EMLSAT00000007994, EMLSAT00000007994-703841 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000007994
Unique NameEMLSAT00000007994-703841
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s475supercontigLSalAtl2s475:100675..125528 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000007994 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000007994EMLSAG00000007994-690760Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000035369EMLSAE00000035369-744297Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000035370EMLSAE00000035370-744298Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000035371EMLSAE00000035371-744299Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000035372EMLSAE00000035372-744300Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000035373EMLSAE00000035373-744301Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000035374EMLSAE00000035374-744302Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000035375EMLSAE00000035375-744303Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000035376EMLSAE00000035376-744304Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000035377EMLSAE00000035377-744305Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000035378EMLSAE00000035378-744306Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000035379EMLSAE00000035379-744307Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000035380EMLSAE00000035380-744308Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto772568auto772568Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000007994EMLSAP00000007994Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000007994

>EMLSAP00000007994 ID=EMLSAP00000007994|Name=EMLSAP00000007994|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=882bp
MMPAPXPGSLKDPDVASLFECEDPDRLFEDLREIGHGSFGAVYYARRGEE
VVAIKKMSYSGKQSLEKWQDILKEIRFLRRLSHPNCITYNGXYLKEHTVW
LVMEYCLGSASDIIEVHKTGLHEEEISAICAGCLAGLSYLHLQARIHRDI
KAGNILLTDAGCIKLADFGSASIASPANSFVGTPYWMAPEVILAMDEGQY
DGKVDVWSLGITCIELAERKPPYFNMNAMSALYHIAQNDSPGLASPDWSD
SFRHFVDXCLQKNPLERPTSERLTQHQFVARVKATHVLLDLIVRTKNAVR
DLDNLNYRKMKKILMNDNCDEQSTIGDDDVSVSDMNEEEEVNPRKLLSSP
SNVDREDDSTLDPKNFATIRTTSIVQRQQKEHLQEEMHEQMSGYKRLRRD
HQASLARLEEQCRQEMEKHKIMLDRDYEQLLTQFSRELERLQLKHQEELG
KKLKNNLNTEKKLIKEVSDLQQVERKSFENKMKAEYKMKKERWKKEMAEI
DTPKRQKEAXLTQRKENLREIDSVETQKMTRGQKEHLDLEIRKFRRRRLL
KYQGLEQDLLREELNKRQNQLETAHSMLLRHHDLTYQLELKQQKAVHSMR
EDHVKRQHSTELVNQEEYTKRLQRELKKKHAMEIKQQPKSLKQKEILIRK
QFRDTCKIQTRQYKAFKSQILQTTPKEEQKSTIRKLKEEQRRKMALLGEQ
YEQTIADMLQKQSIRMDESQELDARALAERLQTELDSLTAHQSKSKMISE
QQRTREKQELEDRVNVRRTLLEQKMEEESQQFLNERSERIRLLHERQARE
LEQFDEESARLGFSAMSIAESSNLPGYGEDNSSSPLTHSHSSGGPFGGGG
SLLSSSSYHSARSFRQPSTTNNIGSPNQRTQL
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mRNA from alignment at LSalAtl2s475:100675..125528+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000007994-703841 ID=EMLSAT00000007994-703841|Name=EMLSAT00000007994|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=24854bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s475:100675..125528+ (Lepeophtheirus salmonis)
AAAAAATTGATTTCCTTCCTTGCTTACTTCTTCGTCCAAAAGATTGGCAA AGGTAGGGATCGCAGTTACCTTTCTAGAAATGTCACTTACCTCCTCATAG GACCCCATAACGGGTCTAGAAGACAATCTGAAATTCTTGTGTACGTCAGT TAGAGTGATAATTGTGGCACTAGCTAACTGGGGATTTGCCATGGGAAGAG CCAGTTGTGAATCGACAGACTCCGCTAATTTATAAAATTCATACATAAAG GATGAAAGTTTGGCGTGGCAAATGTCTACACTGAAGATGATAGATGGAGT AGCTAATGTAGCATGTTTAGAAGGAGAATAGCTTGTCCTGCATAATTAAT TCTACAGATTTTCACTAATATTATTAAATTTTAATTTAACTATTGTCTTT TACATTTAAACGTCTCGACTCTTAAAGGATAGAAACACATTTTGTACAGG GTGAGATTCAGGGTGACCAGATTCTTATTGTAAAGTGTTTGTGTCTGTTT CTAAAATAGCTAGGGTGGAACGGAATTACAAATGTAGAGCTCCGCTATGA CATAAAATAAAACATTTACAGAAATAAAGCACTGTTAATAATAAAATTTA AAAAAATATTTTTTTTACTATTTACTGCGATTGATAATTAAAGTATAACA GGAAATTGCATAAAAAAAGAAAACATCATTAAATGTAATATTTACTATAT ATATATATATATATAGTACGAGTATATATAATAAAAATTGGGTGTAACAA GTCTCCTCCATAGTATTAGTATCAGAAAATGATGTGAACTGAATATTGAA ACTAATCATATTTTACAAGTATGTTAACTAATTGAACAACATGCTAGACT ATGACATTTTATAAAATAAAATGAAAATCTCATGTTTTATAATATAAATA TATTTCAACAAACACTTAGTTATAATTCTTACTTTTTATGTCAAAAATTT CTTTGTCAAAATTCTCTCTAACTGTAATCATTAGGAAAGCCGTGTTTTAT GTTGATTTGATAAACAAAGGAAGATCTTCAATTTTATAAGAGCAGGGTGG TTTGATAACTTTACATTTTAAAGTTATTGGCAGTGTATCATGTCTCCTCC GTAGTAAGTATCCTTACTCTATCTATATATTATTTTTAGCTGCAAAGTGG GGTTTGTGTTGATTTAATTCATCTAATAGCAGCTAATTTAATGAAGCTTC AGGATAGTTAGGCTTCTCTCCTTCTAAAAATTCTTCAAATTGTAGGGGTG ACCACGTTAATTTTCGATTACTTTTTTTTAACATCCGGCGTTTCATATTA TTTTAATCACTTGGAATCCTTATCTATATTATTCAACCAAAGTTCACCTA ATAACTCGAGCAATACAGGAAAATCCTTCTCGTATATGATAGTTAATACC AGATTTAACTTTGACGATTGGATATCCTCGAAATAGAAAAAGTGTGATCT CCTAGAAAGGGGAAGGATGAGGGAATTCAGATTCATATATCCGAATGCTT AATAGTTAAGATCTATCCAAATCAGTAATCACCATGAACTACGTAATACT TTAAACGTAGTTTAACATTAATACTTGAATATTTAATAGTTATAATACTA ATAACCATGATAAAAATCATCAGTACTATGACGTATTTTTATTCAAACTC AAATATCAATAGTTGACATGCCACTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATA TATTTTATGACATAAGTTTTATAATTACTCTAATATTGTATTAATGGGCA TCAATCTGGAGGGTAATCTGTGATTGTCTTTCCAACATTAACTTTAATGT ACCCAATGGGATACATAATGATCTATCAAAACAAATTAATTAACACATTT TTTCACATTTGCTCATGTGAAATTTTCTTTATTGATATGTTAGTACTTAT TAATAGTCACGTATTAGGCTTTTTTGAGTTTCTTTCTTACAAAAATCAAC ACAGATAAAATAATAATATTAAAACGCCTCATCAACTGTAAATTTGGAGA TACGAATTCAAAAATAATTCAAATTACAGTATAATACATACTCGATGCTA CCTGCACATGTTGCAAGATTATATTAATAAGACTACTTTGTTATTGCTTA GATCAAAATATGTCCACGATATAGATCGTGGAGCACTCACTATATACAAT CAGTGCTGGAGCTGTTAAGGGATGGGGGATCCTATCCCCCTCTAAAAAAA AAGATGTATAATCTAATTCGTGAAATATATTCATTAATAGTAGACCTGAT GGTTCCTTGAAATCTCTGAGTACTACTAGTTCAATAATTAATGAAGATTA ATTTAATTTTTTTATGTTTCTTTTTAGAATAAATGTTGCGTGATATAATA TAGGTAATGACGTGACGGATAAGCTTTGCTTTTATTTATACAAATATATG TTTTATCATTTTTGCTATTAAACGATAATACATAAATCAATAAAAACAGT TCGAATATGAGATGAGTAAAATAAAAGATATATATTATCTGCAAGGTTTC GCGACATTTTTCAATTTTGTAATAAACAAATAAGTAAACAATCAACCCTT TGACATTCACCAATATAAAATTGAAAAATAAATTAGAAAGTGAAACCTCC CTCATAAGGTGGGAACACAAGTCTTGAGATTCTTATCTTTTAATCCATTT GAAAGGAATAGATTGCATTAGTGTCATGAAATTATACACATTTTCTATTA TAATAACTGAACGAGGGGGCATGATTGATATTTATATATATGAATGTTCA AGAGGGGGATGTCAAGCTAAAATTAAGTAAACAAAGCTCAGAGCCTATTG ACTGTTATCCTTTTTGGAGTTATACTATTTTCTCGTAACACGGCACCACT CTCAGAATCCTTGATTACAAACTAATGTAAGTAAACAACGTTCATGCCTG ATTCTAAATATAATTATCGAAAATCGTATCACTCTACCCAATATGAAGTG TGTTAAAATCTTCCCTGCCTCTTGGTGAATAATTACCTGATCGTTTGGAG TATTTGGTTCTCCTTAAGAAACAGAATAGCAACATTGCTAATTAATAATT AATATTTGAGGCCAGGATGATGAAAATAAAATTACATTTAAACAAACTCT TTGTCCTGTATATTTCGTATGTACATATGTAAATTGCACATGCAAATTCT ATAGCCTATATATATATATATATGTGTATTTAGTTATATGCATAACATAT AGGCTATAAATAATTTCTCGAGGGAATTCCTAGACAAAAAATTTCACAGA ATCTTCAGTCGGGTTGAGTAATAATATGCCCTTAAAATCATTTATAACTT TCAATTAAATATACCCTTATCTATGTTCAAAAATAAATAAGACTAGTTTA ATTATATCAGTAACCAAACAGAGACTTGAGATATTGACTCAAGTGCACTC TTTAGCAATTTTCATTCTTAATTACATAATACCTGGTGAAATTAATAGTA ATTGAGTATCTGAGTGTGAATGGATTAAAAATCTAGTCCCTAATTAATAA TAAATTATGTATGTTTGTACATTAGACTATACCGAAATAGCAAAAGTCGG GAATTTGGTATCGCCAGATATTTTATATCTTGCATTTTATTCCTCTAAAC AAGAAAATAACCATCAAACGTCCAAAAAAATGGTCCTTCATGGACGCATT TTGATTTAAAAATCTGTAAAATGTCGAAAAAGAGGAAATTTTGATGTTGT TTCATTAAAATTATCGATTGTACCGACTCCTGGACTAGACAGGCGGATAT TGACAAAACACGCAACCACTTATAGTCTATGACATCAACTATTGCAAGAA TTTTCTATATAAGGTATCGTACCGACTGCTGGGAAAGAAAAAAAGATTTG GACACTACACGTAACCACTCATCTTCTATGACGTCAATATTAAAAGCGTG GTGGAAGTCAAATATATGTCGTACACGCGTTATGGAACTTTTATTTCTAT TAACCTTGAATCTCATAAATGGTTTTTTTTTCTTAATTCAAATATAACAA ATGGCCTAAAGAATTTATGTTATTCTAGTAACTTCAAAGTTTTTTTTATC GCATTTGTACCGAGCGCACTTGATCCTTCGCTTACAGGTTTCTAGTATTA CATGTTTTGACCATATCAAGAGTCATTTTAGAATTTAGACTGATGGAAAT TTCTTACAACTTTGCTTGTCAACTAAAACTTGCATGGACTGTATGGGTTT GCTGTTCACTGTCGTATGGGACCTACTGGAACATTCCAGTCTCATGTTTT AGAGGAGTTTAATTCTAAAATTCATGAGGAAGTCCGTGAGGAGGATTAAT TGAGTTTAAACAATCAAATTGAGGAAATTTTCTTCAGGAGTCGCCTCAAA AGAAGTATGGGGTGCTCTCCTCCTAAGAAACAAAGTTATTTACAAGTTTA TTTCTATTCTATTGGGACTAAAGCATTAAACCAAATAGCAAATCGATTCC TGAGGTTAAATCTAAAGCTGGGACTTCTCAATACTGGTCCTCAAGGAGAA 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TTAGTATGAACTCTCAGCTCTTGTATTCAGTCATTTAACATAGGGGAACA ATTAGGAGTTGGAAAATGAATTCAAGACAATTATCGAATTTATCTATGAG TGCAGAATCCAAAACTGTTCCCACTTTTTTTCTCAGTCATCTTCGGTAAA ATTCTTCAATTTTTATAATTAAAATAACTTAAGGAATATAATATGTGAGT CTGTGTGTATGTGAATGTCTGTGTATGTCGAACCTTATTTGGATTTTGCT GAAATTTTTCATGCAGGTTTTTATGGCTCCAAAAGTGACGTTTTGGCCAT GGTGGCCTTTAAATAGCATTTTTACCACTTTGCGTGTACAACATGAGGGC TGGGGTGTATTTTGGATATTACATGGGTTCTTTGATCCTCATGGAAGCGA CGGCGGAATACCAACCTCAGAGAACAGTAGCCCACAACCTATGGGCAGGG GTGTATTCTAGTATATTTGAAGAGGTTCTTGGTGCATAGAAATGGGACGG CAGTGCAGTTTAAACTTTCTTGAGGCCCGGTACTTCACCTGTAAAACATG AGGGCTGGAGTGTATTTGGGGTTATTAGAAAGGTGCCTAGGTGCTCAGGG AAGGGACATGAGAGTAATTTAACCTACCTCATGGACCAGCAGCTCATATA CACAACCCGCGAATGTGGGTTTATTATAGCATATTAGATGGGTTCCTTGA TGCTAGAACCGCAGAATAAAGCAACTACTTCCTCATCCCGTGAAATGAGA GTGAGTATATAATGTATATCTATTAGTATACTCATAATCATAATACCAAC AAGTGAATAATTCTTAAAATTTTACGATCTTTATTTTTTGTTTATATTAA GCGAAAGAGTTCTATACTAATTTTAATTTCTTTGTGTCTCGAGCAACACT GGGCAAACCTTTTTTAGTAAATATAATTATTTATTATTTTACCAATATTA 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TACTTATATAATAGACCTTGCTCTATATATCCTGATATGTAAAAGACGAC CCCTTTACATCTTTATCAGTGTCATTGATATCAATATTGGGCAGGAATTT AGTCACTATTTGTACAAATTCATAAGGACCTTTTTAGTTGCAATACTACA TTATCAGAGATTAGAAAATGGCCAATTGACAGAATAACAATAAAAAATCA TCACTAAATAAACGAAAGCGGCTAKTTAAACTCCCAAAAGGATCAAATAT TAGTCATTGGAGAAAATAACTAACACATGCTATTATAATAGTATACTAAT ATATTTATTATTGTTGTCTCTTGACGAGGTTGAAAGACACAAACTATTCA ATATCAGGAATCCAGGATGACCAAGAGAAACAAAAAGAATACATAGATGA AGTTATAGACTAAAATGAGTTATAAATAAACAAGTATATAATGGACATCA TTGCTACTCGACACTACTCTGATTAATACATGAAAGTTAAAGCTATGGAT ACTATTAAGATAGAAGCTAAAACAGTACTTTACATATACACATCTTAAAT AATAATAAGAACAAGAGAAGGGGAAGAAGGAAGGAAAGGAGAAGAAGAAC CTTTGTAGTTTCTAAATACACTACAATTATGTCTAACTCTTGACAGGTAC AATAAATATTATTAAGTAATAATAATATTATACTAACTTAATCAATGTGT TTCGATGTAACTGATACTCCAAGTATTATACCTAGTCCCTAATTTCTTGG AATTCCTCTTTTCTATTTATTAATCAATATTTATCCACGAAAACTAATCC ATAAAACCATCATCAGAAAGTTTGTAAACATAATTATAATATTAATATCA TATTGTTTGCTTGATTCTAAGCGAATAGTATCAGCATATTTAAAAAATAC TAACTAAGAATTTTACGACAATAAAATTAATATTCAATTAATCCGAACAA 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GGAACCCCCGAAACACTTCTAGACTTCTGCGCACACCTCCTGCAAGATTT TTTCTATCCGTAAATTGGCATTTTGTGATATACCTACTTTATGATTGCAA ATAAATTACGAAAACTTATTCCAAAAAATGAAGACAAATAAGTTTCAAGA ATCAACAAAACTTAAAGATCTAAAATTATATATAAAATAAAAAGATCAGT AAAATCATTTAATAACTATGAAATATTATTCATTGACAAAAGTAATTTTT TTTCAAAATTTTCGTCCTTTTAAACTTTGCCATCGATCTTTAAATATTTG ACCACCTTTTACAGCTACTCTCAATTTTTTCACATATTTTGCAAGACATA GTCGAAAATAATGGTTATTAAGGCTTCGGCAATTTTATCATGAGTGTGGC TGCCTTTTATTCTAAAGCATGCTAATGCTGTTTGACTAGGAGAAAACTCC GGGTTTATCCAATGGCAAGTTACACCAATATGGCCACGCTTTCCAGCTGA CAAACAATCTGCTGTCAAACAGAAACAGTTAATATTTGAGAAAGTGTGTT TCATTTTTTCCTTCATGTTAATAAATTGATGATCAATATTTTCCATTAGT GCTTCATAAGAAAGGACTTTTAAGCCTGGACAAATTTCTTGAATTAGTCT CTTGAAATCTTCATCCCTCACTAAAGTTGGCGGCAGAGATGACTTACATT TAATGATAAATTCTGTTATTAACGAATTTAAATAGTTTTGAGAAATTTGA GCTCCAGAACTTGAACCTTTAGTATAAAAAAAAAGATAGTGATTCTGAAT ATACTTTCAACTTTTTCTTCCCTTTATCGGATTGAATTATTTTTTCGAAT TTTTCTGTACCATGGCGAGACTCTAAATGACGTCGTAAATTGAATTTTGA TCTTTGAGTCGCAGTTACCTCTTTCCCACATTTTCCAAATTCACAACGAA 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