EMLSAT00000006602, EMLSAT00000006602-702449 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000006602
Unique NameEMLSAT00000006602-702449
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s363supercontigLSalAtl2s363:723614..739323 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000006602 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000006602EMLSAG00000006602-689368Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000028932EMLSAE00000028932-737860Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028933EMLSAE00000028933-737861Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000028934EMLSAE00000028934-737862Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto779479auto779479Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000006602EMLSAP00000006602Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000006602

>EMLSAP00000006602 ID=EMLSAP00000006602|Name=EMLSAP00000006602|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=150bp
MRILIKIRALLELARATSSLVCYTIRISEYLSLTSIMYEIIVPKTQDDID
HGSLTTETVRKKGVARATLYKIKKRLVVNKGIEISSSHVRKRLRDLESVK
NAETETTKPIRFQSAKMGVSEWTLRKAIKNAAGKYQAWRWKSMFRSLHRC
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mRNA from alignment at LSalAtl2s363:723614..739323-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000006602-702449 ID=EMLSAT00000006602-702449|Name=EMLSAT00000006602|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=15710bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s363:723614..739323- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGCGAATTTTGATTAAAATACGAGCTCTTCTAGAGTTGGCGAGAGCTAC TTCAAGTTTAGTTTGTTATACAATTAGGTAATTTAGGAATAAATTGCTTT GACTTACAAACTTTGGTTCAAGAACGAATTAAATTCGTATGTCAAGGTAT TTCTGTACATTATTTTATCTCTGGTGATTTATAATTTSAACATCGGCTAA AGGAAAGAAGTTGAGTGGTTAACTTTTTATTACGTCATCAGAGTTGAATA TTATTTTTCTAGTTGGAAATGTCGACTATTAACGCAGAAAAATAAAACAT AAGTGACGTCAAATTACACCCTTTAATCAGCTGATAACTTTGCTTAGTCA TTCGTCAATCTTTTAGCCTCTGTGTATTTCTTTCTCGATGGGATAATTCT TAGTAAAAAAAAAATACAAGCAAGATAAAAACTTATATAAGAAAAAATAA TTCTTATTCGAACAGTGGTTCTTAAACAGTGTGTATTCACCTGAAAATTA TCAAGATCTTCAAATACCAATAATTAATTTGTAATTTGATTAATGAATCA GTTTAAAAATGTATTTACGGCTTTGAAAAAAAAATCCTTTAATAAAACTT ATAAAAACAAAAAATTACCAGTTGGAAGGGAATACTCGTTTCAGGGGTAA ATAAATATGAATAAAAAAATTGAATTATAAAGTATGGATTCATTCATTTG ATCCTGGTTTAGTAATGTTTACAAGATGGATGATTAAAAAAAAGAGAACA ATTTTTCATGGAATACAAACTTAACATGCCTTGGTAATTAAAAAATCTTA TCATGGATTTTTACCCTCTGCCATCGAAGTTGAGCAGAGGCTATTTTTTT GCCTCTATTTGTTTTTTTTTGTTAGTCACCAGGATTACTATAAGAGTTAC AAATCGATTTTGATCAAACTTTGTACAAAGATTCTATATGGTCACAGTAA GAGGCAATCAAATTTTGAGAGGTAAAGATCAAGGTCAATATAGCACAAAA CGTAAAAAATGCATTTTGTATCAAAATGAGGTACAAAATAATCATTTGAT CTTAAGCGAAGCTTTTGCACTCTACCCAGTGCTCATTTTTAGTTTCTGAT TGTATCATATAACATATTATAGGGAATATTGACATTTCTAAGAACTTTCT CCGATGCCGATACGATATTGACTGTTTTGCCCAATATATAGGTTTTCTAA TTTCGAGCCGATTTATCAGCCCACGTTTATTCTGCACAAAAAATCATAAT CTATTATTGAGATGACATCCATTTGTTAACTAGGGATGACTCAACATTAA TTTACATTTGTAAATATATTTATGTACTTACGATACGTTTTTTTTCTTAT GGATTTTTCTATATTTAATCTTGATTGTGTTTTTAAATAGAAAAAGTATT ATGGAACAGCTGAATAAGCATACAAATAAAGTAACTTATGTAATAAATAT GAATAACTTAAAACTCATACTACTAGAGGGAGCACTTTCTTCTAAAAAAA ATGTATTATATTATCTTCTGCAAAAAAATTGCATGGAAATTCGTCAATCA CCTTCAAGTGTTATTTTCTCGACTTGTACGAAAGCTTAATTTAAAAAAAA ATAATTGTTTATGTTTTAATATATCGAAATATGAATTAATTTCAAGGTCT CAGCCTTCATTAATTATTGAATGAGTAAGTATTCAGATTTCAATGGACGA CGCAATTTGTTAAAATTTGAGTTAAATATAAATGTTATTGGTTTTTATTA GTGAACGCTCTAAAGACTAAAGTATTCATCATTCAGCAAACACATTTTTT TTCATACTCTTATTACCAATCTTTCATTGTTGAGGACAGAACACATATGA AATGATACAAGTATTGAGTAGTTACGTGTGCTGATGAAAAAGGGAGAGTA ATAGTGATGATTTCTTGGAGTGTTATATTCTATATTAGTACAGCAACATT TGTCTCTATCCAACGCCTAATTACTCTGGGCTGTGCCGAGTACCACTGGT AATAGATTAAAAAAGGCAAAATGGTTGATGAGAGGGTCTTTTTTTACTTC AAGAGTGACTGAATAAAAGTGTTCAAATAGAGTCCTAAATATGGGGAATC CCAATTAATTATTCGAAAAACGTCACAAATATAGTTTAAAGAACAAGTAA AAAAGTTAATTTTACATAATAGGTCCTCAACTAAAAAGTGTTTCCAGGTA ACTTTTTTATGTCTGCTTTTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTAATTCATTTTCTTCCCTCCATAATCAT TTAACACATAAGGATCTTAATTGAGGATTATCATTAATTCCGCTCCCTCT TTCTTCTCGCACTCTTCGAAAATCCCATTCCTATGTATTACTCCATCTAA CCTAGGAATGTTCATTCAAGTCAACTTCCTTCTCTAGGAGTCACCATGAA TCGAACTTATGCAGATTGAGTTCAAGAGAACACCTTCTTACGAGTAAGTT GTCCACTGAGTTACGTAGCTCCATTGGATGGYTAAGGMCTTTTTGTTGTT TGTGGYTCAGTCATCTCTCTGATATGGGAGGGAAACCATGTCCTCATATC ATACGTTGCCAGTATTATGACACAATACACAAGAGAATGTATTACTTTTC CAGGAAATAAAATAAACGTTTTCATTTACATTTTGTGATTGTGCTATACA GAGACCTTTCCCTCATGTTAAATATAGTAGATTCCATTATGAATAAATAA TTATCTCTAAATTTCAGATTTTAAATTTGAATGACTCACAAAATATTGAC TACGCTTTATAGTGTATCTCTCAACCTTTTCAATAATAAAAAGAAATATG GTYCTTGGCATATTACGTCATTCACTCCAATGTTAAACTATTCTTTATTA ATGGTAAAAATTTAAAACATCGTACTTTAAACATAGGCCCTCTTCTGTAA TATCTACTTTTTTTTGTTAAGAAACTCTTCTTGACTTGAACAAATTCACT TTGGATTTGTTGCAAAACAAGGTTTAAGCTTGATTGTATAAGAATTGCAA ATTTACGACAAATACTTAATCAAGGAAATTTGTTGAGTCAAACGCAGAGA TATATATAATAATTTAATAATATGGAATACATGACAAAATGATGACGATC ATATTTTCCTTGTTGATTCATTGTATATTAATACAAAAATATATAAGTAA ATTATGAAATAATGATACAAATATTATTTCAAAAATGGAGTTATAAAGTT ATGTCCTTGTTTTTATATCTTCGATCTAGGTTTATATCAGTGATGAAAAT TATTTGTATGTTGGGCAAGATAAAAAAAAAAAAAAATKAACATTGACAAA CTGATAATTTGATGAATGTTTTTTAGGAGAGATGATTAGCTCTCATGACG TTTCTTTGGATCAGCTACAATTAACTGTGACAAGGGAGAAGGAAATAAAC AATGACCTAGGCAAGAATTGCTCACATGTCGATCCTCAATTCTACTCGGG AGTCCAACAAGGACTCACAACTATAACTCTGCAACAAATCATCAGGGTTA GTCTCCGTCTTTTATGAGTACACATGAACGTTCAATCAGGGTTTGAATAT AATATAATATCTGTAGGAAAGGAAGTCCTTTAACCCAGGAATATAAAATT TATTGTTCAGATTACCTGTATAAAAAAAAAACACACGATTTACATCCCTA GTATGTATAATATATATTATTGAGTGGGAAATTTAAGCTAGTACTATCCA TATATTATCATTTCTTATTTGATTCATTTTTTTAGATAGAGTCTGTAGGT CCTACATTTTTAAATTCCATAATATAGTCAATGGAACTTTAGATACCTGG AAAAAATACTTTATTTTTGCTTTTTCCAAATGAGTCATTTTTTCTTTAAT GTTTTAGATCAAAGTAAAATAGGGAGCGAATGTCAAGCTATAAATTTAAG CAAGTATTACTCTTCCTCACTTCATTTTTTTACAAATTTTAATCATAACA ATTAATTTGTTTAAATAAATAGCTCATTACATACTAAGGATATTCTAACC AAGGTCCTTGAACTGTGGTGAAATTCTTGTCCTCTAAACTTCCACGTTTC TTCCCATGGGCATCGTTAGATCCACCAGTTACTATTAAATGGCTTTCCAT TTTTATATGCTCTATTTCACTTTTCAATCTCTTATGATCAGTAGAACGAT CCGGAAATTTACTTTTACAATGTTGGTAGTTGTCTTATTTGATCATTGTG CTAATGATCTAATCAACCAGATCCTTTATATATGCAAAGGCTTTACAGTA TCGTGGCATGTATTAAATGAGATTAATATATAAGGGTAATAAATGACTTA TTTCCTTTGGATTATAATTAGAAATACTCCAGTGTCATCTAACGGAGGAG AAAACAATTTCTTTATTCATCTTTTCCTCTCTAGTAAAGGATGATTGTCT ATTCATTATTGTGGATGAAGTACATACAGTGTTATTGCCAACTTACTAAA GTTAAGTAGTTGATATGGTAGAACATTCGAAGAGCGAACATGTTTCTTCT GTAAACAACGACTAGAGACATCCCAACATTTTTTGTTAGAGTATACTCAT ATAATTKGTATAATGGAACTATACTTGAAAATGTTTTCTTTCTTTTTTCA ATTTTAAATTGAATCTAGAGGATAAAAAAGGGTTGCCAACCAATGGTACG CGTGCTACTGTTGGCACGCAGATGCATATTTACTGGCACGCACAAATTAG AATATATTCTCTTACAGTTTGTGTATGTCTTTTACCATTATTGTTGATAG TGCCACACTCATTGATTATAAATATTGAAGTTGGCCCTCTATGTCTCAAA GGTTGCCTACCCCTGGCATAAAGAATTGTGTTATTTTTTATCAAGAGAAA ATTAATTACATCACTGCAAAAGTACAATTTATTATTCATCAATTTATATC CACAAGAATAAGGATTGCTGAAAGATTTTACGATAATAATGTATTTAATA CATATGTTCAAAAATTGAAATTAATGTTTTTATAAAATATATAATAACGA GGTACAAAAAATTATATCCTGTGTCTTTACTGGGTTTACATTAACATGTT CACTCCAATTGCCATTCAATATCCCACTTGAAAGCTGAGAGCTCCAAAAA AATTAGAAGAACCAACACTTTTAGACATTTTAATAAAAGTGTGGCACCCT GTAAATTTATGCATTTGTCTCATATGACACCATTCTACTCCTTAGTTGAA ATCTATGAAGATAATTATCCTTTTCTTGAAGGAGGCAGTAAAAAAATATT GTCATTATTTTACTCATTAAAAACATAATTGTGTAATGGTTTGATATCGA TATATAATATGTATACCCCTCTCATTCATTCTCTTTAACACTTTAAAAGG ATTAATTTGCATTAGGATTTAGGTATATTACTGATATGACTTTAGGACAA ACTTTTTTTTGAAAGTTATAAATGCATTTTTGTTTAATCGATTTTTTGGA AAGTAGGATATTGAGTAAATGTATTGTTCAAATACTATTTTATCAGTTTC TAGGGATATATTATATTGATTGGATGAAATGCATATATTCTTAAAACAGT GGTTCTTCAAATATTTACAGTCTGAGGGCACTTATAATATTACAAAGGAT GTCATTTTCGTTTAAAAAAATGAGCACGAGGAGAGGGCAAGAGCGCAACA TACGGTATTACTGAATTAAGAGCCTTGTTACTCCCTAATATAGGATTGAT TATAATGGGGGGTGGGAGGAGGGAGAAAATGAATTATTACTATAAAAATA TATTAATAATACTATTGTAGCTGTAGTACCCGTCATTGGCCCAAGTTTTT TAGGCGTCAACAAACAGACAAACGTTGCTTTAATGATATAAAAGATAACT CTTAAAGAAATTACATGAGTCATTCTAAGTTTTTCATAACCAACTCACAT AAAAATATTTTTCATTTTGAAGATAAACTTTAGGCCAACGAACTACTTCA CATACTCAATCTATCTATGTTCTGACCTCCATGTTGAATCAAATAATTAT CAGAGCTAAGTCCTAAATTTTATTGCAAGTGTGTGAAGAAATAGAAATTA CTGTTATGCGGAGGGAATAAAACTTCCATGCAAATATTATAATGAGTATT TATAATATTCGTATCGTATATTCTGGGATTGAGATATTTATATATATACT CATTTCCCAGGGAGCACCCATATGAATTATGAGTGAACCTGTACAATGTC GATAGGGAAGCGGTGAGAAACCCTCTTCTTAAATTCTAATTTTCAATAAA ATYAAGCCATAGTTATCATTAGAATTAAATCTCTCAATATTAACAATTTC ATTTAATATAACAATTCAGATATGATTCAAAATAATTTATTGGTTCCGGG TGATTTATATTCAACTCTCAATGTCCAGGAGAAAGAGAATTGTAACAAAC AAAAATGAACATTTCATTATAGTTTCAACTTTGCCATCAAGGATCTTTCA AGTTGTAATTACTAATACTCTCATTGCTTTTATCTAAGAAATCACTTAAT ACATTTCTGAGTTTTTTTTAGTCAAATATGATCTATCTTCTAATCACATC AAAATTTTCAAATCCAAAAACACATTTCCTCTGTCGATAGAACCCTTCGG TTATTTTGGGAAGAGCAATTACTTTTTCAATTTTGTTTGAATTAATTGAG AGGATGGCTGGCTAAAAAATGTCTAGTATATCTCTAGAATTTATTGTTTC CAAATTAAGATAAAGTTCCTGCATTTTCAGCATTCCTTTAGTTTATCAAC ATTTTTGGATGTTGCTTATAGTAGAAAATGTTATAATATTTAAACGTATG GCAAAACATATAACTATTAAATAAATTTAGAGAAAATATACTTCCTCAAA TGTCAATATAAATAAGACTTTTTGTGCCGCGCCCATATTTTGAGTAAAAT AATCAAATATGAAGTTAATGTACATAATCACCGGACAAGACCACACCCCC ACACTAAATTATCTCCAAATTCATATGAATTAATTTCATTATTTATATTT CAAATCAGGAGTAAAATATTGGTGATTTAATAGATAAACGGTTTTGTAAT CCTATAATGTTGGTTTATGGCAGTCGTCAGGAACTCGATGTAAATATATA TATTTTTTTGAGTCTATACCTATTTAAGCTAAAATATAATTTATTAGGGC TGGGAGGTTATGTTAAGCCTAAGACTCGTTACGAACCGCGGTACACCCTT CATGGTACTCGGTTCGGTAATAATAAAATGTTTTTTTAAATATAGTTAAT GTTGCTTTTCAATTTTTTCCATATTTTATTCTTTAATAACTTCTTTTCTT TACAAATAAATTGTTTCTAAATATAGTAAACTTCTCTAAAAAAAAACGGA GGTTGCTATAAGTACTATTATTCATGAATTTATAATTTATTTTGCAAAAA AATGAGCGTTTCTAAATTTTCCAGTAATAATCAAGACCAATTAGCAGTTA CAATATCTCCATCTGTCGAAAAAATCTTTTGCTTCATGCAAATGTACCTG TAGTTACGAAGTATCGTCAAGAAAACACTTGAAAACATTGGGACATTTAT CTAAATTATCCCTCCACCATACTTACCGGGCTTTCGTCAACTGTGATCTA TTTTATAAGTAACTATTCATTTTCTATATATTTTAACTCAGGCTAGTTGG TATCCTATCAATATTTATTGGGCAATACANTGTATGGTGCTTGGGCATTT ACGAGACTTAGTATATGAAATTAAAGTAAACACACTTAGTTATTATTTAT CTTCCTTTAATTACTACCTCACTCCCTCTGGCCCCTCTTCCAATCAGGGG TGCCACCCTCCATGTCTAAACATGGTTATCATACTTTTCCCTTTTCAAAA AACAAAAATAAGCAAAATAAACGATAAAAGCAAAAAAATGTACAAAATTA TAAATTAAATGTAACCATGTGACACATAGAAAGTAAAAATTATTTTTATT TTGATGAACTCAACGCAAGTTTCAGTCGGCTGATAAGGATTATTTCTGGA GATCCTTTTATTTCCACTTTGAAAGTTAAGTTGTGCCTAGGCAGAACGGT ATACAGAGCCAAATAACACTCTGTTTTTCAAATTCTATCATCCCTAACTC AAACTCTCTTTCATTTACNNNGAATTTCCTGAAGTCCAAACTTTGCTGTG GCTGTAAGGATTAGTTCCAGAATACGGTATATCAAGAATAATTTCTCAAG ATACATCTGATTTTGAATCTATACGAGAAAGCCCACAATAGAACAAATAC TATTATTGAAGTAGAAAGTCTTAACAACATTTTGGGCTCCGATTTCTGTG CTGAGAGACTAAAGGTTTTCATTATTGATTGTGTAGCTTATTGAATAGAA GCAGTCAAAAACCTTAGGCAACATTTTCCAATGACGTTGCATGTCATTTG 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TTCTTTTTTTTAAAATTACCGTCAGATCATATTATTTGAGTCTATCTATA CAAGTGAATCTTATAATGTAGGTTCGATACTTGGAAATAGGAAATACAGA TTCAGAATTAACCCAAAAATCTCAAGGGGTAAAGTAATTTGTTAAAACAA ACAATTTAGTCCAAAGACAACTTTGATGAATACCAAAAAAAAAAAAATCG TATGTCAACAGTCCTTGACGATCAAATGAGGTATGCCACTGTTGCCTACT TCAATGGTCTCATTACCATCATAAAAACGAGCTGAATGACAAGAACAATA GCCAAGTGGTGGGCAAAACTGGAAAGGGACAATGGATTTCCTAGCCTAAA TCTCCATGGCCTTGGAGAACTCGCCCTGAACCAGCATCGAACTTCCATCG AGAGGGAGGCCCATGTATACTCTAAAAGCTACTGTGGAGAAGAGATTGTC TGACATATTGGATAAACGCTTGAAAATGCCCTTAAGGCCTAAAATCGAGA CCATGTTGGAGGCCAAGGGCCCAAGTAAAATAAATATACTAAGTCTTATT AATTGTACTTTTTGATAATCTTTATAAAGTTGAGCTTAAGAAAATTCGTT CACGATTCGCAGAAATAGCCACACACTTAAGAAGAATATTTTAATCCAAT AAAAGTATTGTGTTCAAATTTATAGAATGAATTAAGAGACTTCATAATTT CAACCATAGTTTAGAAAATTTATTTAATACTTTTATTGGCCCAAATATGT ATGGCCTTTTTCAATTCAAATTCTTTGTCAAATCTATCCATTTCTCATTC TTTTATTGTTCGAATCAATTTTGTCTATTTTATCTGCAATTTATAACACA CCCAGAGGACTAATAATAATATTTTATTGATATAAATTGAGGATATGAAG TCAAAGAAAAAATATGTAATCCACACTCAATTTTGATAAAAATCCTTTTA 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