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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s3 | supercontig | LSalAtl2s3:814660..830201 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000007090 >EMLSAP00000007090 ID=EMLSAP00000007090|Name=EMLSAP00000007090|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=659bp
MNSNSNNIHHKNSSYNHTNSSPLISIPMINHAGEDEEDEGGTLEDEDLSI SVDGTSSSEVTGTETTKLAKIDFLVSFLVDARGGTMTGCRHSGLRVIIPP KTAPQPMRITCRYFTEDSLLFPPPMNEGEGLACRILKVGPRGSKFLGPVL IEVPHVSSLNEGERELFVMRCNNGRKWIPHEFENFETEREHVLNVAHAIE SMSMSSPEPPPEDLTSVTNVSKYGSSAYLEFPPQPLRNSDAFFHILSHNF PQYFAIISRVRQDSQIIGPKGGTLRSSITPKVQVHFPLKAVVKDIRIGLS VKSIHEELIQDFQLQGGSTSPMVTIXPRRXKXXKPVTVCIPLPEKFNKKG SETIETCLKLVCSMSGNFNKAYWEDVTDTTPIDIIDGCIQFTSVISASFW LINVPKWMSSDVILTTDSLHKNTNRVPYWVRFHAYARKRSNDHPANVQIR VLVLTEADRGVRPLELQEDFKEIARSDFVQVLEKTXLKKVHLNKYFLCTS FWLINVPKWMSSDVILTTDSLHKNTNRVPYWVRFHAYARKRSNDHPANVQ IRVLVLTEADRGVRPLELQEDFKEIARSDFVQVLEKTDIGVEFGGNLIII EGEPDDWRRTFQPFSDNRQGFVIKRRKVHNPYGKGTIIFKSLNENTTLFE TKVDVSKFL back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s3:814660..830201+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000007090-702937 ID=EMLSAT00000007090-702937|Name=EMLSAT00000007090|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=15542bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s3:814660..830201+ (Lepeophtheirus salmonis) GTAATATGTTAGTTCTTCTTTTCTGTTTAGTCGTCTGTTTACTCTGACAG
TCGGGGGGTTTGTGAGGAACTCTTTAATGAAAAAGGAGGAGTGTGTTGTT
GTTCTATTTATCGTTCTTGCTGCTGTTACTTGATGATCATTCTTCGTATA
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TGACATATCAAGGCTTATTTTTTTCTAACCTATGTATAACTTCTAAATAA
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GCTTTTCCTTTGCATGACTAAAAATTAAAAGGTTTTTTCTTCCTTCTTCG
TACATACAAACACACAACAATAACTCCTGCTTGCTTCCCTTACCTCTCCC
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TGTTCAACTTCTTTGAACATCTTTCTCTATAACAATGGGCCTTACTTGGA
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TAGCTCATAAAACGGATAGTCTTGATTATTCCAAAATTGATTAACTGCTT
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AGATTATTCGATATGGCCACCCTTAGCATTAATGACGCCCTCCAACCTCC
TTCTGAGGACTTGGCACACTTTGATGATATAGTCTTCCAGCAATACATTC
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GTAGTTGGCAACTCCCTCAACCTGAGCCTATGTGTTGTAGTCCAATGAGT
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GCCTTTGTCAGGACTGACCTCTTCTTCCCACATCATTTCTTCCTCTTCAT
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GTATGTTGTTTCGAGTCTGACATGTCAATCTGATAACTATCATTTGGGAC
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TCCTGGTATATAGTAATTGTAAATTCTTAAAAAGTGAGGGTTGAGTGTCA
TAAATTGAGAATCGAGACCCCAAAACACTCATCAACAATCCCTCTTTTCA
CATCTCTAGCCATGATGATTAAGGGTTAGAATAAATGAGCAGAAAAAATT
ATGTTGACATTAAAGATAATGTGTACTTTATTTTTTGGTTAAAATACTTA
ATTTTACATTATACACATATAACCCCCATGGGTGGGGTCAAATAGGTATA
TCACACTGTCCTGTACATATATTTTAAAAGTTATGGTATACCTCAGTTTT
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TTTTGCAAATAATCTCTAGGCTTTTCCTTTATTTTATTTTGACAAATATC
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TTTTGTGCGTATTTCCTAAATATTTTTTGAAAATAATATGCAATAATGTT
TGATTTTTAGTGCAAGGAATTTGAATCATTCTTTAAGATCCATCATTTTT
TTTCTAAATGAAAGCTCATGAGATATAATTTTTTTTTCTTCTTATTTTTT
GTGTGTAGTCGAATTTTAACATCAAAACAATGTTACGGTCATTTAAATTC
GGATTGTATCGGACCACAATATGGTACTTAAAATAAGTCGTATCCCTGTT
GTCGATTATTTTACAAACGTTCCTTAGAACTTAAAATTTCTACAAATATT
GTACATTAGTGAAGTACCTCCCTTGTGTTCTAGGTACTTTTTGCCTTAAA
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AAAATTAGTTTTGTTGATTAKTATAAACGACATTAAATATCYTANNNNNN
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CAGCTTACTTAAAATACTATTTATTCTTGTAAAAATGAGTGAACATTGAT
TGGTGATGATGTCAAAATTAAGGCCTGATACACCCTTAATTCCATTCAAT
TTTACTAACGGAATTTAGTGTTTTATTTGTTAAAAATAATTATTCACGAA
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GTTTTGGCTTTTATTCACAAATATTAGCAAATATAGATTTAGACGGGACA
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TCCTTGACAATTTATCAATTAAATAAACGCAATTATTTATTATACATGAT
GTCATTGATAATAGGGCAAGGCCCAGATTGTGCATACTATTTATAAAGTA
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TTCAGTTATTCTCAAACTTTTTACATTGCTTATCTAGGGTTCTTAGTTTT
GAAATAAGTTTGGTGTTAGATTATTCATCCTTTTATGTCACGTCATTAGG
CTTATGTAGTCATTCAACCGCCCTCTCAAGTTCTTAAAATAAATTCTGAA
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AAATTGGAAACCAGATCTCCAGATAAAGCCATTATTTTGAAGATCTACTT
CCCACCTATTACAAAAACAATCGTTTACTACAAAAGGGAGTTTGTCTATG
ATAGTTTAAGAAATACTGCCTTATTCATTTACTACGCACATTGGTCATTC
TAATTAACAAGTATACAGTACAATGACGTTATTATTTCATTAAGTTCAAT
TAAATTTACGCATTTATTAAGTACTAGCGGTAGTTCCCGACATTGCCCAG
AGTTATTGGGCGTCGACGAACATTTTCTTAATAATATAGGAAGTAATTCC
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CATGTACAACTGATGTTTAACTTCCACAACGCTTTTTAATATTGACGTCA
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ATGGTCTTACTTTCCATTTCTATTAAACTTGCTCAATACTTATATCGAAT
CATATGACGTATTATGTCCTCAAAAATGAAAGAAAATGATAAGAGTTTGA
GAAAAAAAATTGAATATGATTGGATTACGGATGAGTACTTTAATATCTAG
ATTGCTCACTAACAAAAACAAACAAACAAGTGATCCCCGTATGCTAAATA
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TATTCGAATCTTAACATACGAGTTTTCTTCAAAAAGTAAGGGGACTTATT
ATTTCTTTATGAAAAAATATTTATTTATTCATTAATATTTATGTTGTCCC
CTTCAAAGTAGTCCCCCTCTGATAAAATATACTTGTGCCAACGGGTTTTT
TCTTTTCAAATCCTCAAAAAACTGCTCATAAACACTTTTCGGTATATCTG
TGAGCTCTTCCTGCGATGTAGTCTTTATCTACTCAATCTTTGCAATTCTC
GTCTTTTGATAGGTATCTTCAGTTTTGGGAAGAAGAAAAAGTAACATGGA
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GGCGAAAAAATGCGACCATTCTGTAGGTAAAATTTAAGCAGTTTCGGAGC
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GCACGAGCAAACCGATATCCCAATATCCTCAACAACTTCTCTGATAGTGA
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GTTATTGATATAATTGGCCGTCTAGAGCGAGGTTCGTCATTGGCATCTTC
CCAGCTATCTTGGAAGAGATTGTACCACTTGTAAACATTTTTTTTTTTTT
AGTTAGAACAGTTTCAACGTATACCATTGTCAACATTTCAAGTATTATGG
AGCATTTAATTTCATTTTTTAGACAAAATTTGATTTAAATTCTTTTATCC
ATCTTTTTCAATAGTAAAAAATCACCGAACACTAAAAATACTTCTAAACC
TTTTACTTCTCACAAACAAACTAAACATATTATATAGCTGAAATACTGAA
TAAATATTCGTGGCGAGTGTACTAACGTAAGAAAAAAAAAATGAGCACAC
CAAATGTAACATACCTGCAAAATTTGAATAGTCATCTTACTTTTTCAACA
CACCTCGTATACTGCAAATAAATATGAACTACGATATACATAAAAGAGTA
ATAGAAAAAACAAACAAAAGTAGAGCTACATATTCGATCTTAGATGCACA
CGCCTGCAATACTTCATTAATACGGCCACATTGTTATTTCTAAGATAAAA
AATATATATACACCAGGAAGTACTATATACAGTGCAGCCTGTATATACCG
GGTGGCCTATTGAAATCTAAATGCTTGTTAATTCGATAATTGATTAAGGC
TGGGTGATATAAACTAATTCATATTTCAAAGCATAAACAATTAGGTACAA
AACAAAACAAAGCGGAAGCTCTTCGACTTACGTACAAGTCGAGAAAATGA
CACTGAATCGTGATCAACGATGTTCCATTCGCACCCTCCAAGCAGTTGAG
CATCTTCTAGACCACTATCTRCACCGTCAGCAAGTTCGAAACGTTGAAAA
GGAAGAAGGCCTCTGTCAAAAAGGCCAAACTGCATCCAGAAGAGTTATAG
AAAACACCCCAGCTTTTTTCCCTCAAGTCCATGACCATGAAATAGATCTT
GGGAGTTTCACACCAGACTGTCAAGAGAGCTATACAAAAATGGGTGGAAA
GAACCTTGTGAAGTTGGAGAGGCGACTTTTGACACCAACAATGAAAGAAA
TCTCTCTCTTTCGTTGCAAGACTTTTTTTAACTGTTTCTTGACACTTTTG
CCCCCCCCCCTCGACTACGCCTTTTGGATGCATGTCGAGGGGAAGGTTCC
AGTGTCCGTCATCCAAACACCGAGTCTATCAATGCTACTGTCAGCCAGCA
CACCATGAGAGAGGKCTCCATTGGCYGCYGGMGCCAGGCCTTCTGCCKCT
GCCGTCACTTGGAAGCCATCATTCCCGCTAAGAGTGACTACATAAATGAT
TAAGAGAACTCAGATACGGATCTCTTTATAGTATTAGTTTTGTTGAAATT
CTATTTTTAATTAATAAATTATATCTTGTTAAAACTCAAAGTCTTCATAC
TTTAGTGGAACACTCGGTACGTTTGATGCTATATCGACAGGCCTGCAATA
TTTCATTACTACGACTACACTGTTACTTCTTAGTTCAAAAATATTTATGT
GATATACATCATCGATATATATGACTGTTTTTCATACATTCAGACATTCA
TATGGATAAACTTTGTATTATTAATATAGATTTACGACTAATATAACTGT
AGGTATTTGAACTTAATTTGAATTTACCTTGCCACAGAATGCTTATCAAT
TAGTAATTTTTCATTAAAAAATTTAAAAATTACTACCATCTATAGAATAT
TCAAATATGACATAATCCTCTCTCTAAATACTCAAAATGCTTCATTTAAA
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ATGCATAGTGATCTATTACACTTAAGTAAAAGTTTATAAATTATTTTATG
TTTTATTACAGCATAATGACATCTTCCATCTCCATCATTGTACATGACAA
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ATTTTTGTAAATATCCTAACAAAATAATATGTATGTCATTTGCAAAATTG
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AATATAATCGCCTCTGGCGTCAATATCAGCTTTAACTCGATCTTGGAAAC
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAGACA
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TTTGCAGTGTGACATGGAGCAGAGTCTTGTTGCCAGACAAATGGCCTACC
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TGTTCTCATTGGCATCAACTTTGAGGATGCAGGGTAAATATGGAGTAATC
CCGTGACCTTCTGAGGTTATGGATGCAAACAGCATAACGATCGTCGTAAA
TTTTGTCTGCTTCTCTTTCGGAATATTAAACCGACTCATGGCCAATCATC
TGTCGTTTGCCATGATTGATTTTTTGATCTTGGCAAAAGTTCTTTTTTTT
CAGAGAAAATCCAGCTCAATGATGGTTCAAGAGGGTGCTTCACCTCGTTC
AGCAAACGCTTGGGATTGCACAACCTCTGTTCCTTTGTATTTTCTGAGAT
CTTCGCATCTTCTATGATTTTTATCGCAAATCATCTACCACAAACCACCT
GATAAGCCTTTCATAACGGTTGAGATCGCAGTCAATGGCTCATATCGATC
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GCAGTCTGACCTCATCTTGTGATCAGCACGCTTTGTAATTGATTAATAAT
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TGATCGATGCCATTTTTTAACTGACACCAAACACTTTTAACAAGCCACCA
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ATAGTTCCTTGTTAAACAATGGCCCTCCCCCTGTATATGAGGGTTAATCA
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CAGAAAGGGAATGTGGAAGATTTTAGGTTACGCCTCTTCACTTTAATTTG
ATGAACTTTTTTAATAAAGGACACTTGTGTGTACCCTTAAACAACGAAAA
GTATCGCTGAGGATTTATTGACAAGTTATAAGTCTGAGTCGGACAAAGAA
TAGAATTGAGGATTGACAGCAGAGGKATTCCTGCCTATGTCCGTGCTTGA
TATAAAGTGGGACTTGTGTTTGTTTCCTTTATCTCACAGATGTTCATATT
GAATTTAATGAAACCTTCAGATGTTAATTTTAGGTTTCTTTTTTTTACAT
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ACGATACGATGTTTGTTGTATTAACGTGTGGGTGACATAAATAATTAATT
GATGTTTATATTAGTAGAGCTATATTTCAAGAATGGTATGTTGTATTATT
TGACAACAGAGTTKATACAACACTAATGGTATTTTTTTCATAATTATTTT
TTAAAAAAGCAAAGCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAATATATATATATAT
ATATATTCTTGCAGACGCCTCGGGTATTCTTTTTGCAATCCTTACTGAAG
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TGCACTTACAACGTAACATTTGAATCTCATCTTGTTTGAAGTTGTGAACT
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AACTGATTTTGACCCTTTTTTCTGTTTCTTTTTGGAGAAAACATTTTGAC
ATAGCATAAAAGTAGAGATGGGATAAATTATAATATTATAGCTCAGAAGG
GGGGGGGGGGRGTTAAATCATTGACAGAACATCTTTTTTAATGATGTATT
GGCGATGCAAGAACAGGTTTGAATATCATTTTCGAATAGTACGGTCTACA
TATTTGAAAGCCTCTGTACCTTGGTACCACTGTAGTTAGTGATGTAAACC
GTATATATTTTTTAACTGGCCCATTTTTTTGGAATTGGTGTTCTCAAGGA
TAAGTTTTCTTTTCCTTGGCAGTTATCATTATTATTTAACTCCTGAGTAG
TGAAGTTCCTTTTCTACTAAATTCAAATATATTCGAAACTTGATTGAACA
GTCGTGTGTAATCATAAAAGACGGAGAGTAACCTTGTGGTCTGTAGAAGA
GTTAGAATTAAGAGTCTTTGTTGACTTTAGAGTAGAATTGAGGATCTACA
TCAGACTAATTCTTGTCAAAATCATTGTATATTTCCTTCTCCCCCTCCTC
CCTCCTTACAGCTGACCTAATGTAACGTCATGACAGCAAACTGGCAGGGT
TACCATGCTTATTTTTGGTTCCTTTTTTTAACATGCCCAAAATACACACG
ATTTTCATCACGAACTATTGTTCAAAACTAATATGTAAAAAATTGTTACT
AATAGTCGCGTGACATTTATATATTTCATAATTATGTGTGTATAGCTATA
TATTGACGTAAAAATCAGTTTTGAGAATTTTGATAAGTCCATAGGCAAAA
AAAATACGAACTGAATTTTATGGTATGAATCGATATTTGTGAAATATTAA
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AATGATAATTTATTAGCAATTATATGGAACTACTGGTGGAAAAGACCATT
TTTGGATCGTGTATGGTGCTCAGCCATTTTCTTACATATTTAATTTTAAG
ATTTATTTTTCATTACAAAATATTGTTCAAATTAGTTCAAATTTTAATGT
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AAAACTATAAAATGACTTCAAAATAGGTATTTTCAAGGCCATTGAAACCG
TATTCCAGCAAACTTTAAACCGAAAAAATAATATACAAAAAACATGTCCC
TATTCTTGATACTCAAAAGCATGAAAAAAAAGTAGGAAAACCTAACAATG
TTAAAAAAATGCTTCCACTTCAACAAAAATATACGTATTATTAATGGGGT
ATGTATAGTGGCGCTGTCTTGCAGAAACATCATACAACTCTCTGAATGAT
AATATTTTATAATATAAAATATAGGTGTGCATTACTCACATAGAGAACGC
TTTGAAAAATTGTATATTATGTCCCCTAAGCTATAGTTTGCCACACCTTT
TTCTGGAAAATATACTTCTTTTTTTTAGTTTGCTCATTCCCTATTGGGTT
TTTGCAAATATCATTTCACATGTATGCGTATGTTTCTTTATGTGTTATGA
TTGTATACTTTATTGGCGCATTATTGAGTAGATCTCCATGTTTAAAGTAA
GGGTATTTAAACTCTGATAAATTCCATCCCCCTCCCCTCATTTTCCTCWA
AAGATASCAGCCATAGTCCATATCCCCCTCTCAATACTCTTAAAATGTTG
GTATTATTTTATATTATCGCTACTAATATGATGTCAAACTTAAAATGTAC
CTCCCTTTTTCTGCTAATTTATTATTCTTATTATTTAATTTTCAGAACTG
AAACTACCAAATTAGCGAAAATAGACTTCCTTGTTTCCTTTCTTGTCGAT
GCGAGGGGAGGCACGATGACCGGATGTCGTCATTCTGGACTTCGGGTGAT
TATMCCACCAAAAACAGCACCMCAGCCAATGCGAATCACTTGCCGTTACT
TTACAGAAGATTCTTTATTATTTCCACCTCCAATGAATGAAGGAGAAGGA
CTTGCGTGTCGTATATTAAAAGTAGGACCAAGGGGTTCCAAGTTTTTGGG
GCCTGTATTAATAGAAGTCCCACACGTATCCTCACTAAACGAAGGAGAAA
GAGAACTTTTTGTTATGAGGTGTAATAACGGGCGGAAATGGATTCCGCAT
GAATTTGAAAACTTTGAAACGGAAAGAGAACATGTTTTAAATGTTGCACA
TGCCATTGAATCCATGAGCATGTCTTCTCCAGAGCCACCTCCTGAAGACC
TCACATCTGTAACGAATGTGAGCAAATACGGCTCATCTGCTTATTTAGAA
TTTCCACCTCAACCTTTGAGGAATTCAGATGCTTTCTTCCATATTCTATC
TCACAATTTTCCTCAGTATTTTGCTATTATAAGTCGAGTCCGACAGGATT
CTCAAATCATTGGACCAAAAGGAGGTACTCTTAGGTCTTCCATTACCCCA
AAAGTTCAAGTTCATTTTCCTCTGAAAGCTGTGGTCAAGGATATTAGGAT
TGGACTCTCCGTCAAGTCAATTCACGAAGAACTCATTCAGGACTTTCAAC
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AAATNCCAMAAGCCTGTCACTGTTTGCATACCACTTCCAGAAAAATTTAA
TAAAAAGGGCTCTGAGACAATAGAAACATGTCTTAAACTAGTTTGCTCAA
TGTCTGGCAATTTTAACAAAGCCTATTGGGAAGATGTAACGGATACGACT
CCTATTGATATTATAGATGGGTGCATTCAATTCACATCTGTTATTTCGGC
AAGTTTTTGGCTAATTAATGTACCAAAATGGATGAGCTCAGATGTAATTT
TAACCACAGACTCATTGCATAAGAATACAAATCGTGTTCCTTATTGGGTA
CGGTTCCACGCTTACGCTCGAAAAAGATCCAACGATCATCCAGCAAATGT
ACAAATAAGAGTTCTTGTTCTCACTGAGGCAGATCGTGGAGTAAGGCCTC
TTGAACTACAAGAAGATTTTAAAGAAATTGCACGAAGCGATTTTGTGCAA
GTTCTAGAAAAAACGGNTTTGAAAAAGGTTCATTTAAACAAATATTTCTT
ATGCACCTCGTATAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTATCAAGCTGTT
ATTTCGGCAAGTTTTTGGCTAATTAATGTACCAAAATGGATGAGCTCAGA
TGTAATTTTAACCACAGACTCATTGCATAAGAATACAAATCGTGTTCCTT
ATTGGGTACGGTTCCACGCTTACGCTCGAAAAAGATCCAACGATCATCCA
GCAAATGTACAAATAAGAGTTCTTGTTCTCACTGAGGCAGATCGTGGAGT
AAGGCCTCTTGAACTACAAGAAGATTTTAAAGAAATTGCACGAAGCGATT
TTGTGCAAGTTCTAGAAAAAACGGATATTGGTGTCGAATTTGGTGGTAAT
CTAATCATAATTGAGGGGGAGCCAGACGATTGGAGACGGACATTCCAACC
CTTTAGCGATAATAGGCAAGGGTTTGTAATTAAGAGAAGAAAAGTACACA
ATCCTTACGGCAAGGGAACTATTATATTCAAAAGTTTAAATGAGAATACA
ACCTTATTCGAAACCAAAGTCGACGTTTCAAAGTTCTTATAA back to top
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