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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s389 | supercontig | LSalAtl2s389:496005..548127 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000006878 >EMLSAP00000006878 ID=EMLSAP00000006878|Name=EMLSAP00000006878|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=387bp
MAHGLKDEEAMMSLNENGIKVVPRRKETSYFGTKTKISVVCLTLVLIGVG AALVLGYPRRPSRGHRIHTDFDGDVNNFIMTEEIIHPKDNHLDSIEGHDI ILAKVSDLRSSFNNRFPRDHSGGQQYRYNLEEVPESFWRTLTYADRNTDE RKIQDIFNGMDINRDSKADPWELHDWIIVVQEAVQSSVHQRQWEQFRKDE NDTITWTDYIYQVNPTGKSTPDMMHRFTRAHRRWQHADQNGDDGLDIEEF KIFLFPYTLDRVALNIIIPETMDDLDLNFDGTVSKEEFLQIHSPDQRDKM SEYFENTLDTNNDGYLNSYEITPWVNPEGFVAVKSEVIHLMEVLDADRDK LLSMREIQRNPTLFLASQVTSFGQIYTMAHNLRSPTQ back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s389:496005..548127+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000006878-702725 ID=EMLSAT00000006878-702725|Name=EMLSAT00000006878|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=52123bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s389:496005..548127+ (Lepeophtheirus salmonis) CGTATTCATAGAATAATAATAATAAAAAGAGGACCTATATAGAATACACA
TGTATAATCCAAGTCTGTAATAGTAGTAATCTCCAGGCTTCCAGCAGTCT
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TCTATTATGTAAATAAAGTTCCAGATCATTTGATTGGAACTGGCTAAAGA
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TAGAACACATATGTACTTCTAAAATCTATATTTCTCAAATAAGTGATTTC
TTGTTGAGGAATTAATAATAAAAGATACACTCTATCATAAAAACAATATA
ACCAACCTACTTAAGTTATTTGGTATTGATGATTAGTGTTGTGTTATTCC
TCATTTTATTCAATCCAGTGCAGTCTTAGGACCGGCTCCATCAGTTCTTG
GGACCAGTGTTTAAGACTGTCAATACTAGTATTGANNNNNNNNNNNNNNN
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ACAGAACTAAACTTGACCGTACCGAGACTGAACTTGACCAGACTGTAGTT
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TTATCCTGAGTCTGTTATTAGTTTTTTCGTATCAAACCTGGTTGATTTAT
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GTTTGAAAAGGAATAACGCTTTGGTTTTTCATATTGATTTTATTACAAAA
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GACTGTCTGGAACCCTAATTGTTCATACGTAAAAACAATTGCAAAAACGA
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AAAAACTCCACAGCAATTCACAAAAAATTAAATTTTAAACATTAAATCTT
TTAGTAGAAAAATTACAAAAATCCGCAGCTATTAACAAAAAAATTAAATA
TTTAAAAAACAAATTCAAATATTTAATTTTTGTCATAAAAATTTCAAAAA
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TTTTATTTTCCACTAAAAAGCAAAAAATCCTTAATTGAGGGGGGGGACAG
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CAAATTTCCTAATATTATCCATTTCAAAAATGCTGATTTTCGACACACTC
TTCAGCTTATGTTTCCAATGTCTCAAAAAAGTGAGGGTGTATTCATGTTA
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AAATTAAAACCTATTCCAAGAGTTTAATAGTTATATTATACAATTTGCTA
AGGTTGTATTGGTACTTAGTATGGGACATAAAATCCCTTTCTGTTATTGG
TTCTTGAAAAGTCATCATCTCTAGAGCGCCCTCTACGAGAGATTGTTATT
ATTAGTATTACAGTAATGTACATTACTCTGTTTATCAATTATATTAGTAA
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TGAAATTAACTGGTTTATAACGTTGTTTAGTAAAAATTGATCTATGAGAC
GGTTTATGCAATCGATTCAGACTCGTCTTTAAAATTAGGCCTAAATTGGA
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ACAATAATTTTATTGATGAACTGACGAAGATAATTTACTCTAATATTAGT
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AATTTGAAGTACCATATTAAGTTTTGCTTTTGTGTTCTTCAAAATGTTTG
TTTTTATTTTTTTAGTGCATGGTAAAGATTCAGATTTCATGTAGAAAAAA
AGAAAACAAAAATCTTGTCTACAAAAATTATAACATGAAAAAAATAGAAA
TTTTTACCCCCAAAAAAAGTCATTTTTACACCGTTCTAAGCTGTTTTCTC
AAATTCAGAACAAGATACATAAATTTTGGAAAAAAAAAAATTAAAAACAG
GAAACCTTTGTTTTTAATTTATATTTATTCTTTATCTCTTCATGTTGAAA
ATTTAGTCCGAATATTGAATGTGCACTAAAAAAATTAATCTATATACCAC
AAAAGTATAATTTTCATATAAAATGCACATTTTCGTGTTATTGGATATTT
AACCAAATATTATCATTGAAAGCAAGGTAGTTGTCTCATGTAATTTATTG
ACGCTACAATTGGCAATTATTGGAAAATTAACACATGGTAAAAAGTCAAA
TTAATCGTTCATATTAAAACACTCCCGTCCTAAATCTTAAGAATGCCTCT
GAATGGTACGCAAAAAGTTGTCCAATTCATAAGAATATTAAATACTTTAA
TTAGGCCTAAATTAAAAATATTAGCAATATATCCTTGTGTACGAAAGATA
CTTAAGTTTTACTTTACTATAATATTGGTGAAAATAATACCTTGTGGAGA
ACACTTTAAAATTTGGGACTTGTTCAAGGACCTAAATCAGGGAAAAGACA
GATTTTAAGTCCTTTAATAACGATACGACCCTAGTGAAATGTAATAGTAT
TACTTCTGTTGTTTCAAGGTGTCCATATAAAAACCACATTTTATTTTTTT
CTCAAATATTATACCTTTAATTCATTTACCAATGAATCCATATAAGATTT
TATACCTTGAAGACCATATGAGTATATTTATCAAACTTATTTATCTAATA
GATACATCAGAGAAACAAGAAATAAGATTATCTCATTAATAATATTATAT
TTGGTCCATCATTTACTCTTATTTAAATACATATAACATAACTCAAAGTT
AATCTGTCTTTTAATACATACATTGATTTAAATTTTAAGGTTGATTGTAA
TTTATATCTTTTTGTAAGATGATAAAAAAAAATGAGATTTAAAAATATGA
TGTTGCCTTTGTTTGACGAATATTTAGCCACATTTCGTATGCAATATAAT
CTTACATATGTATGTACATACATGGTTGTTATTAATCACCGCTCCATCCA
TTTTCCGGCCTTTTCTTTATACTCCTAAGTATTTTCAAGGGTTCGATATT
AATTTCAAATATCCGTTCAAATAAAGTCATAATTATAAACACAATCTGAA
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AAATGTCTGCGAATGTCCTTTTTAGATACGGAGTGGGATTACTGTATTTT
TTTTTCCTCATAGCTGATTGAAACTAATCTAATAAAACATCATGACAGCT
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AATTGCTTGTATAAAATATGAACTTGAAAGCATCTGATACTTTTTGTAGT
TGTAACCTGAATTTGATTTTTTTATTTTCTAAAGCTGTTATCATTATTAT
TTAATTTTTGAGGGGAGAAGTTCTCTCTAAGTATTAAGATCGTGTGATCA
TATATAACGGAGAGTAACACTGTGGATTTTTGGGGAGTTATCGTTGGACT
CAGAGTAGAATTGAGGATCGACATCTGTGTAATTCCTACCTATTCCCTTG
CTAGATACGGAGTATAATGTGTGTATTTCCTTACCTTCATAGCTACTTGC
TGCTGATTGAAATTAACGCTATGTCAGGTAAGCTGCTCTCCTCCGAAATA
TTCTTTAAATTGTCAGAGTTACCAAGTTAATGTCCAGTTTATTTTCTTAG
GGGACCGGCAGGMCATATTTTAATCACCTATATCATATTCAATTTATGTT
AAATTCTCATGACGATCACCGGGCAGGAGTCAGTTTTGACGGGCAGTAAT
TTACAACAATCTTGTATACATGGGTGTGATATATGATGATTACAAGAAGG
TCCTTGATCCTCAAATAAAATATATAACTCATTTCTTTATACAAACACAC
ATAGGTGTGAATAGATAAAATACATCTGTATGTTTTAAGAACTCATGTAT
CAATTCTCTCCTTACATTTATTTCTCTGTTTATATATATCTCTATGATAT
CTACGCAGATACAAAATGAAATCATAAATAAATATTCTACGAGTCCTTAC
TACATACATATATATTTTTGCTTAATATAAGCACCATGTATTATTTATTG
AACTTCTGTTAAATGCATTTAACAGAAGTGAATGTAAAACATATATATAT
GTAATTGCAAAAAAATGTTGATTTTCATAGCTAACATATACATCAAACAT
CTAAATATGAATTATGGCGCTATTCTACGAACATAAAAAATTACACTGTT
TTTTTTTTGTTAACTGTTGATTTTTATATCCATCAAAATTAATTAATTGA
ACAACATTGATTAATCAAACTCGAATTAGCTGTTATTAGCTTATAACAAT
TTCAAGTACTATTAGAGTTGAATCGGTCTAAAAAAAATAACAACTAAAAA
GACTGCAGTCCCAGTCAGTCAGGTCCAAATAAAAAATTTCAGTCCTAGGA
ACGATCTTTTATGGTAACTACAACATTTGAAATAACGTAGATCTACTTTA
TGTCAAACATAATTTCAGATGTTCAACATATCCTCTTTCACGAGACTCGA
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AGCAATCAATTATTATTTTCTTCGTTTTGATATTATTCAATCCTAACTAT
GAGTTTAGAAAGTCTGTCCTAGGACCGATCCAACACTACCTACTATACAG
GTTCCTACATATACTTAAGTCCAGACAAAACAAGCCTTTGTTKAAGCCAT
ATTATATATATATATATTATTTAATGTCCAATAATTAAATGTGATTCAAT
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CGTTCCTTTTTTGATCGGTTATTATATTCTACCCTTAGAACCCTATCAGA
TTTTTTTACACCTTTTTTTGACATCATATACATACTCTTGGCGTACCCAG
TCAGCTTGACAATTTCCAACATGGTTTAATTTCAAGATGATGGCTCCATG
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ACAAAAAATTGATGACTATATGTTTGGATATCATTTTACTTCAGATAGAC
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GGTGGTATTACATGCCATAATAACGGGGAAAAATATTTGTAGGTAGAAGA
CATTTACCCATAGGCATAAATAATTAATTATAAAATTTCTCAAATCAATA
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ACATTCAGTAACTGTTTCATATTTAATATTTGGAATAAGTTTACCAACTA
CCAATTGATTTTACGACTTTCTTAGTCGATTTGGGTTTAGGAAAGGTTGA
GAGATACCTAATATATAGATAACATAGGGTTTATATTTTGCCGTTGTTAA
AATTTATCTCCATTGTCTACAGCTCACCTACTAAAATATCCTGATAAAAT
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ATATTGACATATCGGTTAGCTCGTGCCATAAAATTTTTTGAACGTTTTGG
GTATGAGACGAATGTCAGCGAAGTTTGTTCCGAAACTACTTAATTTTGAC
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GTATTATTTTCATTTATGGTAATTATATTTATTGCCTCTATCTAAATTAA
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TTTCGAAGAAGTGTGTATTCTCAAAAAATAGGATATTTATTGTAGTTTCA
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TATTACATGCAAATAAATTAATTGTAGGAATGTATTATGAAAAAAAATAA
TGAAACACCAACACTTATTATATTCATATACTTCTGGCTACTCCAAACTT
TTATTTGTTTTTAGGAATTCAATGAACTTTCTACATAATATAGTTATAAG
GGTAACTATCTGTATCTTACACTGCTTAAGGAATTCAAATCAAAAAATTT
ATACTTTATTATATAACCCTTACAAAAAATTATATTATAGTTTATTATAT
AGAGCATCCTTTTTGATCAATGCACGTAGAAGGAAACTTATATTTTCGTA
TATTTTTTTTTGAAGGTGTGAAACTTTGATAAATACCAGGGAAACTAGAT
TTGAGATCCTGTGAGGGAAACTTCAATCTGTCCTTAAATTCTACATAATA
GTATTGTACAACTTTATTTAACAAAATAATCATCAAGTTAATAAAATGTG
ATGTGTATTGCATATCTCATCAACCTTCCTTCACTCTAAACAAATAGAAA
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CGTTTTTCAATAATACTAGGAACATAATTTTTCATAACTGAAGAAGGGAT
TTGTGTAAAGAAAAAAACTACTCTTCGCGATTAGAAAAGGAAAAATGGTT
ATTGCATGCGTTTTTTCTTCTTTTTGCCCATTATTTAATCAATCGTCGTG
CGTGTGTTAAATTCTTCTTCTAAAATAAGGATTTTTGCCCATCATTGGTT
GAAATTGATTTAAAAATGCATAATAAAATAAATATATATGATTTTAAATG
TAATCATAATTTTTTTTCTGCACTGATGCTATTTTAAATGTCAAAGGTTC
TCCTCTTTATAGCAGTAATTCATTTTCTTACTCCAAAATCATATAACATC
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TCATCACACTCTTACAAGAATCCCATCCCTGTTCATAGCTTAATAAGAGT
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GGATTTTTACACTGTTTACGGCGTGACAAATATGTACAATGTACGTGTTC
ACGTATTTACATGATATTTTGCAATGATGCATTAGTGTAGTTAAAAAAAT
ATATATCTACCTATAGGAATAAAGCCTCGTGTTTCTATTAGTAGAAGTGT
GTACAAAATTCATTGCAGATTATATGGATAAGGGATCCAAATAAATAACT
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GGGAAAAAGTTACACATGAAACTGTGATAACATATATTTCAATTATCACA
TTTTTATTTTACAATTATTCAAAAATAATAACTTACCTAGGATGTACATT
TGAATATTTTGAATTTATTCTATCCCCTCCTGATACTTCCTGAATAGGGA
AAAAATGTGTTGTTTTTTTTATTTAGAGAGAATACATCTCATCTCGGCAC
TTGTTGACAAAGTATTGAGATCATTTATATGCTGGATTCCTCCGATAGGT
TAGCATCAGGGCTTTGCGTACGGGAGCCCACAAGTCAATTTTTAGCATGA
TGAAGTATCATGTCTGGCTAGATGTAGTTATTCACATATTACCAATCTTT
CTATCACTTCCAAGATTCCTTTTGATGTTGTTCTTCTTCATATTTAATAT
TGTAGACAATAGATCAGGACACCACCAATATATATTGTGTTGGTGTCTTT
TCTACGTCCAAAAGTGCGTGGATTTGAATTTGTTTACCAAGTTCGAAAGC
TATTTTCTCCTTATAAGAATGACATTGTTTTTATTTGGCTCTTTTTTTAT
CAAACGAAGAAAAACTGTGTACAGAGTGAGGATCCAAACCATGCAATAGC
AAGGCTAAATTTCGAAAAACGTGATTCTTATGGAATCAAGAAAATACAAC
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ATGTCCACCTTCACAATCAATAACAGCCTCGACACACCGGTGAACAGAGT
GGCAGSTCTTGATGATAAAGGTCGTGCCTATGGCGAACTACGCTGTCATG
ATGGCAGCTCGGACCGAACCGAAATTTGGACCAGCAGACATTCTCCTCCA
AAACACCTAAACTACAAAGTCCATGGTGTTGAGGTCAAGATTGAATGAGG
GCCACCTGGAGAGACACAAAAAGTCAGCCATATTATTATTGCATAAGTTT
TTGTTCTTCTTGTCCGTATTGGGTTGTAATGGGTTTCTTGATGTTGTAAG
CAGTCCGGATAGAGATTCCGGCGGTCCCTACAGCCTTGTTGGCACTGACG
CCAGGGCAGAGGAGATCACACACGCATTGCCGTTTTTGTTGGTGCACTAA
CATTTTTACATTTAGAGACATGGGATCAAAATAAAACTTGTTTATTTTTA
TTTCAACAATCGTTTGGCTGCATAATGAAATAAATTTTGTACTTAACTCA
TTTTGTTGTAAGTTTTAACAAACTCCATCTCACCCGGTATATATGTATGT
ATTTGTTGGCCAAAGAATGAACGATTGTGTCCTTCAAAAAGAGTTCAGTC
TTATGTACGTACATACATACATTGGTATATCCATGGAACCAGTTATGTAT
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ACAATCGTCTTTTGCATCAACGTTTCTAGCATACATATGATATGTTTAAT
TTTAAGTGTCGAGAGGCTTTTTTTGGCACCTCCTTTCATTATTGCACTAT
GTATGAATCATCAAGGCCTCCTCTCTTAAGCCCTTTTAAATACTAGTTAA
TAAATGCAAAATTAAACATAATTATTTTAATGTATTTATGATGTACTTGC
CATCATTGTTCTATAAATATCTTTCWGATGAAACATTAAAACACCTACTA
CAGAGATAATTAAAAAGTGTGTTCTTTAAAGTATTATAAGATTTATAATA
CAATATACAGGGATATGCAGATAAATTGGGAATTTATTCTTGGAAAATTA
AAATATATATAGCATGGTAATTTATTGATCAAATCTAAAGAAAATTTGTG
AAGTTGTTCCCAGTGACCTTGTGTTTTGATTGATTTGATGTGACCTCCTC
CAGCTTAAATAACCCTTGCGATCCTTAGTCTGAATTGTTCCACAGCCTTG
AATAGATGATCAGGTGGGATCACCCTGCAGTTCTTGGTGATGTTAGCCTT
TAGGGAGATAAGAGCATTTGTTGACCTTTTCTTGAGAATGACCCATAGAG
AGTAATTGAGAATGTTCAAATCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNAAACGGGACCCTCTCCTATAGGAATGACTGAGTTACCCTGAAG
TTAAGGAACTGGCTGAGTCCTGCACATGTGCCACATTTTTCGAACCAAAA
TTCAACTCCATCCAGGGAAGCAAGACGTCCTTCATGTACTTAACTGTGTT
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GGCCAAAGCTCCAAAAACCATTACTCCAGACTGAATTATTGAACCTCAAA
ACTGGATGGATAGACGATGACTCTTGCKTTTGACCGATTAATTTCTGCGT
CCACCATAAATTTTTTCGTCCATAACGACTTCAAGTACCTCAAAAGCTTC
GGACAGCGATCAGTTCTTATGACCTTGGTCTTTCTTGTAAAAAAAAACAA
CAACAATATAATATGAAAGAAAAAATTCAGCAAGTCACAGCCAAGCAATT
TTTAGCAAAAAATTCTAAGATATAGTCATTTGAAAAATTCCAAATTTATC
TGCAGGGCCCTGTGTGTATTTGAAATGACGTTTCAGCAAATGCATCGTAT
TATAATCAAATTTCCTGATAAATTTAATTCACTGGACGTATTGTAGGTAG
TTATTTTATGTTTTTAATTGTAATATTTTTTTAAAGGTTTAATTATACCT
ATATGTAGTGTATGCAATTTATACCTATTATAATGATTTATTTTAAAAAT
ACATACATGAATTGTAAAAGTATACGCTGTATGTACCTATTTGTCATTAT
GTTGAAAGATTGTGAGTAATAGAATGACTCAGACATTCATATAGGTATTT
CAATACCTTCACCGGAAATGAAGTAATTTACTCACATAAATAAGTGTATT
CAACCTCTACATATTAAATAAAAATCAATATACCCGTATGAATCTGCATC
TATGCTTACTATGGATATTCGTTTATAATGTAAATTTATAAAAGTCCCGA
ATGATTTATAATTAGTGATGAAAATCCTGTCTTAAATGGGTATAGTTAAA
AAAAACGAAAATCAACATGGTGACCTTGACAATTTGAAGAATATTTTGGT
AGAGAGAAGGAATAATGCTCATGACGTTTCATTAGATCAGCTACAATCAG
CCGTGACAAGAGAGGAAGGAGAATAGGATATAAACAAAGACCTTTGATAG
AATTACTCCGATGGCAAGCACCATTTCTACTCTGAGTCCAACAAGGAATT
ATAATTACCACTCTACAAAAATACTGAGGGTTACACATCGTCTTTTAGGA
GTACGCACGAATGTTCAATCAGGTTTTGAATATAATTGAATCTATTTAGG
AAAGAATATTCACTCCTCAGGAATTAAATAATAATGACATCTGCTAAGGA
AAAGAAAATTCACTCTTCAGATTACCCATTCAAAAAAAACCGGTCGTGCT
AAAAAATTTACAGGATTTACATCACTGGTTATGATAGAGTTGTACAAAAT
ATGACCTCAAGGTATGTAAATGTAAAAGAAACCGAAAATTTACATGGTAA
CCCTCACAGTTTGAAGAATTTTGTGGAGGAGAGCAGCTATGCTGTCATSA
TATTTCTTTAGATTAGCTATGAGCAGCTATGAGAGAAATTATATAAATAT
ATATCCTACTCCTTATATAGCAAGGGAACATATTCATGAATTATTCCAAT
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CCTCAGTGTTGCTCTCAGTCGTTGATGAGCACACGTACTTTATACTTAGA
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TATACGTCATGAGGAAAATGATAGAAAATCATAAAGTGATATTATTTCAT
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GAAATTAAAGAATAATGAATTTGGATCAATAAAAGCACTGTTCACGTTGC
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ATTCCCACTTCCCAGAATTATTTACTCACCGTCTTTTCACATATTCGTAA
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AATCACACATTTTACACGTCGCCCGAAGKCCTTGCAAGAGTTGAAGATAA
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GGTTTTTCTTGCTCCTCTCGAACCTCCTGATCTTCATGACCTCTATCAGA
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