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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s378 | supercontig | LSalAtl2s378:771291..801671 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000006758 >EMLSAP00000006758 ID=EMLSAP00000006758|Name=EMLSAP00000006758|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=400bp
MTPRAKISTNSQAIKDRIERHKHQNNSEGKSYSGILMLIVTLAIFCILFL CYLRRLFSKKRNTQKTETTTKSARNVKNGAPRAGDLKTTKQEDTELLVEN EENPDEKSPKKKELGKINYKVEYDFNTSTLIVTMIQCKDLIAMDVGGSSD PYVKIYLLPDRKRKQETRVHRKTLNPTFNEVFKFEISYGEVMGKTLVFAV YDFDRFSKHDQIGEXRLPICQMDLAQVQEKWKSLQSIVGDGVLGDICFSL RYVPNSGKLTIVILEAKNLKKMDVGGLSDPYVKIALMQNDKRIRKKKTSI KKCTLNPYYNESFSFEVPFEHIQKVQLWVTVVDYDRVGASEPIGKVVLGC EAKGAELRHWSDMMATPRRPVAQWHTLKAIEGRGFLSLVHQQIKDKEQSQ back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s378:771291..801671+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000006758-702605 ID=EMLSAT00000006758-702605|Name=EMLSAT00000006758|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=30381bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s378:771291..801671+ (Lepeophtheirus salmonis) ATGACTCCTAGAGCTAAAATATCTACAAGTACTAAATAAATTATATTGTA
TGAATGAAATAATGTAGTGGTTACTTCCTCTTGTAAAGGMATTTCACCTT
TAAAATGTCTCCCTTTTCATTATTTTGAATACATTTAGCAATTATAGTTA
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ATAGTGGGATACTTATGCTAATAGGTAATAATCTTTTTATTATTTATAAC
TTTTATTTTGATAATGAAGTACCCATGTAATTCTAACAACAATGTACATA
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CCCAAAAACATTTGAAATAAAAAATTATATGTTCTTCCTTCCCTCTACAT
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CTCTTCTCCAAGAAACGAAATACTCAAAAAACTGAAACAACGACAAAATC
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TTAAAAAGAACTTTTATTTTTTTAAATTATCATCATTGATAACATGATAT
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CCTCTCTCTCTGTTTTCGTTTTGACAACCTCATCTTGTTCAAGATGCATA
TTTGAGTCACATCGTAGCTGAAAWGAGCCTATGAGGTCAAAGAATGACTT
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTCTAATTTCTTCTATTTAGATA
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GATGGGATAACTAATATTGTTTTGTTTTTTTAGAGCCTACTCATGTTAGA
GATGTAAAAAAAGAATATCATTGATCAGATATTTTTTTAGACTATTCTTG
GCTTATTTCAGCTGTGGTGTCAAGTGTATATTCATAATAACCTACCTCTT
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TGTAACTATTTGTAACCTACATATAGCAATTTAAGTTCAACCATATTTAT
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CTTCAATCAATGGGACCTCAAAATGCAACAACGGCTATTAGATTGCTGTG
GTTGGCGATGATATCCTCTTGAGGCACGCCAAGAATCTGAAATTCTTATT
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ATTCCGATTCTAGATTGCTCCAACGGTACTGACCTTCAACGTTTTTCTCT
TGTACGCCTCTCATTTCCTCATTCTCTCCCACCACCCAATCTTTGAGTTT
GAGTACCTTTCCCAAGCCCTAACAGTAGTTTGCCATACCACAGCCAACCA
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ATTTTAATTTAAAATACAAAAATTAATATCAATTTCAACGAAAAATAAAC
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CTKATTTAGTAAACACTTTAAAAAGAGACAAATAGAGAAATATTTATATT
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AACGTACCAATCGATGGTACATTGACAATATAATATATAAATAGATTTGA
GCGAAAAACAGCTTAATATAGTATTTTTTCTTTGTCTTTAATTATTAAAA
ATTGAAACATGTTTGAAATAAAATGATGTTATATTTAAAGCTCTATATTT
CATTTAATTAAGTAGACATCATTTAATTAATGATGAAAGGATGCACTCAT
TAAAAGTTGTTTTATTTTTTTTTAAGTTCAAACTAGCGTTATACTAAAGA
CGTTAGAGTGTTAGTTTAATCAAAATGAGAGAAAATTTTGATATTCATAT
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GAATATGCAAATAAAAACGTTGCAGATTAAAAACGAAAACAAATTCATTT
GACTAAAAGTTAATATATGGCTGTTTTTATACATTATGTGGACATAATTA
TCGTTTCGTTATATATCCAATGGCACGAAATAACCCCTCAAACCTCAATT
TCCAGATTATATTTATTATATTTTTTGTGCCGGAGGTAATCATTTCCCTA
GAGGAGGACTAAGCAGAGTATATGCTCAGATTCAATTAATACATTCCTCG
TATTTTTTATTTCCATTTCTTTAGCATAGTTAATTTATATTCCTCAAGCG
ATTCGAGGTTGCATTGGGGAGAAGCATTTACCTCATTTTCATGAATGCCC
CACCAAAAATAGTCAAACGGATTCAAATTTTTACTGGGAAACAAAATTCT
TTTTAATTCAAGATCTCAACTTCTTCACATTTTCCATTCTTTTTAGAATC
TGGGCTCATTTAATAAGTTGGTGCTAATTTCTAATTTAAGACTGGGAGCC
AATCTCCTTCAAAGATCTTAGAATTATATCTTGTGACATGTTCATCTCAT
GGGAGTGTCTGGTTGATGTTTTTTTGAATTATAGATTTTTGAATTTTCCA
AATTAATTTTTGTGAACATCTGTTGATTTTTGATTTTTTTTTTCAAAAAT
TTAATTTTCAAATTGTTATACCCCCTCAAAAAGAAAAATCTATAATCCTA
AGGAAACCTTTGAATATACTCCACAGTTCGAATTCCAACTTCAATAAGCT
CTGTAATTTTATTTTGAGAAATTAGGACGTCAAAAGAGCATTAATTTTTA
CTCGTTTATCTTGTTGCAGCCCCGTTTTTTAATCTATTTTCTTCAAATAA
AACAAAAATAACTTTTAAAACAATATTTTATTGCATTTTTATAACCCAAT
TTCGTATGGTTTAAAATAAGAGTATAAATAAACTTCTTCCAACCCTCCGT
TTTTGATCATAAAACCTGTACATAGGTAGGAAGTTTGAGTAACATTCATT
AATATTARATTAACATACTGTATAAGAATGATTTATTATTTTTGACAGAG
CATGGTAACAATAAACAGAAAAGTAACTTCAACATGAATGTAATTTCCTA
ATACATAAATATTAAGTTTTACTTAAGTATATGGTACATAATTCAAAACA
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ATTTACTACGTACACCAAGACTTTTCTCTTAGAGTAAGGATAAAAAATCA
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ACATTTAAAAATGAAAAAGAGGGGTTTTTAAAGGTCTCAAATTTGAAAGA
TAGGTATACACTATGCAATATTGTTGTGCTATAGTCCAACAAAGTCTAAT
TTACAATCAACAAGCTTTTTGGTATACGATATCTTAGATTCTTGTTATTT
GACCCATCTACATACATTGAATCCAATTAAAACATAATTCTGCATTTTAA
AGAAAAAGTGTTGCATATATTTTATGTTTGAAGAAAATTGAAACTACAAA
CACAAGCAATTAACCAATTGCTTAAAATTTGAGCACTTTTTGAGTAAAAA
ATAACACACTTTGTACTTTGTATAGGGTCATTATTTTGTTAAATTGTTCC
TATGCAATATTAAATAATAAAAAATTTACAGATCTAAAATGTAATAGAAA
AAAACATTGTCAAAGTAAATAGGAAAATTCTACATATTCCTTTTCAACGA
ACAGATATATACCTATAAATAGCATAAATACGTACACCAATGTATGTTAT
AAACCAATATTACTTATTATTTGTCATGGAGTTGTTACTTGAACAATGAG
AATTAGTTATGAAAATAAAAATAGTAATGGTATTTATTTATCATTCATTG
TTTAGTTATCAATTTTTTTGTATTTATATACTTTACATCTGTTTCACTCA
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ACATAAATATTTTTCAATTTATGTGTTTAAATGTCTAATTTATATTATAA
TATTCCATTGTGTACTTAAATCTAATATAATTTAGCAAGGAATATAATAA
TATGATTAGAAAGTAACATGTACATTGAAAACTAAATGAATATTCATGAG
TCATTTTCATTTTGAATCTAAATGCAGTATCCTATGAATTTTTAGATACA
CACATGACTTGAAATCCCACATGCAGGTAAGTATGAACTATATTACTCAT
CAGGAATTCAAACAACTTTACGTAATGAATAAAACATATTATTTCTTGCA
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ATTCATGAGAAATTTGTGTTATGCATATATTTTTACATATTTCGTTTATG
AATTAAGAGCTGAGATAAAAATAGATGAACGTACATATATATATGAAATT
TGCTTATTAAATGTGTCTTCCCTACGTATAGATGAATGTAACGGGTGTGT
GGTTGAAATTTGGACACTTATCCAATATAGGATAAGAAACAGACATGAGA
GGAATAAGAAGATAATTCCTTCCATCAGCTGACAAACTACTGAGAATATT
GACAACCCCCTCTAAAAAAACCTTGAAAAAGGCCTTACAATGAGACAATA
GAATCTAGATTGCTACTTTATTTCGCTCAAAAAACACACCAACAGAGATA
CGAAATATGATTTGGCAAGATTTAGGAAAGCTCACACACGGAAAATTTGT
CACGACCAAACTCCCCTCTGATAAAGCTCTCTGTGTGGAAAAATTGCCTT
CCTTTATTTAATGTAAATAATCATCTCACTTATATAATGAAGTATGAGTT
GGAAACAAAGACAAAATGAGTAAATGAATATTTTATAATTATTTTCATAC
ATATATTTAAATTAGTAAAAGTAAATACATAAAAATAATGAAAATTCCAA
GACATGGATTGAAGAAACTGAAATAAAATTAAATTAAATGCTAGTTTAAA
TAATTTGGAGCAAATTTAATTTAAAAATGTCCTCAATTAGATGTATTAAT
TGAATATTTAAAGAGGGATATTAATATATCATGTGACATTATATTCAAAT
ATTTAGGCAATAGTTTTTTGAATGTTATCAAGATTCATGGGAATTATTTC
TAATAAGTATTGTAGGTATAAAATCAATACAATTACAATACCGTTAAAAG
AAAGATTAGTGCCTATCTTGGTGGGCCTGGATCCACAATTAAGCAAATTA
GATAATTACATGATGTGTAGAATTAAAAAAAAAAAAAATTGAGCCGTTTC
TGTAGACATCAAATAAATTTTGCGTTAATTAATAAAATTAATGGAATTAA
ACATTGACAAAGTAATGAATATTAATATTATTTATACAAATTAATGAAAT
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ATTATTAATATTCTTTGCTAAATATCACTGAAGACTCTTATTACAAATGA
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GGAGGTATGCATTCCTAGTTCTAAATGTATAATCCGAGGATTCAAGTACC
TTGAGCATCGTTCTCATCTCTCTATTCCAATTAAAGGTTGCTCCAATTGT
ACTGAGCTGTACAGTTTTCCTCTCTTACATTTCACATTACCTCATACTCT
CGTAGGTTTGATTGCCTCCTCGAATCCTCTCAATGAATTGTCTCTTCATA
TCCACCCTCCTCTTCCACTGATAAACCCTGGCATATAATGAAGAAGAGAT
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TTTTCCAATATGAATAATTCATCATATCTACAGTTCTATGATAATTGATA
ACAGATAATTAAGTGATAAGTACTTCTTCCATTCGAATTGCAGTCGTGTT
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CTCTGGTTCGATCTCATTAGTCATTACATAAGTGAGATTGTTATGTACAT
AAAATATAGGAAGGCAAGTCTTTCACCAGGGGAGCTTTATCAGAGATGAA
TTTTACCTAGGCAAATTTTCCATTTTCCTGACACCATTAATTACAACATC
AAGAATACGAATATAGAAAAGGTTACACAGTACTTTTTGGAGACCAACAT
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GCCTGCCTGGCAAACGAACCTTTTCTCAAAGCTCTTAAAGCTTTTGTTAA
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TTCAGCGGTGCTTTCATTCACCATTTTTTTTTTTTAATTTTTTGAATGAA
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CTTTTTATAAATACTACAATAACGTAGTTTTTAATTTATATACCCCTGAA
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CTTTCTCTAAGAATTTTATTTCTTTTTTTGGCAAAAAGTATTGAAGTTTA
TTATTAAAGACTACTTACTAGTATTAATTGTAATACAACCAAATTTCATG
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ATTAGGCCATATAATATTGAGGACGATATAAAAAATTTACATGTATACAT
GAAAATCAAACGCCATTTAAATGTCATAAAAWATGTTGTCGTAAATGCAT
ATATATATTNNATATATATATTATTTTTTTTAATTTTTTTTTGGGGGGGG
GAGGGGGGGTAWAAATAAATTATGGTACCTGCCCTTTTTGGWTGGAAACT
ACGTTGCAGCGTTATATATATAGATAGGTAAATACATATGCAAATATTAA
GAATAAGGAGCCAAATATTTCATTTAATGAAAAAAGGATCATAATCTTTT
TAATGTAACGCACTTTTTTCAATGTTGTAGCATAGATCCCGTGTTTCTAT
ATACTCGTATATATATATATATTATTATATGTCACCATATATAATGCTAC
CTATCTTCTTACTTACATGCTTCTATTTACAGAAGTAAAAAATATAAAGT
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AACATTTTCATAGAAAAAACATTATATTATCATCCTTATTTTCTTATATT
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ATCCGGATGAAAAATCTCCAAAGAAAAAAGAGCTAGGGAAAATTAACTAT
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CTAAAAATGTGACAAAAACCATTTTTCAAGTTTGTTAAAACCATTTTTTA
GATGACGTCATAGAAAATGTGGTCATCCTGGGATATATAATGTCAGTATT
AATTAAGGGAGGAAATGAAGAGGGTATTTTACTACATTAAGAAAAAGCAA
CCTCTATTCAACGTATTTGAGCACATTCAATGGAAATCGTTTATTACGTG
GCATTTTTTAACTGGAAAGAGTATGATTTAGACTTGATTTATATGAGGTT
TAAAAATGGTTCCTAATAGTACAAAAAATTTGAAGGAAAGTTTAAGCAGT
TTTGGAAAAAATTTAAAAGTATCTCAACGGCCCTAAAGTTTTGAAAATTT
ACATTTTAAAGGAAAAACTGAGCATTTTCTTGAATATTGTCGATATACTT
CAAATTAAAGCTTTTTTGTAAAAACGATAAATTGAGATTACTAAATTTGG
AATAAAATATATTTTATAATTATTCAAACAAAAGTAATATGTTTAAAATA
TCGTCAATTTAAGTTGATTGAAATTTAGCTCATATTCCTTTTTTTTATTC
CTTTAGCCAATTGCAACCCAACTGTTGAACTGATAAATATAAATATTTGC
AATTGTGTTTAAATTACATTAAATTCAACAAAAAAAATTATTAACCACGG
CTTAGGGACCTTTCCAAGGAAGTTGACCATTTTAATTCAATTTTAACACA
TAAAACCAGCAATAAAAATCTAGGTCACGCTAGTAGAAGATGGTACTTAC
AAAAATATCATTTGAATACATTTTGTATTTATTTTGTTCATTTTTTTATG
ATTTATCAAATAAATGAACCAGAACTTACTTTAATTTATATTTACAAATT
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TTTTCAAACCAGTTTATTTACATTTTTTTATAATGTCATTGATATATATA
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ATGCTTCCATGTAGTCTTTCCTACGATTCCAAAGTTTTGGGTCAACTTCT
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CTTCTTCGTGACAAAATCTTCAATATTTTTATGTATCAATCATTGATTAA
GTTTTTTGGATTCCTGTGCTTAACTTAGAGAGAGCCCAGTATTTTTCTTT
CCGTATTTAAAATTACTCTATCATCGAAGAAATCGAATCGAACGAGTTTC
TCCGAAAATGTTTTGGAAAATTTACAATAAGTAGATTCTTAAATATTTCA
ATTAATTGAAGACTATTCAGTTAACAACTTCATTAGACTGAGATCGTTTA
ATGAAGAATTGGAGGCCTGAGATGCATTGTCCCACGTTTTAATGTACATA
TACTCTTACAATGAAAACATAAACATCAAGTAATCCTCGTTCTTCCTTTG
GAGTCAATTTGAATTCTAATCTAAATATCCTAATCTTGAGTCTATTTATC
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GACTCCCTTTCAGACGCATTGCCACAAAATATAATATTTAGATCTAATAG
TTCTCTATTTTCGTCTCTTGAATATATTTTTCAAGATTATCATTTCCAAA
TTTAATAGGACTATCTTGTATGCCTTCCAAAAGACTGGCCATATCTTCAT
CTGTAGTTCCAGGTTTATAGTTAGTTTTTTTGATTGATGACCAATTTTAT
TTGAATCTTTTAAACAAAGGAACATCTGGTGATCCATTTGGTACCCATAC
ACTCATGGGAAACAGTTCCAATAACTAATTCCATTATATGGTGTTAATAA
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TAAATTATTCTTGCCAGTATTTGAACTTATAGTGTCAATCCACATGGCGT
TTTTTTACTAAATATGTAGGCACTTTTTGTTCAATTTAAAACACACTCAT
AACTTATTTGATACATTATCAAGAAAAAAGAACAAAAATGTATCCCAATG
ATATATTTTTGTAGGTACCATCTTCCACTAGAATCACTTAAATTTTTATA
GCTGTTTTTATGAGTTAAAATTGAACTAAATTGGTCACTTCCCGTGAAAA
GTTCATAAAAAGGTCACAAAAGCCATATTTATTATTAATTTAATTTTTTT
TCCCAGAATTGAATGTGATTTAAACATAATTACAAGTTTTTATGCTTATC
AGTTCAACAGTTGGGTTGCAATATGCTATAGAAATAAAAAAAATGTTCAT
GTGCTAAATTGCATTCAACTTGAATTTACGTAATTTTGTAAAAGTAAATA
TTTTTTTTAAATAATTATAAATTATATTTTATTTTAAATTTAGTAATCTC
AGTTTATTGATTTTACAAAAAAGCTTTAATTTTAAGTATATGGATAGCAT
TCAAGAAAATACTCAGTTTTAAACTTTCAAAACATTAGGGGTGTTGAGCT
ACCTTTAATATTTTTCAAAACTGTTCAAACTTTTTATTAAAGGTTTTTGT
ACGGTTAGGAACCATTTTTAAATCTCAACCATTTACTTTTCTTTAAAAAA
AAAAAAGAAGATTATATTGTCACCTTAATGTACACTCACTATTACAGTTA
TAATACTATGCTACCACCATTTGTTCGATAAAAACTTTTGGATAAAGTTA
TTCGCGGCCTTTCTCCCCATAAAACTTATTATATTTTATAAGTTGAGTTT
GCCTATTCATAGTCAAATATGTTTTAATTTTTACTTTTTACCCTTTCAAA
AAACAAAGAGAGACTATTTCAGCGGCCTTTCACTCCACTTCTAACAAGCG
ATATTTGAATCGAATATTACGGACCATTGAATTCCCCGACTTTTCTACAT
ATAGATTCCTACCTAAATACATTATTTATTTCTTACCCATTAGTTAGACC
CTTCAATAACTTCCTACATTTCCCTAATGAGATTAAGCAGTTCATTTTGC
CATCATAAATTCTTAATCTACCTAGAAAGGATTGTTATTAGTCTGAATAT
GGGATGTAGATATATATTTTTGAGTGACTCTCTAAAATAATCTTACAAAG
GAGAGAAAGAAAGGAGTATTTATTACCTTTCTAAGTAGACTCTAGTCAAA
TATTTATAACTCCCTAAATGAATCAAATATTCATGTTTCAAATTCAAGGT
ATCATGCTTCTTTGATAAAATAACGAGAGCTATCAAATAAAAGAATTCAC
GTATTTTTAACTATTTTGTAGACATTTTTCCCCGTTTTTCTTTTTGTATT
TTGTTGATACTTGAAAAGAAAATCAAATACATATTTGCCACTTGCCTTAA
ACATCTTCAATTAAACAACGAAAAAATGTAATTTGTATAATTGAATAGGG
ATGAAGTGAATGAGGCATATCATAAAAACAATTTCTTTATTTTTCAAGGT
TGAGTATGACTTCAACACAAGCACGTTGATAGTTACCATGATTCAATGTA
AGGACCTCATAGCAATGGACGTTGGTGGTTCTTCAGATCCATATGTCAAA
ATTTACCTTCTTCCGGATAGAAAGAGAAAACAAGAGACTCGAGTTCATCG
AAAGACACTCAATCCCACCTTTAATGAAGTTTTCAAATTTGAAGTAAGTA
TTTGGGTGACTATGTCTTAGCTAGAGGAGCAAAAGCAAAGGTTTACCATT
ATTTGCTATCTATTTTTCCAAACCATAAAAAAAAAATAATGATGATATCA
ATAATCATGTACTAATATATAGCATGTACATGAATAGTATGTGAGTACAT
AAATAACCTTTAATTAATTAACCTACAGATTGAATTAAAAGCTTAATGTA
ATATTAMTATTATTCACAATACAAGTAGAGAGNNNNNNNNATATACCTGT
AATCAATTAGAAAGAGTTAGAATAACCTTTGAAGTGTGCATAAAAGTACT
TATAAATACTTATAACTTACAATTGTGTCCAAAAGTAGGTAACGATGGTA
ACAGAAAAAAAAACCGGCGGGCAAAATKTCTGATATATAAATAGATTATA
TCACTGTATAGATACTCGAGTTTATATATCTCAGAACTATTTAATGAAAA
GTTAAATTCTTAATATTTTGCTCCAATTTTTGAAAGTCTTATTTTCTGTG
TTTTTTAATTCATCTTAACTATGATACAGTTTATTTGGAAGGTCATAATT
AATTACAACTATAATAATTCAATGTTATACAAACATATTTTTCAGACATA
ATCTTTACTAATGAACTTAACTAAACTCTGAACTGGAATACAAGAAAATT
AGGTAGTAGCATAAGTTAAAGTATCAAGGGCAAATTCATAACTCCATAGG
AGTTTTAACTGGGGTTTATGATAAATGGAATAACCCCCTCACCTCCTCCC
CCTTCAGTATCAGAAGGAAATTTTTTGAATATTTTAAATATAAGCATATT
ACTACGATTTGATCAACGGTCTTAAATCTCTACATGCAAATTAAAAAGTG
TATTATGTGCAGTCTGCCATTCCCTATGAATAATTTTTTCAGCAAAAAAG
GCTAAGGGAGGACTGAAAGTTGACTTTTTATACTCTACAACAGCTTAAAA
TAATTGAATCAAATACCAGTGACGAAATATTGGAGTAAAGTTGGCTTTTT
TGTCCATAAGRGTTTTTATCTTGGGGGGGGGGGGGGGTATGTTTGACTAA
TAAGGATTTTATGAAACTTCTCGATTTCTGTAATAAAGATATTTTTGATC
ATATTGTATTTAAACAAAAACATGGTTTCAAATATTTTGTACACACCGGT
AACTAATTATCATCCCTCTTATGGGACACATCTCACAGGTAAAGAGAAAA
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AATATTTTAATAGATTTATATGAAACCGAGACGAATTCTTTTTGGGAAGA
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