EMLSAT00000007642, EMLSAT00000007642-703489 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000007642
Unique NameEMLSAT00000007642-703489
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s443supercontigLSalAtl2s443:128347..151747 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000007642 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000007642EMLSAG00000007642-690408Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000033601EMLSAE00000033601-742529Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000033602EMLSAE00000033602-742530Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000033603EMLSAE00000033603-742531Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000033604EMLSAE00000033604-742532Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000033605EMLSAE00000033605-742533Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000033606EMLSAE00000033606-742534Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000033607EMLSAE00000033607-742535Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000033608EMLSAE00000033608-742536Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto772839auto772839Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000007642EMLSAP00000007642Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000007642

>EMLSAP00000007642 ID=EMLSAP00000007642|Name=EMLSAP00000007642|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=712bp
MLRFFSRRKVGKGHGDGEGVLSREEEVCCKKRVACRVVLLDGSDLCLMMG
KKWTGEELMSVLHSKLDIIERDYFGLQYTDTCKVPQWVDPSKQIRKQVKV
GPPYAFRMRIKFYSSEPNNLHEEITRYQFFLQLKQDLFASRLECPYHTAV
ELSSLSLQSELGDFDPEIHTPSYISEFRFVSNQNEEFEIDVFNHYKKLIG
MTPAQSELNFLNKAKELEMYGVDMHTVLGKDGSEYSLGLTPTGILVFEGE
TKIGLFFWPKITRLDFKKKKLTLVVIEDNDDGIEEEHTFVFXRNEKACKH
LWKCAVEHHSFFRLRAPIKGPNARQNFFRMGSRFRYSGRTEFQNTVSSSR
TRRTVSFERRPSQRYARRQSHVLREKESEKIKAIKSKIFKLDVLDTSQSS
PSLCSSNSSLESIEEFIPPLKSHKTRDELDFLIKSLQKGVYEMVNIKSEC
KDSIEMLPNNQSSKAGSKPIPLDHYKNNLLTPRGNNEISLFSDAVSIEGD
KIILSLINSKESSQKLINLDSSKELMDSSISVTHFSSSEKKGLEKETLFM
DNDSQENYNLEQRWHISPDRLNLIERNSTNYAISKIINDKFNYGNSMDPT
PPLLPSIETDIKTINIETSFASNQPVTRSLSSVSSPQQCIYKLPAFNVEK
DSPKKECSAFINNDIANKKYSTSSSCSSLDQISPWLVLDNVSCKKKMSPK
MNKLRTVITTEL
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mRNA from alignment at LSalAtl2s443:128347..151747+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000007642-703489 ID=EMLSAT00000007642-703489|Name=EMLSAT00000007642|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=23401bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s443:128347..151747+ (Lepeophtheirus salmonis)
CTGGGATGTAGTATAAAGTGTTTTGGTAGAATGAGTGAATGAGTGTAAGT CCGTATTGTGAGAAGAAGAGGGAAGAAGAGGGAAGAAGAGGGAAGAAGAG GGAAGAAGAGGGAAGAAGAGACTCTTGAAGTGGGGAGGTGAGTAGTGACT TATGAGATCGAGAGCAACAAGTCTGAGTGTGAAGTTGAAAGGGAGGAGCC GAGGTATGTACATGAGCTAATGTTGCGGTTCTTCTCAAGACGGAAAGTAG GGAAGGGTCATGGGGATGGCGAGGGTGTATTGTCGAGGGAAGAGGAGGTC TGTTGTAAGAAGAGAGTGGCGTGCCGAGTGGTGTTGCTGGATGGGTCCGA CCTTTGCCTCATGATGGGCAAGAAATGGACCGGAGAAGAGTTGATGTCTG TGCTTCACTCCAAGTTGGACATAATCGAGAGAGATTACTTTGGGCTCCAA TACACGGACACTTGTAAGGTGCCTCAGTGGGTGGACCCGAGTAAGCAGAT TCGGAAGCAGGTGAAGGTGGGGCCTCATACGCTTTCCGCATGCGGATCAA GTTCTACTCTTCTGANGAAATGGACCGGAGAAGAGTTGATGTCTGTGCTT CACTCCAAGTTGGACATAATCGAGAGAGATTACTTTGGGCTCCAATACAC GGACACTTGTAAGGTGCCTCAGTGGGTGGACCCGAGTAAGCAGATTCGGA AGCAGGKGAAGGTGGGGCCTCCATACGCTTTCCGCATGCGGATCAAGTTC TACTCTTCTGAGCCCAACAACCTTCATGAGGAGATAACGCGATACCAGTT CTTTCTGCAGCTGAAGCAGGATCTCTTTGCCTCCCGCTTGGAGTGTCCGT ACCACACGGCCGTGGAACTCTCTTCCTTGAGTCTCCAATGTGAGTTTGCC CCACCTGCCCCACTTGCCCCACTCACTCTTGCTTTCTTGTTGCAGCCGAG 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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGGGATGTT GATGCCACCATAAAAGACAGGAAGGKCAGGGACACCGACTTTGTCGACAA GGTAAAGAAGATGGTTGAGGATGACCCTACCAGGTCCATGAAGGCCATAG CGAGGGATCTGGGCTGCCATGAGAAAACAATAAGGGACTGTGTATCTGAG AATTTAAGGTGCAGGAGCTACAAGATGCAGGTGCGCCAGATCTTGACCCA GAAAGCAAAGGACAACAGGCTGATGAAGTCGACAAAATTGCTGAACAAGC TCAAGCACCCAAAGCAGCCCGGGATGCTGTGGTTTTTCTCTGATGAAAAG AATTTCTGTCAAGATCAGMCCTGCACCAGCCATTTGAGGAAGGTAATGAA AACCAAGTTCCCTACAATGGTCATGGTGTTCGGGGGGGTCAGCAGTGAAG GTCATGTTATGCCTCCCCACATGTTTGAAACGGGTGTAAAAGTCGATACA GAGGTCTACCTGGATGTTATGAAGAAGGTGGTTCTGCCCTGGATCCAAGG GGTGGCCGGACACAGGCCCTGGGTGTGGCAACAGGACTCAGCACCCTGCC ATGCGTCCAAAATCTCCATGCAGTGGTTAACCGAGAACTGTTATGACGTA GTAACCAAGGACTTGTGGCCTCCTAACTCTCCCAGCCTGAATCCTTTGGA CTGTTTTGTCTGGGGCTATGTCGAGAGGCATACCAACAGACATCCCCATA GCACCAAGGCCAGCCTGATTGACTACATCAAGGAGGTATTCGGCAACATG GATAATGAGATGGTCAGAAGAGCCTGCGGCCAGTTTAGAGGTCGTATTGA GGCCGTTATTGATGCCAACGGTGATTATATCGAATGAATGGCTACTCTAT ACCTATATGCTCGTCATAGTTTTGATTTTCAATATAAAAGTTAAAAAATG 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