EMLSAT00000006550, EMLSAT00000006550-702397 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000006550
Unique NameEMLSAT00000006550-702397
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s359supercontigLSalAtl2s359:12151..34625 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000006550 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000006550EMLSAG00000006550-689316Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000028650EMLSAE00000028650-737578Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028651EMLSAE00000028651-737579Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028652EMLSAE00000028652-737580Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028653EMLSAE00000028653-737581Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028654EMLSAE00000028654-737582Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028655EMLSAE00000028655-737583Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028656EMLSAE00000028656-737584Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028657EMLSAE00000028657-737585Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028658EMLSAE00000028658-737586Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028659EMLSAE00000028659-737587Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028660EMLSAE00000028660-737588Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028661EMLSAE00000028661-737589Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028662EMLSAE00000028662-737590Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028663EMLSAE00000028663-737591Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028664EMLSAE00000028664-737592Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028665EMLSAE00000028665-737593Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028666EMLSAE00000028666-737594Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028667EMLSAE00000028667-737595Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028668EMLSAE00000028668-737596Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028669EMLSAE00000028669-737597Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028670EMLSAE00000028670-737598Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto769292auto769292Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000006550EMLSAP00000006550Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000006550

>EMLSAP00000006550 ID=EMLSAP00000006550|Name=EMLSAP00000006550|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1527bp
MVIVTRVVDDDDVEQWLTPERRIKAMHPTSVQGVEDMISLGDLHEAGILR
NLLIRYNDNLIYTYTGSILVAVNPYQILPIYTAEQIKLYKERKIGELPPH
IFAIGDNCYTLMMRTRQNQCIVISGESGAGKTESXKLILQYLAAISGKHS
WIEQQILEANPILEAFGNAKTVRNDNSSRFGKYIDIRFSQTGVIEGARIE
QYLLEKSRICHQNKDERNYHIFYCMLAGLSKEHKAKLELKDATHYKYLIG
GGSTLCDGRDDAAEFADIRSAMKVLMYSDQDIWDILKILAALLHMGNVKY
KAKVISNLDATEIPEHVNVERVAAILGVNKQALIAALTSKTIFAQGETVV
STLNTNQSKDVRDAFAKGIYGRLFIHIVKKINEAIFKPELHTSDDRSAIG
VLDIFGFENFNTNSFEQFCINFANENLQQFFVRHIFKLEQEEYNLEAINW
HHIEFVDNQEALDLIAIRPLNIMSLIDEESKFPKGNDQTLLNKLHQRHGS
NRNYLKPKSDINTSFGLNHFAGVVFYDTRGFLDKNRDTFSADLLQLIHDS
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FLEQERDRVLTRKILVLQRCIKGWYYRSLFLKKKAAAIVIQKYFRAYNGK
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RKLNAVIKIQSHVRRVIAQRKFRKLRIEYRARTEALKMKEYEARQMEKQL
GKKKAREVAEKKFKERMDNLVREEEEELKKNEILVRRNLQIMKDAEEKAD
QPVDDSAVVDDMFGFLEDQKDNLSESQAPSAFRDLPVQKNVSNGDIVSGI
PTPPEDDEDLSEYKFQKFAATYFQGTFTHQHSRKPLKHSLLPLQTQGDQL
AALALWITILRFMEDLPEPKYHTMDKDNTSVMTKVTATLGRNFIRSKEFL
EAKMMENGEDVSEEERVPLIVNGGTSSIKEKQKSIRHKLVSLTLKRKNKM
GDEIKRKLQEEEYTADSYNSWLESRPTSNLEKLHFIIGHGILRAELRDEI
YCQICKQLTNNPSKSSYARGWILLSLCVGCFAPSDNFVKHLRSFIRDGPP
GYAPYCEDRLKRTFNNXTRNQPPSWLELQATKSKKPLMLPITFMDGNTKX
LLAXSATTARELCNQLSDKIGLKDQFGFSLYIALFDKVSSLGSGGDHVLD
AISQCEQYAKEQGAQERNAPWRLFFRKEIFSPWHDPAEDSVATNLIYQQN
VRAQQYYIEFGTDLDSERLMGLLPNYIPDYCLQREGAHTEWHQLIVQAFK
KSYYVKDRVNVLKVKEDVVSYAKYKWPLLFSRFYEAFRYSGPNLPKNDVI
IAVNWTGVYVVDDQEQVLSSKAFAQTFTLSTIRSEEFTFQSPNAEDIRDL
VTYFLEGLKKRSKFVIALQDYKAQGKK
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mRNA from alignment at LSalAtl2s359:12151..34625-

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000006550-702397 ID=EMLSAT00000006550-702397|Name=EMLSAT00000006550|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=22475bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s359:12151..34625- (Lepeophtheirus salmonis)
GCAAGCAAGATGGTGATTGTGACAAGGGTAAGAGGGACTCATTTGGTCTT CTTTTTTTTTTCTATTCATTACCTGTCAATGCTCCTTCAAGAATTGGAAT ATTTTTCTATTAGTATTAGTATTTTTTTTATTGAATGTTTCCAAATGATT TAACCTAATTTTTGGGAAAAAGATATGGAGTACAGGGGCGTCCGCAAGAT TATATTAGAGGGGGATTTGGTTTTTGGAAAAAAAACAAAAAAATTCAAAT ATAAATTTTTTTCGTAAAAAATTTCAAAAATCTAGAACTAATTAAATTTT TTGAATTTTTGGGGAAAAAATTTCTAAAATCCACAGCTATTCACAAAAAA TTAATTTGTTTTTAAAAAAAAGTTTAAAAATTTAAATTTCAAACATTAAA TTTTGGAAAAAAAAACGAAATATTATATTTTCTTGTAAAAATAAACAAAT CCCTAAATTGGCCAGGGCTACAACCCCACCCCCTGCGATACGAAATTTGA GTTCTTCATGATCATATTAAAAATATGCAAAGTATGTTGCAAATCCAATC ATTATTATCTTTTCTACATAATTAATAACTAATAGCCATTGCGCAACTTT AATTTTCTCTTTTTCATTGATATTCACAAAGCTATCATCCATTCTACACT GTCGAATGCTTCATATTAATATAGGTATCATAAAAGTCATGCAACAGCTC ATAATTTCCCTTTAAATGAAAATCACAAAAAATTGTCAATGAACAAACAT ATTTCTCTGCTTCAGTAATCTTCGCACAGTGTATTTTAGTGAGCTCACTC AGGCGTTTAAGTTGTATTCAATTCTTTTGGATCATAGCTGGCAAATCATA TACATATATATATTTTTTTAAATCACTTGTTCTTTTTTTTTTTTGGTACG TTAATGACCTTTTTAGTCCTTTATATTCATATCTTCCACGATTTTCTCTC 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GAGCCTTGTGAGGCTAGAGAGACCACTTTTGACACCAGCAATGAAAGAAC CCCATCTCCTCCGCTGCAAGACTCTTTTGAAGGAGTCCTTTGAATTCTTT TTTGACACTTTTGGCCCCCCTACAACCCTGATCGACTACACTTTTTGGAA GCATGTCGAGAGGAAAGCCTGCAGTGTTCGACTTCCAAACATCGAGGCCC TCAAAGACACTGTCAACCAACACGGGGATGCCATGGCAGAGGACTATATC TGCAGCGGGTTCTAGGTCTTCTGCCGCCGCCTTTAATCCATAATTGCAGC AAAGGACGGGTACATTAATTATTGAAATAGCTGAGACACACATCTATTTA TAGTATTAATTTTGTTGAGATTCTATTGGTAATTTATAAATTATATCTGG TTGAAGTTTAAAATTCAAAGTGTTCAGATTTTAATGGAATTCTCTGTATC ACTAGCTATACCATTTATTTTGTAGAACCTAGAGTTTAAAAAAATATTCA ATTCAATTAGAAGGAGTAGGAGTTGAACAAAAATACAATAATGTCATGAT CATCATAGTACTATGATGTAAATAATATACATATTATCTGTAGTACATAA AGAGGAACCAATTCTTTTGTGTGTAGCAATGTGTCATAACTCATACTATT TGTTTTACGTGAATGGGAAATATACATACATATATAGTAACCCAGGTGTA TTGAAATTCTATAATTGAGCTTGTATTTACAAAAACTACTTTTCTGTTAA ATAGGGGGATTATATATGGATAGAGCCAACGTCTCGAAGAGAATTCGATG TTGCTATTGGAGCACGAGTTATTTCTGCGGAAGGACGTAAAATTCAGGTA AATTTATTTATTTTTATTCATATTTATAATATTCATTTGTATTTGGCCTG TCAACACAAAAATCAATCAATAATTCTTCTTAAAAATGAGTCACTATTAA ATTTATATTCTTTAACCAATTAATTAATCTAANNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNAGGTGACAAAAATTCTAAAGAATATGATGATCATATTTGAAAG CTGATATCAGGGAGCCCAGGGATATTTCATAAGTCAAATGAAAGCTCTAG ATTTTAGACTATAGCTAAGAAATCCTGGGGATTTCAAACCATTCCAGAAA TATTTTTTAAGTGAAATATTGAAACGTTTATTAATTAGAAAAATAAATTG GGAATGTCCATATATTTTCTAAATTTTTTGATCAAGATTGCTTTTGCGTT ACCCCACCATTAGGTTTTTATTTTTTTTAATTTCCCGCCGTTGGTACTTG ACCTTTTATGAACTTGAATTCTTAATTTTTTATTTCTTATTACTAAAGTA ATATATTATAAAATGTTGACATATTAAGTAGCAATTTGTCTTCTTTTTTC CTACTTTTTTCTAGTTATTTACATGAATTGTCCACCTACGTTGACATTTA TAGTTTTTAATTTTATATTTTGGTCCCTTGGATATCTTGACAATGGATAT AAATGACTCATTCTTGGTCATATGTATATATGTAGTTATAAACTATGGGG GCATCTTTTGTGGGCAACTCAATTGTAACTTATACTTGTATACATACATA TTATAAATTTATCATTAATTCATATTTTATGTACTGCACAAAGGTGAAAC AAAAGTTATCATAGGGAGTAAAATGAATGCTGACGAAAATTTTTGATAAA AATCAACAGGAAATTACGAAATATGCTCTCTTGAAGCCGTACATTAATTT TTTTTTCTCTCTCATTCTCTGTTTTCTGATAGGTTGTCGATGATGACGAC GTAGAACAATGGTTAACTCCGGAGAGGCGGATAAAAGCAATGCATCCGAC CTCAGTACAAGGAGTGGAAGACATGATTAGCCTGGGTGATTTGCATGAGG 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GCAGATATCAGATCTGCAATGAAAGTGCTAATGTACTCTGATCAGGATAT TTGGGATATACTCAAAATCCTCGCGGCTCTTCTTCATATGGGAAATGTCA AGTATAAAGCCAAGGTCATTTCTAATTTAGATGCTACTGAGATCCCTGAA CATGTCAATGTAGAACGGGTAGCTGCAATCCTTGGTGTCAATAAACAGGC CCTTATTGCTGCGTTGACATCAAAGACTATTTTTGCTCAAGGAGAAACAG TGGTATGTTGTTGTTAGTATTTTATGGATGAAAAGTTTATTTTTGAACAC TACAAATATTGTCTTTCATTGCATCCACTTACACTATTTTTCTTGACTGT GGGATGAATGAAAATTATGATAATCAAATGTGGGTGTTTGAACGGATAAA CAAACCGATAAATATGTATTTTTTAAATCTTTTTGCAAAAAAAAAATATA TATATATGTGAACTATCTAATGCATAAAGAAATGAAAATATTTTTACACA TACTTTTTACTACCATAATTTCAAATGAGTATTGTCTTAATATACTTTTA GGTGTCTACTTTGAATACCAACCAATCCAAAGATGTTCGTGATGCCTTTG CAAAAGGAATTTACGGAAGGCTTTTCATACATATTGTTAAAAAAATTAAT GAAGCCATCTTTAAACCAGAGCTACACACTTCTGATGATCGATCTGCAAT TGGTGTTTTGGATATTTTTGGTTTTGAAAACTTCAACACCAATTCTTTTG AGCAATTTTGTATTAATTTTGCGAATGAAAATCTTCAACAGTTTTTTGTA CGTCATATTTTTAAATTGGAACAAGAAGAATATAACCTAGAGGCAATCAA TTGGCATCATATCGAATTTGTTGATAATCAAGAAGCTCTTGATTTGATTG CCATACGACCTTTAAATATCATGTCTCTCATTGACGAGGAATCCAAATTC CCTAAGGTAAAAGGAATATGAGGCAGTAAATTTATACATATACCTATACA TTTTGATCTTTTAGGGCAATGATCAAACACTTTTGAATAAACTGCACCAA AGACACGGTTCAAATAGAAATTATCTTAAGCCTAAATCAGATATAAACAC CTCCTTTGGACTCAATCACTTTGCTGGTGTCGTTTTTTATGATACTAGAG GATTTCTGGACAAAAATAGAGATACTTTTAGTGCCGATCTACTTCAGTTA ATTCATGATTCCAAAAATAAGTTTCTACAAGCAATTTTTGCTAGGGACTT AAGCATGGGATCTGAAACTCGTAAAAGAGCCCCAACTCTATCTTCTCAGT TTAAAAAATCTCTAGAATCTCTAATGAACACATTGGGAATGTGCAATCCC TTCTTTGTTCGGTGTATTAAGCCAAACGAACTCAAAACTCCGATGGTACG AATAACCTTGCTTCCATGAAGATAACATATTATTTATAAATTTTATTTTT TAGATGTTTGATAGAGAGCTTTGTTGTCGACAATTGAGATACTCTGGTAT GATGGAAACAATTCGGATTCGTCGTGCGGGATATCCAATTAMACACACGT TTACGGAATTTGTAGATCGTTATAGATTTCTTATATCTGGATGTCCTCCT GCTTCTAAATTACAGGACAATTGTCGCGGAGCCACAGCTAAAATTTGTCA GAGTGCTTTGGGCAAAGCTGATTATCAATTAGGGCGAACAAAAGTGTTCT TAAAGGATGCACAGGATCTCTTTCTTGAACAAGAGCGTGATAGAGTATTG ACACGTAAAATTTTAGTTCTTCAACGTTGCATAAAAGGCTGGTACTATAG AAGTCTATTTCTTAAGAAAAAAGCTGCAGCCATAGTTATTCAAAAGTATT TCCGTGCTTATAATGGAAAACGTAAATTCCAAAGAATGAGATTAGGTTAT 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