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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s357 | supercontig | LSalAtl2s357:185095..248155 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000006517 >EMLSAP00000006517 ID=EMLSAP00000006517|Name=EMLSAP00000006517|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=397bp
MADNSGENVNSEEVRGVWHDVKTTEARLAPYIIFGGLIFIGIGSILGLLA LANYDKINSKFKNPTPVINPDKNSHYLKKTPSPEGSKFPPGMQPEDYTLN KQPWSEGGNIGAKNANLTVFSEVNETYSRSRSASIISEIGNGGPIGISDV SGPLGNLLFSMKYNFHKTALIVTVNKCINLPAKDTAAKSSDPYVKLQLLP EKQHKVKTRVLRKTLNPVYDEDFTFYGINFNQLSTLTLHFVILSFDRYSR DDVIGEVMLNLESYDLSQTDNNPLLFKQEITPRNPYVKIYLLHNDQRIAK KKTIVKKRTLNPVFNQNFAFELPTFDEGEHGGIKNISLEFLLLDWDRVTK NEVIGRLELGGSNCNGSALQHWNEVISSPRRQIAEWHKLKEIIFIFK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s357:185095..248155+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000006517-702364 ID=EMLSAT00000006517-702364|Name=EMLSAT00000006517|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=63061bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s357:185095..248155+ (Lepeophtheirus salmonis) CCTCTCCCTACAAACTGTCCATTAAACGAATATATGTGTGCATATTGCTT
TCATGCCTATTCCATATACTTCTATATATATAAAAGGAACCTTTCCTTCC
CTTCCTCTCTCTTCCTCTCTTTCCTTCTCTCTCCCACGTAAAAACACACT
CCTAAGAACGCAATCTACAACAGTATACTTTGAGACGTATGTATAAAGCC
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CTTGCACTATTGGGACTACTAATCGGTCTTGTTTCATCTTTTATCGCAAA
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TTTTATATCAAGCTTAGTTTCTTTAAAAAAATAAGTATACTTTATTTGTT
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ACCGCATACCGTGCAATTTGTATAGAACCGTGAGCTTAGAGTTCCGTCCT
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AATCTCAATAATGTATTGAAAGCAGCTGTGTGGAGTAAAATACGTCATAT
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TCTGAGAAAAGCTGTAGATTTTAAAATTTTTCTTTGAAAAATGTACTATT
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ATAATAATAAGAGTTCGAAAAAAAAAAAATAATATGTTTGGATGGCTAAT
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TGCAAATGAATTATGATCGTATACGAGGGGGGTCTAAAAAGTTTCGGACC
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AGATGTCATTATTTTTTCTTCTTTTTTAGTAAGTGTAACCTTTAAAAAGA
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TCCTTATTTCTTAGATCAAAATATATTTATGATACAAACCATTGGAGACA
TGTGCATTTAGCCTCGAACGTGTAGACATGGTGCACTCTATATACTATAT
AGTGCTCTCTGATGTACATCATATATATTTTGAGATCATAAATAATAATA
AAATATTGCGGGCGTGTGTGTGTATAAGAAGGCAAGGTTTCTGTTATTTG
TTTTGTGATGTATATCTTATTTTATGAGGATTTTCAGTATATGTAAAGAA
TGGAATTAAATACAAACGCTAATATCTTAAAATGAATTTTGTTTGTTTTT
ATTAGTGAGCACGCAAGAGATTAAAGTACTCATTCGTCATCCCGAGATAT
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CTCATGGAAAAATGAGTTATCTTCTATATAATTAAAGCAAAATTTTCTGG
TCCATCTCGTATACCACCTGTAGTATTCAATAATTGCATGATTATCAGCC
CCAGTACTCTAAAAAAGATAAGAGTTGATATAAAAAAAATAATTAACTAC
ATAGATATAATTAAAAGGATGAAAACAAAGGCAGACCTTATTTCAATTCT
GTAGAAAGAAAATTAATCATAGTCTATCTATACACATCCAAGAAAGTAAA
ATCAATTATTCATCTCATTTTTTGTTTACAATTTATAGAATTGACTTATA
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AAATTACCCCCACCAAAAAATCCATAAAAACTAATTAAGAATCAACGATT
TTCCTATTGCAATTAAATAAGCCATCAAATACAACTACAATTTATATATA
CATTTTTTTTAATTACACTCATCAAAACCCAGCTTTATTAGACAAAATGT
TCCTCACCACTCAAACTTATTACTTTGTGCAAAACGTTGACTCCTTTCTA
TGTTTGATTTTACTTTCCTGGGTGGTCTAAAGATAGACTCTGATTAATTT
TGCTTTCTAAAGGACTTGGCATTGCTTAAAATAAGGTTTGTCTTTGTTCC
CATCCTTTTAATTATATCTATGTAAGTATATATATTTTGTCATGACAACT
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TTGTTTTTTTTCTTTCTAAGAAAGATAGGAAATACACACATATGTTATTA
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TTATTAGTTTAACAAGCTTAAATTAATATTATTATATAGGTAAATATTGT
TGTAATTTTGTGGGTTCCTTTCTGAATGAGTGGGTGGCTAATAAATCATA
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CATTTTGACCAGTGGCAATAGTAAAAGCTTATAACGGTCAACTTATATAA
AAAAGGTTTAGTGATTATTTTTTATATTCAGTTTCCCTCGTCTTTTTTAC
ATATACAAACTGCACTAAATTATTTAGTCATTTTATCAACATGAGAGAGC
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TGATGAATATTACGGATATTACTAATTGTTCTGAGAGCCTTGTTTTTAAG
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GAGGGCATAATTTAAATAGGAATACGAAGTTTGGAGAAGAATATAAAATA
GGATCCCACTCAGTCAATGAATCGCATCGTCAACGACTTCTCTGTGGCTC
CTTGGACCCCCAAAAGGGCTATAAATTACAACTTAGGATATGTTTGTTTC
ATTAGAACCTCACTCCATCTTCTGACAGAGAGCATAAAAGCTAGGAGGCT
GGAGAGATGCCAGAAAATCCTTACATGGATAAATGGTCAATTGTGAAAAA
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ATGACCGCTGGCTTGTGGAAACAAAAGAAGAGGTCTTAGGGGCTTACTAC
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AGGCCTATTATAGGTGCTAAGGTACACCATCTTGCCACGACTGAAGACCA
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CGTCCACCAAGTGCCAAGAGTTCTGCGCTCAATTCCGGTACAAAGAGATA
TGGCCCCCTTGTTTGCCAGATTTGAAACCACTTGACTTTTCTATAGAGGG
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GTGACGTTTAAAAGCTGCGATTGATTATGATAGTGCCCATATTGAGTGGA
AAAAGTTTTGCAAAATCCTTGTCTAGATTTTTTGTTAATATTAATTTTTT
GCCTATTATTGAAAATATAAAATTATTGATGCATTTTTAAATCCATCTCT
CGAGTCCATGTTTTGCTACCCTGCCCTGTAAGTTAAAAATATTCCGATTT
AAAAGCACTTTTTCAAGTAATAAAAAATAAGATTGAACTGGAAATCGTTA
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GACTATCCGATCTATAAAAAAGAATACTTGTAAATTAATATATTTGGTTT
GGTGAGGTAGATGGTGTTGTGATCAGAGAGTTTTGTTCTGTAAAAGAAGT
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GTCGTCGTTATCTCCTAATGAAGGAAACATCGACACAAACCTGACTCGTA
CCCATTTCCAAGGAATTAATCAAATAGTTTCTAGAATGATTCCAGATCTT
AGATACGGACATTAAGATTCGGATGACATGAACTTTCATGATAAACGTTG
GGTTACGTGCTTTGAAACTTCTTTTAATTGTTCCCCAGTTCCAATAGATT
TACCTTATAATATAGTCAATATGCTTCCAAAATCTCAGATCAAGGAAGAT
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TGTGCCTACTCCCAATCTACACACAAATTAATTACTTAAATATTTTTCTT
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ATCAACGTTCCGAACCCTGATAAGAGGAAAAGAAGGAGAGCGCTAGCAAA
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ATGTAATACTCTAATGTTTACTTATACTTAATCAGTGCATCACCATCTAA
TTAAAGGAACATTATTAAAAAAAGTTACCCGAAAATAGGATGATATTTTT
TTCCTAAAAAAATTAATATTTGAAATATAATTTATTATTAATTTTTTTTA
TTTAAATTTGTTATAAATTGCAGTGGATTTTTGAGATTTCTTCAAAAAAT
TTATATTCAAGAAAAAAATTTGAAATATTTTATAAACAGTTGTGAATTTT
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TTTTTTAACTAGGAATAACTGGTTCATTATTGGCCACATACAATCATATG
ATAGTTGTTGTAAACGTGGGAATGTATAAGACAAACACTTTATGAATAGT
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TCTCAGAGGTAGAAATTCACTATATTTTACATTTTTACTAAATGAAAGGA
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CTCTTTCGGTTCGAGTTGCACACCAGTTGTTAGAGCAATTCCCCCCCCCC
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TATTGAACATAAGCTCCGAGAATAGGATGTTCTTATGTATCCAACCTACA
GTCTGGAGCTGGGACAAAGKGACTACCACCTGATCCTGTCTATGGCCAAT
GGGTTGGAGGTACAAATTTGGCCATAGGCCTGTGAAAATTTGTTTGCCGA
GTTTTTTACCAATAGGGACAAGGGCTTCTAGGAGAAGGGCTTTACGAAGT
TGGGTTCTCGTTGGCAACATGTTATCGAATAGAACTGGGGTCATATTTGG
CTTAAATCGGATACTACTTTTTTTTTTGATCAATTAGAGATTAGGAATGA
AGGAGAATCAAAGAANNNNNNNNNNNNNNNNNCAACACTGAAATGAAATT
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CTTGCTGCATGACTTGGTGATGAAGCTCTGGTCGAGGTCGGCTCAGGCCT
TCTTGAGGGCAGACTTCAGCTGGTCCTTAGACTTGTATTGGTCTCCCGAC
AGCATTCCCTTAAAACATACAAAAACTGCGAAGTCAAATGGCGAACAATC
AGGCGAGTGAGGCGGTTTTTTCTTAAGCTTGTTGAGAAGAATCTTCGACC
TTGCGAGGCGTTTTTCCTTGTCTACAGGCCTGAGGGCTTGACGAGGGGTT
CTCCTGTAGACCTTAAGACCAAGATCTTTCTTAACTAGCCGGTCCATGGT
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CTCTCTTGTTTTCGACATACTTTTTCACGGCAGCAACCATTTCGTCCGAC
CTTCGAGGCCTTGACTTAGATCTTGTAGTCGCCTCAGGAGTCCCTTTGGC
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CTCTCCATACTATCGGCTGMTGTTTCACTGTTTRTATTRATATTTTMCTG
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TTCAACTCCCCCGAAAAAAAAAATGTAATCCTGCGACCGGCCCTGAAAAT
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AATACACTTCATAAATCAAGGTAATATTTATTTTTGTCAACAGCTAATTG
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TTGTACCTACTTACTTTATTGTATGAATGGCCTGAGAAATTTGATCACCC
TACATCAGCACGGCTATAAAATAATAAAATCCTTTTAATAAGGAACTGTT
GTTAAGGCTATCAGTTTTATAATTATGTTCCTTGTTCGTTAGCAAAGGAA
ATAAATCTTTCAAACGAGATTGGATTTGCCAAAACTTTCTCAAAATATAA
AGTGGATTACATTTATAAACTTATAGCGTTTGTAGCAAGCATTGCTCGAA
GTTTTTATTCATCGACATACAGACAAATTTCTAATTTATTTAAAAAAATG
ATAACTCTCTAACAAATCATAAGTCTTACACTCCGTTTTTTATGAGCCCA
CGTAGTTACTAATGTTGTATCGGTCCTTATTTAGAAACGCTGTTCAGTCT
GTTCTCATCCAGTCCAGTCCAACTTGTCTGTCCTTAATACGGCCTTACCT
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TCTCACTTGAAACAAAAATGGGATTATATGGTTTATCATATTTGATAAAA
AAACGAAGTAATAAGTTTTGACCCTTTTCGGATGTTTCGGGGTGTATTAT
AGGAATTTTGAAGTGAAAATTAGTGGGGGTCCTTAATGCTCAAGGACGGT
CCATTTGCATATCCTGCGGTTGGGATCAATTATATTATATTAGAGGGTGT
CCTTGATACTTGAGACAGCAGTGGGGATAGGTTTTGATCCACCTTAGGTA
CCAGCTGCCCACTTGCACAACCTGTTGACCGAAGTAACTTAAACTGTCTA
ATTTTACATTTTTGTCATGTATGTCTATTAGGATGGGTTTTTTTTTCTTT
TTTTTTTCTTAATTACGACTAATGCATAATAAATATTGTTCTGATATAAT
AGAGGTAATCTGAAGGTTGCTTATCACTATAAAAGTTTGAAAACGAAATA
ATCCTTATTTTGCTTAAGAGCATTTTATTATACATTTTTCAGACCTATAT
AATAGATTAATAAAGTTTTGTTTTTTTCTAGAACCATTCAATAGAAAGTG
AAAAACATAAAAAGAAACTGATGATTCGTGTTTAACACGCATCTTTTTCT
ATGGTTGTAGGACGCTTTGCTGAAAATATTTTTGCGAAACAAACAGTTAC
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CAATATTATGTAATTATGATTTCCATTCATATTACTCCAAATTTGAAAGA
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TAAATAATTAATTGGGTTATTCCATTATGAGGATGCTCTAACTCGGCTCA
AATGGCAATTAGAACTGGTGTATCAAAACGAATGAGAATCGATTAATAAA
CCACGGCCTTACCTGCATAGGACAAAAAATGTACAATTTGTATTGTTGTC
TTCTATTAATGTTTGGAGTTCTTGTAAAAACAGTGCTCTTGTTATGGATG
TAACATTTTACACAATAAAAAATGTCATCAATACAACGACATCATTATTT
CGTATATCCAAAGTATTTACATCAGAAAAACACTATATATGTTGCACCCT
GTACACACGTTTGATGCTAAATCATGCACACCCCTCCAAATATATCATAA
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ACATCAGGGGCATCCTCTGGGGGGGGGGGGTGGGCTGGACGGGTTGTAGT
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