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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s403 | supercontig | LSalAtl2s403:286341..293392 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000007167 >EMLSAP00000007167 ID=EMLSAP00000007167|Name=EMLSAP00000007167|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=233bp
MGNKESFSVLIHDILVPSVIQNGSLPFLVLDCHYTLNHTEKDGMILKWYL
NKRTVYQWIPPNRPQGLGSMRHSLNLDFEISPHPYGRHRALYLNSPTTEL
SGNYTCRISTMQNEASKTKPMVIYEPAKSMSLQIYQRPESSNLNISCLVD
HIYPEPLIEIFYQPTTGSQNRERLKGIEERINHYQNGAWHKVVFVLLAKK
LLRFEENVFECHVTLPGTQYALQRRTVYKTESG back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s403:286341..293392+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000007167-703014 ID=EMLSAT00000007167-703014|Name=EMLSAT00000007167|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=7052bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s403:286341..293392+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGGGAATAAGGGTGAAATGCATGTTCAATGGTGGGGTCTATTCATATA
TATTTTGCGAGGGGGAAAAAATGAACAATCAAATAAAAAACTTGCAATTT
TTGTGATTTTTTTCCGATTCCGAATTCGAATTCGATACCGTTTTTTTGGT
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TTAATTGATAAATACAATCAAAGGACACCTTATTCCTATTATCAATCAAT
GGACCCTTAATGTTCAGCTCCGGCCTAATGCAGAGCTTCGCACATATGTT
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ACCTTGMCTCTTCTGCCGTTGGTACCTTTAACTGCCTCAATCGATTCTTT
TGTCCTTGATCTGAACCTTGTAGAAGCTTTTTTTGTGCCTCTCGCGGTCA
CTTGGTAAACAGTAGAGTGCTTACAGGGCAGTACTTTAAAGATCTCTGTG
GTGATTTTCCACGTGGCGATAGCTCCAGAATTACAGCTCTGCGTTACTCC
TGTTTTTGGTTATGATACTTTTATTTCTAGGTTGACATGGATATTTTTTT
GTTTACAGTTTCTTTAGGCCATTTTTTACTTTAAGTTATTAGAGTTAAAC
ATCAAAATATGACAAATAGAACAAAGGCTCGCTTTTTCAAAAAGTGGTGC
ATTTAAAATTGWGGGGCCTGTATGTGATTTTTACGGATTAATATTACTTT
TTATTCTGTAATTTACGAATCTTTAGATTTGATTTTTGTGTTCACTGTAA
ACATCGTTATTATAGTACGACGTTACCTATATTGTGTATGACAACTTTTC
CCCCAAAAACAAACCGAAAAAAGGACCAGAATCAGCTGATAATAAACCAA
TTCTTCCCAACTATGGAATTATTATTCAATAATTGTGGAAAATTGTTCAC
GGCTTCACATGAGCTGATTCTAATTGAATTAATTAACGTTCAGAACACCA
ATTAGGGGGGAGCATAAATATTGACATTTGACAACRTTATACAGCGTCAA
TTATTGCGTTAGAGGCTAAGACCATGATGAAGAACTATTTTTAATTAAAA
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GAAAGTGAACTATAATTTGAATCCTTTCAGATAGAAATAAGTTGGGCCAC
TATATCTTGTTTATCAATCTTTATAACTTTTTATTGAAATACATTTCCTT
AAAACTAAGTTTAAAAGAATACATTTACTGCAATATGTGCAACTAATCGT
GAATATACGTTTTGAAATATCTTCAATCTTCAAAGCATATTTCAAGCATT
TCTAAAAAAAAAAAAAAATAGACATGAACAAATATGGTAGTTAGCAGTGG
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ACTTTAAAGAAGATCGGTTTGCACGAGTCTCAAAGATAAATTATATCAAG
ATCGGCACAAAAGAATAATTTGGTATGGATCGGTCATCCAGAAAAAAAAA
AGTTTTGGATCAGCCTCATTTAAAATTAGGTCCAGACGGATTCTATAGAT
GAATTTTGATGATGTCATTTGTGTTGAAAAAATGAGAATTTCGACCCAAT
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TTACAAAATATAACTTGGTCAACAGGTTTTGTAGGTGGATCCAAATCTAC
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AGCCCGGTCCACAGATTACGCAAGTTAACCAGTTGTCCACAAGGGGAATC
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TATCCTATAGTACACCCAAGCCCATGGTGTGTGCAAGTGAACAGCTGGTC
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TCTCAATTTGCTATCTCATATGGTTCCTGAGATTACGAGGGATGGGAAAA
ATATGAGATACTATCAAATATTTTTCAATGTTTGTACGTATTATGAGCGT
TCTACACGTTTTGATGATATTGTTGAAGTTAGATGGATTAGTGGGCCAAA
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GAAATAATTAAACTGATTAGTCTTTATTCTTATAATTTTATAAACAACTG
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TTTGAGTACATATTATTAGTGATGGAACGATTAAAAAAATTTGAAAAATT
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TTGGGAATAAAATTTCAAAAATTCAAAGCTGTCTACAAAAAATTAATTTA
TTGTTCACACATAAATAGTCGAAGACTATGATAAATATGATTTAATTACA
ATTTCAGAATTTATTTAATAAAGATTAAATAACGGAGTGAAAAGTTTTTA
AAATTCAACCAAATAAGAAATAAATTCATGACTCTGAAGTAAAAGCCTAA
TAATTTGTACATTTTTCGTTCTCAATGTAGGTCAATAATGGGTCGTTTAT
AAATGTTCTTTTGTATATAAATATTTATTATGAGATAATGACCTGAAAGT
TTAATGACTTCCTTGTACAAAATTTATGTAAGCAATTCTCCCTAGAGGGA
GCTTTGTTGTGTTTCTATGAGACATTTGGTGGACGTTAAATCAATATGTA
TAACTAAAGAGCGTCATGTATATCAATCAAGAATATTTTTTCTTAGCTCT
AATTCTGATTCGTCTAAAATTCGGTATATGCGCTATTTTTATCTCTTGCG
CAGTTCATTGTAATCAATTCTGTTAGCAAAGAAATTCATCTAATATAATA
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AAATATAAACTAATAATTAAAACTAAAGTTCATGGTATTTAAATCATAAT
TATGCTCAAATACAATTTATAATAATATTTTAAAACAAAATTACATAACC
TTAATCATCTACGAAGAGTATTTATAATCTATACTTTTTGATCAAAGTTA
CATGAATCCTGACCATAATTCATATACGTACATGATTTTTGTTTATTTTA
TTTCAATCATCTTATCTTAATAAATAGTAATGTTGGGTTTCGGTCTGAAA
ATCCTAGAATGGTCTGACATCATTAGGATTTTTTGTGGATCGAACCAATT
TGGTTCTTTATAGATGTTCGGTCTGTATCGGTATAAAAAAATCGGTCTGG
ATAGGACTCTTTTTAAATTGGGATTAGACCGATTCCATAGATACATTGTC
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ATAACATGTTAAAYGTTGTCAAGGGCGTCCMCAGKGGGCTGAAGGGCTGT
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TTTAATTTGTATTTTTTTTTTCTAACAATTTCTTATTTGAAATTTAGTTT
TTGAATTTTTTTTTCTAAAATATCTAATTTTTCATTTTTTTAATATTAAA
AAGTACGAAGCTCCCCCAAAAGTATAATCCGGCAAACGCCCCTGCTTCTC
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TTGGTCCATGGCTTGAAAACAGTTAATTTTTAGTTTAGGGKCTGAAATCG
TGGTTCTGAATGAAATATCGTTCAAAATCCATCTACAAATCACTTGAGAA
CAAATCAGGAAGGGTAATCGGGTTTGGACCGGGTCTTAACACTAGTAATA
TGCCTATATTTTTATGGGTTTGAGCTGTACTTTTTAGTAAACTAGAGAGA
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CCAAAAATAATAGTAGATCTTAAATTTATTTCTTGCTATACTTCTTTTAA
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CTGGTCCTGGATTGTCATTACACTCTTAATCATACAGAAAAAGATGGCAT
GATCCTCAAATGGTACCTCAACAAGCGGACAGTCTATCAATGGATTCCCC
CAAACAGACCACAGGGCCTAGGATCCATGCGCCACAGTCTTAATCTAGAT
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TTCCCCCACGACGGAATTGAGTGGGAATTACACCTGTCGCATTTCGACTA
TGCAGAATGAAGCATCTAAGACGAAGCCTATGGTGATTTACGGTAAGATT
ACGATGATTCATAATGATTTATTCGACATGTACAATGTACATATTTGTGG
TTTGTCCTATTTTAGAGCCGGCCAAAAGTATGTCCCTTCAGATATATCAG
AGACCTGAGTCCTCTAATCTCAATATATCCTGTCTCGTTGATCATATCTA
TCCTGAGCCACTCATCGAAATATTTTACCAACCAACAACTGGATCTCAAA
ATAGGTAAATGCATGGATTGGTGATTTTAAAAATATTAAACTACATAGTT
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ATCAAAATGGAGCCTGGCATAAAGTAGTTTTTGTACTTCTTGCCAAAAAA
CTCCTCCGTTTTGAGGAAAATGTATTTGAATGTCATGTGACGCTTCCTGG
AACGCAATATGCACTTCAAAGGAGGACCGTTTACAAAACAGAGAGCGGTT
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