EMLSAT00000007552, EMLSAT00000007552-703399 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000007552
Unique NameEMLSAT00000007552-703399
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s436supercontigLSalAtl2s436:271825..290086 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000007552 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000007552EMLSAG00000007552-690318Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000033211EMLSAE00000033211-742139Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000033212EMLSAE00000033212-742140Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000033213EMLSAE00000033213-742141Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000033214EMLSAE00000033214-742142Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000033215EMLSAE00000033215-742143Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000033216EMLSAE00000033216-742144Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000033217EMLSAE00000033217-742145Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000033218EMLSAE00000033218-742146Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000033219EMLSAE00000033219-742147Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000033220EMLSAE00000033220-742148Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000033221EMLSAE00000033221-742149Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000033222EMLSAE00000033222-742150Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000033223EMLSAE00000033223-742151Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto775636auto775636Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000007552EMLSAP00000007552Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000007552

>EMLSAP00000007552 ID=EMLSAP00000007552|Name=EMLSAP00000007552|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=601bp
MHNVAVKSNLRNFSLRNTLTVNMLYNRAAIFLCLEATILATGRIIPLLQI
NNPACIAENLRVTERYICDLNGNVICIGGWXDPTKFCSVPTCELNGRDCI
NGNCVLPNVCVCDVGWDGPNCEVCIPLGGCKHGRCNRPMECNCIPGWTGG
QCNKPECDGCVNGRCYEPKKCIECEECVSYPGCNGTCVNNVPWTCSDSDT
PVPGNPVYEWTTWNQWSTCSKSCGDTGIQRRERLCIPYSQGLXSHCNGEK
FQTKNKSCGTGYKIRQRTCSNPITKYEGTLCNGSSSEKSVCLSSHCPMED
GPHGNPGDYAVCLVERVQXLGLDHVILQHQPMEMDNGQHGVLGLNVHQVV
EGVSKPNKGNVMTQLQNLEDKVEDTRIEKELVPLLDSEGNHAMDAQSRKD
NAITFYVPLMENGLFGENGLLVQKRVKVEKEVGVEYVQWIIMEANHALDL
RLKICITNRCAGQKLQRSSCNEASCSVHGNWGKWTQWTYCTVSCGRGRKS
RSRLCNNPSLQNGGNHCQGRALDSTFCSNGLCSIADYGFSEWTQWSKCSV
DCIGDRGNNVRNRFCSTSKLQFGGRNCKGSRKEKRLCTGIFPKQIRFSLN
F
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mRNA from alignment at LSalAtl2s436:271825..290086-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000007552-703399 ID=EMLSAT00000007552-703399|Name=EMLSAT00000007552|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=18262bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s436:271825..290086- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGCACAATGTAGCTGTTAAAAGTAATTTAAGAAACTTTAGTTTACGTAA TACATTGACGGTGAATATGCTATATAACCGTGCAGCAATATTTTTGTGTT TAGAAGCAACCATTTTAGCAACTGGTCGAATCATTCCTTTACTTCAAATT AATAATCCTGCTTGTATTGCTGAAAATCTTAGAGTGAGAGTATATAAAAT ATTACTTTCGAAAAAAAAGATCCATACAACAAATTCTTTTATAGGTAACA GAGCGTTACATCTGTGATCTCAACGGTAACGTTATTTGCATTGGTGGATG GKCTGATCCAACAAAGTTTTGTAGTGTTCCCACTTGTGAATTAAATGGAA GGGATTGCATTAATGGTAATTGCGTCCTTCCCAATGTTTGCGTATGTGAC GTCGGATGGGATGGACCTAATTGTGAAGTTTGCATTCCTCTTGGAGGGTG CAAACATGGTCGTTGTAATCGGCCCATGGAATGTAATTGTATTCCAGGAT GGACTGGAGGCCAATGTAATAAACCTGAGTGTGATGGTTGTGTAAATGGC CGTTGCTATGAACCAAAGAAATGCATGTAAGAAATCTCATTCCTAAGCAT AGATTATTAAAAAAATGAAGGAATTTTCAGACCCTATGAAGTTCCGCCCT TGATCCCCCTTCAATAACTTAAAAAGTACTTTTATATTCTTTTTTAAAAG AATATATCAAATAACTATAAAATCCACTCGGTGGAATGTAAACCTACGCC TATGGTGATTTTTCCTAGACTTTTTCCTTCTAATTGGGGGAAAAAATTGG ATTTTTTGTTATATAAAGCATCTTTGTCAGACATACATAAGGACACCAAA GTTATAGTAGATTATGCATTTTTAATAAACATGTTGTGAAGCCTTGAATT CTCATAATTATTGACCTCTTTCTGTGACCATATATAATATTTGTACCAAG TTTGATCTAAATCAATCTGCAACTTCTGCTGTAATCCTGGTAACTAACAA ACAAACGAGGCAAAAACATAACTTCCGTTCAACTTCGTTACAGAAGAAAT TATTTGACTTTTGAGCAATTGATCCACAAAACTATTGTTAAATTCGAGAA TTTTCCGAACTAGTCATAGTTTTTAATATAGATAATTAAAATTAACTTGA ACTCAAGATTTGCAAAGAGAACTTAAAGAATTGATTCTTAGAAAGTTTTA TCTTCTCAATTGGAGGATCGTTCTGCAGTAACTAAGAACAGYAATTAAAA ATCGGTTTCCTCATTATCACAATTTTAAAACTTTTGCGGAATCACCAATA AGTTAATAATCCTTAATAAGCTAATTATTAACAATTATCAGATATGTTGC CAAACAATGAAAAAAACCATTTTGGGGTATAAAAATACCGAAGTTTGGTT TATTCAACAATGGGGAACGTCACCTATTTGATGGGATTTTTAAAACAATT TCAAACAAAACTTTAAATTTTTACTACCATTATGAAATAAAAATAAGACT TTTTGGGATAATAAGGCTTGTTTTATTACTTTATGAAAAGGGGAAATTAT GTTGCTGCAGCCAAGCTTAATAGGAATTCAAGTTTAGACCATCATTCAAT CGGGCTTGCTAGAATTTTCAGTCTGATGTACTGTACCGACTGCTGGGCAG GACAGGCAGATTTAACATAACACGCAACCACTCATAATCTATGACAGGGG TAGGTAACCTTTGAGACATGGAGTGCCAACTACAACATTTCTAATGAATG AGTGTGCCTCTATCTACAATTGTGGTAAAAATACACACAAACTACGGGAA TATGTTCTAATTTGTACGTGCCAGTGAACATGCCTCCGCATGCCAGCAGT GGCATGCGTATCATAAGCTGCCGACCCCYGGTCTMTGACGKCAATATTAA AAGTGTGGKGGAAGKCAAACACCAGTCGTACACGCGTAATGGTATAACCT TGCATTTCTATTAACCTTGGCTGCAGGCAGTCTGTAGTATTAATTAATGA AATTTATATATAGTATCACTCAAAAGGACAGTCATAAACTATTCCAGACT CTTTTTTCTTATAACGATGGATGTATTAAAAAGGAGACATTACCTTACAT ATTATGTGGAAATTCTCGAAAACTCAAATTCGACTGAACTCTAAAATTTT AACTCGAATACAACCTAAAAACAGTTTGAAAATAATTATATATTTTTCGT ATATGCATTTTKAGTTGCGACTTTGGATGGACAGGAACTCAGTGCAGCGA GTGCAAAACTCTACGTAATTGTAAAAATGGTAGATGTGTAACCCATCCTT TTCAATNNNNAATGCTATGATGGATGGCAAGGAATAGACTGCTCCAAASC CATTTGTCGTGTCCCCTGTCATCCCGTGAATGGATATTGTGATCAACCGG GAGYGMGTATTTGCCYCAATGGATGGAGTGGAAGAGAATGTGAAGAGTGT GTTTCATATCCTGGATGCAATGGGACCTGTGTTAATAATGTTCCATGGAC ATGTTCAGATAGTGATACTCCTGTGCCTGGAAATCCTGTTTATGAATGGA CTACTTGGAATCAATGGTCAACTTGTAGTAAATCATGTGGCGATACTGGT ATTCAAAGGAGGGAGAGGTTATGTATTCCATATTCACAAGGGTTAARTAG CCACTGCAATGGAGAAAAATTTCAGACCAAAAAGTGTTTTATGAAAAATT GTCGAATGGGTGAGGAAATTTTAATGATGTTTCTAACATGCTTAGACAGG TTTTTGATTGTGGGCTCCTCCCTGCATATATTCTCTTTAAAATTTAATTA TACGTTGAGAAGACATGATTTAAGAAAGGGCATACAAATATTAAAAAGGA CTGACCTTTTTTTAAAAAATACATACGATATTATTTATAAAAGTCATTCG ATTAAATATGCATACTAACTTTTTAAAAAAGACCAATTTAAAAGTTTGAT ATTTTGGTAATAAAAAAAGGGCCTGCACCTTTATCTTTGTCCCAGGCCTC ACTCACATTTAATCTGGCCCTCAACAGACTATTATTAAATTTATTCCCTC CTGGAATTTTACAAGATGGAAATTGGGAAATATGGACTTCATGGTCTCCT TGTAGTAAATCCTGTGGAACTGGATATAAAATAAGACAACGGACTTGCTC AAATCCAATCACCAAATATGAAGGAACCCTTTGCAATGGATCTTCATCCG AAAAATCTGTATGCTTATCTTCACATTGCCCAGTAGGTAAGCAAATTATG TTGGGTACTAATTTGTTATATGAGGAAATATTATTGAATTTTTACATTAG ATGGAAGATGGTCCCCATGGAAATCCTGGGGACTATGCAGTGTGTCTTGT GGAGAGGGTACAAYATCTAGGTCTAGATCATGTGATTCTCCAACACCAAC CCATGGAGGTAAAACGTGCTTGGGGAAAAGTGGTCAAAGGAGTTCCTGTA ATCAAAGAGAATGCACAATTTGTAGGCTTATAATATACTTATAACTATAT GTGGTGCGCCAACATAAAAACAATCATGAACAGAAATTAAAAAACAACAG AAAATCCAAGTTAATTTTTTTACATCATATAAACATCCAGCCCAATATTT CATAGACATTTATCGGTCAATTTTAGACTTTGTGTTCAAATTTGTGGGAT AAGTTAAAGTATCCAAAAATTTTAGCTTTAGTTTAGAACCTATATTTGCC CGGCGTCTCCCGGGATATTAAGAAATCAAAATTAATTCTGAATTCTTCTG CTTCATATATAACACAAAATAAAGACCCTTAAATTTTAAGAATGATTCTC ATTGCATGTTGATCACTTGCACACTTTTTTCTAAAGGAGATTATAAGGTT TAAAGAATAAAAATATTCAAGTCTTCTTCCATATTATTCTACAAAAATCC TTTGTCTTATTCTCTCTTTTTTTCTCTCAAGCTTATAATCTTTTTTTTTT TTAAAGTTTGCAAATATACTTATGCAGCAAGAAAAATTCTTATAATTTTA AGGGCAAAAAAATGTTACCAGAACCATTTCTTAAGTCTTAAGAGCCTACA TGAAAAATTTCAGCAAAATCCATTCATTAGTCTGGGCGAGATTGACAGAT AAACACACCCACACACTGACATTGTATTTAATACATAGATGATTTAATTT GGCCTCGATATGATTTTTAATAAAATCTATCAATTTATCATTTTTTAAAT TGTGATCTTCAATTTTTGCTACTTTCAGTACAATTTTCAGCGACTCTAGA GAATTAATGATAATAATTTGTTAATATAAATTGACGATAATTATTTGTCG AAGAATACAAATCTACTAAAGACTCAAATTTTAGAAATATCATTCTAGCT CGTTTTTGTGTTAACAAACCACATATATAAATAATCAGTTTTTGAATTTA TTGTGTTTCTGACATTTAAAAAAGATGCACAATGGTCTAATTGGAGTAAT TGGACTCAATGTAGTAAAACTTGTGGACAAGGTCAACAACACAGAATAAG AGAATGTTCAAAGTGTCTTTTTGGAGGCTGGACCAATATTAGTAATCCAA CTATAGAGCAGGAGAGTATTCCTTGTTGGGAACAACTCGAATGTGTCATG GTAAAAAAAAAAAAGAATTCGCTTATAAATGTAAAAAGTAAAAAACTACT GCATAGATGGACAATGGTCAACATGGAGTTCTTGGTCTCAATGTACAYCA AGTTGTGGAAGGGGTTTCAAAACCCAACAAAGGCAATGTAATGACCCAAC TCCAAAATTTGGAGGACAAAGGTGTTATGGCAGMTCAATTAATAGAGTAA AAWGCAACAGTAATGTGGATTGCACAATTGGTATTTGAATAATCATGTTT TACTATCAATCTATGTATAGTCAAACCTGTTTCAGTGGTCAGACAGAGGA AACTGAAAAACTGATCTCTGAGTGCAGGTTACCTCTTAAACCAGGTTTCA TATTAAGTAGCAATTCTAAATTTGAAAACCAGATATAGTTACTTTGTGCA GTGACACACTTGAAACAGGTGTTTGGTATACCAGGTTTGACTGTTTATAA TATATCGATTTATTCCTCCTATTTGGCCCAATTGTAGATGGAAAATGGAA TACTTGGAATCCATGGTCGACTTGTTCTACCATATGTAGTGGAGGATACC AGAATAGAGAAAGAGCTTGTTCCCCTCCTCGATTCGGAGGGAAACCATGC AATGGACGCTCAGTCCAGAAAAGACAATGCAATAACATTTTATGTTCCGT TGGTAATATACCAATTAAATAGCAATTAAATTTAAGAACTATTTTAAAGG GACTTTAGATGGAAAATGGTCTCTTTGGAGAAAATGGTCTTCTTGTTCAA AAACGTGTAAAGGTGGAAAAAGAAGTAGGCGTAGAGTATGTTCAATGGAT AATAATGGAGGCAAATCATGCTCTGGATCTAAGATTGAAGTAAGTTTTTG CAACAAAGGAAAAAAATGCCATGTTTGTAAGTACAATATCGAAAGATGTG GAAAATGTCGATATTCCAGTGAGCATAAAAACTGCAAAACCTAAAAGAAT TTCATTAAAAGTATGGTAAGGCAGAAAAATAACACATCAGCTGCAGACTT GTACCAATTCGCACTTTTCTGATCAATTTCCGTTCAGTCGCTCATTCAGT AATTTATTTCCGTTCATTAACTCAAATTAAACAAAACGAAGCCCAACTTT TCACTTTTCATCCAAATTTAATTGGCCAAAAATACAACTTTTGTCTCAGC AAATGTCACTTTTGAGGTACCATAGATTACGTAAATTTATCATTTTTCCA TTTGATATATTTATTTTTTCTTGACACAAGATTACCTCGCTAAAGCAAAA ATCAAAACTATATTTTTTTTTGTCATTTGTCGATTTTCTACTTCTTTTCC CCTAATCAGTATTTTGAATATTGATTGGTTGAATTATAACACCATGCAAT AGGATTTTCACCTGCAGGCTCAAACTCACATTTATTATTGCTATTTAAGC CGTAGAACACGATTTGTTTCAATTTTTTCAAGGAATATTATTGTACTCTA TATTTACGCAACCTAACTAGCTTATTTGATTAAATTTCTTAATAAATATC AAAAACTAAATTGAGAAAAAAATCAATCAAAATCGACCATTTTTCAAGGT ATTTAAAAAAAATGGAAATATAAATATATTGCTCGAAAGTTAGAATTGGA CTCGGAGTAGATTTTAGGATCGACATCGGAGTAATTCTCGTTTACACTCG TTAGGATTTCCACCTTCTTCACATCGATATCACAAAAAGATATAGATAGA ATAATCATTTATTTGTAGTTGGCTATTGGTCGCGATGGACTCGGTGGAGT AAATGTAGTAATACATGTGGAAATGGAAGTCGTACAAGGAATAGGTAAAT ACACATATGAATCAAACCTATTATGTTAAAAAAAAAGATAAGAACAAATA AATGCTGATATGAATATTTCCTTTAGAATTTGTATTACCAATCGATGTGC TGGACAAAAATTGCAACGGAGCTCATGTAATGAAGCCTCTTGTTCAGTCC GTGAGTAAAATTTTAAAGTATTATAAATAATTCACTTTACTTATTTAGAA AAATAAAAAAATGAGTTACATTTCATCCAATCCCAAATCCACCTCCCTCT GGTAGTATTYGAAAATCTGTACACCATTTCTCACACTAAGAAGGGGAATT TTCAATTTTGTTATTTTTTTAAATAACGATAATCTGGGGCGTGAACACTA TTATATATTTATAAATTATTGTTATTATTTTTATTTTTTTTGGGGGAGGG GAGTTTGGTTTTGGAATTTTTTAGAAAAATAAATTAAATTAATTTTATTG AAAAAAAATTATTACGGTTATTCTCAGAAAGTTATATTTTTTGGAAAACA TTTTGAAAAATTACATTAAATTTTCTTCTAAAAAACAAAAATTCCTTATT TATTATTATTATTTTTTTTTTTTGGGGGGGGGGGTTGATATTWTTTACAY AATTNTAGAAAAATGTTTTTATTCGCATGTAAATTCTTTTATGCTTACAA CTTGAAAACATGATTGTTTAATTTTTGAGGAGAAAACATCTAAGTAAAAA TTAAACTACGTTTACCATGAAAGATATTGATGGGCTTTATGCCACAGAAG GGTGCATGGGATACCTTCTGTATATTTCCTTGTACAAAAATTACTGCAAG TATTTATTGGTCCTTGTTGGACTCAGAGTAGAATTGATGATTACTGATGG GATGTGCTAAAGAGCGCGAGGAGAAGGCAGGAGTGAGACATATGTTACAC CAGAATTAGGACCCTTGTTAATATCAGCTACCTGTTTTATGATTTTGGAG GAAAAAAATAAATTGCTGCTATATATTGCTTCCACATTTAAAATAGCATT AATGCAGGGAAAATAATATATTTAAATTCATATTTATTTATTTTATTATG CATTTTTAAATCAATTTAAACCAAAGATAGGCGATAATTCTTCTTTTAGA GTGAGATGTTAACGTAAACAAAACTGATGAAATAATGACCAAAAAGAAGA AAGACCACAGGCAACAACCATTTCTTTTTTTTTTCTGATCCCTGTACTTA 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AGTAAATAGCGGTAAATTTTTGATCTTTTTCACTAAAAATTTAACTTTTT GTGAATTACTGTGAAACCTTTAAAAAATTTCCTAAGTCCTAAGTGGATTT TTGAAAAAAAAAATGCAAAAAAGTTTATATTTGAATTTAAATAATTTCTC CAATTTTTTAAACATAATTTTTTAACTCATTGGATATTTTTTCAAAAGAA AAATTCAAAAACCAAGCCCCCTTAAAAAATATGATCCTGGGGACGCCCTT TATGTAAGTTAGAGTCTTTAAATCTATGTTTTAGAGGGACACTGGGGAAA TTGGAGCCATTGGAGCAATTGCTCACCCTCATGTGGAAAAGGGGTTCAAA GGAGAAAAAGGTAATGATTAATTAACTAAAAATATGCAAATGTTCTTAAT ATAAATGCTTTTAGACAATGTATAAGTCATCGTCCAAACAACAACAGTAA ACTCTGCGTTGGATCAAGAAATCAATCACGAAATTGTGAATCTAATAATT GTCCTATCGGTTGATATTGCTTATTGTTGGTAAGAGTCAACCACAATAAT AATTATTTGTTATTATAGATTATGGTTTCTCTGAATGGACACAATGGTCC AAGTGCTCAGTAGACTGTATAGGTGACCGAGGAAACAATGTTCGAAACAG ATTTTGTAGTACATCAAAACTTCAATTCGGTGGTCGTAACTGTAAAGGAA GTCGTAAAGAAAAAAGACTGTGCACGGGCATATTTCCCAAACAAGTTACG TATCCTACAGCAAAATGTTTTCACAGTGAGAAATCAATTAAACAGTGATT GAAAGTACAGTAGAACCCCGGTTAATTTGTTTTGGAATGAGTATCGAGTA GCAAGTTACGAATCAATTTTCCCCATAAGTAATAACTGAAAATAAAAAAC AAGCACAAGGTTACCCTGTTAACAACACCAAACTAGCGCCATGCGACCAA 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