EMLSAT00000006596, EMLSAT00000006596-702443 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000006596
Unique NameEMLSAT00000006596-702443
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s363supercontigLSalAtl2s363:58872..81781 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000006596 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000006596EMLSAG00000006596-689362Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000028909EMLSAE00000028909-737837Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028910EMLSAE00000028910-737838Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028911EMLSAE00000028911-737839Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028912EMLSAE00000028912-737840Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028913EMLSAE00000028913-737841Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028914EMLSAE00000028914-737842Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto771320auto771320Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000006596EMLSAP00000006596Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000006596

>EMLSAP00000006596 ID=EMLSAP00000006596|Name=EMLSAP00000006596|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=460bp
MNELSRNSSPEPPPYLISEDPSAKVKSSLKLSELIETPVEKHLPTVILNI
GGLKHQILWKNLEKFPNTRLGRISRASNILEIESLCDVLVDHKISEIFFD
RNPTTMGLILGFYRTGILHVDDTICPLAYSDDLKYWQINEIHIDPCCLIK
FNVRRERVLEESGKLIEEDSDSSTSSQHEERFVSDTKRKIWYIMEKPYTS
TLAKVMNIVSISFIIVSLIGMVLSTTHYFHVRNEKGELIEDNYPLNIIEA
VCVIWFTIEYVVRFACCPNKLNFIKGFLNFVDLLAIVPYYVSLILLKTRG
KSYQDIRKILQVFRIMRIFRILKLARHSTGLQSVGYTFKKSYQELGLLLL
FMGMGVLVFSSLAYFAEKEDNGDAFSSXPSTFWWALITMTTVGYGDIYPV
TLWGKIIASVCAICGVLFLAMPIPIIVNNFEQYYKEKLSQDKAEKIICKM
KRQFKDDAKA
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mRNA from alignment at LSalAtl2s363:58872..81781+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000006596-702443 ID=EMLSAT00000006596-702443|Name=EMLSAT00000006596|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=22910bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s363:58872..81781+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATCCACTCAGTGCTCAATATAATGTGAAGGAGAGAGGACTCTAACTTAAG GGGCTCTCTGTAAAATTAGTTCACAACGTACATAGTGCATGAGGCGAACT AAAAATAGAGCAAATCATATTGGTTAGAAGGATTTTGTTTATATGTATCC AATGATACATAGGCACAAGGACCATGATCCGTTGGATTATATCCCCTGCA AGTTGAATTGAATTGAAGGTATGCTCATAATATTCATAATAAACACACTT TTCAACAGCAGAGATGTACATATGTCACGAGAACATGCTATACCCTAATT CAAAATATGGCCTTAGTTTGTCTCAATTAGCCTTAGGGCCCTCAGAAATA GGCCATAAAATTATAAGTATTATTGGTTTGAAAGCTGTATTTTAATTAAT TGTTATTAATCAATTTTAAACCCTTAATTTTCTACTAAAAGGTTATATTC GTTGAATTAAGACCCAGGCATCATTTTTACTTAAAATGCGTTGTTTGTTA TTATGTAATGTTTGACTCAAACATACTGACAACAATAATATCCATGTAAG ACTTACAAGTGTACACGATAAAGTTAATGAGAGAAAAAGAGGATTATAAA TGATATCTCTCTTCAATTAAGTCTTCAAAGGAGTATGTGACGTATTTTTA AGGCTTGATAGATATAGTAATCAAACACATTTACAATTTAATTTGACTGT GTATTTGAAATTGAATCTAAAGGATCTATTACCTCAATAGTTATTTCCAT ACTTGCCTTGTCTACCATATTTTAAATTTTGTAAAGAAGGGGGAGGACGG AACCTGTTTTATGCTTACTTACTTATATTTTTGAGTTCTTTCCATTTTAT CCATTTTGCTTATTTGCAATGGTATTGTTTCGAGGTGGTCCATGTCTCTT TTTTAATTATACGTATCAAAACTGAAAGTCAGATGGTGATTTGTTTAAAG TAGGACTCGAACAATAGGGATTTTTACCCTTTCATTTTTGTACCAAGGCT TAACTTCACTTAATTATACAATATAAACTTTTGTTATTACATTATATTAT TAATTTTTAAAAAGTAATGAAATTGCAAGTTTAATACATACCACAAATCT GATACACAAAGTCTAAAATATCATTTATTTGGGTAATATTAATAAAACGA CGATGATTTGTTCATTGTATCGTTCATAAATAGAATATCTCTGACATTTG ACTCTTTAACCCTTTGAATACCTTTACATTTTGAAAACCAATGTTCCATG GTGTGTGTGTGTTGTTTTTTTTTTCAATTTTACAGATAAAATATTGTACA AAAAAATAGTTATATATGTGTCCAAAGGATAAAGTTATTTTTTTTTTACC CTTTGAATTCTTGGAAGAGTAATATTTTTATAATTTATGATATGTTAAGG GTTTTTATCAAGAGTGATACAACATTTTTTTATATATAAAATACAAACAA TTAAATATTTTGCCAAATTTATTTTTTAGTACAAATTATAAACATATACA TTTATGTATGAATATTTTGTACCAACTCTGCATTTGATATTTTCTTAGAG GTCTTTTAACGTCGCCAGCTTATTGCTGAAGACCAATGACTTCACATGAC CCCAAAGAAAGGATCGCACGATCGAAAAGGTCAATCAACTAATCCATTTC TCAAAATAAGGAGCTCACCAAATTTGCTTTGCAATAAATCGATTGTAACG TTTGGTGTGTCACAATTGGCACTATTTTGTAAAAACCACATGTTTGTCAA GTCCATACCTTGAAATTTAGGCTAAAAAGAACCAGTTATCATGGCGCAAT AGCTACTTCCATTTACAGTAACTATTGCAATTAATTATCATCATAAACGA AAAAATATATCCCTCCGGTATGAAGTTCACAGCTATCAGTAATTNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT TCAAATTCGCTGTTTGTCGACATCCTCTTTCTTATTTAAATTTCTCACTC AAAGTTCTGATGAAGACTTAAATTCCGTAAGGTTGCGCACTGATATGTTT CGATGGTAAGCACTTAGAACTGACTAATCTCTTTATTCAATCTATTAATA AATATTTAGATATCATTTATGGGTATTTCCTATTTCCTGTTGACATTTTG ATATTAATACTTGATATCAAGGGATAAAAATTCTGTATACAATGGGCATG TTAAAAAAACCCCAAAAATCAACATGGTAACTCTGACAATTTAAAAAAAT ATTTCTGAGGAGAGAAAGAATAATGATCAACTGTGACAAGGAGGAAGGAG AAAATGATATAAACTAGAACATTTGCTATAATTACTCCGCCGTCGATTCC CTATTCTACTCTGAGTCCAACAAATACTTACAATTATAACTCAGCAGCAA ATCCTCAGGGTGACTCTCCAATTTTTATGAGCACATACGAATGTCCAATA AGGCTTTGAATCTATTTGGAAAGGATGTTCATCACTCAGGAATTAAATAG TAATGACAACTGCTAAGGAAAAGAAAATACATTCTCCCGATTACCAATTC CAAAAAAATAAACGACAAGCAAAAAAATTCAGCGGATATACATCACTGTT GATATCACATCACCTGGCGAAGCCAGTGCCAAAATTTGATAAAACAAATT TAGATTTTAGACGATAAACCATCAAATGTTAATGTTCAAATATTGTGTTT ACATTAATTTGATTTTTATATTAAAAATAAATATTTTTCTTGGGGAGAAA ATATTTTTGATAAATAGAAATATTGGCTAATTACCAAATATTTTCAAACG TTTTATAATCGGCCGATTTAGTCAACTCGTATTTGGGCTGTACATATACA GGTTTTTAATTGCAATTAATAAAAAAGTTAAGTTGAGTAAAACTATTTAG GTCATAATTTACTCAAAAATAATAGTAAGGCATTCAGACGAGGTCTTTCA CGTTGCAATCAGAGTTCCTTCAGCTAAGTTGCAAGCAAAAAAAGGAAATC TAAAGTTAAAGCTATTTGCCCAATGCCCCGAAAGTGAGAAATATCATAAA TTGAGTTTTTAACGTATTAGTAAAATATTTATTTTTGAATCAAGTGTCGT TGGGGTTAGACCTCAGGGGCCAAAAAATGGTGCATTTAGTAGCATCTTAC CGTTTTTTCTCTTTGAATATGTTAAGACGGAAGACTTCATCCTGATCTGA AGTATCAACCAGGAATCTGATCCAAACGAATTTTGTATTGTACAAAACAT ATATATTTATGTATTTATAAGTGAAGTAGGAATTGGCCTTGTAGTTATTT GATTTTTCAAGAAATAAGCAATTTTCGTTTGAAGATAATGTTTCGGCCTT TTTTTTTTAAATGCACTTTTCATAGTATAAAAGAACACTTTTTGTATATA CGTGTAATGTAGTGTTTGAACTCCAAAGCTTCCTTATGTTTTAAAGACTA AGCTTCAATAATATCTGGGGGGTTCCTATAACATTCCTGATGCTGTTAAA AAAACTCAACCCCTTCATTAGTTTTTTTTTTCTTTAATTATGGAAATACA TACATTAACCTTTTTTTCCTTCAATATTTTTTTAATGTACATAGTTATAT AGTTTSATTTGGTCTAGACATTTTCAAATATTTTTAAGTTGATGACTTCA AGAATATAAGAATGAATTACAAGAGTACAAGGAACTTTTAAAGGGAATGG AATTTATTTTATAACTATTTTACTGTATAAAAGAATATAATTTATGACTA TGTTGGAGAAAAAGAAAGTCACATAGAACTCATAATAATACCGACTCAAT ACTATAATAAAAATTTAATTTTGATTTACCAATAAAGTTATTATTTTACA TATATTTAGTTCACTCAAAAACTAAAATATCCTTGCAATTTCTTGTGTCT ATTATATATTTCCTCCATTTTCTATATTCTTCCATTATCCAATTTTTTTA GTATGACATTTGCATTAGTTTATGAGTAACTACTAAATTTTAAAATAAAT TATCAAGGTTTTAATGAAGGTTTTTTTTTGTTATGTTTTTTTGCGTTGTT ATTATTTATCCACCCCAACGAAAGAATCGAAGGGAAGCCTTATAACTTTT ATTCTTTAAAAAAAATGTTTAGTGAAAAAATAGTTTAAAAGTAATATATC CTCTACAGCAGGGGTTCTCAACAGCTTTTGGGCGTTAAACAAAATGAGAT TATGAAGTCATCTTTTGAACCACATTAATGAAGCATTCTCTTTAACTTTA AGTGGATAAAAGTAATTGAAGTTTGAATATTTTTTTCATACAACATATAT TATTACTTAAAGACTGTTTTGCTCTTGAATTCTGAGCTATCTTTTTAAAG TTTGCATTCAGACTGGTTGTGGCAATGCTCATGGTTTGATCTTAGTCTTT CGAAGCTATTTTAGTACGATATTAATTTTTCACCACGTTCATCTCGTAGA AAACAGGCTTGCACAACAACGTTGATCCGAACATTTTACCAACACGAATA CTAAATTGTTTCAGAATCTAAAATCTTGGTGGGAATCCAACCCCAAACTT TATGGTAGAAGAAGGGAACTTGAACACCTTCTTGCATTCATCATTTGATT GCAGGTCAAGCAGCACAATTTTCAGTCTAGCAACACTTCTATTTTTTTTT TAAATTGATGAACAAGCCCACTTCATTGACCATTTGCAGGAATGAAAACG GGTTCTTAACCAGCTGAAATACAATATTATAATCAATGATGAAAATCTAG 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TATTCATTGAGATTAGTTTTTTTTAAATGTTTATATCAAATTGAAACGTT TGAACAGTAATTTATGTTTTTATAACTTTTTGATATATGTCAAACTCTTA ACTATGATGTCAACCAAAAAATTCATTTTAAATGATAGATCAATCATAAA ACTCTAGATATCTGGAATGAAGACGGAATTTTTCCTTTTCCCAAATGAGT AAATAATGAATAAAATAAAATTGAGACTAAATATACATATTTTGTTGAGT ATTTCTAATATGTCCATATTCAAATTTTAGCAAAGATGTCTCTTAAATAC ATTTTTTAATATATGTAAATTATTACCTTTACAAAAAAAATATTTCAAAC TTACAAAAACTTATATTTACTAAAAAATACCAATTAACTTTTCGTTATAG TCTGTCTTATTCATAATAGAAAATACTCAAATTATATTCTTAGAGACTTG AAATATTGAGGTAGTCATTTATTTAGATACTTCGTGTAAATAAATGCAGA AAAGTACGTTTGTAATATAAATTGGTTTGATAAAATCATTTTTGAATTAA AACTACATGCATGCATTTGCAATAAGTGATTACTATATTTATACGAAATG TAGTATATAGACTTGGACCTACATAGTAGACTGTCCCGAAAAGCGAGCCT GTTTTGTTTTCGGGCTAATATTTTTTTATCCTTGTACAATAGACCTGTTC AAATTTTAACTTTTTTTTCTAAACCTTTTAATATTTGCATTTTTCCCATT CTCTCAGGTCTATAGAAACTAAATGTACCAGTCATTTGGATTTTGGACTG CAGATATACCTGCCGCATAGCCCTTGAAAATTTATTGAAAAAGATTTGGA GCCCATGAAGAAAAAATCAGTTTATGCCATAAACAATATTCTAGAGAAGA GATCTCCAAACACAGACTTCAGAGAAGTAGCAGAGCTGTGTCTGACTATT 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TTCAAAAGGTTTAAAAGAACCTGAGAACGGGAAAAAGTCAAATTTCAAAA GGTATAAAAAAAAAGTTAAAATTTGAACAAGGTTCATTGTAAAAAGATCT TTTCTGTTGGAGACAATCAAAACATTAAATTTCGTAATGATAAAGATTTG AAAGGTTTTTTTGGCGTAGTATAAACCATTTTAAATCTGAAAAATTGTAC TTTTTTGGGTCAAAATTGTACATTTTTCAGTCTTTTGAACCATTCCAAAT ATGATGCTAGGATTTGCTGTTTCTCTGTTGTATCAAGCATAATAAAAAAT AAAGTGTAAATTTTGTCTATGACTGTTGTATGGTGAAAAATATAGTAAAG CTGGCTAAATGTTGTATTGAAAAGTCCGTCAATGTGTTTCTATCCTTGGC GGAGAGGCATGACATCTCATCTACGAATCTATTTTATAATTAGCAAAGTG CAGCTTACATATATACTGCCTGTTCAACTAGGTTTAAGATCCGATTGGGC CTTGAAAGACTCATTGACATTTTGGTGGGTTTCGAAAAAACAAACAAAGG AGAAGTCATTTCATATGCAGAGAGGGGATTTGTGTAGATGTGCGAGAAGA AAACTATAAAAAGTAAATTTGTTTTATAATAGTACTATATTTGGCAAGGA GCAAGGGACCTAAAAATTGGCAATTTTGACCAAAAATACCGCAAAATAAA AAATATATAAATACAATATTGTACTCAGAGTGTCATATTTGACAAGGACC AAGAGGCCTAAAAATGGGGAACCTTGACCGGAAATACTAAAAAAAATATA AAAAACAATTTTGTGCTCATAGTATATCATATTTAAGACAGCCCAAGAGG TTTAAAAATGGGTAGTTTCTACCAAAAATACAAATTTTATCAAACTAAAA AGGACTGTTATTCGACAAAAACGGCATGATTCCCTCAACTTTCTCAAAAC CATTTTTTATTGTCTCAGGCAGAAAAAGTCTTTTTGCAGGGTATGATAAA TAATAACCCCAAAAACAAGACAGTCTAACACTAACATATGTGATTGCTTG TAGGTATAAATCAGGACGTTAATTACTTATTTTATATCATTCTTGCCCCT TTTTGCAAAATTAATCACAAATTACTATAGAAACAGGGAGTTATTGTTTG TAAATTGTTTATTTTATGTATTAATAACATAATCAACATAGAAGTAGATT TAGCCAAAGGCGTTGCTAGGTTTCAATATTTCCAGGAGGAGCTTAATCCC AAAAATTATCAACACCATCATTAAAATACATTAATAAATATATTTATGAT ATTCTAGGACGTACGCGTATTATATATTATATTTTCAATTATACAATTCA TACTATTAATAACTCCAGAATTAAAACTTGTCGATAGACAACATAGTCCT TTTTCATCCATAATGAAGATGTATATTAAGATACACTCGCTAATCCTCTT CCTAGTTCCATTTTTTGATTCGTATTTAATATACGTTCACCATTTGTCCG TTTCAACATTAATTTGAGTTTTTTTATTAATATAAATTTTTATGGTCCAT TTTCGAATCTACAACCCATGCCTTAAAAAAATCCTATGAGACACGGGAAA TCGATTTCGTTGTGTGAAAAAATCAACTTGTAAGCGAAAAAACAAACTTG CCCTCCAGAGCCCAGGAATCTTGTTCGACCAGAATGAAACATAGCCGTAG GTACGTAACTCAGAATTCCGAACAACTTTCATTTTATTGTCCAAGTGCTA ATCTGTCTCCGTTTTTAGAAAAAAAAATACCCCGGTTATGTGTTTTTATT AGCGAATCAAATTAATTTAGAAAGAGAAGAAACAGAGAGAATGAGAAAGT TAAAGAAGGAGGGAAGGGAAAGGGTTTTTTATTTGTGTCAAAAACAGCAT TTGAATAAATTCACATAGGCAAAAAGTTTCACACAAAGATACTTCATTAT TTATACGTCTACTTGGTAAAGTTAAAACTGATTTGTTCTACCATTGGGAT TGGATGTGTGATAAAACCAAAAACAGACTTATGTAATTTCTATGTAAGAA ATGTTAAATTAAGGGAGGAGGGGGCTTCAGTTGCCCAGCGTCGATTCAAG ACCTCAAAGATTGAGTTCGTGAAGCTATTGTGGGTATACAMCAGCCACTT TGCGATTTGGTTTTGTAAAATTTCATAAAAAGGATACGGTCTTGTAAGCG TATAGGTGGGATCCATTTTCCTGATATTGTTTTCTATTATTAGTGGCATA CCTTTCTCTTTATATTGAAATTAACATCCGATCATTTATCTCAAAAAATG GTAGTTTTCTTTGAATACCAAAAAAAAACCACATCTTATTGGAACATTCT TTCTTTTAAAACATATACATATTTTTTAATATGCATTTGAAAAAAACAAC AAAAAAAAGGAGTCATTTTCATCACTAACTGTAAACGTTTGTTAAGTATG ACTAAGGAAGTCATTTTTGTAATGAAAAAACTAAGTTTAGAAATTAGGGA AGAAAAAATAACCCTGCTCCTTCTTCTAAGTTGGTTGTTATTGAATAGAT CGTAGCAGTATTAACTTTTCCCTCTGAAGTAAGCATTCTCTAATTGTCAG GGTTACCTTGTTACTTTTCAGGTTTTTTTTATTTCAACATGCCGAAAATA CACACAATTATCATCACTAAGCATAAGTCTCACTTTTCCTTTCTCATTTG GTGTTTACAAAAATGACTATCTTTTTTTTTTTTTTTTGTTAAAATAATTT ATTTATATTCTACAATACAAACAGTGTAAATAATGAATACATATTAAGAT AAAAGTAGATCATATTGATAAAAAGCCACAGGACAATTATGTTTAAAAAA 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