EMLSAT00000006827, EMLSAT00000006827-702674 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000006827
Unique NameEMLSAT00000006827-702674
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s385supercontigLSalAtl2s385:122699..145346 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000006827 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000006827EMLSAG00000006827-689593Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000029987EMLSAE00000029987-738915Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000029988EMLSAE00000029988-738916Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000029989EMLSAE00000029989-738917Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000029990EMLSAE00000029990-738918Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000029991EMLSAE00000029991-738919Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000029992EMLSAE00000029992-738920Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000029993EMLSAE00000029993-738921Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto772702auto772702Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000006827EMLSAP00000006827Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000006827

>EMLSAP00000006827 ID=EMLSAP00000006827|Name=EMLSAP00000006827|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=518bp
MTSEQFCLKWNNYQSNIVSALGNLKLDEDFVDVTLSCEGRTIKAHKVILS
ACSLYFRDVFRETPCNHPIIILKDTQYSDLESLVKYVYQGQXYISQENLS
SFLKTADALQIKGLAEQSQPAPSGSNESSPNSSPDHDQSPFPETINKNIQ
VPSFPAPPMSPVLSSSYPSQSSSATTLPRTSPIKIPTISHLKRSSFSNLA
QYLSGSNAMSSPPLNGDSSPPSIGNALSKKRKVTPPTKRYELPNYSGSTS
TASPGSPPHSHSTDGGGEHSLEMGEESDRDSARSIESTDLVKPPIISDYD
VSTKEHHHHHHHPQPMTHSPFHNHTHYHHPRLPLMVNDKKEPDDFGETLD
LSKNSSRHHHASTTYPTTNTTSNTTTTIPNISTHISGGVLEAALTASDPL
TSGRNIGTVPTPKRSSMHSSAPTSSSSSTTTNTXTXPPNGGLPSQSKDKD
GQGRNSLVSGQCPHCGNEYTNFSSLKYHVRLIHSEASNTLCCYLCPSSFV
GRASYKEHLISIHGVKHQ
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mRNA from alignment at LSalAtl2s385:122699..145346+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000006827-702674 ID=EMLSAT00000006827-702674|Name=EMLSAT00000006827|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=22648bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s385:122699..145346+ (Lepeophtheirus salmonis)
GAGAAAACTCCGTACTATTTCTTCATATGTATATTATTATATGATAAGTT TTCTTCTATAAAAAAACCAGGAGGCGGCTGAGGGAAACACACGCACTACT GTCCTCCTGCTAGAAGAAAAAAAAAAAAGAATGAAGTGAAATCTTCACAT ACACTCACGAATAACTCGGGACGACGACTTAAACAAAAAGGTAAAAAAAT GTTCATGAATTACTTGGATTTTTACAATACATATTTTCTTCAAAAAGACC CGAAGACACTCTTTCGTAGACTTCCTTAGTGATCACGTCTTTTATCTATA TATATTTCCTGTTTTTGTATGCTAATATCACCCTTCTAATATTGTATATC CTATCTAGACTCTGTTATTATCCCTAATTCATCTTCAACATCTAGAAAAA TAACATCCTCAGTCGGTCGCCATCAAATACAAACAAACAGACGCAAACAC CAATAATGAAAAAAATGATTATCCTTCAATATTATTGTTACTATTATTAA AAAAAAGTTATTATTTACGGAGAATTTTACACCTACTATGACGAGTGAGC AGTTTTGTTTAAAGTGGAATAATTATCAGTCCAACATCGTCTCCGCTCTT GGAAATCTAAAGCTAGATGAGGATTTTGTTGACGTAACCCTTTCCTGCGA AGGACGAACTATCAAAGCACACAAAGTTATTCTTTCCGCATGTAGTCTCT ACTTTAGAGATGTGTTTAGAGTAAGTCTTTATGAAATTTTTTTTTATTCA TTCCTCAAGATAATTGAATCAAATATATGTATATTATGACACAGATAGAA ACTCTATTACTCAGCACTTTTGATATGTAAATAAAATAACGAATTTATCA TCTTCTACACATATAACTTATTAGAGCCTTGCCACTTTTATATATATAAC TGTTTAATAATTTTATTTAAGAGAAGCCCTTAAAGATCTACTGAATCAAA ATTTATTTTCATTCATATATATATATATGTTACATGATAAATGATTGTAA TCAACTCGTTTCTTGTGTTTGCTTGTCTTAGATATTTTCAAAAATATAAT ATAACATCACATTTCCTAGAACGAATTATATAACTCTAAATCAATTATTA ATACCAAAAGTTCCATTTTAGCAAATTAATATCATATATATGTACACATT AAAAAGATGTTGTAATTATATTCATATTTACTACTACGATAGCAGATCCA TTTATTATCTTATAGGTAGTAAATAATCATTCATTATTATCTACATATTA CTTGTGACTCTCACACCTTAATTACCTTTTTGACTTAATTTTGAATTTTC TTTTAAAAGACTATAAAAAGCAAATTATTTTAAAAGAGTGCCTCATTATC TCGTGCTGGGATTAGTAATATTTTTTTTTTAAAACGAACTGTTGTTACTT TTCTTTTCTTTCAGGAAACTCCTTGCAATCATCCTATAATTATTCTCAAA GATACACAGTACTCTGATTTGGAGTCCCTTGTCAAGTATGTCTACCAGGG GCAGGKCTATATATCTCAAGAAAATCTTTCCAGTTTTTTGAAGACAGCTG ATGCCTTGCAAATCAAAGGTCTTGCCGAGCAATCACAGCCTGCACCCTCA GGAAGTAATGAGTCCTCACCGAATTCTTCCCCTGATCATGATCAATCCCC CTTTCCGGAGGTATCTACTACTCTATAATCTACATTTATATTTATATATA ACAAAAAATAATTCTTTTTTCAAGACTATTAATAAGAATATTCAAGTCCC TTCCTTTCCGGCACCTCCGATGTCTCCAGTCTTGTCATCATCATACCCTA GTCAAAGCTCTTCGGCAACAACCCTGCCAAGAACGTCTCCTATCAAAATT CCAACGATTTCGCATTTAAAACGTAGTAGCTTTTCCAATCTAGCTCAGTA CCTGTCTGGATCTAATGCCATGTCTTCTCCCCCTCTAAATGGCGACTCCT CACCCCCCTCGATTGGAAATGCTTTATCCAAAAAACGAAAGGTGACTCCT CCAACTAAGAGATATGAGCTTCCAAATTACTCAGGCTCTACTTCAACCGC TTCTCCAGGCTCTCCTCCTCATTCTCATTCAACAGATGGAGGCGGAGAAC ATTCTTTGGAAATGGGAGAGGAATCTGACCGGTATGTAAAGAAAATAGTG ACCATTAATACTTMCATGCTTCTATACCTACCTACCCTGTACTTAGACAC CCCGTTATTTTTTTCTCCTTTCGTGGAAGTCATTCATTGACATTTAAAAC AACAATATATTAAATACTTTTTTAAAGGGATAATTCCTAGAGTAGAGTGG GCTGTTTATGAGCACTTTATAACCTTTCCATCTTTTTTTCTTTCTTATTA TTCTATAAAACCATCATAAAAAGTCCATTCAAAAAATTTATTTATAAAAT GTATGAAGGTAGTGTTGTGTTGGTCCTTTCGGTCCAGTCCAGCCTTAGGA TCGGTTCTATCAGTCTTTAAGACTGTCAGTACTAGAATTGATTAAAAAGA GTAGAAATAGAGTTTAGTGAATTCATCAAGGACCGAGCTTAATTAGTTTT TAGGACTGATACGTAGGACTAAACTGGACCAGAGACTGAACTGGACGAGA CGGTACTGCAGTCTTCAGTCCTAAATAAGGTCTGKCCCACCACTATATAT AGGTACATATTACATATGTGGTGCATTAACATTAAAACAATCCTGAAAAA TGGCAAGAAACTTAAAAATATTATACTTACATAATATATGCAACACAATA TTTCATAGACCTATTTCGGTCAATCGTTGTCTTTATATTCAAATTTATGG GAGGATATTAACCCTTATCAAATAAAATTGTGTATTCCTTCACTGTGACG ATGAATTTTGACTACTTTATTGAGGGATAACCCAAGTGGGTCCATCATAA TAACTTGTTGATATAAATACACGATAATTATTCGTCGAAGAATACAAATG TAATTAATACAGACTCAATTTTGAGCAAAATCGTCCTAGCTTGTTTATGT GTTGACGGACGACAAATTATATATAATGTATAAACATAATCAAGGGTCTA TTTGACACTGTCTTTTTTCTTAAAATTTCCTTTCGAGCTCTCCTCATTTG GATACTATGTTATAATATTGTGAATGTAACTTCATCAAATTATCTATTGA AAGGAGTTGCAATAGATACTTGGTACTAATATAGTGTTGCTTTAGTCTCG AACAACTGCTCTTAATATGTACAATATATTAATGATTAATATATTGTACA TATTATAATGCGACTAATTCATCATAGTGTTGTTTTCATGTATGAGGGAA CAATTTATAATTGTGCTGAGCCGTTTGAAATTTCATTGAATTAATTACTT TTAATCTAAATATACCTATGTTAATTGTATAGAAATAAAGGGTAGTCTCA TTAAATTTAACGGCACTAAATTAAGAGTAATTTAATTTTTTATGGGACTC TTAATTCCTGACCATCCTGTATATCTATATTAATAAAGCAAAGTGATATC TCTCTGTGAAGAACTCATTTTGAACAACAGTACATAATAATAATGAATGG GGCTTTAGATGAAGTTTAGCAGTTTGTGATTAAAGCTGAGCGTGTCATCT TGAACTGGACCGAAATATTGGTCCAACAAGCCCCAGCCCTCCAAGCAATC CCTGATACTTTGGCTGTAATACAATATATTATAATTGTTAATAATAACCT GATTTAATCAAAATAACAATAACAAAAAGAAAAACCCTTATTTGATGTGA AAATATACAAAGAATGAAGGATTTAAAAAAAACAAAAAAAAACACTCTTG TGTTTAAAAAAAAAAAAGTAGAAATGACTTGCATCCATTTTGTATTGTCA TTTACCTTTTATCAAGTATTACAATTGATACTATTTTGATATTGTACATA TTATATTTATACATGTAGAGTATATTCATTGACATCACAAATTGTATCAT AATTTAAGGCGACACCATTTCGGGGGAACGGAGGGTTCATCGATGATATT TTTACTAAATAAAACGAATTCCTAATTAATGTTGATAAAACTTCATCAAA GGGCTTAATAAAGTCAAAAATACTAATAAACTTGTAATGAATGCTACTTA ACACCAAAGAAAAATAGTGATATTTGAATAAATATCCAGTTATTTATAGG CACTACTGAAGATCCCTATGAAATGGTGAAGATTTTTGTAATTAATTATT TTATGGATGGYTTAGGAACGGGAAAAGTAGGATAATTGACCCTAGCAAAT GTAATATTTAATTTAATGTACTAAATTATTTAAATAATAACGTATAATTA TGTTATTAAACTAGGGGTGAGATCCGGTCTCAAAGTGTGTTGTTTTTTTT TGGTTCGGTCTTATGTGCTTTTTCTCCACACATGCGGATAAAATTTATTT TCCAAAAAAGTCATACATTATCATTTTTTTTGTCTTTTCAATACAAGACC GGTCAAGAAAAAAAATAAAAATATGACAGCTGATTTCCAAACCGAAACTA AACAATAGAAAATAGTATATTTTTAACACATCTGATATAGAATTAACTAG ATTTTGGATATTTTTTAAAGTTAGTAAAGGTTTAAGTCCTTTAATTTATC AGTCCATTTTAACATCCAAATATATTATGTAGTACCATTTACCTGAATCT GGATGAAGAAGAGGTTTTTACTTTTATAAAACATGGTTGCCTCTTCAAAG ATGGCTGGCATCAACAATGCTGATATCACATGAAAGCGTTCTATATATGT 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AATAAAACTAATCAGGGAAAAGAAACATAAATGTCTACAGCAAACAACAA AATGATGTGTTAAAATGAAAATATCTACAGCTAACGAAATTTAATAGCCT TTAATATTTTGTGTAACGTGAAGTAATGTTGTGTTCAGTCTTGGAAGAAT AGTAACGGTGTTGTACCGATCTAGGATTTCTAGACCGAACCCCAATACAA ATATATATTATTAGTATGTTGACATATTATAACTAAAATATCTGGTTGAA GTTTGTAATTTTATGTAGGACTTAAAGAGAGAGAACGCAAAACATAATTT AATAAACATGTTTAAGTAATCTTTGAGACATCTTATGCAATTCTCTTGCT CTATGCATTTTTTAAAATTCTTTCAAGGAGATCTTTGCATCATACGTAAA TATATGTATATATTCACATACTGAAATAAAGTGAAGTCTGTTTTTACTGT ACACTTGAAAGACCCTCATTTATTACATATCTAATGTATATTGATACTTT TTGCTTCAATTTGAATTTGGACCTAAAAAATAAATATGTTGTAAACAAAA AAGGTAGACATTTTGTTAGTGACCATTTCGTCCCATAACTTTATACCCAT CATATTTGATAATCACGAATTTTAAGCAGTTTGAGAATCTTTGGCTCAAA AGCTTTACGGATACAATTGCAAATATGTTACAATCAATGGATTATTCGAC AAGAATAAATACGAATTTTCTTATCAGAAAATTCTGGAATATTGAAATAT AAACAAAATTCACCACCATTAGATCTAATTAAATATCCCTTCCCCCTCCC AAAAACAACAACCACTTAAAATAAGTACCCCGATAATAACCCGTGAATCA ATTAATTGTTTCCCCTTCAAAATCCATTAATAATTATTATTTTACAAAAG TTTAAGCATGGTCATTTCATCATAAACATTGTAGTAAAAGGCATATTTTT GAAGTTATTTCATAGTTTTGAATAAAATGAACAGTTAACTGATACCATTA TGTGCCAAAATGAAGCTGAATGATATCTGAAACAATTGATTTTGTCCCAG AATTTTAATAACAACAATAAAAAATTTAATTATCTTATCCTTGGCACACA AACCCATGAGGAAAAGTACGAATAATTCTCATGCTGAAAATTGGCATGCA AAATAAAAATAGTGCTTTAGTTATTGTTAAGCCCCTTAATGCCGACTAAA ACAAAAAAAAAAAAACTATTTTATGTAATAATTTTAAATGAGCCTTGTAG CCTGTGGGTGAAATGTCTTCAATGCAGTTAATACAATCAGAAAGATACAT CAATGAGTGGAAATTATCTCTAAAGAATTATGATCATTCCTGATTTGTAT TCTAATAAAAAATGCCGGACAATATCTATAACTTAAGAGTATTTGAAAAA AAACAACAACCTTTATCAAACCATCAGTATTGATGGTGATGGAAGAAATG TGTATTTTGTTGAACGCGGATAGAAGGGAGGAGAAGAACTTAATAAATAA TACTTGAAAACTTTAGCTGCCTGTTACATCATTTTGGAGGGAGAATAATC TGATTCACTAATTGTGTTGGGTCGCTCTTTATTTATTCGGTCCAGTCCAT CCTAGTCGTTTGACTGTTGTTCCTAAACGTTTGGATCTTGAAATTTTTCC TAAAAATATCAACCCAAATAATACATTTTATAAATGTATTAAGAACATAT TTTGCAAAAATATTCATATTTTCATTATAATGCAATATAAAATATATATT TTATATTGCATTATACAAAAATAATAATAAAAAACAGGAAAAGAAACCTT CAATGACGTCGTGAGACATTGATTTTCCCTTCTTTAAGGACTGACAAATG GGATTGGACTGGACTTCGGGCTGGCCTCATTGTATAAGTTTACCCGTATG 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CACAAGATTTATTAAGAGTGTAGAGGAAGGGCTGTTCTTAGTCCCTTCTG AATCCATTAAAGTTACCTACTAGTCAAAATTACCTGAATTTCTGTACTCG TACAGACAAGGTATCTAGTAGAATTTTCTTCAAAATTTAAGGACGTACTT ACTCGTAGATATCGGATCTGTAATACTTTTGTACACTTATAGACATCATA GCATGAATTCTTCAGAACAATATTTGAGTAATTATAATTTTTAGTAGGGA AGAATTGGCCACCTTCAGTGATTCTGGAACCAAAGGTGTCATTGATCCCC ACCACTTTTATGGAATTTTTATAGTTATCGCAATAAAAAAATGTTCAGCT AGTCTAAAACTGTCTTCTTTTTTTTTTTAATCTCATTTGCTCAAACTTTA TCTCTCCATAAAAGTTTTGTCTCTAAAATTATTCCAAAAATAGGTTTATA CATTTTAAATTGTCTCTTCTTAAAAAATAGCTCTTTGGAAAATTTGCTAT TCTCTTAAGAAAAAAAAACCCGAAAAATATGGTCATGCCCCCTATACCCA AAATATATACATATATACTAAAGACCTGTAAGCGAAGGCTCATGTGGGCC CGCTACAAATGAGGCAGAAGAACTGAGAAACTTCTTCAATGGTATAATAT GAGTTCAAAAGGATATATTTATCAGATTCAAATATATTCCTGTTCTTAAA ATGAGGCCTATTATAGGCTTGATATTGAAATTAAATGATTTAATTCCAAG ACTTTAATTTATGAATGTCACTAGCCTGATTTTTTTAATATAGGTATATG TTTGACTATTTCAATCTGATAAATATTTTTTTTTCCATAAACATATGAAA AATGGTCGATCAAATGGCCTTATGAGCTTATGTTACGTCATTATGGTATT TTGTCAACTCGTCTAACCCATTTGTAGGGGGCGGACTAGAGCCTTTGCTT 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