EMLSAT00000006354, EMLSAT00000006354-702201 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000006354
Unique NameEMLSAT00000006354-702201
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s346supercontigLSalAtl2s346:709445..729979 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000006354 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000006354EMLSAG00000006354-689120Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000027757EMLSAE00000027757-736685Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000027758EMLSAE00000027758-736686Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000027759EMLSAE00000027759-736687Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000027760EMLSAE00000027760-736688Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000027761EMLSAE00000027761-736689Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000027762EMLSAE00000027762-736690Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000027763EMLSAE00000027763-736691Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000027764EMLSAE00000027764-736692Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000027765EMLSAE00000027765-736693Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000027766EMLSAE00000027766-736694Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto779420auto779420Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000006354EMLSAP00000006354Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000006354

>EMLSAP00000006354 ID=EMLSAP00000006354|Name=EMLSAP00000006354|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=357bp
MAEEFESIEKILETHLPKDELEVVQRLIYGSIPREVELGASVVSGASERN
IELACYNFNCLKEDLRAPRQVRVGIIQNKIVEPTDKPVETQRNALFKRIG
DIIDVAGMAGANIVCLQEAWTMPFAFCTRERLPWTEFAESAEFGPSSKFL
ANFAKKYAMVIVSPILERDENHGDVLWNTAVIISHTGSVIGKTRKNHIPR
VGDFNESTYYMEGNTGHRVFETKYGKIAVNICYGRHHPQNWMMYGINGAE
IVFNPSATLGDLSEPFWPIEARNAALANSYYACAINRVGTEIYPNKFTSG
DGKEAHNDMGHFYGSSYIAGPDGTRTPMTQRLDLYAKSLSEASLHDFTPQ
VIKDTES
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mRNA from alignment at LSalAtl2s346:709445..729979+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000006354-702201 ID=EMLSAT00000006354-702201|Name=EMLSAT00000006354|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=20535bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s346:709445..729979+ (Lepeophtheirus salmonis)
GTGTTGTATTCAAATACAGTTCAGCTCTGCCTAAAACATTATTTCGGGCA GACTTTGTTTTCATACACTCATGTATGTACTCGTACATATAAAAACAAGA TTTCTATTATCATCTCTTTCATTCTCTTCCAAATATAGTCTGCAGTAATA CAGGATAAAAGTGGAAATGGCTGAAGAATTTGAGAGTATTGAAAAAATAC TAGAGACTCATCTTCCTAAAGATGAATTAGAAGTTGTACAGAGATTAATT TATGGCTCTATTCCTCGGTAAGACAAAATATATTAACATTTTTTCGTACA AATGATTACTTATTCGTATGTGCCTTGTCAACACTAAATCAAGCTAGAAG GATTTCTTTTTCTCTATTGAATATGGATTACATTAGTATACTTTGACGAA TTATCGTCAATTTCTATCAGCATATTATTCTGATTTGTCCTGTAAATTGT ACTCAGAGTTGGAAAAAATCCTCGTCACAATGAAAAAAAATAGAAATAAA TAGATTTATGTATTTGAAAAGGGTCATGACTGGGTCGATTTAAGTCTCAG AAATCAAATGAAGGCTCTTAACAACAAAACCTATAATTTATCAAAATATG TCTTATAATGTAAAAAAATATATTAGGCATTTTTCGTCCACTTGATTTTT ATTCAAGATTGTTTTAGTGTTAACTCATAATATATATTTGATTTTGATAC TGTTTTGATTTTTTATCATATGTTTTAGTGAAGTTGAATTAGGAGCTTCA GTAGTATCAGGGGCGTCAGAAAGAAACATTGAGCTTGCATGCTACAATTT CAATTGTCTGAAAGAAGATCTTCGAGCTCCAAGGTCAGTGTTAATTCAAT TTTATTTATTTATACTATTAGGGTGACCATATTTTGAGTTAGAAAAATGA GAATACTAATCATTGTTTGTTTTTATACCCGTTTCAAGAAATATTTTTTA GGTCTCCAGTGATTTTTTTCTAGACTGATCTAGACCTAATTGTAGACTGA AATTACTCAATTTTTTTTATTAAACTGCACTTTTTTTATCCCGATCAAAG GGGATTTTCTTTTGTGTAGACCAAATTTCAAATCGAAATTCGACCCAATT AGTTCCTTCCTGAAAAAAAAAAAAAATGTTGTTAGACCGTTTTAGGACTT CAAAACCGAAAACAAACACTAGTTAATATATGAAATTTAAGAAAATAAAA AAAAAATGGTAATAACAAATTTTGGTTATATTTTTATAGCATATTTAAGT CAATTTCTTTAATTGAATGTTTTGTTCATTTTTAGAAGATTTTCAACAAT GTTCATTTATGCCACATAAAATTGTAGATTTTGTGATTTAAAAAAAACAA ACAATCGGTTAAGATTTAAATGAGAACATGTCTTGGGTAAAGAGGATAGT TGGTCACCCTTTTTTAAAACGTAGAATTATATATGTACTAAAACTTTTTG AAACTTGTACTCCTTTAGACAAGTTCGAGTAGGAATTATACAAAATAAAA TTGTTGAGCCAACTGACAAACCTGTCGAGACTCAGAGAAATGCTCTGTTT AAAAGGATCGGAGATATAATTGATGTGGCTGGAATGGCCGGYGCCAATAT TGTCTGCCTTCAAGAGGCTTGGAGTATGTAAATATATATAATTATTTATT CCCTCAAAATGACAGATTTTCGTTTTTGATTTGGTTTGTAATCAGGAAGT TTCATTTTTTAACACTATAATACCCACTAGGTTAATGCATGATCATAACT TCCTGATTTTTTGAAAATATTCTACATATCTAAATCTTAAATTTTTTTTT AAGTCGGAGATTTTATATATCGAGATTCTTTAGTTTTTGGTTAGAAATTG ACATTTTTTATGATTTCTATTTAAAAAATGTATGATTTTCTCCACATAAC 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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNGGGGGGGCTAAATTAGATAAATTAGAGAACTTCAAGGCATGATAAAGA TTAACTTGATTGAAACTCCTATCTGGAACTTTGTTACTTTTATTGTACCT AACAAACTTTTCTTCAAAAATAAACAGTATAAAACCCAAAATCAGTTGAT ACTTAGTCAATTCTTTCTTGCCATAGAATCGTTATTTAATCATTGTTGTG AATTCTTCATGGCTGAATAAGACCATATCCAAATTTAATCAATAAAAGAG GAATAAATAGGAGAAAAGAACAAAAAAAAAAAAATCTACACCTGACAATT AAATACAGTGTTAATTTATATAGGAATGAGATAACACCGAGCTGGGGATG TGGGGAAATAATTACTTCATGCCAAACATAAAAGGGGTGAATCTGGACAA AACGGAATATGAAAATTTTACCGAATATTGAATTTTGAATTGAATATTTT ATATGTATTGTTGGTGTTGTACTATTATGCCAAACTGAGAATGAAAACGA ATTTTTCATCCCACAAGGTTATTTTTATTGTATCTTCCAACTTTTCACTC AAAAAGGGAGGAAACATGTTCTAAAATCAGTTGGTAGTTAGCTAATCTTT CTCCACTGTTACACAATTCTTCATCTAATAGTAGCCCATTGTTCATAGTT TAACAAGAGATGATTAAATTTTATAACACTACTACTAACAGGGGKGCCMC AAGATTTTTTTTGTWTGTGTGTGTGGGGGGGGGGGGGAGGTTGCTTAACT 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