EMLSAT00000007948, EMLSAT00000007948-703795 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000007948
Unique NameEMLSAT00000007948-703795
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s46supercontigLSalAtl2s46:333270..367321 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000007948 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000007948EMLSAG00000007948-690714Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000035170EMLSAE00000035170-744098Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000035171EMLSAE00000035171-744099Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000035172EMLSAE00000035172-744100Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000035173EMLSAE00000035173-744101Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000035174EMLSAE00000035174-744102Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000035175EMLSAE00000035175-744103Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000035176EMLSAE00000035176-744104Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000035177EMLSAE00000035177-744105Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000035178EMLSAE00000035178-744106Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000035179EMLSAE00000035179-744107Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000035180EMLSAE00000035180-744108Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000035181EMLSAE00000035181-744109Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000035182EMLSAE00000035182-744110Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000035183EMLSAE00000035183-744111Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000035184EMLSAE00000035184-744112Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000035185EMLSAE00000035185-744113Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000035186EMLSAE00000035186-744114Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000035187EMLSAE00000035187-744115Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto776500auto776500Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000007948EMLSAP00000007948Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000007948

>EMLSAP00000007948 ID=EMLSAP00000007948|Name=EMLSAP00000007948|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1311bp
MMYFLVFCLFLPQLSNSASIQGQRYKKNVFQPIRDGVWSEWSKWTSCSRS
CGGGISSRSRSCFPPSTMSFRGRGLEPVDEERCRGQGNDQILCNLHRCPF
SSISFRSQQCAKFNHIPYQGKYYSWESAENDRPLCALDCKTKERSDISTR
MADMVVDGXRCRDDSLDVCISGICTKVGCDLKLDSNKKVDACGVCDGNGT
ACSDHHAVFIWEETPLSHCSVPCGGGFMMARPICINAKTREHVIDDLCDS
TNRPNERMAPCNQKACPARWEVDDWKSCSKPCGRGVSEKQCLDLKPPSKE
GCNTHQCPQWFTGLWSDCSTSCGKGTRHRNVICRDERGLPSGACDYSIRP
GVSQVCYTHCEEEDHDNDSLFNHDQDETKTKTKKGSSSESGGNGWIRLDG
EVTSHMDVDQDEEENSHVLEEHESSKMVEASSIHPLNSETVSPQPPQELL
QXATTDPTFIVEEWGTCSSPCGEGIRKRKVEXKIFLEFSKTIAVLPDNEC
PGPKPPITEVCYSGLCNRDTSSINNIQMDIGDPSSARRSTYSWKDAGFTS
CSESCLGGIQESKIICVEDELETPVAPNNCPIDSRPEIIVRTCNDHPCPP
RWNVSEFSKCSKSCGGGIQIRSVSCIQEVRHGGNNILKVNDSLCPQPPPI
TQQFCNVLDCPIKWTTSDWTKCSSSCGGGYKFRKVRCQQLLALGEMADKP
DMQCPGRKPEEQRLCNSQNCPEVTGIYSKFHYEKDHLDSNVKNHHTHHKL
EKEVRMPSIKANFNQNYIQTDPTKKTVKLKVGGKASVYVGTKLKIRCPVK
KFDRKKIQWSHENSLIKPLIHKSKQEKRTTNVFVTKKGGLRIKKINYSDA
GVYTCLAKGSTATIELIVQRLPDDYSNDSIKWKKYGNAVNGSKFSSKDGY
YNKYGTTWDPHKLWVSDTTTEFPSQPASDNKNSNNNLYMRFNTVENRNEK
SWNLVAPNKEESDYYDWESNANTQQEKQNSYTNALDQKSAFTPSSSSPSS
SVSLHLISLIILILLSQLYFNRRKQLSSLDYVDHPEYEDNTEIKGKDREG
SLKLQWQTTEWTPCSQTCGIGGSQLRKIRCVVIQGNNATEIPKDICVDSG
LSSSKPDSFRKCIHNSPCPKWLADPWPACLQNSKCISRGRGLQLRQVRCG
YLSNEEKNKKDNNLDDRFCEAILRPKASRQCNNPKCEGKWHVGSWSECST
PCGNNGTRIRTVKCRWKNELEVPTESIEDSSCETSMPKPSSSEPYTRTIP
EDCHDESQYCGLVYSFKLCNLPKYKDKCCYSCSIVXXXXXXVSMEELLVF
ILFNDFQSPNI
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mRNA from alignment at LSalAtl2s46:333270..367321+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000007948-703795 ID=EMLSAT00000007948-703795|Name=EMLSAT00000007948|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=34052bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s46:333270..367321+ (Lepeophtheirus salmonis)
TGGGGATCCAACATCTCGCAGAGAACCAATTTCTTTTTTGATATACAAAT ACATACATACATATGTATAGAAAGTGCATAGTTGATTCATAATAACACCA AACATATCTGGCCTACTTCCATTCTATTGAGTATATTATATTCCATTTTT GTCTTCAATATACATCCTTCAGTAAGAAAAATAGTTTATCGCTGTGATTG AAATACGTATAAAAATTACACATTATTAGTTTTGAATGAAGTGTGCTGTG ACAACAATGAGGATTTAAATTTGTTACTAATCCTCGGACTTCAACCCTTC TCATTTACTACTCTCATCGTTATTCCATGTTTGATACGGCGATATCTCCA TAACCTACGAAGAATACAAAAAATGGGCACTTTTCATAATGATAAATACT TAATGAAGTTATAAGTAACAAATTTATTATGGTAAGAGATGCTTTTTTAT TCACAAATTAATATTAAATATTTATTGTCAATGTGTTTATGTCTTTTATA TGTAGAAAGATGTTAATTGGATGCTTTAGAACCATTATGAATAGGTACAT AGAGCATACATATGTATATAAAACCACTGGGTAAACTTTACCAATGTTTA TTGCTACATTTTTACCAGCAAAGCAAATATTTACACAGAAAAAGAAAGGG GAAATATACATAGATATTATTCATATGTATGTCTATATAAATGGTTCCAT GGTTTTGAACCATTTCATTTATTATATTTGTTATGTTTAGATTTGTTTAA CTTATCTAGTAACAATTTATAGTTGTTCAGAAGTCATTTTTTTCAAGTCT GTATCTAGTCTCGAGTTTTTTTTTATTGGGTGAATAAATGGAATTGCGAT TTTTNCCAGTTTGCTTTGGAGTTTAAACTCGTAGATCCGAAGTGAGTAAT GAAAACTTTTTTCTAACACTAATTCAGAAATTATGTAAAAATTCAAAAAT ATCAAATAAAATGTTTGAAGTTTCAATGTTTTCATTTTGTGTCCAAGTTG AGTTGCAATTTTTTCCAATATTATAGTCTGATCCGAATCTGAAGATGTAG TTTACTATTGAGGTTTCAGTCGGACTATTTGAATTAAAATCTTCTTGCTT TGACTCTGATTCAAATCAGACTCTTTGATTCTGAAATTGTGGTTCTTTTT TTTTCTTTTTTTAATATTCCTTTAATTGATCAGATGAAGTTACACATATT AAGTGCAAGTAAACAATATAGAATTACTCCCAACTGGCCTAGGAATAATC TTTGAAGTCCATATACATTAAGTATATTTCCTTCTCTAGAAACGACCAAT TATCGAATTTACGCACATTCAGTTAAAAAAAAAATTTATTCCGAACACAT TGTTCCTTACGTCGTTTAGTATTGTAGCTTATTATTGATGTTTCAGAGCA ACCCCACGGGTTACAAGCTTCTTCTTTTAACTCTTATTCCAATTAGATTC TTTGAACTTTGAGTGAGATTCGAGTCGTAAGTTTGTCGTTGTAAGTACTC CATGAGTTAAGTCTCGAGTTTTATTTTCATTCAACTTATGTGCGACTTGC CTCAATCCCGAGTTCACATCTCTGTTTAACACGCTCTCAAAAAATGGAAT GTTCTATGGATACAAAAAAAATGATTAAATAGTGTTTTTGCATTTTAAGT TGAATATATATTTATCTAGATGTAGGATAGTATATGCAATTCCTTAATGG ATACACGATTCCTGACCTTAATTTGTACATATTATGTATATAATTTACTT CTTTTGATTGAAATGAAATTGCTATCATCATGATATGACTTTACTCACAA AACAATAAAGAATACAAGTAGCAAGAGAAAAAAATTAAATCAGGCACACA ATGTATATATAAATCATGTGATTCATTAATAGAATGTGCGAAACTTTAAA TCATTCTGTTTAATACAAAAGAAAACAATACAAAGTAATTATACATAATT TTCCATAAATGATTTTTTCCTTCCTTTATTGTCAATGTTTTGGTTTTTTT TTTCAAATTAGGACACGTTATATAAAATTACTTCATTAACTAAAATTTAA ATTCTGCTTTTAACTTAAAATTATTATGTATATATTTATTTAAATACAAC TATTTAAGCCTTCAAACAGGAGTTCTCAACTGGTAACACAGTGTGACTCA CATTTTATCAGGGGCATTAAGCCTTGGATCCGTTATTATTGTTTTTGATT CAAGCAAAGGACTTTGAGTCGGCAACATTATTTGGATTTTTAGTTCTATT TATATTACTTATAATACAGATTTGGAGGAACTATTTGAAGCTTCAATAGC TGTTAAAAAGAACTACAGTCTCTGAAAATATAATTAAAACAATTTATTGG TAAATAACTATGATTTATATTACTTTAAGTCTCAAATTTGTCAGCTATCA TGCCTTTAAAAATAGTCGCTTGATATTGTACAGCTTTGTACTCTATATTT TTTTTATATCTATGATATTCCTAAAAGAGAAATTTGCATAATTTTTATAG TTAGAAATAGCGAATACCTTCAATTTGTTATCTTTTTCTCAAAAATTGCG GTTGGGATTTTCCTTTGTTAGTGTTGAAGATGAAAGTTTAAGGCTATTAA TATTTTTGATTGGTTGTATGTGACTCATCTATAAAAGGTCTGCAAACCAA TTTTACTTCGTGGACCATGAATGAAGAAACACTAATCTTAAAATCTATAT CAAGCTAATTGGATTATAATTTCATTCAAAATGGATTTTCATATAAATTA AAAAAAAAAAACATAAACTACCTTAATGAAGTATTTAATTATTAATAATT AATCAAATCATTTCACAGTTTTTTATTTTTTTACCCTATAATTATAATTA CTAAATGACAAAGATTTCATACATCAAATCTGTCTTTATTAGTACCTACA TAATATAAAATTTACACGAATCTTCTTTCTACTATGTATGTCATCCCCCC CCCCCCCCGCCCCAAATAAAGGATCGTTGTATCCTCTCCCTCATGTACAT ATGTGTATCAAAAATAGGGCTCAGAAACCCTCTTTTGTTGTTTATCCTAA ATGTTTGGATATATTTACGACAAAATTGTCAGTTTATTTCTATTTCTTTG TTTTGTATCATATTAGTTGTCTAAAAAGATTTCGTTTAATGACTTGGAAT TAATTCAACTTCCTAGTTGAAAAAAAATAAATATATATGAGAGCTTACTA TGTTCAAAATATGTAGTGTATAAGTTGCCACGTTTTGAGCTCATTGTTAG ATTATGTATCCTTATTTTGATTAAATCAAGGTATTCAAATAATTATTGAC GAATTTGTGTCTTTCAAGATGTATTTGAAGAGAAGAAAACTTGAGTACAA CTTTTTTTGTGGAATCATGAATTGTACAAATAAGTTTTTATTGAGGAGCA TCCCCATATATTTTTTACAACATAATATTGCATAAACATATTTGAATACA TATCGTAGGCTTTGTAATCCAATTTGTTGAATGCATTAAGATACCCAAGG ATTTTAGGTATAGTTTAAAGTCTTTTTCGGAATAAGAAATTTATATTGGC CTTGATATGGCCCCCTTCAAATAGAATATATCATTTTTTTATTTTTTCAT TGTGACGATCCGTTTTGGGTACTTTAAGTGCAATTTGTGGGTCCTCCAAT GGTTGATAAGAATTATTTTTTTTCGTGGAATTTGAAGGTTATTCGTCGAA GAGTATAGATGTAATCCACAACCGCTATAGAGAAAAATAATTATAGTTTG CTTTTAGTATTGACACGCCACACATATTGTTTTATTTTTAATCTTGACTA GTTCTGCAAAATGCTGCTTTTCACTCATTTAACGACAAATCAACCCACAC ATAACATCAATTCCTTGATATAAAAAATTATTATACTTTAACCATATAAT TGGAAAAAAAAAAATCTATATATTTTTTACCTAATTACAGGTTGATATTT ATAAATAAACATCAAAGGGTGAAACTAGCAGGAGCTTTGCATTGAGCACA TCAAGTTTTATGAAAAATGGGTCGTTTCCTTTTAAGTATATATTTGTTAA TCATTTTCACTCAGTCAATGACTTGAGTTTTTATTTATTTATTTCGGATT TAAATTTCATCTACCTAATGAGTGTATTTTCATGCATTTTGTGTGCAAAA AAATAAAATAAAACAAAATTATGTGATGGTGAGTGAAATTTTGCCAAATG AAATAATTGTAATATTATGGGGAAAAATGAATTAGTACATATATGACCAA TAGCTTTGTATTATGTAATCCAAAATGACGTAGAATTTAACTTAATTTAT TTCTATGGTATATTTTGTTCTACTTCGAATCATTAATAGCACCTATATGT TGAACAGACCTATTACTATAAAACAATTATTCAAATTGTGTCGTTTTCGT ATGAATAGGGGGAGGGAATCTCATTTTTCATTTGTCTTGGAAATAAAACC TACTTTTACGATGCGGATCTTTTAATGTGTGGAAATAAAGGATTTAAATA ACCACTTACCTTAATTGAAACATTTAGAAATGAGTGCGACATAGATTATA ATTTATGTTTACATATAAGCTATAATTAAATCATGAGTTCATATGCACAT ATATAACATGTACATCCCAATACTTTAACTTTGTTTTTTCTGTGCCAATG CCTCCAAAAGATACAAAACAAAGTGGTGAAACACATTTGTTAGCTTGAGA AGATTTACTTTGCTACATGAAAGCTCTTTTTCTGGCAAAATGCCGCTTTT GAGATACCAGAGCGCTCATAACTTCATGCAAATTGTTTTTCACTTCGCAG AATTCCTCTTGTTCCTTCAATCCTTATTTAGGACGGAAAACTACAGTCCT GTACGGTTCAGTCTCGGTCCAGTCTAGTTGAATCCTGTATGTCAGTCCGA AAACGGATACAGTTTGATACTTGATGACGTCGCTCAACTTCATTTTGAGA AAACCTATTTATATATATTACGGCGTTCATAATTTTTTGAGCTAAGCCCC ACCAACCCCTCACTCAATGATAAAAGCTAGCAATGTTCTTTTAGCCAACT ATATTTAGAAAAGTATTGATTATGTGGTCTTCGTTTCGCCACTTGGGTTT GAGCTATAGCGCCTCCAGAGTCCTAAATATACAACCTATATAGTACAGGG CAAGGTTAATAGAAATACAAGGTTATACCATGACGCATGTACGACTGATG TTTGACTTCCATCCCACTTTTAATATTGATGTCATAGAAAAAAGTTTAAG AAATCCATAAGTATTCTCAAAAAATTCTATTTTTGGAAAAAAAAAATCCA AAAACCAATAGCTATTCTCAAAAATTAAATTTCAAATATTACATTTTCTC CTAAAAAGCAAAATTTCCTTAATTTTGTAAGGGGGGGCTACAGCCCCTCC AGCTCACCCCCTGCGGACGCCCTTGTAATATTATTCTTTATCTTGTTTTG GGGGGTATTTTTACTTACGTAAAATCAAGTATTTGAAGACATTTCCTGCT CACGCGATAGATACCTGAGAGGTAAAAAAAATATTCTGTACTTACCTACT TTAGCAAACTGGATCTGATTCGCTAATAATGCATATTTAATACACTTATG TTGGATGTAAGAGTAAATAATAGGGAATAATATGATATCATGATCTAAAG CATCATTTTATTAACTGAAAATGCTGAATCATAGCTTCAAACACTTATGT AGTTAAGGCTGCTGTATTTTTTCTATCTATCTATGTATATTGATATTCCA TTTATTGGAAAATAAGTAATTAGTTGTTGTTTTTTTTTGTTAAGTCATAG GAATTGGAACCGTCTATGAATGCAAGAACTAGTTTTTCATAAAGGAAAAC ATTTAATTTAACACATCGTTAAATATATTTTCAATTGCTCCAGAAGTAAC AAATGTATTACTCATATTATTTGTGGGAGTTCATTTATTTTGGATCTAAA GATATATTAAAGTACATATTAGGGTGTCAAAAATTTCATTTTTTGTAAAA GTAAAGATATGGAGGTTTAAACGTCTTCCTTTTGATAAAAAATATGATTG ACAAAACTTTTTTTTTTAATATTTAATATCTATTGTCTTAAATTTTTTAA ATTTTATATTTAATTAAGATTTACTATAACATAAACTTTTTAGTAAAATT AACAAATTTATTTAAATAGAATTGCTATGAAAGGGTTTTTATATTTTTTA TGAGCACTCAGTATGTATTTGTCTAAAAGGACAATAATAGTATTTAAACG AATGTGTTTGTATTTATTAATAGTAAAAATATATATTTGTATTTAAATCG GCCACAAATGACCCAGAAAATCTTTTTTTTTTTGATAAATAATATCTTAC TTAATTCTCATTCAAATTTTTTTACCTATATAAATTTTTGATTTGTTTTG TAAGATTTGCTCATAAAGGTATTTATTCTCAAAAAGGTCAATAAGGTTAA GGTCATCAAAATTATACCTTTTTCGTAGATGTAAGTTGAAAATATACAAA CTTGAAAATGTTAACATATATCTGTCAAATCGTTTAGCCGTGATGAGTTA TCGAACTGACAGATAGACAAAAGGTTACATTTTGGTAAAATACTATTATA TTTCTTGTATAAGCACTCTGTACCTTTAGAGAAGTAAATACTAAGTGTTC 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TGTTACACCTTGTATCTTTTACATTTTATTTATAAGAGTACCTATATGGT TATCAATTTAGTTGTATTTATCTATCAATTTAAAATACGAATTTGAACCT AGGTTACTTTGTATTTAATTATGCATCCTACTTTGTTCATTCTCCAGGTT TCGCATATTATCTGTATGTGAAATACGTTTTAATGTTAGTGGCTTAGTTT ATGTATTTCCTTTAGGGCAAATATTATTCTTGGGAGTCTGCTGAAAATGA TAGACCTCTTTGTGCCCTTGATTGCAAAACAAAAGAAAGATCAGATATAT CAACTCGGATGGCTGATATGGTTGTCGATGGGKCTCGCTGTCGAGACGAT TCACTGGATGTTTGCATATCAGGAATTTGCACTGTGAGTATGGGCGAGAC GGCTTTGGAAAAGGTTCATTAAATTTATTTTTTTATTCTATTTTAGAAAG TGGGATGCGACTTGAAGTTAGACTCCAATAAGAAGGTAGATGCCTGCGGT GTTTGCGACGGAAATGGAACAGCATGTTCTGACCACCATGCAGTTTTTAT TTGGGAAGAGACACCTTTAAGTCATTGCTCTGTTCCTTGCGGAGGAGGGT TTATGATGGCTCGTCCTATTTGTATTAATGCTAAGACTAGGGAACACGTA ATAGATGATCTATGTGATTCTACTAATCGACCCAATGAGCGAATGGCACC TTGTAATCAAAAAGCTTGTCCTGCAAGGTATAAAGTCTACATATTATATC CTTCATAGTTTCCTTTCGGTGTACTTTAATGCCCTTTTAATATAGAGAAG AAGGAATTATTTATGCAAATAAAATTCAACTCATCTTTTGAAAAGAAAAA AAAGGGGATTTTCAATTATACACATATAAAACATATACTTTACATACAAC TCTTACTGCTCCTAATCTTTTTTAAGTATTGAGTGGTTGTTTTTCCCAAA 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TAAACGGTTATTTTGCTAAAATTACTAAACCGGAATCAAATTAATTAATC TGTACTTTATCATTCCAATAAAGTTAGGCTTTTTGTTCAAGTAAAGCTTT AATCGACATTGACTGAAGCAAGATACAATCGAAAAAAAACAATTTTGAAG AAAAAAAAAACCTTGTTACATCACTAACACAAAAATATCCAAATTCATTT CAAAAACTATGGAGAAAACAACTTATGACAATTATAGTAATTAAGCAATA AATAGCAGTTAGTATGATTGACTTCTTTGTATAACTACTAACTGATTTTG GGCCCTTTTTCTATTCACGTTTTCGGAAGAAAGGTTGTGTGATACAATAA AGCTAACCAAGTGCTAATAGTTTGAAAAATATCGGATTGGAATTTTTTTA ATGCTATCAGATCGGGAAATATTTTTATATCAGCCCATGTATAGTATTAG TTTGCCATCTATGGAAGGGCATATTATTCAATCCCTGTTGGAAATTGTTT ACTTCTTAAAATAAGTCACTTCCCATTGAACCAATCAGAGTTCAAAATAC TAATTGTGGGAAAATAAGTAGAAAATCGAAAGCTACAAAAATTAACCTTT TTATTTCAGTGAGGCAGCGCTGTGATATATGTACTGAATAGAGTTGAGAC TCGGTATAGCACTGATTTTTTTTTTTTGGTTCGGTCTTTTTCTGAGACCG GTCTAGGCCAATTTTTTTTTTTTTGGACCGAACTAATTTTTAAAAAAATT TATGACGCTCTCAGACGGGTCTAGGATTTCTAGATCGAACGCCAACACCA GTATGTATGATGAAAAAGCATAAGAAAAGACTTGAGTAGAAAGTCACAAG AGGCTACTTTAGTCAAGAGGAGGGGAGGTTATATATATATATATGAATAT TAGTGGAACTATAGAACGTAATCCTTTATTCATTGTTTATTCCTTTAATT 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