EMLSAT00000006344, EMLSAT00000006344-702191 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000006344
Unique NameEMLSAT00000006344-702191
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s346supercontigLSalAtl2s346:398832..414386 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000006344 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000006344EMLSAG00000006344-689110Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000027697EMLSAE00000027697-736625Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000027698EMLSAE00000027698-736626Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000027699EMLSAE00000027699-736627Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000027700EMLSAE00000027700-736628Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto777280auto777280Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000006344EMLSAP00000006344Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000006344

>EMLSAP00000006344 ID=EMLSAP00000006344|Name=EMLSAP00000006344|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=437bp
MSSPMFIALINTKSGGNVGSYLLSRFKEILDEERVYNINADGGPGRALKE
HLHTENLRIIACGGDGTVGWILSEMDKLSYPDSACIPSIGIIPLGTGNDL
SRSLNWGGKYRDKPLRKVLLDIAKADVVDLDRWSLLVTPRDVIMDDKLLD
EDDLMFGTSDDNLPLNVVNNYFSVGIDAHIALQFHKARNNNPEHFTSRTR
NLLFYGLEGGKDLFKQQWRNLMNHVRIVCDGEDFTDKLKAYGAHSVLFLN
IKSYAGGTKPWNRKNGTQDIADGLLEVVAMDNLDLAILHAGGSGTSVCQC
REAXITSNKPLPMQIDGEPCMMRPCQIVIRGLGSKVKMLARNKTATCKLT
LSFEYLFKMMMCLCSISSICLYYYVYVHSRSNAATVTVGGVGGRGSGADV
SAAAATSLLLLLPSLKQTLIILLSNTYQNMHSSYLII
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mRNA from alignment at LSalAtl2s346:398832..414386-

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000006344-702191 ID=EMLSAT00000006344-702191|Name=EMLSAT00000006344|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=15555bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s346:398832..414386- (Lepeophtheirus salmonis)
GGGGCTATGAGTAGTCCAATGTTCATTGCTCTTATCAACACAAAGAGCGG AGGAAATGTAGGATCCTATCTCTTATCCAGATTCAAGGAAATCCTTGATG AGGAGCGAGTCTATAATATCAATGCGGATGGAGGTCCGGGAAGAGCTCTC AAGGAGCATTTACATACGGAAAATCTACGCATCATTGGTAGGTGATGAGT GAATGAATACCTCTTCTATCTGCCTTCTTTTTACTTACCTTCTTATATAT CAATATGTTTGTATATGTAGCCTGTGGAGGAGATGGAACTGTGGGTTGGA TCCTCTCGGAAATGGACAAACTATCATATCCCGATAGCGCTTGCATACCC TCTATTGGTATTATACCTCTTGGCACAGGGAATGATCTCTCTAGATCTCT CAACTGGGGCGGAAAATATCGTGACAAACCTCTCCGTAAAGTTTTGTTGG ATATTGCAAAAGCGGATGTTGTAGATTTGGATCGGTGGTCTCTTTTGGTT ACTCCAAGAGACGTTATCATGGATGATAAACTTTTGGATGAGGATGATCT TATGTTTGGAACTGTAGCTAAGGTAAGGTCGTTCGTTCATGTTGCTTGTA CAAACATTGTAGTACTTAATGTATAGCTAAGGATGTCATTTTTGTACTGA AAAAATGACCGGGAGTGATACCTATGATATTAATGGTAGTATCAGCTGCC TGTTATTTGATTTTGGGAGAGAAAATGAATTACTTTCTTTAAGAAGAGAA CCTTCTCCATTTAAAATTGCTTTAGGACAAGGAAAATATAATAAATATAT ACTTATTTTATTATGAATTTTTAAAACAATTTACACCAAAGATAGGCAAT AATGCTTACCGCAGAGGGAGAAGGTAAATAATGAAATGTATTTTTATTTT TTTCATTACAATAATGACATCCTTATACATAATTGTGCGCTGTGCATGTA ACTTGTGGTTATCCTGTTGAAGTTTTTCTATTTCTGAAATTCCAAATTGA TATGATCTTAGATCAATATTCATTGTTTTGTTGCTCAACAGTTTGTATTA ATTAATGGAATATTTAAAAAAATTAAATTGTTTTTTGTATCCGGTTATTG GGCGTTTAATGATGCAACAGCATTTTTTATTTGAATGGTTGTAATAAGTA ATTAATATTTTAGAGGCAGSAAGATTAACCACATTTTAAATATATGTTTC ATATTCAATTATTAAAAATTAAGACATCTAATTGACTTATTTATAATTAA TTTCTTAACTATRCCTGCCTCTAAAATATATATTACTTCTTACAATTAGT CAAATATTTGACTTAATTATATTTGATTTGGAAACATTTTCACGCTACCT TACATTGCATATTTATTAGATATTTCATAAGAAAATGAAAAGTTCTACTA AAAAAATCAACCAAATTCAATTTTTTTATGGCAAATCTTTGAAGTTGTAA TATAAGTTTTAGTCTTATTTAAGCAATCATATAATGCAATTGAAAAAAAC CAAAAAAAAAAACCCGCACATTTTCTGTATTCAATATAATTTAATAAATG TTTTTACCAATCGTTATTACTTTTAATTTTCATAGATATCGTTATTTCAT ATCGAAATATGGCTCTGAATCGAAATTATACTCTAAAAACGTAATTTAGT CGTTAACTGAGTATTTTTTCGTAACGGCTTGTACAGGAAGAAGCTCATTT AACATACTTACTTTTTCCTTGTACAAAAGATTTGACCCCCAAGCTAAGTT TCAGTGTACACTCTATTGGAAATAACAATTTCCTCTGGCATAAAACCAAT ATAAAATATTTTACCAAAATTGTTATAATAACATTGATCATGTCTTTATC TATACTGTACCTCACAACCTCTCCTCTTAAAAGAAAAAGGCCCATAATCA CTTGGTAGTTAGGCAATTCTTCCAACTATACAATTATTATTAAATAATAG TTGGTAACGTTCACAGCTTTATAATAACTAATTTGTATCCAACAAATCAA TTTTAAGTGAACTGATTGCAGGAATAGAAGAAAAGACTTCGACAGCAGAT AACCAATTACAGTGTAATTACTGATTTAGGTTTTTTAAAGGAGAGGTTGC GTTATATAATCAAGGTAACACCGTGTCTACTGTTGATATTGTTGCAATGT TTGAAATTGAATTTTCACGCTTTTTCTATTTCTAAAGACGACTTAACACT GTGTACCGTACTTATTGTATTAGTAGTACTCTGGGGTCTTTTTTTAGGGG GGGGGGAGAGGGMGCAGTTTGTGTTATACATTAAAGTTAACCAATTTTAT ATTAATCACGGAATCCAATTGTTTAATTAAATGCCACTCTAATCACTAAT CATGATAACCAGAGTGCACGTTTGAAATAGATAATATATTTTTTATTACT AGGATTAAGTATTATGCTATTTTATAAGCCTTTTGAGATACGTCAAATCC AAGTACAAGACCTGTCTTATTTCTAATGGGGTAGAGTGTATCATTTAAAA AATAAAATGGATTTTTCTTTTTTTGAAATTTCTTCAAAGAAGCATTAAAA ATAGCATTTGTGTAGGGAAAATATTATAACTATATTTAAATTCATATATG TATATTTTATTATGGATTTTTAAATCAATTTACACCAAAGATAGGCGATA GTTCTTCTCTTAGAGTGATATTTTACCAGCCCCACGACCTATTTAATAAT GAACAAAAGAGAAGAAAGAGTAAACTTATCAACCGTTTTTCCTTTTCCAA TAGCTATATTTAGTTTTTCCTTTACACAGTTCCCATCTTTAAGTATAGTG TATTCCTTACCCTAATATAGAAGAGAGTAATTGAAAATTTACTGACGAAT TTCACACTGCTTATATCAAACTAAAGGAAACCCAAATCGATTAAATACTG TTGAAGAATTTATAATTTTTGGTGACTAAAGGTGGGCTACCACATCTATT TAGAGCTTTAAAACAAAGTATCGAAATGCACTAGTTAGCTTAAGGAAATA CATGGTGGGAAAGGACATATCTTTTTCCCACGGAAGATGTCGCTTTTTAT GTTACCACTGATCATATATACTATATACATATATACTATATCATTTTTGT CATTCCCCTCCTGCCGGATTCAACTTTATCTCCCCTTATCATAGTTTAAC TTGTAATTCATTTAAAAGAGTCTGAAAATTCCATGGAAGCTAGGTAGTTA GTTATGTAGTAATATTCAACCTGGCTGGAAAAAAGGTTCGCCACAATCAC TGCCATCTACAAATATCAATCACGAGGTCTTCGTTTTGCTACTTTGTTTT GAAATTTTACATCTAGGATGCGTGTACTTACATGTAATACGTATCCAGAC AATTGATTTCTAAGAACTTAGCATGTTATAGTCTTCAAACCTTCCTTTCA AAATGAAGAGGGGTTCGGGATTTAGAATGTGTCTGGTTTGTAGTAGTGAA GATATGATTAAAATTCATTTTGGAAGAACGAAAACAACTAAAATGAAGAA ACATTTTAAATCACAGAACCTTTTTATTTTGAGAGAGAAAGTTGTTCCTA TTTGAAGATTATAATATCCTAGGTTCTTAAAAATAAATTGCATATACTGT ACACTCATGATAGATGTAGTAAGCCGCCTTAAGAAAAGAGCCTCTGTAGT TGGCATCTTTATTTTCTTGTGAGTTAAATAGAAAATTGACTAATCAAACA CGAAGTAACTTCGAGTTTCTAGTAAAGTCAAATTTTCCAAAGGATATTTT ATGCGAGTTATCTTCAAATCTCAACAGCACCCATGTCAAAATAAAGAGGT 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TTGTGTATATATATTATTTTGGTAGGTGATTGCAGCAGAAGTAGTATTGG TTCAATTCTACATATCTACTTTTCTTACAAAAATAGATAGAACATTTATT TTCAAAAAATCATAATCTTATTTTTGTAGATTGTGTGTCGTACATATTGT AATGCATGCATATCTTAGTTCCATACATAAATCTTTTCAATATACAATGT ACATACGTTAGAGTGGCCCTTATTTTTTACTAGTGATGGGACGATTAAAA AAATCCCGATATCCCGATGCCGATGTGATTCTTGTAAAAATACCTATGTC GATTCTTTAATATTATAAATCATTGTTAAAAAATACAATTTTGCTATCAG AGGCGTCCATAGGTTTATGTTTTAGGAGGGGCCTTGGTTTTTGGAACTTT TTTGAAAAAAAAAAATCATTCAAATATATAATTTTATATTTAAATTTCTT TCAAAAATCTACAACTAAAATTAATTTTGGAGGGGGCTATTTTTTTTTTT TTCATAACCTAGAAAAGTAATAAATACTTAAATACCTGTAATAAATAAGA ATTGGAATAGTAAATTAAACATTATTTTCCCATTGCTGATTCCAATTCTA GAAAAAAACTACCGACTAATCGTTTCATCACTATTTTTTACATTTTTCTT CTTGTCAAATTTGTTGAAAAGATATGTTTTGTGTCAAAGTTTTGAAATTA ACGATATTTAGTATTCATTTTTGGGAATTTATCAAATTTTAATAAATGGT CTTTAAAAATATTATTGGTCAAATTTAGTCTTCTCTATATTAACTAAGCA AAGTTTATCTGTCTTTATGAAAAATATTCAAGGGGTACAATGTATATAAT GCCCCTGATGTATATGATAAATATAATTTGATCTAAGAAATAACAATTGA TTCGTGTTGCAGGCGTTAGCATCGAATATGCAGCATTGTTTCTGTTTGTT TTTGTTATTGATTTCTTATGTAAACCAAATATCATAATTCATATGCATTT TCAGTTTATGTTAATATTTGAATAAAAAATTAACATGTAGTGAAAATGTT CCACTATTACTCTTATATGTGTTTCGAGGACCGAGCACATATGAATTGAA ATAAGTATTGAGTACTTGGGAGAAAGTGTGCTAATGAAAATGATGAGTAT CACTGATGATTTGATAGGGAGTAAGTAGTACTGTATAATAGTAAAGCAAA ATTTGTCTTTTAGCAAACGGCTTATTACTCCGGGCAATCTCGAGTATAAC TCCTAGTTCATAATAAAGATAAACTTTTTCTTTTCTCAAATTATATTTAT CAAACTTGTCTTTTTACAAAAATACAATTATGTCAAAATTGTCAAAAAGA TCATTTAGATTCATAGCACATTGCAGTTAGCATATTGTTACTTCTGATAT ACAAAAAATAAAAACAGAACCAAAATGATTGTCCAACCATCAAAAAGAAA AAAATTTATTGAACTTTTTTTTGTCAGTTTGTATGTTTTTGTGCTTGGGA CTGGAGGTTCTTTGTCCTTGTTATGAAACGACACAAGACTACTCATAATT TTCCTTTATGTCTAAATATTTAGGCAAAAAAAGTTAAAAATATTTTTGTT CACTTAATAAAATTTGGTTGTCCGTTTTTCTAGTACGGTTTTGATATGGA ACCTGATTTTTTTCTATTATTGGGAGGAACTGTTTGGTGTAACTATAGAT GAATAATCAATAATAGACTGATCAATACTACTCTTAACAATCGATGGAGG GGGTAGTCAGGCTATTGTTGCATCGGCCCTTATTTAGGAGCACAATCCAG TCTGGTTCAACTTGTCGGTTCTTAAAGAACATAAAATCGATCCTTTGTGA CGTCATTGAGGGTGTTTTTCCTGTTTATAATTATTCTGTTATAATTTAGT ATAAATATAACATGTTATTTTTATATTGCATTATAATTAAATAAATAATT TTTTTAGCAAGATATGTGGAATGTTCTTAGTTTATATCTCATATATCTTA TTTGGGTGAATAAACCATGGATATTTTTATGAAAAATTCCAAAGTCCGAC AGTTAAGAATTGTCAGTCCTCAAGACCGGTCCCGAGGATATCCAATGAAA ATAAAAAAATATTTTATTTATATTTAGTTTGCTTATGTTAAAATACTAAA CTAAAACGATCTACTATAAATATATAATAGGTAAATTTCTATTTTAAAAC CTCATTGTATGTAATATTTTTTGTTGTTTTTCTATCCATTAAAAGTAAAT ATAATCAAACCTGCACCCTTTTTGACACTTTTGAAAATGCAACATATAAT TACATAATAACATACCATGTGGAATACTGATTTTAGTAAATATAAAGCAA TTTTTTCGAATTGCTATATAATGAATATACATTCAAATACTACTAACTCG CTAATCCTTTTCCTAATTCCCTTTTTTAATTCGTATTGAATATAAATTCA CCCTTTTTTCGTTACTAAAAAAAATTTTTTTTTTTAAATTAATTTGGTGC ATTTTCGTATCGATAACCCATACCTTAAAAAAAAAAAAANACACACGAAA TCGATCTGGTTTTGTGAAGAAAAAWCAACTCAATAAAACAAACTTGCCCT TTTGAGCCATGGAATATGTTATGATCAGAATGAAACATAACACTACGAAA GTAACTCAGAATTCTCAACCACTTTTATTTGATGTCTAAAATTTGTGCTT GTCTACGTTTTAACGTTTTTATCATTGTTTTTCCTAGCGGGACGAACGGA CATCAGGCACACACGCACATAAATTATTTTAATGCTATGTCAGATATAAA AAACTGAAAATTGTAGTAAATGGATGATACTAAAACAAAAGTGCATTTTT TTAGTAAAGTTCAAAACTTCCATGACGAGTGTTGGGGGCAAAATTGTGGT AACTCAAACATCAAAGATATTAGGGTTATTCCCTTTATGTCATTGATAAA GTCTAACATTTAATTTTAATACTTAAAAACAACGACATTCAGACTGTTGA AAACAATTTCTCAGATCTATTTTATTGTACAAATTGGAAAACATTATTAT TCATAATGAAAGAATTGATTTTCCCAGCTTCATTCTGTAATGTAAATATT TGAGTTACAGCAATTTGGTTCTTATCTTACGATATGATAATGATATTTTT ATACCGAAATACATTTTATAAGACTCTTAACATTTTGGAAATAAATATAA ATAAGTTCTACTCTAATAATGTACACAATGGTCCAGATTAATTTGTAAAA TATTGTAAGGGTTGTAACGAACAAACTAGATAGGGTAAAACCATATTTTT TATAATATTTGAAAGCTACATTTAATGACATAATGTTATTTATAACATCT CTTGATATTCTCGGCCACGCGGCCCCGGAAGATTTGGAAGGCCCGGTCGA CCTTGTGCAGATCCAAGTTTGCCATGTATCTTAACACAGGCCACATGCTC AATCCTCCCCCAGAGATAGAACTCGCATTGGTTCAGGTCTTGGTAGGACA AAAATCTGGGCTTCTAAAATGAGGACATTTTGTCGGCCTAGACATCTTGC GCTTTTTTGGCCTTGTGGGCACTGTCTTATTAAAAGGTATAATTTTCTTC CTTAGGTTACACCATCCATCTGGGGAGTATAAATGTGAGTGTAAAACCAG AACCAGTACAATGGCAATGCTGGATCTGTAAGAGGTAGCCTGGGTCATTT AAAGAAAAAAAAATCGTCTCGTTAAATTTTAAATATTATGAAACGTTTTG ACAGCTACTCTGATCTACCCCAAAACATCCTTCAAGTAGTCAGAGTAGTA 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AATATAAAATCCTATGCTGGCGGAACAAAGCCCTGGAATCGCAAGAATGG GACCCAAGACATTGCAGATGGACTCTTGGAGGTCGTGGCTATGGATAATT TAGATTTGGCGATACTCCATGCTGGAGGTTCGGGTACGAGTGTATGCCAA TGCCGAGAGGCTGMCATCACATCCAACAAACCACTTCCCATGCAGATAGA TGGAGAGCCTTGCATGATGAGGCCCTGTCAAATCGTGATTCGAGGACTGG GAAGTAAAGTCAAAATGTTGGCCAGAAATAAGACTGCGACTTGTAAGTTG ACCTTATCCTTTGAGTACTTGTTCAAAATGATGATGTGTCTGTGCAGTAT TTCGAGCATTTGCCTTTATTACTATGTCTATGTCCATTCAAGAAGCAATG CTGCTACTGTTACTGTTGGGGGTGTTGGGGGGCGTGGTAGTGGGGCGGAT GTGTCTGCCGCTGCTGCTACTAGCCTTCTTCTTCTTCTACCTTCTCTGAA GCAAACATTAATTATCCTTCTATCTAATACTTGTCAAACCATTTCCTTTC TTGCTCTCATACTACAAGATTAATTCATAGGACTTTTTTCTCATTATTTA ATTATCATTTTTATTTGCTATTTTCATCATTATTATTATTATTATTATTA TTTGCTATTACTATAATTAATATTATATAATAAATAAACCGAAAAATATA CAACCACAAAACATACCATGCTAGACCTACACACCAGCATATATCACTCG TCACCATAAACGCAAGCTAGGATTATAATCTAAATTACTTTTGACAGTTT TCTTCTCTACTACTAGTTAACTTTGAAGGACTGCCATTAAGGGTACCCCT TCATAATATTAGAATATGATGTATATTATTAATCAATTCTAATATCGAGA ACAAATATTTCTTCAACCTTTTTTGAAGGATTTATTATCTTAATTCATTC CCTTATAATTAACACGGGTTGGTAATAATAAAAAAGCAATTAAAAGTATA AATAGTCCAAACATTAATCTTGCTATCTATTTTATATATATCTTGTAATT TTTGTAAGCACATATAATAGGAAGATCATTACTTTTTCAAAGGAGGTATT CTTTGTAAGTATCGTAAAATTTTGGTAGACAATTGAACAAAAAAGGTTTA TTAAAATATTTAGCAGAAACTCCTAAATATCGATTCCAAATTTGCTTTAA TTTAAGGTAGAGGTTGCATGATAATGCTATAAGATCATTGTCTAAAATCT GAACAAAAAAAATGAAAATTATTTCTTTTTTTTAAATATAGCTACTTTGA AGTTTGTCAAGTGCTACGATAGCTAGAAAAAAATGTTCATCAAGAAGATA TTTTATTGTTCTTTATCTCAAACCGGACGAATCAAATGATCACTTATGCC AACAAGATTCCGTAAATTTTTGAGTGCTAAGAGTCTGACCCATGAGATAC ACTAACAAAGGATGGAGAATTAGTACTAAAAAATACATTAGTCGTCATAA TAAATATAGCTACTAGCACAAAATAATTCATTTAATTTTTTTCGAAATTT AGATATTTGAACAGATTTTTGATAAATGAGATACATGAAAAGGTCAATAA AGATTAGTTTCAGGTAAACAAATATAAATGACGGGAGAAAAAATGGGAAA ACAACTTTAATAGAAAATATATTATGAACTAATATTAGGGTTATTTTAAT TATTTACAATGTGTCATTCAATTTTGATATTTTTCTTTCATTTGTAGTAT TATCTTTTCACAAAAATTTTTTACTTATTACTTTGCCAAACATAGTCCCT CCTTTCTCTAACAAAATTTGTAATGAATCAGAAAGTGTTTTCCGAGCAAT AATGCTTGCTTTGTTACAGAAACTTCCCCCTCCATTTGCTAAGTAATAGT 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AATGGCGTTTCATCATATTTTTCTTAGTGGCGTATACAATTTCTTCTTCT TTTTGCCGAATTTCTTGTGTTAATTCAATTATAAGAGGGGATTCATGGAA GTTGCTTATTTCGCAATATCAGTTCCCCTTGCGGTCAAAAAGTACTAAAT TTCTAAAGAAACTGAATTTGTGATCATCGTTTTCGCTACTTAATTTACAG TTTAACTCTATTTAATTCTTAAAAGATCAATTTGGGAAGAACGTATCAAA AATAAGAAATGAATATGTTCACAAAACCTCCTCTTCATTTTTTAAAAGGA ATATCATTTGGACATTACAGATCAAAATATGCATAGTTCTTATCTAATTA TTTGA
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