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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s3 | supercontig | LSalAtl2s3:1196101..1219563 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000007047 >EMLSAP00000007047 ID=EMLSAP00000007047|Name=EMLSAP00000007047|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=702bp
MSGSSNGANAGISESKADLVSVEAADTNKPSFSINSWSRRTSLERLLLCI CGILVLLIVVMIILSIVRNERPLGPYPQPPAPIPHSKCTTPDCIASAHSL LQNMNPESRIADDKTYKSQFSIIGDELDEQIRDILESNGTENDSLVFNQV RSIYQACMNEDSLEGLGLEPMLKELKSLVMGFDQASLGLSREYLVQGFES ENVNYYYSYMQKVAVLLGASPEEAATQLKESLLFEMKLANASLPKEERRN ASKLYNPMKLIDVDDLMPGVNFTDYVNEPKRNVANYLLWRIASQGLFVLN KAAREISLEYRKNVTGTPADAPRWKKCVGAAGSLGTVVGHLYVSKYFKED AKHNMMEMVKYIKKEFKKILQEITWMDEQTRTRAINKLAAIKEYIAYPEE IMKVENLEELYKGLKINNNTYFENEKSLSLWSYSYLWKKLREKIDKTDWK RHAEPAVVNAFYSSIENSIQFPAGILQGVFFNKNRPHYMNYGSIGWVIGH EITHGFDDRGRQSDSNGNLNDWWEMETKKKFLEKAQCIIWQYGNYTSKAV NVSLNGVNTQGENIADNGGLKEAYRAYVSWESVHGQENSLPGLNFNSRQL FWLSAANNWCSKFRPKVLKNRILTGYHSPGAFRVRGTFSNLKEFSQDFKC PLGTNMNPINKCECIYYXLFYLFCQKKNNNYYFNSVSIIMYYFLNTSYFH TT back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s3:1196101..1219563+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000007047-702894 ID=EMLSAT00000007047-702894|Name=EMLSAT00000007047|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=23463bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s3:1196101..1219563+ (Lepeophtheirus salmonis) GTCAGTCAGTAGTACATTTAGTATTCGGCGTATAGATTAAATACTTAATA
ACCTACGTCTATTTCTATGAGGAAAATATCTTTATAAAATATCAATTCCT
AAAAAGGTATTACTATTTTCAAATATAAGTCAATATATTATGTATATAGG
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CCTCCATCCCTTCCTGGGTTTGTAAAATACATAGAAACTCCTTCAATTTG
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ATGTACTATCACTCAGGGGACATCCATTACAAATCCCTCTAAGTATATAC
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GAATTTAGTATATGTAGTGAGTTAAGACAAAAATAATCTTGAACACAAAT
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GCTGGTTCCAAGATTAATATCTCTTTCTTGCGAGTTTCAACTGGTTTGCT
CAAGTAGTTTGTTTACACAAACTGCTTCAGTAAACATCTTTATGTTTTTG
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AGCCATCTTCTGGCATCCTCAAACCTCTATATGCCCACAAACCTATACAA
TTTTTTTTCTGGGAAGCCTTTTACATCCAATGAAGACATTAAGAGGGTCA
TAGATGAATATTTTCACAGCAGTCCAGACTATCTCTTTCGGGAAAGGAAT
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CAATAACTTTTCACCTTATCCTGGTATACATACAGCCAAATACTTCATAG
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ATATTTTAGTCAATCAATGTTTCTATAGAAACAAAACTTACTCGGGGAAA
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GAATATTTTAATTGATCCTCTCGCACAACAGCTTAATAAAAGCTACAGAA
GAAGAAGCAGAAAACTTGATTTACATATCTGAGGGACAAACCTTCAATAT
ATATATTATTAGTGTTGTATTCGAGTTATAACAATTGAGCTCAAGTAATT
GAATATTCAAACCTGTGGTTAGAATATTATCATTACGCAAAAGTATCGTC
TACTATGGGGAGCTCCAAACCTTCAAGCCTTTGGAACAATACAGATTACA
GATCCTGGATGTTCCAAGGGTCAAAACTTTTTTTTTATTTTTCTTGCCAT
TCAGCTTTCCCGCTGAATGTTCATTTGATAGTCATTTAGATGTCATGGGC
TAGATTGAACTCATGTGCCGTAGACCCCTGGTCTAAAACAGCATATTATG
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AAAATAGGCAGGAATACGACAAAGAAATTTACAAAGATTTACTCAATAAA
AATGGAGGAACAACTGTTGATGAGATAAATTTACACTCGACCAGGAGCGT
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TGTACATCAAAATTTAAAAAATATTCTTTTAAGAACACATTATGAAAAAT
ATTATTTGTGAATATGATTTCCACCAGCTCCAATTATAGCCTTCAAAAGA
GGTCGGAAGGCAGTACAACTATATTATTATAAMTCTTCGKCATCCTCCTC
TAATCAAACTCCTCATAGGGTATTTTGCTGTAGCAGACTCTACAGGCTTT
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TAGAGAKGCCMCTGCMCYCRACTWTTTRAAGTTYTACYCATTCGRGTTCG
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TGACAATTCCACATGTAAAATACGCAATCCCTATTTCCCCCCAAAAAAAA
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ATTTTTGAAATTTTTAAGCAATATATTTTTGAATTTTTATTTCAAAAAAT
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CTTTTTTAAAGAGCTATGGATTTTTAATTTTTTTATCTAAAAAATAATTT
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TTTTCTTGATTTTTTTTTTTCCCAAAAATTAAATTTTTTGTGAACACCTT
CAAATTTTATAATTTCTGAGCTATAGACTTTTGAATTTTGTTGTCAAAAA
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ATGAAGCCCCTACTTCTAAACATATAATCTTGTGGACGCCCCTGAATTAT
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GCTTGGGTACTGAATAGATTCATAGGACATTACCCTTAGCATATTTTTGC
TCATAAAATATGGAAAAATATTGACTTTTGGCAAATAAAATAATTTGCAA
GATCTCCATCTAGGGTTACCCCACATGTTTTCCCAATTGATATGTTTTCG
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ACAGGCACTCCTGCAGATGCTCCGAGATGGAAAAAGTGTGTGGGTGCTGC
TGGATCCCTTGGCACTGTTGTGGGTCACCTCTATGTATCTAAATATTTCA
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GAGTTTAAAAAGATCCTACAGGAGGTGAGGTCCTTTTTTTAATATTAAAA
TATACTTTTTTAAATGGCTGAATACAGATAACTTATACCTGTTTGCAAGG
CTTTACAATTGATATTCATTATATAAAATGAATATCATGCATGTTAAAGT
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TCAAAGTAAACTATACAAAAGATATGCAAATTTGTTAGTGATAAATCCGT
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GGAAACTACATTTTAAAAGTTAAATCTTAATTAGTATTACCACATAACTA
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AACATACGAGGTAAACATCTCAAAGTAAGATTACATTTCGAATTTTACGG
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CACAAACATATATTTATTTACTGTTCCAGTTATATAATATGGTTCATTTG
TTTGTGAGAGGCATAATGACAATAAGTATTTTGTGTGTTTGGCGATTTTT
TACTATCTCAATTGGGATGATTGGGCTTTGGTTTCGACATCATAACCATA
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CATTGCTCATGAAATGATTCTTTTGGTCAAAATAAAGCAGTTTCGGAACA
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GCAAGAGGCAACTGGTATGTCAATATCCTCAGAAAATTCTCTGATAGTAA
TTTTCTGCACTGCTTCAACGTTTTCATCCATTGTTGACATGCTTTGGAGT
CCAGAGTGAGGCCCGTAATGAGCATCCTCCTGGACAATCTTGGAAGAGTT
TCTACCATTTGTAAACATTTTTTTACTGAGAACAGTTTCATCGAATACAT
TGTCAACCTTAAAGTGTTTTGAAGCCCTTAATTTCATTTTTACACAAAAT
TTTATGCAAATCCTTTGATTCATGTTTTTTCAATATAAAAAAATCSCCAA
GACGCRCATACATTATGCCTCTCACAAAAAAAAAAAAAACATAATATAAT
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AAATAAAAATTGAGCATACCAAATGTAAAATGCCCGCAAAATTTGAAAAG
TCATCTTACTTTTTGAATACACCTCGTATATATTTTTCTTGTAAAGTTAA
ATTATGGGTCTTTGAAAATAAATGAAATTAAACAGTTTTCCAGCAATATA
TTTATATTTATAGAAAATATATACACTTAATTTTTTTTTCATCTTAAAAG
GTTAAATTGTCTAAAACCATTGTGATATGTTGGTTAAAATATGCTTTTCT
ACATTCTTAAAGATTTTTTCCTTTTCTTAATCAACTTCTTATTTAAAAAA
AAGTAGATTAAAGGCTACTTAATAAAGGCTTTTTATTAATGCAATGAAGT
GTCTGCCTGTTCAAAATAATTCTTTATTTTGAGTAAAATGTTTAATTTGC
TTTTTGATTCTTATGTTTACTTTCTCTCACTCTTCATATTTTAATTCATT
GGTAAATCCAACTTTTCATGATTATATTACATATAAAAAGCATGATGTGA
AATAAGCAATGTACATATATGGTGGTCTATATAAAAACAATCCTGAACAA
AAAAAGAAGAAGATATAATCCCTATTAATTTTTATACTTCAGAAATACTG
GGTCAGGCACTGCTATTGAAATAAACTTTGAGCTCATCTAAATCCTGAAC
AAATGTATTGTGACTGATTTCTGGTTCTAACTGATAGTGCAGATAGTAAT
GGTACATTGATTTTCAATATGACCTCCATAGGCCTCAATTTTCCCACAGA
GTATTCAAATTGCTATATTAGTAATATGAGATCTTTTAATGATATACAGT
TTCAATAAAAAAAAGTTTGCATTATCTGGCATAGCTTTTCATTCTTTTCT
GTGTTGATCATTTTCAAGTAATAGACGCTTCATGAAACATTTTCAGAACT
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ATGTAAGATACCAAAGAATTTTAGCTATAGATTAAAACCTTTTATTTGTT
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AATAAGATTAGTTTGTTAATAGAAATTAACAATAACTTGTCAAAAAATAC
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TGTTGATGGGCTGCATATGTTTCATGTCAATTATCATTCAAATAATGAAA
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TACTTCACTATGGCATCCTCAATGCTGAATAATTAATTTATTTTTATAAT
TAATCAATGTGGTTCTCCGGCCCTACTTATTATAAATACTTGAAATCACA
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TTCTACATGTAAATGCATATTACACACCTTTTCAAAGATGTATTTGCCTA
CATTTCAAAATTTACATATGCAGGGGAGACTGTGAACCATTTCAGGGTAC
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