EMLSAT00000007233, EMLSAT00000007233-703080 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000007233
Unique NameEMLSAT00000007233-703080
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s405supercontigLSalAtl2s405:178614..197434 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000007233 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000007233EMLSAG00000007233-689999Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000031735EMLSAE00000031735-740663Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000031736EMLSAE00000031736-740664Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000031737EMLSAE00000031737-740665Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000031738EMLSAE00000031738-740666Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000031739EMLSAE00000031739-740667Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000031740EMLSAE00000031740-740668Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000031741EMLSAE00000031741-740669Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000031742EMLSAE00000031742-740670Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto773947auto773947Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000007233EMLSAP00000007233Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000007233

>EMLSAP00000007233 ID=EMLSAP00000007233|Name=EMLSAP00000007233|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=402bp
MDQDQRIEEDISVSRESTPPSSHPFLTSGLLRRDSEDDGTLESMSASLSH
HVHHHRSHSKLIYRCQAGTGMCVIDKAHRNQCQACRLRKCLHMGMNKDAV
QNERQPRNTATLRPESFSSMDSHRFLREASVAVGAFGIPISPFTIPLHHQ
PNPPPLHQPQNIIPDFGSSNLGSPIPPMPHLSMKTPPLDNKLKQRSTNSI
TTPTNSNNNVFDHSSIPDLKIYPLTESNHEIAARLLFMAVTLLEESWSEL
FLLCAIQWSMPLEKPSLFSLPNPELYPSEIVNYVDVLTGILGRYKRTAVN
PAEFACMKAILLFKPETQGLKDHALVENLQDQALVMLNNHVETTLPGGGG
GRGQLSSSRFGRLLLLLSNLRQSNSFKIEKLYFDRIIGNAKMEKLLCDMF
QS
back to top

mRNA from alignment at LSalAtl2s405:178614..197434+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000007233-703080 ID=EMLSAT00000007233-703080|Name=EMLSAT00000007233|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=18821bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s405:178614..197434+ (Lepeophtheirus salmonis)
AAACCAATCATGGATCAAGATCAAAGGATAGAAGGTAAGAAATCACGAAC ATTTCACTTACAAATATTATTATATATTTGTCATAGAACCAAATAGTCAT GTCCCTTTATATGAAAGTATCAAATGCCAAAAGTTTATGCAATCTTTTGA GTAAGAAATCAGTTAACAGTTAAAAATACTTGTATATTGTTATATGTATT TAAAAATTGTAAAACAGGTTTTTTATCAGAAATTCCAGAGAAAATCATCA GCCTTACTTAATCACAAACATTAAAAACAGTACAATTGACCACATCTTAT TAAAAATTCAACCATTATAACAATTCAACAAATTTCCAGTTTTTACATTG GTTTAGTATTTTTGAAACCACTTTTACTTAACCAATTATTTTGTTCATGT TTTAAAAAAATCCATTTTTTGAAATTATTCGCAATTTTTCATATTAATCT AATAAAATAATTTTAACTTGCTATATATTTTTTCCCCCTTAACAAAAGCT AAATTGATTTCCATAGATATACTTTTTGAATAAGGGTGATTTTGTGGCTA AAATGAGAAGCAATTATAGAAAGTTAAAAGGGCTGAAGCGCTTTTTAAAT AAAAAATCGGCGGATTTTTATTTAAAAAAATTGCTGTATTAATTCTACAA GAATTATTTTGATTTTTTACAGCATATATTTTTTTTGAAAAAAATTAATC TAATAAACAATTAATCAAACTACTTAAATATGTATTTTTTATTACACATT TTTAGTTAAAAATTCTATTAAAAAAAAATTAAACTAATATAGTTTCACAT TTTTTGCAACTTTTTAAAGAAAAAAATATTTTACTTCTAAATTTGTGAAA CGATATGGGTTAAGAATAATTATTTCTTTCACAATGATTTAAAAAAAAAA TAACAAAACATCTAATAAAATAAATAAACTTATCATGGTAAAAATTAATT TCAATATATTGCGATTTTTATAAAAAGTCTTTTAATTTTTTTTTTGTCAA TAATCTCCTATGATAATTATTCCATAATTGTAACTCATTTGATTTTTTAC TCATATTACAAAAATTCCATAAACAATCAATTCTATATTAAGCAGTTAGT CACGGAAAACTGAAAAAGCGACCGCTTAGTGCAAGCGACCTCTTAAAGAA ATTTTTCGATTTTGTAACGATTCTAAATCTCAAAACTGGATGTGACTGCT CAGTGCGGTGACACGTATAAAACAGGTGGTCGTAACCAACTTTGAGTATA TTTATAATTTAATTTCCATTTTTCTATCTATTTTTAGGAAGTTTAATCAA TATTAATTTCTTCCCATAAAAATCAATATTTTTTTGTCAAATTAAAAATA AGGAAATAAATAGATTAAAGTAAATTTTAAATAAAATTGGTTTGAAAATA TATCAATGAATTACGAGGTACAAGGGGAATTATTTATAATTAAAAAGACA TATTTCCTTAATAATAAGTCATACTTGACTAAAATTTTGACAAATGATTC ATATATATTTAAATTATTCAATAAATCCAGCATTGGCATTGTTGATAGCC TCCAGGCGCTTACAGAAGTTGACGCACACCTTCTTCACATAGTCCTTGTC CATTGCATTTCCCTCCTCATTGACTGCTACTTTCAGGGCCTCAATGTTCG AGAACTAGAATTGGAATGCCTTCCCTTGACATGCAGTCAGTGAGCTATAA TTTTTTAATGACTGAAAATATGATGCAACGAAGAGCTGGGGCATACTTCT TATCAATGAGAAGGAATCGGCAGTGTTGTAGACATTTGGTACGGATTTCA AGTGTCAACATGTATCAGAGTCTTTCCACGAGTGTTTCGAAGTGTCCACT CAGGCAGTCCCATATGGCTGCMTGGGGGGGGGGGGGGTAATTTATTTTCT TGCCTCTATATCCAAGGCCTTCTTGAAACTATCCAGCTCCAGTAACCTCT TCTAAACCTTACCAGGGTTCTGCTCAATGCCTTTACTTTCATTCAATCCC TTTGTAATGAAATAGATGGTCGTGCGGGTGACCCCTCTCTGCTTTGTAAT CTTAGTTGGAGACGGTCCTACAAAACAGATACTTTGATTCTTTTTTCTTG TTGTTGAGGTAGGTTTTGTTTTGTAAAACAGTGATTAAAACAAAATGTAC CTTTTGGTTTATTCTCAAATAATTTTATCTTGTGATTCAATATGAATAAT CTACATACGACTATAACACATAAACAAAACTAATTTTAAAATTAATTTCC TCTCACCTGGTATACCCGTATTGGCGTTAAAATGTAATCAGGAATAATAG AAATCAAGAATATAATTTGAGGCGAGTTAATACAAAAACAATCTTGAATA AATATCTAGAAAATGAAAAATGGGCAATTAACTTTTTTACATCATGTTTA GGGTGATATATTACATAGACATATTTTGGTCAATATTAGGCATTGTCAAG GGATGCGATGATTTTATTTGAGCTGCCATATCCAGTCAAAATAAAGTCTC ATAAATCACTATAGCTAACATTCTTATGTATATTTCACTCAACCTTTTAA TTTGAATATAAAGTATATAATTGACCAAATTAGATATCTGAAATGTATGT TGGGATGAATCCAGGCAAATATCCGTAACCTTAGAATCGACCCAGAACAT TAACGTAAAAAATATCTGCAAAAAAAGGTAGGCTTAAATTTTATCGTCAA ATTCTACCTACCAATTACTTTGATTGATTCTTTGGAGGCATTCAAAGTAG TGAAAATTCATTGTCTCATTGAAAAAATTGAAACTGATAGATTTTATGTT TTTAAAGGTTTTTTTTTGGGTACAAATTGGGAGTGAGTGACGATAAACTT TTGTTAATTAGTGGTAAATTTGTGGTGCTTCCAAAGGATTGATCAGAATA GTTTGTTGAGGAATACAAATGTTATCTAGATTCAATTTTGAAAAACATTT GTATTGATTAGCCACATATTTTTCCTCTAAAAAGCACATAAATTAAATAA TGCCTTTGTTTACGATAGATAGAATATTTACATACCTGTAGCCAAGGGTG ATTGATTTTAATCCTATTAACACACACAAAAAAATTAATTAGAAGGATAT AACGTAAAAACAAAACTAATTTTTTATTTATGTAAGCGTAATTATTGAAA GCCACTTATTACTTATTTTTTCTAGTTCATTTGTGTTTTTTTTTTAAATC TTGGTTATAATTTTATGACCTCATAGACAGGAAGTTTCTTCCATTTCCAC AAATGTTACCTTAGACATATTTGTAGTGATGGACCTAGGTAATAATGTTA GATCCGGGGTGTTTCAGTTATTTTATAAAAAAATATTCATTAATTTTTAT AATTTTTTGGTTCTCGGTGCTAAAATTGAGAAATTATACTATTATTCTCG GTTCAATTCTTAGATTCCCTTTTCAAATTGACTAGGAATAGACTTGAAGT TGTCTATTATATTGCGTGCGACTCCCCTTGGAAGCTTCACACTTATTTAG GACTAGATACAGTTTTTTTTATTTTTAGTCTGGTCCTTACAATTGATTGG ATCCAAATATACTACCATTTGTAAGCATAAAATTAATTTAGTGTTTTCAC TGACTTCACAAAGAACATAATAAACCAAAAATCATGTAGCCACCTCAATA ATTGCTTGTTTTATATTTTATGAAAAAATAGATTGACATACCAATAGTAA TTTTGATAAGTAAAACGGTTCGAAAATACTAGTATCGTGACAACACTAAT ATACATATGATATATATTTTTATATAAGGGGCCGTAGTTGTTAAAACTAT AAAAAATGGTGTTTCAATATTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTGTAAAAGATT TCTTTTTGACCAACTTATTTCTTTATAAAAAAAAGGAGAAAGATTTTTTT TAAGACATTTCATTTTCGGTTATTAAATATTCTAAATTTATCAAGACAAC CGCTGTCTTTCCCATAGTATATTACAAATTTATAACCTGATATTTCATTT TTCCGACTAGCAGATCCATTGGAGTGTATAGATAACGACTATAGGCACTT TTTCTTCAAAGCCATGATCTTAGTTGAGGCTAGAAGAAATTTAAGAAACT CCGTCGATAGAAAGGAAGGAATGTTTCAACAAAAATTAAAGCCTATAATA TAAAAACTTGGCGGTAAAATTACCGGCGGCAAAAATGATCGCTACAAGAT ACCTAGAACCGTCAACCCCATCTGAAGATGGACAAATCTGTCGATGAATC ACTATACTATTTATAATTACGGGTAATTTTACGCAGGGCAATTTTGTGAA GGCAATATGCGGGGTATAAATTTTCCTATGGGCTCCTCGCAAGATATAAT ATACTCGTATATATGTATGAAAGTTAAATACTGGTTATATCAGTACAACA TTACATTATACATTAGTCTAATTCCTTATAATTTATAGAACGATTAATAT CCCTGTATGTGTCTTTGGACACATAGCTACAAGACTTAATGGATACCATC TGTGTTGTCTCGATTCATTTTGATACTTTGCATAGGATTCAAATTGATAT TAAAGGCTCTTTTCAAAAAGAAACGAAAAATATATAATGGTTTTGATAAC AATAAAAGGAATGGAATGGGCGGAGGAGGGCTCCATATGTACATAAAACT TGAATTTATCCTTAGACGAATTATCCTGGATTTAAGGAGTAAAGAAAAAC AGAGAGAATCACATCTGTTCCTTCAAAAATATGGAGAAAAGAATGAATCC 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AAACTTCTGGTATTAATCCTTTATTTATGATCTTGTCTGAGGAGGGGGTT TGAACTCGAGACTTGTAGATCGACTTGAATTTGAGTCCCTATTTTGAAGC CTTGCGTCTCAATTTTATCTCCAATCAAAGACTCCCATCTTGATTATGGC TCAATAGCCAAGACTGGCGACTCGAAAGCTATTTTATACTGATCTCTTTA GACTCTTTATTATTATTATGTATTTGAAATGAAATCAAAAGAAATCTGAA GACTCTAGTTGGACTTCATAAAAATATTCAAGGACTTGGACTTGTGAGCA AAGACGTAAGGCTCGACTTGGACTTGCACAGGCTTTTCCCGCACCTCTGG ATATTTTAGACGTGACTTGTATCTATTCCATAAGATGGGGTGAGTTTTAT AGAGAAAAAAACACCAAAAGTTGGGCAGGAAGCGTACATAATAAATGAGA TATCTTAATTTGTATTTGATGGATTCAACAAATTGTAACAAATGTTACTT TTTAAAGTGATTTTGAAAAGAATTATATTTGTCTCTGTCTCTCTCAACAG GTTCATTATTCAACCCCCTCCTTGTCTCTCCTCACCCATTATCATCGATG TAATATTCATTTGCATAGAATACAAATCGCCCACATCTTTTTTTTTCCCT CAAGTGATCCTAAAGTGGTTGTATCTTCAAAAWTAAYAAAGAAAGATAAA TTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAATAAAATCAGGATTTTTAATGT ACTAGTACATTTCCATTCTCTCTAGACACCATTTGACACATGTTATGTTA ACAAATATAAAGGATGACAAATTACCAGTTCTCTCAGTCCAATCCCCTCC ACCCTCAGCTCATTGTCCACATAACCATATACATACATACTTGTATATCT ATTAGTTATGAGCAAATGTCGTCATAGTCCCCAGAAAAAAATACCTTAAT CTATTTAGAAATAGGCTAAAATTAGTCTTAGAAAATTGTTATTTTTGTAC AATCTAACTAATTTATTTGTTTATTAGATTATCTTCTTTTCTTTTTTTTA TCAGAAAATAAAGAAAGTTTGTAATGCTGGATAAATACTCAATTATCGTC AAATATCAAGACTATCATAATATCGTATAAAAGATGACCAATACCGCTTT GTGTCAAAGTGGCGAATGTCAGTCTATTTTTATTTGAATTAATTTTTGTG AAAAATATATTTACAAATATTTCTATTTCTTACTAAATTTCCTACAGATT TCAGAAATAAGCTATACTCAATGTATTATCATTTAATTTTTAGAAAATGT AATGTTACAGTTAGAAAAATTTTGAAAATTGATTGCCTATATCTTATGAA AATGTCTGACTTCCAGAATGAAAACGTTACTTGAAATTAGTATATATTAT TATGTAATAGAATACTTCGACGAATTATAATTCAATAAAATACTTACTTG ACATCATTTTTAATAACTCTGAAAACCATGGCGGAGGKATAAGAATTAGG TATAATGGAAATTCATCTGACGCTAAAAATGCATCATACTAAAAAGCGAC GCTATCTTTGGCCTAACACTTGATATTTCTACCATACAAAATTGACAAAT ATGCAAAAAAAGAATAAAAACTTCATCCAATGGCTTTAAAAGGAAAAAAA AAAAACACCATTAAAATCGATGGTAAAATTAGTTTTAAGACTCGGTCCGA GACCAAATCTTTTTTTTTTGTCTGACCTTAAGTAATTTTTTTTTCAAAAC TGATCTGGACCATTATTTCAATTTACTTTTCTAAAAAATTCTAGACCGGT TGAGACCAGTCTAGGATTTATATCCGATAACCCAACACTATTAAAAATCC CTATAAAAATTTCTCAAGCTATTCTAATTAATATTTTATCCTTGAGAAGA 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