EMLSAT00000006968, EMLSAT00000006968-702815 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000006968
Unique NameEMLSAT00000006968-702815
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s396supercontigLSalAtl2s396:160743..177530 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000006968 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000006968EMLSAG00000006968-689734Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000030607EMLSAE00000030607-739535Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000030608EMLSAE00000030608-739536Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000030609EMLSAE00000030609-739537Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000030610EMLSAE00000030610-739538Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000030611EMLSAE00000030611-739539Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000030612EMLSAE00000030612-739540Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000030613EMLSAE00000030613-739541Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000030614EMLSAE00000030614-739542Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto773567auto773567Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000006968EMLSAP00000006968Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000006968

>EMLSAP00000006968 ID=EMLSAP00000006968|Name=EMLSAP00000006968|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=427bp
MDCYFRQYWRXERLSFTGLKNNTHHLKIDQLSLNVKMLEKIWKPDTYFHN
GLSSYIHTITRPNKLLRISEHGDITYSMRLTIKAKCPMMLKSFPMDWQSC
PLVLGSYAYTIDQVYYRWQHSSNAVAYEGKLKLSQFDIITTAYRSLNFSR
NTDDRYTLPLVGGFSVLQVVIALQRHTGYFLIQIYLPCTLIVVLSWVGFW
LNREATSDRVGLGITTVLTLSTIALDSRTDLPKMGSGEVYSLVEFPHLAD
LQIIDEEEKELEGGWTDNALKHTVSVISGFPNSATVQSFVTNTSELSPFE
DFHQILPPPPPPPRSLNLSTSQREVKSNGRGTSTMSQAQTQTETTTSCFK
QFLYCLMSNQEYRKQKTKEATRMGSTNSTSKIDSVAXILFPVSFCLYNAV
YWYSYFRPHTPFDWKNHILKGNILEPK
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mRNA from alignment at LSalAtl2s396:160743..177530+

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000006968-702815 ID=EMLSAT00000006968-702815|Name=EMLSAT00000006968|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=16788bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s396:160743..177530+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGATTGTTATTTCCGGCAGTATTGGCGGGNTGAGCGACTCAGTTTTAC AGGTCTCAAAAACAATACTCATCACTTGAAAATTGATCAACTAAGCCTCA ATGTCAAAATGTTGGAAAAGATATGGAAGCCAGACACTTACTTTCACAAT GGATTAAGTTCATATATTCATACTATTACTAGGCCCAATAAATTACTCCG TATCTCTGAGCATGGAGACATTACATACTCAATGAGGTAAGAACTCCTTA TTTCTAATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTAAAAAATGCAATTAGCAAA GTTTGAACAATTTCTATGAATATTTAGAGATAGCACAACGGTCCTAAAGT TTTTAAATTTTACATATTTTTGGTAAAAAAACGTTATTTTGTTTTAAATT AATACATTACAGCTTGATAGTAAAATTAACAAATTTTGTTAATTTTTTAT AAATGTTTATGGTAAATCATTTTTTATGTTTCTTAAAGAACAATAGAATT ATAAAAATAAAATTTGCAAATATGTTTTTTTTACTTATATTAACAAGAAA AAAAGTGCAATTTTGATGGCCTGAACCTAGATAACCTTTTTATGACTTTT TTTGAGGAAAAATATATATATAGCCAAGTTCTATAAAAATAAAATAAAAA ATTGTATTTTATAAAAACATATTGCAATGAAAATTTAGTAGGAGCTAATA TTATAAATAGATGATCTACAGAGCCATTTTAGGATAAGAATAATGACGGG TTAACAATAGAAATATACATTTTTAAGTTAATTTAGTTTTTTTTGTTAAT AAAAGTAAAAAAACGTATTTACAAATTTTTGTAGATATCAGTAGCTGCTC ATTGGATTTGATACGCAGGTGGACAGACAGATAAAAATGGTTCAAACTGT GTGAATTGTATTTTTTTTAATCAAAAGGAACGCATTTGATACCTCCGTGC TTTACTTTTTCAAAAAAAGTAGTTTAATTGGCACCGTAATGAAAGTACAT CGATATGAAAGGATATGCCATATAGTCCAACAAATATTTATGCAATCGGG AATTCTTTAAAAAAAAAAAGTTTTATTGTATTGACAGAGAAATGAAATTT ATTTTTATTGGGGATTGTCAATATTTCATTTAATATTGACTTTGAAAAAT ACCCTCAATTTTTTATTCTTTAATACTGTTATTTATTGATTAGATATCTC CTTCATGTTTGAAGGACAGGCCATTATGGGGTTTATGTGGTCATTACGGA GCGATAAAGAAACAATTATAATTTGATTTATTAACACTTGAAAGAATCAA TATTCTTACAACATTAATATCAATGAAGTATCATGTAGCCCTGTCTTTAA GTAAATTGAATTTATTTTAACCCAACTAATGATACTCAAAGAGGTGGTTT TTGAGAACGTTCAGGTGTTTATGGTCTTTTTAAAGCTTCTGGATTCCAAG ATTTAGCGTATCTAGTATATTGTACGTACCACAGTAAAAAATTGAACGAC CTCTAGTTCAAATTTGAAACTCAGTTTATGTTCTACAAACTATCAGATAC TTCTTTTAGTGATTTGACAACAGATTCTTCGAGTTAAGTTACTTATGTGC ATTTTATCAAAAATGTATTAAGTATAAAGTCAAATTTGGATAAAGGAAAC TACTATTTGTCCTATGGATAGTTGTGTATATCCAGATTTTTCTTATATTC GAAGTATATACAAAAAAAAATAATTTTTGGATACTTATGTAAATAAGTGA TTATGAAACTTCTTATTTCGAGGCAACACGTGTTTTATTCGAGCCTATTC TATGGAGATCATAGTAAATTTTAACTTTATCCTTTAGAAAAACGGTTTCT TGGGGACACTCATGGCATGTACCCCCCAATTAAAAAGCAATGTGAAACGA ATTTAAAAAGTAATTTGCAGTAAAAAATGTTGGTGCCAGCATAGGATTTG TCAGGAGTATGTACAAGATGTGTGCTGGAGGGAGTTGCCTTCCTTAAATT AATGAATTTTTGTTGCCTACAAACAATTTAAAAATCGAAAATTTAAATTT TTAAATTTTTATCCCAAATTTATTAAATTAATTTTCTTTGAATAGCTTTA AATTTTTGAAATTTTCTACAAAAAAAAAAATTTGATTTGTTTAATTTTTT TTGTTAAAACCTATGAATATTTGATTTTTATACATGATTTTTTTTTCAAA AAAGGTAATATTTGAAATTTCGTTCCAAAKAATTAAATTTGTTTATAATA AGCTGTGGATTTTTGAATTTTTTTTTTCAAACTGTTTAGTTTTTTGAGAA TACCTATTAATTTTTTTTTTTTTTTCAAAAAGTTTAACTTTTGAGAAAAG SCTGTGGATTTGAAATAAATTTCCAAAAAAATAATATTTTGTGAACAGCN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNTTTTTCCCAGAAAGTTTAATTTTTGAGAATACCAAAAATTAATTTTTG ATATTTTTGTGTGAATAGCTGTGGGTTTTTCAATTTTTTTCCCCCAAAAA 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GATATGAGTATTTTAGTCCTTTATATGTTGCAAATAAATAAATATACTCT TTCGGTACGGCGTTTTATGCGTATATATTTTGATATGTTTCTTCATTTGT TCTACTCAAATCTCGTTTTTTGATACCATGTTTCTAATATATTCTTATAA GTATACTTCCAGAGTTTATTTATGCCTAATTAGAAATACAATTATACAAT TTTTTATTTTAGACTACAAAATGATCCTTTAAATTATTAAAAGTATAACA CGTTATTTTTCTTCCCTTCATTTGTAGGGTTGATTTGTTGAACATAATAT AATTTTTTATCATGTAATCTTTCAAAAAAGAGTTATGGATGAATAATTGT TTTGTTTTTTTGTCTGATACAACCATCTCGTTTTCCTTACCCATAAACTA AAGATGATGATTTCTTTACTTCTTTTACTAATCCTAACTTTATATATTAC ATGATATTTTAGAAAGTTAAATTGGTCAAGAGAAAAAACGACAAAATTGT CTTTGAATAATGGTTGTTATGATAAGATTATCAGTATCGTTTTACAACCC TAGATATGCTTAAAAATGTAGTTTTCATGTTTAGTTAAGTCTATGTTATT TAACGACCTACCGTTGTGAACTATTTTGAATTCGGAATAAAGTACATTTT AATTTTATACCGATCTTCATCTACAAATACTGAAGTTACTATTTTTGGAA TGCAAATTAGTTATTAGAAAAATCCTCAAAACGACATTTTGAGACTTTAC AAGCAAGGGGAAAGTTGTATATATTTATCAAAATTTATTATAAAATTCTT AGACGCGAAGAACAACCGATTCTATGAATAATGTTTTTCTCTGAAATAAA AATGCACAATTTGCAGTTTATAAAGCTTATTTTCCATCGGGAGAGAAATG GCCAATATTGCCTATTGGTACAGATGTTATCGTGAAATATTCTTGTTTTT TCTTAAAATAGTATTTTTGTTCATTATTTTAAACAAAATGGTATTTTTTA TGTTCATTCGGCCATCAAAAAAGATACATTCAATTAGCCAATCCTAACTC TTGATTTTCTTAAATATATTAAAAAATTTCTCTATAGTATTCTACCTTTT TTTGTCTAAAATAATAACTTTAAAATCAATCAAACGTATCTAGTAATAAC AGGACAGCTTGTGTGGAAACACGATATTAAATGACTTGGTGAGCCAAGAA AGGAAGTTAAATTTGATTTTGCAAATGATTTTATGACCAAAAAAATTTTT CAATACGCAATTTCTGAAAATATTGCCTATTTTTGAGGAATCAATTTTGC TCGTGTTCCTTTTATTGAATGGGTCTTAGGCTCTATTTGATTTGCAATGA TACCTGCTAATATACTCTGAAATCGTTATTATCATCCAGTGGCCCAATGG GGTTCATTTACCCTTATTAAGTCATACAACATTCCCACAACATGTTAGAT ATTACATAAGAATTTAATTACCTTCGTATTCTATTCAAATGGATAACTTA TCAGTAGTAATGATTTAAAAACTGGCATCAATGTTAAATAGATCATAAAA TATTAAATTTTTAATAAATTACTAGGCAGTTTTTATAGTTTATAATGAAA ATAAGTTATTAAAATCTTTCTTATTTTACATAAATGAACTCTCTATGAAG TATGTTTGACAAGAACATATTACACATTTGGTATCAAAAACGAGTTTCGA GTAGTAAAAATGAAGATACAAATCATAATATACCGGTAGTTGCATAAATA CGCGGACTTAATTTTAAATGCTTATATCTCGAGGTTCCGTGACCGTAAAT AAAAAATTCCAGCATAAGTAACTCGGTAAATCTTTTATGTAGCAATGTAT TAATTGTGAGATATAGCTCACTAAAGACATCTGGCAAAAACGTTCAGAAT 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