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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s34 | supercontig | LSalAtl2s34:475939..484727 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000006378 >EMLSAP00000006378 ID=EMLSAP00000006378|Name=EMLSAP00000006378|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1127bp
MSSYEEFREWKSCSDILHKIPEKYHKNWIPYDLHLTCIAAHLQFIALGTN
IGLVYWYDRLNGKLMKLVCADRRTPISKISLLDSVDHMLAIGNQQGIIAI
FQIPKLSEKTLFATTSEGGTDCFHIENVHSEQITCLEWSMNGQKLFSGDF
SGLVSMTNVDYSLRKTCTTKICNLKSLVTQMTYCKGVLLISSLDQSFFCY
PNFNYEIHVVGGKSRQINGVYGGLINYETSSKCVYALILKPNWIIELAKT
SVDERSSGEIKEKMPFKSRLKEPHKEIPLLNPPVLSNVDXLSGDGLYLKA
MGDSFVAFDNRILHILKIEDTNVKIEASCHSLKGILDLSVTSKKEIFILE
NSRTIIRIATFLDESEAILNKEKYALPGTEGGPGLEILSNFISNSGKKIL
NKFPKLMSLGEIGEILLGEVDTGEEASEKMLVSDVSSHSIIDKNDSTIGD
TLSNLQLELANNSSLSINVQETPNKDLNINEESEEKLVDILDLKKFLPEI
KLLEDNQSTEKVFHPDPLVHIPIDVPLKITEDECFEKEFQKLPLSIEIRK
DPIEDAPNWHRLSGMGRDINNFTACAHYVIIQDDCERSFISYRKSGFKFW
IFLKDFAPWHNLSISSDGCIIWRLYKSKVYSLRTKDSKISEMKFYDWIEI
STAGIVDIYMTENDGYMLNGIDHTLIKHSNISCNQPFDPRHFVIRPLDDS
IERLLLICDERIYALNRDKNIKMYLFEDDKSKNLSLNSHKEIGSFISGDT
LSISMVKSFIGVKIVIVNSDGIVLLVDESKNESYSFSSSFLCDNISTKIV
KLYEDSIWISSQSEIYLNESMVMCKSWSYFEIIPKNYRLNEIYCDGIYRN
SGVMWSNVFVDSPTTKSLYYLNTNVKSRELINVSLPKKTGQVVNVSSNGF
HTWMLDNKGVIYIRSGISSATPSGNSWVTLDSSQLISMNVRLVYFSLGTD
VVWAVDNDGKFYMRLGSLSLSNQDFLPAWISCDIEYNDSFVPIKLVKIFS
CHAIHVVWAIDDKKEIYCRTGINGDFRLGNNWTKVNNSFGGAVHLAVCDS
HVWALNSMGRIYVRVGMSQTCPEGQSWRFVPGALGGSISSSACGSVFVLN
LEGKLEKQFPSKFSVNLLTRNMEHFEN back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s34:475939..484727+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000006378-702225 ID=EMLSAT00000006378-702225|Name=EMLSAT00000006378|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=8789bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s34:475939..484727+ (Lepeophtheirus salmonis)
TATTATAATAATACTACCTTTGCATAGCTAGTAGTACGTACTTATAAAAA
AAGAAACTATTCAGTTATAAATGTAATACAGAGGAGAATATTGCCATTGT
CGATGACGTCACTACTCCATAAGTAGATATTTTATATTTTCTCTATCATA
ATCCATGCCATTGTGAATTATTGGATAAATAACTGCGATTGTGAATGTAA
GAATCTAGCTAATTGTAAAAATGGGTTCCTCTTTATCGTCCCCTTCACCA
ACGGATTTGTTTAATCGGGCTCTCAAAGAAAATCCCGTCATGATATTTTC
GGCAACTTATTGTCCATACTGTAAATTAGCCAAATCTGTTTTCTCCAAAT
TAGGAACTAAATTTTCATCCATCGAATTGGATGAACATCCTGATGGAAAG
GCTATTTTTCCTGTAGTTAAAGAAAAGACGGGTATCAAAACGGTAAACCA
GGGGTCCAAATTTGATATTGTATTGCTCTATTGACTTGCACAAAATGTAC
CTTACCACATTGATTGATATATTTTTAACGTCTCTTACTTTTTATTTTTG
TAGGTACCACAAATCTTCATCTGTAGTAAATACATTGGAGGTGCCGCAGA
GATAAAAAAAGCTACTTAACTCTGGTAAATTGCAGACCATGATCGAAAAA
TGCTGCGATGGAGATTTAACTTGTAAAAATCATTATTCGCGTTCTAGATG
ATAATCATTTGTTACATATTGTTACTCTAGTAGTTATTTTTATTCGTTCG
TTTGTTTTGTGTTTCTTTTTAGACAAATTAGTTATTTAAAATAAATTGAT
ATGAGTTCATATGAAGAATTCCGTGAGTGGAAGTCCTGTAGTGATATTTT
ACATAAAATTCCAGAGAAATATCATAAAAATTGGATTCCATATGATTTAC
ATTTAACTTGCATTGCTGCTCATTTGCAGTTTATTGCATTAGGAACTAAT
ATCGGACTAGTGTATTGGTATGATCGTCTTAATGGGAAATTAATGAAATT
GGTGTGTGCTGATCGGAGAACACCTATAAGTAAAATTTCGCTTTTAGATT
CGGTTGATCACATGCTTGCTATTGGAAATCAACAAGGAATCATTGCTATA
TTCCAAGTACATATTACTCATTCTTTCTATTGGCATAAACGTTGGGTGCA
TTTAATTTCATTACTTTTAGATTCCGAAGTTGAGTGAAAAAACGTTATTT
GCTACAACTTCCGAAGGTGGTACAGACTGTTTCCACATTGAAAACGTTCA
TAGTGAGCAAATAACTTGCTTAGAATGGTCAATGAATGGACAAAAACTAT
TTTCTGGAGATTTTAGTGGACTAGTAAGTAACTAGTATAATCATTAATAT
CTCTCTTTTAAAATATAATTAATATTTATAGGTTAGTATGACAAATGTAG
ACTACTCTTTGAGGAAGACATGTACTACCAAAATATGTAATTTGAAATCA
TTGGTCACTCAAATGACTTATTGTAAAGGTACAAGTCTATTCTTTTAAAA
ATTTGAATTACGTGTGATTTCCTTTGTACCTAGGAGTTTTACTAATATCT
TCGTTGGATCAGTCCTTTTTTTGCTATCCGAATTTTAATTATGAAATTCA
TGTAGTTGGAGGTAAATCACGACAAATAAACGGCGTATATGGTGGACTTA
TAAACTATGAAACCAGCTCTAAATGTGTGTATGCCCTTATTCTTAAGCCA
AATTGGATTATAGAATTGGCTAAAACTTCTGTAGATGAACGTAGCTCTGG
AGAAATCAAGGAGAAGATGCCTTTTAAATCTCGGTTAAAGGAACCTCACA
AAGAGATTCCGTTACTCAATCCTCCAGTATTGTCAAATGTGGATGSTCTC
TCKGGAGATGGTCTATATTTAAAGGCAATGGGAGATTCATTTGTAGCTTT
CGACAATAGAATTCTACACATTTTGAAAATTGAGGATACCAATGTTAAAA
TTGAAGCTTCTTGTCATTCATTGAAAGGCATTTTAGATTTATCTGTCACT
TCAAAAAAAGAAATTTTCATACTAGAAAATTCTCGAACAATCATAAGAAT
AGCAACATTCCTCGATGAATCTGAAGCCATTCTAAACAAAGAGAAATATG
CGCTACCAGGTACAGAAGGTGGTCCAGGCTTAGAAATTTTATCTAATTTT
ATATCTAATTCTGGGAAAAAAATACTTAATAAGTTTCCTAAATTGATGTC
ACTCGGAGAAATCGGAGAAATTCTTTTGGGAGAGGTCGATACTGGTGAAG
AAGCAAGTGAAAAAATGTTAGTGAGTGATGTTTCTTCTCATAGCATTATA
GATAAAAATGATAGTACTATTGGCGATACTCTCAGTAACTTACAACTAGA
GTTAGCAAATAATTCTTCACTTTCAATAAATGTTCAAGAGACACCAAATA
AAGATCTTAATATCAATGAAGAGAGCGAAGAAAAATTGGTAGATATTTTG
GATTTAAAGAAGTTTCTGCCAGAAATCAAACTATTGGAAGATAATCAATC
GACTGAAAAAGTATTTCATCCTGACCCTTTAGTTCACATTCCTATCGATG
TGCCTTTAAAAATTACAGAAGACGAATGTTTTGAAAAGGAGTTTCAAAAA
CTTCCTTTATCAATAGAAATACGCAAGGACCCGATTGAGGACGCTCCTAA
TTGGCATCGACTAAGTGGTATGGGACGGGACATTAATAATTTTACTGCTT
GTGCACACTATGTGATTATTCAAGATGATTGTGAACGTAGTTTTATTTCT
TATAGAAAGTCGGGCTTTAAATTTTGGATTTTCTTAAAAGATTTTGCACC
TTGGCATAATCTTTCAATATCTAGTGATGGTTGTATTATATGGCGTTTGT
ATAAATCTAAAGTATACTCTTTAAGGACGAAGGATTCCAAAATATCCGAA
ATGAAATTTTATGACTGGATTGAAATCTCAACTGCAGGCATTGTTGACAT
ATATATGACAGAGAATGATGGATACATGCTCAACGGAATTGATCATACTC
TTATTAAGCACTCTAACATAAGTTGTAATCAACCATTTGATCCAAGACAC
TTTGTTATAAGACCCTTAGATGACAGCATAGAAAGACTTCTTCTGATATG
TGATGAAAGAATATACGCATTGAACAGAGATAAAAACATTAAAATGTATT
TATTTGAAGATGATAAATCGAAAAATTTGAGTTTAAATAGTCATAAGGAA
ATTGGTTCGTTCATTTCTGGTGATACACTTTCAATTTCCATGGTTAAATC
ATTCATTGGTGTAAAAATTGTAATAGTTAACAGTGACGGGATAGTGCTAC
TGGTTGATGAAAGTAAGAACGAAAGTTATTCATTTTCTTCTTCTTTTCTA
TGCGACAATATAAGTACAAAAATTGTTAAACTCTACGAAGATTCTATTTG
GATATCCAGCCAGTCTGAGATATATCTTAATGAATCTATGGTCATGTGTA
AATCATGGAGTTACTTTGAAATAATTCCAAAAAACTATCGTTTAAATGAG
ATTTATTGTGATGGGATTTATAGGAATTCTGGAGTAATGTGGTCTAATGT
ATTCGTTGATTCACCTACAACAAAAAGCTTATATTACCTTAATACGAATG
TAAAATCTCGTGAGTTGATCAACGTAAGTCTACCAAAGAAGACAGGACAG
GTGGTGAATGTATCATCAAATGGCTTTCATACGTGGATGTTAGATAATAA
AGGCGTTATATATATTCGAAGTGGAATTTCCTCAGCAACACCTTCGGGAA
ACTCATGGGTTACTCTCGACAGTTCACAGCTCATTTCCATGAATGTCAGG
CTAGTGTATTTTAGTTTAGGAACGGATGTTGTATGGGCAGTGGACAATGA
TGGTAAATTTTATATGAGACTTGGATCTCTGTCTCTAAGTAATCAAGACT
TTCTACCTGCGTGGATATCCTGTGATATAGAGTATAATGACTCATTTGTA
CCTATTAAGTTGGTTAAAATATTTTCATGTCATGCTATTCATGTAGTTTG
GGCCATAGACGACAAAAAGGAAATATATTGTAGAACGGGTATTAATGGTG
ATTTTAGACTTGGGAATAACTGGACAAAAGTGAATAATTCGTTCGGAGGT
GCCGTCCATTTGGCTGTATGTGACTCTCATGTATGGGCTCTCAATTCTAT
GGGAAGAATATATGTCCGGGTTGGAATGTCTCAAACTTGTCCAGAGGGTC
AAAGTTGGCGGTTTGTACCGGGAGCTCTTGGTGGTTCGATTAGTTCGTCT
GCTTGTGGATCTGTTTTTGTACTGAATCTTGAGGGAAAACTTGAAAAACA
GTTTCCTTCGAAATTTAGTGTTAATTTATTAACAAGAAATATGGAGCATT
TTGAGAATTAGACGTACTCCTTATGTTTTTATCTATAAATGAGAATTATA
TTTTTTAGATTTGAAAGTTGTTGAGTTATATTTTTTGTATGTTATATCTT
CTTTCAATGATACCCATAATTAACATTGTGTATAATAATTATCTCTAACA
TTAGGCCAGACAACAACTTATATGACATAAGTTATATATTATGTATTATT
TCAAATATGTTGCAGTAATTTAAACAAGGCGATACTTACAGCTAAAAAAA
TATACAATTTTTAATTATAACTGTGATTAATTACAATTTAAAAATGTTGC
AAATAACTCATAAAATCATTTCTTATTTTTATGATCATTGATTGATTTTT
CAACAAGAAGGAGGGATACGTTTTTATCTACCTTAGCATAGTCGGTATTA
CGAATATTAATGAGCTTAAGAAATGTGGGGGAAAGCTCAGACAATAACTT
GACCATTTTGTTCATATCTGGAGCGTTGAAACTAAATGACTTCAGTAATC
TGGGTAGTAAAAAGTCCATGCGTAACGCTACTTTTTTCTCATTAATAAAA
GTAGATCTTAAGAACCGAGCAACCTATTTTAATATAAACAAAAAAAACAA
TGCTGGCTTTAAATATAATTAAGTGATAATCGAACGAACTTACATCATAG
AGCTGGTCTATCTGTTTCAACTCATCTGTTTTCTCCTTATCTGTCACTAA
TTCCTTTTCCATCAGAAGTTTTTCTTTAGCTAAAATCTTTTTAACTAATA
CTGGATTGATGCCCTTAAAACGATTTTTCAAGGCCTCTTTGAATGCAGCC
TCTTCTTCATCATTTTTATCTTCTTCCACAGAGGAGGAGGACTTCTCGTC
CTTCGCTGGAACACTTATCTCAGAGTGGAAAAGTTTATTGGTTTCTCGCA
TTGCCTCACTCACTAATAGAAGAGCATTTATCTCGGGCTTTGCAGGTAAT
TTCGTTACGTCTATATCCGAACAACATGTATCAGGATTGAAATCCTTATG
CCATCTTGCAACTTTTTCGTTGCTAAAAGTAAAAGTGAAAATATATCTAC
TGTATTTACTTATATGATAACAACACAACATACTCAACATGAATCGGAGG
ATCAAGAGAAAGGAGGAACTTAGAGTGGAAGTCTTTAGTTATTTCCAATA
GAGCATTGCTAAACGTCGTTTTTCTTTTAACCAAATCAGAGGGACTTACT
GTAGTTAGAGGTTCGCTCTCATTATTTGATGGGACAATCAATAGCTCATA
GTCCTCTGAAAGATTTCCGAATCGCCCTATCCTTCTCTCCCATGTAAATT
TAAATGCATTGGGATGAACACAACGAATTTGTTCAATATGAGCCATAGTG
ACTTCAGATCTTACTACATTTTGTACAGGTCCAAATAAATCTTGAAGACG
TATAGATTCGCCTCTATTGTTTCTTAGACTTATGATCTGATCAAGAGCAG
AAAAGATAGTGAGTAGTTTTTTATAATTTTTAGGAATGGGTAGGAGACTC
GTTGTAAGATTGGCATGACGCAAATAAGCAGGAGTGAGCCTTTTTGATGG
AGAAGCAGGAGGGAGMGCTTTTTTGGGTGACAATAAGAGTTGAGGAACTT
GGTAGGAGAATTGAAGTACTTTTTTAACGGGAGAAGAGCTCACTTTTTCA
GGGGAAGATAACTCTTTGAGCCTGGCCTGAAGCTCTGAGAGTTTCCTCAC
TTGTCCCAACCTTTTCTTCACGTCAATGGGTGAAAGGGGACATTTTCCGG
GAGACACTCCTTTGAATGGTGAGCTCAGAGGCGGATTGGCCTTCTTAGGA
GTTAATGAGGATGTCTGAAATTAAGAAAGTCAGGAATAGAAATTGAAATC
TGTTTGAGAACTAAGTTTAGATCACTCACCAGATCCAATTTATACTTATC
AGGAATAGGTTGAACTTTGAGGGGCGTGCGGGGCACCTTGCTCTTCACAG
GAGTCTGAAATGGAGTTTTGCACTCCTAAAATTAAAGAAATGAGGGTAAA
TAACAAGTGCCAAGACAAGGGCGACTTTAGGACTGACCTTCGCTTTTCCC
TTAGCCAGTTCAACCTTGGAGCCCATGACCTTTCTTCTTTTGGATGGAGG
TTCCGCCTCGAAACCCCTCTTCCTAGTTGAGAAAAAGTCCGTAATCTTTG
CCTGAGGAGTCGCCATTTCCACTTTCAAAGTTTCAAACCCTTTTAACTTT
GATTTATTTATGAGTTTCAACTTTTAAGGATCAAAAGTCAATAGAAACCC
TATGTAATAAAATAATAGAGAAAAGAGTTGATTTTGGCGCGTCAACCAAG
TTTTAAGCAGCTGCAGAACTGTTGCTACTGATACATAAGTGAAAATAGAA
GCAAAGCTAGATGGCTGCGCAGCTCGCTCAGGTTGCTAGCTTGGTATGTG
ACATCCATGACGTCATTCATCAAATACAAAATAGTCGGCCAATGACGTCA
TTGCACCATTGTTATTGAGTATTCTATATGACTATTATCTCTTGATTGAC
AATATAACTAAGTCGAAGACAATCATGGAAGAAAGGCAACTCCTACGTTC
TCGGCATGTCAAGTTCCTCCGTCGTATACTCGAAACACCGAATCCGTCTT
CTTCTTCATCTATGGACTCTAGTCGCATGACAATTGTGTTTTTTTGTGTA
GCTGGCCTAGGTTTGTTTACTTCTGAGTTCTTACTTGTTTTGGATTTCTT
CCGAATCGGGATAGGAAATTCCTTAGGCTTCCCTTTTCCTAATATCTGCA
CTCTCTGATTATCTCTAGATTTGCTGGGTGAAAAGAAGTTAGATGAGATG
AATGAATGGATTTGGAGCTGCCTCTCCAGCAAAGGATTTAACGGTAACCC
TGGAAGAACGCAAGGACCCGGACATATCGCAATGACTTATTCCGCACTCA
ATATCCTTCTCATTCTTCAAGACAGCCTCAAACAACTCGACAAAAAAACC
CTCTTAAAAGGAGTAAAAGAACTCCAACTTCAAAATGGCTCTTTTTTAGC
TTCTTTCGAAGATCCCCAGTCGGATCTACGTTTTCTGTACTGTGCTTGTG
CCATTTCTTATATCTTGCAGGATTGGAGTGCAGTCAATGTACCTTTAGCC
AAACAATTTATATTATCTGCGTGGCGTCCAGAAGGTGGGTTTGCACAGAA
TCCAGGGTGTGAAGCCCACGGAGGTAGTACTTTTTGTGCCGTGGCTTCCC
TCTATTTAATGGGTGATTTAGAAACTGCTCTCAGTAACGTACAAAGAAGA
AAACTTGAACGATGGTGTCTTCATCGCATTGGGAATGGCTTTCAAGGTCG
TCCTAATAAACCTAGTGATAGTTGTTACTCTTTTTGGGTGGGAGCCACAT
TGCGGCTCTTGGGAGTGGACGMTGATTTGCAATCATGTATCGATTTTACT
TTATCGACCCAAAGCCCTATCGTAGGAGGTTTTGCAAAATGGACGGACTG
TAATACTGATCCTTTGCATACATATTTTTCTCTAGCAGGCCTGTCCATCA
TTGATAAAGATTTAGGTTTGGAAGCAATGCACCCTGCTCTGAATATACCC
TACACTGCCTTTGAGTATTTAAAAAGCTTGCACAAATCGGGAAATATTTA
AATTCTTATTTATTCACCTAATATACATAAAAATACTTGAGCACAACTTT
TCAATGTTAGAATTGTCTGACCAATCCATTCTTAAACTCGCCTTTCCGGA
ATTTCCATCTAGAGCTTCAAGCTTAATAAATGTTGCCACACAATGATCTT
TTATCTCTTGGGAAATAGATGGTATGTTATTTGAGAGCTCAACGAAATTT
GTAGTACTCTCCACCACGCTCAAATAGTGAGAAAAATTATAAAGACTCTT
CATGAAATCTTCGATGAGTCGTCTATAAAAGGCTATTGTCTCCAATATTC
TTGGATGACTAGATACCTATAAGATACGATTTTTTCGAGTATCAAAGGGA
TAACATTAAATTATAATACATACATTTTATATATAAATAATAAACATTAA
TCTGGGAACATTTAATTTTATTTACCTCAAGTTCTCTGAATATTTCATTT
CTTCTTGATTCTTCCTCTAAATAATCATTCATTTGGTACTTTTTCCTTAT
GTCTGTATCTATTTGATTCAAGTTCCCTTCATTAATTAATCGATCTAATG
AATTAGCTAAAACCGATTCCAGTTCTTCACAGGGTTTCAAAAGTCGAATT
TCGATAAGATTATCAAGCCAAATTGCACGATTTATAAGGAGTGATTCATT
CAACTTTTGTTTGAAGCAGGTTTCTTGAAGATTAAAAATGTACTTAGTAT
CAAGGATTGACGAAATTGAATTATACAAAAGAATATCACTCCAAATAATT
GGAATTAGTTCAGTCAAAAAGTAGTTCTTTAGATCTAATCTAATTAATGT
TTGATTATTTTTTAATCGTTTCAACACTTTCCTCGTTTC back to top
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