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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s411 | supercontig | LSalAtl2s411:294059..323201 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000007321 >EMLSAP00000007321 ID=EMLSAP00000007321|Name=EMLSAP00000007321|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=7bp
MFLHQPD back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s411:294059..323201- Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000007321-703168 ID=EMLSAT00000007321-703168|Name=EMLSAT00000007321|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=29143bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s411:294059..323201- (Lepeophtheirus salmonis) ATGGTGAAGACCTTATTGTGACACCCTTTGCACAAATATTAGCGAGCCTT
CGCTCCGTTCGACAAAACTACATCTCCCTAACAAATGTTCCTGCACCAAC
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TAAAAGTGAAGCAACAAAACTGTCTAGCTAAAGCTCAGTGCTTTATATTA
TAAAAGAAAATGCAGTATATCTCTCTGTCTTATGTTATTAATTTAGCAAA
TTTATCTTTTTCTACGTCAATGCCCCATTTTTGTATGTGCGCTTAATAGT
TTATAGCTTTGAGACTACTTTATATAAAAAATAACAATGTAGGAACAAAC
GTATATATCAGCATGTTGAAAAAAAGTAGTAAACATCGATATTATTAAAG
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TTTGCTCTTTCTAAAGTATGAGTTCCACATATAAGGCCCTGTACAAACAG
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ACACGAGGTCGTTTTCCTCATTTGCCTAAAACGATATTTTCTAAACGGGT
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GGATAATATATTTTGAGCTAGTATTTTTTAAATATTTTTAAGAAAGCATT
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AAAAATACGACAAGGTCCATTGTTAGGGTTGTTAATTATAAACATATTTA
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GTTTAATAATGAGTGTGTGTGTACATGAATAGGAACGTTGAGAATTTGTT
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TCTTTTATATGCCCTTGCTAATCATGAAGTGGGATTTTGGTGTAATCCTT
TACTCACATAGCTTTTCAATGCTAATCTAATAAATGTTATGAGAACTAAG
TTCCTCTCCTCCAAAAAATTATCCAAGTTGAAAGGGTTATCTGATTCATT
TTAGTTTTTTTATCCATATCGAAAATGGTTACATTTTTTAACTCAAAGCA
ATGGACCTATTATTTTAAATTTAGTTGGTTATTGTCACCTATTCACCTAT
TGATTCGAGACAATCATAGCTGTACAACATTGTGTGCACTTTTAGATGTT
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TTCCTTCTTTCGTAATTAAAGCGGTTTGCCCATATTTATGTAATCGACTG
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TTTCTCGAAAAAGATATTAATAGTTATCAAAGAGTAACGCAATAAGCACA
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AATGTATATGAATTATGATATACATGCGATAATTATATTTAACAATTCAC
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TACATTAGGGAGTACTATTTACAATGCATCCTGTATACATGCTCGATGCT
ACATTCAAACGCTTTTTTCAAAAACATGTATACGGTATACAACAGGGATC
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TTGTGTTCAATTCTTAAACATGTAGAAAACTTGCAATTTCTAGACGTGTA
CGAAGCAAAACTTTTATATCATGGGCTTTATAAAAAAATAAGCACAAGTA
ACATATTTCTATAATTACATAATAATGATTATCGTGTGTTATATATTTTT
TTTACCTCCACTTTCCATGATTGTATCAAAAAATAAGTGATTGTGCCTAG
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GAAGAAAAACAATAATAGTTTCTCCTTTTTAGTTATTTTCGTTTTTACTA
ATTATCATCCTTATATAATAATATAAATTTATCACTATAATTAGATATAA
TTAAATTAGTAACTACTTTATACATTTACCTAAATAGAAATATCATTCGG
CAATTTTTATATACCAGCTACTTTTTTATTTTGCTTCCTTTTTCTTTGAT
TGGGAAGGTAATATCTTGAGTCATGCCTCTTGCTGCATAGTCTTGGTCTT
AAAGTCAGTAATTTTGATACTATGTATGTTTTGAAGTCATTCTTAACATG
ATAAAAAAATGCGAATGGTACGAGTTCTTCAGTTAGGTACCACAAATTTG
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TTACTGATCAAGTTATTGACTGCTATAAGATCATTAAAAGGTACTGCTGA
AGGAAGTTGAGCTGTAAGCCACCAAGACGAGTAACGAAAAATAAAAATCA
TTCAAGGTATTATAGTTTATGTTGCTGTCCAGTCACACATACAGTCCCAT
TAGGTAATTCATTAACCAGATTTTTGCTGAGCAGATCGATTTANTATATC
ATAAAGAAGCTTAGACATCTACCTGGATTTGTGTAAGATAACTACCAGTT
ATCTTACAATCCTCTCTAACAAAAGTTTTAATTGACAACGTTTTGCATAG
CTGAAGGATATCATCATCTTTTCTTCTAGTCTTTTATCCCGAGATAATAA
TTGAGGTCCTTGATATTACAACAATATACTAACTTTGCCTAAATAGTAGT
TTAATCCAATATTGACTAATGCTACCCTTGAACAAAGTGTGACCTGTGAA
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ACGCACTACGTAGTAAAATTTGAGCTATATACTAGTGACTGTACCTGTAT
ATGTGTTCAACTGACGCTATTGCAGTACTATCAAAGGGGTCATATGATTC
TTACAATGATTTATAATTGGGGGGGGGGGGGGGACMGCAACACTCTATAT
ATGAAAAGGATAATTAATAAGAAAAAAAAAGAAGAAAGGTTTTTCTTTTT
TTATTTTCTGTACTGAACTTTAATAGTGTCTTTAATATTTTATACGCCTT
CTAGACACAATCACTTATTGTTCTCTATAATCAAGGAAATTAGAGTAGAA
AAAAATTAAAATATCTTTATATTTTTTTGTTCATAGAAATATTCTATCGT
AAAATATGTTTTTAAAATAACGCACAAATTTTGTTTTGTTTCATAACTGC
ATCACCCTAATATATATAGATAATTCTGTTGGTCCTCCTCTAGAAGCGAA
CGTCAGTCCAGTCACACTTTGGTATTTTCTCCATTGTATATACGAGTAAC
ACATATTTTTTTTTTTTTGTAAAAATGTGTTCCACAACAAGGAATACAAA
TTAGTTCTACCACAGCTATCAAGTATACTAGGTAGATATCATTACACTTT
TTCATTTTAAAAAACGCTTGTCAAAAAAACTTTAAATTTTTTTTCAAGCA
TAAAATAAAAAATAAGTGGCATTATCTGCAGTACCGGAATAATTTGTTTT
TCATTTTTTATCAAGGATAATCATTTATATTTAAAAAAAGTATTAATTTA
ATTTATGTAGATATTTCTTAATAAACTCTCTACGAAAAAAATTAAGAGCC
TGTCTAAGGAACATAGACACAAGGTCGGACCATAATAATATAAAAATAAG
TAATTATATATAGAGTTGGATTGTTCATGCTTAATTAAAAATAACATCCA
ATAATGCAACTTTATGTGCTTTAAAGAATATATTCTATTTCATTCTTTTA
TCAGTACTTAATCCAAGGAAATAACTGAAGCATAGTCATTGTGTCAATTC
CATTTCATAATATATACCCATAAAAGTTATACNTTGTCCCAACATTTGGT
TTTTGTAATATTCCAAAGAGAACTTCAAGGACCTTATATACAAATATTAA
TTTACTGACGTACTTTTCATACTTGCTTATAAGACGTTCAAAATTAAACT
CTTGGGTACAACGTCATATTGCATATAGTTACGTTTTGACAACTTATTCT
ATGAATTATGTTTTATCAAAAAAAAAAAAAAGACTATGATTTCTAGTTTA
TTTAAACTTTTAATACCATGTATATAATTAATTAAGTTATTGAGCAAAGT
ATTTTTGTTTAAATACTTGTAGTAATGGAATATATTATGAAAAAATTACA
TTGACAAAAAAAGTGTTTTCACAAGCTTACATTAGAACTACCGATTGATC
ACATTCACMCCTCCCCCATCCTCAACTTCCAAAGTGTCATTTTGAACCCT
ATACATAAGACATTATATTTCACTGTAAATTAACAAGCAATATTTATTGA
TTACCTATATTATATACCATTTATCTATATCCATGATTCCATCATCATAT
AGTTATGACGTCACAACATGTGCTCCTAATTGCAGTCGGAAGATTGGTTA
AGTCACTTTAAGACCTTAATGTTTCCTATTATTGACTTAATGCTTTCTTG
TTATTGCCAATGTTTTGGATACATATCAATTTGAAAGACTTGTTACTCTA
CCCAGAGCTCTTCTCTAATTGAAGCAGGTTGTCGTGCAAGATTTTCAGGA
GGATGGCCCCCTGTTCTACATCCTTTCAATATAGTCAAGTAGTCCTTCCC
CCTTAACAGAGAGTTACCTGAAAAACATAATTTTTCAAACTCCATTGTTG
TTGCTATGTAGAGTCCTTTTCTAGAAAGAGCCAGGCTACATATAAATCAT
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TTCATATCCCAGGTCACAACTTAAAATAAGATCATTCATTTTTATAATTA
ATTAAATTTGCAGGCCACAGCCGTTTGTTGCTAAATAGCCGCGTTCAAAT
TTAATTTATTAAGCTATTAGTATAATTTTTTGTTGTTGGATAAATGATCA
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ATTAGTTCAAAAAATTTGCACTTATTTAGTATAAGTAAATATATCACGTA
AAAACATTTATTGGTAGATATAAATCACAATTTATGTTGACTTTTATTGA
TCATTGCGATGATCATACGGCTTTTATACATTTGCAAGGATACATCTTTA
ATTACATTTATATATTTAATGCAACACTTGTTATAATTAACTATTTTGTA
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ACCACACGTGCACATCTTACGAAGTCCAATCTTTGCACCCAATTTTCGAC
TACTTTTCCGCATAAAACGGCACTTTAACGTCGTTAAAGCGCAACTCATA
AACAAGACTCGAGGAGATTGCAACTGTCCAATAACCACTAGACCAGGGAT
TTCACGTGACCCCCAAAGAAAATAGTCTAGAGGCATTAAATTGCACGAGC
GAGGCGGCCAATTGACTCGTCCATTTCTGCAGATAAGAAGCTCACCAAAC
TTACTCTTCAATAAATAGATTGTAACATTTCCTATGTGTGAAGTGTTGTT
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TGTCATCGTTGACGAAAAAGTACAGTCCAATGACKCCGCCAGCATGCAAT
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GTGTGGGATTTTCTCGGCTCAATAGGGCATATTTTGCTTTTTAACAAAGC
CATTGAGCCAAAAATGTGCCTCACCGCTGAAGATGATTTTACGTTGAGAA
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TTTGAAGTGGTCAAGCGGCTTCAGTTCTTGTATCAACTTGATTTTATACG
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GCCCAACGATTGAGAACGGCGCCTAAGAGACAAATTTGGGTAATCTTGAA
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TTGGCGTTAACGCTCTTAAAGCTTGGATCAAAGACTCACCACTTTTGTAT
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TGCACTTATTTAGTATAAGTATCAATGTAAAATGGAAGCGTCCGATAACT
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CTGAAGGACAATTTTCCGAACGCAAATTTTGACGAAGGACCATTTGGGAC
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TATTGTTCATGTACAATATACATCATATGAGAGAAAATACTTTACTTATA
TGTTAATGATCATTATATAAACAAAAGACAGTAATATCTCGTTCGAATGT
TGTTTAAATTTTTATATTTGTAATACTTTGAATAAATTAAATAATAAACG
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TTACGCTGTTGCGTGTTCTAAACGTTGGTTGGTTGAGTTAAAATAAGCAC
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AACACNATACAAAAATGACCAATGAAATCTTCAACCTCAATAGATTTGCC
TTTTTTTTTTTTTTTCAAGAATATAGTTACAATATAAAGCTTTATTTCGA
AGTGAAAGATATATGAAAATTAAAAGTAATATGACTTAAAAAAGCATTCT
AGGATTCGAAAAACTATTGTTTCCTAAGTAAGCTTGAATATAGTTCCACC
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GAGGTTTATATTTTTGGCCTATTTTGTGTTTTAATATATTATAGCTAAAC
TAAATAATAAACCTTATATTGCACCTTAAAAGATTTGAGGCCGAAAAAAT
GTTCGATTTTGATGGATTTTTTCATTAAACTTTTAACTTTCTATTAAAAT
CTCTATTAATATTGCAAATTTGCAATTCTGAGAATTTATAATAGCATCAA
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AGGATGTTCTATTAAGGCAATTAGGGTATTTCATTATGTGATTATGAAAT
ACAATTCAAATATTTAGTGAGTTTATACAATTTGAGTCTATTGCGCTAAA
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GGTGGTTAGTTCAGGTCATATTAGAAAAGCAAAAAAAAGTGGGAAGTATT
TTGTATATAAACTAAAAACAGTACAAAAAGCTCATCAAAACATGTTAATT
TTTGTTTCTCAATCTGTTGTATTTATTTTTTGTTGTTGCGGAGAGAATGT
CTAAGTATTGAGTGGGTGGCTAAATGTGAGTGTGCTCATGAAAAATGGAG
GGAGCAACAAGGAATTTTTTAATCTTACCTGATATATTATTCAATCAAAA
ATTTTATATTCGTCAACCCTTAATGACTCTGAGCAATGCCGTGTACTTCC
GCAAATACTTAATAAAACAAGTCAACTTTTTTTTCAAAATATTTTTAATT
TTATATTTTATTAAAGTAGTAGTTACTTAACGCTTAGATTACAAATCTGC
TTTTTGAAAATTCTTGATATGAATTATTTTTATGTATTTCTGAGTATTTT
TGTATTTTTATAGAATCAAGCCAACTTTGAGTGAAATAAAAAATAAGTAA
TCCCACGAAAATTAAATTTAATATTGGCAAAATGAAATGTTTATTTTAAA
TGATTAAATAATTACATAATGAAAAAATGCAGATTAAAGTTTAAAAAGAC
AAACATTCAATGCATAATTTTGCCTGCACATCATAGTTTTTCTTTCTATC
TCGATATTGGAGACAGCTACGGGGATATTTGAAATTCAATTATTGCAACC
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ATTTTGGAGTAGGAGGAGTAAGATAGGAGTTTATCCATTGGCTGAAAGAA
GACCACATCCTATTAGGTAAGGAACCATGAGGAAATTATATTATAAGGAA
TAAATTATTGGAGCAGGAGGAGAGGGATCTCGACTTTTTGAGATATTCGG
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TGGAAGAAATTGTAATTTTGTCCTAAATGAACTATTTTGGGGAGGGCTCG
ATCCTTGGACTGAGGGATGAGGCTGGAGGAGGKCACAGKCCTTCAAGTAG
AGCACTACAACTTTTTTCTGGTATCTACCATGAGCTAATAACAGAATGAA
CGTAAAATCTATTATGAAGATGAAACTTCTATGTCATCAAGTCCATTATC
TATTGAAATAGAAAATTATATAAATATACAGTACAAACTACAATGATTTT
TTAAATCCAACTAAAAACTTATTCAAGCTCCACAATTCTACAATTTCCAG
ATAGAAATGAAAATATGAAGTGCAGGCAAACTTATACAATGCACCCTATA
GGAATGTTGAATTGTGAAATACAGATCCCTAAAGGTAAAAAACTGAAGGG
TAGTTGGACGGATAGACAAATGCAGCCCATGGACCGACCCATCAAAATTA
TATTGCTTACCAATTTATATTTCATTTCATTGTTTCTCTTATTTATAAAA
TATTTATAATTATCTTGGAAAATCAAGAAAAAAATTACAGCAATAAATCT
TGATTAATTTCTGTTAAGAAAAAACAATTGGATTTTTACTATCAATTTTG
AGCTTTTTTTCAGTTTTTTCTTCGAGAAAAAGTTATAAGAAATAATTAAT
GTAACGACTTGCTATATTTTGGATCGATACACTATTCTACTAGTACCCCT
TATCAAAAAAGAAATAAACTTTAGAATTTAGACTCTAAATATGTATGTAT
TTTCAAAAACCTATTTTTGTTTGTCACAATTTGTTTGTCAAAGAAGATTA
AGACTTTGTCGTATATAATTGAATTTTGTTGTTTTGTTTTTATCATTGAG
CTATTGTTTTCAATTCTATATTTATTCTTTAAGTAAAAGTACATATCCTC
TTTCACAAAAGTAAATAAGTCAAGAAAACGTCTTAAAATGAGCTTAATTT
ATCTACTTTCAGTTTAAAAAATAGATATTTGTACATTATTGGCAATTGTT
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AATATGAATAGGCTTTTTTCAAAAGTTGATTTTATTACTGATTAATAATT
GAAAAGGTAACATCTAAGTGTTAATTAAGGACCAGTGACGGAGAGAAACA
ATGAGGATTTACGTGAGAATTATAAGTGYAAGTCATGCTGGTCTCATAGT
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TTTGGGACTCTCGGTTCCTGGAAACAACCCTTATGATAGTCGGTCCTTAT
ATTTTTCCCTAAAAAGTATATGGTTTATTAAGCCAAATATGTTATATTAG
ATATATATTAAAATCATTGCACATATCCTTCTAAAAATATCCCTGTTTTC
TTTATAAATTTATAAATTATATTATATAATTTATTATATTTTTAAAAATA
GAGAAATACCACCAATGATGTTGTAAGGGATCAATTTTACCTTTTTAAGG
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CCGACACGACACTAATTATAAGTGTTAGTCTAGTCATTGAGGATTGCCAT
CATATGTTCTTTTTCTATATACGGAGAGATGTTTGTGCGGATATCCTTCC
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TCTCTCCTCCAAATTAATTCTCAAATTATCAGGATTATAACGTTCATTTT
GGATATATTTTATTTTTACATACTGTAGGAAATGCTTTATCAATAACCGT
TTATACAACTAATTCGAAAAATTAAACACATCTAGCATAGCCCTTTGACA
TATATTTGCTCCGTAGGTCCCGATATATAAAACACAAATTTTATTCCTTT
ATTTTATTCCCTAATATATGTTTTTTATGAATATATTAAATTATTATTAT
TATTAAACTTTGCTTTTAATCATCGTTACAATAATATACAATGTCGCCAA
GGGAGAAGAAAACAATTTAAAAGAAGAAAAAAAAGACTTCTTTCTATTCT
CCACTTCCTTCTCTGACCCTCTCTTTCTGCATATGACAATGTTAATCTTA
ATTACCCTGGTATTCTCGTTCTCATCTTCTCTTCTCACTTCACAAGATAA
CCATCTTCCACCAGGCGACCCTATCCATTTAATTTATCTTTAATAAAGCA
AGGTTTATTTGCCTGTCTGTGGAGGACTCACTTTTGATAACGAGTGTGAC
AATATATGGATCAGCCCGTCATAACTTAAGAAAGAAAATAAGAGTATATA
CAAGTATATATGCATATCAATGTGACTTTAGATTAGGCTGAGCAACGAGC
GTGTGTAGTTAAAGGACATCCTTTCATATAAAAAGAAAAAAGAAGTACTT
CTGTATAGGGTTGGAAAACCTCCTCTTCTCTTAAATAGTAATAAATGACG
TCATTCGTTCAATTCACTTTATCTCAGTCATCCCCCCCACCCCCCTCMCT
TTTGAAGTGGGKCTAGCACGCTCAACCACCCTTCTTACATACATAATTAT
ACTTTTTCTGTTGTTGGTTAATTGGGTTTATATTTGAAGTTATTTTTTCC
TGATTTAACGCCCCAGCAGTTAATAAAATACTGTTCTTCGAGAATTATAA
TATAAAGATGACAGCTTTACCAAATTAAATCAATGGTTATAATTGTATTA
TTATTTGCTATGTCCGTGAAGTCACATATGATTCCTTGCCTGAGTAGTTA
CGTAGCACATGGGCAGAAAATTCCCGGTTTCTAACATAAATGGTGCTATT
TTTTTAAAATTCACATCATTTTCAGAAAGTACTAACCTTTAAAAGTCAGC
CTTCAAAATTTCATGACCATCAGGTCTTTCGTTTGTAATGTATTGTGCTA
AGTGTGACGCTAATTTTTTTATTTACAAAACACTAGGTCAAAAACAATTT
TGTTTTTTATTTTACAGTGCTTTTTGATGGAAAAAAAAATACTGTTCAAG
CGCAGAATGTATATAATTTTTTTTTAAACTAATTTTGAACGAAAAAAAAG
CTTGCTTTCTTTGTTTAATTCCGGATTTTTCAGGCTATATTTTTAATATG
GTTGACTTTCAAACWAATAMAAGCCGTTGTAATCTTTGAATAACCTTCGA
AATGTATTTTATGAATTCATAGCAAAGGTAAATATTAATATGCATGACAC
GAAGAGTGACATCTATAATGACGATATTTGTCAAGCCAACTTCAATGCAA
TCATACTCAAATTTGCTAATCAATCATGATTGTAATAGTACAATTTTTAT
GGCATACACGTAGATATATATACATATATATTTCAATTAACCAGCATAAG
CCTTACTTATGAGTATTAGAAAGTGTTATTAATCAATGTAAAAAATTTAT
AATTATAAGATCTATTTATTTTCATCTTAAATGAAATATTATTAATATGA
TCTTTAAGCTCCATACGAAGTTTTTAAAAATAAGTCCTCACTTCGTATAA
TTTACAACTCTGTCCTTAGTGTTACTCTCCATTTTCAAGAGCACATTAAC
ACTAAATTACTCAATACTTAGATTTTGTCTCCTCAGCTACACCCACCCGT
TGTTAAAATGAGTCGCTCATTCATGTTTTATACAATATATACAACCGTAT
AAAATATGCCTTAATGCCTGTATAAATTCATTTTTTTAATACAACGTGCA
CACCCTATTGCGTTATTATATTTTTTGATCCAGAATCTACGTAACTCTAA
AATACAGTCAAAATGTATGTACAGAATCTAAGCATTCAAACAGACAAACT
TTAAATATTAATCAAGATTTATTTTGTAAGAACGTCAACTGATATACGCT
TTGAGGTCTCCTTTCACGTTTAAAATACGCGTATTTTCTATTCTGTGTAT
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GGGCAGACTTGACCCTTTGCTTACAGGAATGATATGTTTAAATTGATAAT
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AGACGTATCAAATGTTAACTGTTAAAATCGTAGTAAGAAATGAAGTAGTA
CCCAAATGAGCATTTACCTGAGCCTGCAGCTGAAGATAGGGTGAAACTTT
TTAGAATTTCTCTAGTGAATACCCTATTCCCGGCGGAATGATGGAGCACA
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GGTTTCTTCGTGTATATCTAATAAATATCTTCTATTAAAGATAACGAATG
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