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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s351 | supercontig | LSalAtl2s351:505906..522411 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000006432 >EMLSAP00000006432 ID=EMLSAP00000006432|Name=EMLSAP00000006432|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=789bp
MPVSSSSENTRKRTASSSSASGNNAAFFGPTAPAIPIPENQRLIRPRSRY SAAARCSPPALVLSLSPGLGHDGLPSPGGCYAAAGAQQVVEPSSVVVGSN PSAHHRGSPCNXLLAAAMRSSAVAASAQCNFLYRELESPTPKRQRFSSQD MLDQLVQCSTPPPPPPPTTRRRNTSQRWHQEPSRCITPQRNASSLRRSPQ QARRSPQQLRRSTRYRQHNPPVNGNDYHQRNHDYAAANRAPWHHQDQVSS SASPDQSGTSESSTTSPLSPSSPLCSSSSSTKQWKPHSWVPPRMPTTXLX XLXXLXEXTXQXQPTQLLWATSSATSPIVSSCCRSGXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAAAASFQSHHHHHHHHTSSCGYPIPPTTFH HHHFPTHHPQLHPPAAAHVVNLRGSRGENSLSASSSAAAXAAAAAAAAAM FHSEQIARSMPQNLQNQXAASSATPPTAGGPFPQVPSSVAYNNPPSLHNH QQPLHINVLHDVQSSARLRSASNAANNRRISTAGGPLPPRRWRXNNGNNX SAVPPSQPTGAGGTTTNNPTTTTNANNSVTHLQQSAAAALNPNLAAVAAV GSQHLXHLYPPGFLLHVLAMLSNSPLQPGLSPNDVTEPENYEALLNLAER LGEXKPKGLSKTDIEQLPSYRYPGDSDNDQQSTCVVCMCDFEIRQSLRVX PCSHEFHSKCVDKWLKSNRTCPICRGDASNYFSSPGIPE back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s351:505906..522411+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000006432-702279 ID=EMLSAT00000006432-702279|Name=EMLSAT00000006432|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=16506bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s351:505906..522411+ (Lepeophtheirus salmonis) CTGTGCGCGTGTTTATTGGTGTATTCATTTATTATCTATACTTAAGTGTT
AAGTGGTGAACATGATTCAACTATGAAGTTAGTGTTGTTGACTACACTGT
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TGTTCTTTTATATGAGTGAATAAAATAAACAATTTCCTTTGTTGTTACTA
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TCTGCCTTTCACCATCACCATCATCCTGTCTATGATATTACTTTTTTTTC
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TTACAAGGCTATCTGAGGAGGAGGAGGCGGCGGCGGCTGCTGACTGGTAG
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TTATATCTATATCAACTTTTTAACGCTCAGTACTAGCATATAGTTAGCTG
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TCATGGCCAAATAACGCTGGCATATATGGGCCTCAATCACCAGGAGGTGG
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AAGTTAAGGGATGTGAGAGCTGTTAAAAGTTCGATTTTTAACGTTATTTC
TTATGAGTTACATTGCGTTCACTTACGACCTCCATCCAGCAACTAGTTAA
ACTCTTATGTCAAGGTATTACTATAGTAGTATTTATCGATCATATAAAAA
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TACATGAATAATGATGTGAAAATTATCCAAACTATCTTAAGCTTAAATAA
AAAAAATATTAATTGTTTACTTTGAGAGAGAATATATCTGCTGACAGATA
TCCCCCTAGTGTCGTGTTTTTCAGTCCAGTCCTGTCTTAAAGAAGAAGAA
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TACGGACAGAAGATTGAACTGGATAAGTCTTCTGTCCTAAATAGGATCGA
TATTATACTAGATATTCTTATAGTCCTCCTTCCTTGCTAATCAGYMGCAT
GTGCAATGCGTGGGGTTGAAGNTATTAGAAAATTTTAAATTTGTAATTTT
TTGTGAACAGCTGAGGAGYCTTTTGAAATTATTATCCAAAAAAAGATTTC
TTTTTAAGAATAGCTATGAATTTTTGAAATGTGTTTTTTGTTTTTTTTTT
TCCAAAAAAATTTAATTTTTTGTTGACAATTGTGGAGTTTTTTTTAAATT
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TTTTTTTCTATAATAACTGCAAAAACAAATTCAAATATTTTCACAAAATT
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GAGACAAAATACAATATATTAGCCGTTGAATTTTGGAATTTTTTTGAAAA
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AACAGCTGTGGATTTTGGAATTTTTTTTTCTTAAGATTTTATATTTGAAT
TTTTTTCAACAGCAGTGGAGTTATGAATTTTTTTCCAAAAAATTCAACCG
TTTTGAATAGCTATGAATTTGTGATTTTTTTAAAATTTGTTGTGAGTAGT
TGTGGATTTAAAAAATTGTTTTCTAAATATTTTTTTTTTTTTTAATTCCA
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TAGTCTTTATCATATAATATAGAAAGATATTTATATAATGTATTACTATM
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TCCTTCTTTAACAAGATAAGAAAAGAGGGCATCACGGATTGTCATGACCT
TGGACAGTCTCATGGAGAGAAGGAGAGAGGAACAAAAATTAGAGGGAAAA
TAATATCTCTTTGGAAAATATTGTTGTTGTTAACCTTAAGGCGCGAATAT
TTTTCACCTTGGCTAACACCAATTCCTGGTCGATGATCTCTTATATCTTG
TGTTTATGTCGTAGTGTACAAGTTACAATTTGTACGTCACAGTCATTTTA
ATTTACAACTATTAATTAATTGACTATTAACATTTCATTTTGATCTAGTA
AAGTTACTTAATTGTTACATATGTAATAGGGATATGTGCCACATAGTACG
TCTTATTAAACTCAGTCATTTTCATCAAAATAGTACCTACTTAAAATAAG
ATATGTTGTGTTTAAGTCGAGGTTTATGTACTAGTTGTAATTTGTATTAA
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CATTTTATCTATTAAAATGACTTTGTTATTATGTATGTATGCAAGTAGTA
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AATTGGCAATTTTTCATTAAAAAGTCAAAAATTACATCATTAATAATTAT
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GGGACATGATGGTCTTCCTTCTCCCGGCGGGTGCTATGCAGCAGCGGGCG
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GCTCATCATCGTGGTAGTCCATGTAACGAMCTCCTCGCAGCAGCAATGAG
ATCCTCAGCCGTAGCAGCTTCAGGTAAGATTTATTTATTTTTTTAAATAT
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TGGACGGGAAGACGTTAGAGCTATTTCAAGTGCGTTTTTGATAAGTTATC
TCTTATAGGTTAGATCGCTTTGACTTACAAACTCCTCCGTCCATGAACGA
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TGATATTACAATTAAACATTCAAAATTATAAACGCGGGGTTTTTCTTGTG
TTCCTCTCTGTTCTTTCTACCCTACATATATTTTTATAGCCATAGTTATT
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TGGGTTAATTGAAGCTATTTACAGTAGATCCCACTGAAGCCGGATCTCAA
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TGACTCGGAACTCGAACAATTTTTTGGAATCGTGATTCGACTCTTAATTT
CGACTTAGTGCTTTTTTAATTTAAAAAAACAAACCGTTCGTGCTTCAATT
AATTGCTGCTAGTTGACGTTGTTTTGTGGCACTACATGTTATACTGTTTT
AGACTCACACACGAAACATGGGTCCCATGAAAGGCATGGAAGATATTTTG
TACATTCTACGACATATTTCTTTTAAAATTCTCTCTAAAAATTAGTTGGT
GTAAAATTTGATGGTTGAGAAGGTTCTATTTCTTTTGGGGGAAATTGATT
GGACACTTGACTACTGTGTCGCTCCTTCTAGAACGCATGAGCGTCGAATT
CCGGGGTTCTACTGGAAATATATGTTATGTATTTAGTACTTTAATTTTAA
AATTATTTGCTCTATAATTAAAGAGGGAATTGGAAAGTCCTACTCCAAAG
AGACAACGGTTCAGTAGTCAAGACATGCTGGACCAATTGGTACAATGTAG
TACTCCTCCACCCCCTCCACCTCCAACGACAAGACGTCGTAACACATCTC
AAAGATGGCATCAAGAGCCCTCTCGATGCATCACACCTCAACGCAACGCT
TCTTCCCTGAGAAGAAGTCCTCAACAGGCTCGTAGAAGCCCTCAGCAGCT
CCGTAGAAGCACTCGATATAGGCAACATAATCCTCCTGTCAATGGTAATG
ATTATCACCAAAGGAATCATGACTATGCTGCTGCTAATCGGGCTCCGTGG
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TTGTAGAATATACCAGTAAAAAAAAACAGGAATCGTGATGAAAGCTATTG
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CCTTTCCTGGTTTCTTTTCATTTATTATTTTCTGTTTCCTCTTCTTTTTC
TTCTCCCCTTTTCTCTTCCTCTTTTGCTTATCATCCGGCCTCATCCATGG
TCTGGTAGTGGTCGATGTTGTACTTGTATGTACTAAGGGAAGAATTACTC
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TTATGGGCCTTAAAGGCTACCCTGTAGCAAAGACATTTTCATATCCTCCT
CTAGCCTTATATCATCATTCATCATCAATATCATTCATAAGAAGACCACG
GAGGGGAGAGAGAAAGGCTTAGGAATGATTATTTTCCTTCCTTTAAAAAA
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GCTTTACAAAGTAGTAGAAGTATATTCTCTCTCTATCTTTCTCTTTCTAG
CTCTCTCTCTCTCTTTCAACAACACTTTACATTGTAACATTTTTGTATGT
AGTAATTGTACTGAGAAGCGGTGAACTCTTTCCNNCACTTTTTTTTACTG
TGGAGAACTCCCTCTCTGCTAGAGGAGGAGATACTTGAATACTACTACTA
CATATAAACACCACTATTACATTCTGTGTTGTTAAACTTTTATTATGTGA
CTCATACAGACACTTTGCAAGTGAATCGGAATTCTAATTACTTTGGGATT
TGATTAGCCTCTTCTTCATCTTAACTGATATATATATTAATTAGTAAATA
AAGAGAGATAATTCCATTTTCTTCATCTTTTTCCTTGCTTCTATCTTTGT
GATTTGTATTGTTTTTCGTGTGCTTTTCGTGGTTTCGTGCAGGAAAATGC
TTGTATGTGTCAACGTTCCTGTACCTGTAAGTTAAATCTATTAGATGCAA
TTATATATGATATGATTTCAATGATGGAGTATTAGCTATTTATTAAATAC
GAATGTCATATTCTTTTTAAGGTTCATCTGCCTCTCCAGATCAATCTGGG
ACAAGCGAATCCTCCACCACATCACCTCTCTCACCCTCCTCKCCTCTATG
CTCCTCATCCTCCTCCACCAAACAATGGAAACCACATTCCTGGGTCCCTC
CACGGATGCCAACCACCKCCCTTRCAKCCCTTRCCRCGCTAMGCGAATSC
ACARCCCAARCKCAGCCGACCCAATTGCTTTGGGCCACCTCCTCCGCCAC
CTCACCAATTGTTTCCTCCTGCTGCCGCAGCGGCGNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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CTTTCAATCACATCACCACCACCACCATCACCACACTTCCTCTTGTGGAT
ATCCCATTCCTCCCACGACCTTTCATCATCACCATTTCCCTACACATCAT
CCTCAACTTCATCCTCCGGCAGCAGCTCATGTCGTCAATCTACGAGGATC
CAGAGGAGAAAATTCACTCTCAGCCTCATCTTCGGCTGCTGCTGSTGCGG
CGGCAGCAGCAGCAGCTGCTGCAATGTTCCACTCTGAACAAATAGCTCGC
TCTATGCCTCAGAATCTACAAAATCAGKCGGCGGCTTCCTCAGCAACTCC
TCCTACAGCGGGAGGGCCTTTCCCTCAAGTCCCTTCATCCGTTGCTTACA
ATAACCCCCCATCKCTCCATAATCATCAACAGCCCCTACACATCAATGTT
TTGCACGATGTCCAGTCTTCAGCCAGGCTCAGAAGTGCAAGCAACGCTGC
CAACAACCGACGAATAAGTACAGCTGGCGGTCCTCTTCCTCCAAGGAGAT
GGAGAAGNAATAATGGCAACAACAAKTCTGCTGTTCCACCTTCACAACCC
ACTGGTGCCGGTGGCACTACTACAAACAATCCTACTACTACTACCAATGC
CAACAACAGTGTTACGCATTTACAACAATCAGCAGCAGCTGCTCTGAATC
CAAATCTGGCTGCAGTTGCGGCCGTAGGCTCTCAACACCTCKCTCACCTC
TATCCTCCAGGATTCCTCTTACACGTTTTAGCCATGCTTTCCAACAGTCC
TCTACAACCAGGACTCTCCCCTAATGACGTGACAGAGCCAGAGAATTATG
AAGCCTTGCTCAATTTGGCAGAGAGGCTGGGYGAGGMCAAACCTAAAGGT
CTCTCCAAGACCGACATTGAGCAGCTTCCTTCGTATCGGTAAGTCGTTTT
TTGCTTATAATCTATTTTTTTTAAATTTGTATATAACATATCATCCTCTC
TCCWCCATTAGCTACCCTGGAGATAGCGATAATGATCAACAGTCCACCTG
TGTTGTTTGTATGTGTGACTTTGAAATTCGTCAGTCTCTTCGTGTTTTKC
CCTGTAGCCACGAATTTCATTCAAAATGTGTTGATAAGTGGTTAAAGGTA
ATTATTTTGAGGAACTTAAGTAGTACATACCTAATCTAATTTACATCTTA
ATTTCATTGTTTTTTTTAGTCCAATCGAACCTGTCCAATTTGCCGTGGAG
ATGCATCAAATTATTTTTCTTCCCCTGGTATCCCTGAATAGTATTCTCTT
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