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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s342 | supercontig | LSalAtl2s342:241012..253741 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000006297 >EMLSAP00000006297 ID=EMLSAP00000006297|Name=EMLSAP00000006297|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=464bp
MELRIRECCCSLATFVRIFGLVMIFAYILSAVGVILWYGLFTEENSEHSR LLLVIFILGLSFVFLGILVNLLLLFGLSCNKRTLFLPWLVFHFMIILGCF ALGLFIIIHYTILEPSKRANGEEEYEKAFDGXSQTTXAMAVVSVIPLLVG IFLMFMWIFVDQLFIQMRAMKKKKNIEIGASTLSLAYSVKNDPLRPHHSI PVSRRILKQPPPPRYVQSLPRSTGGGKARKLGGRRVELSHKTSSASTSTS LHRRRVASRLKKSKSLEQILDSSSSSMSGPHYWVSNGNIPSSNSGSHRSH RKRRREVKSMAPSYCTMERSSRSKSAPLRKEDSGGGQRAVEFLDAYDEAS YLPPPVLDESQPYIGDCDLSGLVPPPPIDSDTGKSVTIASEVTEYRYPEK SNRKSIQEDLNLMHHNEEHHPSNGNNSNNPSSATDTWFTKLSNRSRPSYT KDQIIGLYCQDVPL back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s342:241012..253741- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000006297-702144 ID=EMLSAT00000006297-702144|Name=EMLSAT00000006297|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=12730bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s342:241012..253741- (Lepeophtheirus salmonis) ATGGAGCTTCGTATACGAGAATGTTGTTGTTCCTTAGCGACATTTGTTCG
AATTTTTGGACTTGTAATGATATTTGCATATATTCTCTCGGCAGTAGGTG
TGATCCTTTGGTATGGTCTCTTTACTGAGGAAAATTCGGAGCATTCCAGG
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AATCTATCAATTTCTAGTTATTTTATTGTGGCGATGAACTTTTGCTGTAC
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TTAAAAAATTACCAAGAAATATCATAAAATTTAGTGATAAATAATTAATT
TGAAGATTCCTCATATAATTGACTCATTTTGGCTTGTTTWCTCATTCTAT
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AAATATTTTCTGCCCAATATTACGTAAACATAAATTGGTCAATTATAAAC
TTTACATTCAAATTTCTTGGATATCTATGAAGATACCCAAAAATAATATC
AACAGTTGGACACCCTCATTTGATCTATGAGACTTTAGTTTGTTACAAAT
ATGGCCTTTTAAATACATAAAATATATATTTAAAAAAAAGATTATAAATG
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AAGACAAAAGCAAGCTAGAAGGATTTTTCTTAAAAATTGAATGTGGTTTA
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ATTGTGGACAATCTGATAATCTGACTCTTGATATCAAATAAAGTTAAAAT
TATTATGTATCTTAACTCATCTTACGAATTCGAATACAATGCCTACAATT
GACTGAAATATTGGCCTGTATTTATATTTGAAGTAACCAAAATAAATTTG
GGGTTTCTCCATTTCATGAATTAATTATCTCGAAAATTGTTTATATGTTG
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GAACTTGAAGATAAGTATTCGTCGAAGAATACAAAATATGTCATTAATGT
TAAATTTTGAGAAATAATATTCTAGCTTGCTTTTGTGCTGATGAACTACA
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TGTCTGATTATTCCTTTTGGAGATATTGTGCAATGTTGAGTGCATGTGCA
AGAACTGGTTACTATCTTCTAATACCTATAAAATTTATTATATACATAGA
TATATTACATCATCTTCTTTTTTTCAATGTCTTTTAACATATCCTGATAA
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TTACTCTTAAGTAAAATACAATTTGAAAACCCTTTGTTCGTAGTATGTTG
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GTTTTTAACAGTTTTTATCATATTCTATAAATATTCTAAAAAATATTCTG
GAAACAAATATCCTGAAGTTTTTTTACATATTTTTCATTTTTTGGTCATT
ATCCTCTTCTTGTCCATTCCTAAGGGATGAAGATAAGAATACCATACCAT
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ACATAACAATCGTATAAAATAAGTAGAATATTGTGAAAAACGATATTGGA
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TATTTAACTATCAGTTGATATAAGTTTATTAAATTTTAAAACTCTTTTAA
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TCACATGTAGCTACTCAATACGTAGATGTTCTCTCCCCAAGAAGTAAATA
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ACAACACCAAGACGCGAATGTTAAAAAATGCTTGGGATTTACTACCAAAC
ATACATGTACTCCCCTTTTATTTTATTTTTTAATATGAAGAAATGAGCGT
ACACACATTCGTTGCTAAACCTCATCTAAAGTCAGATTAATTATTTTTTA
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AAAAATGAGTACTCAACTTATATTTTATAAATATGAGTTAGTTGACTTTT
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GCTTAGCTTATTATTGTCAATTTTCCTATTGAAGGAATGTAGTAATAAAT
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CATTTTTCTTTTTTAATATGACATACTCCATTGCATTGTTGTTACTTTGA
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TGCAAAAAAATGCCAAATTGTATAATCTCTAAATATATTCAAACCATAGC
AAACACATTAAGCGTTTGTTTTGGTAAATTATGGTCTAAGTCAAACTAAC
CCGGAGTTTGTTTACATATTAGTACTTTGTTTACAAAAAAAAAGATGTTA
GCGCAATCTTTCGGTTATTATTGACCATTGGTAGTTGTATATTATTTGTT
TATATCGACATCTGCACCATCTTGTGGAAGTTAATGTTTTTAAATTTGTT
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ATATTATTTCGTTTTTTGTCCCTTTTCCTCTTCTAGTCCATTCCTAAGTG
ATCATTCCGAGGTATGAATACTATGGCTTGGGCCTTCTTTGTGAATTAAT
GTACATACTTKCTTGTTATTTTTATTTTTTTGTATGAGTTGACATTTTAT
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TTATATTTGACAATACCTCTCCATTTATGTACCACCATAAGTATGTATAT
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TGTACGTAGCAATTGGACTTATATGGGTTGGTTTTGTATCTAAAAATATT
CGTTTAACATGCTCTGAGGGTTTTATATATGTGTTATGGATGTCCCGAAT
TCACATTATAAAATCCTCCACGGTAGAAATTTTTCAGATACAGTCAAACC
TTGTCTAAACCAAGGTAAATAGAAATATAATGTTAGAACATCATGTCATT
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ATACAGACTTTGTGAAAACGCAAGCCCTAATTCACTATGACGTCAATATT
AAAAAACCTAGTGGAAGTTAAAACATCAGTCGTACACGCATTATGGTATA
ACCAAGGGTAGCTATAGACTAGGATAGCCACCGATTTTTTACCTGTTCCA
GTGTAGAACCAAAAACAAAAAAGATTAATAAAGTCAATAGTGCTGAAATA
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TTTTTTATATATATTCCCATAGATTGAACCTTCTATTACAACGTAAGTTA
TAATTCTTTATTGGCAATGATAAAAAAAAATGAATAACAAATATTAATCT
TCATCAAAATGTAGAATGTATTCAAATAATATATAAAATATTCAAATGAG
GTTATTTTTCGGAAGACAAAGAGGATAATTTAGCAGATTTTCTTCGTTGA
TCTGATGTTGATTCTTTTTTCCGCTTCAGACTGATCATTTCTTGAACTTA
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ACATACTTAGGAAGTTGTTTATGTAGCGAATTGACAAAAGAGCACATTCG
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TCTTTAATTAAAAGATTCTTGGAGCAGAAACAAGACTTTTTTTAGTGACT
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ATGCTTCTTTATTAAGAAATTCTTCTTTTTCTAGTTCTATGCTTTTCAAA
AGAGACAAATGTTTGGAATTTGCTAAGTCTCTATAAGTATTCCATCTTTC
TTAACTAAGTGCTTAAGACAATGAGTAGGTACAATAGAACCTTGGAGAAA
AGATTTGAAGCTCAGATTTTCTTTTATAATTATTCTTCTTTCTACCACAG
TCAATTTTCACCCTCACAAAATTGGAGAATATATATATTTTTTGGTTTGA
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AAGAAAAAGAAAAGGTGACTTTCGACTAGACTATTCTTGAATCAACAAGT
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TTAGACGCTGAATCTATCCATTCTTTCTCAAAGTGAGAAGCTGAATTGGT
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TTCCCATCTGGGATTTTCTTTTTCTTTCTACTGGGATTCCTATCCCAAGA
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TTGAATCTACTCGTACATACAACCATTTACGCAATACTTTTGTACACATA
AAAAATCGTTTGTCATCTTCTTCTTTAAGATGATACTCTTTTGATAAATG
TCAAATTCATATGTCTATGTTATTTTATCCTTTTTCTAAATAATGTGAGA
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GTGTTTGTTCGAAAAAGTTCACCTCCCGTCAGATCCCATCCTAATAACAT
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GAAAAACGGTTGTTGCGTGTGTTCTTTCTTCTTTTTTGTTCATTATTTAA
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TCTTTGATGTAAATTGTTTTAAAAATCCATAGTTGAATAAATATATAAGA
ATTTAAATATAATTATAATATTTTCACTGCAATAATGCTATTTTCAATGT
AGAAAGATCTCTTATTTATAGCAGTAATTCATTTTCTCCTACCAACATCA
TACAACAGGCAGTTAATATTAAAAAGGGTCTTAATTCAGTAATACTATAA
GTTAGCTTGTGTCTTCTTCTTGTACTCTTTTTTACTTTTTTATATCAACT
CTACCTAAAGTACATTCTTTTCTTAATGACATCCGCAATTAATCTCCACC
AATTTTTATAAGAATAATACATACTTCAATTTGCCCCAATTTATTAAGAA
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TGCGGTGTTTTAGATTTGGAGCGTTTTTTAAGGACCGAAAAAAGGGACGG
GACCAACTTTTAGTCCCATTTAAAGTACCGACATACCCATAATACCTAAT
ATGAATATAGGAGGTAGTTAGGATGACCTTCTAAGGACATCATTCATAGG
CTGCCTATATAGTTAGCTATATAGGTAGATTTTATTAAAAGTAGATCAAC
GAATGAGAAATTTAACACGCTTCGGATTGTGCATTTTTTTTATATCTATA
TAACCATGGCTAATTAAACGAATGAATGAACATTGAACTTCACCGAGTTA
GTATCACGTAAATGTCACTAATGATTCCATAAAATCTCATAGGTTGCTTT
GCTTTGGGTTTATTCATTATTATCCATTACACAATATTAGAGCCGAGTAA
AAGAGCCAATGGAGAGGAAGAGTATGAGAAGGCATTTGACGGCGMCTCAC
AAACGACAMAAGCCATGGCAGTGGTCTCTGTCATTCCTTTAGTAAGTATT
TAGTCATTTAACCTAATATATTTTCCATGCATTAATTATTTTTTCTCTTC
CAGTTAGTTGGGATATTCCTTATGTTTATGTGGATATTCGTTGATCAGCT
CTTTATTCAAATGAGAGCTATGAAGAAAAAAAAGAACATTGAAATTGGCG
CTTCTACCCTTAGTTTGGCGTATTCTGTAAAGAATGACCCTCTTCGTCCG
CATCACTCTATTCCAGTGAGTCGAAGAATACTTAAACAGCCCCCTCCTCC
CCGATATGTTCAAAGCTTACCGCGTTCAACCGGTGGCGGTAAAGCTCGAA
AACTTGGTGGAAGACGTGTTGAATTGAGCCACAAAACGTCTTCAGCTAGT
ACATCTACAAGTTTGCACCGACGAAGAGTCGCTTCACGACTTAAGAAGTC
AAAAAGCTTAGAACAAATCCTAGATTCGAGTTCCTCCAGCATGAGTGGGC
CCCACTATTGGGTATCGAATGGGAACATTCCATCGAGTAATTCTGGAAGT
CATCGTTCTCACCGCAAAAGAAGGAGAGAAGTAAAGTCCATGGCTCCTAG
TTATTGCACAATGGAACGTTCCTCTAGAAGTAAATCAGCTCCTCTGCGCA
AAGAAGATAGTGGTGGTGGKCAACGAGCAGTTGAGTTCTTAGATGCCTAT
GATGAGGCATCCTATCTTCCTCCTCCGGTGCTAGATGAATCACAGCCCTA
CATTGGAGACTGTGATTTGAGTGGACTCGTCCCACCACCGCCCATTGATT
CAGATACCGGTAAAAGTGTGACCATCGCATCAGAAGTCACTGAATATCGA
TATCCAGGTAAATGAGATTCAATGCAACTTCTTGTATTTTTGTTACACCA
CTAAAGTCCATCCATTTTCCAATGATTTAGAAAAAAGCAATAGGAAATCA
ATTCAAGAAGATCTCAATCTTATGCATCATAATGAAGAGCACCATCCCTC
AAATGGGAACAACAGCAACAATCCTTCATCGGCCACCGACACATGGTTTA
CCAAGCTCTCCAATCGATCTCGACCTAGCTACACAAAGGATCAAATAATT
GGTCTTTATTGTCAAGATGTGCCTTTGTAA back to top
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