EMLSAT00000007530, EMLSAT00000007530-703377 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000007530
Unique NameEMLSAT00000007530-703377
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s433supercontigLSalAtl2s433:260626..286019 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000007530 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000007530EMLSAG00000007530-690296Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000033113EMLSAE00000033113-742041Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000033114EMLSAE00000033114-742042Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000033115EMLSAE00000033115-742043Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000033116EMLSAE00000033116-742044Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000033117EMLSAE00000033117-742045Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000033118EMLSAE00000033118-742046Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000033119EMLSAE00000033119-742047Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000033120EMLSAE00000033120-742048Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto775799auto775799Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000007530EMLSAP00000007530Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000007530

>EMLSAP00000007530 ID=EMLSAP00000007530|Name=EMLSAP00000007530|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=911bp
MSPIPGRNSAQSCQPPPPQAPSSTTSSNRGXSPVQSXPPPPQPMRVHNSR
EIKQQFAQTLQSMQALSVFPGDHLNGQAEPPPPYPMGTAAMTPNPPPSXS
QSLAMRQSPTLSSTSSTDYRRSPAPGHPLLAXSVMATNSATASPTPSVIS
NSSSTRSSVQAWPSRQTKTHSPIIMQSVKSTQVQKPVLQTAVAPSPTPPS
DGSSSPPVAPPTGAPPPPSYEFSMQQKQQRTSPSLNPPPPPXPPNSSKRL
PIMEEHXLPPPPPYPSTALGFSLETNNHSEGLVNATAINAKASPVISTAK
VVSNANLVRTIENKPPLQRKYSPLTSETGSSASRSESPVSDSQTVSAASP
LSFLSSSNEAXTTTDSGVGGMEPSSIVPPPPPYKTTHHTSPKPERKKVSA
EKEEVRKESLIRNCPPQAFKFFMEQHIENVIKESKQRRARQMRLEKELAQ
LNVKDPVMSEQMRCVLRKKETNYLRMKRAKLNKKHFKKIKTIGVGAFGEV
SLVRNIDXANSSKTGGGLYAMKTLKKSHVVDRNQVAHVIAEKDILAEADN
DWIVKLYYSFQDKDNLYFVMEYIPGGDLMSLLIKLGIFEESMAKFYVAEL
ACAVDSVHKMGFIHRDIKPDNILIDSKGHIKLTDFGLCTGFRWTHNSKYY
QKNGDGHCRQDSMDPGNLDLDSGRCSCPSISNGLKPLERRRLKEHQRCMA
HSLVGTPNYIAPEVLLRQGYTQLCDWWSVGVILYEMLVGXPPFHANSPAE
TQYKVINWEHTLHIPRGAKLSEEAKDLIKSLCILSDRRLGKNGSEEIKCH
PFFKGIDFSKPIRTQPAPYKPDIMYETDTSNFDPIDPDRLRATSEDDEEE
EEDERLKRRKDYHRFYEFTFRRFFDDGGHPLRMEDFGNSLLSSSSGNSSV
VTSPPADAVYV
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mRNA from alignment at LSalAtl2s433:260626..286019+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000007530-703377 ID=EMLSAT00000007530-703377|Name=EMLSAT00000007530|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=25394bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s433:260626..286019+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGCAGAAATACGGAATTCTTTACGGCCGMTTGAACAACAGGATCTACC ACGTCCTGTGAGCTCTTTATCTACGACAACTAGCTGCTCTTCCTCGAACA ATAGTGTATACAACGATAGTATTCAATGCCTCGTTAATATGGGTTTTGAT GAGGTAAAAAAATCAACTTGTTATTATTATAAATATTATTTTTGTATTAA TCCTACGCAGTTTGCAACTACAAATTCCATTCATATGGGGTGTTGTAAAT ATTTGATCTACATAAGGTTTGGGGGGGGGGGGGTAGGAGAGATAATATGA AAGTCGTTGAATTTGTTGTCGTCCTACAAGTTTAAATGTCATTTGTATAC TTCTTTTTTATTAATATTATGTTATTAACGCCATCTTGAGTCAAGAATGC GTTAAATCCGATTACATTTTTTTATTATTTTTTTTTCTGCATCAATGTCC TTTGCATTATTTTGGCAAAGGTATTTTTGGCCTTCATATTCCTTTTATAT ATATTATACCAATACATATTTGTTCAAATATGTTAAGAATTAGATATATT TTAAGGATCAAGGATGATTTAATAGAAAAGAGAGGAGGAGAAGGAAGACT TAAACGAAGACGAAATAAGTAGAAAAAACGGTTTTTTTTACTTTGCATTC TTTCGTAGTTTTTTATTATTATATTTTTTTTTAAATTCATTAAAATACTT TCTTATTCAAGTCAAGAGTGTGCAGTGAAGGAGCAGCGTTCTCCCTGATC GGCGTGCCTACTTTTCTTTCTTTTTTCAGTCGCATTCCATTYAAGCCGTT AAAAGAATTACATGATAATATATATATATGTACATATGAATGTATGATGT ACTTATTTGTAGTGATGCGTAGCAACATTTTCAAGTCGAGTCGATCAGTT AAGAGAAATAATGAAGTAATTTTGAGTTATATCCAGGACTCGACAGACAC TCTAGCCCATGGCTAGTAAAAAWCCAGTTGGGMTAGAGMAGAGTAGCCTC TATGTAGGCCGTTTAAGCTACGGAATGGCATACCTTACATACTGCATATA TAGTCAGTTTTGAGTTCAAATCATGAGTATTATCTTATGTCAATGTCGAA TAGACATTGAAAACAAATATTAGGGGTGATTTTTAAGTAAACTATATAAA TGTATTTTTGTACTCCCAAAATTTAATTTATTTCAAGACAAAATTACCTT CATACTTGTCTAAAAATGATCCAATATTTGTGGTATTCGATGCTAAAAAA AAAGAAAGGAATATGTTCTTTGTCAAATTTGAGTTTGGGGAGAGTGRAGG GAGATCTAGCCAAGTATTAGTTAAAGTGGATGTAATTATATACTGGGGTT GCCTCTCATCGTGACAGTGGTGCTCCTCAAAAAATGAATGCGACTATTAA CATTTAATTAGACAGAAGCTAATACTATATCATATATAAATAAATTTGTT TTTCAATATGAAAGGATGCTATTTGTAATTCATTTTACATAAATAATAAG GAACCGTAAAAATCTGTCTCAAGTACACATTGTCATTAACCCACCGGGTT CAGCCTGACTGCAGTTTATAGTTTTATCATTTACTGCGAAAATACATTAG ATTTCAAAAAGAGTAAGGAACAAGCAAAAGCATTATGGATCGTTTTCTAA AAGCAAAAGCCCCATAAGAACTGGACATGATTGATTGTGATATGGAGTAT AGGCCTACTTCATGTGAGTAATCGTCCACATGGTCGCTAGGGTAGATAAT TAGTATGTAGTTTAGCTTAAAAAAATGACATTCAAGGACAATTACAAATA TTAAAAATATTTCATTTGCATTTAGGCTCGATGAAGTGTCATTTTCTATA AGATATTACACTATTTTATACATTTTTGTAAGACTGAAAAAAGCTTGAAA AAATCTGAGRTAGCCACATGCTTAATATATATTCCCCATTAAATATTAAT TTCTAATCAATAAAATACACATTGAATGTTGACAATGTAAACCGAGAATA GTCGTTAAAGATCGAAACGAATCGATAAATTGTTGGAGGAAAATAGTGAG ATAAAATCAAGTAGCTTGCTAAATGCTGTCCTACCCTAATGATATGTCCT AAGAATTAGAATATTGTAGGCCCTGATTACTTTACTCATAGTAAAACATA CAAATTTTCAGCTCATCAGTGAGCCCATGCACTTTAGCCCAGATTAATCC TTGAATAAAAACGACCATGACCATTATTCATTCATTTCTAGTCAATGAAA TACTTTCATTACATACATTTTTTTTGTATGTAATATATAATTGTTCACAC TTGGTCCGAGATCGAATATTTTTTTAGTAAATAACTGTGATCATCCAGTC ATTTGTCACAAAACAAAACAAAATTACAACTTGTTTATACAAGTAGGAAC TTGTGCACAACATCTACATKCTCCTCTGTCTCCTTAGCCATTAAAAGAAA CTCATCATAAACATTGATCGACTTAGAAAATCACTTAGTAGTAGGGTTGT GTCGTGCTTTATTTAGGACTGGAGTCCGGTCCAGTTCCGTCCATGATAAC GTCATTCAAATGCATTTATACTGGCAGTCCTAAGGACCTACGGTCTCAAG GACCGGTCCTAAGACTGAACTGAATAAATAAAGACAGACACAACTCCAGT TATTAGAGTGAAGAGCGCCAATAAGCTCAAAACATCTATTTGATGAGGCT ATATAATACAAATCACATAGTAAGAAGCCTACTCAATAAATAAGCATGAA GTTAAGTTACGGTTGTTATTGTTTTTTTTTTTTTCGAATTTGACATTTGG ATCTACACTTGGAATAATTTGTATTGTGTTCAAACCGAGTCGATGCAACA CTAGTATTTAATTAATAAATAAAGGTTTGCACTTGAAACTATCATAGGTA GGGGGGGGGGGGGGGAAGAAAAGGAAAAGAAGAGAGTTAGCCTAATTTTT AGCCTTGAAGAATTTTTTTTTTCCCCAAAAATGCGTCATATGTACGTGTG TGTGTGAAGATTTGTCTTAATTCAAAGAGTAATAAAAATTCCATTCCTTT TTTGAACTTTTGACCCATTGAAGAATCTTTGTTGTTAAATAATCGTTGTT GGTAAATTTGAGGGAAAACTGATTTTTTTTTTGTAATGGGAGAGAGAAGA CGTGCAAGATGGGGGGGGGGGGGGGTTATGAAAATAAATAACAAGGAATG CTGCGCACCTTTAATAAGAAGAATAAATAAAAATATTTTTGGCTGATATT CAAATTTATTTGAAATTCCGATGCAGATTATCGGACACCTACAATACTAT TTGTATTTAATGCAAAGAAAAGGGGTGTTATTTGTTGCCATTTGGGGAAC AAAATACTTGTACATAGTTGGTAATAAACTGCCTTTCTATATATTAGTAA GACATGAAGCTACACTATAGGGGTTCACCCAGAAATAATCTTGGATCAAG AAGAAAATGAGAAAATATGTCTCAATATATCCTTTTGAATTGGTATATAT ATATTTTTGTCTGCAAGTTGTGATTTTGTAATTTGTACAAGTGAATTCGC TTAAAATAATGGACTTTTAAATTTGCCACTAAAAATGATGTAGCATTGTG ATTGGCTCTTAGCAGCCAATCAGTGAATACATTAACATCTAGAAAATATT TATAAAACAGTAATCAAACATTTCATCCTGAAGTGGTTGTAGTTGTTGGA TCGGATGAGTTCATATAAGTATGTTCACATTAGTGAGATCTCGTATTCCT TGAACCTCGTGAGACGTTGGATACAGTCACCTACGGGCAATTCCACGCAA ATGTAAAATTTTAACGCTGGGTATTTTGTCACTTCTCTCAAAATCCATAG GTTCAAAATACTTTATATTGCAGGTTCTTAATCCCTATAACTGTAACTAA AATATGCATATACACTTTTTGTAATTGAAATCAATGTCCTGTCAATGTTA AGCTATGTTTCCAAATTTCTCTCCGAAGGCAACTTCCATAACGCTGCCAT TACAACTAAATTAGTAATTTGATAAATGAGGTCTTCTCGTTGGCCAAGAG GACTWTTGGCCAGCCGTCACACCTCCTGATTTTTGACTATTTTAATGCAA ATTACTCGAATATATTATGTGCCACATTATAAATTTCAAATGCCCAGAGT TATATTACTCATAAATACATAATAACAGGGGCGTTTGTTATTTCTGATAG GAGGAGGGCTTGGTTTTTGGAATTTTTTTTTTTCAAAAAAATTCCAAAAT TGAATTCCCCATATTATTTTTTAAAATAATTATATCTTGCTTTAATGTTG ACGGCTAGGAAAAATTAAAGAAATTCTTAGTTCTTTCTCCTTCTTTTCTT TCGCATAATTCAAATTCCTAAATGGCCTCCATCATTTTATATGCGCGGCA TACCAAGTATATAATTTTTATTGTTATTAAGAGTCATAACCATAGTAGAA ACCGGTTCCTTCATTTTTTGTATGTATGTATGTAGTGATATTTGCAATAC GCTCATTATTTGCAAAATATCTCCTCTCCTTGGTTGTTTTATATTTATTA TTATGTAATAGGCAGCATTGTGCTGCTGAGCGGCTTAAAGTTACACTCTA GAGGAGGAGAGGATCAAGGTCATCCGCATTCCATACTCCATTATGTTCGC GTTCCTCGTTTCTTCTTCTTTAAATTTAATATTCTATCGCTATCTATATA GTATCTATGGAAATATTTCGGTTCATAATGTGTCAACGGTTTTTATTAGT GATGGAACAATTTCAAACAATTTCCCCATCCCGATCCTACACTGCGCAGA CACTTAATTGTCCAAAAATACTCATACTATCCTGGGATTGAAGGTCTGTT CCCTATGTTTTTGTATTTTTTTGAAAAATTCTAAAAACCAAAACCAAAAA AAATCAAAAATCCACATTTCAAATAAAATTATATTGTATTTTACCCACTC ACCACAATTAAGGAATTTTTGTTTTTACTAGAACATTTCATATTCGAATA TTTTTTATAATAAAAAAATTTAATATTGCATTTCTTTTTTCAAATTAATT TTAAAAAAAAGATAAATAAATATATACTTATAATCCTGCGGACGCCCCTG ATGCTGCAANNNNNNNAAGCTAGTCCAATTTTGAACCATGAAATGTCCAA TTATTTGCCGCAAATGCAATGATTAAGTGTTAATTAAATGAACTAATAAT TGATTTATGTCATTATGAGGATGCCTTAAAAGTTGACTCAAACCGCTTTT AGAACTGCTGTAGCAAAAATATTGACATCCACTCAATAAATAAATTAGAA AGAAAAAATATGTTTCATTAAAGGAATAGAAGGACTCAATCAATGATTGA TATTCAATAGATAATGTGAATGTATTGATTGCTTGGATCCAATGTGTTAG AGCTCCTATATATCTGGTCAAGTGCTGAGTGACATTTCTCTATCACGAGG TCGTCTCGGACTCTATAATTATCAAGATTTGTTTTTGATTGGAGTAGTCT AGCTGATAATTACTTTGTATTGCAGCATTAATCATCATCAAAAACAGATT ATTTTTATCGGAAGATCGTCAGTTCGGAAAGTGACCGACATTATTTATAA CTAATGATAGTATGATTAATCGGAATTTGAGAATCTGGTGTTTTTTCTGG GATCGGGAAAATAATGTTTAATTGCGATTCAGATTCTTGTTTATTACTGG 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TACAACTTATTTTCCTGATGCCAATTAATCGTTCTGTGACTAGTTATATA TATATATATCGTGTGGATGTTAGGAGTTTGTACAAATTGTACCTACAAAA AGGAGAAAAAGAGTTTAGAGCCTACTTGTGATAAAGATAACCCAATTGAA TATTCCATCGACATATTAATGTAATTGCTACTCTTTTTTGTTATGACTAA TTACTANATATATATATCGTGTGGATGTTAGGAGTTTGTACAAATTGTAC CTCAAAAAGGAGAAAAAGAGTTTAGAGCCTACTTGTGATAAAGATAACCC AATTGAATATTCCATCGACATATTAATGTAATTGCTACTCTTTTTTGTTA TGACAATTACTAATTGATATGTACGGGGCCAACCGTTATTATTTACTTAT TTCTATTATGCAAATTTTGAAAGGTTAAGAGTAATTTTTTTTACAATTTT CCAATGTTGTAGAACACATAATTAGCTGTCGTTTGCTAAGAAAAACATTG TCCTAGTAACCACCAAGAGCACAGAGTACGAGAAGAGGATTGAGATAGCA TCACTCCTCCGCGTGAAATTATCCTAAAAGACCATTGGGGAGCAGGCTGC TGGGCCCTCGAGGATTGCTGTCCTAATCCTTTTCTCGCACTGTGTGCTCA TGGTGGTTACTAGGACAAAGTTTATCTTTGCAATCGACAACATTACTAGT AGGAAAATTGTAAAAAATGACTCATACCTCTCAAAATTTGTGGTATATTA TGAGGTTCCACAGTTATATTACTCGTATAAATGTCGTGTACAAGTTGCAA CTCAAAAATGAGATTAATAATTTACTCTCAACAATAGAATATTCTTTAAA GGTTGATATATTAATTAATTATTAATAGTGTAATTTTTGACTGTTTATTA AATGTAGAAATTGCTCATTTATAAGTATTTTCTGTGGCACATTATAAAGT TCAAATGTCCATAGCTACATTTATTATTTGTAAAATGGATTAAAATGAAA TGACAATAAATATCATCAATTAGTAGCAGTTATTTATTAAAATCATTGAT GTTTTAGCTAAATATGATGTTATGACACATCACAACTTATACAGTCAAAT CCGAATATTTAGGGGGGGGGGGGGGTTCTAGAAATGAATTGATGACAATA ATCGAATTTATCTATGAGTGCAGAATCCATAACTCATCTCAGTTTTTCTC GTTCCTTGTCATTTTTAGCCTTAAACAATTTCCAAATTTAAAGTAGGATT AATAAAATATATATGTGAAATTGTTTCTTAAGATTAAAAAGGGTTTTTAT TGATTCTGTACCTTGTTCCGAACCAGATATATTTCTATTTTTAGACTGAA AAACAATTCTCTTCTTTAGATCCATATAACTTATTCATAATACATAGTGA TGACGAATATCATAGCTTATATTGTAGAAAAATATTCAATGTATAATTTA AAAATATGCAATTCCAAGGATTTTTGTTCTATTTTATGTTTTTAAATGAT CCCATTTTAAAATATTATAATTCCCTACTCATTGTGAATGGATCACTTTA TTGTTTCGATCTTGGTATCTCACTCCCAATGAAGGAGTCCAATCTACTCC CTTATGAGGGTTGAATAAAATATTTCGCATAAAAGAAAATACGAAGTAAA AATCCGCATAAAGTCAACTTTTTCTTGCCTTAAAAGTTCCATCACTCTTA ATATATAACAATGTAATTTATAATATATCAAAATGAAATGATAGCCTTAA TTAATAGTTATTTATTAGAATAACCAATGTTGTAATTAAATAAGATATTT TAAAACAAAGAAAATGGAACTTGTAGATAGCACTTTGTATTTTAAAAAAT GAAGTATGGATATGCTGAAAGTAACTAGATTTTTATATCGTCCATGACTT 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GGATACTTTAAGTAGTGCAGTTTGCGGCACATTCTAAGAGCTAATAAGAA TAATTTCTTTATTGAAACTGACAATCATTCGTCGAAGAATACAAATTTAA TCATCATTCAATTTTCAAAAAATCATTTTAGCTTGATTTTGGATTGAGTG GGCCACATATGTTTGAATGAAAACATGAATATGTTTTGCAAGATATGTAC AATGATTTTAATGTAACTCTTATATCCCTTATGTGGCGTAATAAACCATC GACATATTTAAGAAAAATTCAAGGACCGATAGTTCTTGTCCTCAGACTGG AATGAACCTAATAAATCAGGACTACTCATAAGCATAAAAACGTGACTTTT TAATAAATTTTTCAGTTAGTATGTTTTGTCTGAAAATAGTATATATATAT ATACTGGGTGGGTATTTTATATCCGGTACAAGTTTAGATCTTGTTATCTT GGCAACCCTAAGATCTATGTTTAAGAAAGTGTGCTGGTAAAAACTGTAAG AAGAAATACAAAATACTTGAGATATCCACCGAATACGAACGCCGTCCGGA TATTACTTTATTTCTCCATCCGGGGCGCAGACCCAGGGACACACATCATC TCCATAGACACTAATACTAGAAAGCTTAAATTGATGTTAACAGATCCGGA GTCGTGCTAGAATTTTAAATTGGTACTGTTTATCTAAATTGGGTAATTGG ACGGAGGAAAACCCAATATTTGTAAGACTTTTGGACAAAGAAAATATTTG GTCTCCTAGCTACCCGGATCTGAACCTCTTGGACTACTATTTGGGGGCGT CTTGGATAGAGAGAGTCCAGTAAAATTGAATATAATATTGTTGATTCCTT GTGTCTTCCATTGTCAAGGTAGATGTCAACATGAACAAGGCGTTCTTCAT CAAGGCCTGTGGTTGAAGCTGGAGATGGTTTGTTTGAGTTATGTACTTCA 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