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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s36 | supercontig | LSalAtl2s36:1124995..1137618 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000006659 >EMLSAP00000006659 ID=EMLSAP00000006659|Name=EMLSAP00000006659|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=625bp
MVSEEKSSAEQPNFNRGDRVSASVRLRNNNKKEDQSKKKRNRHSGDFGFF SKAEPKSEMTTDSSDDEQDLKDWSYITFPNKDVDKPDVIESKVLKSSLET NGPKMTPIKVVTREVPGLLPLRPLSTVIXNVPGPASATNPGNKRLSGDFS GYGRSPKENNRRKSEVYSSASSGVVRVSHEEFEFKKHELALSAPLVEEED DGSEIEIEEKSKVLTPKLSNKLLQSKIAAGLGRRSITSVNLNSNKKNSYR SALCKSQENLVKATAFNVDESLDKDKSTLKKGLLWQQRDKLFSRWKERYF ILTTDYLHCFKRRTSRITEMGEFIFKIKCGEVEDVELLDKRGYLTICISL PRDGKVYLRKTDGIREWYSLLKECVRECKKRRKESGALFRKQITDSSSIE NWLQARKKIGLQYSYSDSTPEISKIPSSSSPKTSSQPPFSSSEKQERVEI TLQELNDLYKNEDEEERLRKRDSLTCLPSDPSVFSSPQEIKRRNSGIKSS SNGGSGDSKKINRLSLMSDIELPDCCNQDLGIDLEKGIFLRKKYLIPGDA ESNDSGNNSMNTNGSVGSTTSSSGSGSNRSEERLETHFENIDIRDRSSDV FKNRDLKGGRRRSTQHVPGLQITHV back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s36:1124995..1137618+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000006659-702506 ID=EMLSAT00000006659-702506|Name=EMLSAT00000006659|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=12624bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s36:1124995..1137618+ (Lepeophtheirus salmonis) TGATCATAAAAGCAACCCCCTCCCTTAGCAGCAGAAACAGCTCANNNCCC
CCATAATTTATTATTTTATATTATAAAAAATTTTCTTTTTCCATCCTGCC
GGCGACAACAACATTTCATTGAAAGGCGTGCGCGTTTCTTTTTTTAAATT
AAGTAAGTTTTGGATTGGAATAAATGTGTGTTAGTATGAATTTTACCTCA
ACGACTGAGGAGGTTGATGTTACACTGGGAGTCTGTCTTTCATATCTATT
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CAATCAAAAATCGCAGCTGGACTTGGAAGACGCTCCATTACTTCAGTTAA
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AAGAAAATCTAGTCAAGGTAAGAAATTGCTGTTAATAGACTTTTTAATTA
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TGTGTGTTTTCATAACTATTATAATTAGTAACAGAACAAAGGGAGAGAAA
TTGGATCTAAGATATTTAAGTTAGAAATTGAAGCATTTTTGCATCCAATA
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TTATTATTTTTTGTCGTCATTGAATTAATGAATGCATCATTGAACTTCGA
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GAGAGAATTGTTGTAAACAAGCTCTCTTTGGTCCCTCTAGTATTCCTCTA
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TTTTGTCTTCTTTAAAGTGATGTTTTTGAACGGTCTATATGAATGATTCC
TCTGGCATTAATTTTCCTTTCTTTCTACGTTCTTATCACTGAAAAATTAT
ATCTATATTGTTGTTTACCCATCTTTTTTAACCCCGTCAATGTGGCACCA
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AAAAACAAATATTTTATAAATTAACAAAATTAAAACGATACTAAATGCAA
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CTGAGGACAGGAAACACCAATTCAAACTAACTAACTTATAAAAAGTAACA
ACAAAAACAAGAATACGAAAACACATTGTGTTTAATCATATTTAAAAGAT
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AAGTGAGTTACTGTTTATGCCTGGATTTTTCATATTTTTAGAACATATAT
AAGTCCCATAATATTATTATAATCAAAAAGAACTTTTTTGTGACTTGCAA
CGGTTTTCATTATTCAGGGAACTCTCAAAATGTACATATTTTATTTTATT
TTAAAAAGTGTTAATTACTTTAATGTACATATATAAGCTATAGCCCTCTG
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TGGATTTAGTAGTTCCCTTCTTCTTCCACCTGGCTTTGTGTCGTCACACA
ATACAATATGTATTTAGACATTCATGGCCCAATACTACTTTGAAATTTCT
TTTTCATTATACTGCCTCGCCTTCCATCATTCATATCATACTTACATATT
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ATTAAATACAAAAACATATCGCTCTTGTTTTTATCCGTTCACATCCCTCT
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TTTTGAATGCGTATGAAATTTCTCTAAAGGTCTTTTAAAGGGTAGTAAGA
ATGATTGTAAATGAAATCATTAAAAGTATAAAGCATACTCTTTTTTTATA
CTCTACTGTCGTATTGTCACGATACGGATATTTTCGTACTGGGTCCAGTA
TTAAAATTTGTTGCGTTATTCCAATACTTTTTGTAGTAAAAATGTTAGCT
AAAATGTCGTTAAAGACAATTTACAGGAGGGTCAGCAGAATTTTTTTTTT
TTTTTTGGATTNTTAGTGGACAGGGGRTTTGGTTAGGTCAGAAATCTGAT
GACTTTAATTCAATAAATGGCAATCTTTTTTCTTGTTTTTTTACTAAGAA
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GTACGACGCACACGCGTCAAAGCGCTCTTGTCTTGTAATTGAATAACCTG
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ATTGAGCCTGTAACCGAGTTCCAAAACAGTTTTTTATTAATTAGTATTTT
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AAAAATCAAACATATAAAATTACATATTCATATTCATATATATTATTTTT
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GTAGCCAAAAGATATAATCACATTATTTTATAACCCCTTTCTTTATAAAA
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CTAACCAAAGCTAATAACCAAGTGGCGAAAAGTGTCTGTTAGGTTTAATG
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TATGATATTTTAAACGATGTCACTTATCCATTTTGCCTCATAAGTCATAA
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AATTGGCGAATTCATGGAGGTTACATAATTAGTTATAGAGTAATATTCAA
GTATACTCCACGCCCCTAGCGAGCAAAAAAGTTGTCGCATAGCCATCAAT
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GCTTTAACAGAGCCCACATATAAAAAGGGGAAGTAGAATTAACCATTCAA
GTCAGTAGTGTCATAATAAGCTATTTTTAATAATACTTGGATCTAAAAAC
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CCCCCCCATGCCMCGACATCCAAAGATCCATATTCTTTTCTTCTTTAAGA
GTAGTAATTATAATATTGTTGGTATTCAGCTTCTACTATTATTATTTTTT
TAAATGTTATTCTTGTCATGTTTAGTAAGGTGTGTCCTCAATCTTAAATT
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TTTTTTTTTCTTTTCTTTTGAGTAATTATATAAAGCCTTTCATTAGTAGC
ATATTTTTACATTCTTTTTAATAAAGGTTTAATGTGAATGGATCTCATTA
AAATTTGAAACTCATATCCGTTGTTACTGCTACATATTAAAATAATGTAA
GTGGACTAAATGAAAAACCTCCTTAACGTTGTCATGTTGTTGTTTTTTTT
GTATCGACAAGTTTTAACGCCAAGGAAATCTATCAGCAACTATATTTTCT
AACCTCTTTATAAAATACTCATTCTTGTATCTTTATAACATGAATAATCT
AAACTGACTGAAGAGGAGGATGCATTGTGGCTAATGAATAGGGGTAAACA
ATCTTGGTGTTGTTATAATTAAGTTATTCCTACTTTTTTAATAAAAAAAC
TGCACCATATGGTGTTCCTTCCCTCCTTTTTGATCTTTTTTATAATTACT
GTTTAGTAAAGTGTTTTTTCTTTCTTTTTTAAACAGTCATGAGTGATATT
GAGTTACCAGATTGCTGCAACCAGGACTTAGGGATAGATTTAGAGAAAGG
AATATTCCTTCGTAAAAAATATCTTATTCCTGGAGATGCTGAAAGCAACG
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CTTTACTTGTCAATTACAGTTGTTTCATTCTACTCTCACCTTACATAGTT
GGATCCACAACATCCTCATCAGGCTCTGGAAGCAATCGAAGTGAAGAGCG
CCTTGAAACGCATTTTGAAAATATTGATATTAGAGGTGGGTCNCTTCAAC
ATCAATATTTTGTATTCACCAATTATAATTCTTTTATTTTCTCTGCATAG
ATCGTTCTTCGGATGTCTTTAAAAATCGAGATCTTAAAGGTGGAAGACGA
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CTTTCAATCTTTCTTACATTTACCTTATTTGATGATAAATTTAATTTAAA
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TCCCTTTTTTTTTTTTCTTTTGGTAAAACCTGAATACGATTTTAATTTAG
TTTTGTGTGTTATTTACCTTCACCATTTAATTCAATTCTAATGGTTACTT
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