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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s46 | supercontig | LSalAtl2s46:333270..367321 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000007948 >EMLSAP00000007948 ID=EMLSAP00000007948|Name=EMLSAP00000007948|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1311bp
MMYFLVFCLFLPQLSNSASIQGQRYKKNVFQPIRDGVWSEWSKWTSCSRS CGGGISSRSRSCFPPSTMSFRGRGLEPVDEERCRGQGNDQILCNLHRCPF SSISFRSQQCAKFNHIPYQGKYYSWESAENDRPLCALDCKTKERSDISTR MADMVVDGXRCRDDSLDVCISGICTKVGCDLKLDSNKKVDACGVCDGNGT ACSDHHAVFIWEETPLSHCSVPCGGGFMMARPICINAKTREHVIDDLCDS TNRPNERMAPCNQKACPARWEVDDWKSCSKPCGRGVSEKQCLDLKPPSKE GCNTHQCPQWFTGLWSDCSTSCGKGTRHRNVICRDERGLPSGACDYSIRP GVSQVCYTHCEEEDHDNDSLFNHDQDETKTKTKKGSSSESGGNGWIRLDG EVTSHMDVDQDEEENSHVLEEHESSKMVEASSIHPLNSETVSPQPPQELL QXATTDPTFIVEEWGTCSSPCGEGIRKRKVEXKIFLEFSKTIAVLPDNEC PGPKPPITEVCYSGLCNRDTSSINNIQMDIGDPSSARRSTYSWKDAGFTS CSESCLGGIQESKIICVEDELETPVAPNNCPIDSRPEIIVRTCNDHPCPP RWNVSEFSKCSKSCGGGIQIRSVSCIQEVRHGGNNILKVNDSLCPQPPPI TQQFCNVLDCPIKWTTSDWTKCSSSCGGGYKFRKVRCQQLLALGEMADKP DMQCPGRKPEEQRLCNSQNCPEVTGIYSKFHYEKDHLDSNVKNHHTHHKL EKEVRMPSIKANFNQNYIQTDPTKKTVKLKVGGKASVYVGTKLKIRCPVK KFDRKKIQWSHENSLIKPLIHKSKQEKRTTNVFVTKKGGLRIKKINYSDA GVYTCLAKGSTATIELIVQRLPDDYSNDSIKWKKYGNAVNGSKFSSKDGY YNKYGTTWDPHKLWVSDTTTEFPSQPASDNKNSNNNLYMRFNTVENRNEK SWNLVAPNKEESDYYDWESNANTQQEKQNSYTNALDQKSAFTPSSSSPSS SVSLHLISLIILILLSQLYFNRRKQLSSLDYVDHPEYEDNTEIKGKDREG SLKLQWQTTEWTPCSQTCGIGGSQLRKIRCVVIQGNNATEIPKDICVDSG LSSSKPDSFRKCIHNSPCPKWLADPWPACLQNSKCISRGRGLQLRQVRCG YLSNEEKNKKDNNLDDRFCEAILRPKASRQCNNPKCEGKWHVGSWSECST PCGNNGTRIRTVKCRWKNELEVPTESIEDSSCETSMPKPSSSEPYTRTIP EDCHDESQYCGLVYSFKLCNLPKYKDKCCYSCSIVXXXXXXVSMEELLVF ILFNDFQSPNI back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s46:333270..367321+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000007948-703795 ID=EMLSAT00000007948-703795|Name=EMLSAT00000007948|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=34052bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s46:333270..367321+ (Lepeophtheirus salmonis) TGGGGATCCAACATCTCGCAGAGAACCAATTTCTTTTTTGATATACAAAT
ACATACATACATATGTATAGAAAGTGCATAGTTGATTCATAATAACACCA
AACATATCTGGCCTACTTCCATTCTATTGAGTATATTATATTCCATTTTT
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TCATTTTCACTCAGTCAATGACTTGAGTTTTTATTTATTTATTTCGGATT
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ATTTATGTTTACATATAAGCTATAATTAAATCATGAGTTCATATGCACAT
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TTTCTTGTATAAGCACTCTGTACCTTTAGAGAAGTAAATACTAAGTGTTC
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ATTCATAAAAATGATTTAAAATTTGCCATTCATTTTTTTTTATCAAATGG
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GGGAGCCATAATAGTTAGAAGTATTTTGATGCTGAAAAATATGGATCAAA
GAATTTGCATCAAATTTTGTGTAAAAAAGGAAAATAAATGCTCAAAAATA
CTTAAAATGTTGACAGTGATATACGGTAAAACTGTCCCGCGCAAATAAAT
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GAAGAAAATTTCTATGAGCGAAGTTGCTGAGGATATTGACATATCGGTTG
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TTTGTCCAAAAACATCACCAAAATCATGGCTCATCCACCGGATTTGACCC
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CTGCTTATTTTTGCCCCAACTTTCCAATTCAGCATCCATACAAGGACAAA
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GTTGACGTCGTAATTTAAATTATAATCAAAATTACAGTTAGATATGGTGT
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ATTTTATAAGATGCTATCACAAAAAATGAGGGAATGGAAAAAGGATTGGT
TTTCAATTTTTGTAGCCAGTGAATGCTTTTTACACAGAGTATGCGCACTT
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TGCCTTCCTGGACATTACATTAGGTAAAAAGTCCAAGATAATATTGATTC
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TGTACTTTATCATTCCAATAAAGTTAGGCTTTTTGTTCAAGTAAAGCTTT
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AATAGCAGTTAGTATGATTGACTTCTTTGTATAACTACTAACTGATTTTG
GGCCCTTTTTCTATTCACGTTTTCGGAAGAAAGGTTGTGTGATACAATAA
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AAAATGGCAGAATCAAATAAAAAAAAGTTACGTATGTTTTGATAACCTTT
TCTTTAATGAGAGCAAAAAACATTAACCAAAGGGTTATTTCTACTTTTTA
AAAGCGGCTATATATATACAAAGTACAAACACAGATACTATATAATGGTT
TTGAAAACACAAACACAAGCTTTAAGCTACGTACATTATGTGTACCAAAT
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TTCCTTTTTTCTTTTGTCAATAGAGTGTGACATCATAGTCAATATACTAT
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ATTTTGCCTTCATGTACTGATACGTTGAATAATAGATGTCAAAATTTTGA
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TGTATAGAGTTGTCGAAACAAAAAAAAATGAGGTCTCAATTCCAGATTTT
GATAGACTGTATTTTTTTTACTACGATCCCTGTAGAGATGGTGGAAAGAA
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TAATATGTGCAATACATTTTGCTTTTATTGGCAACAATTTGGCATGTGGA
GAACCAATTCTTAAAGAACCCCTAAGAGCAATAGTTTTTTCCTCTGCAAC
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CATTGTCACATATAAATTTTCAGAGCCAACTAGATATAGAACTACTTTAA
AAACAATTGTCCGAAGGTATGAACACTTTCATCCAGGAAGGCCAATGGAT
TGATTTTTTATGTTTTTTATTATTTAGTGTATGATTATTTGATGGCTGTA
ATGTTTAATTGTTATTAGGTTTAGGTCTGGGCTATGAGTACTAATTTTAA
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GATTATATTATTTTATGTTTTCTATATATCTATATATATATATGATATAA
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ATACTAGTTATTTATAATGTATATATATTAAATCTTAAAGGTCAGAAAAG
CCTGCTCTCATTTTAAACATCANNNNTTACATACTAGTTATTTATAATGT
ATATATATTAAATCTTAAAGGTACAGAAAAGCCTGCTCTCATTTTAAACA
TCAAACTCCGTCTATGGTGTTAGGGATATAAAAAAATGCAATTTGAGACC
TCAAAGTGCATATTGGTGCTGATTTTATGAGTCAATTATGAATGACATGA
GTACTTAAAAGAAACAACTTTAACTGTAATAGTGAGGAGACGTTCCTCTC
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TAGGACATTGAATTTACATTTTATATTAATTCATGAATGAATAAATTAGC
ACTATTAATTTAATTATGATATGACTGATGTGAAGCTATTTATTTCCCAA
ATACTTTAAGGGATTTTTTAATTATCATGTAGCTTATTCACAATTTTTAT
ATATTATAAATACTTAGAAAGTACAATATTTTTAAATAACCAAAGGTCTA
CAATTGAAATCTTTTTAAAGATATTAACGGATGTTTGCTTCAAAGAATGC
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TTAGTTGGAATATATGTAATAAGGAGATTCATAATATACCATATACATCT
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TTTTGAACTATGGAAACACAAGAGGCCTCAAAATTTGTGTAATTTTACAC
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TTTTTGGTGTGACCTTGACATTGGAATTTGAACTTGGCCTCTCATAACCT
CTCTTACTATTCCGATATATAATCTTAGTACCATGTTTGGTCAAAATCGA
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CAACAACTTTTAGCACTGGGGGAAATGGCAGATAAGCCAGACATGCAATG
TCCTGGTCGAAAACCCGAAGAACAGCGACTTTGTAATTCTCAAAACTGTC
CTGAAGTCACTGGAATATATTCTAAATTTCACTATGAAAAGGATCACTTG
GACTCGAATGTCAAGAACCATCACACTCATCACAAGCTGGAAAAGGAAGT
GCGAATGCCTTCGATTAAAGCAAATTTTAATCAAAATTACATTCAAACAG
ATCCAACGAAAAAGACAGTCAAACTGAAAGTTGGAGGAAAGGCCTCTGTC
TATGTGGGTACAAAGTTGAAAATTCGCTGTCCCGTTAAGAAATTTGATAG
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AATTCTGTAGTGTTCAACTCCATGTGGAAATAATGGTACAAGAATTCGCA
CGGTCAAATGCCGCTGGAAAAACGAACTAGAAGTGCCTACAGAGTCCATT
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