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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s393 | supercontig | LSalAtl2s393:420904..431047 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000006931 >EMLSAP00000006931 ID=EMLSAP00000006931|Name=EMLSAP00000006931|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=387bp
MXNRYCGDENLDISLPSPLNISFVSDGVFRYPGAECVYRSIQENGIAVLN
GFNKTTNYQSSNNYDRGSIKQFFHGRCQDEASSVDKTSQNVNQGIENKEE
TLKEGLWSGKCGDSPVELKNRIIGGYETEIHQYPWMXSIFKPCDDGGDTD
EFCHVCGGTVISDTWILTAAHCINKLDKYNISIILGDHNLKTIGRDQRSV
NGDRVIIHPDYNSPTFLNNDIGLLRTEKHIPFSNYVSPLCLPGLGETGFG
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KICKRIYGPGFTENMMCTSGKNGKGDCYGDSGGPALVKNEKGSYIQVGIL
SFGAFDGCELGYPSGQVFVFKFIDWIQHITGLQFGSN back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s393:420904..431047+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000006931-702778 ID=EMLSAT00000006931-702778|Name=EMLSAT00000006931|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=10144bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s393:420904..431047+ (Lepeophtheirus salmonis)
TTACTTTAAAGATTTCTTGCGGAAAAATATTGTTAAAGGTAAGACATTAA
TTATTTTTTAAATCTGAATTTACTTCAGACATAAAGCTCTAGATACATTG
AAGTCAATCGCCGTCATTTTTCCCTTACCCCTCCCACTTTATTCATAGAT
CCTTTATCCATATTCAGTATTGTATTTCATGCTTTGTGGTAAATCATATA
AAATAATAATTATTATTGCAAATCCAAATATTTATTATGGAATATTTCCA
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CATAATTTGCAAACCAAGAGTTGTTGTGTTTTTTTTTTTGCAAAAAATTT
GTAAACACATTTTAATCCATTTATGTATAAGTTCATTAAAGTATGAGATT
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TAACCATATTAAACGATATCCGTGGTATGAAGTGATTTTTATATTTCATA
TTTTAGTGAATAATAATAGTATTTGTAAAAAAGAAAATGTGAGGAAGATC
AACTTTTCCTGAAATTTGTTGTTTTTTACACTAGATTTGGGCCCTATTTT
AACCTGATATATAATATAATATATGTGTCTATAATAGAAGAATAATGACT
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GAAAAATGATTTTTCTTTTACTGAGCAGTTGCCAAGATTATTTCATTGCT
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GATTTTGATCCATTTATGTATTACTCAAGTATGAGATCATTTGGATATAT
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AAAAAAAAAAAAAAACCATACTTCCAACAACGTAAGAAAAGAATTCCAAA
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TACTGTAACTATTTTGGAGTTTACTATGAATTATTGATTTTTTTTTATTC
TTAAAAGTTGCATCTCATTTTTAAAAAGGGTAAGTATACTCAAAAAATTT
AGGAGCTTTGATTTGATTTTTATTTGCTTGTATTATTCTGATAATTTAAA
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TGAAAGAAATATTAAATTATAACATAAATTAAAAAAAAAGAAAATGTATC
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AGGAAATTATTTTGTCTCCTTGCGGAAAGAATTTTAGTTCAGTCAACGGG
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ACAAATTCCATTTACAGCCTCGATCAAACGGCTCCTGCATTGACTATTTA
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TTCCATCTCCTCTTAATATATCTTTTGTATCTGATGGTGTATTTCGATAC
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TTTGAATGGATTCAATAAAACTACAAACTATCAGAGCTCTAATAACTATG
ACAGAGGGAGTATTAAGCAATTTTTTCATGGAAGATGTCAGGACGAGGCA
TCAAGTGTGGATAAGACTAGTCAAAATGTAAATCAAGGAATTGAAAATAG
TAAGTCTTAATTAGCTTCGTAACTTTACAGGTTAGATAATTATTTTGCCT
TTTAAACTTATAGTCTGTATTAGTTTTGTCATGATACCAATATTTTTTGT
ACTGTAATAGAGTAAAAAATATTATTTTCACATCTCATAATTTAGAAGAA
GAAACATTAAAAGAAGGATTATGGAGTGGAAAATGTGGAGACTCTCCAGT
TGAACTCAAAAATCGAATCATTGGCGGCTACGAGACAGAAATTCACCAAT
ATCCTTGGATGGKATCTATATTTAAACCTTGTGATGACGGTGGAGACACG
GATGAATTTTGCCATGTCTGTGGTGGAACTGTTATCTCTGACACTTGGAT
TCTTACAGCTGCTCATTGTATTAACAAACTAGACAAATATAACATATCAA
TCATACTAGGGGATCACAATCTAAAAACAATCGGTCGTGATCAACGATCT
GTAAATGGTGATCGTGTTATAATTCATCCAGACTATAACTCACCCACATT
TCTCAATAATGATATTGGACTCTTGCGTACAGAAAAGCATATTCCTTTTT
CTAACTATGTCAGTCCTTTATGCTTACCAGGATTAGGGGAAACTGGATTT
GGTACTTTTATTTCACATAATACTTCTACTTTGGACACTACAGGATTGAT
GGTAGTTGGCAAAAATGCAACCATAATTGGTTGGGGGGTTGTAAGTGATG
GTAAATATTTAATTGATTGCATTTTATATCTTATAAGAAACCGACGCATT
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TTGATATTACAAATCAGATGATTCTCTAAAAATTATTATAGGAATGACAA
TAACGAACAAAATATGAATAATGCTTAAGTAAAGGGGAAGAGGGACTGGT
TAATATGAGAGTAAGTTGGCAAACTTTCTATCAACTTTCTACGAGTTGCA
CTTGAGCACTTTCGTGGAATAACCACTTAATAGTTATGCTTTAGATTCAC
CTCTTTGAGGGGAGTAAATATATTCAATCTTGAATTGTGAAATATTTTTG
AGTCTTTTTTTTTTCGGGTTGATAAATCGTCTTCTTAAATTCAAGTATAA
GCTTAAGCTCTTACAACTTTTTTTTATTTTATGAATATATATCTATTGGG
AGTTAGTTTATAAGATATTGATGTTTAAAACAAATATCAGCTCAGGGGAT
ATAATATGAGACAAATATATCTTCTAAATAATTAAGCAACGGTTGTATGT
AGATTAGTCTTTTTTCATAAAGTAATTTTTAATTGTATCATACAAATAGG
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CATAACACTGATAATTTGTTATGGAGTTGTATATACGTGTAAGTCCTTGT
TGGACTCCAAGTAAAATTGAAGATCAACNCGGATAATTTCTGTCTATATC
ATTTCTAGATACGGGTTGTTTGTTTGTTTTTTCATCAAAAATATATAATA
TTATAAAAAAATAAATTAAGAGGGAATGTGAAAATAAACCTTCTAGTTAA
AATTCTCCCCTCAATTTCAGCACACCACCCCATTTGAATTCCTTTGAAAC
ATAAGACACCAAAAGACAAATTTAATAAAAAAATATGCAAACATTGAGAG
AGGTAAAACAAACACGTAATAGTTAAAATTACTTTTTTAAATCAAAAATT
AACATACAACCGAGTAACATACACCACTCAGCCACAACTAAAAAACTAGG
TTTAAAGAACGTTCATATTAATAATAACAAAACACAGAGAAGACTTTGTT
CATCCCATTCTTTACTTTTCCGGAATATATCTATTAATAATATCTAGTTA
ACCAAGAAGGAAAATATTGAACCAAATCCGAAGCAAAATCCAAATCCAAG
GAATACTCGAGGAAAAAGAGGTATATCTGGCTGCAGTTGCAAAAATTACC
TTCCTAATTTCCCCAAATCGTAGTTCATTACGAGAAGTAAGTCGACTTGC
TATAAGTGCCATAGAACTTATTAATACATATTTGACTCAACCGATTTCAG
AGACGGAATTTCTTTGTAGAGGAATCCCAGACAAAATATAAGATTTCATG
TGGTTTGAAGGCAAACCCACCAAGCTCAACAACTCAGCATTATGTGTTGA
TAAAAATCTTACCTCCGATACCACTTGACACTCATTTAGCATTTAGGACT
GAATTGTATTGTGTACAGTAGAGAATACACCCAGTTGAAATTGTAGGGAT
ATATGTCACCTTTAAATTGTATTGGGTATAAATGCAGTTTGGCCGACCTA
AGTAGCAGATATCGAGATTTTGCATTGGGTTTCATGTCATGAATCGTAAC
AATTCCAGTTTTTGAGTGTTTTCATTCAGCCCAAAGAAAGCTTTCTTGTT
AATATTTTACCTTATCACGTCTACTGTGGAACTGGAGTTAAACTTTGGAG
ATGCTCGCTATATTATTCTTTGAGAAGCTCCCAAGAAAAAGACAATACAC
ATAATATAGGATTCGATAGATCTGTTCCAATCATAATGTAGCTATTGGAA
ATCACAGATCTCTCCTCCTTTTCTGGTTTGCATGACAGATCAATCATCAC
TTTATTGCATATTTTTGGCAATAAAAGCCCTAACTGGACAAAGGCTCTAC
CTAGGTGACTTCTTGGTCTCTTGGGTGCTCCAATATAAATGCATTGTAAT
AAAACTCGGAGCCATTCCTCCTCAACGCCACTCCTGGTGATGTAGTGACA
ACACATAATACGGAAGGAATTAAACGGATATTGTATAGATCTATACGGAT
CTGTAAAAAAAAATTCCTCATTTGAAGTTATCTAAACTTGATGAAGGCAT
TTAAAGATTTATATTCGAATCAGATACTCCATTTATCTCCCATTTTATAT
CTAGAACATTGATTGAGCTCTTGATCAAGGAACCCTCAATTTCTGAGTTT
TCTTCAGATTTCCATTGGCCCAGAAGAAGGACTACAGTCCTTCTGACATT
CAATTCCAACCCCGATGTTTTCTTAAAACTTCTTCCTCAGTTTGAATTAC
GAATTTATTTCTACCAACAAAGTGGTATCTAATGTATAAATGTATAACAG
GTGTCTGAAGTCTCCAAAAACTTCAGACCATAGCCGAGAGAATTTACGCT
TCATTTTTTAAGGCAAATTCATTCATAAAAGCCACAAACAAAAGAGGGAC
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CTTGCCCATCCAATTTAATTATGAAATTCCCATTTCATAGGAGAGCTCTA
ATAGGGTTGAAAAATTTACTAGGCTATAAACTCTTCACAGACTTCAAAAT
ATTTCTTTCTATAAATAACCAACGCAATCCCACATTGAATGTTACGAGAA
ATATGCGAAATTGTACTATTCCTTAGAAAACCCTTCTGATGTAGGTTGAT
CCTTTTCCTCAAAATTGATTCAATTTGTTCGGCAATTACACCTGAGAGTA
TTCTATAAATCTCATTCCAAGACTGTAATGGGTCTCCAATCATTTATATC
KCAGCCATTACCTTTCTTGGGAATTAGAACAACCCGTCCTCTTGCCACTT
AGTTTAGCAGTTCTCCAACCTTTTCCATTCCTATTGATATAAGATAGGGC
TAAAAGTATTAAAAAAGACCCCCCCCCCCCGACCACACACACACACCATC
AGGKCCTGACGCTTTATCTCCCTTGAAATAAACCTACCAACATACTCATA
AATGTTTGCATTGGTGAAAATGGCCTCAGGAGTTATTTTCCTTCTTGTAG
AAAATCCCGACCTTTGAATGCTGAAAATATCTTGAAAATGTTTCAGGAAA
GCTTCCAAAATATCTAATGTTTTAATTTGATATTTTTCCTTATTTATGAT
TCCCTCATTAAAGTATCAGAAGTGTAATCTCTATTTTTCAACTTTTGAAC
GTGATACGTTGATATATTTTCTTTTTCAACCTTTCTCTTTGTTTCTTCCC
TTGGGATTTCAGAAGTTCTGAGTCCATTGATCACATCAGCGGTATAGGTT
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ATTAAGTCCATTAAGAGTTCCTATTACACATTTAGCAGAAAAATTGTAAG
GACCAGTCAATCTCAAACGACATTTCCAAGAGCACATTTTAATAATATAT
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ACAGATAAAGAAACCAGAGCTAAATCCATACTCGATTAAAGTTGCCCAAA
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TAATGACTTACAAGCAAGGCTAGGTACTATTGCTGGTATATATAAAGGGA
AGAATATTTCTTTTTCTATTTTTTTAGTATTCAAAATCAACCAAAACTTA
CACGTTGAAATGGTTGGAAATTATAGGAGTATTACAAATGTAGAGCCAAA
TATTGTAAATTATTTATTATTTTAAAAAGTGGACATTGTATAAACTATCC
CCTCTCTTTCCATACTCTAATTTCTAACGAAAAGCAACTAATGCTAATTT
TAACAGTAATGAAAATCAGGTTATGAATAGTGAAGTAAAAACACGCTTAA
ATTTAGGTGTGTTTTTTAATATATAAATTTCAAAATCCTAATTAAATTTG
TCGAACTTCGACATTTGTATATCTAACTATAATAATCGCCCTTGTTTGTT
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TTCCTTCACTAATAAGAACTTTCCATAGAAACACGAAAAGATTGATTGAT
TTAGAAAAAAAAATAAGAGTGTTAATGATAAAAAGCGATTTTTTTCTCTA
ACTAAGATTTTCTTATATAAGTAATTCATTTTTGGACCATTTTTGATTTT
TTACATCTGTATATCTAATTATTATTAGGTAGGAATTTTGTCGTTTGGAG
CATTTGATGGATGTGAACTGGGATATCCAAGTGGACAAGTTTTTGTCTTT
AAATTTATAGACTGGATTCAACATATCACTGGGCTCCAATTTGGAAGCAA
TTGAGACACGTATATGGCATAAAAAAGATGTTTTTAGTGTGTCTGTGTAT
ATTTGTCGAAGCAGTGGATAAAAGTTTTTCAAATATCTATAAGGAATAAT
AATGTTTTTTTGTATATAAATAGTCTAATAGTTTTATATCCTAA back to top
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