EMLSAT00000006758, EMLSAT00000006758-702605 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000006758
Unique NameEMLSAT00000006758-702605
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s378supercontigLSalAtl2s378:771291..801671 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000006758 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000006758EMLSAG00000006758-689524Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000029674EMLSAE00000029674-738602Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000029675EMLSAE00000029675-738603Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000029676EMLSAE00000029676-738604Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000029677EMLSAE00000029677-738605Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000029678EMLSAE00000029678-738606Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000029679EMLSAE00000029679-738607Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000029680EMLSAE00000029680-738608Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000029681EMLSAE00000029681-738609Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000029682EMLSAE00000029682-738610Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto779645auto779645Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000006758EMLSAP00000006758Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000006758

>EMLSAP00000006758 ID=EMLSAP00000006758|Name=EMLSAP00000006758|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=400bp
MTPRAKISTNSQAIKDRIERHKHQNNSEGKSYSGILMLIVTLAIFCILFL
CYLRRLFSKKRNTQKTETTTKSARNVKNGAPRAGDLKTTKQEDTELLVEN
EENPDEKSPKKKELGKINYKVEYDFNTSTLIVTMIQCKDLIAMDVGGSSD
PYVKIYLLPDRKRKQETRVHRKTLNPTFNEVFKFEISYGEVMGKTLVFAV
YDFDRFSKHDQIGEXRLPICQMDLAQVQEKWKSLQSIVGDGVLGDICFSL
RYVPNSGKLTIVILEAKNLKKMDVGGLSDPYVKIALMQNDKRIRKKKTSI
KKCTLNPYYNESFSFEVPFEHIQKVQLWVTVVDYDRVGASEPIGKVVLGC
EAKGAELRHWSDMMATPRRPVAQWHTLKAIEGRGFLSLVHQQIKDKEQSQ
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mRNA from alignment at LSalAtl2s378:771291..801671+

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000006758-702605 ID=EMLSAT00000006758-702605|Name=EMLSAT00000006758|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=30381bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s378:771291..801671+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGACTCCTAGAGCTAAAATATCTACAAGTACTAAATAAATTATATTGTA TGAATGAAATAATGTAGTGGTTACTTCCTCTTGTAAAGGMATTTCACCTT TAAAATGTCTCCCTTTTCATTATTTTGAATACATTTAGCAATTATAGTTA TTTTCACTTCATCTATARTATATATGTATTTCAGATTCACAAGCCATTAA GGACCGAATTGAACGTCACAAGCATCAAAACAATAGCGAAGGAAAGAGTT ATAGTGGGATACTTATGCTAATAGGTAATAATCTTTTTATTATTTATAAC TTTTATTTTGATAATGAAGTACCCATGTAATTCTAACAACAATGTACATA TATAAGAACCACTGATTAAAGTATTCACTCAATCAATCAACTCTYCCTAT ATATCTACGTCCTGTGTATAGGGACATACTGCAAATGGAAATGACTCTTG ACTTAATATACCATTAAAGTATGTATTATGTACTTTTGAATGAAAAAAAA CCCAAAAACATTTGAAATAAAAAATTATATGTTCTTCCTTCCCTCTACAT TCATTTGTGAAAGATTACAAGACTTTATGGTTATTATTTTTTGTTTTTTG CAGTGACACTTGCAATTTTTTGCATTCTATTCCTCTGTTATCTTCGTCGT CTCTTCTCCAAGAAACGAAATACTCAAAAAACTGAAACAACGACAAAATC CGCTCGGAACGTAAAAAATGGAGCACCAAGAGCCGGAGATCTCAAGGTAG TATTGAACTAGTATTTTTGATTAGCAGTACCGATTCGAACATATTTAAAA TATGTGTAAATACAATATTCTCCATAGGTATATAAAAACTCGCCACATCT TTAAAAAGAACTTTTATTTTTTTAAATTATCATCATTGATAACATGATAT CCACATGTATATTATGTATGTATTCATATATGTTGTGTACAAGTTTGGAT TTAATAGTGTCATATTATATTACATATAACTAACACAAGCCATTTTTTTA CTATTAATCGAATTCATCATTTCATTTTGAATAACTGGTTCATGACATCT TATTTATAATACATACAACTAAATCAGTATTTATAAGCAATAAAGCCTTT CGATAACTTTATTACCTTATACATATTATGTAATATTGACATTGTATATA CAGGATTGTACATTAGTACGATGTCAAAAACGGGTAAATTGTTACGTCAG ATAGGTTAATACAGTGTACAGGGGGGTCCCAATTCGTGCGATATAAGTTT GGATTGACGTGTGACACCGTTGTATTATTGTAAAATACAGCACAACTTTT AAAAGTGAGGGCAGGTAAAACAATTAATGTAAATCCCTGGCATGTAAAAG AATACATCAAAAGTAAGTAACTTTCTTAATAAACATATCAAGGATAACAA TGTACATCATGTGTAACAATCAATTAACGCATCACTTACTTCCACTCAGG TATCGTCAATTCATCACTAAAAGCCTCTTTAAAGTATAGAAATTGTACAT GAATGATACTTACATACACTCATATTTAGATATAGGTACTTTAGGTACAT AAATAAGATTAATGAGTCACAAAGATAGAGTTTAATGTTTTGCTCTTCCT CACATGTAAGGATACTTTGAGAACAATAGTATGGTGGTGTATCAACATAC CCCGTATATATCTGAGAAAAACAAATCAGCTCTGTATATATCTCATACCT TCCTTTCTTTCAATTAATATACAATACATGTATGTGTATAAAAGGATTGA ACTATCCTTTTGTCAATCAACAAGTTTGATTGACATAATATGTACATCTG TAATAATAATTATTATTTAAAGGCGGATAGATGACAATATTTTGAGAAAA ATCTTTTATTTTGTAATAGTATTTATAATGACTACCAGATTGACGTCGTC TTGATGACTTATGTTATATTGATAGAATAATGGATACACCTTCGTAAATA TAGGTAGACGAATAAGAGAGAATTAAAGTACATAAGCTTATTGTTCTGTG AGTCTTCTTTATTCAGTCCAGTCCAATCTTAGGACCGGTTCTATCAGTCC TTATGACTGGTCCTTCAGACTGTCAGTACTAGAACGGATTTAAAATAAAA TAAAGTTGAGTGACGCCATCAAAGACCGAACTTTATAAGTTTTTAGGACT GATATGCAGGACTAAACTGGACAGGGTTGCAGTCTTCAGTCCGAAATAAG AACTCATATAACACTACATGGAAGTAGAACCTACATATGTTCTAAACATT AATACATTATTATCATTATGTTAATTCGTAACTCGAGGGGCATCCCTTAG TATACATAATTAAGAATATTGTACATAATAAATTTAAATGAATAATACTT TTTTTCAAGAGCTCCTTCGAATTTGCTTTCTATATCTTTTCTTGCATTAC ATGTACATTATTACAAAGTTCTGCCAAAGTTTTAAGATTGCATTTAAAGT TACATTCTAGAAAAAAGTATGCTCATGTTTTCAGTGTTAATTATTTTCAT AGTAACGTCAATTAATCATAGTTGTCGTAAGTAGTTGAATACATGTTATA TACATATATAATACATTTTGCCTTAAATAACATTTTCAATCATTATTTTA GACGTGGTATGATTTATGAGTAAGTTGATCGACGAAATGTTTGCTTTGAT ATTTGCATTAATAATATATTTAGTAAAACACCGACCATGAAGTAAATCCA AATTATTTTTTCCTTTCACTCATCTCTTTTTTCTGTTTCCATATGCATAA CATTCCCTATAATAACAGAAAAAAATATATATCTACCATACTAGCTTCCA GATATATATTAATAACAAAATGCCATTACCAGGACATTTGATKCCCTCCG ATGGCTTTTTAATACATTTCTTTTTTTCAGACTGTTCAACAAATTGGAAA TACTTACAAAGATAAGATCATTAGCTATATTGGAGAAGAGGCGGAACTCA ACGAAGTGAATGTAGGTTGAGTGTTCTTCTTCTTCTTTCTTGTTGTTCAA CCTCTCTCTCTGTTTTCGTTTTGACAACCTCATCTTGTTCAAGATGCATA TTTGAGTCACATCGTAGCTGAAAWGAGCCTATGAGGTCAAAGAATGACTT GAGTTAAGTGTGTGGGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTCTAATTTCTTCTATTTAGATA TTAAGGATTAAAGGATCACTATAAGACTCGATAAAAATTGATTACTTCAA GATGGGATAACTAATATTGTTTTGTTTTTTTAGAGCCTACTCATGTTAGA GATGTAAAAAAAGAATATCATTGATCAGATATTTTTTTAGACTATTCTTG GCTTATTTCAGCTGTGGTGTCAAGTGTATATTCATAATAACCTACCTCTT TGATTTTAGTAGTGATTTTTGTCTTAGATAGACGCCTGACGTTATTCTTA CAATGTGAACATTAACATTTATTTTTTTATTTTTCTATGTATTGTACATG TGTAACTATTTGTAACCTACATATAGCAATTTAAGTTCAACCATATTTAT ATTTAATCACCTTTTCTTCACAGTATTTTTGATTCCAACCATAATAAAAA AAAGTATCCTGCATGAATATATAACGTCTTATATGCATGTCTACTCATTA TTTATAAATATTACTCAACAAAGTATTATGTAAAATATACATAAGTATAT CATAATACTACTACTCCCTATAAATTTGATGCTTGACGACACAAAAGCTA CACTATGATATATGCCTAACCTCCACAAATAAACTTCAATTTTATATCAA AGTACGACGTTGAATATCTTTAATGTACAGGGTTTTACAGATAAATCAGG ACAAAAAAATATTTGCTCAAAGTAATTATAAATAAATTTTGTTTAATATC AACCAATAAATTAATGACAAAACATTATTAAATTGAGTATGAAGGTCAAC CTTCAATCAATGGGACCTCAAAATGCAACAACGGCTATTAGATTGCTGTG GTTGGCGATGATATCCTCTTGAGGCACGCCAAGAATCTGAAATTCTTATT TGATCGAAAAAGAAGGTTTATGAAGAGGCAATGACCATCATTCTCATCTT ATTCCGATTCTAGATTGCTCCAACGGTACTGACCTTCAACGTTTTTCTCT TGTACGCCTCTCATTTCCTCATTCTCTCCCACCACCCAATCTTTGAGTTT GAGTACCTTTCCCAAGCCCTAACAGTAGTTTGCCATACCACAGCCAACCA CATATTCTTCTGATATATTCTGGATTATAACAAGGTGGAAATCACTGCTC TTGCCTGATATTATGCTTGTTTGTCAAAACATGAGTATTTTCAATATGAA TAATACATCATGTATAATGATAATTGACGGCGGAGAAGTGTTTAGCWCTT CTCCTATTCTTACCACTGTCGTGTTTGTATATTTTTTATTTATTTCATCT CATTAATTATATTATTTATTTTATATCTTTTTCAAACTTATTACATGAGT GAGACTTTGATAGTATGCATTAAAATTTGTAGCCTAATTTCATCATTACT TCAACGAAAAACAACCATTGATGCTTTTGATAGTTATAAATATTACTTAT ATTTTAATTTAAAATACAAAAATTAATATCAATTTCAACGAAAAATAAAC AATAACGACGTATGAACTTAATTTAGTTATATTTTAAGGTGAAATAACCT 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TTTTAATTCAAGATCTCAACTTCTTCACATTTTCCATTCTTTTTAGAATC TGGGCTCATTTAATAAGTTGGTGCTAATTTCTAATTTAAGACTGGGAGCC AATCTCCTTCAAAGATCTTAGAATTATATCTTGTGACATGTTCATCTCAT GGGAGTGTCTGGTTGATGTTTTTTTGAATTATAGATTTTTGAATTTTCCA AATTAATTTTTGTGAACATCTGTTGATTTTTGATTTTTTTTTTCAAAAAT TTAATTTTCAAATTGTTATACCCCCTCAAAAAGAAAAATCTATAATCCTA AGGAAACCTTTGAATATACTCCACAGTTCGAATTCCAACTTCAATAAGCT CTGTAATTTTATTTTGAGAAATTAGGACGTCAAAAGAGCATTAATTTTTA CTCGTTTATCTTGTTGCAGCCCCGTTTTTTAATCTATTTTCTTCAAATAA AACAAAAATAACTTTTAAAACAATATTTTATTGCATTTTTATAACCCAAT TTCGTATGGTTTAAAATAAGAGTATAAATAAACTTCTTCCAACCCTCCGT TTTTGATCATAAAACCTGTACATAGGTAGGAAGTTTGAGTAACATTCATT AATATTARATTAACATACTGTATAAGAATGATTTATTATTTTTGACAGAG CATGGTAACAATAAACAGAAAAGTAACTTCAACATGAATGTAATTTCCTA ATACATAAATATTAAGTTTTACTTAAGTATATGGTACATAATTCAAAACA TTTCTTTTCAATACAACAACACTTTGTAATAAATTAGTTCACATAGTTGT ATTTACTACGTACACCAAGACTTTTCTCTTAGAGTAAGGATAAAAAATCA ACTTTGTACAATTTTAGCCTAAAATTTGATTACTTTTAAGAAGGTAATGT ACATTTAAAAATGAAAAAGAGGGGTTTTTAAAGGTCTCAAATTTGAAAGA 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ACAATTCTGTCTGAAAACAATGTGGTCATCATACTCACCAGATCCCAACG GCCTGCCTGGCAAACGAACCTTTTCTCAAAGCTCTTAAAGCTTTTGTTAA TGAGTATTTGGAACTTCATGACCCCCCCCCCCCATTATATTGTTACCACC TGTCAAAGTGAAAAAAGGCAATTATCAGAGTCTATAGTGACTATATTAAA GCTTAAAAAGGGGTTCAATATATGTGCCAACATCTGTACAATGTATAGTT AATGTAGCTCCTGAAATTAAACTTGTTAAAATTCTAGATTCAAAATGTCA AGTTTTCAATTACGCCCCCCGGTGTGTGTGTTGGTACTCTGGTAGGTAAA ACAGATAATGTACTCGAGTTGTACTCAAGAGAGTTGCTAATCCAGGGTAA TGTGAAAGCTCCGTCTTTATTGCATACTCTTCTCTCTTCTCCTTTTAATT CACTATGCCTTAGTAAACGACATTCAAACTTTTTCTTCTTCTTCTATTTT TTCAGCGGTGCTTTCATTCACCATTTTTTTTTTTTAATTTTTTGAATGAA ACGATGTATAACAGGTTATTGGCTAYGAAGGGAGGGTGAGGAGGAAATAC AGCCTTTCCAGGGAGYTGATAAACACACTTTGAATGCAACTCTTTTTTTA TATATTAAGTGCCTTACTAAGTATTTATTTATAAGAGCTAATTGGTGACT ATAATGCATAAAGCCTTAGAATGGGTATTATACATTGTAGAGAMTTATTA TWAAGCCAKAAGCCACATAAAATGACTTTGTGCAATAATCTAAAAGTTAC CTTTTTATAAATACTACAATAACGTAGTTTTTAATTTATATACCCCTGAA TAATACCAAGTTATGTACCTATACACATATCAACTCATTTGTACCATAAA AAAAATAAAACTTTGTCCATACTATAAAGTGCAAATTCATAGCTGAATTT CCCTAATGAGTAATAAATAGTATTGATAATTTTTGTAGTGTCATGTGGAA ATTTTGTTTTAGAAAAATCCTAAAGGATCCATCTTTTTTCAATTCTTAGG CTTTCTCTAAGAATTTTATTTCTTTTTTTGGCAAAAAGTATTGAAGTTTA TTATTAAAGACTACTTACTAGTATTAATTGTAATACAACCAAATTTCATG ACAAAAAAATCATTACTCTTTATTATAACTTAAATTGATTTACATATAAT ATTAGGCCATATAATATTGAGGACGATATAAAAAATTTACATGTATACAT GAAAATCAAACGCCATTTAAATGTCATAAAAWATGTTGTCGTAAATGCAT ATATATATTNNATATATATATTATTTTTTTTAATTTTTTTTTGGGGGGGG GAGGGGGGGTAWAAATAAATTATGGTACCTGCCCTTTTTGGWTGGAAACT ACGTTGCAGCGTTATATATATAGATAGGTAAATACATATGCAAATATTAA GAATAAGGAGCCAAATATTTCATTTAATGAAAAAAGGATCATAATCTTTT TAATGTAACGCACTTTTTTCAATGTTGTAGCATAGATCCCGTGTTTCTAT ATACTCGTATATATATATATATTATTATATGTCACCATATATAATGCTAC CTATCTTCTTACTTACATGCTTCTATTTACAGAAGTAAAAAATATAAAGT TCACAAGAAGAAACTGATCAATTATTAAAAGACTGACTGTCCTTTCTACT AACATTTTCATAGAAAAAACATTATATTATCATCCTTATTTTCTTATATT TTAGACCACTAAACAAGAGGACACTGAGCTTCTCGTAGAAAATGAAGAAA ATCCGGATGAAAAATCTCCAAAGAAAAAAGAGCTAGGGAAAATTAACTAT AAGGTGAGTCAAACTATATGTTCAATTATAATCATACAATTGTGGGAGGT 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