EMLSAT00000006920, EMLSAT00000006920-702767 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000006920
Unique NameEMLSAT00000006920-702767
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s391supercontigLSalAtl2s391:540984..570159 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000006920 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000006920EMLSAG00000006920-689686Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000030408EMLSAE00000030408-739336Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000030409EMLSAE00000030409-739337Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000030410EMLSAE00000030410-739338Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000030411EMLSAE00000030411-739339Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000030412EMLSAE00000030412-739340Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000030413EMLSAE00000030413-739341Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000030414EMLSAE00000030414-739342Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000030415EMLSAE00000030415-739343Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000030416EMLSAE00000030416-739344Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000030417EMLSAE00000030417-739345Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000030418EMLSAE00000030418-739346Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000030419EMLSAE00000030419-739347Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000030420EMLSAE00000030420-739348Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000030421EMLSAE00000030421-739349Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000030422EMLSAE00000030422-739350Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto778486auto778486Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000006920EMLSAP00000006920Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000006920

>EMLSAP00000006920 ID=EMLSAP00000006920|Name=EMLSAP00000006920|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1201bp
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IYTDMDKVRDEIIRKTNLIAGENKGVSKEPISIKFFSPHLLNLTLVDLPG
ITKVPIGDQPEDIENQIKELIQDYISNPNXXILAISPANTDIATSESIKF
AKDVDPTGARTLAVITKLDLMDAGTDAXDILCGRVIPVKLGIIGVINRSQ
QDIIDNKSINDAVKDEEAFLKRKYFKLASRNGSVYLGKTLNRLLMCHIKT
CLPEIRARINSMTLHYDSLLKSYGDDIFDQSAILLQIITKFSNAYVSTLE
GTSHNMLTSELCGGARIFYIFNETFGRTLDSIEPLDGITHMNILTAIRNA
TGPRSSALFVPEVSFELLVKQQIAQLSEPSLRCIDLVHEEMQRIIKKKEE
NEKSVTKYREKAKFKMRRVFVFVLFIQYIICFTHNPFQSSNFGNNRYALT
SEKSCRFGECQPVVDCAGRFTPEERVWNLCTFSRTEVGLCCKKLSHNDVL
HHRTHDKTLTNGIPLCEKSFRSFGNDHLAGNTVAVRFPIFNVTNILAINR
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ASCDQNFSCDRESPFRNPRGICFSMPRRANDGRDLPSARFVSTMSTNNLL
RPNVRFTNLLMASGQFIDHDLVHVPVFSKEDGEGFDCCSALLGNNTLECF
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YGSTEEELIALRTFRKGLLTLDPENENLPPNINNDECLDPNNCFLAGDSR
VNEQTALTSVHTLWARQHNKVATVLNSQNSTWTDEELFQVTRQIVNAQWQ
HVVYNEWLPIVLGPTTMQEFGLWTLRKGFSHDYRDDFDPRITNEFAAAAF
RVGHTLIPSALRSYNILNAKPTGSLLLRNNFNNPKQLQTPGFLDEITFGM
VIQNIEDFDNRISDENHLFELNDEGLDLIAVNLQRGRDHGIPGYIFYLEI
CGSRKIKRFEDLKYNMALENINLLKRIYNNVKDIDLFIGMLLEVRSKDSL
IGRTFLCIITDQFARLKRGDRFFYDLDGKSTGSFTLEQLNEIRKFSFSRL
ICDNTNIPRIQPFALENANHQYNIITSCDSPSIPSPQYTIWSSIGRRQLK
Y
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mRNA from alignment at LSalAtl2s391:540984..570159+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000006920-702767 ID=EMLSAT00000006920-702767|Name=EMLSAT00000006920|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=29176bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s391:540984..570159+ (Lepeophtheirus salmonis)
AGAATACTCACTAGGAGTAACATATGTTTTTTAGTTACTTTTCTCACGCC AAGCACGTAGCTGCAAGAATCATATAAAAGAATGTGTCGAGACTCGAGGC TGATGAAAGAATAAATGATGAGAAAGAAAGAGAGAGAGAGATAAAAAAGA AGCGAAAGTTGGAGTTAGATAGGGGTAGATGGAGAGAGAGAGAGTGTGAT AGAAGGAATTTATGAGTAGTAATAAAAAGTTCGGGAGACGTGACTTTTTT TTAAACTGCTAAAAGCCAAAAGGCAAAGACCCAGAGAGTTGGCTGAAGTC GTTAGGAAATAATAGTATTAGTACATGATGGATTCCCTGATTCCGGTCAT TAATAAACTACAGGATGTCTTTGGTACAACTGGCACCGAGATCGTCCAGC TTCCGCAAATTGTCGTTGTTGGATCACAAGTAAAAATCCCTTTTAAAAAA GCTAAATTAAAATGATAAATTGGTGGTAATCTTAGAGCTCTGGGAAAAGT AGCGTGATTGAGACAATGATCGGTCGATCCATCCTACCTCGTGGTACAGG GATTGTGACGCGGTGTCCTCTTGTTCTTCAACTCATGTATTGTCCATTGG AGGATGAGAACTACCGTTCATCCAAGAATGCTACTCTGGACGCGGAGGAG TGGGTCGAGTTTCTTCACGATCCCAATAAGATCTACACGGACATGGATAA AGTGCGGGATGAAATCATTAGGAAGACTAATCTGATTGCAGGGGAAAATA AAGGGGTTAGCAAGGAGCCCATCTCTATCAAATTCTTCTCACCCCATCTC CTCAATTTGACGCTTGTGGATCTTCCAGGGATTACAAAGGTGACTTTTAC TTGTGGCAATCCTGAATACACTCATTAACAAATCTCTCTTATATATGAAT AAAACCAAACAGGTCCCCATAGGCGATCAACCAGAAGATATCGAAAATCA AATTAAAGAGCTTATTCAAGACTATATAAGCAATCCCAACRCCARCATCC TTGCCATATCRCCTGCCAATACAGACATTGCCACCTCAGAAAGTATTAAA TTTGCAAAAGACGTGGATCCCACGGGTGCACGAACACTAGCTGTTATTAC CAAATTGGATCTTATGGATGCAGGAACGGATGCGGMGGATATTTTATGCG GTAGAGTTATTCCAGTCAAATTAGGAATAATTGGCGTGATTAATCGGAGT CAGCAGGATATCATTGATAATAAAAGCATAAATGATGCAGTCAAGGATGA AGAAGCATTTCTTAAACGCAAATATTTTAAACTTGCATCTCGTAATGGCT CSGTCTATTTAGGAAAAACATTAAATCGACTTTTAATGTGTCACATCAAG ACCTGCCTCCCTGAAATACGAGCACGCATTAATTCAATGACTTTGCACTA TGATTCCCTTCTCAAATCCTACGGCGATGATATATTCGATCAAAGTGCAA TTTTATTACAAATCATAACAAAATTCTCCAATGCCTACGTTTCAACTCTT GAAGGGACATCTCATAATATGTTAACTTCTGAATTGTGAGTCCCATCCAT TTTGTATGGTAGTAACGTACCTCTAATCTTTGTTTTTTTTATAGATGTGG AGGTGCCCGAATTTTTTATATTTTTAACGAAACGTTTGGCCGAACATTAG ACTCCATAGAGCCACTTGATGGTATTACACATATGAACATACTTACTGCT ATTAGAAATGCTACAGGCCCACGATCAAGTGCACTTTTTGTACCCGAAGT GTCATTTGAACTACTTGTCAAACAACAAATTGCTCAATTGAGTGAACCAT CGTTGAGATGTATCGATTTGGTTCACGAGGAAATGCAGAGAATTATCAAG GTTTGGATTTTTTCAAAATGCAGAAAAGAAGTGTTTCATTTCTTCTATAT 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AATATTTTGTGTATAAGACAAAAATTTGTCAAAAGGAGGAGTTGTTTTAG TTAACAAATTTATATATTTTAATTACTCTCTTATCGCGGCCTTGGTCCTA TTTTACCTCTTATGAGCAATTTTAAAATGCCCAGATATCACATTTTTATT CTGAAGCAGCAATCTTCCGATTGATAATAGGATAACATATTATATTCAAA CTTCTGGGATTTGTTTTAAAAATTAAGGTGTGACATATCAAAATTATACA AACTCATAAAAACATGTCGCCAACGTATTGAGAAATGCAATATTTACTGT TTATGTTAATATATTATTGGTTCTATTTTTATTTTTTTTGTGTGTGTGTG ATTATACTAAGAATAGACCGATATTCATAATTAATTAATTATCAGTAGTT TATTTCTTAGTTATCACATGACGGATAGTGTATCAATTTAAGTTAATGTT ATACTGCAGTTTTAATTCTTTGTATTGTCTGTTATAAATGGCATAATATG TTAATATAAAGCGTGCAACAAAAAAATAAAMATAATATTCAATCATATTA CTCAAACTTATAAAAATACAGAGATAAAAAATCAGTTCGTAAATAATCGA AACCAGATTTGATACAGAAATACTAAATAAAGATTCTTATTCGGCGTATT AATTCCTATTACTGAAATTGAATATGTAAATTAAAACATTTTTTTGTTGA CATGTATAAACGATCTCTGGGACTACCAATAGAATCCGTATTTCCCTTGC AAAATCACCAAATCGGTGGATCTTTAGTTTATACATATATCTATGAAATT TTACTGGCTATTTATTCTCTAAATAACCTGAAAACTGATTTTTAAATTGT ACACATTTACATTGAATTCCAATGAATAAAGTTCTTCACTTAGTTTTAAT TAAATAAGGGGKTTTCAAATTCTATAAAGTTGCACATCTTATTTTGTAGA 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ACAATAGAGTTCATGACTAATTTATTAAAGCAAACAAATCTGGAAAACAT CATTTATTATATGGAGGCAAGGCAAAAACTGAACAACATGTGTATAATTG GTTTTTCAAACAGAGGCCAGTTTTTAATTCTCTTTTCATATTAATATTTT TTTTATTACCTTTTTCAGAAACATAGTAAAGATGTTAGAGAATTTTTGGG ATTTACGGAGAAGAAACTCTCAAAACTAAATTTGAGTATGTTACCAGATA ATTTTCTCGTATCAGAAGACGCAACTGAGAAAGAACGTGTCTGTTGTGGA ATCATTGGTATGCTCTTACATTATGKCCGCCAATCAAAGCTAAAAAACAA AGTAACGAGACTTAGTTTGATGAAGATTTCCTTGGCTACGACAAAACTTT TCCCTCTCGCAAGATGTCGCTTTTAAGATACTTGTACAAATAACGATACT GTATCTTTCCTCCCGTGATACATGCAATATTTTGTTCCCTTCACAGAATT CACCTTATTAACTTCATTAAAAGGGTGAATTCATTGAAATTGTGTAATTA TTTACGGACTAATTTATACAATCCCCTCAGTGTCCCTACTTGACAGAAAA GTATTCTCGTAGCCAACTATATTTGGGGAAAATTAATCACATGCTGGTCG TTTCGCAACTTGGTTTATAGCTTTGCTCTCCATTCTTATATGTTTTATCT CCTCATTATTTTTTTTCAGCTGTACTCATTCATTCATACTTTAACATTGT TCGACAAAGGATAAAGGACAGTATTCCAAAGGCCATTATGTACTTCTTAG TCAATCACGTTAAGGATAATCTACAAAGCGTTTTAGTCTCATCTCTATAC AAACAAGAAAAMCTTAAGGAATTACTCATTGAGTCGGAGGATATCGGTGC GAAACGAAAGGAGGCCTCTGAAATGCTTGAAGTAGGTTATTATACACTTT AAGACTTATTTTACATACATGATTATCAAATTATATGTTTTTCGGGGCGA GGAGCTTGAATTTGATGATGTAATCTATGTAAAACTAAGGTGGAGTATTG ATTTTGCATGGCTGAATTAAAGCTGCAGGAAGTAGCTAACATAAATACAT TTTTTTAGTGAAATATGGAATTCTTGAAGAAATTAAAAAACAAAAAAATC CTGCTATCCTTCATCCTCAAATTGTGTCCCAAAGATAAAGATATGCCTTT CTAAACATAAAAAACAATGAAAATCATTGTTTTTTCTTAATTTTACACTC ATTATACCAACAAATTCCAGCTTTTCACCCCGAAAAACACATAATTCGAT ACAAAATCATACTTCTCTCATAAGTATGCCCTCTAAAATCAGTTATTAAA GTTTTTCAATATGTGAGCGCCATCTAGTTGTTAAGCTTTTAAAAAGGGTA ATATCTTGCTTACCTGTTGGCCGATTTTAAAATTATTTTTTGAAGTGAAC ATATTGAATAATACTCTATGCAACAGTGTAGTTAAAATATATTTTCATCG TAGTGGGTATAAAATTGTTTGAATTTTTTTGAAATAATATGGAACTACCC ATACCCATTCCTTATCACGTAAAGATATATACTGGAATTACTCCGTTTTC GATCTTCAATTCTACTCTTAGCCCAGCAATTACACTCTTATAATTCCCCA ACAAATAATCAAGGTTACTCTTTGTTATTCATGTGCATGCCCATTCGTGG TTATACTTTATACTTAGATGTTATCTCCTCAAGAATGAATGAATAAATAA TGATAATAGCTTTAAAAAATAAATAAAAACACTTTCAGGTTGCCAGAAAC AAAAAAACTCCCTCACTAAAATTGTGGTACACAATGTAAAAAGTTTGAGA ACTACTGAGCTGGAGGCAGAGTACCAATTGTTTTTATACTAAGTTAGGAC 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