EMLSAT00000007264, EMLSAT00000007264-703111 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000007264
Unique NameEMLSAT00000007264-703111
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s408supercontigLSalAtl2s408:582699..611533 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000007264 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000007264EMLSAG00000007264-690030Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000031887EMLSAE00000031887-740815Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000031888EMLSAE00000031888-740816Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000031889EMLSAE00000031889-740817Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000031890EMLSAE00000031890-740818Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000031891EMLSAE00000031891-740819Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000031892EMLSAE00000031892-740820Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000031893EMLSAE00000031893-740821Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000031894EMLSAE00000031894-740822Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000031895EMLSAE00000031895-740823Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000031896EMLSAE00000031896-740824Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto778733auto778733Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000007264EMLSAP00000007264Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000007264

>EMLSAP00000007264 ID=EMLSAP00000007264|Name=EMLSAP00000007264|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=555bp
MASCSHNNPRKFSEKIALHKQKEAEDKLEYDKIMSECAMVKGTAGRIPSS
PMSSHNNVHHPPPAYSNNMCSDVNSRLLPPNISCSSNRHGSLPNVNAAIQ
SMEHPGLHTEGIPLILDQRLQSYQHQHHHPPHHSVHHANSPHGHHISLRE
QQPGPIRSVKNRIDTSPYGSSYHLLPPANPVDWRRTVSDSSLHHSVHGAG
GSHENLSKTQGPSHLLSSSPHKRSNSEVSMDEETRRLHQMSSPKQSTTNF
SEYLLPNDPSDKKPGSLPDLSTFTGVNISNDRSNGGGCSSNENSPPGLSN
GSSGQQHPTPHLRYNPSSPDVSTSPWSPNHHSEGGDYNTNPHSSHLYTQT
QVSSPMNYGGRCTSPVDAVGGGSPHSPLGHSMSPTSPVPQPVSHHTNLPN
NNASYEDLEFYSQEQLELSREFQRVNMMDSWDSSTPYSHNYYSRGHHSSR
YEPINNEIVNLLTNMDSKGTQQIHQSSGLIQMSSKLPNIILTDVAGTDQD
LHGLAMTTALECVNEDSLKADLGKLDDSMLRLLTEXAGSDQAIADPVTEE
HLKLL
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mRNA from alignment at LSalAtl2s408:582699..611533+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000007264-703111 ID=EMLSAT00000007264-703111|Name=EMLSAT00000007264|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=28835bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s408:582699..611533+ (Lepeophtheirus salmonis)
TAGTCAGTCATTTTGTGTTGTGTGGCTATGTGCAAGGAAATAATAATTAA TATTGTTTCGTGTAAATTAATTCAATTTTTCCTTTTATAAATAAAACGGG AAGGAAGTTCAAGTTGAAGTGTGTCCTTTATTCTTTTTGTGTTTTTTCTC TTCAAGATGGCATCCTGCAGCCATAACAATCCTCGAAAGTTTAGTGAAAA AATTGCTTTACATAAACAAAAAGAAGCTGAGGACAAGTTAGAATATGACA AAATCATGTCAGAGTGTGCTATGGTGAAAGGAACTGCGGGGAGAATTCCA GTAAGACTATGTCATCTCTCTTCTTCTTACTAAACTATCAACTCTAACTT AAAAGAATTTGCCACTTCCGCAGTGGCAAAAGCGAAAAATGAATGGGGCA TTTATAGAAAAATAACATAAAAAGTGAAGAAAAATTGATACCAAGCACTG TATTAATATTACCTATATATAACTGGATAATGTTGATGATTACATAATAA TAAAACTCGTCAAACAACGACGACAATCTGCGACTTTGTGTTAATGTATA TTATGTACATAGCATAGTTATCGTACATATTCTAATATCCTTTGCTTAAT GTGTAGAAAAGTCAAACTACGCGCATTTTCAAACAATGCGACTTCTTGAT GTAGGACTTGACTGGGTTCTCTCTAAAGTCAATAAGAGGAGGTCCTCCTC AAATGTACATGTGTACTATTCTATTTACATAGTACCTACATTAAAAATAG GAATATTATTGTTTTTGCATAATACATACTACTGTATTGAAGAAATGTGA TATCTCATTGCCTTTAATGAATGTAGTTGAAAATATACTCCATATGACTA TGAGTGTATAATTTGATCCCTTGGAGGATTTTATTTATAATAAGGAATTA AATTTTTCCGATCATTAATTCATCATGAATATGGACACATTTTTGTACGC CTCTCAGTAGATTTTTCTATTAGTTATTAAAAGAAAATTACTTAATAATG TTGAACTCGCAAATACTTTAAGTTTCCCATTTATGAAGTACCCACCTCAT AATGTGACTCATTATTTTGAGTATCTATTGAGTCCCATAAAGAAGCCTGC TATTACGCGTATTTACTGGGAAGGAGGACTTTATAATTAATCATTCTCAA TATATTTGACCTGCTTACATCAATTGAAATTATGATTCCTGTTCAAAAAA TGAAATTTGAAAAGTTCATTAATATTGTTAGTAGTATCCATATTCTATAC TTTCTTGAAACTAGGTTCATCAAATTGATTTTCTGTGTAAATCTAGGAAA TATTGAAAATTGGAAAAACTTTATCCCTATTTGTAGCATTTTTTTTGTTT TTTTAAATAAACGAATAAATCTAATCAAATCACTAGGGAAATAGATAGTA AATCCGTTATATAAAACTTTCAATTCTTTGTGTGTTTCAAAAACCCAACT TTTTTGCTGAATGTTAAATTCTTGTAAGAAATTTATCAAATTGAAAATGT ATTCTCTTATGACGCTCTCTAGAAGCAAAAGTGTACATTGAGAAAAGACG AGATAATATGTCTTACAATACATCTTTTATTAATTATTTATGTAGATAAG TTTCGTTTTTTTAGTTGTTTCTATTTCTAAATATTCTACTAAATTTGTTG GTGGACAAACCCTTGGTATTACATAACCTATATGTGATACATGATTAATT GAAACTTTTAAAATGTTTCTCTGCCTGGGTTTTCCTTCCAAAAAATTTAA TATTCTTATTGAACAACTTTTATTAACATACTAATATATTTATATTAGTA TGTTTGTCTAAAGATTGAAGTCAAAGCATTTCCTGAGTAACGATCTAATT ATAGAAATTTATATATTTGTGGACATAATATGTGGTTCTCCGAGTTCTAA ACTATGTGCTGAATCTATTACTTGTGGCTGTAACCTTTTGCAGGGGTATC CGCAGGATTATACATATATATATTTATTTATTTTTGGTGGGGCGGGGGGG CTTTGGTTTTTGGCATTTTTTGATAAAAATTTGAAAATTAAATTTTCTGT AAAAAATTTGAAAAATTAAATTTTTTGTTAGAAATTTCAAATATTAATTG TGTCTAAAAGTAATTCAAAAACACAAAGCCATTTACAAAATATAAAACTT TCGGAAAAAAAATTCAAATATTACATTTTATGAAAAAAATTTCAAATATT AAATTTTTTGAAAAAAAATTTCAAAAATCATTGGTATTCTCAAAAAATAA ATTTTGTTAGAAAAAAAAGTTCAAAAATCTACAGATATTCACAAAAAAAT TAATTTTTTGAAAAAAAATTTCGAAAATTAAATATAAAATTTTAAATTAT TCAAAAAAAATTCAAAAATTAAATATAAAATACAGGCCCACCACCTGCAG ACACCCCTGTTTTGAGACACAGTGCTGAATATATGCTACTTTTTTCTGCC CTAAGCTCCAGGCTATATGTAAATTCAGACGTTCTTGCACTTTATGTTAT TCTCTTGGTGTTTTTGTAAAAGCTTGAACTTTTAAAAAAATGAGGTCCTA AGGTCTTAATGAATAATTTATGAAATCATCGAAGGTACTATTATCTTTTG ACAATCATTCATCCTAAAACAGAGACAGATACAGGGTTCCATAATATAAT AAAATTGATTAAGTCTCATATAACATCTTTTTTCACCCCAAACGCCTGGC CATAAATTTGGCAAAGGCGAAATACCAAGAATATATCATAAAGTCGTACA AAAATTGTATTCATCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAATSCCCTMSCCTGCCG TGAAAAATTATAATTCACCTATTAAACTACATTTCATTTTGTGGGCATTT AAAATTAATAATATACCAATGAATATCAATTAGTCAAAAACTACATTATA AATTTTTCGACCATTGATAAAATATTCAATATTTCGTTGCATTATCCTTA TCACACATAATACTTAAAATTATTCTTTTGAAAGCTTTACATCTCATTTT TTACTTGCAACTTGTACAATTGGCTCACACAAGTTATAATTTGTACACAG TAATTATGCAAAATATATACGAGTATATATTATAAGTATGTATACATTAG TGTTGAGTTTCGGTCTGAAAATCTTTTACCGATCTGGGACCTTTATAATT TTGACAAATTTGGGCCAGCTTTGGTCTGAACCGGTCTCCTAGTAAAATTT GCTCTAAAAAAAATCTCTTACGATCCAATCCCCCCCACATTTTGTCTTTG AAATAAAGGTTTTATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTATAAAAAAATC CCTTAGATAAGACTAAACCCGTTAATAGAAATAATTGACTAACCTCGACC GAACTGGGGAAAAATTATCCCTTGGACAGAGTCTCAGTACTAGTAGTTGG GATTGTATCAGTCCTGAAATAGACTGGAAGTTCAAATTAGATATAAAGTA GATATCCATGATGACGTCATTTATCAAAGACTGTTTCATGGGGCGGCTTT TGCGTCCGATTCGAACGTGTCCTTTTTTTGTGTGTGTGATTCATAAATCC CTACTAGGGGTAAGTATAGTTATTTACATACCTAATATATTCTAAAGATA TTTTGTTTGTTGAATATAAATTCCTTAACTTTTATGTCATAGTGAGAATA CTCTGGCGTAGTAGAGTCAATTGAACAATAGAAAAATGATCTGGATGTGT GTTTGATAGTGAGAGTAGCTTGTCTTATATCTATTTTATTTACTTTATTT TATGTATAAGTTCTACATACATATAGTTTATCACGAATATTGATTTTCCA ACATTTTAGAATATATAAATATCTATATGAATCGTATTGCTGGAAGATCT TAATTGCTTTTATTTTACAAATGTATGTTTTGTAGCTACTACTACCTACT TACTATTCAGTTAATTATACACATTGACTCTGTCTCCAAAAATGTTATCT CATAGTATTAATATTTTTCTTTATTCATCAGTCTATTACAGCTGGAAGCT TTATTATTCTGCATTCGACGTACCTAAACAGTATGTACTACACATAGCGA TAAAATATATAAATCCACTTTTCCTAATTAAAATGTGTAATGAAGCTTAT ACTTGATGGAAAAAAATATCAATATTTATTTATGAGTAGATCCTTGTCAA CTCTCCTTCTTTCCCATACAAATTAGTAGGTTTGGATCGGCCCTAGGACT GCATTCCTAATCATGTCTCCTCCTCCAAGGTATTACGTTGCTAAGACAAA AATAGCCTCCTTTTGTTGCCAGCTGTCGATTCCCTCGTCTCACTTTATAG ATCATGGATAGTTCATACTCTATTCTTTTTCATAAATAAACGAAGAAATA ACTCATTAGTTATAAATCTAATACTTATGCTGAACTGGAATATAATTTCT TGTTGATCCCTCGCTGTCTTTCTATATTTATTTATATATGTATTGTATAT AGTATTTAAAATTATTTTATTAATGTTGTAAATAACTCAAGAATTTAGTA AAACTTGTCAATAGACATTTTTTGAAGTTATTCCATCCGTTCGGCTATTA TAATTAGAATAAATAGCAATATCATCATCCTCTTTCCACCATCATGAGAT ACTACCTCGTTATTTCTCTTTCTAATTCCCTTTGTCCGTTAGTACAATAA TTTGTTTTTGGGATTTTTAATCTCTTTGGTGCATCTTCGAATCGAATATC CATACCTTAAAACAGTCTTTGCGACAAGGGCAATCGATCTTGTTTTATTG 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ATAATCCTGAAGAATGGAATCGAKCGRTTTCTTACAATCAMTAGCCACTA TAGCGCCAAATATTTTATTTATTTATTGTGTATCGGTTAAGAGGAAAAAA TTACCAAGTTACTGATTATTGTACGTATGGTAATACAAATAACTATCGAG AAATAAAATATTAAAAATGTCGATTAATTTTTTTTAAATATATATAAATG TTTTTCCTTTGAAATTAAGTATTTGGATCGAGATATATGTTTTTTATTTG ATCAAGTACTGTACAATGTAGTACCAATAAAGATCCTAGATATTTAGATA GTCTGCGTCCTTTGAAAATGCAATATATAAAATTTTCTCACACGTTCTTG CTAATAGGTAGAGTATAGTTTTAAAAAAAAGAGTGGATAKTACCCAATAT AGTTTTGTTAAAGGCAAAATAATGGACAATGTAGCTTTTACCATACAAAC TCTATTAGAATCTGATAATAATGTATCGCTAATAACAATTGATTTCGCTA AAGCTTTCGATACCATATCTCACAAATATATAATCCAGAGGCCTTACAGG AAGACTTTTGTAGACTATATTATTCAAATGGTAGGTGTTATCCTATATGG AACTAGAATGTGGTTCCAATAAGGAGGTCAAAAATACTTATTTTATAACA AAAGAGGCGTGCGACAAGGAGACACTTCTTCTGCAATACTTTTTATTTTA TGTATCGACCTATGTCATTAGGGTGTCCTGTTAATGTATTTTTCTGAGCT ATGCAATCAAAAGAGGCATTCAAATTTGCCTAATTTTACACACATATGAA AATAGTAATAAAAAAAATTGTGCATCATTTGGAGGGCTCTACCGCTCTTC AAAGTTTTGTAAAAATTTACGTCTTCACAGATTTAAACTGAAATAATACA AAAATGAATTTTAAGAGTTATTTTATGATTAAAACAAGAATAGGCATTCA 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TCGGATTGCATAGATGATTGAAAGAACACTCACAGCTAGACTATTTTCAA TTTTTCTACAGTTGGAGTGCCGGCTCGACGTCTTTGTGGGCAAGTCTAGG ACATCTAGCTTCACATGGTACTCTGCGAGATTGTTCCTCTCCGCGGCTTC CTCAATACCATGAATCCTTGAGCACTTGTAGAACATGTGTCTGCTTGTAT CGGTTTCTTATCCACAGAAAGAGCAAGTTCTCTTCGTTGGATCGCACAGT GACTTATTTTGAAATAATGAGGAGGTGGACATTCGATACCAGAACCATTT TTTGCAGAAGTCTATGAATGGATTCATTATATATATTTTTTATTTTTTTG AGCGCGTGTATTCAAAAATTTTACAAGTTATTTGATCTGCTTTGCAACTA TCGTGTGAGAACTACAAGATTTTGCCCTTGACAGAATTGTATTTCAAAAA TCACCATTCGTAGGGGACTGTTTGTCTTTGATTAAACTTTCCTGAGAGTG AAAAATTCCCTTGCACTGATGAAACGTGTATTACAATTTTTGGGTTCGTT TGGACCAAGAAGAGGGAGGACTGAATAAATCATAGATAACCAGGAGATAC CCATGTTCGACCATGTGGGGTCTATTTTCTTGAGAACTTGAATAATTTCA GTTGGCTCATGAATACCCTTTCACTAAATCTGACACCTTTTTATTGCGTG AGTTTGGTTTTCTTCGTGCAGCTCAAAAATATTTAATGAGTAGTAGAGGT CTGTACCAGGAGAAGTTTGGTGCAACTCCATCTGAAAAATTAAAAGAACA ATAATCATATATATATATATCTATATATACTGGATAGGGGAAAAGAATCA AAAACATCAAAACTGACAAAACAATACACTGTATATTTTTGCTCTAGCGA GGTAACACAGTACTTAATATTTGTACAATTCCAGAGCAAAAGTCCATATT 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