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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s398 | supercontig | LSalAtl2s398:388164..498883 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000007012 >EMLSAP00000007012 ID=EMLSAP00000007012|Name=EMLSAP00000007012|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=785bp
TDKRTVLRTDDEDEEILKRPSSSQSHHSKKRSSFKERLKCTRTSSEAAAR RTRXVGAELKSQQGFLGLLRQKFGRATSPSRPLKGGEDENGVCDDTEILS TKRSNKDGGREXLPTYSGPIQLPPSQEVEIVQLMGDKDNTSLCSSVNKAQ QLRHTNSIGSSTLSPQVSFDNPHHDHFKSHSKFSLRINLKRGIDLAARDS GGTSDPYVKFFYKGKLFYRSKIVYKNLNPYWEEHFTQVIDDPLSPILLKV FDYDFALRDDFIGEASISLIPIELNVDSNFIITLIDPSSTSKNPENLGKV ELSIGLTPLSETESLISGDNKSLLDDSIISSNKKATPWSATVNIVLVEGK NLTAMDFEGTSDPYCKFRLGNDRYKSKPIYLTLNPKWMEQFDLTLFQDQS QELEITIWDKDQRTKDDFMGKCTVDLSSLAMEKTHELHLRVDEGSGEIFI LLSISGMTNYPGLTSIKNFDSFSLQNEQLIRSSYRFLNSFKDLSDVGFLF IKIYCAKGQNPQIQLEIKVTWNWLRAAIVTLNPKEEKYFTITEKFKRQVF LNNVMRIKGFIMEFVNLGVACQNILEWESPFRTILAFIAFTTITYYFQPY HVPIGLLIIFVKNYIAISYLGSRSQLSASHTHTATSDGMDEDEDMDDNDG SSQDKEEKKTLKEKLLAIQEVTAMVQNAIGCVASLVEEIKNTFNFSVPFL SWLAILILVIVVLILYFVSLRFLVICWGINKFSKKLIRPHTVPNNELLDF LSRVPDDEELLDRRELSTVPEEPSARTSAHKKKRN back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s398:388164..498883- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000007012-702859 ID=EMLSAT00000007012-702859|Name=EMLSAT00000007012|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=110720bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s398:388164..498883- (Lepeophtheirus salmonis) ACAGATAAGCGCACAGTATTACGGTAAGAACTTTATAATTATAACTTATA
GTAGTGGTTTGGTATTTTGTATTGATATAAATAAAGGTTTTTCTGATTAG
TTGCAAAATTTTAACAGATATTATGATATAGTTAACCCTTTATCGCCTGA
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ATTTTTACGACAGTTGGCGATATTCTGAGGGGCATGTTTATTGCTAGAAA
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CATATTCTGGTCAAGAAAATGGCCAACTTTTTTAACAAATGTCACTTTCT
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TCATTACGGGTCATGATTCAACTTCTGATTATAATCTTTTTCATTCCATA
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GTTCAAATAAGTCATATTATCCATTTAATTAATTATCGGTGGAATTGGCT
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GTCAAGCCCTATTTTCAGATGATTTTGTTAAATAAATGTCCTCACAAATT
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CTGCATCTTGTAGCTCCTGCACCTTAAATCCTCAGATATACAGTCCCTTA
ATGTTTTCTCATGGCAGCCCAGATCCCTCGCAATGGCCTTCATGGGCCTG
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CCTGACCTTCCTGTCGGCGCCCTCCTCCTTGGGTGCCCTCTTATGGTAGT
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AACTACGTATCGTCAGTTGACGAGAATAGCTTTCCTATTTGGTAACCGTC
TTCAAGTTATCAAGGTTTAAAGTAAAATCTGATCCCCGCTCCCTGTATGT
GCGTTGTTCGACTCAAACCTGAGGACAAGAAAAAAAGCAGCTGATATCAT
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TTACAAAAGAATTTCTAAATTTACGTTCCATTAGTTATGTAAATTTAATT
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ATACCAGGTATTCTGTGCTATTCTCAAACGTTGAAAGACATGTTGCATCA
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AACACTCTAATGTAGATCTTGCTTTGTTATTCTAAACAATATATTTATGG
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AAGCTTTTGACATTGGATGAATTGTTTACATTTTTACTAATTAATTCCAC
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ACTACAACTATTTCTACGATGTGATCACCTCCGGCCTGTTTCCTCAGTCT
ATGGACTGACTCCGAGTCCTTCTTTTTCCTCCCATCTCCCCTGTAGACTC
CATAAGAGAGAAACTCATGATCCTCCAATGTGCTAATTGTCCGAATTTCT
CCTCTGCAAAGTTATTTCCTTAGTATTTAAAGGTTGCAATAATTGACTTT
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GACGTGTTGGTAAACTTATACAGTGTAGCCCTAACCGAGTCTAACAATTA
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TATTTTATAAGAAATAATAATATTAAAATTGGTGTTTACTTTATTCAGTA
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GAATTTAAATTGTATGTCAGAATGGAAAATAGTCATTTTTATTATAAAAT
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CACTACTCGGGAATTGAATAATAATGACAACTGCTAAGGAAAAGAAAATT
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CAGATTTACATGTTTTTATTATTCGTTCATTCTTGAGGAGAGAACATATA
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TATTGTGCATTTTTGGGGGTTATTCTCTATATTATTAGAGTAAATTAGAG
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CTTATTTGGACACAAGTTTGAATTAATTAACCTTGTAAATATGGGAATCA
ATTATCTTTTAATTATTCTGTAATAGGTATTAAGTTCTGTGAATAATAAA
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TGTATTAATATTAATTTTCTTCAAGTTCTAGTGTTCATTAATAAATTATA
TTTTGTAGTTTAAAATTAAAAGTTTTGAGTTTGAAACGGACCACTCGATA
TATTTAGACTTTTTGATATACATATAATAGATTTGACTAATCTATTATAA
AAATACATTTGACTCTTGTAGCCCAGCTCTATATTATCAGAAATTGTCTA
CATTAAATATATTTATTTTCATTATAGAAGCTATTCCATAATATTGAACT
GCTTGTTCATTATGTAATTACAAATATTATAAGAGTATTGGGTTATTTTT
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TACTGATATAAACTAATTAATTATACAACATACATAAATACTAAATAAAC
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AATAACTAATGAAGGTTGAGTCATTGAAATAATTTCATATTTCAATATAT
TAAAACATAAGTAATTAGTCACAAAACAAATCAAACATGAGCTCTCTAGT
TTACGTACAAGTCGAGAAAATAACACTTGAAAATGATAGACGAATTTCCA
TTCGGACACTCTAAGCAGTTGGGTGTCTTCAAGAGCACTGTTTAGGGTGT
CAGCAAATCCGGAACGTTGGAGAGGAAGAAAATGGTTGGAAAGAGCCTTG
TCAAGGTGGAGAGGCCACTTTTGACACCATAAATGAAAGAACCACATCTC
TTCCAATGCAAGACTCTTATTAATGAGCTTTTTGAGCTCTTTTAAACTCT
TTTTTTTGCACTTTTGGCCGCCGTCCAACCCTGACGGCAACCCCTGTAAT
ATTATTCTAGTGACTATAATCTGCTCGTTAATGTGATGTCCAGATTGGTT
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GGATTTTTTTTTTTTTTAATTCCAAAAACCAAGCCCCCCTCCCAAAAGAA
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TTCATTTGAGATAAAAAAACTTAGTTGAAGAAAATGCCTTTTTACGACAG
CAAAAAGTTGCATTTATTCACAAAGATTTTCCAGGAGCATAGTAAAAAGT
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TTGTCTTCCCACACTTTTGAGGGGTTTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTT
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GGAGTAGTTGGCCTACAACTTGAGAAATACTACTGTCTCCATGAACTCCA
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GTTGTTGAAGTTTCATTATATGGCGTTACCAAGGTAAATAGAAATACAAG
GTTAGACCATTATGTAATCGGGATTGATGTAGTTTTCAATCTGATGTATA
GTACCGACTGCAGGGCAACAGAGGCAGATTTTGACAAAACACGGGACCAC
TCATAGTCTATGACGTCACTATTGCTAAAATTTTCATTTTAATGTATCGT
ACCAACTGCTCGGCAAGAAAAACCTATTGTGAMAAAACMCGCAGCCACTC
ATCTACTATGACGTCAATATTAAAAGCGTGGTGGAAGTCAAACACCAGTA
GTATACGAGTTATASKATGTATTTCTATTAATCTTGGGCGTTACCTCGCT
TACACAAAAATACCCTCTGTATTTTGTTGTCAGCTGTCGATCCCCTCTTC
TTCCTTGATATGTCATGGCTATTTCATAATTTATTACTTTTGATAAATAC
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TCGTTTTAAAAATTGTGAAGAAATAATATCACAGTGATAGAGTGGAAGTA
CATACGTAGAGATATATTGCAGTTGGTATCATTGACTTATTTAGCTAACT
ACCAGATGATTTGTGGCCTTTTTTCTTTTCGGAAGAAAGGTTGCTTGATT
CAATTAAGGTAACGATGCGCTGAATTTAAAAGTAGGATGTGGTTGACTAC
AACGTATTTTTATATACTAGCTATCATTAATTATTTTCTTAGTTTTATAT
TCTTCAATCCTAGCTAGAGAAAATAAAAAGATAGATAGAACTGCATAACT
GAAAGACCGATGTATCAGTACTAGGACGGATTTACCAATAAATCCGTTTC
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GTCGATCGTATGGACCAATTCATCAGTTTTTAAGGCCTACGGCTATCTTT
TTATTTTCTTCAATCCTAGCTAGGATTGAAGTTAGTCATTACTTAAGTTA
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AACCAGATCCGAACAGAGTTGGCCCCTTATCGGTCTAGTGGTTCTGGTTC
AAGTTTCAGAGTTCCAAATAGCTAAGGGCTTCTTATGGATCTGGAAAAGA
GGTTTTAGACACCAGACGGTATAAATAAAAAAGGAAAGGGGTGGGGTAGA
TTCTGGATCCAGATACACTACAAAGCTTGTTGGTGCCCTATAATATTTCT
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GTAGACTGAAAGTAATTGTCAATCTTCCTTGACCCTATTTGTATATAATA
TTATTTATTGGGCGGCAATTATCCAGCGACACCCCTTGTTTTAAGTGCCT
GTTACCAAACTGAGCCTGTATAAAAAAAAATAGAGACCAAAACTGTTGAA
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