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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s343 | supercontig | LSalAtl2s343:350089..357466 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000006310 >EMLSAP00000006310 ID=EMLSAP00000006310|Name=EMLSAP00000006310|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=59bp
MIKSFILLWNKYRGRHRIYRCPLRINTQYLLLEVYKKGPYVSNHPCEATY
LLLNLNLKN back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s343:350089..357466+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000006310-702157 ID=EMLSAT00000006310-702157|Name=EMLSAT00000006310|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=7378bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s343:350089..357466+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGATAAAAAGGTAAAAAGGTGAAAAAAAAATCATTTTTTTGTGAGAGTA
TTAATCAATTATTCAGTGACAAAAAATTAAATTCAATACATAAATTGTAA
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ATTTTCTTGTGATATAACCTTCGTGTTGAGCTTGGATTTTATAAGCCAAA
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ATCAATCAATCGGGAATGTAATTAGCTGACATTGAAAAGAGATAAAAACC
TCATCAAAACGTATAAATAGGGTCAATCAAATTTTCATTCCCTCAGTCGT
CATGTACCACTTACAGAATGAAGTCAAAGTTTTTCTTAAGCACAGGAAAC
CGCCAATTCAAATTTATCGACTTATATCCAGAAAAATATGCTTAAGTTGG
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GCTAAGATCCGGTCGTCTCAGGACTGCATGAAACCGGAAGAACATCGAAA
TACTTTGACTTAAGATTTATTTTATGGTACCATCAAAATGTCAATGCCAA
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AAAAATTCAATAGAAAAACGATTGGATTTGCTCTAGGTAAATTTTTTGTC
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TTCTTAATGTTACTTTGTTTTTCATTAGCACTTTCACACGTAGTTCATAC
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TAGGATGAATATATAAAAAAACTAGGTTGTGTTATCAAAAGTTGACTATT
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TGTACGATGACATCGACAACTGCTTTCAACAGCTACCAAGGCCAACTGGG
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TCCCCCAATACTGTTTCTCCCTTGACAATAAGAAGAGAGCCTGTGCTACT
CCCCACCGTAATTTGCATAACCTCAAGGCTTACGTCCAGCAGTAGTTGGG
GGCCATGTCTGAGACCTTCAGTAAGAAATTAAAAATATATTCCTAACTTC
ATACCCCAGTGATATCATTAAATAGTAACACATCTAGGAATTACTATTTT
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TTTTTATTAAACATCTTGAATTATTTGTGATTAAGAGTATAAATATTCGT
TTTTCGTCATTTTTCATGCTATGAAGAAGAACCAAAACAATTTTATCTCC
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CTTTATATGATAAACTTTATGCTTTTAATTCAAAACTTTTTACATAATCT
GTAGTTTAAACTATTTCATGAGTCTAAATATATATTATTTTTTTCTAGTT
TCATTTTACTTTGGAATGTAATAATATAAGCCATTCTTTGTCTTCAACAA
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AATTACTGATGACATACATTGACGTAGGTGATCCATTTTTCATCTCCAGT
CACAATCCTCTTGATAAATGATAACTGAACCGGCCAAGCTCAATACTCGC
TCACACCTTTTCCTCTCGCTCTCCAAAAATAATATCCCTACTAATAAGTA
AACAACGCTCATACCCCATTGATGAAAACATGGAGTATCACGGGAGATGA
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GTCAACAAAATAATATATATATATATTTATTTGTAGAAGTACAGAGGCCG
ACATCGTATTTATAGATGTCCACTGAGTAAGAAACTTGTAGTTTGTTGTA
CATACATACAAATTAAGCATACATTTCCTTATCAAAGTTTGAAAACACTA
TGGCCCGATTGCACAAACTTAACTTAAATTTAATCCAGCTTAAACCTAGT
AACATCATAAGTTACTCATATAAATTGAAGCCAAGTTGGTGCAACTGGGC
TTAAGGTCTAAATGGAATGAAGATAGAGTGAAGAGGGATAAGATATATCC
TTCATAAGATTTTCACTTGAGAACATGGTCAAAGCCGTGCAACAGAGTCC
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AAATTAGTTATTCCCCCTTACCCTAACAGCATCCTATTTCTACAAAGCTA
GAAACAAGTCCATGTCTACAAGTGAACGGTTGAATGTTCACCCTAAACAA
AAATCTAGTCGTCAGATTAGTTGAGGAGACAGCTTTTTGTCAAAAGATGA
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ATTTTCATTTTTGTCAATGCTATTTGTAAAATTATTTCTTTTCTAATAAA
AGGTAACTAACTAAATATGGCTAAAAAAATTCTGTCAAAACTCTCAAAGT
TTTTCAAAAATCTCCAATCCGATGCTTAATATCTACTAGCAAAATAGAAA
AACAAACTATAAAATTGACTAAGTTATTCATTTTTCCCGCAATAATCTGT
TTTATATTTATCATACAACTGTAATGTAAATTTAGGGTTGTAGCTTTTTT
GAAATTTGAAGGGTCTTTCGCAACTGTCCCGTGTTTTTATCACGTTTTAC
ATGTTTTAAATGCTCCCTGGCTAATATTATGCATTTATTTTTACCGAATG
AAGTCCCAATAATTTTTTAACATGTATATTAATTATATATTACATAATAT
ACTCAAAAATAAAATAATAATACAATGATTATTCTGAGTAATAATGTACA
TTACCAAAAACTAAAAAAACTAAACAAAAATGAATCAATGTATGAAATTC
ACAAACATTCACTAAATTTAAATACGTAAAAAATGCATGAAAGAAACTGA
ATATACATGTATATTTTCAAAAATAGTCTTTGGATAAGTATGTAGAAATC
TATGATGTAATGACATAAGTATCATATGGATATAATTAGTCTCCAAATAA
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TAGGAAGATGAGCCTTTGAAATGAGTCCATCATGGAGAGAAGAACGTCCA
TTATGGCTCGCAGCAAGATTTTTTGGGGAATAGTCTGTAAAAAATGAATA
GAAAAAATTAAATTAATATTATTTTATAATTATATTTCGTCAAATGGATT
ATTTACTATAAAAAGTTAAATTTTAATTATTAACTGATTTCAATTTATAA
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ATTAGATTAGCTGGGAGGAGCTGCTAGATGCCATAAATTAACACAAATCC
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ACAACACTGTTTTAGTTGCAACTATAAAATGTAACGCTCTCGTTAGAGAC
ATATTTTATTTAATCATATTTATTAATATAAATATATACTTTAAGTACTT
TATATTCATTAGTGATAGGACGATTCCAGAAAAAATGTCGATGGCGATTC
CGATAAAATTCTAGTAAAAATTACCGATGCCAATTCTGATTGTTTAATAT
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ACTATATATATATATTTATTTTTTTGGAGGGGGATGGCTTGGTTTTTGGA
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AATATACAATCTGATATTTAAATTTTTTTCTTAAATCCACAAGTATTCAC
AAAAAATTTATGAATTCCTTAGCTGTTTACGAAAAAATTAAATTTGTTTG
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GAAAACAATTTTTAAAATTAAATTTTGAATATAATTTTTTTTGAAAAAAA
TCAAATATTAAATTTTGTGTAGAAAAAATTCCAAAATAAATGGTTATTCA
CAGGTAGTTAAAATTTTGTGAAGAAAATTTGAAAAATTAAATTAAATTGC
AAACATTCAATTTTCTAGTAAATAGAAAAAGTTCCAATTAAACATTATTT
TCCCGATTCCAGAGACAACACCAGATTCTTTGTTCCCGATTAATTGTCCA
TCACTAATATTTATAGATTTATTACAACTTGTCTTATTTAATCCCTAAAC
GCTCAGACATTAGTAAAAAGTGAAGACAAGAATATCTCGAAACCTATCGT
CACATGTTTATCTTTATTGTATCTTGCAACCTTTCCACCAAAAAGAAAAG
TAGAAAAAAACAGAAAAACGGTTGATAGTGAGAATGAGTTAATAGCTTAA
CAAGAGCTAATTCAAATTCAACCAATCAACGTTAAAAAAACATTGATAAA
GGGATTTTTTTTTTGTCTATGTAGGTAACGCCATGATATACTTCTCAAAA
ATGAAAAGAAAGGTCCAAAATCATATGGGGTACAGTCCAATAAAAAACTG
TCCCTAAGTGATTGACTATTCTTCATTTAGTACAAAATATTATATTATTA
TTTTAATTTTGTATTTAGGAATCAACACTCAATATTTGTTACTAGAGGTG
TACAAAAAGGGACCCTATGTTAGTAACCACCCGTGTGAGGCAACATATCT
ACTGCTGAACTTGAACCTTAAAAATTAG back to top
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