EMLSAT00000006502, EMLSAT00000006502-702349 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000006502
Unique NameEMLSAT00000006502-702349
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s356supercontigLSalAtl2s356:525701..540805 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000006502 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000006502EMLSAG00000006502-689268Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000028402EMLSAE00000028402-737330Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028403EMLSAE00000028403-737331Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto778379auto778379Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000006502EMLSAP00000006502Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000006502

>EMLSAP00000006502 ID=EMLSAP00000006502|Name=EMLSAP00000006502|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=354bp
MILNDVKDSSAQQDNAEYFGLLENNNGEFVEAATVLDENRGATIGDTRQF
SWMKDKKAPKKLQGLFLKTIYLLELEKEFHFNKYLCRPRRIEIAASLDLS
ERQVKVWFQNRRMKHKRQSSSSNTPGGYNGGGSKGSSSSGGGGCSGDHGH
DSNEDEEDEELLEETDAWVGGDEAGQRDDQSIGSSNKPGKPFQEXEMSLQ
TGPIINDEMYVEMNNDPIIYDXYSKYPCDQSNWYDCSNPSNDHLYSYPSS
SNNSTTNYSYVNEDVAFPYSQPSSDMNNPIQSESYSNQPYFQSNCDNQEY
AVGNEYYWQQQHQTQGSQDQHFQQEGSSYPCYNEQSYMNCYYNSAMPKQS
FECQ
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mRNA from alignment at LSalAtl2s356:525701..540805+

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000006502-702349 ID=EMLSAT00000006502-702349|Name=EMLSAT00000006502|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=15105bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s356:525701..540805+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGATATTAAATGATGTAAAGGATTCATCAGCACAGCAAGATAATGCAGA ATATTTTGGCTTACTGGAAAATAATAACGGCGAGTTCGTAGAGGCGGCAA CGGTGCTTGATGAGAATAGAGGGGCGACTATTGGGGATACGAGACAGTTC TCATGGATGAAGGATAAAAAGGCCCCAAAGAAATTACAAGGTTTGTTCCT TAAAACCATATATGTATGTTGGATATTATTAATTAAGGATAAGTGTTAAT TTCAGACTTTGTTACATTTATTATCGTTTTAATTTGTCAAGAAATACGCA AGAGTAATTACATGGATTTATTTAGGATCAGTGTTAAACTTTTCTTGTTT TGTCAAAATTCGCTCAGTATTCATCACATCTATTCTCGTTTTTATTTTGT CCGGAAAGGCGCCAAATAAATTACAGGGGTTGTTCATTTAAGATCAGTTA AATATATAGGATATTATTGATTTAGGATCACTTTAAATTTGGTCTTGTTT CGTCATACTTTTTGCATTGTTCGTCACATTTATTCCCGCTTCTATTTTGT CAAAAAGGGGCCAAAGAAATTAGAAGATTTGTTCCTTTGAGATCAGTTAA TTAAATATGATATTATTAATTTAGGATCAATTTAAATTTCCTCTTGTTTT GTCATACTTCTTGGAGTATTCGTCACACATATTTACGGGTTTATTTTGTC AAGAAAGGCGCCAAAGTAATTACATGGATTTTATGGCCAATTATTTATTT AGGATCAGTGTTAATTTTGTCTTGTTTTGTCCAATTTCGTGCAGTATTCA TGCCATTTAAGACCAAATATTTACTTAAGATATTATTAATTTAGGATCCG TGCTAATTTTTTCTTGTTTCGTCATACTTTGTACATTATTTGTCACATCT ATTTTCGTTTTTATTTTGTTCGGAAGGCAACAAATAAATGGGAACGTTTG TTCCGTTAAGAACAAATGATTTATTTGGAATATTATTAATTTAGGATCTC TGATACTTTTGTCTTATTTTTTGCAAAATTTATAATATTTATTATTTAAT TTATAACTTTTTTGATAACTCTCTGGACAGTTTGTTGTGAAGCACCGAGA TATCCTGTATGGGCTCTTATTGACTTGAGAGGATTTACCTAGGCAATTAT CTTTAACTCCTCCGTATCCAGTTTATTCTTTTTGACAGATCCCTTCTTCC TCTCCCGCGTTTTGGACTTGCTGACGGCGTAGATGGTTGTCCTGGACACG CCCAACTGCTTTGTCTGCGTGAATGAAAATTCATTGATCACGTTCAAGTG TCATTTTCTCGACTTGACAGTAAGCTAGAGAACTCAGTTCCGTTATGTTT TGTAACTAATTGGCTATACTTTAATTTACGAAATATGAATTAATTTCAAT AACTCAACCTTCATTAATTATAGAATTTGTAAGTGTTCAAATTTCAATGG AACACCCGTTAGATGAAAAAATATGACAATGACCCCGTAACTTAGCTAAT TTAATAAAATATCCTAACATCTAAGCTCCCTAACATTCTTCTAATTGTCA AGTTGACGAATTTAATTTTGGGTCATTTTTTTTTACATACTTGAATGTCA TATTATATGAATCTTCATTAGTAAATAGGGCTGGAAATATTGTCTAAATT GTGATGATTCTAAAAATCCCGCCTTGGAAAATGTCATCAAAAATATATCC TTTGTTCCGATATTATGCTTTTGCAGTGGGTCAACTTTTGTTCTGGGAGT TTTTATATATTGGTCCAGTCCAGTCTTTTATTTTTGACTTATTATTTATT TATCCTTTTTAACAAATGAATAGATGGACAATGTCACTTTATCCAGTGCT TGGATATCAGTATCATTATAGGCAGGAAAAAAAGACCTTACCATACAACT AAGATATAACTTAGTTTGTTATCCATCACCCCCATTCTACAACCACCGCC CACTGAGGGGGTACCCTTGAAGTATCCCAGTCAGTTCTTATTCGTTCTGT CCCATCCAGTCTTACGTCCGGTCCTATCAGTCTTTAATAGCGACAGTCCT TTGTTCTGTCAGTACTAGAACTGATATATATATATCAGTTTTCTGACATC ATCAAGGACCAAATTTTACAAGTAATATGTGAAGTAAAAAGCTCTGTGCG TTCCTTCAGTTTATTTTGACAATAAAATTCACATAGTTTGGATAATACAA TTTAGATTGTTCCAAATAGTATTAAGACAATTCTTAAGTTCCTGGATCCT AAAATATGTGGTCACATTCCGGTCCAACTTGACGATTTCCCATTATACTA TCGACATTTTCGATGTCCATATTACCAGAACGAAATCGCTGGAACCACCG CTTTGTTGTTGAGTTCGATACTGTATTGGGTCCATAAACAACACAATTTT TTTTGGCCATTTGCTCCGCCTTTTCACCTTAGTCGTAGTGATACTGAAGA AAGTACCGAATTCTCTCTTTTTTTACTTCCACTTTGGAATGCTGTAACAC ACAATCGGCTTCAAGAAACACAAAACTGTAACTTAATTTTTTTTTAAGTG TACACGTAACCTTTAAGCATACTTTAATTTTTTTTTGATGTAATGTATTA ATCGTGAGACACTAAAGACATCTATCGAAAAAAAACCTGAACTTTCTNAC CTAACATAATATTGAACTTAATAATATATGCAATACTGAACTGGAAAGGA CCAAGACTAGACTAGAAAGCGGTCTTCGATCCTAAATAAAGATCGGCATA ATCCTAGAGTCAACGATTTGATAAATAAAATACATTTATAATAAAAAAAG TCGAAAAGAGCGGCTTKCGTTTTWTTATATAATAAARTTGAAATATGAAA AGTCTGAGAGATACAAGGTACTGTATTATGAAGGTGTGTCGCTCACAACT TTTATAATTTGACAGAAGTAACCATCCCATTTTAATGACGTCACATATGT GGGGAAAACACTCGCCCGTACTTGTATTTTGTTCTAAGATTACAAGGAAT CTAACCCAAAATGTAAGATTTTCTACTTGCAAACTGGGCCTGGTACTATA TAAAGGGGGAATTACATTTTATTTTCGCACTATACCCTTCTAAGTGTGAA AAATAAAATAGGTGAACGTTTATCTACGTTTATGAATATAATAGGGTAGA TAACTATTACTAATAGTTGTCTTGTAGTTGTAAGTTTGAACAACTGCATC TAATAATTTGTGAATATTTTTTTCAATTTTCTTTGGAATGGGGATATACA CCATTATCTTAATATTAGGTATAGTTTTATTATAATAAAAAACAATTATT ATATCGAAGAAATCAATTATATATTAAAAATAAGTAGATATTATTTTTTC TTAAAATCAAACGCCCATTTGAAAAAAAATAAACTTACAACTAGATCTTA ATTTGTTATTTATGTTGATATAGAGTTTATTTTGATAACAGAACTGAAGA TGATGCATTGAATAAGCCTCTGTTGGCTTGTGRTATTACTTATTTCTCCA GAAAGAGTAAATTTAATTATAGTAAATTTTTGAATAATATTCGGGAAATC AAATTTTCTAAAGATTTTTCACTTTTATATTGCTTTCAATAGTTCTACAA CTAATAATAGGAGGAATTTTGAAATTTCTACTCTCCCGACAACAATCACA ATTACAAAATAGCATTTGCATGTCCAAAATAAAACCGAATTAATCAATAA GATAAAAAAATAAAATAACGGAGAACTCATCAATATGGAATGTAAATTTC GAAGAATATCATTGACACTTTATTATTTTTTCATTCAATACTAAAACAAT 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CCTTCTAACTCTTAGTTTTTTATTCATCTGAGCCTAAAATGTATTAAAAA TATGTATTTACATCGTTATACAATCTTATTTCCATAGTGTTGATAAAATT CAACCATCACAATGAAAAGAATAAAAGATGTTCTCTAATTATTTTACTTT TCTTWTGCTTAATCAAYCCYGCCCCCCCCCCCCTCCCCGAGAAAAAAAAT AATAATAATTATACAAATCAAGCAATTTCAGAGAGATTTCCATTACATAG TTGATTTTACTTTTATTTAATTTAAATATCAATGGACTGAGGAGGGGTCC ATTAAAATCTGAACACTTTGAATTATAAAATTCAACAAGATATATTTTAT TAGTTAATAATAGATTTGAAGATACAAGATTTCAAACTACAGATAAAATT CCTGCCTCAGATACTTAATATTACTTTGTCATTCCACACAAGCCTGGAAT TTTAAATTCTCTGCAATGGTGGATCTATGAAGAACCAACAAGACTCCCTC TTATTTTTCAACCTGTGTGGAAATATTTGTCAATACCAGCAAATTCTTTC CCTCAGTAAGGGTGTTCTCCGCTTCATCATATTTGTATGATTGATTTTGT ACCAACATACGTTAAACACCTAAAAGGTCTGATCAACCAACCTCCAATAT TAGAAATTGAAAAAATAGGTGTGTTTGCATGATCGAAAAGTCATAAACAC ATATAAATATGTGTTTATCAAGATGTAAAGATTCAAAATTAATGCCTTTT TATATACAATTAGATGTGTTGTATTTTACTTTATGAATGAGTTATTACAT GCTGATGTCATAAATATATTTAGCTCACATGAGTATATATTAGAATATCT TATATTTTTGTTAAAGAATGCCAGGTTCCAAGGGTAAAAGTTCCAAGTTT CCACCCGGAAAGTATTGCACTGGCTATTTCAACACTCCTTCGCCCAAGGT 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