EMLSAT00000006894, EMLSAT00000006894-702741 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000006894
Unique NameEMLSAT00000006894-702741
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s390supercontigLSalAtl2s390:257697..273584 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000006894 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000006894EMLSAG00000006894-689660Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000030285EMLSAE00000030285-739213Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000030286EMLSAE00000030286-739214Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000030287EMLSAE00000030287-739215Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto775418auto775418Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000006894EMLSAP00000006894Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000006894

>EMLSAP00000006894 ID=EMLSAP00000006894|Name=EMLSAP00000006894|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=133bp
MSESSDEESRLYDALEAASEASYKFRTSSQLEEGGPVLEDDYLLTEYSRF
LSVTNDYSSPSSIQRERYQIGQRISALYTQDDRWYPAKILSFTTLENGER
KYTVRYKFHGNLEELESSHIRKRKARNNFVNAR
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mRNA from alignment at LSalAtl2s390:257697..273584-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000006894-702741 ID=EMLSAT00000006894-702741|Name=EMLSAT00000006894|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=15888bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s390:257697..273584- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGTCAGAGAGCTCGGACGAAGAATCTCGACTCTACGATGCCCTTGAAGC TGCCTCCGAGGCTTCTTACAAGTTTCGAACAAGCTCCCAGTTGGAAGAGG GTGGTCCAGTTCTAGAAGATGACTACCTCCTCACTGAATACTCTCGGTTC CTGTCAGTTACGAATGATTATTCGAGTCCTTCTTCCATCCAAAGAGAGTA AGTGTGGTTCTATCACTTAGTAGTAGTATTGGATTTCAGTTCCTCCACTC ATTCCAATACATACTTCAATTATGCTACATTCCTATCCTTGGAGTGGATT AGATCTTTGTTCTTTACTCTTCATTATTATTATTTACTTCATATTTTCTT TCCCCCCTTTTTTGACAACTTGACGTATGATATTGCTTTCATATTGATAT AGTATGGAAATTTGAAGTTCGTAATTGTAATTCAACTCTTTCTGTATTTA ATTTTGTACCTATTTAGGCAGTCCTTTTTGAAAGAACTGACTAAGGTGAA GACTGATAAATATTTCTTTAATTAATTAATTGTAACGAGATTGGTTATAA ATGTGTCATACTCATGACTCATGTTGATGTATCAACATGACACAATATGG CGTGTAAGGTCATAACTCATAACTGAACAGATTCAGAAACTCTCGCAGAC TTTTTGAATGGACTTGAGCCTTATAGAGGCCTATGTCTTATTTACAGAAG TTGAAAATCATACAAGCTATTGAATGAATTTTTATATGAGGAGGACATGT GCATCTAGATTAAATAAATTCAGCGGGTTAAGATCTGGGTCCTTCGGGAG GCAGGATTCCATTGAGTTGAAGCAAGACATTTTTAGCTTAGTTTAAGATG AGATTGAGGTCAGTCCTAGAAGGAGGTTTTATGTCGTTTCTGAACTTCAA GCGTCTGGAAATAGTGTCAATTATTCTAGAGGAGCCTCCAGCTTGCTCGC AATCTCCATGTTTGGCAAACCCCACGGAGAAGTGAAGAAAAATTTATTCT AAAATCAAACAATTAAATTGTCCTCTACTAGTTTATCTCTTAATACTTTT GTTGATAATAAACATCTTAAAATTTAATGACAAATAATAGAAAGACAATT ATGCAACGTCAGTATTTCTCTCAATTATGGCCTATATATTCAAATTTATA GGAATATTATCTAAAAACTAAGATTTTTATTTAATAAATGATACTTTTTT GGCTCCAATATGGCCTCAACTATAGTATAATCCTTTATTTTGTGACCTTG TGGGTTCTCCGAAGAATTCATTAAAATAATATATTAATAAAATGCAGGGT AGTTATTCGCCATTTAATATAAATATAATCCAGACTCATTTTTGATGCAA ATCATTCTTGGTTGTTTTTCTATTGAAAAGACATACGTGCTTTTCATAAA GGAACAAATCGGTCAATATCGACTGTTGGAATCAGTCGAGTTATGGCACA GTTTATAGGACTATATCTTATTAATTGTACGTTAAATTACCAATATATTA TGAATAATAGATTTTTTTAAATTTCTTTATTTAATTGCATTTTTTTAGGA TCAGAAAACATCCTATGATGCTGAAGTATACAGTGGCCCCTAAGAAATAA GAGAAGAATTTATATCCTTTCATAAACTTCATACCTCAATTTAGACATGG CAGTGAAAACCTTGGATATCTTTTTTGCATCAATATTGTAGTGAATGAAG ATAATCAGAATCTCTGAAGTCTAAGCAATTCATTTACACTAATTTCTTTA TTTATTCCCATTGATAGTAATGCTTTTCTTCTTTAATGGTTTATTGGAAT GTTTTTCGAGGCAATAAAAAAGGAGAGATAATATAAAATATTTGCTATTC AAACTGGATAAGAACTTTTAATTTTCTTGTTGATAAAATTGTGCTTAAGG ATGCTCGATTCCCGAGAGATAATTGACGAAAAAAAATTCTCTTATTTCGT GGGACCTGCTAGTGTATACTCTACGTCTTTTTTCTATAAAAAACAAACAT CAATACTTTTTACTTCAATGATACAATTTTTAATCTATCCTTGTAAATAT ATCATATTCTTTTTCCTAATTTTTTCTTGGACAAGTATCATCGAATTATT GAGTAAGGATATTGCTTTAAATGATATTGCTAAAATTACTTCAATTAACA AGTTGTAGCTTTATTATGTTCTTTTGAAAACTTAGAAATTTATAAAGTTG ATTTTAATTATGTGGAACACGGTACATTATTGGCGTTCTTTCACTCACTA GGATAGTTTTTTTATAGTTTTCTTCCAGTTTAGTTACTATATTCCCTTCT CATTTTGTAAGCAGCCCTTATCCGAAACCTGTCAATTGATTTTTATGATT TTCCGGGATAAGTTTTTTGATAAGCATCATTTTTGTGTCCTAATATATCT ATTATCTCTCCTTTTAACTCACTAATTAATCACTGGTATTTTCAATTTGA TAGGGGATTATACTTGGGGGAGGTCCATATCTCTTTTATTAATTAATCCA TTTGTCCTAATTTCTCAGAATAACCTATACAGGAAGCAGAGGGTATTAGC CTCCTCACTTTTTGAGAATGTACAATGATAGCAGTAGAAAAAGAGACTTC TTTTCATTATAGTTTATGGGCCGAACCATGATACAGTCTTGATTACATTG TATCAAAAAGCTATTTAGATCTTTTTTAAGTCTTTGCACTATATTCTATT AGGTATATGGTCAACTTTACAATGATACCATTATTTAATTTTGGCTTCTC AATATTGTTTATTTATTGTAATATATGTAGGATGTTAATGGTGGATCAAA CTGTGAGCCCATAATTTTTTTAATACCTTATTTATACTAGCTCATCATTT CCTTAAACATTAGTAAGTTATTCGTTTTATGCTCTCCGCCCCATTTTTTT TTGCTTCTTAAAGATGGGATTTGTAGAAAGTCCCTATTTGTATACAACAT GCACAAATAATTACTTATTTTGGTAGATTAGCAACTCTTCAATTGTAGTT AGGGATGTAGGCCTCAAGATCAGTTTCTTCCCTCCAATCCCTTGATTTTG TCTTTGTGTTGCCCCTTGAAAGTTTTGGGTAGGATTTTCTTGATCACAGC TAGGTACAAATATAGATGTAATATCGATATTGAATGAAGGGTTTACATTT CAATATTGAGAGTGAAGCGATGGGCTGTCGGCGGTTCTAGGAAGATTGAC TGCAGGAAAATAGCGATAATTATAAAAATTACCCACAAGTATAAAATATA TATAGTAATCCATCGAAGGAAATGGGGTAGATAGTTGTCCCAATCTACAG AAAAGCCGTTGAACATAGATCGTGGGAATTTTTTTCCCCAATAATTGTAA ACAATTATTGGGTAATTAGGAAGGGTCCTTTATGGTTTTTGAAGCTGTCG GGAAGTTTTTGAGATGCCCCAATTTTATACAGTACAACCCTTTACCTGGA GTATAAGTGTTTTTACAGAGTCTAACAGATGAACCCGGCCAAAGTTTTAC TTAAGCAATATGAATGACAAGGCCATTACTGTCAAGTTAACGCAAAAATA TCAACTACAGCCATGGAAGTACGCAAAGAGCTACTATTTCTGAGTTAGCT CGAGCAGGAACGGTATCATAGACTCCATTGGGTATCCCAGGACGATGCTC TAAAGCGTCTGAACGAGTCGGGGGATGTCATCCAGAGACCCCAAAAGCGA CAACAAGAGGAACCTGACATTCCTGGTTGGTCTGAAAAGGTAAATTAAGG CCAACCCCAAGTTGAATCTAGTTAAAGACACTTTGTGAGCACAATAACTG 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GTCCTTTTTCTTGATTTTTGTTCAAGATTGTTTATATGTTGACGTACTAC ATGTATTAAATTAAAAGGGTTGAAAGATAAAGAATATTTAGAATTTATCG AAATTAAAATCTTCAAATTTTTTGCAACACATATTTTGAATATTCTACTT CTTTTCTCCTAAGGAGTTCTCTGAATGTTGATTGTTTAAAATTACACAAA CTCTTATGGACGGCGCTCATTTTTCACTCAGTCTCCAATCTTGTCAAAAA GTACCACTTCATGGCTGCTTGGTTTTCAGTCTGAAACAAAGCTATTCATA GCCTGAAAAAATGATATTCGTAGTTTTAAAGTTACTCATAACTTATAATT AACTTTAACAGAGTTGACATTTTTGCATTGAAAAAAGAGCGCGAGGAGAA GGCGGGAATAATACAAATGGGGGTTCTACTGAATTAAGTGCCTTCTTTAT AACAGCTGGTTGTTATATGATTCACTTATGAATTAAGATGGGATCAGTGT AAAGAAAAAACTAAGTTAACCGATTAGAAAAGGAAAAACGGTTGATGCGT GTGCTCTTTCTTCTCTTTTTAATTATTTAGTAGGTCATTGGGATATTAAC ATATCTCTCTGAAAGAAGAATTCTCGCCTATGTTTGGTGTAAATCATTTA TAAATGTATAATAAAATAAATATATGTGAATTTAACCCTATAGAGACCAG TGGAGTTGAATATATAAAGGTGAATAGCCTTTTGAGTTTTTGTTCTAAGT TGTAATTCAAGCTAGATTATTATACCATATTATATTGTTAATTGTTGTAT AGTACCTTTTTAGCAAGTTTGCAAAGATAAATAAAAATGAGTTATACAAA TGATTTTTTTGGTGTACTTCTGAAAGGACACAGGTCCATATAGGGTTAAA TATAATTATAACATTTTCCCTGTAATAATACTATTTCAAATATAGAAGTT TCTCTTCTTTCTAGAAGTTATTCATTTTCTGCCACCAAAATCATATAACA GGCAGCTGATATTAACAAGGGTCTTAATTCAGTATTACCATATGTCTCCC TCCCCCCTTCTCCTCGCGCTCTTACACAAATCCCATCTCTACTCATAACT AGATTTARGTATGTGACCATGTACCATTATTATATTTATTTTTGAAACCC TCAAGTGTTATCCAAATCTTAATGATAATTCCATTCAGCATGGTAATTTT CTTAAACTTATTCCACTTCTTGTATCTTTATGTTCCTTCTATTCATCTTT AAGTTAAATTGTGGTGATAGAATTAGTCAAAGACATATTTTAATAAATGA GCCAATATCTATGATATAATTGACGTGTCGTTCGTTTTTAACTTTTTCTT ACTGGAATTAAAATAAAATAAAATGAAGGGTGGACAATTATGGGGGGGGG GGGAGCAGACACCTTAATGTGTGGGCATATAAATAATTTAATATTTTCCT TTTAATATAATCTCATTATTAGAATAAGAAAATATCAAATAAATTATTGT CATTTTTGTTGATATTATATACATAATATTTGTATTGTATATGCTTAGAC ACTAACGACCTGTTATAATATATTATAACGAACGAGGTTTTTTTATTATT TCTTCATCTATTTGTACAGGGTAGTCCATAATTAGAGTCCCCTTATAAAT TAAATTACTCACAGATTATGATTTTTGTTAGAATATGACATATTTTTACT TTTTACGGCTTGTTTAATATTGTRATACTAATATCTCATTTAATATGCTT GTCCTTGTACAGAACCGTGACCAATAATTTTGCTTCGAACATTTTTACAT CAAAATACAGGCCAGTCCAGAATTACATTCCCTTTAACTGTAACGTCATT TAATTAAGATTATGGTGTGTTGTGATTTCGTTACCCAAATCAGAAATATT 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