTAAAGCTACCTTGAG TCAAAGATTAACAGAGGTCCTCACACAATCAATAAGTCCTTTATTGACTT CATCGTTCTGGAATGCAGGAAGTTATATCTGGCTCTAGTTTTGAGGTTGT TGGGGAGGGGCAGGACCCGAATCGAAGCAAGAAAAGCTAGATTGAGGGTA AATATATTTTATATGATTTATCTCCTTCTTAGCTTTTGTTTTTGAATAAC TGTTAAATAATGCCAATTCAAACATTAATATCTAGTTGATTGGTCAAAAG CATCGGATTGTGTTGTTAGAACCTGCATATGTTCTTACTATAATGTTATA CCAAAATCGATACGTAACTTTTTCCGTAATCCTCCTTACCAACATAAGCA CCATTGAGAAAACATAACTTCATTTCAACTTCGTTGGCGGAACTAATAAA TCAAAAACAAACCTAACAAAAAAAGATAGTGTACAATAAATAAAACTGTA GATCAAATTGAGGTGCAATCAGAAAAATTAAGATAGATTTGGGTTCATTT ATAAAATCCTTGATAATTTGGAAGGAATGAGATTAGCTTACTTCAACAGG GAGAAAATTTCATTTGTGAGCACTTCTATTAAAACACATTTGTTGAATAT AGTTTGTACATCAATTACTTAACATTTGGATAAACTATCCACTTTTAAAA TCAGGAGTGGGTTCTTGTTGCCACATTTATGAAGCATCAGGTCAAAAATA ATACGAATTAAACTTTTTTGCGTAAATTTTCAGCATTATACATTCAAATT CTTAATAAATGGAAATCACCTATAACAATTGATTGGATACTTGATACAAA ATACTATATATTTATTGTAGTAAAATCGGATGAGTGTTTATGTACAATTA TTATTGTTTATCTGATGATAACTCTACACAAATACTTTTCACTCATCATT TGAAACATGAACTAGATGGAAAGCTAAAAATACTGATTTTAAGAAAAAAC GTATTAAAAAAAGGACTAGTACAAGGTCAATGGTTGAGGCGTAAATAGAA AAGTAACGAAATAGAATTAAGGACGCGAAAATTTTTGAGAGAAGTTGGCA GCTCAATTTTTTCAGAGCTCAAACAAAAATTAGATTGAAATCGTAGTCCT ACAAAAATAATAGTAAATTGGACAAAAGTTCAAGCTTGTATTATGTTTTA AAATGAGATATTTTTGGGGAAATATAATGCATTCAAAATAATTTTAAGTT CTCAATATTCTGAACTCATTTTTTTTGTAAATTTCTTGATTCAGTTATTA TATCTCGCTATGCATTTTGCCAAATACTTTCTTCTTTTTTTGTCAATAAT ATCCAATAAATTTTTTGATATTATACTAAAAGAACATCCCAGCAAAAAAT AATGAAGTTAAAATCTATGAACTGATTTACCATTAGGTATCAATATTTAT AATAAATCATTGGATCATGGATTGCTAAATACTGATATTGATTAATTAAT TGTAGGATTTTCAAATAAAATATTAACTACAGTATATAAAGGAATATTAT TTTATTCAGAACGTGTTATTTATAGGTTAATTAGTCTACATCAAGTGATC ATTGATCAATTTAACCATGAGTTATTCCGATTGAAGACGATTCATAGTAG TTACACATAAATAGAAAGTTATGGCGATAATAACGATTGTTAAATACGCA AAAGATGGACTTAAAATGTTAAGTAGTTCACATTTAGCCTCAAAATCTAT GATACAAGTCTCAAATTCTAGAAGATGAAGGTGCATATTCAAGCAGATAT CCTCTATATCTTTGTACAAGGGAGGATGAAACATCCTTGATAATAAATTC TTCAATAATGAACCACAAAAATATACTCTGCATGAAAATCAAATTAAAAA CACTATTTTTACAATTTCAATAAATCAGAAAAGGGAGATCGGGAGATCAA ATCAATTTACAAGAGGTGGGACATGCATTATTAAATGTTGAAGTAATCTA TAGATGAAAATAAGTTCATCAAGAGATACTCTTCTCCAATATAAGATAAA TCTGATGAACTACGAAGGAGCTGAAAATCTCATAACTATGTCATTGATAT TGCCTCAAAAAATGCCTTCCTTTGATGTTGTTTTATACGAAGTCCTTCCT CCATAGTCATTAATAAATGCCATCGGTGATTATAAGTTAGATCTAAAAGT GATAAAAGGAAATATTGTATAAAAAATTAGCTCTTTCTTCTACAGAATAT ATTCATTGTATTTGGAGCACTCTTTCAAGTTTCACCTCCGAAAAACAAAA ATTTCTAACAAATTCGTMAAACAGACGATCCACATTTTCTTGAATGACTA CTTAGATCACAAATGAAGGTTTTCAATGGAAAATTATATAATCATCTATT TCTGAATTAATGATTCATTACTTTTTAACAAAAATTAATTCTTCTCTTCA ACAATTGTTATTTAATCAAAAAATTATTTATTATTTATTTTCAAAGTTCT ATCGAGGAGGCTTAGTGGCTGGTTTATATCCATATTTTAACAAATCTATG GTTTGTATTACATAGTTAGTGGTTGTGAACAATAATTCTTTGAGGAGAAC CTTGTTTTGTGTAAGTTAGTAGCTAATCTCGGTTTTAAAGTACAATTTAC CACGTCCTTTAATATAAATTATTAAACATGAAGCGACATTTGATTTTTTT TCAATTTCCAATTTTAAATAAATAATAATAATATATAAGTGCATTCCATC ACAAGGAAATAGCCTCAAAAGATTCAATTGCATATGATAATATGAAATAT ATAAATAATCTTCATTATTTGATAAATTGCACCACAAAATAGTTTTTCTG AGGAAGAAAGGAAAAATGCCTTAACATATTTTTCACTTGTAATGGTTTAT GCTGTATACTCCATTCTTTAGCCCAACATTTAGGGAACAAAAATTTGCAA TTGATTTTTATGATAATTTCATTATGGAATCGAATGAAAACTGAAACAAA AATAAGGAAGTTTTTATTTTTTCATCCCATGTCTGTAAGTTTCAAAATGT CTGGGCAACATAAAAAAATACCACTGGTGTACAGCCTTCTCCGCGTCAGT AACAGTGCAAATGAATGCTTCAAATACCATTGGCATCTCAATCCGAACGA TCTACAACATAAGGCAGTCTATTATAATACCATACTGCCAAAAAAAAAAA GCAGCTTCTACAGCAACATATTGGCTGGCTGCTGGCACACCTCCMKGTGT TCCTCCTCCATCTCGGTCCTCAGTCCCTTGGCTTAAAGCGGTTTGAAGAA GAATGTATTCCGTACCTCTCATATAAATTTGGATTCCACCTGAGCTCCCA TCATAGTGGCGTAGTACGCTATGGACACATCGTCTTCGTCAGAGATGTAA TGTAATCGCTGGCGTGTCGAGGCTAATAATTTTTACGAAGGAGGACATAT TTCATAGAAAATATATTGTATTTAAACCTATTAGAAATTGGGGTTGAGTT ATTTTTTCTTGATTCTATTAAAAATTAATTAAGTTATTGCAAGTTTTGAG TTCCCATTATGTACATTCCATATACAGGGTCCACAGAAAGTCCTATTAAA TTAACTTTATATAATATAATTATATGTAAGGTTGTCATATATTATGTTGA AACACTAGTAAGATCATACCTAGATCAAAAATAACAGTTTTGAATTGTAA TAACGGGGTTGTTAACCACAATCAAAGCCAAGACAATCAAAGTGTACTTG AAGGGCAAAGATCCACCACCCTCTTGAAGAACCTGAAACCCCTAGAAGTC AACCCCATGCTCAGCGAGAGAAACATTGAGAGGTCTCAATCTATCAAGGA CAGACCCATATCACTTTTTTATCAAGTTCAAAAAGGACGCCCGGAGTAGT CAAAGCAAGGATTGCATGAACTACCATGAGGAACCTCACTTAGATGGCCA AGGATTTCATCAAGAATGAGAGACTTTGTATGAGATGACCTTGAGATGTA TCCCTAGAAATTGAAGAGACAACCTTACCTGGCAAGCAAGGTCAAAGCTA 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TATGTGCGTGGTCTTTTTACAGTATATATTTTTTACTCATTACACTTAAA AGCAATGTGCAATAAATTACTAATAAAACAATTAATTTTATTGAGGCAAT TTTGTCTAACATTGCACAAACCTTACACACCATTAACCAATCACAAGTTC ATTAAATGTATATAAAAAATGAGAGAAATGTGATTATTTATTTAAATCTT TTTAATGGAAGGTTAAAGAAAATGAATGTCATTGTATGTATGAAAAAAAG CCAGCTAAATCATGCTTTGAACTGTCATATTTAAAAAAAACACAATTATT TATATTACATAATTTCTAAAATTTGTGAGCTTAAATGCTCACAAAATTAA TCATATAAGTTAACGTTTTTCTATGTAAAGAGAATAAAGTACTTTTATAA ATGAAAGTACTCTCTAGATGAATGACTTTAAAAAAATTATTTCTCAAAAT AAATATGTGTATTTTATATTTGTTTAAGATGAGTAAAATGTAATCAAATA TATGTTGACAAAAAAATGGATTTCCTTCTATGATAAATTGATGAGGAATT AGAAAAATCATTGAACAGTAAGCTATTAATGGAAATTGAAAAATGAAATA AATTAAAGATCAAAATGACTTTAAAATTTTCATATTTTATTAAGTGTAGC TGTTGTTTGTAGTCTTAAAATGTACAATATAAGAAAAATAGCAAAATTTC ATTTTATATTTAGTTTATATGATGTTCAAAAGCTCTTAAATATAGGGATA TTTAGTCAATCAAGATGGCAAGACTATAAGACGAATGAAAGGAAAATCAA TTCAATGAACAACACATATGTGCCGTTTTGATAATCAGGAATGACAAATT ATTCAACAAGGAGATATTTGAGACAAAAAAAGTAACCTTGAGAACCATAA ATCGTAATAAAGACCATGGAAGATACAAAGAATCCTCGAGGAATGATCAA TAAGTATCCAAACACATTAGGGGAAAGGAGATATGTGCACCTAGTAGTTT CAGTCTTAATCATGAGGACTATTTTGTGCAAATTTATCTTTAAATTTATG TGGATAGATCACTTAGTCCTCTCTCTCTGATAAACTTTATAAACGAGGAG ATGTCCAAAATGAGCCACATGAACAAGAAATGAGAAGAATTATTGAGGTT GACGCAAATTATTTCGATTAAATGAATGTTGAACATTATTAAATGTCCAT TATTTCGTTTTAAATAAAAATCTAAAAAAATAACGATTTTATTGCATTTT TTCAAAAAAAGTTTTTACTCAAATACAAAACTTATTTATGTAGTTTGGAA TCATTTGTGTTAAAGAATAACACTTTTTTGAGATGTTTGGAGACTTTAAT GTATTATGATCAAATAAAACTGTACAGAATAAATAGATTAAAAAGACAAT TAGAAAGCCATTGACTACTATGTACAATAAACTTAAGTATTTTAAGCTCT CCCATCATGTATTGTTTTTATTCTTTATTTTAATGTAAAATTTAGTAAAG GCAGAATAGGAAATACATTGATATAAAAAAATTATTTATATACAATTGTA TTCCCATCCTTCTTTGTATCAAAAACATTTTAACTTAAAACTGATTGATC TAAATAACAATAATAATAAAAACTCTAAAAGAGAATATTAACAAAAAAGA TACTAATAATTACTTTAAATTGTATAAATCTTTTGCATATATTTTATTTA ATATCAGAGTAATGTAACATAATAAAGAAAGGCGTATATTATTATTGGTA TTATCATCGTTATGAATAAAAAGAGAAAGTCATTTATGCAAGCACAAAGG TTCTTATCATATAATGATACCTATTGATATATAAATAAATATATATAAAG TCATCTGACAAATATTTTATTAAATAAAAGATAACCATCAATACAATTAA 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AATATAATAAATTGATTAGGCACAACTGCATAATTTAAATTTACATACTT TTTCTCTGTCTTTATAAGTAATAAATTATACTTCATCATTTCTCAAAAAG GTTTCTTATAATAAAAAAAAAACCTTTAATTATAAAATAAATGGAAAAAA GTAGTTAGATGTATACTTTTAAAGTGTATATATTTGCATGACTATACATC GACTATAACCAAAACATATTTTGCAGATCACATTGGAAGAATTTAAATTA GGACGATTCAGAGACTCACACACGGCAGGCTGCCCTGATGGATATCTAAA ACTCCTTGATGGTATGACACCCCGAGATTTGCATCGACTCAGTGGCGGAA AAGGAGATAACTCGGGKCAATTCTGTGGTATTGTGTCTAAAAGTATTCGA CCCGTTTATATATCAGAGAAAAATGAAGTCACTGCGGCTCTAAGGTTCTT TAAATTCTATGGAGGAGAAACCCCGGAGAGAAACTTTGCTTTTCGTATCA AGTACAAGTTCCTTCGACTATCGAGGGCACATTCACGGTAAGGGATAATA CACTAAATATATATTTAATTGATTTTAAATAGGAAAATAAGGCTGAGAAC CATAAGTGACACCATACAACATAAGCTCTGGGTAGTGTATTTGTAAAATA GAAGTCTTTCGACAAATGAAAGAAAATGAATGTAATGATTTATCATTACA GTAAAACATTCATTAAGAGAAAAAAAAATCACCTTTAATGGCATAGCTAA ATCGAACAAAGAAGGCAATGTAGTTACACATTTGGAACGAAAATTTGAAA AAATGACTGAGTCATTATTGAAAAATTAATTGCAATAAAATAATATTTCT ATGAAAAATATTTAGTGTGTTAAATGAAATGCTTTTTCATATTTTAGATC AAAAAATTAAAGTCTGATTTTTTAGTTAAATAAAATTGTAAATTAATTTT 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