EMLSAT00000007325, EMLSAT00000007325-703172 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000007325
Unique NameEMLSAT00000007325-703172
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s412supercontigLSalAtl2s412:129788..148284 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000007325 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000007325EMLSAG00000007325-690091Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000032175EMLSAE00000032175-741103Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000032176EMLSAE00000032176-741104Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000032177EMLSAE00000032177-741105Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto772876auto772876Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000007325EMLSAP00000007325Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000007325

>EMLSAP00000007325 ID=EMLSAP00000007325|Name=EMLSAP00000007325|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=150bp
MAGIDLTREQVAELREAFNEFDDDGSGTITTQELGYAMRAMGMNPTEQEL
LELINEFDTDGSGQIEFPEFCNMMAMKTGQANDEEMVRMAFRVLDRDGSG
TITSAEFRHLMTNIGDKLSATEVEMLIGEADKDGDGHLDYEEFVTLMTSN
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mRNA from alignment at LSalAtl2s412:129788..148284-

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000007325-703172 ID=EMLSAT00000007325-703172|Name=EMLSAT00000007325|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=18497bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s412:129788..148284- (Lepeophtheirus salmonis)
CATAGACTTCTTACTTGCACCAACATGGCTGGKATAGACTTAACACGAGA GCAAGTAGCGGAATTACGAGAAGCATTTAATGAATTTGACGACGATGGAT CCGGTACTATAACAACACAGGAGCTGGGCTATGCCATGCGAGCCATGGGT ATGAATCCTACGGAACAAGAGCTTTTAGAACTCATTAATGAGGTGAGAGA CTATTATGGTTCTTTAACATTATGATTTAACATTGGAGTTATGTCATTAG GGAAATGGGGTTGAAATGAACATACTCATAATCTTAAAAGGTTCATAAAT TATTTAGTATTACATGTTAATTGCTGACTAAATGAATTTATAAAATATGT GTCCCTCTTTTCTTCATTGAAAAGTTATCTAGTATCTAATGGAACGACAT AGTTCAGAAAAAATATTTTCTTGAATTTAATGTGCGTAGGTTTTGTTTGC ACCTCGGTTGTTCCTAGAAAAAGAAATATACTTTATGTATATGGACTTCA AAGAAGATTCTAGTTCAGATGGAGTAAATGTAATACTATAATGTTCACTT ATTCTTAATCGGTGCAACTCCATCTGAACAATTAAGGGAATATTTTAAAA AAATAGGTAGTATCTACCGTTGGCTGACATTCAAGGAAAAGAGATATAGT TATAGACGGAAGGAAGGACAATAAAGCCCCCAAAAATTTGTTAATAGTAT TTCTTCATTGAGGTAACTATTTTCAGCTTCATTGGACAATCCCCTCATCT GTGACCGCACATTATGCATTAAAACAATCAACTAACTACAAATTTTAATA GTCTTTATTGCATCTCACAACCTTTCCTCTTTCAAAAGTTGGAAGTTACA TAGCTAATTATTACCAAATGTTGAACTATTTTTCATTCAATAGTAGGTAA TTGTTCACAACTACTTAGCATCACAACTTCTAATTCGATTTTAGCAAATC 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AAGTATGACTCGCCTATTGACAGACTTGTAAGCGTTCCGCTATTTTGGCG TTCCGTTCAATTTATTTTTCCTTCAGCATTCATTGTYCAGCCATTATTTT TGTTCCGTTCAGCGTTCCAATTATAAGGTAGTACCATGCTTGTGCAATGT ACACAAACGACCTTGTTAAATGAAGCTGGACAGTTTTTGAGGCATAAAAA GTGGGATACCCCAAAGGAGATTGATAAATCAAATTGAATGTATAAAAACG AGATGGTTTTCACGGATGTCTGGGGCGCCAAAAGCTTCTTTTTTTTGTCT AAAATATCTATGGGAATCATTAAAAAAATTAATTGAGCTCGAGTTCAAAA CACTAATAGCCGACTAAAAATTGCAATATTTTATTTTGACAGAAGTGGAA TAGCCATGTCCGTTGGGATTCATTTCGATCTCCTCTTAATCCTATATTTA AATATAGATTAATTAAGTCATCATTAATTATCAAAATCTATTATATATAA CTTATGACGAACTCTTAATAGTACTGAGTCATTGTAATATATTGCGTATT TGTAGCACGTCATTCAAAAGGAAGCTAGGATAATTTTTCTTAATATTGAA CATGGAATACATTTTCCAACAACAAACAAATAATTCTGATTAATTCTTTG GAGGCACCGCAAATTGTACTTTGCCAAAATTAAATGCCACATTTATAGAA TTCGAAAATTAATAAATTATATTTCTAATGAAATATGGGCCAAATAAAAG TCAGCTAGATAAAACAAAGGTTTTCAACTACAGTTAACACTCTCGGGTAT CTCAATTCATCCCATTATTTGAAATCAAGCCCTATAATTGACTGTAATAT ATCTTTCAAATATTGCCTGTCATTTTATAAATATTGAACCTTAATACATA CGGGTTATGCGAAATATATGTACCACTACAATAGATTAATTTTTCGAGGT 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