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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s436 | supercontig | LSalAtl2s436:235719..254938 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000007549 >EMLSAP00000007549 ID=EMLSAP00000007549|Name=EMLSAP00000007549|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=996bp
MANNSGLDDIDLASLKDPAGIFDLMEIVGNGTYGQVYKGRHTMTGQLAAI KVMDVTEDEEEEIKLEINVLKKYSHHRNIATYYGAFIKKCPAGKDDQLWL VMEYCGAGSVTDLVKSTKGQSLKEDWIAYISREVLRGLTHLHACKVIHRD IKGQNVLLTDNAEVKLVDFGVSAQLDRTIGRRNTFIGTPYWMAPEVIACD ENPEATYDNRSDLWSLGITALEXAEAQPPLCDMHPMRALFLIPRNPPPRL KSKRWSSKFKNFIETVLVKDYHQRPYTDQLLKHPFVRDQPTERQVRIHIK DMLDRMKKHKEEKQREEMNQFQFSGSDDELPEAPLAGEPSSILQAPGENQ LRKNFQAIQEHNKSAAQKQAALAAAQQQQQQRAQKEHRNSRKEEPPPVEP GPPSXPPLPHRLDGSNSSTPPGPPPQRPLPPPPGQQSNNDQLRRTESSKP ATPPSRDQRNSRILPQPQQQXPPQQQQRKPEDLDVLAAQLNELAASPRNL LRIRQRQPSGGDKNSSNGNGLXAVPPPLVEDDDSSDDDDQPVQRDGTLQV NDPVPKPLRELQRKAPGRPLPPTPDDENCQNRDINAQVMPDLLPQQSSNL SGPSTPVSRMSEDQRQGISPHGGMHEKQKSFLSFGFSAEAAANNGNGGVR RESSQVPNVNVAPSSHDLVADTPEIRKYKKRFNSEILCAALWGVNLLIGT DTGLMLLDRSGQGKVYQLISRRRFLQMEVLEGQNILVTVSGKKNRVRVYY LSWLKSKILRTDNAIERRAGWINVGDLQGAVHFKIVKYERIKFLVIALRD SIEIYAWAPKPYHKFMAFKSFSELQHRPLLVDLTIEEGTRLKVVYGSTSG FHAVDLDSASVYDIYIPKHAQGPITPHTIVTLPNSNGMQLLLCYDNEGVY VNTYGKVAKNIVLQWGELPTSVAYIGTGQIMGWGNKAIEIRSVESGHLDG VFMHKKAQKLKFLCERNDKVFFSSAKGGSSCQIYFMTLNKPGMSNW back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s436:235719..254938- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000007549-703396 ID=EMLSAT00000007549-703396|Name=EMLSAT00000007549|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=19220bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s436:235719..254938- (Lepeophtheirus salmonis) ATGGCCAATAATTCAGGACTAGATGATATTGATTTGGCCTCACTCAAGGA
TCCTGCCGGGATTTTCGATTTAATGGAAATTGTGGGGAATGGGACCTATG
GACAAGTTTATAAAGGACGGCACACCATGACTGGTCAGCATGTTTTTTAT
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ATTGTTGTCATCTTAATTTTCCATCTTACTGTATCAATAATTATCCTTCT
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GTTGATCTTTATAATCTATAAATAAATCCAAACTATAGTAGACTTTTGTA
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GCAGAAGTATGGTAAATAAAATAAAAATATTTTTTTGTGAAATACATTCT
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GCTCCAACCTGAGAGGCGGTGTGTATTTTGGGATATTAGGAGAGTTCCTA
GATGCTCAGGTAAGGGGTGGCTGATAAATTTAACTTACCTCGGTCCTTGC
AGTTTATCTGGACAACCCTTGGACTGGGGTGTATTATAGTATATTAGAAG
AGTTCCTTTGTGCCTAGAATTGCGTCGGCGGTGGYGTTAAAAATATATTT
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CGGCAAGCGCCCCCCCCCCCCCATGTCCATTTATTAACTAGACTGTAATT
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TAAAAATGTCAGGCGCGCCATTTTTTAGTTTTTCTTATAAATATAGCAAC
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TACTATGTCCAGCAAAAAAAAGTGGTTTGATGAATACACAAAATATGGCT
TCACGTGTATAAAGGAAAGTGATGGGATTCAGTGTCCTCANAGCTATGTA
GAAAATTCTTCACTTCGGTCTTAATGGATAATCTTTCAATCCCTTCTTAC
TATGTCCAGCAAAAAAAAGTGGTTTGATGAATACACAAAATATGGCTTYA
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CTTCCTAAAGCTCCATGGAGATGGGAAATGAAAGAACACACCACTTGCTA
AATTCAAGGTGAAGAGACCTAAATTTGATGGAAAGGCTACTCTGCCTGTT
CTCCGCTTTATACCCATCGACGAACCAATCCTCACAGCATCGTACGAAGT
TGCCTAACTCATCGAAAGCAGAGCAAATCACACACAATTGGTGAAACACA
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GAATAAACGACATAAACAATAACATATTGGCTCAAGTAGTTGCAGATCTT
ATTCAAGCCCTGTAAAATTCAGCCTCCAACTCGATGAGACCACTGACATT
TCTAAACGAAGTTAGCTTGTCGTATTTTCGCGCTATATGAAAGATAACGT
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ACTACGTGGAAAATAGTCTATGAAGCACAGTATCTTCAAAGAGCTGTCTA
AGGAAATGTACCTMGGAATTCGAAGTACTTCTGTAGAGCTGAAGCAAGTA
ATTGCCATGCACTAAGAARATCTTACAAAGCCTCTTTAGGGATATTTCCC
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CAGCAGAGCCAGCTTCAACGGCAACTCTTCAGAACAACAACACTTTCAAC
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TGGATATACTCATACCGTTTGTAACTAGAGTTTTTTTTTTTTGAAAAATC
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TCTTTCTATTTTCAATAAACATACAATGATCATTTTTTAAAGATTGATTC
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GTGTGTAGGCGCTTGAAACTGGAACCTGATCTAAATTCTTGCATTCCAGG
ACGATGATGTTCTTCAAGGACTTCTTGATGGTGTGAATACCTCTGTTATC
CTTTGACTCTAGGTAGGTCCTGAAATAAATGATCAATCGGATTCAGGTCG
GGGGAGCTAGGAAGCTAAGTATCCAGGGACACCCAATCGTAGAAGTGCTC
CTGGGGCTAATAATGAGTCGTTTTGGAGGTGTAGCACAATAGCGCACCTG
CGTTCTGCTTCTGAAAATTTAATTGGCTTGCATTCCGGTTGTTGACTCCA
TGGTAGTGTTTTGGCGTCTAAATGAAAGGTTTTATATGTATATTTCTCCA
CAAAAAAACAACAACAACAAACATTGAACAATCATCATATATGTATGCCG
GAAAAATTTGGAAATCTCAAGTGCCTAATTTCATTGCTACACCCCGTACA
TAAACTCAAAAATGAGAAAAAAATGTTATCCTTTTAAAATTTCATTGTGG
CTGYAATTTTGAAACAGATAACCCCTCTAGTGATTTTTATTTTAAAAATC
TATCAGCATATTGATTTATTATACAGGGCGCGTGGACAAAATCTGCCGCA
TATTAAGGACRACATTACTCCATCAGCTGATGTCTGATCTGTCTGTTTTT
GGTGTTAAAAAATTTCCCGGGTCATAGACTTCAGTTATTGTTTACCACTT
GTAGCGATAGTATCATCTTAAGTGCCCAAGAAAAGTCATTATGTTCAATG
AAACAGATCGTAGGTGCGCTGCCATTCAGATTATACTTAGTGATCACATG
AAATTAAGCAATGCTGACATCTCTGGCCTTCTGTCAATGCCAGTTAGAAC
GGTCAGAAGTCTCAGGAAGCAGCTGGAGGAGTCATCGGATCCGATGGACG
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GTCACCTTCATCAACAAGGTCAGGGATATCACCTTCATCAACAAGGTCAG
TGACATCATCGACGAGGACCCCCAGCGTTCCATGAGAGCCATGGCGAGGG
ACCTGGGAATGACCGAGTGGACCGTGAGGGCTTGTGTGAAGAAGGACTTA
AGGTGCAAGTCCTACAGGCGTCAGACAGCCCAACTTCTGACAGAAAATAC
TCGAGGGTTGAGGCTGCTCAAAAGCTTCAGGCTGCTGAACATCTTGAAGA
ACCTAAAGTTGCCGAACATGCTCTGGTTCTTCTCTGATGAGAAGAATTTT
GTTCAGGATCAAATCCACAACTCCCAGAACCATCGCTGTATTGCCGTGAA
CAACGGAGACGTCCCCAAGAACATGTTTCTGGCCACTGTCATGTTCTTTG
GGGTCGTGTCAAGTGAGGGTCATGTCATGCCTCCCTCATCTTCGAGACAG
ACCTCAGGGTGAACACTCGGCTCCGCCCCACAAAGCTAAGCCGACGCAAG
AATGGCTGAAAAACAATRCTTTAGCGTTCGTACCCTTCTCCTCTTGGCCT
CCCTCATCACCAAATTTGAACCCGTTGGACTACTTATCCTGGTCTACGTG
GAGAACATGACCAACCGCTCCTCCTATAACACCAAGCAGTCTCTCATCAC
CTGCATCAAGGAGAAATTCAGTGAGATAGAAGCAGCGCAGGTCCAAAATG
CCTGTTCTCGGTTTCGTAGCCGCATTGAGCGGGTTTTTGCCSCAGACGGC
GGCTACATTGAATAGATAGATTTTCTATATCCTAATAAAGATATTCGTTT
TTATTTTATCAATAAATATTATATAATAAGCTTGTAGTTTTTGTTTTTGT
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TATTTATTAAATATTACTTAACTACTTWAAGTAGGTAAAGRATTACATTT
TAGTGAATGTAACTAACACGTTTGGCAAAAATGATCGGACCTTAAGAGGG
CATACTTTTTGTACATATTTGGGATTACTATAAGTCGTCCAAATTATAGT
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