EMLSAT00000007336, EMLSAT00000007336-703183 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000007336
Unique NameEMLSAT00000007336-703183
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s414supercontigLSalAtl2s414:24152..55376 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000007336 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000007336EMLSAG00000007336-690102Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000032205EMLSAE00000032205-741133Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000032206EMLSAE00000032206-741134Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000032207EMLSAE00000032207-741135Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000032208EMLSAE00000032208-741136Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000032209EMLSAE00000032209-741137Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto770519auto770519Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000007336EMLSAP00000007336Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000007336

>EMLSAP00000007336 ID=EMLSAP00000007336|Name=EMLSAP00000007336|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=399bp
MKGILWILTLMGCCFMFSEALYGRGSGVGLLKLGLVKGLVAGXLLSNIGR
RRRGFRGRGGFRRRRGFGRRRFGSGRYNGRRGGGGYGNGGFLFRGKRAIN
EYEEILLSASQEDQNDCAKRLVCEISSLPPTAMSLEEVQIASAFNSNYLD
ISKATVEFELAAQIGKRVGLEQCSVIYKRCPFPRAKLMEIPTIVSIPTPR
KLQVKQIEMKGILWILTLLGCCFMFSEAIFGRQGGFGRRGGFGRRGGFGR
RRFGGGRYNRRRGGGGFGRGFGGGFGGRGFGNGGYGNGGLLFRGKRAINE
YEEILLSSSQEDQNDCTKRLVCEISSLPPTAMSPEEIQIASVFNSNYLDI
SKATVEFELAAQIGKRVGLEQCLVIYKRCPYPRAKLMEIYSKTNVEDES
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mRNA from alignment at LSalAtl2s414:24152..55376+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000007336-703183 ID=EMLSAT00000007336-703183|Name=EMLSAT00000007336|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=31225bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s414:24152..55376+ (Lepeophtheirus salmonis)
AGTTATAAAGATCATCATATCGAAATGAAAGGGATTATTTGGATATTAAC CTTACTGGGTTGTTGCTTCATGTTTTCTGAAGCACTCCTTCAAGGAGGAA ATGGAGTAGGACTCCTTAAACTTGGTCTTGTAAAAGGACTTGTGGCCGGM GCTCTTCTTTCTAATATTGGGGGAAGACAAGGAGGATTTGGAGGAGGAAG ACGAGGAGGAGGCCGTAATAATAGAAGACACGGCGGACGATTCGGCGGMG GAAGACTCGGCGGTGGAGGATTCGGTGGTGGAGGATTCGGCGGCGGAGGA TTCGGGGGTGGAGGACTCGGAGTTGGAGGATTTGGAGGTGGAGGATTCGG TAATGGAGGATTTGGAGGAGTTTTATTACGTCGAAAACGTGCCATCAATG AATATGAAGAAATCCTTTTATCTGCCTCTCAAGAAGACCAAAATGACTGT GCAAAACGATTAGTATGTGAGATTTCAAGCCTTCCACCTACGACCATGAG TCTTGAGGAAGTTCAAATCGCTAGTGCTTTTAATTCGAATTATTTGGACA TCTCAAAAGCCACTGTTGAATTTGAACTTGCTGCACAAATTGGGANNNCT AAGTAACTCGTAAAAATATACTTTTCCAAATATATATAATTATTTTATAT GGATGTACTTTAACATCCCCTATTAATATATCATATAGTATATCTCCTTA CGCTCTTACACAAATCCCATCTCTACACATATCATAAAAATAAATATTGC AGGCGTTTACATATAGCGCCTATATATACATTGCACACGCCTGTACTATT TATACCTTTTTATTCCTTAGATCAAAATATTTTCCTACCCGAATATTCGT TTTCCTATATACATACATTCAGACATTCATACAGACAGAAATACCAACTT TGGATTATCGATAAAGATAATAATTTCTGTATTGAAATCAAAGTTAGTCA TTGCACGTTTTAGCTGCAATTTGACTTATATAAATATCCACTACATAATT TAACAGTACATTCAATTAAATATTAATGAAATGTCTATATCTAAAGTGAC ATGAAACAAAGAATATGTATGTATAAATTAGCCTACGCAATTCCCATTCA TTTACCTGTCTATTAATAATATTAGTCCATATTATCGAGTTATATATACG ACTTAAGAAATGAACAAAAGCATATTTAACTCTTGTAAAAAATCCTTATG AAAACATCAAATTGATCTGGGAGTATATTTCTTTTAATAGAGATGCTTTA AAAAGTGAAAAAAAATTAATGAGTTTAAGATCAACATTATTGAATGCCAA AAATGTAGAATTGTACAACCTTACAACCAACAAAAGTGAAAACATATTGA AGCCATGGACTATTTATTTCAAAAGGACGTGAATTGGCATACTTGTGGGG CTTCAGACGTCAGGATATTCAAACCTCAGCATCATTATTTCCTTTTAAAT GAAAAGGTTCTCTGAACTTGAACGTTTCTTTTCTGTAGGAAAGAAAATGG CACAAAAAATTTGTAATTACTAAAAAATAAACTTCTGTTGTATTTTATCT CCTTTAAAAATCCACCTCTTGATTTTCATGATCTTAGGTTCGATAATCTG TCGTGTCTAGAGCAGGAAATTTAAATTATATATATTTTTATAAAAAGATT TTGTTGCCCATGAGTCGTGATAAAAATCCGCTGTAAGTTTTTTAGCTCGG TGTTTCTTTGTAATGGACATCTGAAGAATTAATATTCTTTTACTTAGCTT TTGTCATTATTATTTAAATCCTGAGTAGTGACTCTTTTTTTCTACTGCAT ACAACTATATTCAAAACCTAATTGAACATTCGTGTGTGCCAAGGTTGAGT CTGGCTCAGGTTCAACAGTTCTGTCAGTCTCGGTTCTTTCATTTCAACGG TTTCGGTCTTGGTCTGTTTTCTGCTTGAATAGTCTCAGTTCCGTCCCATT TTGTCCTGTCCTTGATATTGGTCTGAAAAAACCTACCAAAAATTAAGGTA TTCTCTACATTGTATAATTTTTATTCATATTATAGCAAATTTTTTTCAAT TTACCATTTGACTTAGTTTATTAAAAGATTAAGTATCTTTAAAACACGTG AATATTTTACCATTATGTTTAATTTACGCTTAATTAAAATATTTATTATT TTTTGGAACAATTGACCCTTAAAATCCCGGATTAATGGATAATGACATCA CAGACATAATAAATTTGGGAAGGCTACAACTCCAAAGTATCATTTTTACA TATCTTACTGCAAAATTAGATTTATATTTTTTTTTTCTGTTTTAAACTGG CCTCCTGAATCGATACATAAAATACCCGTCTCCGACCTTGAATCCAACTG CAGTATTTTGAATGTCAAGGACTCCGACTCAACACACAGTTATTTAATAA TATATTGTTTAGCCTTTATCAGTACTATTGAGTCAATTGAGTTTAGAGAC TATAAATTTAGATCTCGTTTATAGCCATAAGTAGTTATTACTTAAATAAT TGTGCCAGGTATAAAGAAAATATTTGGAATATAAGATATTTAACAAAATA AACAACAAAATATATCTATTGTTAATACATTCATAATTTTCTGAACATAA TTTATACACTCGTAACCGAGAAACAACAATACAAACAATCTCTCACTGCA ACGTCACTCATTAATCTGATGACAATACTATTCGCAGGGCTAAGTAATGA ACTAGCATGGCTAATGTATATACTCTACCCAACATAACAATTTAACTTAG AGATGTTCAGAAATCGTAATTGTATAGACCAGGGGTCACCAAACTTTTTT ATACGGTGGGCCTGATAACTGAAAAAATGACGAGCACGGGCTGCATAATC 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AATCGTATATAATGTTAGAGTTTTTGGGGTTGATTTTAATCTACGGTTCC TTTTTATATGTATCACACTTGCATTATATGCAGGCTTGTACCCGTTCAAT TGTTCATTTTGAAAAAACTTTCCGTTCGCCATTCATTCGTTTATTTTTTC CTTTAATTCCTTCGTTTTTCCTACTGTATGTTTTCTTTTTATAAGTATCG CACTTGTATTATATGATGCACTTTTATACCCGGCAATATATACAGTTCCT TGGTGTCAAGGAACAGACAAGCATTACTTTAATAGTATAGAAAACAACTT TCCAACAAATCCTTAGTTAATTTTCTGTTTTCCATAAGCACACTCTCAAG TATTTCCTCCATATTTCATACATCGGAAGATGTACTCACAAACTCAACAC TTTCAAGGACTCAAAAGAAAAGTGGTTCCACTATAGAATGGCTAKTTCAA CCCTTTTTACGAATAAYATAAAGATTCTGTCGGGCCAGTCTAAAGACTTC TAGACATCTGTATTCGAATTGCTAAAAAGGTTTCTCGTAATGTCACCGCT ACACAAAGATTTCACTTCAAAATAGAGTACCTAATCATGAAAGTGTTATT TATTCTTTACGCATCAAGAAGTAAGAACTCTTGCATACCTATTCAAACAA CATATTACTGCCTAAGGGAATAACCTAATGTTTATTATTTACAATTATCA TGTGGTTATATATAAATATCTATCCATTTTATAATCATTTTAAGTTACGT TAATCTGTAAGAAAAGTTCTGATACCWTTTTTTWAAWTTTTTTTAATAAA GTAAATATGACATTCCAGCATTTTGGAAAGAAAATTTAATCTTGTTGCCC AACTATTTAAATACTCTATTTTCGAATTAAAATTATACATATATTATGTA TATATGTAACTTTTTGTATTTGATTATAATCTATTTTATTTCTAGTTGCA 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CTTTTGGATTGATTGTTGTTTTTGTTTCTAATAAATGCCAAGTTTGACAA AAAAAAACTTTTATGGTAGATAGTAATATTCATAAAGGTAACTCTATCAC ACCTGTTCTAAGCAGATAAGATATAAATTTTCCCACCTTATTTTCCAGAT CAATAGCTACACTTCCAAACTTTTGTAAATACTATACATTCGGATCATAT CCATAAGATTGCTTTAATTCCTTTTTGGTGATAAAGACCGGTCAACAGTT CAAAAAGACTCAGTGTGACATCATTTGATGGATTTAGTAACCAAGTACAC ATTTTGGAAATGACACTATCCAAAATCGAAAAAAAAAATCCTTTTGATTT ATTCTTTTTGACTTGAAGCAGGAGTGTTGATCTTATATTTATGTAATCAA GTGCTTCTTGGAACACATTCTCCTCTTCCAACTCTCATACAGAACTGAAG AATGACCAAATACCACGAATCAAAAATTTGATGCATCCCACTTCTCATCT TCCAACKCCTTATACATTTTTGASGAGCCAGAAGAAATATCTGGATCTTC CTTTTATAGTTTCACTGAGATACCCTTCAGCAGTTTCTTAGAGATATATG GGATACACAGTTTTCAAAGGTTCTGATGGAAGCAACTATTGCCTAAGCAC GGGAGAGAGTTTATCGATTCAAGTAGTAGGACTCCTCCAGTAAAGATTTG TTCTCTATCGTCCCAGTACATCTGAGGTATGACCATAGTTTCAGAAGAAG AAGCAAGACTCTTTGGGTCACCAAGGAAGTTTTCCATCCTATCAAATCTC TCACCCATGTAGACCATTTCATTAGAGTATTCAATGCGATATTTTTTTTC TATTGATATTTCCTTTGAGTCTCTTTAGGAAACGCGGTCTAGGGCAGTAG ATGGTATACTTACTTTTTTTATTTCAAGGTGCAGATTTAAAATAATATAT 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