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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s397 | supercontig | LSalAtl2s397:881136..945644 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000006996 >EMLSAP00000006996 ID=EMLSAP00000006996|Name=EMLSAP00000006996|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=19bp
MSFLGLLMIKSVIYGPWVY back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s397:881136..945644- Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000006996-702843 ID=EMLSAT00000006996-702843|Name=EMLSAT00000006996|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=64509bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s397:881136..945644- (Lepeophtheirus salmonis) GTACTCGAAACCTTTTCTCCAACAGAGGAGACTACAGATGAGTTTTCTTG
GCCTACTTATGATAAAAAGTGTGATCTATGGTCCTTGGGTGTACTGACCT
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TTACAAGGTCTCAATTGAATAACAGTATAAATCTTGCTTCCACCTCTTCC
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GGTCATTTAAACGACATGAACACAAAACAACAAGGTTAATCTTCAAATTC
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TCTCGCACTCTTCAATTGTCCTATTTTTTTACACATACACTTATAGGATA
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TGCCACCATATTCGGCCCATGTGACTTTTTCTTTCCCCAAAACTGAAGAG
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ATGTAAACTAATGATGTATCGAATACASCTGCCACTTATGAATACAATTT
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ATTATCTTACTTAACCGGGATTAATATATGCTGTGTAAAATATAGTCAAT
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TGATGTCCCACTCCGTCCATGGCTGTGCAATGCCAGGTAACCTTATGTAT
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AAAAAAAAACTAAACTAATAACGTTTCCTAAATTGATTAAAAATTAAAAT
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AATATTTAATTAAAATACCTGTCATTTTCAGAATACTTTTATATCTTTTT
TTTTCATTAAACGTCAATTTTCAAGTTTAAAACAAAAAACCACAAAATCT
ATGTATTTTGGAGATGAAATTTTAAAATTCAGTAGTATGATGACGTATTT
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TTTTGCAAGAACGATAAAAAATATTTGGTCTTTTGTGTTCCTCTTTACAA
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TTTTTTTCCTAAATTTTCAGCGGACAATATTTTTCAAGTATACATGTTTG
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AAAAATAAACTTTTAAATCTTGCTCCTTTTCCCTTCTCCTCCTCCGTTTT
TTTTCTGCCTAGCAACAGTTTTATTCTTCATTCTACTATTAAAAATTAGT
TGGGAAGGGGAGATTGTATTAGCGAGTTAATTTTTCTTAGATGAACACTT
ATGAGAATTCAATCTGTTCTATAATTTTTTAGGATGCTAACATGAAGGGA
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TTACTATTTACTCTGCAAATATTTTGAAGTACCTATGTCCAATAAGCATT
GGATATTACGCAAGATACTAAATTATTTGGAGGTAAAGTAATTTTAAAGT
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TTTTATTGAGATGGGGTTGAACAGGGTTTAATTTACAAGAAACATCAACA
AAAATCTTTTTTTTTTAAATCATAACTTTGCTTTAGCTACGTACTAAGAG
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AAGCAGGCGTAACTGTGGGAGMATCGCCGTACTCAATACCTGTACAGAAG
TAATTATGACGAACTTAAACTTTTTTTTATCAAACCCAGGAACCCACCAC
ACAATTTTTATAAATAAAATTATTTAGTTGAATTTTTAAATTATTTGACA
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CCCCCTCCTCCCAATGTGTCGGTGAAACGGACAGGCTCATACTAGTAACA
ATACATAAATTATAATGCTCGCAGGTGCCCAAGGCATCTGTACATACACA
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GAATTTTTTTAAGAGGTTCAAGATTATAGTCATGGCTATATACTTACATA
ATCTCCATTTGCTTACATACTTTTTATAGATGTAAAATAACATCTTATAT
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TGAAACATATACGTGAATTTTTTATGATTATTTCAAATAACCAAATTTAG
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AAAAATAGTAGTAACAATTAGGATCAAAAAAATAAAATACATTTAATTTA
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TCTTTATCCTTTAGAGCATTTTTAGCTATCAAGTTATTCATTATTTCTAG
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AGTAAATTGAATGTCGTCTATCAGAATTGAATTGATAATTGGGTTGTTTC
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GGGGAAAATCAAAGACAGTTTTGAACATATTGCCTACAAATTTGGTCATA
GAAGTGTCCCATTTATCATAGCAGATATGAATAAAGCATTCATTGTTGAA
AAAAACGATCGAACATTTAAAAGTCACTGGTCTGGAGTACTTAAGAAAGG
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TTATACTCCATAAAAAATATTTTATGGAGTTAGAATTCGGAGCAAGGAAT
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ATTGACACTAGATGTAACCTATTTCTTCAACAATATGGAACTGGAAGTAC
GGGTAACCGATAAGAATCTTGAGATTTGAGTACCCAGCTAATGAGGGAGG
ATTTTTTTCTAATATKCCTATTTTTCCATTTTATAGTGGCCAATCACGCC
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AAAAAAATGATATGGCAGTTGGCCTTCTGTATTTTTCTTGCTGCCAACTG
TTAGTTATTATTMAGATAATAGCATAATAAATATTATACACATTGAATAT
ATAATTCTATCAAAATGAATATCTATGACAGAGTATTAAATGACACAAAA
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TAGGTACTACCTTTTTGAGCTCATAATAGTCTTAAAAAAATGTTCTTTGG
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TTATCGTTATTTAACAAAAGGAAATTTTTTTACATGTCTAATATTGTAAT
TTCTGAAGTAAACATAAGCCGGAACACAAATCCTGCGAATACCGCTGTAA
AAGAATATGAACTGTAATAAAATATCAATTGTATTTTAATACATTTAGTT
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TACAAAAACACATATTATATTATAAGTACGAGACTTTTCTGCAAAAGTGG
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AGAACATATGTATAGTTTAATTGTGAGTTGCTTTTTGAGATATGTTTTGA
TGTAGTTTCAGCAGCAACCCCTCAAAATCTTGGTCTCGTTATCCTCAAAG
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GACGACAACCAAAATACACATTTTGTCGACGATTATTCATTTGTCTACAA
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GAACTCAATGTGCGTAGGTTCAATTAATATACTACACATAACTTCATTTT
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GTAATTCTATTATCCTTGTCATAAATAGATAAACTATATCCTCAAATTTT
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TCTTTCATTTAAAGAATTTACTAATAAGAAGAATAAAAAATGCTTATATT
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TGACCTGCAAAAATAATCGAGTTAATATGGACTTAGGGATAAATATTCAA
GAATTTTAGATTAAAAAATACTGGAGTGTACTTGTTTGACGATTGTTTTA
ATCATTTCAGTTTCAATAATCTTTATATACTTCTGTTTAGGAAATTATAA
ATACATTATTTTATACTAGAATAAAAATAATAATTGTATTCTATCAAGTG
AAATTCTTGATGATATTCTCAACCTTACATTTTATAAATCCGTATTGTTT
TATATACATACATTCAAAAACTGTATTGCTTATGAGCAACATCGTGTGAG
CTTAATTATTTTCATTTTTTGAAATGTTGTTTGTGTAATTTGTTGCTGTC
ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATCGCTGTA
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AACTAAGTTTGTCCAGAAAATGTCTCACACAGTTTTCCGTTCGATTGGGA
AGGCCATCTGAAACACGCACTCAACCAAAAAGGTGAGAGACTACAACAGC
AATTGACATTCCCAACGAAAACTTCCGCTATGATTGTTTTGATCTATTTC
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TTGTAGCAATTATGGACCTTAACTTCATGATGCTGCTTGAGAGCAACAGT
TTTTCTTTTTTTTTCTAATGTATAATTTTTTTTGCCTTGGGTATATTTCT
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TTTTAATTCATGAAAGAAAGGGTAAAATCAGTAGCAAATAGATACAATTT
TTGAATTATCTCACGTGGGGAACTGTCTTAATGCAATCAAAAACTTGTAT
GTATAGTTACCCCCAAGAATACAGTTATGATGTTTACAATCACTATAAAA
TGAATAACAAAAATGTTACAATAGYCCACAAGCCAAAGTGTGACAAGACC
ATTAGATCAAATCCTGGACTTCTATCAACATCCTGACTAAAAAACGCAAT
TAGTGCCAGTCATCTCTCTTCAAGGCCATCAATTTGGACTTAAAGATGAC
GTCTTACAAACACATCATCCTTTCAAAAATTATATAAGTCATCCAGGTTA
AGAAATTCTCGACGAATGAAGTTCAATGTTCATATATTTTCAGGTGGGGT
GGAGGTGTTAAAATCAAATTCAACTATAACTTCAACCCTACTTTACAGGT
GCAATATCATCTATTATTTAATATAGAAAAAATAGTTTTTAACTTCCGGT
GAAACAGTTTCAGCCATTTTATAGTTACATAACAGTCGTTTGAGTGGGTT
GATGTGAGTGTGTTTGTCAAAATAGACAAAATGGAGTATCATTAAATTAT
TTGTTTTTGAAAGTGTAACCTTTCATTAGATTAAAACAATAGCGGATATT
TCAAATTTGACGCGTCTAAATCAATATAACTCGAAGTAATTGAGCTAAAA
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GACGGGTTACAGAGACAAGGGTATCGGTGGGRGAAGTGTGTTTAGKTACA
AGGAGACTTTGGTAAAAAATAAATCAATCAAAAAACAAGAAATATATATT
GTATCCTTGTTAGGTCGGAAACTTTTCGGACATTCCTCGTATAGTCACTA
AGAAAGTTGGGCTAAACTAAAAGTCAGCGGAGAGGTCTTCTCATATGTCC
AAAATAAAGGCCCTAGTCTTCCTTCATACTCTGGGTGCCATTATGAACAA
TAGCAGCTGTTATTTATCCCACGGATGGTGTAAAGTATCTTTAAGCTTGT
ATGAAGGCCCTGCAAATCTATGATATTAAGTCCGTTTCCTACAAACATAC
AGCTGTCAACACTAACAAAAAACTAGATATATTAATCTGAGTTTTAGATA
GGTGGGGGATGGGATTTTTGTAAAAACACATATTACAGATTAATAATGGA
AAAATTCCGGGTTATGTATTTTTTTATTTTCACTCTTCAATGGATCATCG
TGGTGTTAACCTATGTGTGGTGATGACATCAAAACAGGCCGAGATACTTT
TTCTCAATATTGCAACAGTATTATAAACATATCCGTTGATATGAGTACTA
TAATTTATATTAATCTTAAAAAAGTGATAAATTCCTTAGGAGCTTTATTT
TTTAGGTTAACTGAACCTGATAAAAATGTGTTTATTTTGTAACACTGATC
TTACATAAAAGATACTGAGGCGTCATGATGTGAAAATTATTTTAAAAAAA
TATGTATAAAAGTATTCATCTTGCGAGAATAAATAAAAGAAGAAAGGAAT
TAGTTGGTTAAGAGACTGAGACTAAGAGACATTCAACTAAAATTGATTAT
ATTGATGATATCAAAATTCAATTTAAAGTTCAAATACCACACGATCAAGT
TGACTGAACTTTTATATAATATGTTCATGTAAACATTTAAATAAATATAT
ATAATATTAATAACTTGTGGAACAGCTTTTCAGTAGTTTAATATTGCTTT
TGACTCTTTAAAAAATCCTCTTCAGTTTTTATTTGAAGTATAAAGCTTAT
AATGCGTTTTTCTCTGTTTCATTAAAAAGAAATCCCAGTTTGCTTTGATG
TTATCGCTAATCATATATCTTTGATATTTTTTAAGAAAAAGCGCATACAT
GATTCCTTTTCATCTTTTATGAGCATACATGAATCAGGATTATAATAGAA
TTGAATGTATTAGAAGAGGAAGTTCACTACTGAGGAATTAAATAATAATG
AGAAAAGCTGAGGAATAGAAAATTCATTCTTCGGTTTACCAATTCAAAAA
AAAAACAAAAAAAACGGACCAACTAAAATATACACACTTTTTACAACACT
GTCCATATACGTGTGATACTTTCAAGTAGCTATAAAGATGCCAGAGTAAC
AATATCAAAGATAGATCCTTGATTTACTCCGCGTGGATGTTTATTTTAGG
ACGATGAAGGAAGTAGTGGGCTACTCAAAAAGCACAATTTTTGATATACA
ACAAAATTTCCGGACTGGAAAATGGAAGATGGGATTATTAAACATACACT
TGGAGGAAATTGTAAAATGTTAGGGATAATTTGAATAAAACTATTCCCCA
ATGTGTCTTTTTAGAAACTACAGTTTCCATACAGACAACGGGCAGAGAAC
TTGGAGTCCATGAGAAGGCCTTTCCCCACTGGGATTAGTTATAGCAACAA
GAATAATGCCCCTCAAAAGTACAGTTGGAGGTTTTTGGAAAAAACAGAAT
ATGGGATAAGGATAAATGTCTCTTTTTCATATATATGTTAACGACATATT
TGCTGGTTAATTACTTAATAAATATGTCGTTAACTATAACTTTTTTATAG
TATGTTGTTTTACAATACGTGTATATACTATATAATAGTCTGGATGGATC
TAATCGACCTTGTATACTTAGAAAATGCTATTTTTTCTCATTCTACCTCA
CAAAGGCATTGTTGATTTATGCATGTCAAATGTATTGAAAGTATACTATA
ATTAACTATGAATTAAATCTATTTATAACTTCTTTTGAATGTATGCAGTA
CTTTATTACAATATGGTGAATCCTTCAATTAAATATTTATTTGTGTTGTT
TTTTTTTTGCATTATCATTCAACTGTATATTTTCAACCAATGAATTTTCC
CGTAAAAACATACATATAAAATGTGTTAAGGTGTATTAATAAAAAAACCA
CCTTGTTTAGATAGATCGATTCATGATGTTGTTGGTGTACCTATTGTAGG
GTTTCTTATTTCCCGGATATTTTTTTTAATTATGAGATCCTGTGACATTT
GGAGAACCAATTGGATAATAATGAATACTACAGAATTGATGTATTTATAT
ATTTTTTGAAGAAACTATCAATTTTAAGCTAGTCTTATCCAGGGGGGATT
GTTTGAAAAGTCAATGCAAATTCCAGGATATAGTCCTACTGGTGGGTATC
GAGGTTATGTTTAGTTAGTAGAATCTTTTTGAAGAACACACACCATCTTT
CAGCCAGATCGGTTTATCTCTTTCTGTTTGGCATTCGTTAGAATCCAGGA
ATTGGCCATAAAGATTATGGCTACTGTCTTTTGGATTCACAAGGAATAGT
CCTTATCGACTATCTGGAAAAGGATAAAACTATTACAAGTATATTATTCA
TTGTTATTGTACCTTTTGAGAATCGAGTTGCAAGAAAAAACACACACGAT
TGGCCCACAAAAGGTCCTTTTCTATCACGGCAATGCATCACCTCACACCT
CACCAGTTGTGATAGCAAAATTAATGGAAATAGGGTTCCAACTCGAGATG
CCCACAGCACTAGTAATCTCATGCACCTTCACTCTTCTGTCATCCATCAC
CATATCATGGATTTTATCAATAATTTCTAGAGTAGTAACCTCAACAGGGC
GTCCCGAACGTTCAGTGTGACTTGTGACCATAAAGCCACTCCGAAATTTT
TGGAACAACTTATAAACCGTTCTATTCGAAGTTGCAGAGTCCCCAAAATC
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