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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s396 | supercontig | LSalAtl2s396:160743..177530 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000006968 >EMLSAP00000006968 ID=EMLSAP00000006968|Name=EMLSAP00000006968|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=427bp
MDCYFRQYWRXERLSFTGLKNNTHHLKIDQLSLNVKMLEKIWKPDTYFHN GLSSYIHTITRPNKLLRISEHGDITYSMRLTIKAKCPMMLKSFPMDWQSC PLVLGSYAYTIDQVYYRWQHSSNAVAYEGKLKLSQFDIITTAYRSLNFSR NTDDRYTLPLVGGFSVLQVVIALQRHTGYFLIQIYLPCTLIVVLSWVGFW LNREATSDRVGLGITTVLTLSTIALDSRTDLPKMGSGEVYSLVEFPHLAD LQIIDEEEKELEGGWTDNALKHTVSVISGFPNSATVQSFVTNTSELSPFE DFHQILPPPPPPPRSLNLSTSQREVKSNGRGTSTMSQAQTQTETTTSCFK QFLYCLMSNQEYRKQKTKEATRMGSTNSTSKIDSVAXILFPVSFCLYNAV YWYSYFRPHTPFDWKNHILKGNILEPK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s396:160743..177530+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000006968-702815 ID=EMLSAT00000006968-702815|Name=EMLSAT00000006968|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=16788bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s396:160743..177530+ (Lepeophtheirus salmonis) ATGGATTGTTATTTCCGGCAGTATTGGCGGGNTGAGCGACTCAGTTTTAC
AGGTCTCAAAAACAATACTCATCACTTGAAAATTGATCAACTAAGCCTCA
ATGTCAAAATGTTGGAAAAGATATGGAAGCCAGACACTTACTTTCACAAT
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TTGTCTGATACTGATACAATACCGATACTGAATATTTGGCCCGATATATT
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GTATCTCATTTTTGCTACTCTGGTACATTCATAGATGCTTATACCATAGA
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TTTATTGAGACACACTTAGGAATAGAACGGTTTGTGGATCCGGATCCAAA
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TAGTGATTTTTGTATTCTAAAAAGCTGATAATATTTCTCAATCCGAATTT
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ATATATTTTGTTGTAAGCTGTATATATTTATGTTTCTTTACCTCTAATCA
GTATTCTTAATATTAATTGGTTGTATTTGAATTAGCTCTTATTAAGCAAT
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TCTTTAAAACCTGCATTGGAATCCAAAATAGATTAATAAAATAATATCTC
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GTTATTTCCTCATTCAAATATATTTACCTTGTACTCTGATCGTTGTACTG
TCTTGGGTTGGTTTTTGGTTAAACCGCGAAGCAACATCTGATCGAGTGGG
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TTTAAGTAATAGTATTTCTTTGTACCGTAATTTTTAACTGATAATATGTA
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GGAGATCACATCGTAGAAATGGTCATAGTCCTTTACATAATGTGATGCAA
TTTCCTCTGGCCTCATTTTAAGTCCTTGGATCGATCCCTAGTCATTCTCC
TCTTACTCCAATAATATATTTATAGTGGCGTTACAACTGGTGAAGTTATT
TATTATTATTATAAGGTTGCGATAATTGAATTTCAACATTCTTTGTAGGT
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TCCATTTATGTCATCCTTGATACATATTTATTATATTTTTTTTGCAGATT
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TTTGATAGTTATTTTCTAATTAAATGTCATATTTTTACTCGGATTACATA
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GGCTGTACATATTTCTTATGTAAGTAGAGATCAATTTGGTAGTTCATCTG
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AATCCTTATCCTTTTTGATTTTAATGCTTTGAGGTATATTTTTGACCCTT
TCTCCTTGATTTTAGATTTAATATCCAGTGTTTAGTAACTCTCAGACCAG
TGGTTTGACGAAAATTAATAAGACATTTCCCTACTGTATAATGCAGTTAA
AACACTTTATTTTATTTCCCAACCTTTCTTCCAAAAAGTAACAGAAAAAA
ACACAAAATCAAACAAATGCCATATCATTTTTTAATTTCTCATGTTTTTA
CCTATATTATATTTTACAACCCTTCCTCACAAAAAGTCATCAGAAAAAGG
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CAGAGGTCATAGTAATGTGCTTGGTTATTTTATACGTCAACTTGCTGAAT
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ATTTGCAACCTCGGCTGTCAAGGGAGAGGGGAAAAATTTGAAGAAAAAAA
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ATCGAGAGACACGTGTTCTAGACAATGGTCCGTGATTCATATCAATTAAA
ATATAAAATTACAATCAAATATAGTCCATAAAGTTGTAAATATTAAGGAA
TATTTATCGTGGAAATTTTTGTAGTGGTTGCCAACCAGAGCAGTATTTTT
GATTGTATAAGCCTGGTTTTCATTTTTCTTTAACTCTTAAGGTGAGAACG
TTTAAGCATAAAGTATAACCAAAAGTATGTATAATCCATGAATGATGGGG
AGTAACACTAAGGATTTTTCGTGAATTTATAAGTCTTGATGCTAATCGGT
AGCATTTTATATCTTGCCTTTTGTTTTTTTTAGTAGGGAACACGAGGAGG
GTTTTGTATTTTCATAAAAAGAAACTTCCTTTTCTACTACCTACAACAAG
CTATAATTGATATATACGAAACAAGAGTGAGCATTTGTCTGTGCTCATGA
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GTTTGAAATAGAATTGGGGATCGACATTCGGAGTAATTCTTATCCATTTC
CTTGTTTTTCCATCTCTTCTCCTCGGAACAGCAGTTTGTGGCAGAACTTG
TGAAACTTTATGACAGCTAAGCAGCTCCTACTCAAAACATTCTTTAAATT
GTCAGGATTACCAGGTTGATGCTCGGTTATTTTAACTCGCCTAAAATGCC
ATTGATTTTCATGACTAGCTATAAGTGAAATTCCCTATTGGACTCAGTAT
AGAATCGAGGATTGACATTAGATTATTTTTTCTCTCTATGTCCCTACTAC
ATGCAGATTGGGTTTTTTATTTATTTATTTTCATTCATAGATGCTTGCAG
CTGATCTAATAAAATTGCTAAGCTGCTCTCCACTGAAATATCATTTAAAT
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TTTCAACTCTAGTAATATCCTGTCTGAGGTTCTAAAACGTAGAGTCAGCT
ATTTTAAATCATACAAGAGTCAAACCATAGAAACAGGTGAAAAGAAAAAA
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TTAAAAAAAAGTATATTTTGGCAGATATTAGGTGCTTTTATGAATTTTTT
ATATTACTTTGAAAATTCAAACGTTGTAACAGGCATTGTGTCAGTCCAAT
TTATTCAATCCAGTTAGTTCAAGTCTTAAATTGGGCATATTAGTCCTTGG
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CTTAAAAAAGGAGAAATAAAGTTTATTGACGTCATCAAGGACCGAACTTT
ATAAGTTTTAGGACTAATAACGGCAAATCGAGATTGAAATTATCATCTGG
CTCTTCCATAATATGAACTTTTTAATTCCATACAAATTATTTTTTTTCCT
TTTTATCCGTTAACCCTTAAAAAAATGCAGTTTAGATATTTAAAAAATTT
TATAAGTATTATATTCATTAACATATCCTTTGACGAGAAAGGACGAGTAT
TTGGACTTTTTGAAAAATAATGAAACTAAAAATGCGGGTGGTTAAAATGA
CATCAGTATGTGACGTATTTTTGTAGTCTTTGCTAGCTGGGTGTCAAGAT
TTGGGGTACCATATTCAGTTCATTCTGACTAAGGAGCTCAATTTACAATA
TCGTTGTGGAAACCTAAAGGACAACTGGCAATTACACTCATGAATTATCT
TTTAAATTCAAGGATCGACTCTTGAATTTGATAGATATTTATAAACTAGT
CCTTCAATTACTTTGTTGGATGATTAATAAAAAACGGCAATTATTATATC
AACCATTATCCTAACAAGTGGTTAAGTTATGTACTACTTAGTTAATTTTG
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CCGTATGATAATACTAATCATGTTGACCTACAAGATTGAGTAAACCCCTT
TTCGAAAAATATTTTACAATCACCATAAACGAATACCTCATTTTAAAGTG
TGGGAAATTCCATTTATGCTTCGGGCCACATAGAATACACTTTGAATGAA
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GTTGTTTCAAATCTACATAATGTATTAAATATAACATCTTATCGTTTTAT
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