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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s384 | supercontig | LSalAtl2s384:101016..118859 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000006823 >EMLSAP00000006823 ID=EMLSAP00000006823|Name=EMLSAP00000006823|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=435bp
MSDKMSENQLLDSVENSIWHAFDFLSLEGDGTAPKSKLKVFSNLPDEIPV
NEQHSYESKTDNVXWEWXSLNFIKREGEFIIFPDHCVYQLYRIFCIGQDW
NAEEFDSIASVIPAFKFGIFLTVLESKYTKDTDKGGLIEAVRDIHDFFVL
DVVKKGHLGKKMDFLPAYREHFFVLQPNLLSFYNGTSQREKRGDIVVDGQ
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SLKTSINQSGHPIRYQRRLAETRRLMRQEEKEKLDVELLKQTDTMEETRA
QLELEKQARINAEVQAETLMEQCALESEKTAELEKIRTQLESLLDEERQA
KKDEETVRRLQARILNEEWERRDFLEKLQEEQKNMLEEERKKRSEFEKMQ
QDKENQLNGIVLHNLFIFKLLIFLSYDYIEAQKRK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s384:101016..118859- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000006823-702670 ID=EMLSAT00000006823-702670|Name=EMLSAT00000006823|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=17844bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s384:101016..118859- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGAGTGATAAAATGTCAGAAAATCAATTATTAGACTCCGTGGAAAACTC
TATTTGGCATGCCTTTGACTTCCTCTCCCTTGAAGGCGATGGAACAGCAC
CTAAATCCAAACTCAAGGTAGGAAAAACAACCAAACATTCATTATAACGT
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CTAGCTGCAAGTCTGTGATTATGCGTCTCTCACAAGTTGTTTACATATAG
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AGGTTTGGAACATAGTCTTCCTTGTCTTTTGATTGAATCGTTTATTTTTC
CCTTAACCTCTCGTTCCCTAGAGCCCTTTAGTCCGAAGGACTGACAGTCC
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TTTTAGCTCCAGCTTGTACAATTTGATCATACAAGTTAAAACTTATACAT
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GTGCAAAAAAACAAAATTACACATAAATAAACTATGAACTCTTTTTGCAA
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TTGCAATCTAAAGGAAAAAGATATGGATTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGG
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ATATATACATACTTGTATGTAAGGATCAAACGCAAACCCTTTTTGAGCAG
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GCAGGSTGAAAGAATGTGKTCAAGGACACAAAGAGAAGTAAATATGGGTT
TCCTTCATATTTCTTGGGGGGGGTGAGGGGGGATTATCTCTCTTTTTTTT
CTGAAGCAAGGGATCTCTTTTCAAAATGTTTTTGAAAAAAAAATCAAAAA
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TAAATTTTTTGTAAAAAAAAAAATATTCCAGTTATTAGCAAAAATTCTTT
AATTTGGGGGGTTACAGCCCTTCCTGCCAGCCCCTGTGGACGCCCCTGGT
TCATATTATCTATTTATTAAGATACTAGTATTCATCACTTAATGTGAGAG
TTCTTTCTAATATAATTATTATTTGGAAATGATTATTATATCAACAAGGG
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ATATACTAGAATTGGAGGGGATTTGACTTTTTGATCCCAAAACCAAGGCG
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ATCTTATAGAGGGATAAGTAAAATTGTAAATCTTAACCATTTTTTAGTCT
TATAGTTTTTAAGTTGTAAGCAACTTGAAGAGTGACCAGTCTTTTTTTTA
TTTTCTGCAGAAGTTATTTTTCTAATATAAAATGTGTGTGCCCATGTATG
TCAGATAGTAACGATGAGGACTTTTGTTGGTGTTATATGATGTAAGTCAT
CTATATTTTTTAGCTGGGCCCTTATTTTTGGAATTAGTAGACTGAAGAAT
GAATTTTCTTTTCATAAATTGTGGTTATTATAACCTATAATTCCTGAGTG
ATGAACTTCCTTCCCTTTTACATTCAATTATATTCAAAACCTAATTGAAC
CTTCGTTAAAAAAAAAAATTGAGCNNNNNNNNNNTGAAGATTTGGTGGAG
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ATCGGATTAATTATAGCAAAGTCCATGTTTATTTCCTTTTCTCCTTCCTC
TCTTGTCACAGCTGATTGTAGTTGATCTAATGAAACGTCATGAGCAGTAT
TCTTTCTCTCTTCCTAAACATTCTACAAATTGTCTATGTTGATTTTGAAT
TTCTTTTTTTTTAACATGCCCATTCTACACTCTACACAGAATTTTTATCG
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ACAACCTTTCCTCCAAAAAGAAACAGAAAAAAATCCCAAAATCATTTGGT
AGTTAGTCAAATGAGTCAATCATACCAACTGCTATTAATTGTTTTATTAC
TTGTTGGATTTAGAGTAGAATTGAGGATCGGCATTGGATTAATTCCTGCC
AATATTCTTCTATATTTCCTTATCTCTCTCTTCTCTTGTGACAGCTGATC
TAATGAAAGGGCATTAGAGCTAAGCTGCTCTCCTGCAAAACATTATTSAA
ATTATTAGGGTTACAATATTAATTTTCCGGTTTATTTATCTTAACATCTC
CAAATGCACACGATTTGCATCACCAATTATATGTGTAAGTCCCTGTTTGA
CTCTAAGTAGAATTGAGGATCGACAATAAAGTAATTCCTGCTTATACCAA
TGCTAGCTAGATACGGAGTGGGGTTGGTGTTCATTTACTTCATTCTGGCA
TTTAATTTTTANTACTTCATTCTGGCATTTAATTTTAAAGAAACATCATT
AATACCGAAGTGGATCACCTGAAATAATCAGGGGTAAATTTTAGTGTTTT
ATTTTTTTACAAAGTCGAAAATGCTTACAGCCTTAGCTATAAGACCTATT
TTTTGGAAAAATTTCAAAATCTATACATATTCACAGAAAATTAAATTTTT
GGAAAAAATTTAAAATATTAAATTTCTTGGAAAAAATTTTAAAGTCTATA
GCTATTCAAGGAAATTAAATTTTTTGAAAAACAAAAATAAAATAGCTAAT
TTTTAGCTCTGCTGAATGATTTGCCCGAAGGATGATGGGGGGGGGGGCTA
CAACCGCTCCGGCCCACCCCTTTTGAAGCCCCCTGATACACAAATGATAC
TAGAACGTCATCCTTTCAACCCCCATTATACACATGGATCTTAAAAGGGA
TGCATTTGGCACTCGGGACTATTGTTGCCATGTTCCCCACTCCAGATTTA
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ACATTATACTTATCTTGTGCCTACTCTTCTTTTTAAAAGAAGCGCCTCCC
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TATTTGGCTAATAATAGTTCACTTTAATTTGCGCCGTTTACAGAGGCTTA
ATTCATCATCGTACATTATTCTTTTATTTCCATCTCACCTCTCTGAAACT
CAATATGCGACCCATTAAGACATAAATAACCTATAATTCTTGTTGACAAA
ATTGAGTGTGGATTATATTTAACCATTTGATAGATTTTATTTGAAGGTGC
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CTACCTAAACTTCTTGGGGATCTTAAATCGTCCCGTAACTTTGTATATTA
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TAGATTGTTTTTATGTTGCTGCAGGATATGTGTACCTAAATTTCAAGAAT
CTCCCCCCCCCCTTGAGTTAAATAGTCATATCTACATCACTGGAAAACAA
TGGGAGAGTAACTTTTAAGGCAKAAGCCATTCCGCTATGATTATATGTTA
TACATTATTTTGAATACCTTGAAAAACTTGTCCTAACATGAAGTACAGTT
TTCTAGAGTACCTTGCTACCACTAATTTTAAGATATATATCCTTTTGGCA
TGCACTTTTAAAACTTCTTTATTCATCTTGATGGTTTTAGAGTAATATAT
TATTATCAATGTATGCCGTTATACATATATCCTAGACTCAATATGCAGTA
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TAAGTTATTTAATTAATTATTATTATTCAACTTTTGATATATTTATCCAA
AATTTTGACTTATATAAACTGAAATATTATTTTCAGTGACTATTTTTTTG
TCCAAATTTATAGTAATACATACAGATACAAAAATCTCCTTCAATTACGG
TRGTATTCGTCGTTATCCTTAATGTTTAGTGATAAAATTTCCTGTATTGT
GTGTGTTCATGGTTGCGTCTAGGACAATGTTTTCTTAGCAATTGACAGTT
CATTTTGTGTTCTACAATATTGCTTATAGGAAAATTGTACAGCAAAAAAG
KCTCTTAGCCTGTCAAAGTTTGAATAGTAGAGATGATTAAATAGTTATCC
TGGTACAGCTGCTGTTTCTCACTTATGGGTGTGTCTTGTCTCCTTATATT
ATTTTGGCTCTGGCTACGAGACGATTTTTTCTCCATTCGTGGCGCTGAGT
ATGGCATGAATTACTCTACAAATGACTACACAGTAAGGTGGGTTGTACTT
TTCATTTTTTCAAAATCAAAAACCGGCAATGTTTTTTACTTTTTTTTTTT
TATGTAGATTTCAAAAATGTAATTTATTAACAAAAATAGGATAACCCTGA
GCTACAACAATTTCACTTTGAAAATTAAAGAAAATTCATGTTTTTTTTTG
GTCTATATTTTCCAGTGCTGGCTTTTTAATATAATTTATAGATATTCATA
TATATTAAGGGAATGTATATGTACTGGCCTTGATAGGAAGAGTTCAAATA
TGAAGAAATTTGAATCATTAAATCATTCTAACCTAGTTATTTGTTCACTT
TTAAATAGATAAATAAGCAGTAATTTCGATACTGTTTTAATTGGAGAATA
CTTAGAAACATATACTTTTATTTATTAACCTTAACCTGTATATCTGTTGA
TGCTGTATTTTATTAGTTAATTTATTTTAATTCTAAATATATTATTAGTA
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TATTTAATTAAATGATGAAAATATTTAAATTACATTGAATCAATTAAAGA
GTTTCAACTTTTTCTTTGAGTATATCTTCCTTATAATTTATTTAGTTCTA
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CTGGCCTTTAATGTCCAAATTTCCCACTCTCTCTTTTTTTGTGAGAAATA
CTGTGAAGAAGGCCATTTTAAAACCCTTTCACAACTTTGTGTATGGCAAG
GCCATTTCAACACTTTTTTGGTGTTTGGATAGAGTTCTTTAACTCGGAAG
TTGTTAAGGAGCAGCTAAGACACTCCTTATGACTAGTTGATTAGGTCAAT
TATCCTTGGAGGATTTGTTGAAGAGTTTTAAGTGTAGGTTTTTGTTGGAT
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AAAGTTGTAATTGCGTTAATTTCCTAATGGGTGAGATTCTCCCATCCCAA
ACATTCTTCAAATTGTCAGGGTTAGTATTTCTATTTTTTGTTAATATACC
TTTAATGCTTAGAATTTACAACTCTACACATCATTCAAACAGGTGCATGT
TGTCACTTTGCTTAATAGTTTTGGATTAGCGTATGTACAAATGCATGAAC
TCATAATGAGTGTTTCTTTCTAATAGTTATTATTTAAATTCTTATTAATA
ATGTCCTTGAATCGTCCTTATCTACAAACATATGAAGAAATGCGTAGTAC
ACAGAGAAAAGACTGAAAAGGGGTTTGCCTAGTGGGTTTTAAATACGCTA
TATGCACGTAGAAATGTCATATTATTACACCTCATTTATGTACATAGGAA
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ATATCTTCAAACAAATGAAACACTTTGTTGGATCTCTTAACCTTTCCTCT
TTCAAAAAGAGAAGGGAAAAAGTCCTGAAATTCTATGCTCCCCAATTATG
CCTTATATCTACTCTCCAACTGTTGGACGTTTTCTGATTTAATTTTAGGG
ATATTCAATTCACAACTAAAAAAGAGCTGAAGTCATCAACTTTTACAACA
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GATTGACTCTCGTGTGAAATTTTTTGTNATTTGACAATTGTGTTTTTTAT
TTTTTGTTCATTTTCCAAAGGTGTTTTTATTATTCTTAAATCTTGAAGAT
ATACCGGATCTGACTTAGTATGAAGTAATTAAGTGTGAGTGTGCATATGA
ATAGTGATGGAAATTGAGTGAATTTTTTAGCACGCCCGTTCTTTTATCTT
TTTTGGTTGGCATCCTGAAGAGTAAATTTTCTTTTCCTAAGCTGTAGTAA
TTATTATCTAATTTCTGAGGAGTGAGCATTCTTTTCTACTACATTCTATT
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TCTAACCGTGACTTACAATTATAACTCTGTAACAAATCATCCGAGTTACT
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TTAAATAAATTTTATGTAAATAGAAAATGGTTTTTGCCCATTTCAAAAAA
AAAATTGTTATAAAAAAAAGTTGTAATTTACAAAATAAAAAAAATATCTC
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GTTGTTTAATTTATTCTGTTACAACTGAACAATTAAAATAAGGAATAACT
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GGGACAGGGACCGGACTAGACTGAGCCTCTGTCCTAAATAAGGGCAGCCA
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TATAAAGACTTCCTTCTGAACAGTCCTAGGGCATGACCTTATCGGTCTTT
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AGCTCTTCAAAATAACCTCTTTCAAAGAGGGAAGATACCTGAAGCTTTCT
TTCATCATTTTCTTTATGTTTATMCTCTTCCAGCCTAGCCAGGAGTGAAG
AAAACAAAAAGATAGCTAGGAATGTTTTATGATAAAAAAGATCGTACCGA
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TCGTTATACAATCTTATTTCTTTATTGTAAAAAATATATTAAGTATTAAA
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TGTTTTTGTTGGCATCAAGGAGTATTCAATGGAGATGTTAATTCTGTTGT
TTTTATTCTTAAAGCCTTTTGAGGAAGCTTCCTGAAGGGTTATTGGAAGT
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TCATCATCAATTATGATGCATTTTAGGACCCTCTATCTGTTTTGTTCCGA
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ATATTTCATAATAATATGATAAAAATCTACACATAATTAATATAAATACT
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ATTGGATATCAACTCAGCAGACTTGGGTTTAGACGATTATCGAAGCACAG
ATGCCCTCAATTTTGAGCAGTATCGCTATTATCTTTGTAAAGAAGTGAGT
ATATATTATTTACCCAAATAAAAAACTGCGGAATTAGATATCCGTTGATA
TTTTACATTTAATTCATATTTACAAAAATCAACCATCAAATATATCCCGA
TCAAAATTGGTTCCTTCATCAACGCGTTTTGATTTGAAAATCTGTCATAT
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TATTTTTTTATCACAATTTTGAGAGGAACAATTTTCTATTTTCATTTTTT
TTTTTTTTGTCAACTTGTTCAAATTTTCCCTATTACAACAAAATTTAACC
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CTCTTCAAAAATTTTATTTGTCTAAATTGTACCTATTAAAAAACATTTTC
GTCACAATAATTTATTCGTTAGGATTGATAAACGAAACTTGATAAGTTAT
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AAACATAATACAATACCGAATAAAATACTATAGGATTTGAATATTATGAA
ATCTATATATATAATGTCATTAATTTTTAAAAAATTAAATGACTATGATA
GTCTGGGAGTACCTTAGAAATAAATAGCAGTTGGAGTGACTGATTTATTT
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AAATGATTGACTTACTTTAAAGAAGATACATTTTTATGACAATATCTTWT
TTTTTTTTCGTATATAGCAATTTCTTTATCTTCCCGGCCCTTTCAAGGCA
ATGCCAAATCCCACCTCTACTATGCACTACTGTCTTTGAGTCTTTTTAAT
TATACTTATTTTCATTTTGGACTACAAAACTGTATTTATGCATGCGTGTG
TGTAGTCCTCATTCCTACATCCTTATGACTGAGTATTGACGAGATGATCA
AATTTGATAGAAAGTGATTATTACTGTCACTAAGGTTCCTTCTCCTCCTA
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TCATATTTATATGTATCTATGTATGAATAATTAAGCAACTCCTCTGCATA
AAAAAAGAGGCCTTCTTCATACATATATAGACTTGAGCATTGCATGTAAT
ACTGAGTGTTAATTTTAATACCCACAATATAATGTATTGTAAAGTCCACA
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TTCCAATTTACCTGATGAAATCCCTGTGAATGAACAGCATTCCTATGAGT
CCAAAACGGATAATGTCTGKTGGGAATGGKGTTCCCTTAACTTTATCAAG
CGTGAGGGAGAATTCATCATCTTTCCAGATCATTGTGTATATCAGCTCTA
CAGAATTTTTTGTATGTTGGGCGAAATGGTGGAGAATGACAAGGGACATG
TTGAGGTGAGGGGGTTTATATTTTAGAGGGTCGATTAGATAAGTTCAAAA
TATTTTGAACATGTATTTAAAACAACGTCTAAAGAAGGCATCTCTGCGGG
AGAATTAAAGGCTTTCAATATGACGCCCAGGGTCATAATGAAGACTGGAA
TCTATATTTCTATTATATATATATGTTATTTTTTTCAGTTTTTTCAGAAA
CATTTTAAAATTAATTGTTTTTGATAAAAAAATCAAAAATCTACAATTAT
TCACAAAAAATTTAATTTTTTGTAAAAAAAAATTTCAGAAATCTAAAGCT
TTTCATAAAGTTTTTTTTGTTTTTTTTTTAATTTCAAAAATCTATAGCTC
TTTTCCAAAAGTTAAAATTTCAAAAGTACATAACTTTTAACAAAAAATTT
AATTTCTTGGAAAAAAAATTTCAAAAATTAAACTTCAATTACTTAATTTC
TTGAAAAAAATTTCAAAAAATCATAACTATTCTCAAAAAATGAAATTTCA
AAAATCTACAACTGCTCACAAAAAATTAAATTTTTGCAAAAAAATTCAAA
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AATTAATTTTTTTGGAAAAAATATTTGTAGAATTATTTTTTTTGGAAAAA
AAAGCATGAAAAATTAAATAAATTTTTTGGAAAAAAAAGCATGAAAAATT
CAATGAATGTTTTGAAAAAGAACTTCAAATATTAAATTTTCTTGTAAAAA
GCAAAAATTCCTTAGTTTTGGGGGGCTCGGGCCTTCCATCCCATCCCCTG
CGGAATCCCCTAGTATGCTGTTCTTGGGGAACTTAGAGTTGATTTGAGGA
TCGACATGTGTACATTTCCCAGTGAAATGGGATTTGTGTGCATTCTGTTC
CTCTTTAGCGACTCGCAGCTAATCTAATAAAACGTCACGACAGCTAAGCT
GTTCTTCACCCAAACATTCTTCAAATTGTTGGGGTTACTAATTCATTTTA
TGGTTTAGTTATTACCATATAGACAGTTTGTATTTTCAACTTTAAATACG
ATTTGTCGAACAATTTTTAACTATTTATGACTCTGGGTGACTAAGATATT
TTAGGTAAGGATGTGGCGTTTGTAAGACTTCATCTTTAAATCCAAATTGA
TGGTTTTGGAGAAGAAGTTGTCCAATTGTAGATGGTTTGTTTAGCCAGGG
TACTGAGAGGATTCCAGGAACTGATATGATGGACTATTTTAGGTCAGTAA
CAAAGATAAAGTGTCCTTTTGTTTTCACATCTTAGCTTCTGAGACTTCCT
AGCGTTATTTTCATCCTTTTACATATTGTTTATTTGATATGGGATCCTTT
CAAACGCCTAATCTCATCCTTCCAAGAAAATAAATTTTTCTACTTCCTCT
GAATGATAGTTTAATTAGGTTTAAAATAAGTCACTATTTATCTAATCGAC
CCTACACATACAAATATATTGTCCATTGCCTTTATTCTTCTTTTTGACAT
GGCAGGTTATAATGGCTGCTGAAGAAGTTGAGAAWGTAGTTTTTCAATTT
ATGAATACTCTTGGAAGAGGTCAAGACTGGAATGCAGAGGAATTTGACTC
CATTGCATCTGTCATACCAGCTTTCAAATTTGGAATTTTCCTTACTGTTC
TTGAGAGTAAATATACCAAGGACACAGATAAAGGAGGTCTAATTGAAGCT
GTCCGGGACATCCATGATTTTTTTGTTCTTGATGTCGTAAAAAAGGTGTT
TTGTAAAGAAAAATTTGATGGGAAGATTAATTAACTTACATAAATAATTA
ACTATTTGTTAGGGACATTTGGGTAAGAAAATGGATTTCCTTCCAGCATA
TCGAGAACACTTTTTTGTTCTTCAACCGAATCTGCTTTCGTTTTATAATG
GAACTTCACAAAGAGAGAAACGTGGTGATATAGTCGTTGATGGACAGTGC
AGGGTGGAAGTTCTTGAGGATGTATCTAATCGTATACCAATCAAGTCTCC
CGGCTCCAAAAGTCATAGTAAATTTCAGCTTTTTGCTCAAGAAAAAAACT
ACATTTTTCAAGCTCCGGATCATAGGTAGATATTTATCCATTTGATGAGG
TCATCTAGGCAATTATGGTTGTCATTAATACTTTCAACAGAACTCGATTA
CAATGGGTAAGCTCACTCAAGACTTCAATCAATCAATCTGGTCACCCCAT
TCGCTACCAGAGACGACTGGCAGAGACCAGACGTCTGATGCGTCAGGAAG
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