EMLSAT00000006673, EMLSAT00000006673-702520 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000006673
Unique NameEMLSAT00000006673-702520
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s36supercontigLSalAtl2s36:1762436..1789047 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000006673 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000006673EMLSAG00000006673-689439Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000029222EMLSAE00000029222-738150Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000029223EMLSAE00000029223-738151Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000029224EMLSAE00000029224-738152Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000029225EMLSAE00000029225-738153Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000029226EMLSAE00000029226-738154Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000029227EMLSAE00000029227-738155Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000029228EMLSAE00000029228-738156Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000029229EMLSAE00000029229-738157Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000029230EMLSAE00000029230-738158Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000029231EMLSAE00000029231-738159Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto780870auto780870Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000006673EMLSAP00000006673Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000006673

>EMLSAP00000006673 ID=EMLSAP00000006673|Name=EMLSAP00000006673|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=714bp
NFRHSFFAKYVIYEVQTGKEFPIIETPEDEELETKKSGAFSKQEVPFLQY
VEWSTVGNAYIFVYGNNLYYKKSAKDPHVYPITTNGRIGIIFNGIPDWIY
EEEVFGSNKAVWFSSDGSRLCYVQFNDTNVEEISLPSYDPMDLKSTFIRY
PKAGATNPTVRFPGRSTFLIDFASKDTISTITIQKINMHIDLSPLFRDHY
VVWMTWVDNHIISSSWINRHQNVSIIAHCEEMSNWRCKEVYRESTETGWS
NMISSLHYSNRPPDTEFLLKALVMDGHVGFFRQIMRVSYGNSSIKEPLTI
GRYDVTSIYGWDSINNYIYFGSSPREEPTHSHVYRIYYDASGPLSLETPL
CLTCCGIEEKIEPEHEVDLWLRGYIHDSKNNILPSRSVKTGCLKNSAIFS
TDFSYWVWECSGPETPPQVFLVYSQNNTIIHTLTDNYALRKRIANMSLPI
VRTFSVKIPETIYNASVRLYLPPEVKHESLMTYPLIVQVYAGPETQATQA
DWRHGWASYLAARMGWIIALIDGRGSKGSGEKREREIWKRLGSVEVEDQI
TITKYLSKKIPVVDLRRIAIWGWSYGGYAALRALANPNQDIFQCAISIAP
VTSWRFYDSVYTERYMGMPDINGNYLGYDQSDVTHQAVHFRSTDKTMRKL
FLIHGTRDDNVHLQHSMIYPDATHNFQNVRHHFYLSMERFFSSCFDEVTK
NDSKESLSLVNLFS
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mRNA from alignment at LSalAtl2s36:1762436..1789047+

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000006673-702520 ID=EMLSAT00000006673-702520|Name=EMLSAT00000006673|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=26612bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s36:1762436..1789047+ (Lepeophtheirus salmonis)
AATTTTCGACATTCATTCTTCGCCAAATATGTAATTTACGAAGTTCAAAC CGGGTAAGTATTCTTATATAAATAACAGACTAACTAAAAATCTAACACCT TCATGTATTCATACTTTTATGCAACAACTCTTATTCGATAAAAAAGTGGC TTTAATCCATTAATATTAATACATTAGAAATATATGTGTAATAAAAAAGT AGTGTTTGCCAAAGAAGTTGTTAGTAAAAAGGAGAAAAACAATGGTAAAA GAGCATTATCATATTGAATTCTGATATGAATTTACTACAATATATTTATC TTTTATATAGCATCGTTGTTATAAATACAATATTTGTAGAGAAAAATTAC AATATTATTCTCTGTGTTCTCTACAAAAGTGGCATCTCTAGTCATTGTTA TTCTATGAATTGATGGAGGGTTTGCGAATAAGTTAACACAATTTATAATT ATGTTTGATTATTATTTCAACTGTCTTTTCTTGCTTAGAGTATTTTCAAT GAATATCAGAGGTGGAAACATGGACTCTAGAATTGCGACTTGACTTGAAC ATGAATCCATATTAATGTCACATTTAAAGACTTGCAACCTGACTTGGATT TAATAGCTATTTTATACTTAATTTAAGAAAAGCCTTGACACTATGAACCC TATCAATAATTATAGAATTGAAATAAGTTCGAAATAAATCTGAGGACTTA AACTGGGCTTAATTAAAATATTCAAGGACTTGTTATTCCAAATTGCAGTG TAAGGATTTTTTCTCATCTCTGGACAGTATACGACCTAATAAAAAATCAA GATTTTCAAATACGACTATTATGACAAAACTGAATATAAAATAATTATCA TATTTATGATCTCCCTATACTAAAGGGAGATATTGTACAACAAGTGATAT GCTTATCACTCGGGTTACGATTAATGTTGACATAGAGTTGAGTTTAACCA TAGAAAGAAAAATAATAGATGGTACAAAAGGACTCAAGGAAAAGAACGGA TACACAAAAAATCAACAACAACAGCATAAATTAAAGGGAAATGAAAAAAC TCCTTATTTACCTGTTTTGGAGATACCACGAGAACACTGAAACGAGTAGT GATGAAAATCTTGTATATATTCAATTTTTTGCGAAGAGCTATGGACTCTT GAATTTTTTTTCCAAAAAATTTTAATCTATGGATTTTTGTAAATAGCCCC CCCCCCCCCTTCCGAGAATAWAATTCTACAGACAAAGGGYCATGTTAAAA AAAGAAACCGAAAATCAACATGGTAACTTTACCAATTTGAAGAATGTGTT GTAGGAGATCAGCTTCAATAAGCTGTCACCAGGGAGTATGTGGAGAACAA AAAAAACAAAAAAATTGGCAAGAATTACTCCCATATCGATCCTCAAATCT TCTTTAAGTCCAACAAAAATTACAATTATAGCTCCGTAAAAAATCTGCAG GGATAAGGCATCGTTTTTTATGAGAACACACTAATGTTCAATCAGGTTTT GAATATATTTGAGAAAGGATGTTCAATACTCAGGAGTTATATAATAATGA CAACTGCTAACTGCAATTTCAAAAAACCGGGGCAGCAAAAAAATTGAAAG GAATTACAGCACTAGAAATGAGTATATAACGATATCTTTTTTTGGCGTGC ACTTATTTTAACTAAAGAGCAAAATACTTTTCTCATATTGATAAGGTAAA TGCAATAAATTATACTTCAGTACCTCATATCTCACCATTTATTAAATAAC CTGGAGATCTATTTTTACAATATACCACACTACATAAAAATGACCATTAT GAAAAATATATAGCATTTATTAGCTAATTAATTATAAGAAACAAATCAGC ACTTTAAAAAAGACCACAAAATTGTATTTGTGCCAGTGCTTATTCATTTC AACAAAACTCAAAATTATTTCAATTACATTTTAAGAGCCTCTATAATACA GTTTTTCTACAGGGATTTTCCATAAGTTTTTTAACATATCCGAGAAATTC TCTAAGAATAAAATATTTATCGTACAGTTTAATAATTTATATCAATTTTG CTCTTATGTGATGATGTTTGTGGAATAAGAAATGTATTTATGACAAAAAA TTACTCTTATGCGGAGTTCCTATTAACCATTTAGTCAATTATTGCAATTT TGACTAGGCTTTCCATTCTACTTAGGTAGAATATGTTCATGCAAAGACAT ACCAGTAATCACATCAAATTATAATATACTCCAAATTAATTGACATTTAA TTTCAATAGTAATAATGCTATATTTAAAAATATTTCTTTAGTATTTTAAC ATAAATAAAACGAATTAATCATAAAACAATAAAAAATATAATTTTTTTTT TCAATTTCTAAAACAAATTTTTTAAATTCTAGTCATTTTTTCGCAATTTT ATAGTATCCGTACTATAAATAATTTTTTGTATTCAATCTCTATGAAATAT GTGTTATCAATTTTGGTGCCTACGTAAGTATTTCACTTTCATAGTTTTAA AAAAGACCCACCATTACTTGATTTAGATATTATTGTTTATATAAGTTAAT ATTAGTGCAGAGAGTGAAAAAAGTCCTTATACTGCACGTCTAAGTAAAGT TTCAAGTCTTTGTGTAGAATTACGAGTTTTTGAATATTTCATCGATTCCC ACGTGAGTCCTCTGATTTATTTTCAGTTAATTTCATCCCCAGTATTGTAA TATATAATCCTTTTTTTTTTAGTGAAATAGTGTGTTCCAATCGTTTTGAG TTTTTATATACTATTTAACGTACTAGAAAGAGTGTAATCATTTTTTTAAG ATTTATAGAAGTTATAGCTCACATCATTTAAGTATAAATATCATTTGATA 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ATGGAGAAGAACCTTCTACATTTAAAGTATTATTAAGGCAGAGAAAATAT TATTAGTATGTTTGAATACAATCTAATATATATTTATTTTATCATGTTTA TTGTTTTTTTTTAACTTACACCAAAGGACAGCAAGAACTTTTATTTTCGA GAAAAATATGTTGACACATGTAGCTGATAATTTTTACACGTGTTATATTC GCAACTTTGTATATTTTATTTTATAGGTTCGAACTTTACTTTTAGTATTT ACTGTTGTATCTCAGCTATAGATTAGAAGAAGAAAAAAAACATTAAGGAA ATAATGAAGTAATAATGTTTATAAAAACGAATATGTAAGGAGTAACCGAT AAAAGATCATAAGTCTATTTCAAAAGTAACCATTGAGCTATGGCATCTTA GTGAAAGTTGTGATCTTAGTTGAGGCTAGAAGTAATGTAAGAAACTCACT TTATATAAGGGAAGGGATGTTTAAAAGGAAAAGAATAAAAATAAAGTTCG AACCTTTAATATAAGTATAAAAAGGCTTTGAATATATCATGTAGCAAATT CTACAAGAAACAAAATAAAACAAAACTGAATACTATCGTGTAAAATTATC AAAAACTTACTTAAAAATATTGATTTTCTCTACTTTTTTCCCCATCTCAG TTTATATCTAACAACGCAGCCTAAAATAATGTCATCTTCCGTATTTCAAA TGTGAAATTTAGCCGTGAAAAAGTTTGATCGTAGTCAAGGAAATATTATC AAGCCAACATGAGTGCTTCGCTATTTTTTTGTAAAGATTTGGTTGCAAGG GGAATTTATCTGACTCGTCAACAATATGTATACGCTATTTTATATATAAT TGAAAATATTCAGGGTGGAACAGTAAAACGTGGACTCGAGGGTTGGTTTA GAAATACATCAATAATTTTATATATAGTAGGCAAAAAAAAAATGTTAAAA 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AAATGAAAAGGTAATATTTACATCAGTACGTGTTATAGTATACATAATTT TCTTCTTGTTTATAATATTTATACGTATTTCGTAGCCTAATAAATCATGA CTCAAATTAAGGCTATAAATTTAGGCTTATTACCAAAGCGGCAGATTAGA TACTTACTAATTTTTTTTTTAGTCGATGATACTTATATATTGCGTCAACA TAAAAACCTTCTTGAAGAAAAATCAAGCAAAAGAGTAAATTCCAATTTAA TGTGTATTTGATATATGCATGCAGCTACTATTAATAAACATATTTAAGTC AATTATAGGCCTTGTATTAAAATTTGTAGAAAGGAGATTCAGTTTATTTT ATTTTATTTATTGTGATGGTATTACAAAAAGTAATTTCCATTTTAATTAC ATAAAAATACCAACAAGTTATTTCTGGTTCAAGGTTGGACAATTGTACAT AGGAAAATAATCATTGTGAGCAGTTTGGGAGGCTATCCAAGTCCCACTTC TTTAAATATCAGTTGAATAAATAGAACTGAAGACTGTTACGCAGCGTCAT ACACATGCAAATATCTTTTTCATATTTACCTGGAAACTGCGTAACAGTTC AATTAACTCAAGCAATTTTTAAATCTGTGATACTCGTATACTATTTTAGG GAACCTATTATCCTTGATCTAGGGATGCAAAAAAATGATATTTGTTTGGC TAAAATGAACTAGGGGTCGGGTTATTATTTTTAATTACTTTTAATGTTGT GGAACACTTTAATGTATAAATATTTTTCTCAATTCAGAGGAGGTCTTTGG TAGTAATAAAGCAGTATGGTTTTCATCTGACGGATCTCGCCTTTGTTATG TCCAATTCAACGATACAAATGTGGAAGAGATCAGTCTTCCATCTTATGAT CCAATGGATTTAAAAAGTACATTTATCCGCTATCCCAAAGCAGGTGCAAC 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