EMLSAT00000007047, EMLSAT00000007047-702894 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000007047
Unique NameEMLSAT00000007047-702894
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s3supercontigLSalAtl2s3:1196101..1219563 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000007047 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000007047EMLSAG00000007047-689813Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000030948EMLSAE00000030948-739876Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000030949EMLSAE00000030949-739877Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000030950EMLSAE00000030950-739878Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000030951EMLSAE00000030951-739879Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000030952EMLSAE00000030952-739880Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000030953EMLSAE00000030953-739881Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000030954EMLSAE00000030954-739882Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000030955EMLSAE00000030955-739883Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000030956EMLSAE00000030956-739884Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000030957EMLSAE00000030957-739885Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000030958EMLSAE00000030958-739886Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000030959EMLSAE00000030959-739887Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto780525auto780525Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000007047EMLSAP00000007047Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000007047

>EMLSAP00000007047 ID=EMLSAP00000007047|Name=EMLSAP00000007047|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=702bp
MSGSSNGANAGISESKADLVSVEAADTNKPSFSINSWSRRTSLERLLLCI
CGILVLLIVVMIILSIVRNERPLGPYPQPPAPIPHSKCTTPDCIASAHSL
LQNMNPESRIADDKTYKSQFSIIGDELDEQIRDILESNGTENDSLVFNQV
RSIYQACMNEDSLEGLGLEPMLKELKSLVMGFDQASLGLSREYLVQGFES
ENVNYYYSYMQKVAVLLGASPEEAATQLKESLLFEMKLANASLPKEERRN
ASKLYNPMKLIDVDDLMPGVNFTDYVNEPKRNVANYLLWRIASQGLFVLN
KAAREISLEYRKNVTGTPADAPRWKKCVGAAGSLGTVVGHLYVSKYFKED
AKHNMMEMVKYIKKEFKKILQEITWMDEQTRTRAINKLAAIKEYIAYPEE
IMKVENLEELYKGLKINNNTYFENEKSLSLWSYSYLWKKLREKIDKTDWK
RHAEPAVVNAFYSSIENSIQFPAGILQGVFFNKNRPHYMNYGSIGWVIGH
EITHGFDDRGRQSDSNGNLNDWWEMETKKKFLEKAQCIIWQYGNYTSKAV
NVSLNGVNTQGENIADNGGLKEAYRAYVSWESVHGQENSLPGLNFNSRQL
FWLSAANNWCSKFRPKVLKNRILTGYHSPGAFRVRGTFSNLKEFSQDFKC
PLGTNMNPINKCECIYYXLFYLFCQKKNNNYYFNSVSIIMYYFLNTSYFH
TT
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mRNA from alignment at LSalAtl2s3:1196101..1219563+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000007047-702894 ID=EMLSAT00000007047-702894|Name=EMLSAT00000007047|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=23463bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s3:1196101..1219563+ (Lepeophtheirus salmonis)
GTCAGTCAGTAGTACATTTAGTATTCGGCGTATAGATTAAATACTTAATA ACCTACGTCTATTTCTATGAGGAAAATATCTTTATAAAATATCAATTCCT AAAAAGGTATTACTATTTTCAAATATAAGTCAATATATTATGTATATAGG TATTTCTAATTGTGAAATTTGCATTTTGTATCTCATTTATTACTTATAGT TTGTTTTGCGTGATTGAGATTTGAATAAGCCGGTGGATTTTCCGTTCACA GTTCAAGAAAGAATAGGGTAAGTCATTTACAATATTTTTGAATATATTTT GATTAATTATATTATATAATTCATTTCAACCGAATTGAATTTGAGGGAAG AAGACGATGTAAGAAGAATCCTCCTTACTTTTGAAGTCAAATTTAAATAA AAATGCCTTGCAAAAAGTATACAACTTTTTTCTTGATAAAAGAATGTTGT ATATTCCTAGTATTTTAATTATTTTATTTTAAATTAAAAAGTATGTTTTG AATATGTCTTCTTTGAATTGATTAAATACACTAATATGAACGTATGAAAA CAGTGATCATGCCCCTTCGTTGTTGAGGTCTCCACATATTGTCCTTCGTG GAAGGTTGTTATATTTGATGTATATATATTATAATATGTCATGGGAAGGT GGCTGAAATGTGTGTAGGAAAAAAAAAAACTTTAACCAAGGTTTTTTTTA CTTAAAAAAAAGTTAGTGAATGACAGGGACAAAATTCTTTTTTCAACTAG ATTTCTTCTGAAAAGGAAGTAGAAGGTGGGGGGCGTTCGTTCGTTCTTTC CTTCTTTATGGAATGCAACAGTTCTGTGCTTAAATTACTGACTTGTATCA AATAGCTCTCCTATCAGTTATGCTCTTGTTTGCAACTAAGATATATGATA CATTTTATTATTGGATATCATAAGTCCTCTAGTTTCATGTTCAGTTTTAG TAAAAATGGTTGCATATTTATTGCGTTTTTTCTTTCTCTCCTGCGTACCT CTACATACATACTTGCAGATGATTCAAAAATTTACGCATAGATTTACGCC ATTTTCAATAATTATTATATCAATAAGTAGATCGTCTCATGACATTATAT AATGGGAAGTTTTTGCCATTTTTTGTCCACCCCCATACTGAATTTGGCAC ATTTCTGTAAGCCCTCCCCCTAGTTTGTACATAGCATTTAATGTAACTAC AAAAGAATTATCATGAACCACATGTCTAAATTTACGTCCAGAAACTTTAT GTTTTTTTCATTAGATTTTCTTCATTTTTGTCTAATATTTTTTTTTGTGT GTGCTCTTTGCAGTTCATGGGTCATTTGAAAAGCCTAGATGATACATACT TGATGCATAATTAGTAATTTAACAAAAAAATATATCACAGATATATATAT ATATAAAAGCAAAAATATAGTTATAAAATTTTCTGGAATAATATATATAT GATAAGCAAATTCTTCAAATAGAAAGTTAGATGAGTTGACTAATTTACAC CAATTTACAAATTAGTATGTAGGTATTTATTTAATTATTTTTCACCTATT CATGCCATTATGTTGCGGTTTTTTCATTCTTTTTCAATGTTTGAGCCTTT TCTTAAAGAATAGATAGTTGTCGGGTCAGTCAAGGTATGTAGATACGAAA GTACTGCTTTAAGAGCTATTAAGAACAACATTTAAGCAATGGGCTTAAAT AGGTATAGCTTTGTACATATGTAGTACAGGTTGATTCTTTCTTCTTTGGT GTTTATTTTTATACTTTTGAACTGCAACAGGTTTCAATAGGAGCGAAGAA TCCTCTTCACTCCTAGGAAACTGGATTTTAATTACCTACATATACTGTTA ACCAAAAAGATATTGCAAAACATGTCACTCCACAATGCATAATATTACGA AATAAATTGTATATTTATATTACAATATAGGTATTTATTATTTCGTGTAC ATCAAATATCTATTACAATACAATAGACAATTCTTGGAGGAAGTCTTAAC TTGTAAAATGAATTGTTTGAGCAATTTTACCTTCTTTTTTAATATCTTGA CACAAAACTAAACATATTTAACATGTTGTATTTTTAAATCAATTTGCACA TGCATCCATAAATATGCAAGTATATTTGCATTCGGTATTGACCCATTTAT GATGTGAAGGGACATCCACAGGCTACTTACCCATCTTATTTGTATTTGAA AATTCCTTAGTCTCTTATCTAAGATCGTATTTTTTAATTTCCTTAACTAT TCTTTTTAAGTCATTTTCAAATTATTTTTTTAAGATAACCGTATCTTTTA AACGAAGATTTATAGGTAATTAAACAAAACAAGAATTTTAAGACAAAAGT TGAGGTCAAAACAGTCAATGCATTCATTGTACAAGTCGTTTTTTGTTGAG CTAAAACATAATATTGAATTATTCTAACACTGTCCTTAGTAATTCATGAA TATAGAGAGCTTATAAATAAATCAATAATTATTCTTCTTGTGTCCCTTGA GACAATTCTTCTTTCTATTTTTTTTTTTCAAGATTTAGTTGACTCCAAAA ATTTACGGTCTGGTTGTATTTTTAGTTGTATAAACAAATTCAATAAACTT AATGTAATTTATCTTTCTTATTTTGACTCTCTAAGCAAAAAAGGAAAAAA ATGGAGTGACATTTTTTGAGTTACTGCTTAATATAAACTTAATTAACCCA TGTATCTAATGTATAAAATACTACACATTTATAACATATACAACTAGTTC ACCTGATAAATCGGAGACGACAGTTTTTAATACTTATTATTTTGAAACAC TTTTCATGTTTCAAAAATGATAGACGCTACTGTTTAATCAGCAATTTTGA ACTAAAGTGGTTTGAGTTTCATATCATGTTTTGATAGCTATGATTTGTAC TTTTTTTTGAAAAATAAGTGAAAGACATGTTAAAAATAATTCACACTTCA AGAGTAACTGCGCAGTATGTAGCTTCTATCAGATTTTAGGATGACTTTTT CATTTTTGCTCTCTGAAATTCAATCCTTGTATTGCATGTAAGGTAATACC CATTCAGCAATGAGTAAATAACAGTTTGCACTTATATATATATAGTTTTA AAGTGATAAACAATCTTATGCCAATCAAAAGTACAAATAATATTCATTGC TATTTTTGTGTTAACAAAGAAATAAACACAGATTTCTTCTATTGGGATCT TGATCTCTGTCCTTACACGCACACTAATTTTTTTTTTTTTTGTTTATTGT TGTAGACGACTTTTTCTTTACCTGCAAGTAGATAAAAAAAATCTTTTTGA ATTCATGATGCTGTATAGTATCTCACATGCTCTGAAAAGTTTTTTTAGAG ACATAGAAAATGATAGCCTGTCTTTGGACAATTCTTAAACTTTTTTAATT TTTAAGGTAGTTGATTCCCTCAAATATATATATTAACTCACACGTACAAC ACTTGTGTCGACTTTTTGTAGTTCAAAGCGGCGTACTACAAAATTTTAAG TACAGTAAGTGTGTACACATTATATCAACACACACTTTGAAGTAAAAAAA ATTCGTAGAGAAAGTAAGTATATGTAGTCGTAGTAGAAGCATATTTAAAA AAAAAATGAGGAGCGCGTCAAAAGAATAAAAACATACATTATATAAAATA CACTCAACATTGAATTCCTAATAATTGTGCTATAGACATTTCCATATATA ATATTTTCAATCAATTCCTCACCTCTCAGTCCTTACAAAAGTTTCAGTGT TGTTCTATGTATGTAGTTAAAACTCATTATCATCATAATAAATGTATTTA 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