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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s390 | supercontig | LSalAtl2s390:87184..144140 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000006903 >EMLSAP00000006903 ID=EMLSAP00000006903|Name=EMLSAP00000006903|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=611bp
MTQICPFDKYPLKDSHLLLLVLGHSALSRRESGIAKVLGKMTKKFSNKLA RSADILFLKDLVVNKACDRAKKALQDEAPKSWLPITHDSIRLIEQAKSIC EQRIYLDEAKELFSLISSKWLHAVLEIHDEVAAQIQNNTEEVEYIDGVSS IDCDDEELGVDDKRRLIFNEPEGKGSDDKKEEEEGLTVRVENGRITVARI LSESLIDRQGLLRVGDVILEANGKKIRTPEELLKIFEGKSDLDEIRSSGK LSTITTVSSSGAASNPSQAKERTLNSVNLDEELEGNNNPYDVNEFITLKI EPAMTDDTLSTKDDDGKHYIRANFNYDPRKDNLIPCQDIGLKFKAGDVLE VCIKVVCMIFIYKIVEWSDPSWWQARKVNYKEPPGLIPSQDLEERRKCFV HFDDADYNQLYCCSAGTKRNKRYFDYFVSQNIDFDRAELFLYEPVEKMPP FKRKTLALVSHPALENSKNKLIERIIDYNPDKFAEAKRDSTGYLEGITFA SILQIMKESKLCLIDCQPDSLKLLHNSVNFLPYVIFLTPPSVHKIEVFDE GTKEGANTIRRKSKEIALEYNTYFDQTIELEEIDSTIKKILDSMEKLATE TQWVPRNWVYS back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s390:87184..144140- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000006903-702750 ID=EMLSAT00000006903-702750|Name=EMLSAT00000006903|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=56957bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s390:87184..144140- (Lepeophtheirus salmonis) ATGACTCAAATTTGCCCATTCGATAAATATCCTCTCAAAGATTCACATCT
TCTTCTTTTGGTCCTCGGTCAGTGATACATGGGCGCTCCTACAATACGGA
CACGCACGCATTCATTCATTCAATAAATAAAAGAGAAAGATTCCACTCAA
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CTATAAAGTACTATCACTATTTTGATAGTTCCAGTGACATGTTAAATAAT
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GATGACGTAATCACCCCCCATTTCCATTTTATTTTATGGGGGATGGGAGG
GGGGGGTGAATTGCAGCTAATTTTGACCCTATTTTTGTTCTAAATGACCT
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AAAAATATGTATTTAGTATTAAAGCAGAGTGAATAAGAAATAATTTCTAT
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AAGAAGGCTTTGGACTCAAGACGCACCTACAAATAATAATCACAGGGGTG
TAAGTCGGAGATGTTTGAGAGCCATTCATGAGGAGCCCAAAAATGAGATT
TATTTGACTGCAGTAATGCCAACATCTTTTTGTCTGTATGGGCATGGGAT
GAGCCCTTCTGGAATGTGTATTGGCTCTGTGAAGCGTCTTGATTCATCCA
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AAAAGAGAGCTTGAGCTCTTTTAAAATGATAGATTACTTCGTTTTCATTC
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ACACATTTATGATATTTATATATTTGTCATTTTCTTGGCAATTTCTTGAA
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GTGTTTAAAGTAACTATAAAAACATGACACATATCGAAGAATAATTCGAT
ATTATTACCAATAGGTAAGGTTACTTTATATTAAACATATTATGTATCAT
AGCTGTTTCTTGTTAATATAAATCAATTATGTCTTACACTATTGCAAAAG
ATATATTCTATTAAATTTATAGAAAATTTGTTAAGTTGTGTGAGGAAAAC
TAAATACTTTTTTTTCATTTTCCATTTTCACTATTAGTTGGTCAAGCCAG
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TTCCCCACTTGAGTCATAGATCCTTCTTCTTTATATAGTGCCCAATACTT
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CTTTTACTCATTTTGCCTCAGGGATATTTCGCCTTAAAATATAAATAAAG
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NNNNNNNNNNNNNNNNNAAAATCATAATCCATTATGTAAAATGATAAAAG
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TTATTGTTTACATATTATTTTAAATCGAAATATTTATGAGGCAATATGGC
TTTTATGCAAAATAGTTTAACGCAAAATGTCCTGAGGAAAAATTGTTTAA
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ATTTAAGTACATTCTTCGTTGGTAATTCTTGGGAAATAAACTTTTTAAAC
CATATTTGTTATATATAATTTTTAATTTTTATATTATAAAAATTACAATT
TTTGTCTAAAATATTTGTTAACCTTAAAACTTGTAATAAATAAATGTGAA
GAAGACAAACCATTGCTGAAGTTGTAGTTTGACATTTAAAAAATATTAAA
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TGGCTGYGGCATGATTGTCGMGTTGTTTTRMGCGAAACAAWGCYYCAATT
ATTTTGGTCAAAATTAAGTAGTTTATGAACAAACTGACACTCGTCTCGTG
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ATTTTCAAAATCAATTTTCTTCACTGCACCAACGTTTTCATCTGTTATTG
TCGTGCTAAGGGCGTTCAGACTTGTCATTGGCATCTACTCTGCTATTTTG
GAATAGTTTCTAATACTTGCAAACATTTTTTAATCAGTACAGTTTCACCG
TGTGTCACTGTCAACTTTTCAAGTATTTAATTTAACAATCTACACAAAAT
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TGTAGCCACTATGCCTCTCACAAACAAACTAATCATATTATATATCTGAA
CAGTAAATATATACTCATGGCGAGTGTAGTAAGTTTAAAAAAAAAAAAAA
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TTTTGAACACACCTTATATTATTGTATATAATACAAGAAAAAATGAATTT
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GTAAAACTACACTTAAAATGAAATGAAAGATGATATTTAATTTAAATAAT
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TTATTTTATGTCATCAAGATAATAATTAATTTATAAAATTATTTGAATTC
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TTGCTACATGTCTAAAGTATTCTTTGAGTTGTGATATCAACATTCATGAA
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GAAAAAAAAATGAAACTTTATAAAGAAGTTTTAAATTTACTCAGCAATTT
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TGGCATGCATCTTTTTAGCTGTGCTCTATTCTACGCAGTATCATTTAAAT
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TGTCCCATTATATTTAAGGAAAAAAAAAGAAAGGTCAATATGAAATTATT
TATTTTTTGATTGAAATACACATAATTTAATTTATAATTCAAATCGAAAT
GTCTCAAAAACAAAACAAAAAAACCTTTCCTCCACACTAAATTTACATAT
CTTGTGAATAACTTATATAGCTAAAANNNNNNNTACAATTTTACCAGGAT
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GGTAATCTAAAAATTAGTTTCAAATATAACATTGTTATTCATATTCTTAG
TATTCCATTATACATTGTTAGCTGAAATTAAACAACCGTTTCAGGAAATG
TGACTATTTATAACTGTTGAAAATATATGAAAATATTGATACGTTTTGAT
ATGGAATTACCTATAAGAAAATTAATATTTGCATCGATTATGTACCCAAA
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AAAAAGGGAAAAACACACAAAAAAAATCTGAGGAATACGAGGTTTACACA
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ATCTAGGAGTATATGAAAAAAAACAGATGAATCCGAGTGGAAATCATATG
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GCCCGAATCCAGGTTAAAACAACATGGCCAATGACCACTATGTACTCCCT
GGTCCCAATTTTAGCTCCCATCTCAAATAAGTATGGGGCTTAACTTTTCC
ATCCGACTCTAATACTCCAATGACCACTATTTTGGCTGTTTTTTGTTGTT
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TTGTCATAATTTTTTTTTTACAATTTAACTATTGTGCACAAAAAAAGTGA
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TGTCTGGAAGACCTTACGGAGCTCCAAAGTCCTCGAAACTTTGTCATTAC
GTGCATTGACGTAGAAGGAGAACTTTAGGTATGTCCATCTTTTTCTGACT
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TCTTTATTCAACTGATAATAATAACTCCTCGTTTAATAGCTTATATACTT
CTTTCAAGAATTCTTTATTTTGATTGGTTCCCGCGCAAATATTCAGTAAA
TTATTGAAATCTAAATTACATTGTGTTTTCCCTCTCCCATTCCGTATATA
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AAAGATCCCCTCAATTCTCATATTTATAATGGCTCCTTTAAAATATAAGT
TGATCAAGTTTTATTCTGCTATTTTTCTACAATGTACATATTCTTCCAAA
TATTTTTTTGGTTGAACTCGAGTTAGCTGTTGCTAAGGGGTGAACAATTA
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TTAAGTTATGCACAATTCCACATTATTAAATAAAGATTGAACAATAGGGT
ATCTTTTTGAGAAGAAGATTTGGCTTACTACCAATGGATTTTGGGTGTTT
TTGCTTACTTTTTGGAGAAAAGTTTTAGAGATACAAATACTATGAATATA
TTTATGACTCTGATTTTATTGTAATTTATTCCACTGATCTTTCCTTATAT
TTGTGAATAATATGAATAAATAATTTATTTTCGCTGTTCAAGTCACGTTA
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TTGAGAAATAATATATATACTTTAAAATTCTACATTTGTATTCAATCTAT
TTTTAAATTTCATGCTGCAATGATTCAATTCTTTCCCACTTCAATATATC
ACGTAATCACCTTTATTTTACCTCGCAACTTCTACATCAAACATAAAAAA
AAAAAAAACCCAACAAAATTAATTGGTARTAGTTAGCCAATTCTTAATAT
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ATTCAACCAATCATTGTTCAGAACACTAATTAATAAAAAAGAAGTAGACA
AATTGACAAATAACAACCAAAAAAATGAAATTTTTTGTGTAATTGAAATA
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GTGGATAACATGTGTATTCTTCTATGAATTATCGTTCATCTTTATCAACA
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AACCAAAATGAATCATCAAAATAAAAGCATTAGAAATTGATAGTACGGAT
TGAAATGGCCTTATTGGGCATAATTTAAGCATCTTATATTCAATAAAAGT
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TTATGTTGTAGAAATGACATACATTAAATTAGTAAACCCGTTTTACCTAA
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CTCAATTTGTATGAAGTAAGCAAAAAAAAAGCAACACCAAAAACTCGGCT
CGTGTGTCTAAAATGCGAGTATTTATTCGTAACTCGTTAAAAATTATTTT
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GGATTGAAAAAGTTTAATACCTTTTAGCAGCAAAATTCAGCTTGCAGCAC
ATCACTTTTATTATTTTTCATGGAATAAGTAAAAATTAATAGGAAAAAAA
TTATGTGTGAGTGATGAGCCTACAGTTTGTTTGCTCCAATATGATTCATT
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TGTTCACGAGCCCAAGTCAAGCCTTGGGTTTTTTTGTCTCGATTCCGATT
SGAGCCACTATCAGTTCTGGTTTTAGGGAGAATAGGAGTCATTTGACCTT
GTCTCTGCATAGTCTACATATTGTGAATAAAAAGGACCCAGTAATGGGAC
CAGCAGTACCGTAATATACTTGGAAGTGTTGAGCCAAATTATACAACGGT
TACGTCATAGTTTTGTAACTTTACAGTTTTAGTAAATAAACATTACACAT
ATTTAAAAAAGTGAGGGCCAACGGGATCTTAAACCCTATGGTTCCGGCGC
CACTGTTCGTGACTATGAGTATGTTCTCCCTCTTGATAAAATTTTGTTAC
AGCAGATTAAAAAAATTTATGCCTTCAAAAATAAATCTCTCATAAAAAAT
GTCATTCAAACTTTTTATCAAATATGTCAAATTTTGTATAAAAAAAATAG
TCGTTTGAAATTTCTTTCAAAAAAGAAAATAATAATAATATCACATGAAA
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GGTAGGTTCGCGCCCCGTTCATTGCTAGAGAAATTTAATACTATAATGTT
TACTTATACTTAATCACAGCAACTCTATCTAACCAATTAAAGGAACATTA
AAAAAAATTAATAATAATAATGTCAACTTAAAAAAATTATGATTTAGTTA
ATGTTATAGAATAACCGAAATAACCCCACACTTTCTCTTTGTCTCAAGCT
CTACTCTTTATAATTTCGACTATGGTCAATAGAGAGTTTAAAGATGCTGT
TGTTCAACTTGAGTCTTATTTGTGAGACGAGCCCCCTCAGATCCAATTCA
GTCATCAGCAAATATTAAATTCAATTATCCTATACAATGGCACTTAATAT
TTGAATAATATTTGATCTATAAAGTAATTGTAAAAGTTCACCCCCAAATT
TGATACGAAAAAAATAATAATAGTTTATTTATCAACTAGTAAAGTAATAC
AAGGATTAGATATAGAAGTTAAAAGATATTTTTTTACTTGTTTAATCAAA
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TCCTTTTTTGAGTTAAAACTTTGTAGGTTCGATTCACAGTCCCTTCTATA
CAGGGGAATATACATTATGTATATGGACTTCAAAGACCATTTCTAGGTCA
GATAAAGTAATTGCAATACTATAGTATTTACTTATACCTAATGGGTGCAA
CATTGTGTCTCATGTCTCAAATCTTGAATATTCTAGAATGAATTTTCTAA
CTTTGTGCTCGAGTCTAGTGTAAAGTTGCAGTTTTGTGAGACGTAATTCT
GACTTGAGTCCCAATCTTCAGCTCCGTCAATATTTAAAAATTCATCTTTT
AACTTAAAAATGAGTAAGGGAACAGAAGAAACCCCTTTTTTTGAAACAAT
GAAAAGTTACACAGAACGAGTCTTAGCTATTTTGGGAACCTATCCATAGT
GATGAAAATTGTGGTGTTATTTTGGGTGTGTTAAAAAAGGAAAAAGAATC
AGAAAATCAACATGGACACCCGGACAATTTGAAGAATGTTTCGGAGAAGA
GCAGCTTAGCTGTCATGACGTTTTATTACATCACCAACAAGAAGCTATGA
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TCGAGAATACTGAGTCTCAATTCTACTAGGAGTCCAACAAGGATTTACAA
CCATAACTCTGCGACAAATCCTTATGATCCCACACGCATATTCAATCAGG
TTTTGAATATAATTGAATGTAGTAGGAAAGGATGTTCACTAATMAGGAAT
TAAATAATAATAAAACAGCCAATGAAAAGAAAATTCATCTTTCAGATTGA
TCACGACAAAAACAGGACAAGTGGAAAAATATATGCACAAGGCTAAAATC
CAATATCTGGAAGGATAAGGATAAGACTTCCTTATTTTTTTAGAGAAAAA
ATATACTTTACATCGGCATTTTTTTAAATTCTTGAAAATATTTATCGATT
TACTTTATTTTTGACAGGAGTACATTATTATTATTTTTTTAGTGATCTTT
CTTAGCGACACAATAAAAAATAATCAATCAAGCGCCAGTACTATTAGGAG
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GATTTTGGAAAATGCAATAATATATTTTTTCCACAAATATTGATTTTATA
TTAGCTATTAACATTTCTTCATTGTAGGAATAAAGGAGACTTTTTGGCAA
GTTTTTTATCAAATATATAATATATTTAATTAAAAGTTATCTCAATATAA
TTTATAAAATGGGATTCTTCTAAATTAGATGGGTGGATATAAATTGTACA
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TACACTATTAATAACTTATAAGATTTAGAGTTAATGCATGCTTAACAGTA
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ATCTTTTTCCCGTAGTTACAAGTAATTATAAAGAAATTGATCTGTTTTTG
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AAGTTATAGTAGAAAATAGTCTGAGAGGTGTGTTCAGCTTAATATATCTT
ACGTAGGGTGTCTCCTGTAGTAATCCCCAAATAATCAAAATATCATACAT
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CAAAATCCTATGAGAGGGATTAATCAACTTCCGGTGGCAACAGTCATGAA
TGTCAGAAAAATTGCTTCTGAAAGCATACATGTTGAACTTATTATMGGAC
TGGACAAGACCTAWAAAATCCTWKAAGGAGAKCTTGKCCGCCATAAAACT
CCCTTGGCAGGACGGATTATTTATGTGTGTTTCATTTATTGTATTTTTAG
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AAGTTAGGATTGTAAAGTGTCAGTAAGTAAAATTCCCTGCAATCAAGTTA
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