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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s427 | supercontig | LSalAtl2s427:85085..93720 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000007470 >EMLSAP00000007470 ID=EMLSAP00000007470|Name=EMLSAP00000007470|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=724bp
MKRSILVLQIIISFSVVSSSTEDWAIKVHGGLEVANQVAKEHGVRNLGEV
LPNSDIYHFERVHRRRHKREENLFEELMKSSPWSEKQIELTRVKRQITTH
FPINRNIFNDVRPPIQSGHKKSICSMNTYETETKQSRRCVFPFVYKGKLY
SKCTNDHSVNGKEWCATEVTPKGEVVNGQWGDCNPSSLLCHPVVDEPSFP
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DENASADLNDRDGDPYPRYDIINSNKHGTRCAGQIAAAANNSYCSVGIAF
NAKVGGIRILDGRIFDSLEAQALSYNRDYIDIYSASWGPDDXGATVDGPG
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SSTSENGFIPWYSESCASSLATTYSSGASNRRLREKKIVTTDLHGSCTKS
HTGTSASSPMAXALIALTLEANPNMTWRDVQHIVVLTARGSAGSYLKSDD
WSVNGAGREFSHSYGFGLMDADAMVKLAANWTNIPEQMICHSSEVIYENG
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SGTTSRLLNFRPFDDERVGFASFNNWPMMSVHFWGENITNKDLDEWTLKV
INRGNGVASLKRWKLRFYGSNSAL back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s427:85085..93720+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000007470-703317 ID=EMLSAT00000007470-703317|Name=EMLSAT00000007470|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=8636bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s427:85085..93720+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGCAAGCAAGGGGGATATCAATGCTTTTTTGGTTATTTTGAATAGATT
TTTATTTTGTGTATGTTTTGATTAAATTGTTTATTTTTTTCTACGAAAAA
AATAATCACAGATTTCGTATAAAGTGATTAAAGTGTTGATGAATCCAGTG
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CTGAACACTTTGAATTATAAACTTAAACAAGATATAATTTATTAATTATA
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CTTTCCACCCACTTTTTTGATAGTTCTCTGTACAGCCTACTATGAAACTG
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ATTACACTCCAACGTTTCGAACTTGCTATCGACGTAGACGGTGGTCCTGG
ATCCTGTACGAAGTGCGCGAATGGAATTTTTTCGATCACGTTGAAGTGTC
ATTTTCTCGACTTGTATGTAAGCAAGCGAGGTCAGGTTTGTCTAGTTTTG
TAACTAATTGTTTATGCTTAAATAGATCGAAATATGATTTAATTTCAACC
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CCCCCCGGTATTTGGTATTATATATACCTATAAATTTTATATATCAATAA
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ACGAGGTACAGGGTGGATGAAGCAAATAATGTTTTATCAATTCAATGCAA
TGTTAATTAAAGTTATATATTCGTAAAGGGAGTTTCTTTTTTTTCTCAAT
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TAGGTACGTCACTTCTTGTAGTCAATCCCCAACAGCTAGTGTTGTGTCAA
TCCTTACTTATTTGGTCCACTCCAGTCGATTCTTAGGACCATCCTTTGCA
GTCCTTGGGACCCGTCCTTAAGACTGTTGGTCCTTCGAACTAGCAGTACT
AGAACTGATTAAGAAATAAAAATACAGTTTATTGACGTCATCAAGGACCG
AACTTTATAAGTTTTAGGACTGATATGCAGGACTGAACTTGACAGAATTG
CAGTCTTCACTCCTAAATAAGGGCTGAAACATTACTTCCAACAACTATAT
AATTCCATATTGTGGGAAGAATTGGCAAACTACCAACGTGATGATATAAT
ATACAAGGTTGTCCAGATAAATTGGAAATCTTTAAAGGCTTATAACGAAC
AAACTAAATTAGGTAGAACCAGAGTTTTTATTATTATTGAAAGCACTGAT
TGTTTTTTTTGGTTCGGTCTTAAGTGACTATTTCTAGACAGATTTCAGTC
TCAGACCGTGGACCGATTTTTTTTGGTCTCAATTTATGGACCNGATTTCT
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GGATCAAAATTGATCCAAGCTTTCTCTGTGTTTAAACTTTGTATCACGTC
ATTGTACTTTAAAAAAATATATGATGTCATGGTACAAACAATTTATCTGT
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ATCTAGACCGAATTATTATTTGAGACCGGTCTAGGATTTCCATACCGAAA
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AATGTAGCTTTCAAATAATAATAAAAAGTATGGTTTTATCTCATCTAGTT
TGTTCTTTATAAGCCTTTAAATATTTTTCCAATTTATTAGGACCAACCTG
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ATTTAAGGTCAATTAAATTTGCAAGTATAATTGTCGTAATCTATTGTACT
GTGTCAGACCTATTTATTTAGTCCAGTCCTGTCTTAAGACCAATCCTTCG
GACTGCCAGTACTAGAACTGATCAAACAATGAAGACGTCATCAAATACCG
AACCTGATATGCAGGACTGAACAGAACGGGGCTGCAGTCTATTGCCCTAA
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TGATGAAGGTAACCTTGAAAATCTTCATAAGGCAAGATAAAAATCAATGA
TTAAACCATTTTCTTCTTGAATGCCTTTATATAAAATAAAAATATATATA
TATGACAAACAACGGGATTTAAAGGTCATATTCTTGGCGTCTATCATATG
TTTCATATTATGATTAAAAACAAAAGCATGATATTATTCGGTAGACTCGT
GAAGAAAGAAAATTGGGTTAATTCTTACATAATCAACATTACTTTTATTT
TTATTCTTTAAGTTTCTCTTTTTATGAGGATTTCACTCACTTGGCGCCTC
CTTCCGCACGATTTATTTTCTTTACTATTTTAATGAGGCAAGTATATCTT
GGAATAATTTTGTACTATGTATTTCTTAGGTGTTAGAAATTTAGGTGAGG
TTTTACCGAATTCCGATATCTATCACTTTGAAAGAGTTCACAGAAGAAGG
CACAAAAGAGAAGAAAACCTCTTTGAGGAGCTTATGAAATCCTCTCCTTG
GTCCGAGAAACAAATTGAGCTCACCCGTGTTAAAAGACAGATTACTACTC
ATTTCCGTGAGTATTTATTATTTAACGTAATACCCTTTTGGGAATATTCA
ATATATTATGTATGATCAGCAATATTTAGTCCTGGTTTGGCGATTCCACG
GTTTTTCATTTCAAGACTCTTTATAAAATTCATAATCTATGTATCGTATA
TCCAAATAGAATACAATATTCAGAGGCGTACTTAGTATTATATCCTACAT
ACTTTTTTTTCAAAAAATTTAATAATCCACAGCTGTTCACAAAAAATTAC
AAAAATTTGGGGGAGGGATATAGCCCTTCCAGCCCACCCTCTGCGGATGC
CCCTGATATTAGTTCGTAATACAAACATGGGTTGACCCACAGTTCTATTT
CCCCCCGGATTTGTCCTCTTTCTACAACCTGTCCTTGGACTATTTATAAA
TTAATAAAATGTCCTGTTTTATGTGGGATAAGTAGTGCATTTTAAAAATC
AACTTAAAACCAGGATTTGACTACCATGTTAGACCTCCATCTAGCGCATT
GTGCAACGTAATGCCATATTTTAAAGATTTTTGCGTATCATATGATTTTA
AAGGGAGAAAANGGAATTACTGCTATAATAAAGAAGAGAGCCTTCTACAT
TTAAATTAGCATTAGTGCAGGCAAAATATACTAATTATATTTCAATTCAT
TAATAATAATTATTTCATTATGCATATTTAAAACAATTTACACCAAAGAT
TGGCCAGAATTCTTCTTTTAGAGGGAGATTTTAACACCTCCAATAATGAC
TAAACAAAAGAGAAGAAAAAGAAAACACGCATCAACCGTTTTTCTCTTCT
AATCACTATAAATAGTTTGTCATTACACAAATACCTTCCTTAGTGCCGAT
GGGGAGTTTAAACATCTCTGTATTCAAACTAGTTTAAACATTGAAAATCT
GCATAAATATTTTTCTTAAATTCTTTTTTAGCTTATGATACTCATAATGT
TCTAGATCAATGGTTCCCAAACTTTATTGAGTTCGACCCTTAAAATATGT
GGCTAGACAATGTGCAACCCCTATATCTCTGATTGAGAGATGAATATAAA
ATTTGGAGTTCATTTTATGTAATTAAACGACTTAAAGGCCATACCAATCC
TATAATTTCAACTCAGAGGCAAATAATATACGTTATTTGACTATATAGAT
CAAATATAAAGATTTTAATTTTACATATTATATTGAAGGATATAAGAAAT
ACAACGAAGAAATGATCTCATATCTATTGTAAATATAAAATCAGCGATAT
GCATACAACTTGTAATTATTTCTATACTGTCAATTCGTCTTTTGTGGTAA
ATAAAGTCAAAATTGAGACTCTCAAACACATAATATTAAAGACTGTGGAT
TTGCAAATAGGCTTATAAACGAGTCAAAGTCTTAATGTAAAGGAATTCGT
CTAGTTTTTTAAAAATCCAAGTCTGTTTTTAGTGTTTGTTCATATGAAAG
TTCAGACTTTCCCACTTTCCATATCAGACAACAGATTATTTTGTAAAGGG
GTCCAATACAGGTATTTTCGCGTGGAGGACTATCTTCTAGGAAATACTTT
TTAAAATGGTCACTAATTGTAACAGCCGTCGAGCCTTGCTTACAACGTAA
AATTTAAAATAAGGAGGGACAAAATCAGAAAAAATGTAATAAAAAACAAG
GTCCAAATTATCTACTCTAAAATAAAGATCAAAATATTAACCCATTTAAA
ACCTACCCAGATATGTACCCTCCTTTTTGAAAATCAAAATAAGGCCACCC
TGTACTAACATTCAAATTGTGTCTCAAACAGTATGGTTCATCCACAGAAC
TAATTACCTGGACTATTAAGAGTATTATACATCATTTATTGATATATCTT
TTTGAAAGTATTTAATGATTTAAACATTAACACATATTTTAGCAATAAAT
CGAAATATATTCAATGATGTCCGTCCACCTATTCAGTCTGGACATAAAAA
GTCTATTTGCTCAATGAACACCTATGAAACTGAAACTAAGCAAAGTCGAC
GATGTGTTTTCCCTTTTGTCTATAAAGGTAAACTCTATAGCAAATGCACC
AATGACCACTCTGTGAATGGAAAAGAATGGTGTGCCACAGAGGTGACGCC
AAAGGGAGAAGTAGTGAATGGACAATGGGGAGACTGTAATCCATCATCCC
TCCTTTGTCATCCAGTTGTTGATGAACCAAGTTTTCCGTTTCAGGATGTA
TATCGTGATTTTTTTGGACTAATTCCCATTCGATCAGGTAATCCTCAAAG
TCTTTTTGTTGAAGAACCTCCTAGACCCGTTGAAGTAGTCGAAAGAAATC
TATCTGCTTACAAAAGTAAGTGGAATGATAGATTTTGGCCCGAGATGTGG
TATTTAAATCGTGGGGGAGATCATTTAGACATGAATGTTGAAGAGGCTTG
GGAAGGAGGCTATAGCGGMAAAGGGGMTGTGGTGACTATTCTTGATGATG
GAGTGGAATGGGATCATCCAGATCTCATTGACAATTACGATGAAAATGCC
AGTGCGGATCTTAATGATAGAGATGGAGATCCCTATCCTAGGTTTGTCAT
TTTCAAACCAAATCATTGAAATTGGTTTAATTGTAATTAATACATTTAGT
ATATAAAGCAATATTTTCCTGCATTTTTCAGATACGACATCATTAATTCA
AATAAACACGGAACTCGATGTGCTGGCCAAATTGCTGCGGCAGCAAACAA
TTCTTACTGCTCAGTTGGGATTGCTTTTAATGCAAAGGTTGGTGGAATTA
GAATACTTGATGGGCGTATTTTTGATTCTCTTGAAGCTCAAGCTCTAAGT
TACAACAGAGATTATATCGATATTTATTCGGCCTCTTGGGGTCCAGATGA
CAAMGGAGCCACTGTAGACGGACCCGGAGTATTGGCTAAGCAAGCTCTTG
AGGATGGAATTAAATTTGGACGGAAGGGAAAAGGATCTATTTTTGTTTGG
GCGTCTGGGAACGGTGGAAAGGTACGGCAGAGTCTAACTTTTTGGAGTAT
TATTTTTTTATAATAGTTTTTTATTTTGATAGAAAAGTGATGACTGCAAC
TGTGATGGTTATTCCACCTCAATTTTTACTCTAAGTGTTAGCTCCACCTC
AGAAAATGGATTCATTCCATGGTACTCTGAGTCATGTGCCTCCTCTTTAG
CTACAACATATTCATCGGGAGCATCCAATAGACGACTTAGAGAAAAAAAA
ATCGTCACGACTGATCTTCATGGATCATGTACAAAATCTCACACAGGTAC
ATCTGCGTCCTCTCCTATGGCTGSTGCTCTAATAGCGTTAACATTAGAAG
CAAATCCAAATATGACTTGGAGGGACGTTCAACATATTGTCGTTCTCACA
GCCAGAGGAAGCGCTGGTTCATATTTGAAGAGTGATGATTGGAGTGTTAA
TGGTGCTGGGAGAGAATTTTCTCACTCTTATGGTTTTGGACTAATGGATG
CTGATGCCATGGTCAAATTAGCTGCAAATTGGACAAATATTCCCGAACAA
ATGATCTGCCATTCATCAGAAGTTATTTATGAAAATGGACTCGTCGGTGA
GCAAGACTCCGAAATAGAATCAAAGACAAATGCCTCCTTGTGTTCAGAAG
AAATAAAGTCTCTTGAGCACATTCATCTATTTATAGACCTTGACAGCACA
TCTCGGAGAGGAGATTTGTCCGTCTCATTGACATCACCAAGTGGAACCAC
TTCTAGACTTTTAAACTTCAGACCATTTGACGACGAACGCGTAGGATTTG
CATCTTTTAACAATTGGCCAATGATGTCAGTGCATTTTTGGGGAGAAAAT
ATAACCAACAAGGATTTGGATGAATGGACTTTAAAAGTGATCAATAGGGG
GAATGGAGTGGCAAGTTTGAAAAGATGGAAGTTGAGATTTTACGGAAGTA
ATTCAGCATTATAATGTAGTCTTTTATAAATAACAAATAAATATAATCAA
GTTGTAAATATTATCTTATAGGATTTGCGTCTTGTGATCATATATGTACG
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GATATGTATGCTGTAATAATATAATTTCTATCTACT back to top
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