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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s390 | supercontig | LSalAtl2s390:257697..273584 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000006894 >EMLSAP00000006894 ID=EMLSAP00000006894|Name=EMLSAP00000006894|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=133bp
MSESSDEESRLYDALEAASEASYKFRTSSQLEEGGPVLEDDYLLTEYSRF LSVTNDYSSPSSIQRERYQIGQRISALYTQDDRWYPAKILSFTTLENGER KYTVRYKFHGNLEELESSHIRKRKARNNFVNAR back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s390:257697..273584- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000006894-702741 ID=EMLSAT00000006894-702741|Name=EMLSAT00000006894|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=15888bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s390:257697..273584- (Lepeophtheirus salmonis) ATGTCAGAGAGCTCGGACGAAGAATCTCGACTCTACGATGCCCTTGAAGC
TGCCTCCGAGGCTTCTTACAAGTTTCGAACAAGCTCCCAGTTGGAAGAGG
GTGGTCCAGTTCTAGAAGATGACTACCTCCTCACTGAATACTCTCGGTTC
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GGCTCCAATATGGCCTCAACTATAGTATAATCCTTTATTTTGTGACCTTG
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GTTTTTCGAGGCAATAAAAAAGGAGAGATAATATAAAATATTTGCTATTC
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ATCATATTCTTTTTCCTAATTTTTTCTTGGACAAGTATCATCGAATTATT
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AGGGATGTAGGCCTCAAGATCAGTTTCTTCCCTCCAATCCCTTGATTTTG
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ACAATTATTGGGTAATTAGGAAGGGTCCTTTATGGTTTTTGAAGCTGTCG
GGAAGTTTTTGAGATGCCCCAATTTTATACAGTACAACCCTTTACCTGGA
GTATAAGTGTTTTTACAGAGTCTAACAGATGAACCCGGCCAAAGTTTTAC
TTAAGCAATATGAATGACAAGGCCATTACTGTCAAGTTAACGCAAAAATA
TCAACTACAGCCATGGAAGTACGCAAAGAGCTACTATTTCTGAGTTAGCT
CGAGCAGGAACGGTATCATAGACTCCATTGGGTATCCCAGGACGATGCTC
TAAAGCGTCTGAACGAGTCGGGGGATGTCATCCAGAGACCCCAAAAGCGA
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CCAACCCCAAGTTGAATCTAGTTAAAGACACTTTGTGAGCACAATAACTG
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AAAGACCAACACGTGGAGAGCTGCACAAAAATATTTCAGCTGTAGAAAAT
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GAACAAGTATTTGTTTCAAAAGGACTCTGACAATGCACGGTCCCAAAATT
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GGAGCCCATGTCAAAGCTGGCCAAATACCGTTATGTGAGCACGATGAGGG
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TGACATCATATGTTTTTTCAAGTACAATGACTTTATACGATGTTTAAGCA
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GTTTTTTTTATGTGGAAGGAAAGCAATAATAATAAATAAGTAATTAAAGA
TAATCCAGAATAATACTCTTTGTAGATTAGTAAAAATTTAGTTGATTAAG
CGTACTTGCGTAGTGTGGGTAAATATATGTAGTGTTAGATTCGAGTCAAC
ATTTTCGAGTTCTGTTGAATTTGAGTCATTGATGATTTCCTAAAGATATG
TAATGTAGTAGTTTCTACTTTTGAACACATTAATGCCGACAATGTCCTGG
CAGTAGTTTTAACTGACTCCTTAACAATTTAACATTATTTTATTAAAAGT
GTWCTTTTWTAATTTTKWTTTTAAGGTTTTTGACATCKTTTCYCCCTGCA
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TTTATTTTTTAAACTTGCAACTTCTAAAAACATTGTTTTACGAAAGTATT
TCTCATTTTGTGTGGCAAGCAAGAAATCTTTCCACTNNNNCTTTCATGGT
TAATACTAGTGCTGGCAAAGTCCTTTTTAAAATCAGGCCTTGGTTTTAAA
AAAAAATGAATTAATCTAGAACAATTCACAAAAAATTTAATTTTTTGAAG
AAAAAAAAAATCAAAATCCATAGTTACTCTGAAATAAAAATTTATGGAAT
TTTCTAGAAATCCATAACTATTCTCAAAAAGTTAAATTTATAAATTAAAT
TTCAAATATTAAATTTTCTCGTAAAAATGAAAAATTCCTTAAMCGGAGGG
AGGTTACAGCCTCTCTAGCCCACACCTTGTGGACGCCCCTGGAATTGAGG
ATCCTATGTTCTTTCAAGATACGGTATGGGATTTTTATTGATTTCATTCA
TCTCATAGCTGCTCAAAGCTAGTCTAATGAAATTTTATGACAGCGCATCT
GTTCTACTCCCAAAACATTCTTCAAATTGTCAGGATCACTTTGTTGATTT
TCGATTTTTTTACCACACCGGCATATCATATTTTTCCGAACTATAGTTAT
TGTTATCCTAGAAACTCTAGGATGCATTTTATTTTACCTGTGTTCAATTG
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TCTTTCGAGTTCGAGTAATACTGGATTCCAACACTAATACGCAGTATGTA
CATACTTACTCTATGTGTTTTATACAAAATAATCTACGTCCAATGAAGTG
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AGAAATAAATACTAAATGCCCCTTTTTCTTATAGATAATAAAGGCATGTT
GTTTTTTTCACGTTCAAGCTTAATTCCGTCTTAAATACTATAGGTGAAAA
AATGTAAGCTTAGGGGATATGATTTCTCTCTAAATGAAAACCCTTGTATT
TATCGAACTGTCTTTCATCATGTTACTAGCGGTAGAATACGCCATTATAC
GGAGTAATTAGGTGTCGATGAACATATAAATTTGGAGCTAGGAGTACTTC
AGCTTGTTCCTAAACCTCTTATTAAGTCACATTCATTTTTTTAAATTTTA
TGTATCTCTTTTTTTCCTTTTTTAATATGAGTTGAACTAAACGTCTGCGA
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ATTAATTATGATGTACATCATAAAACAATATTATACTACCTTTTTTCTCC
TTTATTCTGTATATGTAGTGGTGTGTCAGGCCTTAAGGCGAGTTACCACA
TCTATCGTGCGTCTACACATGTAAGTGTATGTATATATACTTATATAAAC
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ATCGATACAACACTATGTACTATGTAGGTATTTGAGATACATCAGGCAGT
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CATAAACATCACATTGTTATTTCCTACATCAAATATATAAATATATGATA
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TTGAATAATTTTAAAATTTTATAGTTACACATATATTTTTAAATTTTCTT
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CGAATACGAACGCCGGGTGTACGCCCAAGAACACAAATAACTCCATACAT
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CTCTTATGGACGGCGCTCATTTTTCACTCAGTCTCCAATCTTGTCAAAAA
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TTTTACGGCTTGTTTAATATTGTRATACTAATATCTCATTTAATATGCTT
GTCCTTGTACAGAACCGTGACCAATAATTTTGCTTCGAACATTTTTACAT
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CTAGACATCATTTTATTCGAAGTGTAGTTCCCTGAGATACGTTTAACTCC
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TGGACTCCGAGCAAAAATTTGCCATGAGATACGATTTTTTTTTAATTTTC
ATTTAATTTGTCATATGGAGTTGCACTGATTAAGTATAAGTAAACAATAT
GGTATTACATTTACTCCATCTGATCTAGGGGTGATCTTTGAAAAACATAT
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TGTGAACATATATTAGATATGTACGTGTAGTAAACATAGATAAGAAGGAC
CTACCTATTAGTCCAGCTATCTCCCCATGATTTGATTCCTTTATTATTGA
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TTTATTTATTTTATTATGAGGGTTTTTTATTTTATTTTTATACTACAATA
TGTATTAGGTATTATATATTCTGTGGGATTCAATGTGCTTACAATTTTCA
CATTGGTTTTTGTTTTTTCTTGCTTTATTTAAAAAATACAATCTTTTTAT
TTCTTTTATTTATATTTAATTCAAAATTTGGTATCTAGATTGTTACTTTA
TTTCAGTTATAATATGAGAAAGAACAATAATAAATTAAGCCCACTAACAA
GGGAGCATTAAATTATATATATCTAAAGAATAGGTACATATAATTTAAAG
AGTCGTCCCCTCCAGATAATAATGTGTATAAATATTGAATGAATGAACGA
GGCTTGATTAAATTTCTATTTATATATTATGCCATAATCGTCTCCTCCAT
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GAAACAAATTCAAAAATCCATAGTTATTCACAGAAAATTAAATTTTTTGG
AAAAAGTTTAAAAAACTAAATGAAATTTCCAATATTCCATATTGTGAAAA
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GGGGGGGGGGGGGGGTTAAANGACCCNCCKGCRCKCCSCCRSSGGYCGCC
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AAGATATTTGTTTAATATAATGAAAAGATCAATGACCGTTGATCTAGAAA
ACTAGAAATTCGAACTCATATAATATATGATTCCGAAAAAAATTGGCCCA
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GTGTAAATAATCACTTAAAACCGAACCGAAAAAAAGTTTGCGGCTGGYGG
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GTGGTATTTTTACTCACGTTGGGAGATATTTTCTTTTGGGTAAATAAGTT
TTTATGAATAAAAATGTGTTGAGTATTTCAAGAATGCTTACCTCCCGTTT
TTTCTCTCCCCATCCTTCCCTTTTACGGTGAATTGTTTCATAGAAATATA
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ACAACTACAATAATCATTTCCTTTAGTGTTGCATTCAAGTTAGGTATAGT
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GCATCAGGCAAATAGATAATTGATAAAATCATGTTCAACAATTAAGTCAG
TTTGATCACCTCAATTAGGAAGTCAATAAGTATTAGTGTTGTATCAGTCC
TCATTTATTCGGTGCAATCCAATCTTTGGACCGGTCCTATTAGTCCTTGG
GAATGCTCCTTACAACTTTTGGACTGTGAGTACTAGAACTGATATAAAAA
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AGGACGGATATGCAAGACTTAAGTGGACCAGACCAAGACTGAACTGATCT
TCAGTTCGGATCGACACAGCACTAATTACTATTGGTTATGTTAGAAAATC
TGATTTGCATGATAGAAACCAAAGTTGAAAGTCAATTAAATGTACTATGT
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGG
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TCGAGTTTATTTGAGTTTTTCAAATACTATTTGGAGGAAGTTTGATTATT
TTTCATAAAATTGTCAACTTTAGTAAAGTCAAGTTTATTTGAGTTGGAAA
TCTAACTCTTATTTCCTTTCTTAAAAAAAAGAAAGAAAGAAGATGATGAT
TGACTTTTTCTCATTGATTTCATTTAAATAATAATGAAGTAGCAATTAAA
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ACATATTAACCAATGACTTTTGTACATATTAATTAATAAATAGCTAAGAA
TGGTAACAAAAGATCGAAAAAACAGAGGAAATATCACATAGTATGTACAT
TAAATAGCTAGTAGCTTGAAGTATAGTGTAACTTTGCAAGACAATAAAAA
AATAGTTTCTCTTTAAAACTTTGTTTAACTTGTTGAACTCTTGTATCTCT
TCGGGGTTTGCCGTGAAGGCGGTTCTTTACTTCAGAAAGTTAATAAGTTT
TAAAAAAATAGGCACTTGGTGTATGTAGGTAACATATTGGAGGAAGTAAA
GAACCTGTTTACAAATTATTATTATTGATTAGAATAACACACTCCTTGGT
GGCGTTAGTAACTAGGAAATACTACTAACCTAAGGAATGAACGATTTGTT
CGAAGGTGATTTAGGTAAATAAAGTTACATATTTTAAGTAGAGAAAAGAA
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GCACTAAATACAGTTTTTTCAAAGAAGGAATCTTCGTTTGAGGTAGTCCA
GTGAGAGAATTTTTTTAAAAAGATTTGAGATCACTTTTTTAAACATAAAG
TATATACATGGGTGACTTTTCCAGTACATAATTTTGTTATTTCTTTCATT
TACAGAAGGCAAGAAATAACTTCGTGAACGCGAGGTGA back to top
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