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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s378 | supercontig | LSalAtl2s378:501896..508830 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000006746 >EMLSAP00000006746 ID=EMLSAP00000006746|Name=EMLSAP00000006746|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=462bp
MGNEFPIAEDVKPSLKDPIFNHLKVRQTLSSWIKDIQKIGFLYTNEIEVE
EEDSDSEFDDDPDLIGDPYSEIEDDDIKEIEDGKERLKGQCSVILKNGDI
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WDTIQHPCFGRIPKLVALTDISEGEEFTCHYRIDMEQANLIPSLEWYVNA
WDEFTPPINDHD back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s378:501896..508830+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000006746-702593 ID=EMLSAT00000006746-702593|Name=EMLSAT00000006746|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=6935bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s378:501896..508830+ (Lepeophtheirus salmonis)
GAGGAAACTAATTAGAAGTATGTAGAAGAACCGTAGGGAAAACAGTAACC
ACAACATGTGAACGGTGAACCGGCTCTATTGACTCTGCATGAGCGTATTC
CCTCTTAGAAAGCAACATTTTTTTGTTATTTGTATTGTTCATTCATATGT
AGCTGTAGACTTCTTCTTGAGTTGTGTATAAGTCTACTCATCTCATATTT
AGGAAATATAAATTTTTAAAAAACAAGTCGTCGTCTGAGTTCGAACGTGT
GTTCTCATGGGTAATGAATTTCCAATAGCAGAGGATGTTAAGCCATCCCT
CAAAGACCCTATTTTCAATCATCTCAAAGTGAGGCAAACTCTTTCCTCTT
GGATTAAAGATATTCAAAAAATCGGATTCCTTTATACGAATGAGATTGAA
GTGGAGGAGGAAGACAGTGACTCTGAATTTGATGATGACCCAGATCTCAT
TGGAGATCCTTACAGTGAAATTGAAGATGATGACATTAAGGAAATTGAAG
ATGGAAAGGAGAGATTAAAGGTTTAAAACACCAATATACATATGTACATA
CTGAGTTGTGACACATTCCCTTATCTTTTTCAGGGTCAATGCTCAGTTAT
TCTCAAAAATGGAGATATTGTCTCTGGTCGCTTTCAAGGAACAAAACTCC
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AGGCTATGGGAAAGCACAGCTCTTGGATGACACTTGTTTGGAGGGTTATT
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TATGTTTATTTACTCATGCTTTGTTGACTCTAGATTTTTTAAACAGATTT
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TTGTATTTTTTCAAAATGTTATTAAAATCAAATGTTGAACAAATTGACAA
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TCATCTATGTAATTTCATTCTTTTTATAGAAGTTTTGATTATTAAAATAC
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TTGAGTGAATAAAACTTTCAATTATTATGTCAAAGTCCAGAATTATTAGG
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GATATTTGCTCNNNATTATTAAAATACATAAATTAATATTAGCTCATTTA
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ATTATGTCAAAGTCCAGAATTATTAGGATTCTATATTTTTTGGCATATAA
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TTGGGGGGGGGGGCTACATACCCTACATCCCTCMCATTGAGGACACCCCT
GCMTATATTGTTTCAAATCTTGCTACGCCTCTTTCATTATTAGGTTATAT
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AGCTCTCTTTGTCTCTTTTTTTTTTCTCCATAGTTACGAATTATTACGTC
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TATTTCATGCAAACTTATTGCTTCTTTTTTTTTCCATCCTAAGATCTCTT
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CATCGACAATCTGTGGCCTGAGCATCAACGCCTCAACCAGAGAATTGAAT
GAGATTTACTTCAACCCTGTGAAACCTGATGCGCCTATTTATAGCTATTG
GCCCTCTGATTTATATTCTATTCCTTGTCCACGTTTGTTAAGGGATCCTT
ATGAGACCTCAATCGCTTTTCTAGCAAAGTCGAAGATCAGTGAATTTGCG
GGAGATGGNCTATTCCTTGTTCCACGTTTTTAAGGGATCCTTATGAGACC
TCAATCGCTTTTCTAGCAAAGTCGAAGATCAGTGAATTTGCGGGAGATGG
CTTGTTTGCATTTCGGGACGTAACAGCTGGKGAAACCGTTGCTTTTTATA
ACGGATTGAGAATCAGGATTGGAGAAAAACCAAAAGTGGAATCTGACAGC
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TCAAATGTTCCAAATGACTTCCAAATAAAATACGCAATTATTATTTTTTT
TTTTTGAATAAAAAGCAAGGTTTCTTTTTTCCCAAAAAAATATTTTTGAC
TTTTATATAAGTAAATCGAATGATGGGCCTTTTTTTCAGGAAAAAAATGT
TTAATTTAATTTTTTGAATTACCTTGAATTGGTCTTTTAAATTACTTGTG
CCCATATTTCATTTAATGGTGTTTTAACTAAATTAAAGCTAGGGGCTCGT
AATTCACAACTCCAACAAGAAATACAATTTAATTGCGACATTATACTCGA
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CCGCAAGACGGTGAAACYCCCTGCCACTTTATTTACTGATTAATATAAAT
AAACAACGCTCATGCCCCATTAGCTTTGACCTCCTAATTGTACACATGCA
AATGAGCCATATTTTTCTAAAAAAAGAAAGGTGTTAAATGTGTTGTATTT
TTTTATGTGTAAAGTCATAAATAATATGTTTAGGCGAAGAGAGTGTCAAA
CTTTAAATATTTCCTCATTTATTTAAATCAATTATATTGGACTGTTTATT
TATGTTTTTGCTAATTGGCTATTCTAAATTTGTAACTGTAAGTATTAGTG
TTGGGTTTTCGTTAGTTTCGGGTTCGGTCTGAAAATTTTAGAACGGTATG
AGACCACTCTGATTTTTAATTGAACGAACTAATTTGGTCCTTTGAAGAAG
TTAAGTAAGGACCGGTCGAAAAAAACCCGGCTTAGATCCGTTCCAATTTA
AAAATCGGTCTAATTTTTAGTTCGGTCAAGACTGAAACAATAAATGAAAT
TGATGACATCACGTATGCTTCAAAATGGTGAACATCGGCATAATCACTTT
ATGTAAAGTTAAATATGTTCTATTGGTCATATTTGTAGAACTCATAGATC
CGGATATGGGAGAAAATCGGTCAATAGATTGAGACCGGAAATAATTGCTC
TAGATATTGATACCAAACACAATTTGTCTACAATTTGTAAACGGTTAAAT
TTTGGTCTGCTGTCTGGGACCAAAATATCGTTACAAAAAAAATTACTTAA
GACCAAAGCGAGAAAACCTTGGTTTACGACTGCGTCTCAATAATAGTGGA
TATCTTGAAAAAGAGTGAGTTCTTTCTAACCACAGTCCACTATCTAAAAT
CTCAACTAAATTCCCATTTCTCACATGTATAATTACTTTCCAAAATTAAG
TTATATTGTAATGTTAATAGATGTAATGCAATTAAAATAGGGGAGTTTTT
TTTAGAATTTAATTCTTGTTCCCTTTTTATGTCATTTCAGATACCAAAAT
CTGATTATATGGAYATTCCACCGGGTTACGAATGCTCTAAGAAATACCAA
GCCTCCTTTGGACATAAAATAAATCACTCTTTTAATCCAAATTGTGGTTG
GGATACAATCCAACACCCCTGTTTTGGAAGGATACCTAAATTAGTAGCAT
TAACAGATATTTCTGAAGGAGAAGAGTTTACATGCCATTACCGAATCGAT
ATGGAACAAGCTAACCTCATACCAAGTTTGGAATGGTATGTGAATGCTTG
GGATGAGTTTACTCCTCCCATTAATGACCATGACTAATGCAAAGATTTGG
GTCAAATGTGAATCATATGTGATAAAATGATAGAGAACAATTAATTAATT
ATAGATATATATGTATATACGCTTTTGATATTTTATACCGAAATTAATAT
TTATAAATGTGTGATCATTCTAATGAAACTCAAGATTTAAATACTTTTTT
TCAATTATACTCATAGTTGATTAATCTAATGAATATAAAATAACGAGCAG
TTAATCAGTATGTATGCTTTAAAAAAATGAGGTAACAACATCAATTGGGA
GCCACTTCACCGGGTCGATGTTGCATCAACTTATAAAGGGGAACATTGGT
AAAGCCGCTAATATTCCACCAACTCCAAAATTCGACTTCTYTAAACCATT
CCTTGAACGACAACCATCCAAATGTCTCTATAACGAGTTTCCTTTGACGA
AAGTCATTAGTTTGATGCACACAGGGAAGATGTCCAGGGAGAGAACAAAC
ATTACAAAACACCTTAATAACCAATAGTTTATTTTAATAAAATGGGTAAA
AATAATAATTATTGTTTAGTTTTACCTCAGTATCGTTTACCCAACATTGA
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ATGAGATCTTAACAACTGTATTTGATCCTCACCTTTCAACTCTGTCGTTC
TCATTGTGATGAACCAAGTTTTCTTCCAACAATTGCTGAGCTAGCTTCTC
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AACAGCTGGAGAACTGATACGATAGTCATCGGGAATATCCATCTCATCTC
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GCAAATACCAAACCTTATATTATGAACTTTGATCTCATGGATCAAACTTT
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ATATGTACAGCAAATTCATGATTTATTCAAAAACCAATTAATTCCGCTTG
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TATTTTTCTAGAAATCTTTTTCCTATGAGATAAAAGGCATTTCTCATTTG
TTAATTTTCTATAGAAACAAAGTACTTTGTTGGAGTACATTCTGGTATTA
AATTCACATACTAGTTACCTCTTACATTATTATTT back to top
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