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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s364 | supercontig | LSalAtl2s364:283468..356183 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000006608 >EMLSAP00000006608 ID=EMLSAP00000006608|Name=EMLSAP00000006608|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1714bp
MNQSQGKFWEEENDFDEDELYSDDPVLAEVTSVLLDWRDIWRSLYILRDD EKFNEIQIIMEQLMEMRRTLISGTLTAEQTREMKLKISEKIDNGNDILDL DMTPREDNGERVDIDKHGVIYVFNTHIKCEQKATTNSSLPTNLAGLSPNF STNFASQSSQNYNFHVSLREFSYGSSIFGSVSDNNNGSLADNVQLRFSLY SGQLSSYISEFVVMRPPEYGAEESGAIFLDVGSLNKCRDLYLVXQVXRIG RMLLHEYKKPGSTSYKRPFAVGVFNISKVASAGVDGNVIEFETRLQACED KDFHHLHELILKKSGTRYNAVSSGQNSRVVVDVRLMAGXLXQLRRDHQXL FHTTPISRKLGFPNTIMPGDVRNDLYLTIDKGTFERGGKAAARNIEVTTM IFDKEGNLIENCIHSAATLNEVGETKVTSPILYHTNSPNCTEDGNSTSHS GLVFHVIVSIISYLEDPKFEHFRPVMDNYIAEHFASSLVYKGLLSCVRHC ADLVMSTDKQEPIQKCFKALEYISKFVVQSRILFARATGGENEDSFRVDX HLLFNSFNNMMSSTSPTVLPSQVIFLKHISSVYAHFLQILPVVDIARLVT LLFDTIPKYIPSDLLRAKLIAIRSAVNSPVFQDPESRSLLLSTSLIHVKQ HLLEKEELRLCSDILGDIVTFLHIRNNNPIITKDIEKTSNSILEPLMRTI LQMDRVVVSNIVASLVSCLAGVIQLMSSNHFIKLWEQIVSRKQIKEFLLQ SFLLFQELIKVEPFPHEWFTMRFLVSSIILKTIQEFANPLILYFQEDEYF DSQLWTNYFTLGVSFIKQSSLQLENHSESKKKKILKRYGDMRKSMSLQVL SLWEHLGGMKVHFIPGMVGPFLEMTLISEPEIRRSTLPLFYDLLECEYHI KTNFRQLNSSTTACLSMCADIITDSGVTSKENQFFFTIMLKSSSGLHVTP QSSSYWRQPMERLMLQLSPVTKRRSLKTSASASSSSNKFRRAQSEPDKYR LNSINFSRKIPEMIARNTEAINGVTVSAANDSHNSGSLSSVSSTYSSCSS HVSIHSVGCVAPGDGSSMKADILTLRVHDIFLVETELIDKLDILVSENKG DEDYKQLFNTILMESLAQKNPIWRENGQSFVLSVTRLLERLLDYRNVIQG DENRDKRMSCTVNLLNFYQSEVNRHEMYLRYIYKLHDLHIPADNYAEAGF TLKLHADQLAWSNRTLHSDLRNGKEXELLYLKILDYLDKGKQWEAAIPLT KELADFYERRIYDYQKLSGILKRQAQYFEKIISNSQEELRLDPEYYRVGF YGQGFPLFVRNKEFVYRGMECEKLGTFTQRLLTEYPNAAVLTTNSIPESS ILESDSQYIQICCVKPISNYNNLSSDSTYDIPERIRKFHLVNNVDTFQYD RPFHKGQKSVDNEFKTLWIERTTLHIQKPLPGVLRWFEVDRSKTTELSPI QHACETIEIKNREIRHLMSPGSQINKNLTQSLQGVIDAAVNGGISKYQDA FFSPDSVVEHEDFRSRLKAGMYEQVAVLESALTVHEGIVPQELMPLHLHL VERLSVMKKSLPEFNRQTFSDRRKSSSIINTPLPPVPSXNVAVXIPRHFC SDDIMTTSCPFVNDYVWDDGDDDVVDLVGKDPTSKKSRKNDTYAIYSNHR MSINSSSPAKRNTPGGGSTLLTPSSKGMTTGSINRLKKSVERDSGHVSSE SFDDAPPLPPRSTC back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s364:283468..356183+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000006608-702455 ID=EMLSAT00000006608-702455|Name=EMLSAT00000006608|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=72716bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s364:283468..356183+ (Lepeophtheirus salmonis) CTGTCTTTAACTTTGCCGAAACAATAGCAGGAAAATTTGGTTTACAACTT
CATCTGGGTGATACAGTACGAATTATGAATCAGTCGCAAGGTAAATTGTA
ATATATTTATGACATCTCACTTTTGTTGAATTAATTAATTATTAATTAGT
GGATTAATTATATATGTTGCACGTCAACCTCCCACATTCACTACTTTTAA
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AAATATGAGATGAGTTTTAAAATTGATAGGATGTTTTTAAAAATTGCACG
TTCAATTTTTTTTTAGTAGTTGTTTATCAGTTCTGTCCATTTCAACTTTT
TCTTAAAATATCGTTATAATATATTTAAATAATAAACGTATACATAAATT
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GTTGGTTTTAACTCAATTTGATTGTAAATTTACAAATCAAACTAATTTCC
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TTTTTTGCATTACTAGAATACATTAAAAATACTATTCCTAAAATTAGAGT
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ATAAAGCCTTTATATAATTAAAGGTTAATAAATACTGCAACAAATGCTAA
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AATATGTTATTATCATTCTTTTTTTTAGCTTGAGCTTCACATATCGGGTG
GAAGCTTGAAACTGACACACTTTGAAAGAAATTTAATTATACGTTTAACA
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AGGCCCTCTCCTTAATGTACGGTTAGAAAGAAAAGTCGAGGGGATGGCCA
TCCGGACTGTATGGTGGTCACATTCTCTTGTCCCGGAATGCAATGCTGTT
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CTGAAAGATGACGTTACCGTTCGGGAAAATTTTATTGGAAACAAGGTTGC
AGGTTGGCGTTGAAAAAGTCTTGTCTACAAGGCTGCTGTSATCCCGTAAT
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GGGATTTTTCAGAAACCCTCCTTCCTCTCTATGGTTTTGTTGGGGTCTAG
CTTTTTCTTAACATTGTAGATCGTCGTATGAGCCATTGCTGTCACCCTAG
TCACCTCTGTTGAAGTGTGACCACTGCTAAGAAGAGTTGAAGTCTTGAAT
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AGTTTTGTTAGTAAGTATTTTTTAGAGTTTGAACTTTTTGGTGCTATATT
TTTAGAAGTGAAGTGAGCCGTTTCTGTAAGATTTGATACTCATAAGCGGA
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AGTCTGAGACCATAAATTATTTTTCTCTATCGGACTAAGTTGGTCGAACA
AAAAAGGCCTCTCTGGACCAGTCTATAGAAAAAATCAGTCTAGATCAGTC
CAAAGGAAAAAATCGGTCTAGACACATTTTACAGATAAATTGTTTATAGC
ATGACATCATATGTATTTTCCAGTACAATGACGACATACGAAGTTTAAAC
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GGTTTCTCTCTGGGAATCCCGTTTTTCTGGGATTTATCAAGGGCTTTATA
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CAATAACTTTTTTCTTGACCAACTCAGTCATTTTTACTCTTGGACTGGCT
TAAAAGGCCTCTCTGGCATCTTTTAGATTTAGTTTATTGATTCGATCAAT
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TCCAGACCATCTGACCCCTCACTGAGAATATGTTCATAATGTTGGTGTTT
GTGGGACCCGTGTGGAGTAAAATGACAAACTTTTCTTTTGGGTTCCATTT
CCTACTTACAGAGTATTTAATTTCACCTAAAGAGTTTAATGGACTCCTTA
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CCTCTTAAATTCTCATTTTAATAACATTTCTAGACTTTTTGAACCCTCGA
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CCAAATATGATCAAGAATTTTTAAAATGCAATTGTAATCTAGAATCAATT
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CAATACATAAATTAAATTTTGTACACCATTAAAAATTATTTGTACTTTGA
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TGTGAAATGGAAATATTTCCAGTATGAACTAAAAGTGTTTTTATAAAGCT
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ACATTTTCTCTCCTGTAGGATGGTATCATGGATATGCTCTAAAAAATCCA
ACATATACTGGGATATTTCCGGCTACTTATGTTCAAATCAAAAATATTAG
TGGAAGTGATACTGAGGGGTATGTTGAATATAGTAAAATTTATCCATAGT
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TAGCCCMCCTTCCGAACCTTATTTGCCAAGCCCATGGCCCGAATCTTCTA
ACCCGATATTCATTTATAATATAAAATAAAATATTTCCTTTAAAACTAAT
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TGTTGAGACTCGGTCCAGCACCGATTTTTTTTCAATTCGGTCTTAGGTGA
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TTTTTTTTTTCTAAATCAACCGTCATTGATTTTTTCAAAAAAATCTCAAA
AGTACACGATATGTTCTACTGTATTTATATAAGAGACAACGGGATCAAAA
TCAATCCGAACTATCTCTGTTTAGACTTCGTATGACGTCATTGTACTTGA
AAAAACATATGATGTCATGTTATAAACAATGTATTTGTAAAATCGGTCTA
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CTAGACCGAATTTTTATATTAAGACTGGTCCAGACCGAGCTTTTTTGTTG
GACCAAACTAATTTGGTCAAAAAAAAAAAATATATATTACAATATCAGGC
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ATTTTTTTGTAGAAGGAGATTATTAGGTTAAGAAAAAAAAAAAAAGGGAA
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TTTATAGAATTTAACGGTTTTTATTTTTTGTTTTATATGAAGCAAAATAG
TTCCTAATTAATTTTAAATTCTTAATGTCCCGGGCAATAACGGGAAACCC
TTCTCTATCTCCTTTAAAAAGAAGTGTGCAAAACATGCATACTCTTAAAA
TTGTCCAGTCTTTATTTTTTTAATTTATATGGAGCAGAAAGGTTCATAAC
CAATTTTAATTTCTTAATGTTCGGAGCAACGCCAGGCAAACTTACTCTAG
TAGTACCTAATGTAGTATTTAATTGTTTTCAAAAGATATTATCATTACAC
TCATATTCTTGAAGAGAGAACAATATGTATAAAATAATCACGTGTGGGTG
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GTACCTCTCAGACTCGGAGTAGAATTGAGGATCCACGTTGGAGTCATTCC
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ATCTCACAGCTGTTCGCAGCTAATTTAATGAAACATCATGGCAGCTTAGC
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TCGATTTCTTCATTTTAAAATCCCGAGAAGGAGAAATGCATTTTCATCTA
TACTTTTAACTCTTCAGCGTTACTCTCCGTCAATTATGATCACACAAACT
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TAAAAGCCAAACTATCAGTTACCGACCATATATTCTTTTCCAAATAGAGG
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TTAGTACCAACCTTTTAAAAACAGCTGTCAAAATTTCATGACAATTTGTT
CTTTAGTTTGTGATTTATTGTGCTAAGCGTCAGGCTACTTTTTTTATTTC
CAAAACGATCGGCTAAAATTCATTTTATGTCTTAATTTTACACCACTTTT
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GGGGACTCTGTTCCATAAAAAAAAAATACAAAATAAAATGAATTAATAAT
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TAGCACTTCTTTAGTGGTATGAAACGATATCTTGAGTGCGGGGTGAAAGG
GTTATTAACTGTTTTAGGGGTGAAATGTATTTCTTTACATAAGATAAGAT
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TTTTCTAATCAGTGATAATGATTAAGATTACATTTCTTATTAGGGGGTCT
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AAAAATATATTTCAAATATCCAGAGCTGTTGTTCAGAAGAAACTGAAAGT
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AATTAAATTTCAAAAATCCAGAGTAAATTAAAAAAAAAATGAAATTTTTG
GGGGAAAAAATTCTTAAATTCCTTTTCAAATATAAAATTTTTTTGGAAAA
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TGTTCAGAAAAAAATGAAATATTTTAGAAAAAAAATATAAAATTAAATTT
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TTTAGGCATGAGACGAGTCGCTGCACAGCTTATTCCAAAAGAGCTGAATT
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TGATGGATATGTCAGGGGTATCTGCAGGATTATATATATTTATTATTAAT
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AAAATATCAAAACTAACATTTCAAATATTATATTAACATTCCCATTGTCC
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AAGAGGAAAACGATTTTGACGAGGATGAACTTTACTCTGATGATCCAGTC
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TGGAAATGATATTCTTGATCTTGATATGACTCCCAGAGAAGATAACGGAG
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AAGCAACAACAAACTCAAGCCTGCCAACAAATCTTGCTGGTTTGAGCCCA
AATTTTTCTACAAACTTTGCGAGTCAATCCTCTCAAAATTACAACTTTCA
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TTATACTCTGGTCAATTATCCTCTTATATTTCCGAGTTTGTTGTCATGCG
TCCTCCAGAATATGGAGCTGAAGAATCCGGAGCAATTTTTTTAGATGTTG
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ATAGGGCGCATGTTATTGCATGAATACAAAAAGCCTGGATCTACGTCGTA
TAAGAGGCCCTTTGCAGTTGGGGTGTTTAATATTTCAAAAGTTGCCTCTG
CTGGGTAATATTTGTTTATTTTTAATGTCTCATTATTATATATGGACATA
ATCACAGTGTTTTAAATACCGAAGATTCACCATAATTTAAAGTACCTAAG
CTTTTGAAACTAGTTTCATAATCATAATTTATATTTACTAATGGGAGTTC
AAAATTTAATAAATAAAAATTTGAGAGTAAATTTAGTGATTCCTCCTATG
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ATAGTTTTGGTATCTTAAATAAAACCTAGACTTTGGTATTTACCATCGTG
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CCTTTATTTAACCTCTAACTATAGTGTTGATGGAAACGTAATTGAGTTTG
AAACGCGTTTACAAGCATGTGAGGATAAGGATTTTCATCATTTGCATGAG
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AATTAAGGCGGGATCATCAACRCCTTTTTCATACTACTCCTATTTCGAGA
AAACTTGGATTCCCAAATACAATCATGCCTGGGGATGTGAGGTGCAGGAA
ACCTTTCTTCTAACCGTGTTAACTCATTTCTCATTGTTTAATTTTGTATT
CCCCCTAGGAATGACTTGTATTTAACGATAGATAAAGGTACTTTCGAGCG
AGGAGGGAAGGCTGCTGCGAGAAATATCGAAGTGACAACCATGATCTTTG
ATAAGGAAGGGAATCTAATTGAAAACTGTATTCATTCTGCAGCTACTCTC
AATGAGGTAGGAGAAACCAAAGTCACGTCCCCTATTCTATATCATACTAA
TTCTCCTAACTGGTATGATACTGTCAGACTTCAAGTTCCAATNNNNNNNN
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TTACAAATTCGATGATACTTCGAAATCAAATAATGTTAGCATATTTTTAC
CCTCTGCCTCAAGCTTAAAGGGAGTTTCAACTCAGGAGCAAGCTTTAATC
AAGCAAGGTTTTGTGAAAAGTACAAAAGAAAATGTATACATTACAACAAA
ACTTTGTTCCACCAAACTAACGCAAAATATTCATCTTATGTCTCTACTGA
AATGGAAAACTAATCCAGATATAACTGATACTTTGAACAAAGTCATGAAA
TTAGTAAGATCATTTATATTTATAGCTCATATATGTACCTATAACTAGAG
GTTCTGTTTCCTCGAGATATATCGGGGTTTTACATATAGAACAATTTCCC
GAGAAATGTCGTATTTAATTATTTTATAATATATGGTTGCATTATGTAAT
TGGTCCAATGACAAGTTGAATTCACATTGAAGATTCATTTGGCGATAAAG
TTTTTAACAATTTATACAACAGCATAAATGATGCTCTACGCAAAACACTT
ATAACAAATCAATACGAACAATAATTAATTATAATGTATGGAAAACAATA
ATTAATTTTGGACCTTTGACAAAAAATCAAAGCTGTAAAATAAAGTGACG
AAATGCGTCAATCAGATAGAAAATATTTCCTTCTCTAGGAGAAAATTCCC
TTTCCCGGAAGATGTCACTTTTAGGATACCAGAAATGACATTGATTTTTC
ATTTTTCGTTATATGAATTTGTGATTCCCTTCAATAATTTACCTAGCAAT
TACTCAATTAATAGATTGATTTCATGTTTAGTGATTCTGTTAGTTATAGA
GTAATTCATGACAGTCGTTTCAGCGTCTCCTATTGGTCAAAAAGTATAGT
CCTAGCCTAGTTTGGTGGCAAATTGACTATATGGTCATCGTTTCACCACT
TAGTTTATAGCTTTGGGATAAGACTCGCATAAAATTTATTTTTTCTTCTA
AAATATTCTTAAACTTCTAAGTGTTTATTATTTAATATATAAAGAGCGAA
TTATCTGCAATATTGATAAAGGACAATTTTTGAGGAAATGAGAAACTCTA
GTACTCTAGTATTGGTCTTGATATTAATAGATATTTTTATAAACTTCAGG
GCGGAGAAGAAATAGTTAAATTTCTACAAGATGTACTCGACGCGTTATTT
GCCATGTTTAGTACCGAAGATGGAAACTCTACGTCCCACTCGGGTCTTGT
TTTCCATGTTATAGTTTCTATTATAAGCTATTTGGAAGATCCAAAATTCG
AGCATTTTCGTCCGGTAATGGATAATTATATAGCCGAGCACTTTGCATCC
TCTTTGGTCTATAAGTAAATAAGACATTATTTGAGTAATTTAATAATATA
CACATAATTTTTATTTTATTTTATCAGGGGTCTTTTGAGCTGTGTTCGAC
ATTGTGCGGATTTAGTGATGTCAACTGATAAACAAGAGCCAATTCAAAAG
TGTTTTAAAGCACTAGAATATATTTCCAAATTTGTGGTTCAATCTCGAAT
ACTTTTTGCTCGTGCTACAGGTGGTGAAAATGAGGATTCTTTTCGAGTGG
ATGMGCATTTATTATTTAATTCTTTTAATAATATGATGTCCTCCACATCT
CCAACCGTTCTTCCATCACAAGTTATTTTTCTCAAACATATTAGCTCTGT
ATACGCTCACTTTCTACAAATTTTACCAGTGGTGGATATCGCTCGATTAG
TCACTTTGTTGTAAGTCATTTAATCTCTCTTAATTATATTTCAATGAAAA
ATATTAGATTGGGAAATAGAAAATTAAAATGACTTTTAACAAAAATGGAT
TAAAATTCAGGTGGAAAAATATCAACTGTATTGGAATTTGTATATAATAT
TTTAATACTTATGATTCTAATAAAGAACATAGTTGAACCCCAGAACTCGA
CTCTAATTCGTTCCAAAAGGAGGGTTGAGAAGCGTTACGATGGAGTTACT
TCTACTCCATGTAAAGACCGGTTACGAACAAAGTTGTTGTTTTTTTCTTG
TAAAACGTGATTACTATTTGTAGTAATTTAAAAATTTATGACCACAATTT
GTAAATTCATTCTTCAAGTATGTTAAATATAAAAATTCTCATACAAGTGT
GAATTACATAAACAAAGGAAGTTTAAATATGAGATTAAACTTGTTTTATG
GATATAAAATATCTATCATATTAGTTCATATAAAATTTAATTTGACCCAA
ATCAGTTTTATTATTTGAGAAGCGAATCAAATTGAAGTCTACATTTTGTG
ATAGGTTGATTTACTTGGTCCTTTTATCTCTGAGGGGACAGACTAGAAAT
ATAAACTGGCTTTGTAATAAACACTTTTAAAAAAAATTTAATACTCATTA
CTGTTGATAAACCTAAAAAATATATTCACTGGAAAAGTGCATGAAAAGTA
AGAAATGTATGGCTCAGTCAAACTATTTCATTGAATATAAATTAACTTGT
GGTAGTATCTGGCATAGTTCGGAGTAATAGGGAGTCCACGAACAGACGAA
CTTTGACTTAATTATGGAAGATAACGCCCCATGAAAGCCTCAGTCTCAAT
CACTGTTTTTTATTAGCATACTCACACGTAGTTAGTCAATACTTATATGT
TCTCATCTACAGCTAATCCGAGCAACATACGCTCCATAATACATTCAAAA
TCATAAATATGTGTATGATACATCATAGAGAAATATATACAGTGTACCTT
GCACAATGCTAGATACCTTTGCAAGATTTTATTAATATGACTACATTGTT
TTTTCTTAGATAAATATATGGATATTAATATGATATACATCAGGAAGCAC
GAATAAATAGTGCACCTTATGTGCACGCTCAATGCTTCATTCAAGAGATT
TCACTAATATGACTACATTGTTATTTCTTAGATCAAAAAAGCAGATCTTA
GATCTGCTTTTCATTATAGCATACATTGATGTATGCAGATAAACGTGGCT
TTATTAACATAAATAAATAGGCACTGGGCATGTGTAATTAGTTATTTTTT
CTTCCCTTTCTTAGTTAGCGACTCAAGTAGATCCTTAATGACTTTGTTAT
GTTCGACTGGACTGGATAATTATATATCTTTCACTTAGACTTGTGAATAA
GATCATAAACACATTTTTAAAAGAATTGGGGTTTACATAGACCCCAGGAC
AATAATCTTTTGGATATGGAATTAGAATTTAAAAAAGTGTTATTAATTTT
AAGCAAATTATAAAATTATGCATAATTGGTTATAATGATAGTTATTGATC
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TTCGGACGGGACTCCAGTCTTCCGTTCTCAATAAAGACTGACACAACCTT
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TATATGTATCTATATATATATTAATTCATTTTAAATATGGTGAAGAAATA
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GGAATAATATACATAGTATATTATTCTAAACTGTATACGGTATTTTTTTT
TCAATATCCCAAAAACAGTCATCCAAATACTTTGAATTATATATTACTCA
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AAAAAGTAACTTAAAAATTAGAAAAGTAAAAACGGCTTCTTCTTTATTAG
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