EMLSAT00000007090, EMLSAT00000007090-702937 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000007090
Unique NameEMLSAT00000007090-702937
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s3supercontigLSalAtl2s3:814660..830201 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000007090 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000007090EMLSAG00000007090-689856Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000031134EMLSAE00000031134-740062Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000031135EMLSAE00000031135-740063Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000031136EMLSAE00000031136-740064Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto779814auto779814Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000007090EMLSAP00000007090Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000007090

>EMLSAP00000007090 ID=EMLSAP00000007090|Name=EMLSAP00000007090|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=659bp
MNSNSNNIHHKNSSYNHTNSSPLISIPMINHAGEDEEDEGGTLEDEDLSI
SVDGTSSSEVTGTETTKLAKIDFLVSFLVDARGGTMTGCRHSGLRVIIPP
KTAPQPMRITCRYFTEDSLLFPPPMNEGEGLACRILKVGPRGSKFLGPVL
IEVPHVSSLNEGERELFVMRCNNGRKWIPHEFENFETEREHVLNVAHAIE
SMSMSSPEPPPEDLTSVTNVSKYGSSAYLEFPPQPLRNSDAFFHILSHNF
PQYFAIISRVRQDSQIIGPKGGTLRSSITPKVQVHFPLKAVVKDIRIGLS
VKSIHEELIQDFQLQGGSTSPMVTIXPRRXKXXKPVTVCIPLPEKFNKKG
SETIETCLKLVCSMSGNFNKAYWEDVTDTTPIDIIDGCIQFTSVISASFW
LINVPKWMSSDVILTTDSLHKNTNRVPYWVRFHAYARKRSNDHPANVQIR
VLVLTEADRGVRPLELQEDFKEIARSDFVQVLEKTXLKKVHLNKYFLCTS
FWLINVPKWMSSDVILTTDSLHKNTNRVPYWVRFHAYARKRSNDHPANVQ
IRVLVLTEADRGVRPLELQEDFKEIARSDFVQVLEKTDIGVEFGGNLIII
EGEPDDWRRTFQPFSDNRQGFVIKRRKVHNPYGKGTIIFKSLNENTTLFE
TKVDVSKFL
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mRNA from alignment at LSalAtl2s3:814660..830201+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000007090-702937 ID=EMLSAT00000007090-702937|Name=EMLSAT00000007090|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=15542bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s3:814660..830201+ (Lepeophtheirus salmonis)
GTAATATGTTAGTTCTTCTTTTCTGTTTAGTCGTCTGTTTACTCTGACAG TCGGGGGGTTTGTGAGGAACTCTTTAATGAAAAAGGAGGAGTGTGTTGTT GTTCTATTTATCGTTCTTGCTGCTGTTACTTGATGATCATTCTTCGTATA ACTAATAAAGGGTGAAATGAGAGAGAGAGAGAAATAAAATGTAAAAAATA AAATGTAGTTTGATAAATAATTCTGTCCAATTTACTTTTAAAAAAAACCC TGACATATCAAGGCTTATTTTTTTCTAACCTATGTATAACTTCTAAATAA TAGAAAAGTGATACAAAACAATAAGTGAAAGAGACCATTTAAGCATACAT ATAAATAAAGGTTGTGGAAGAAGAAAGAGGAACGAACAAGAAGAAGAAGA AAAGAAAAAGAAGTTTGCACGAAAATCATAAAAGGAACAATAAATTTTGT GCTTTTCCTTTGCATGACTAAAAATTAAAAGGTTTTTTCTTCCTTCTTCG TACATACAAACACACAACAATAACTCCTGCTTGCTTCCCTTACCTCTCCC ACTACTCTGTCTCTCTTTCTGTGGATACCCCCGCCCTCACACACACAACA AGGATAATCCCCAGAGATCCCCTTCATCTGAATACATACTTCCACATTCA TCATTAACTCATTCGAATCTAAAAGTGGAGACAATGAATAGCAATAGTAA CAATATTCATCATAAGAACAGTAGCTATAATCACACCAACAGTAGCCCCC TGATTTCCATTCCGATGATAAATCATGCTGGAGAAGATGAGGAAGATGAA GGAGGTACTTTGGAGGATGAGGATCTGAGTATTAGTGTGGATGGAACGAG TTCATCTGAGGTTACAGGGTAAGAATCTTCTTATTGTTTTGTTTCATATC TGTTCAACTTCTTTGAACATCTTTCTCTATAACAATGGGCCTTACTTGGA CAGGGGAGATTTGAGATATTCTGAAAGGGGGATAAAGTATCCTTTAAAAC AGAAAATGAAACTAATTTATTTTCTAAAATAGGACATTTATTTTTAAGAA AAAGTTATTACATTTCTGAGCCAAAAATGTATGAGGAAATGGATGCATTG AAATCCTGACATGGGTTAATGGAGGTTAAAAAAAATTGAAAACTACAGCT CTATAACAACAACATGTAAGAGACACTCAATTTCAAGGATGAATTTACCC CCAGGAGTTATTTTTTCTATTTTAGAGGGTAAATGTTACCATATAATAAT TCATAAATACATTAATATAACTTTTACTTATAAAGCTTGTAATTGATTTT TTTCCCCTTTGATCATACAACTTACCATTGACTATTGTTAGGAGAAATGT TAGCTCATAAAACGGATAGTCTTGATTATTCCAAAATTGATTAACTGCTT AGTTTGGGGMATTGTTGAATGCACATATACCCACATGTTCCAAAAAAATG TAACACTTATTAATAATGATATACTTTTCACGGAGACTATTTTATGAAGT AAGAATGTTTTTCTTTTTTTTCATAATTGTTAAATGACTGTAAAATAATT AGATTATTCGATATGGCCACCCTTAGCATTAATGACGCCCTCCAACCTCC TTCTGAGGACTTGGCACACTTTGATGATATAGTCTTCCAGCAATACATTC TATGATGTCATGATGGATGCCTCCAGGGATACTGTTGAGCTGTGTGATTT GTAGTTGGCAACTCCCTCAACCTGAGCCTATGTGTTGTAGTCCAATGAGT TCAGGTCATGGAATCTGGGATGCCACATATCCTTGGACCAAAAGAAGGTC ATATTTTTTGGAGAGCCAATCCTCACTTTTTTTTGTCTAAATGGTATGGA GCACCATCCTGTTGGAAGACATATAGCCGTCAATACTTGACATGTGTCTC 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AAAATGGTATCTCATACTGTCATAAAATATTTGACCACGCTTCGTGCACC GTTTTTGAAAGTGGGTAGTAATAACTTGATTGACAAGAAATAATTTTTTT TCCTGGTATATAGTAATTGTAAATTCTTAAAAAGTGAGGGTTGAGTGTCA TAAATTGAGAATCGAGACCCCAAAACACTCATCAACAATCCCTCTTTTCA CATCTCTAGCCATGATGATTAAGGGTTAGAATAAATGAGCAGAAAAAATT ATGTTGACATTAAAGATAATGTGTACTTTATTTTTTGGTTAAAATACTTA ATTTTACATTATACACATATAACCCCCATGGGTGGGGTCAAATAGGTATA TCACACTGTCCTGTACATATATTTTAAAAGTTATGGTATACCTCAGTTTT GAAATGTAATAGTCACATATATGTTTTATGAAATTATATTACAAAACTGT TTTTGCAAATAATCTCTAGGCTTTTCCTTTATTTTATTTTGACAAATATC CGTATGATAAAATATAGAAATATATTTACGTTTACATGAAGTATACATAA ATTAACAATTTCCTATCKCCTTCATTTTTTTTTTTTTTTCAATAATTATA TTTTGTGCGTATTTCCTAAATATTTTTTGAAAATAATATGCAATAATGTT TGATTTTTAGTGCAAGGAATTTGAATCATTCTTTAAGATCCATCATTTTT TTTCTAAATGAAAGCTCATGAGATATAATTTTTTTTTCTTCTTATTTTTT GTGTGTAGTCGAATTTTAACATCAAAACAATGTTACGGTCATTTAAATTC GGATTGTATCGGACCACAATATGGTACTTAAAATAAGTCGTATCCCTGTT GTCGATTATTTTACAAACGTTCCTTAGAACTTAAAATTTCTACAAATATT GTACATTAGTGAAGTACCTCCCTTGTGTTCTAGGTACTTTTTGCCTTAAA CTACATAATTTGCATCAACACATTTAGAACTTTTCACCATAAAGTCATTT TTCCTCAATGATATTTCATGTTAATATATACATAATTAAATCTATTAAGC AAAATTAGTTTTGTTGATTAKTATAAACGACATTAAATATCYTANNNNNN NCTAAAAATTATGAAAAAAATTATATAACAAAACTCCAAGAGATACATAC TATTGAAATATCACTATGTAATACATTCGAAGCAGGAACAAAATAGGTAA TAACAATAGTATAATAAGAGAAATAAAAATAAACAAAATTAGTCTAGTAC AACTTTTAATATCTTTCATACCTGAGAATAGCTTATGTTACTCTTAATTT CAGCTTACTTAAAATACTATTTATTCTTGTAAAAATGAGTGAACATTGAT TGGTGATGATGTCAAAATTAAGGCCTGATACACCCTTAATTCCATTCAAT TTTACTAACGGAATTTAGTGTTTTATTTGTTAAAAATAATTATTCACGAA ATTAATGGACAGAATTAGAATTTNNNNNNNAACAAAAATGTATTTTAATT TCTTAATAGATCAGTCGAATGATATTGAATTTATGTATAACTGTAGGACA TAATAGCATTTTGATTCATTGCTAAAGACTTATTTATGTACATACCTTCA ACATAAACAAATACCCCCTTTGCTAGTGAAAGTACAAGAGTGCGTGTGTC GTTTTGGCTTTTATTCACAAATATTAGCAAATATAGATTTAGACGGGACA ACCTACTTAATTTTGCTATCGGGTAATAAATCACGCCGTATAAAAGAAAA AAATCATAATAATAATGCTATATACATACATACTTATAAATGCCTAAATA AATATACATTTATATTGCTGAATAAAGTAAGAAAATTGTTTTTCCAACGT TCCTTGACAATTTATCAATTAAATAAACGCAATTATTTATTATACATGAT GTCATTGATAATAGGGCAAGGCCCAGATTGTGCATACTATTTATAAAGTA CTTCAAAGAGGATATATACATATGTTACATAGTAGATGCAATTCCTCATA CAATTCGTAACTTGTACAGGTGAAATTTGCAATTCACATAGCGTCTTTTT TTCAGTTATTCTCAAACTTTTTACATTGCTTATCTAGGGTTCTTAGTTTT GAAATAAGTTTGGTGTTAGATTATTCATCCTTTTATGTCACGTCATTAGG CTTATGTAGTCATTCAACCGCCCTCTCAAGTTCTTAAAATAAATTCTGAA AAATAAAACAAAAATATTCATTGGCTTCAGATTCTCACGCCAATGGCGTG AAATTGGAAACCAGATCTCCAGATAAAGCCATTATTTTGAAGATCTACTT CCCACCTATTACAAAAACAATCGTTTACTACAAAAGGGAGTTTGTCTATG ATAGTTTAAGAAATACTGCCTTATTCATTTACTACGCACATTGGTCATTC TAATTAACAAGTATACAGTACAATGACGTTATTATTTCATTAAGTTCAAT TAAATTTACGCATTTATTAAGTACTAGCGGTAGTTCCCGACATTGCCCAG AGTTATTGGGCGTCGACGAACATTTTCTTAATAATATAGGAAGTAATTCC CTAACAAATCCTAGGTGTTACTCTCCATTTTTCCTTAGCACATTCACAGG TAACTACTCAAAACTCAAGGTTTATAGAAATACAATGTTATACCATATGT CATGTACAACTGATGTTTAACTTCCACAACGCTTTTTAATATTGACGTCA TAGTGTATGAGTGGTTGCCTATTTTGACAAAATCTGGCTGTCTTGCCTAG CAGTCGGMACAATAAATCGAATTGAAAATTCTAGTAAGCCCGATTACATG ATGGTCTTACTTTCCATTTCTATTAAACTTGCTCAATACTTATATCGAAT CATATGACGTATTATGTCCTCAAAAATGAAAGAAAATGATAAGAGTTTGA GAAAAAAAATTGAATATGATTGGATTACGGATGAGTACTTTAATATCTAG ATTGCTCACTAACAAAAACAAACAAACAAGTGATCCCCGTATGCTAAATA CAAAACGCCTACGAGAGTTAATACATTTTTACATGCATATGTTCATATTT TATTCGAATCTTAACATACGAGTTTTCTTCAAAAAGTAAGGGGACTTATT ATTTCTTTATGAAAAAATATTTATTTATTCATTAATATTTATGTTGTCCC CTTCAAAGTAGTCCCCCTCTGATAAAATATACTTGTGCCAACGGGTTTTT TCTTTTCAAATCCTCAAAAAACTGCTCATAAACACTTTTCGGTATATCTG TGAGCTCTTCCTGCGATGTAGTCTTTATCTACTCAATCTTTGCAATTCTC GTCTTTTGATAGGTATCTTCAGTTTTGGGAAGAAGAAAAAGTAACATGGA GCCAAATCCGATGAATATGGTGGCTGAGGSATGATTGCGGMATTATTTTT GGCGAAAAAATGCGACCATTCTGTAGGTAAAATTTAAGCAGTTTCGGAGC AAACTTCGTTGACACTCGTATCATGTCTAAAACGTTGGAAAAAAATTATG GCACGAGCAAACCGATATCCCAATATCCTCAACAACTTCTCTGATAGTGA TTTGACGGTTTTCAAAAACCATTTTCTTCACTGKTTCAGCGTGTTCATCT GTTATTGATATAATTGGCCGTCTAGAGCGAGGTTCGTCATTGGCATCTTC CCAGCTATCTTGGAAGAGATTGTACCACTTGTAAACATTTTTTTTTTTTT AGTTAGAACAGTTTCAACGTATACCATTGTCAACATTTCAAGTATTATGG AGCATTTAATTTCATTTTTTAGACAAAATTTGATTTAAATTCTTTTATCC ATCTTTTTCAATAGTAAAAAATCACCGAACACTAAAAATACTTCTAAACC TTTTACTTCTCACAAACAAACTAAACATATTATATAGCTGAAATACTGAA TAAATATTCGTGGCGAGTGTACTAACGTAAGAAAAAAAAAATGAGCACAC CAAATGTAACATACCTGCAAAATTTGAATAGTCATCTTACTTTTTCAACA CACCTCGTATACTGCAAATAAATATGAACTACGATATACATAAAAGAGTA ATAGAAAAAACAAACAAAAGTAGAGCTACATATTCGATCTTAGATGCACA CGCCTGCAATACTTCATTAATACGGCCACATTGTTATTTCTAAGATAAAA AATATATATACACCAGGAAGTACTATATACAGTGCAGCCTGTATATACCG GGTGGCCTATTGAAATCTAAATGCTTGTTAATTCGATAATTGATTAAGGC TGGGTGATATAAACTAATTCATATTTCAAAGCATAAACAATTAGGTACAA AACAAAACAAAGCGGAAGCTCTTCGACTTACGTACAAGTCGAGAAAATGA CACTGAATCGTGATCAACGATGTTCCATTCGCACCCTCCAAGCAGTTGAG CATCTTCTAGACCACTATCTRCACCGTCAGCAAGTTCGAAACGTTGAAAA GGAAGAAGGCCTCTGTCAAAAAGGCCAAACTGCATCCAGAAGAGTTATAG AAAACACCCCAGCTTTTTTCCCTCAAGTCCATGACCATGAAATAGATCTT GGGAGTTTCACACCAGACTGTCAAGAGAGCTATACAAAAATGGGTGGAAA GAACCTTGTGAAGTTGGAGAGGCGACTTTTGACACCAACAATGAAAGAAA TCTCTCTCTTTCGTTGCAAGACTTTTTTTAACTGTTTCTTGACACTTTTG CCCCCCCCCCTCGACTACGCCTTTTGGATGCATGTCGAGGGGAAGGTTCC 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AACGTTTATATTTATGAAGTAAGAAATAAATGTGGAATTAATCATTTTCT TAGTTTTTGTTCAAGATTCATTTTGTATTGATACAACAATTATAAAATGT ATGCATAGTGATCTATTACACTTAAGTAAAAGTTTATAAATTATTTTATG TTTTATTACAGCATAATGACATCTTCCATCTCCATCATTGTACATGACAA TGAGGTGGCTAGCAAAATTCCATTTTTGTTGTATATCGTCGCCCTTTTGA TATAAACAACAGCTTCCATAAAGAGAGCAAAATCCGCATATAATTTGTCC TTTTCACATAATAATAAATATGCAATTTATATCATATAATACCTACATCA CTCAAACGATAGATTTAAAGAAATCAACAGAATAAGTATGTTTTGACAGT TTTTAATTTAGATACATACACATAAATAGAATAATAAGTTACTTAATTGA GGCTGAATTCATACATTCTAGATTAAGGACATCACATCATCTCACCTTCT ATTTTTGTAAATATCCTAACAAAATAATATGTATGTCATTTGCAAAATTG TTACTCATACATTTATACAGACTAATCTTATTTTGGAATTGGTAATACTG TGTCCTTATTTGAATGAGAGATTTTGTGGTAAAGTGTTCAAGTTAGTCAA TTCTAAATTTTTATGTACATTCTGTCAAAAAAGTACAGGGAATTGTTCAC TTCAATTCCCCGCACTGAAGGGATTTATCAGCGTTTTTTTCTAGGTTGGS AGCACTGTCTTTCATTATAATGTCGAGTTTGAGTGTAATTTGTTTACTAG TTTGCTTGCAAAGGCTGGYTAAGCTGACTTATCCAGATGTTTCAAGCAAA CTGGCCTACAGATCGCGATCAAACTTTGCATCATAATGAAAGACAGTSCT GCCAACCTAGAAAAAAAATGTTGATAAATCTCTTCAGCATGGGGAATTTA AATTTACAATTCCCGGTACTTTTTTGACAGAATGTATTTATGTACAATAT TCATGTTAAAAAATAGTCTATACATCAGTATTTACGAGGCTGGTAGGATT ATTTGAWTWAAAAAAACATATCATATCAAGACCCTCGGAAGATCAAACAT TTTGAAAAAGATACAATAAATTATTAAATTTTAATTATTGAGAGCAAATG CCCACCTTACCCCTCCCCCACTTCCGATGACCCTAAATATGTACAATGTA TAGGGGGCTGCCTCTTTTTTAATATTATTTTCTCCTAAACTAATCACCCA ATTTTAATAATAACAAATGATAAATGAAAGTTAAAAAAATCTTCTTKCTT AATATAATCGCCTCTGGCGTCAATATCAGCTTTAACTCGATCTTGGAAAC GGAAACAGATCTTGATAACAGTTTTCTTTGGTAGATTCCCATATTTCTCC TGGATTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAGACA TAATCTCTGATTTTGTGTTGTAGGAGGATCTCTTGGKGTGTCACTCAACT GCTCTCCACACACAAAAGGWCATGGTGCCGAGTATTTAGAGCCCTAACAC TAAGTCCAACAAGGTCAAAAAAAAAAAATGACAACCAGGTCAACGTATTC TTTGCAGTGTGACATGGAGCAGAGTCTTGTTGCCAGACAAATGGCCTACC AGCTACAACTTCCTCAATCCAGGGTTTGATATGATTTTACTGGGCCTTGA TGTTCTCATTGGCATCAACTTTGAGGATGCAGGGTAAATATGGAGTAATC CCGTGACCTTCTGAGGTTATGGATGCAAACAGCATAACGATCGTCGTAAA TTTTGTCTGCTTCTCTTTCGGAATATTAAACCGACTCATGGCCAATCATC 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GCAAATGTACAAATAAGAGTTCTTGTTCTCACTGAGGCAGATCGTGGAGT AAGGCCTCTTGAACTACAAGAAGATTTTAAAGAAATTGCACGAAGCGATT TTGTGCAAGTTCTAGAAAAAACGGATATTGGTGTCGAATTTGGTGGTAAT CTAATCATAATTGAGGGGGAGCCAGACGATTGGAGACGGACATTCCAACC CTTTAGCGATAATAGGCAAGGGTTTGTAATTAAGAGAAGAAAAGTACACA ATCCTTACGGCAAGGGAACTATTATATTCAAAAGTTTAAATGAGAATACA ACCTTATTCGAAACCAAAGTCGACGTTTCAAAGTTCTTATAA
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